149 VIII Hydantoin (PAHYON01)
(Previous) 1,3,5-Trinitro-1,3,5-triazacyclohexane (CTMTNA03)
(Back) Elements:
O 2
N 2
C 3
H 4
(Z = 16)
(Periodic Table)
(Next) Uracil (URACIL)
This is one of the solids used in the blind tests of crystal structure prediction.
See: "Significant progress in predicting the crystal structures of small organic molecules – a report on the fourth blind test", Acta Crys. B 865, 107-125 (2009), and
"Towards crystal structure prediction of complex organic compounds - a report on the fifth blind test", Bardwell, et. al Acta Cryst. (2011). B67, 535-551
The complete set consists of 22 solids.
Unit Cell Parameters: a b c alpha beta gamma Volume Density Heat of Formation (Kcal/mol)
X-ray: 9.35 12.18 7.23 90.00 104.60 90.00 796.72 1.669 -8.8 calc'd using PM7
PM7: 9.30 12.16 7.27 90.32 103.94 90.02 798.17 1.666 -107.0 calc'd using PM7
PM6: 9.47 11.65 7.39 90.34 105.55 89.79 785.70 1.692 -96.0 calc'd using PM6
X-Ray PM7 PM6
For X-Ray structure, contact the CCDC: http://www.ccdc.cam.ac.uk/
Optimized PM7 data set:
MERS=(1,1,2) GNORM=4
Hydantoin (PAHYON01)
O -0.03673613 +1 -0.04736619 +1 -0.02514635 +1
N -1.41416237 +1 1.17076001 +1 -1.43886375 +1
C -1.59665308 +1 2.51387185 +1 -1.78825538 +1
C -0.63800877 +1 3.32776988 +1 -0.92513399 +1
N 0.00402883 +1 2.29948491 +1 -0.07749650 +1
O -2.39876979 +1 2.89786637 +1 -2.60797977 +1
H 0.10177818 +1 3.88664759 +1 -1.54756988 +1
H -1.18363552 +1 4.08559784 +1 -0.31265526 +1
H 0.80201937 +1 2.51857513 +1 0.50757514 +1
H -1.85531080 +1 0.36808442 +1 -1.88876364 +1
C -0.39197368 +1 1.03607084 +1 -0.44905422 +1
C 4.29027842 +1 -5.05055757 +1 -0.44686718 +1
N 3.26962033 +1 -4.91620704 +1 -1.43709530 +1
C 3.08544362 +1 -3.57332561 +1 -1.78372109 +1
C 4.04554666 +1 -2.75852539 +1 -0.92379113 +1
N 4.69302317 +1 -3.78729677 +1 -0.08103584 +1
O 2.27994412 +1 -3.18309672 +1 -2.59779876 +1
O 4.64854326 +1 -6.13156129 +1 -0.01935740 +1
H 4.78136346 +1 -2.19808484 +1 -1.54898879 +1
H 3.50032556 +1 -2.00178928 +1 -0.30917300 +1
H 5.47322274 +1 -3.56759825 +1 0.52456262 +1
H 2.82140448 +1 -5.72145286 +1 -1.87855127 +1
C 3.65729968 +1 1.03533929 +1 -1.46147433 +1
N 4.68387989 +1 1.17112723 +1 -0.47696415 +1
C 4.86223660 +1 2.51404005 +1 -0.12660933 +1
C 3.90152070 +1 3.32732132 +1 -0.98824286 +1
N 3.25945255 +1 2.29800087 +1 -1.83421328 +1
O 5.66222928 +1 2.90350271 +1 0.69282440 +1
O 3.29996804 +1 -0.04744258 +1 -1.88545166 +1
H 3.16186789 +1 3.88502377 +1 -0.36478491 +1
H 4.44693562 +1 4.08486784 +1 -1.60120426 +1
H 2.46143922 +1 2.51489139 +1 -2.42090861 +1
H 5.11945466 +1 0.36845821 +1 -0.01851897 +1
C -1.01594531 +1 -5.05120695 +1 -1.47014849 +1
N 0.00408955 +1 -4.91487100 +1 -0.47957586 +1
C 0.18376583 +1 -3.57253249 +1 -0.12961730 +1
C -0.77883266 +1 -2.75908041 +1 -0.98779433 +1
N -1.42378400 +1 -3.78860527 +1 -1.83034954 +1
O 0.98819939 +1 -3.18049586 +1 0.68528861 +1
O -1.36786069 +1 -6.13140720 +1 -1.90265032 +1
H -1.51577734 +1 -2.20055658 +1 -0.36182943 +1
H -0.23462060 +1 -2.00189227 +1 -1.60246328 +1
H -2.19629904 +1 -3.56930532 +1 -2.44695944 +1
H 0.45547703 +1 -5.72150856 +1 -0.04115551 +1
C 2.75055695 +1 0.97904679 +1 2.03695526 +1
N 3.77331304 +1 0.84501357 +1 3.02633501 +1
C 3.95463657 +1 -0.49844732 +1 3.37770636 +1
C 2.99570916 +1 -1.31267586 +1 2.51469386 +1
N 2.35189087 +1 -0.28439224 +1 1.66714004 +1
O 4.75355574 +1 -0.87791594 +1 4.20214402 +1
O 2.39671451 +1 2.06196755 +1 1.61079017 +1
H 2.25672248 +1 -1.87314195 +1 3.13618443 +1
H 3.54063433 +1 -2.07094751 +1 1.90068262 +1
H 1.55349691 +1 -0.50353901 +1 1.08224302 +1
H 4.20346319 +1 1.64642808 +1 3.48710477 +1
C -1.93232760 +1 7.06412983 +1 2.03627432 +1
N -0.90745731 +1 6.93061690 +1 3.02327774 +1
C -0.72557452 +1 5.58844297 +1 3.37383827 +1
C -1.68581913 +1 4.77234368 +1 2.51444308 +1
N -2.33657765 +1 5.80049247 +1 1.67437821 +1
O 0.07565369 +1 5.20301493 +1 4.19383803 +1
O -2.29007709 +1 8.14428606 +1 1.60623371 +1
H -2.41944995 +1 4.20924309 +1 3.13963196 +1
H -1.14228173 +1 4.01605782 +1 1.89744759 +1
H -3.11957587 +1 5.58065187 +1 1.07080330 +1
H -0.47139802 +1 7.73495170 +1 3.47644932 +1
C -1.30148618 +1 0.97689455 +1 3.05087336 +1
N -2.32737757 +1 0.84103962 +1 2.06424076 +1
C -2.50564765 +1 -0.50122356 +1 1.71440945 +1
C -1.54604717 +1 -1.31532760 +1 2.57609816 +1
N -0.89886469 +1 -0.28537047 +1 3.41758506 +1
O -3.30578509 +1 -0.89003828 +1 0.89482866 +1
O -0.94349479 +1 2.05846862 +1 3.47705012 +1
H -0.80912594 +1 -1.87476836 +1 1.95115614 +1
H -2.09123979 +1 -2.06969723 +1 3.19190632 +1
H -0.11609741 +1 -0.50417508 +1 4.02148267 +1
H -2.75959324 +1 1.64476864 +1 1.60638418 +1
C 3.37196191 +1 7.06332525 +1 3.05933884 +1
N 2.35510294 +1 6.92819322 +1 2.06444107 +1
C 2.17262139 +1 5.58605973 +1 1.71682065 +1
C 3.13357003 +1 4.77061909 +1 2.57584524 +1
N 3.78034422 +1 5.80021509 +1 3.41686016 +1
O 1.36703667 +1 5.19423549 +1 0.90302936 +1
O 3.72597889 +1 8.14150615 +1 3.49434600 +1
H 3.86937999 +1 4.21263518 +1 1.94950097 +1
H 2.58888843 +1 4.01482569 +1 3.19120553 +1
H 4.54332135 +1 5.58010340 +1 4.04331377 +1
H 1.90433433 +1 7.73324070 +1 1.62423232 +1
O 1.78149508 +1 -0.05044050 +1 -7.02131798 +1
N 0.40531566 +1 1.16657307 +1 -8.43666883 +1
C 0.22286416 +1 2.51004595 +1 -8.78725584 +1
C 1.18185437 +1 3.32449003 +1 -7.92378047 +1
N 1.82490684 +1 2.29610539 +1 -7.07729387 +1
O -0.57686389 +1 2.88934925 +1 -9.61082782 +1
H 1.92002382 +1 3.88548410 +1 -8.54562746 +1
H 0.63674750 +1 4.08151081 +1 -7.30902955 +1
H 2.62303707 +1 2.51522805 +1 -6.49111015 +1
H -0.02601973 +1 0.36538806 +1 -8.89630301 +1
C 1.42805143 +1 1.03256684 +1 -7.44764540 +1
C 6.10984134 +1 -5.05254979 +1 -7.44532634 +1
N 5.08755015 +1 -4.91875399 +1 -8.43448864 +1
C 4.90402930 +1 -3.57648994 +1 -8.78359417 +1
C 5.86378359 +1 -2.76053615 +1 -7.92291760 +1
N 6.51238889 +1 -3.78885101 +1 -7.08201317 +1
O 4.10144351 +1 -3.19129701 +1 -9.60239781 +1
O 6.46635630 +1 -6.13309677 +1 -7.01532469 +1
H 6.59735370 +1 -2.19763644 +1 -8.54786397 +1
H 5.31927723 +1 -2.00434321 +1 -7.30599154 +1
H 7.29613690 +1 -3.56873224 +1 -6.47787699 +1
H 4.64782608 +1 -5.72315147 +1 -8.88371890 +1
C 5.47970266 +1 1.03495799 +1 -8.46069989 +1
N 6.50577415 +1 1.17119697 +1 -7.47338394 +1
C 6.68344350 +1 2.51319803 +1 -7.12396798 +1
C 5.72342563 +1 3.32692184 +1 -7.98585552 +1
N 5.07730495 +1 2.29708802 +1 -8.82625423 +1
O 7.48351396 +1 2.90204806 +1 -6.30416223 +1
O 5.12092643 +1 -0.04651291 +1 -8.88590234 +1
H 4.98610705 +1 3.88576436 +1 -7.36057710 +1
H 6.26878742 +1 4.08218465 +1 -8.60087796 +1
H 4.29099519 +1 2.51546314 +1 -9.42811247 +1
H 6.93679547 +1 0.36640920 +1 -7.01608610 +1
C 0.80623940 +1 -5.05171606 +1 -8.46917021 +1
N 1.82410597 +1 -4.91631385 +1 -7.47564795 +1
C 2.00526006 +1 -3.57428090 +1 -7.12649458 +1
C 1.04327583 +1 -2.75923230 +1 -7.98503450 +1
N 0.39615748 +1 -3.78886758 +1 -8.82477979 +1
O 2.81057086 +1 -3.18231667 +1 -6.31239672 +1
O 0.45293347 +1 -6.12992571 +1 -8.90457127 +1
H 0.30795037 +1 -2.20085431 +1 -7.35783549 +1
H 1.58753313 +1 -2.00387317 +1 -8.60109695 +1
H -0.36600515 +1 -3.56848694 +1 -9.45281152 +1
H 2.27401684 +1 -5.72173196 +1 -7.03448058 +1
C 4.57050160 +1 0.97721144 +1 -4.96095127 +1
N 5.59351625 +1 0.84226667 +1 -3.97197927 +1
C 5.77411358 +1 -0.50081473 +1 -3.62198873 +1
C 4.81474711 +1 -1.31435984 +1 -4.48478530 +1
N 4.17475147 +1 -0.28605958 +1 -5.33347960 +1
O 6.57498598 +1 -0.88533376 +1 -2.80125914 +1
O 4.21531261 +1 2.06055039 +1 -5.38465292 +1
H 4.07420451 +1 -1.87209219 +1 -3.86259359 +1
H 5.36043933 +1 -2.07322885 +1 -5.09653594 +1
H 3.37363797 +1 -0.50465519 +1 -5.91534720 +1
H 6.03167965 +1 1.64495678 +1 -3.51876807 +1
C -0.11282738 +1 7.06217253 +1 -4.96221582 +1
N 0.90866987 +1 6.92800223 +1 -3.97315103 +1
C 1.09195680 +1 5.58527516 +1 -3.62535968 +1
C 0.13136963 +1 4.77033615 +1 -4.48546121 +1
N -0.51493463 +1 5.79895470 +1 -5.32618528 +1
O 1.89675396 +1 5.19474248 +1 -2.81075057 +1
O -0.47148772 +1 8.14285551 +1 -5.38986409 +1
H -0.60376286 +1 4.20973755 +1 -3.85952697 +1
H 0.67667320 +1 4.01371854 +1 -5.09964973 +1
H -1.29670451 +1 5.57893107 +1 -5.93244009 +1
H 1.35681623 +1 7.73335309 +1 -3.53120582 +1
C 0.52058193 +1 0.97664507 +1 -3.94749179 +1
N -0.50606908 +1 0.84073555 +1 -4.93171853 +1
C -0.68433861 +1 -0.50215692 +1 -5.28240341 +1
C 0.27625691 +1 -1.31551443 +1 -4.42081247 +1
N 0.91945725 +1 -0.28615014 +1 -3.57693114 +1
O -1.48423756 +1 -0.89139902 +1 -6.10188837 +1
O 0.87673847 +1 2.05950963 +1 -3.52229619 +1
H 1.01477494 +1 -1.87485724 +1 -5.04473057 +1
H -0.26923417 +1 -2.07164001 +1 -3.80667625 +1
H 1.71360620 +1 -0.50359561 +1 -2.98482558 +1
H -0.94231316 +1 1.64309935 +1 -5.38958668 +1
C 5.19435684 +1 7.06281768 +1 -3.93969697 +1
N 4.17511104 +1 6.92672960 +1 -4.93140397 +1
C 3.99403378 +1 5.58426053 +1 -5.28017240 +1
C 4.95568001 +1 4.77036926 +1 -4.42119587 +1
N 5.59997230 +1 5.79989377 +1 -3.57793553 +1
O 3.18919097 +1 5.19242448 +1 -6.09461672 +1
O 5.54760040 +1 8.14285964 +1 -3.50783127 +1
H 5.69323837 +1 4.21231705 +1 -5.04661397 +1
H 4.41125012 +1 4.01290693 +1 -3.80740783 +1
H 6.37291690 +1 5.58060452 +1 -2.96221687 +1
H 3.72267483 +1 7.73299046 +1 -5.36876897 +1
Tv -9.29953269 +1 -0.02791310 +1 -0.12657450 +1
Tv -0.03349038 +1 12.15919306 +1 0.03977082 +1
Tv 3.69530113 +1 -0.02509356 +1 -14.06718315 +1
Optimized PM6 data set:
MERS=(1,1,2) GNORM=2 PM6
Hydantoin (PAHYON01)
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N -1.46234018 +1 1.25072090 +1 -1.28453775 +1
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