150 Uracil (URACIL)
(Previous) VIII Hydantoin (PAHYON01)
(Back) Elements:
C 4
H 4
N 2
O 2
(Z = 12)
(Periodic Table)
(Next) Thymine (THYMIN01)
Unit Cell Parameters: a b c alpha beta gamma Volume Density Heat of Formation (Kcal/mol)
X-ray: 3.66 12.38 11.94 90.00 120.90 90.00 463.33 1.607 -58.9 calc'd using PM7
PM7: 3.67 12.38 11.87 90.30 123.18 90.28 451.57 1.649 -107.1 calc'd using PM7 (ref: -101.4)
PM6: 3.60 12.46 11.91 90.74 120.87 87.23 458.43 1.624 -95.2 calc'd using PM6
X-Ray PM7 PM6
For X-Ray structure, contact the CCDC: http://www.ccdc.cam.ac.uk/
Optimized PM7 data set:
MERS=(3,1,1) GNORM=4 Z=4
Uracil (URACIL)
H=-101.4 hr=nist
C 0.01820735 +1 -0.02060489 +1 -0.03368841 +1
C 2.48552932 +1 0.00229232 +1 -0.01693831 +1
C 2.43356394 +1 1.43587157 +1 -0.00091221 +1
C 1.23505302 +1 2.08491699 +1 0.00602850 +1
H 1.14553840 +1 3.18977077 +1 0.01804748 +1
H -0.85933536 +1 1.88707097 +1 -0.06056726 +1
H 1.24021494 +1 -1.71917068 +1 -0.03781712 +1
H 3.38485092 +1 1.97358571 +1 -0.00303474 +1
N 0.04864995 +1 1.38250466 +1 -0.00898430 +1
N 1.25176509 +1 -0.67926576 +1 -0.01016968 +1
O -1.03004987 +1 -0.63605607 +1 -0.07634157 +1
O 3.49703557 +1 -0.69655346 +1 -0.03508709 +1
C 6.44687759 +1 1.62487039 +1 -0.41187795 +1
C 8.83491897 +1 1.01707429 +1 -0.52448379 +1
C 8.44268755 +1 -0.36236203 +1 -0.52846158 +1
C 7.12576698 +1 -0.70688155 +1 -0.48934731 +1
H 6.77371602 +1 -1.75669146 +1 -0.50626376 +1
H 5.13723493 +1 -0.02054099 +1 -0.35720613 +1
H 8.03796891 +1 2.98254012 +1 -0.48269126 +1
H 9.24040224 +1 -1.10991331 +1 -0.56210668 +1
N 6.14050490 +1 0.25571015 +1 -0.42388251 +1
N 7.79766865 +1 1.97114295 +1 -0.49404615 +1
O 5.57700334 +1 2.47385011 +1 -0.33785126 +1
O 9.98158007 +1 1.45848992 +1 -0.54266295 +1
C 4.70507989 +1 -4.15111705 +1 0.25395865 +1
C 2.23795992 +1 -4.17686888 +1 0.23666649 +1
C 2.28933155 +1 -5.60481634 +1 0.22283010 +1
C 3.48829242 +1 -6.25837950 +1 0.21605281 +1
H 3.57732249 +1 -7.36306698 +1 0.20584258 +1
H 5.58164581 +1 -6.05799362 +1 0.28050392 +1
H 3.48351970 +1 -2.45243291 +1 0.25548138 +1
H 1.33781207 +1 -6.14559958 +1 0.22624810 +1
N 4.67359427 +1 -5.55482445 +1 0.23403569 +1
N 3.47160787 +1 -3.49295381 +1 0.23209455 +1
O 5.75455432 +1 -3.53660620 +1 0.29020393 +1
O 1.22654608 +1 -3.47694324 +1 0.25482630 +1
C -1.72328092 +1 -5.79670880 +1 0.63353214 +1
C -4.10908908 +1 -5.18667892 +1 0.74530038 +1
C -3.71725539 +1 -3.80574992 +1 0.74892164 +1
C -2.39883164 +1 -3.46247710 +1 0.70653865 +1
H -2.04620877 +1 -2.41154487 +1 0.72210993 +1
H -0.41015847 +1 -4.15233941 +1 0.57807546 +1
H -3.31625074 +1 -7.15315355 +1 0.70553706 +1
H -4.51549151 +1 -3.06083975 +1 0.78285522 +1
N -1.41476600 +1 -4.42742202 +1 0.64341642 +1
N -3.07437972 +1 -6.14136829 +1 0.71622705 +1
O -0.85459467 +1 -6.64639644 +1 0.55600104 +1
O -5.25524324 +1 -5.62906385 +1 0.76422682 +1
C -0.09723242 +1 -1.54988709 +1 3.28449015 +1
C 2.37008808 +1 -1.52650627 +1 3.30065350 +1
C 2.31779727 +1 -0.09251827 +1 3.31601310 +1
C 1.11892268 +1 0.55678241 +1 3.32301675 +1
H 1.02850841 +1 1.66174740 +1 3.33455227 +1
H -0.97497156 +1 0.35705503 +1 3.25685604 +1
H 1.12619910 +1 -3.24809455 +1 3.27933341 +1
H 3.26847944 +1 0.44488746 +1 3.31368384 +1
N -0.06662248 +1 -0.14642991 +1 3.30754713 +1
N 1.13664534 +1 -2.20820274 +1 3.30648231 +1
O -1.14600702 +1 -2.16473842 +1 3.24448683 +1
O 3.38240083 +1 -2.22389566 +1 3.28398885 +1
C 6.33176187 +1 0.09780328 +1 2.90526235 +1
C 8.71978921 +1 -0.51164615 +1 2.79317447 +1
C 8.32627919 +1 -1.89062900 +1 2.78943730 +1
C 7.00816734 +1 -2.23562003 +1 2.83075144 +1
H 6.65442019 +1 -3.28663492 +1 2.81466604 +1
H 5.01986202 +1 -1.54707360 +1 2.95972268 +1
H 7.92413424 +1 1.45433789 +1 2.83504592 +1
H 9.12374632 +1 -2.63897234 +1 2.75508131 +1
N 6.02387094 +1 -1.27129716 +1 2.89316865 +1
N 7.68299849 +1 0.44286538 +1 2.82277603 +1
O 5.46228366 +1 0.94655606 +1 2.98256448 +1
O 9.86620516 +1 -0.06949324 +1 2.77243054 +1
C 4.59072790 +1 -5.67995405 +1 3.57142086 +1
C 2.12345044 +1 -5.70227811 +1 3.55492520 +1
C 2.17599220 +1 -7.13590603 +1 3.53902751 +1
C 3.37390804 +1 -7.78593840 +1 3.53197112 +1
H 3.46237894 +1 -8.89015418 +1 3.52014390 +1
H 5.46791209 +1 -7.58660736 +1 3.59777839 +1
H 3.36790038 +1 -3.98145986 +1 3.57660582 +1
H 1.22648936 +1 -7.67530342 +1 3.54116483 +1
N 4.55971800 +1 -7.08352470 +1 3.54874366 +1
N 3.35709138 +1 -5.02125005 +1 3.54894199 +1
O 5.63955162 +1 -5.06523246 +1 3.61124997 +1
O 1.11132544 +1 -5.00476900 +1 3.57179629 +1
C -1.83870137 +1 -7.32401756 +1 3.95000072 +1
C -4.22610885 +1 -6.71598789 +1 4.06319897 +1
C -3.83328020 +1 -5.33642230 +1 4.06598674 +1
C -2.51626670 +1 -4.99210611 +1 4.02632551 +1
H -2.16288119 +1 -3.94252661 +1 4.04283555 +1
H -0.52730871 +1 -5.67969377 +1 3.89554783 +1
H -3.43039156 +1 -8.68196180 +1 4.02088465 +1
H -4.63130786 +1 -4.58959247 +1 4.09972595 +1
N -1.53088766 +1 -5.95500370 +1 3.96187033 +1
N -3.18949753 +1 -7.67009021 +1 4.03369337 +1
O -0.96996583 +1 -8.17319104 +1 3.87397534 +1
O -5.37319005 +1 -7.15614309 +1 4.08190342 +1
C -0.21220647 +1 -3.07875970 +1 6.60252481 +1
C 2.25491791 +1 -3.05537591 +1 6.61865790 +1
C 2.20270060 +1 -1.62137066 +1 6.63228255 +1
C 1.00350147 +1 -0.97245218 +1 6.63920425 +1
H 0.91325578 +1 0.13246530 +1 6.64933089 +1
H -1.09089885 +1 -1.17203868 +1 6.57434446 +1
H 1.01059116 +1 -4.77688736 +1 6.60029786 +1
H 3.15345628 +1 -1.08371673 +1 6.62868784 +1
N -0.18263880 +1 -1.67539917 +1 6.62315037 +1
N 1.02158199 +1 -3.73713553 +1 6.62309646 +1
O -1.26099578 +1 -3.69391152 +1 6.56362748 +1
O 3.26747441 +1 -3.75240796 +1 6.60076574 +1
C 6.21775948 +1 -1.43081305 +1 6.22212083 +1
C 8.60568731 +1 -2.03872430 +1 6.10924693 +1
C 8.21201447 +1 -3.42184601 +1 6.10570038 +1
C 6.89445910 +1 -3.76583112 +1 6.14592489 +1
H 6.54106531 +1 -4.81632184 +1 6.12948875 +1
H 4.90592923 +1 -3.07692594 +1 6.27628078 +1
H 7.80993004 +1 -0.07531620 +1 6.15017997 +1
H 9.00928587 +1 -4.16938253 +1 6.07195219 +1
N 5.90970775 +1 -2.80235405 +1 6.20947598 +1
N 7.56825293 +1 -1.08816474 +1 6.13779094 +1
O 5.34863366 +1 -0.58434372 +1 6.29934742 +1
O 9.75129009 +1 -1.59753130 +1 6.09158689 +1
C 4.47530085 +1 -7.20874923 +1 6.89006240 +1
C 2.00825862 +1 -7.23185835 +1 6.87246594 +1
C 2.06033639 +1 -8.66512423 +1 6.85604863 +1
C 3.25846021 +1 -9.31416349 +1 6.84920305 +1
H 3.34700554 +1 -10.41854485 +1 6.83694043 +1
H 5.35284661 +1 -9.11564776 +1 6.91579687 +1
H 3.25317122 +1 -5.50970915 +1 6.89342547 +1
H 1.10874855 +1 -9.20241346 +1 6.85808838 +1
N 4.44453915 +1 -8.61212135 +1 6.86506750 +1
N 3.24184793 +1 -6.54978780 +1 6.86563286 +1
O 5.52403765 +1 -6.59358815 +1 6.93128779 +1
O 0.99621430 +1 -6.53354125 +1 6.89090281 +1
C -1.95317185 +1 -8.85391181 +1 7.26811084 +1
C -4.34360848 +1 -8.24605219 +1 7.37901613 +1
C -3.94792995 +1 -6.86575054 +1 7.38314619 +1
C -2.62985512 +1 -6.52024127 +1 7.34212745 +1
H -2.27737821 +1 -5.46914103 +1 7.35797377 +1
H -0.64100060 +1 -7.20894265 +1 7.21217647 +1
H -3.54526416 +1 -10.21078480 +1 7.33853268 +1
H -4.74538552 +1 -6.11880294 +1 7.41707738 +1
N -1.64544325 +1 -7.48441388 +1 7.27851516 +1
N -3.30362226 +1 -9.19974573 +1 7.34872849 +1
O -1.08417326 +1 -9.70322009 +1 7.19248046 +1
O -5.48558580 +1 -8.69077144 +1 7.39698635 +1
Tv -0.38939794 +1 -4.67766185 +1 9.96963790 +1
Tv -12.29934736 +1 1.39573543 +1 0.10698054 +1
Tv 1.37161859 +1 11.67102546 +1 -1.64734987 +1
Optimized PM6 data set:
PM6 MERS=(3,1,1) GNORM=4 Z=4
Uracil (URACIL)
C -0.03699180 +1 0.01240190 +1 -0.07960290 +1
C 2.46580244 +1 0.03259631 +1 -0.03558015 +1
C 2.40468259 +1 1.47067395 +1 0.00662304 +1
C 1.21408713 +1 2.13248774 +1 0.03270380 +1
H 1.13146176 +1 3.23899093 +1 0.09307259 +1
H -0.91433649 +1 1.94291611 +1 -0.02067470 +1
H 1.20453821 +1 -1.70188904 +1 -0.10787037 +1
H 3.36480680 +1 2.00650265 +1 0.02870657 +1
N 0.00907440 +1 1.43018236 +1 -0.02076522 +1
N 1.21079478 +1 -0.65000770 +1 -0.06270671 +1
O -1.09480796 +1 -0.59808793 +1 -0.13933997 +1
O 3.47259828 +1 -0.68368939 +1 -0.05154019 +1
C 6.41765833 +1 1.60532998 +1 -0.32736556 +1
C 8.83997243 +1 1.00154198 +1 -0.49953754 +1
C 8.44210193 +1 -0.38083953 +1 -0.54229017 +1
C 7.13096865 +1 -0.74786830 +1 -0.49904595 +1
H 6.79148846 +1 -1.80402807 +1 -0.54779225 +1
H 5.11421746 +1 -0.06790130 +1 -0.33613234 +1
H 8.02809851 +1 2.98066437 +1 -0.37537951 +1
H 9.24528537 +1 -1.12823206 +1 -0.61743253 +1
N 6.12876314 +1 0.21584659 +1 -0.38138836 +1
N 7.78158032 +1 1.95892509 +1 -0.42318051 +1
O 5.53339389 +1 2.44100918 +1 -0.20348981 +1
O 9.98611001 +1 1.46237793 +1 -0.52523347 +1
C 4.75865213 +1 -4.18690861 +1 0.36428347 +1
C 2.25738910 +1 -4.21211265 +1 0.30211237 +1
C 2.32009388 +1 -5.65062480 +1 0.26638544 +1
C 3.51179173 +1 -6.31051948 +1 0.24672098 +1
H 3.59961270 +1 -7.41707929 +1 0.19142973 +1
H 5.63801660 +1 -6.11775768 +1 0.29937692 +1
H 3.51669624 +1 -2.47475718 +1 0.37591194 +1
H 1.35968903 +1 -6.18507190 +1 0.24754535 +1
N 4.71481319 +1 -5.60524018 +1 0.30488741 +1
N 3.51073784 +1 -3.52697779 +1 0.33518269 +1
O 5.81725925 +1 -3.57712085 +1 0.42729006 +1
O 1.24876394 +1 -3.49816182 +1 0.30659544 +1
C -1.69428093 +1 -5.78633970 +1 0.61591249 +1
C -4.11434867 +1 -5.17435724 +1 0.79953418 +1
C -3.71314644 +1 -3.79189150 +1 0.83281275 +1
C -2.40085873 +1 -3.42960169 +1 0.78566657 +1
H -2.05380049 +1 -2.37551699 +1 0.82898966 +1
H -0.38751498 +1 -4.11513255 +1 0.62531185 +1
H -3.30698061 +1 -7.15633023 +1 0.67342240 +1
H -4.51572487 +1 -3.04344586 +1 0.89601367 +1
N -1.40197250 +1 -4.39769836 +1 0.66846988 +1
N -3.05923866 +1 -6.13492873 +1 0.71819691 +1
O -0.81260345 +1 -6.62511820 +1 0.49394815 +1
O -5.26101067 +1 -5.63264393 +1 0.83217122 +1
C -0.15300610 +1 -1.51393555 +1 3.20365752 +1
C 2.34920740 +1 -1.49394839 +1 3.25951152 +1
C 2.28967383 +1 -0.05584542 +1 3.29153290 +1
C 1.09943497 +1 0.60678248 +1 3.30838163 +1
H 1.01768232 +1 1.71363434 +1 3.35979451 +1
H -1.02844543 +1 0.41767969 +1 3.25209195 +1
H 1.08573591 +1 -3.22874032 +1 3.19976430 +1
H 3.25002755 +1 0.47942960 +1 3.31077586 +1
N -0.10571638 +1 -0.09535963 +1 3.24996114 +1
N 1.09414285 +1 -2.17640617 +1 3.23716991 +1
O -1.21259928 +1 -2.12196365 +1 3.14148833 +1
O 3.35620016 +1 -2.21037012 +1 3.25103761 +1
C 6.30519345 +1 0.07938285 +1 2.95179982 +1
C 8.72488353 +1 -0.52812204 +1 2.77207331 +1
C 8.32508573 +1 -1.91131369 +1 2.74337487 +1
C 7.01338255 +1 -2.27588444 +1 2.79083024 +1
H 6.66787374 +1 -3.33058690 +1 2.74823881 +1
H 4.99883569 +1 -1.59247497 +1 2.95736470 +1
H 7.91652427 +1 1.45333749 +1 2.88903360 +1
H 9.12873478 +1 -2.65858215 +1 2.67771598 +1
N 6.01344054 +1 -1.30947139 +1 2.90693907 +1
N 7.66842559 +1 0.43127332 +1 2.84602275 +1
O 5.42240453 +1 0.91758457 +1 3.07228407 +1
O 9.87152103 +1 -0.06953903 +1 2.73874959 +1
C 4.64599876 +1 -5.71367240 +1 3.65186101 +1
C 2.14401295 +1 -5.73543618 +1 3.59582501 +1
C 2.20437078 +1 -7.17336793 +1 3.56354257 +1
C 3.39484091 +1 -7.83562220 +1 3.54788709 +1
H 3.47707930 +1 -8.94244601 +1 3.49724537 +1
H 5.52265266 +1 -7.64465139 +1 3.60428718 +1
H 3.40631823 +1 -3.99951100 +1 3.65615139 +1
H 1.24402986 +1 -7.70856176 +1 3.54428685 +1
N 4.59943227 +1 -7.13245694 +1 3.60477776 +1
N 3.39868860 +1 -5.05195904 +1 3.61761861 +1
O 5.70544285 +1 -5.10531970 +1 3.71366641 +1
O 1.13616788 +1 -5.02022875 +1 3.60328552 +1
C -1.81293378 +1 -7.30947559 +1 3.90314727 +1
C -4.23171640 +1 -6.69926558 +1 4.08407608 +1
C -3.83068659 +1 -5.31630923 +1 4.11264611 +1
C -2.51863076 +1 -4.95326951 +1 4.06478152 +1
H -2.17150573 +1 -3.89917436 +1 4.10732628 +1
H -0.50530088 +1 -5.63906484 +1 3.89779404 +1
H -3.42590350 +1 -8.68181680 +1 3.96567984 +1
H -4.63375165 +1 -4.56844600 +1 4.17856386 +1
N -1.52003956 +1 -5.92104727 +1 3.94855796 +1
N -3.17669356 +1 -7.65986968 +1 4.00851941 +1
O -0.93180866 +1 -8.14937379 +1 3.78239528 +1
O -5.37872733 +1 -7.15690561 +1 4.11821757 +1
C -0.26497994 +1 -3.04096201 +1 6.49103756 +1
C 2.23655068 +1 -3.01730469 +1 6.55295272 +1
C 2.17445780 +1 -1.57872313 +1 6.58956867 +1
C 0.98293555 +1 -0.91850536 +1 6.60808722 +1
H 0.89554648 +1 0.18808849 +1 6.66496040 +1
H -1.14347591 +1 -1.11001127 +1 6.55642194 +1
H 0.97627358 +1 -4.75380774 +1 6.47970806 +1
H 3.13480093 +1 -1.04407379 +1 6.60816098 +1
N -0.22052204 +1 -1.62303494 +1 6.55018925 +1
N 0.98289214 +1 -3.70167301 +1 6.52046312 +1
O -1.32355340 +1 -3.65087146 +1 6.42910846 +1
O 3.24442985 +1 -3.73245089 +1 6.54867045 +1
C 6.18756619 +1 -1.44425726 +1 6.23928954 +1
C 8.60839090 +1 -2.05316935 +1 6.05595003 +1
C 8.20819103 +1 -3.43585777 +1 6.02265062 +1
C 6.89643270 +1 -3.80018890 +1 6.06966261 +1
H 6.55151830 +1 -4.85512618 +1 6.02652267 +1
H 4.88169833 +1 -3.11693781 +1 6.22905807 +1
H 7.79831701 +1 -0.07215118 +1 6.18199951 +1
H 9.01169717 +1 -4.18329792 +1 5.95944548 +1
N 5.89619228 +1 -2.83348791 +1 6.18636139 +1
N 7.55187791 +1 -1.09387707 +1 6.13807850 +1
O 5.30394545 +1 -0.60735549 +1 6.36068988 +1
O 9.75481468 +1 -1.59429735 +1 6.02358149 +1
C 4.53055230 +1 -7.24051793 +1 6.93500075 +1
C 2.02794997 +1 -7.26224712 +1 6.89055496 +1
C 2.08953530 +1 -8.69998044 +1 6.84782927 +1
C 3.28039085 +1 -9.36153526 +1 6.82379135 +1
H 3.36332304 +1 -10.46798173 +1 6.76477614 +1
H 5.40855043 +1 -9.17081478 +1 6.87743041 +1
H 3.28822961 +1 -5.52679017 +1 6.96371209 +1
H 1.12930743 +1 -9.23553839 +1 6.82545472 +1
N 4.48498035 +1 -8.65839768 +1 6.87628203 +1
N 3.28269116 +1 -6.57876155 +1 6.91713421 +1
O 5.58838530 +1 -6.62981064 +1 6.99460756 +1
O 1.02047170 +1 -6.54671715 +1 6.90467703 +1
C -1.92430522 +1 -8.83556975 +1 7.18175111 +1
C -4.34625972 +1 -8.22958682 +1 7.35494762 +1
C -3.94735508 +1 -6.84716655 +1 7.39789182 +1
C -2.63584576 +1 -6.48177995 +1 7.35474774 +1
H -2.29458487 +1 -5.42625519 +1 7.40391750 +1
H -0.61987555 +1 -7.16361189 +1 7.19096055 +1
H -3.53657433 +1 -10.20910432 +1 7.23041858 +1
H -4.75005496 +1 -6.09924159 +1 7.47300238 +1
N -1.63452174 +1 -7.44675040 +1 7.23648372 +1
N -3.28895952 +1 -9.18761790 +1 7.27818424 +1
O -1.04202927 +1 -9.67293288 +1 7.05720401 +1
O -5.49253324 +1 -8.68987195 +1 7.38089407 +1
Tv -0.74219569 +1 -4.42079250 +1 9.83442296 +1
Tv -12.37224531 +1 1.44352787 +1 0.37588501 +1
Tv 1.48463221 +1 11.74360067 +1 -1.32482218 +1