151 Thymine (THYMIN01)
(Previous) Uracil (URACIL)
(Back) Elements:
O 2
N 2
C 5
H 6
(Z = 16)
(Periodic Table)
(Next) 4-Nitroaniline (NANILI22)
Unit Cell Parameters: a b c alpha beta gamma Volume Density Heat of Formation (Kcal/mol)
X-ray: 6.85 6.78 12.89 75.08 90.00 90.00 578.91 1.447 -34.9 calc'd using PM7
PM7: 6.90 6.80 12.18 74.39 90.18 90.30 550.20 1.522 -116.5 calc'd using PM7 (ref: -110.6)
PM6: 6.79 7.00 11.72 77.86 89.82 89.67 544.54 1.538 -100.8 calc'd using PM6
X-Ray PM7 PM6
For X-Ray structure, contact the CCDC: http://www.ccdc.cam.ac.uk/
Optimized PM7 data set:
MERS=(2,2,1) GNORM=4
Thymine (THYMIN01)
h=-110.6 hr=nist
O -0.02399517 +1 -0.02207470 +1 0.08523165 +1
O 3.19079300 +1 -2.37161852 +1 2.24159083 +1
N 1.65158359 +1 1.16548386 +1 1.07188348 +1
N 1.58648583 +1 -1.21460829 +1 1.17787477 +1
C 1.02021372 +1 -0.02859482 +1 0.73796442 +1
C 2.78815676 +1 -1.26865197 +1 1.93142747 +1
C 3.38753175 +1 0.01992458 +1 2.25813299 +1
C 2.82110236 +1 1.17471494 +1 1.81892906 +1
C 4.61323913 +1 -0.01797350 +1 3.08839513 +1
H 1.25542684 +1 2.04745996 +1 0.70465126 +1
H 1.13784247 +1 -2.09898856 +1 0.88274131 +1
H 3.23911116 +1 2.17667419 +1 2.02725795 +1
H 4.95142508 +1 0.97568243 +1 3.41769674 +1
H 4.45329116 +1 -0.62177185 +1 4.00061735 +1
H 5.46147234 +1 -0.46670467 +1 2.54402303 +1
O 0.85223639 +1 -3.29136067 +1 -3.19764592 +1
O 4.06427264 +1 -0.93797447 +1 -1.04146983 +1
N 2.52896648 +1 -4.47664598 +1 -2.21033702 +1
N 2.45986740 +1 -2.09713897 +1 -2.10170706 +1
C 1.89569819 +1 -3.28338231 +1 -2.54327614 +1
C 3.66267845 +1 -2.04182530 +1 -1.34921895 +1
C 4.26038131 +1 -3.32988471 +1 -1.01885178 +1
C 3.69468565 +1 -4.48522882 +1 -1.45721066 +1
C 5.48562567 +1 -3.28930517 +1 -0.18786930 +1
H 2.14221104 +1 -5.35717392 +1 -2.58997169 +1
H 2.00670751 +1 -1.21244353 +1 -2.38860341 +1
H 4.11065733 +1 -5.48715771 +1 -1.24431395 +1
H 5.82574435 +1 -4.28200473 +1 0.14280753 +1
H 5.32490029 +1 -2.68529913 +1 0.72351709 +1
H 6.33350605 +1 -2.83900840 +1 -0.73145261 +1
O -0.56857208 +1 0.14024844 +1 3.31056236 +1
O -3.77415980 +1 2.48522642 +1 1.13672515 +1
N -2.24100864 +1 -1.05064541 +1 2.31796645 +1
N -2.17730061 +1 1.32835639 +1 2.21061039 +1
C -1.60961479 +1 0.14338387 +1 2.65300685 +1
C -3.37451652 +1 1.38159070 +1 1.44886515 +1
C -3.96928968 +1 0.09281979 +1 1.11742188 +1
C -3.40130074 +1 -1.06128998 +1 1.55658714 +1
C -5.19404490 +1 0.12870958 +1 0.28525784 +1
H -1.85092845 +1 -1.93193608 +1 2.69108093 +1
H -1.71080637 +1 2.21386006 +1 2.47118506 +1
H -3.81292421 +1 -2.06366186 +1 1.33736113 +1
H -5.53314506 +1 -0.86612222 +1 -0.04066699 +1
H -5.03339242 +1 0.72965600 +1 -0.62828538 +1
H -6.04193896 +1 0.57955592 +1 0.82799707 +1
O 0.31165405 +1 3.42202961 +1 0.01475926 +1
O -2.89328868 +1 1.05360840 +1 -2.13813357 +1
N -1.37365536 +1 4.59773702 +1 -0.96638071 +1
N -1.29254712 +1 2.21862098 +1 -1.07923627 +1
C -0.73074756 +1 3.40714694 +1 -0.64057960 +1
C -2.49612966 +1 2.15932194 +1 -1.83047959 +1
C -3.10085044 +1 3.44427205 +1 -2.15853543 +1
C -2.53868059 +1 4.60169064 +1 -1.72013246 +1
C -4.32478328 +1 3.40185230 +1 -2.99183045 +1
H -0.95087263 +1 5.48643229 +1 -0.64810022 +1
H -0.83535874 +1 1.33478952 +1 -0.79488276 +1
H -2.95617594 +1 5.60167854 +1 -1.93750869 +1
H -4.66638940 +1 4.39459865 +1 -3.32099586 +1
H -4.16023581 +1 2.80091199 +1 -3.90498509 +1
H -5.17137486 +1 2.94742078 +1 -2.45034276 +1
O -0.01554349 +1 -6.90285831 +1 0.06593147 +1
O 3.19520347 +1 -9.23564805 +1 2.24285698 +1
N 1.65175827 +1 -5.70516367 +1 1.06036292 +1
N 1.58787572 +1 -8.08415359 +1 1.17880804 +1
C 1.02295764 +1 -6.90081910 +1 0.72828827 +1
C 2.79032696 +1 -8.13377590 +1 1.93190653 +1
C 3.38512796 +1 -6.84317040 +1 2.25826351 +1
C 2.81582948 +1 -5.69077835 +1 1.81675990 +1
C 4.61210028 +1 -6.87901910 +1 3.08763105 +1
H 1.26025498 +1 -4.82475918 +1 0.68468869 +1
H 1.13746382 +1 -8.96999372 +1 0.89279353 +1
H 3.22834397 +1 -4.68698610 +1 2.02801800 +1
H 4.95117302 +1 -5.88447156 +1 3.41397709 +1
H 4.45351493 +1 -7.48069612 +1 4.00091588 +1
H 5.45920483 +1 -7.33052151 +1 2.54390415 +1
O 0.85714874 +1 -10.16912474 +1 -3.20851740 +1
O 4.05698141 +1 -7.80222654 +1 -1.04571780 +1
N 2.53535223 +1 -11.34661590 +1 -2.21641259 +1
N 2.45501952 +1 -8.96750837 +1 -2.10381404 +1
C 1.89795838 +1 -10.15587055 +1 -2.55036832 +1
C 3.65826565 +1 -8.90760980 +1 -1.35236619 +1
C 4.26140125 +1 -10.19312696 +1 -1.02244889 +1
C 3.69903331 +1 -11.35054825 +1 -1.45966041 +1
C 5.48717859 +1 -10.15086348 +1 -0.19175706 +1
H 2.14241847 +1 -12.23234564 +1 -2.57763059 +1
H 1.99792909 +1 -8.08510851 +1 -2.39279651 +1
H 4.11697493 +1 -12.35074367 +1 -1.24446636 +1
H 5.83017337 +1 -11.14367064 +1 0.13565020 +1
H 5.32419236 +1 -9.55094663 +1 0.72206291 +1
H 6.33280800 +1 -9.69545627 +1 -0.73445475 +1
O -0.56503257 +1 -6.73844279 +1 3.29663631 +1
O -3.76920215 +1 -4.37737841 +1 1.13509040 +1
N -2.24727766 +1 -7.91904521 +1 2.31494372 +1
N -2.17069594 +1 -5.53964524 +1 2.20082696 +1
C -1.60703998 +1 -6.72722725 +1 2.64091269 +1
C -3.37135988 +1 -5.48220899 +1 1.44524419 +1
C -3.97315875 +1 -6.76903180 +1 1.11798443 +1
C -3.41055867 +1 -7.92521587 +1 1.55887739 +1
C -5.19697314 +1 -6.73192852 +1 0.28485896 +1
H -1.82763833 +1 -8.80583646 +1 2.64035356 +1
H -1.71573460 +1 -4.65587399 +1 2.48786511 +1
H -3.82655894 +1 -8.92621356 +1 1.34240005 +1
H -5.53466466 +1 -7.72584258 +1 -0.04455707 +1
H -5.03396992 +1 -6.12946730 +1 -0.62771211 +1
H -6.04643596 +1 -6.28287364 +1 0.82709179 +1
O 0.31312708 +1 -3.45702745 +1 0.00994270 +1
O -2.90037798 +1 -5.81067896 +1 -2.14540959 +1
N -1.36709662 +1 -2.27208408 +1 -0.97200872 +1
N -1.29793045 +1 -4.65135838 +1 -1.08088865 +1
C -0.73215772 +1 -3.46509853 +1 -0.64140864 +1
C -2.49917347 +1 -4.70701290 +1 -1.83564188 +1
C -3.09723327 +1 -3.41883475 +1 -2.16517581 +1
C -2.53126451 +1 -2.26324420 +1 -1.72745969 +1
C -4.32213809 +1 -3.45916115 +1 -2.99640183 +1
H -0.97617194 +1 -1.38997757 +1 -0.60037613 +1
H -0.82810044 +1 -5.53522134 +1 -0.81897043 +1
H -2.94604096 +1 -1.26129283 +1 -1.94271973 +1
H -4.66143010 +1 -2.46653245 +1 -3.32802921 +1
H -4.16110967 +1 -4.06424452 +1 -3.90700130 +1
H -5.17072582 +1 -3.90842054 +1 -2.45317606 +1
O 1.72929972 +1 -0.02559662 +1 -6.48243675 +1
O 4.93907769 +1 -2.37111735 +1 -4.31457300 +1
N 3.39891280 +1 1.16329624 +1 -5.48852521 +1
N 3.33249241 +1 -1.21624684 +1 -5.37612151 +1
C 2.76913678 +1 -0.03137533 +1 -5.82276752 +1
C 4.53516121 +1 -1.26830543 +1 -4.62367686 +1
C 5.13236144 +1 0.02085189 +1 -4.29601090 +1
C 4.56405801 +1 1.17469157 +1 -4.73475834 +1
C 6.36002819 +1 -0.01460275 +1 -3.46873308 +1
H 3.00883180 +1 2.04367494 +1 -5.86538960 +1
H 2.88325657 +1 -2.10130033 +1 -5.66874565 +1
H 4.97738089 +1 2.17717400 +1 -4.52100786 +1
H 6.69832193 +1 0.97944717 +1 -3.14064603 +1
H 6.20260150 +1 -0.61850716 +1 -2.55623266 +1
H 7.20735392 +1 -0.46253683 +1 -4.01570483 +1
O 2.60310914 +1 -3.27589939 +1 -9.76490338 +1
O 5.81462769 +1 -0.93489779 +1 -7.59540526 +1
N 4.27441975 +1 -4.46794327 +1 -8.77469829 +1
N 4.20727095 +1 -2.08826996 +1 -8.65831203 +1
C 3.64359389 +1 -3.27267336 +1 -9.10670603 +1
C 5.40994134 +1 -2.03709127 +1 -7.90529889 +1
C 6.00497054 +1 -3.32713317 +1 -7.57687158 +1
C 5.43715088 +1 -4.48080022 +1 -8.01691140 +1
C 7.23004844 +1 -3.28945108 +1 -6.74554229 +1
H 3.88610336 +1 -5.34687513 +1 -9.15636323 +1
H 3.75354683 +1 -1.20323925 +1 -8.94106416 +1
H 5.84925822 +1 -5.48399662 +1 -7.80207698 +1
H 7.56862226 +1 -4.28304439 +1 -6.41580691 +1
H 7.06949006 +1 -2.68535728 +1 -5.83415393 +1
H 8.07918987 +1 -2.84029871 +1 -7.28830685 +1
O 1.18301769 +1 0.15394652 +1 -3.25568751 +1
O -2.03299815 +1 2.48740648 +1 -5.42418527 +1
N -0.48901967 +1 -1.04347583 +1 -4.24259318 +1
N -0.43246238 +1 1.33563277 +1 -4.35036090 +1
C 0.13930744 +1 0.15234272 +1 -3.90966390 +1
C -1.63126382 +1 1.38524722 +1 -5.10998007 +1
C -2.22414788 +1 0.09463419 +1 -5.43839778 +1
C -1.65246035 +1 -1.05776164 +1 -4.99924171 +1
C -3.44896997 +1 0.12761247 +1 -6.27088754 +1
H -0.09415204 +1 -1.92458456 +1 -3.87201570 +1
H 0.03374696 +1 2.22156757 +1 -4.09083665 +1
H -2.06300101 +1 -2.06134020 +1 -5.21396591 +1
H -3.78647221 +1 -0.86793899 +1 -6.59611749 +1
H -3.28913742 +1 0.72761725 +1 -7.18525860 +1
H -4.29747780 +1 0.57848312 +1 -5.72918194 +1
O 2.05709447 +1 3.42048090 +1 -6.54054631 +1
O -1.14629774 +1 1.05576417 +1 -8.70041652 +1
N 0.37340214 +1 4.59849040 +1 -7.52207302 +1
N 0.45073058 +1 2.21906720 +1 -7.63300350 +1
C 1.01433530 +1 3.40720866 +1 -7.19533063 +1
C -0.74950658 +1 2.16071899 +1 -8.38944116 +1
C -1.35323401 +1 3.44639349 +1 -8.71668761 +1
C -0.79094428 +1 4.60305422 +1 -8.27657626 +1
C -2.57809134 +1 3.40718278 +1 -9.54893424 +1
H 0.79672807 +1 5.48714380 +1 -7.20395301 +1
H 0.90522809 +1 1.33501046 +1 -7.34511868 +1
H -1.20776675 +1 5.60341261 +1 -8.49277586 +1
H -2.91799722 +1 4.40103946 +1 -9.87648321 +1
H -2.41557284 +1 2.80699480 +1 -10.46289435 +1
H -3.42444287 +1 2.95336623 +1 -9.00630034 +1
O 1.73172833 +1 -6.90725095 +1 -6.48894859 +1
O 4.94656231 +1 -9.23497846 +1 -4.31272254 +1
N 3.39598864 +1 -5.70685833 +1 -5.49485072 +1
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C 2.76962652 +1 -6.90416752 +1 -5.82576714 +1
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C 5.13247930 +1 -6.84158118 +1 -4.29834447 +1
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Optimized PM6 data set:
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