226 Cellulose 1 beta (ja0257319 s1)

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(Next)          alpha-Chitin (SUSGIW)
Reference: "Crystal Structure and Hydrogen-Bonding System in Cellulose I beta from Synchrotron X-ray and Neutron Fiber Diffraction"
Yoshiharu Nishiyama, Paul Langan, and Henri Chanzy, Journal of the American Chemical Society 2002 124 (31), 9074-9082
Carbohydrates: Glucose, beta-Maltose monohydrate, Sucrose,
alpha-Lactose monohydrate, beta-D-Fructose, beta-D-Galactose,
beta-Cellobiose, Cellulose 1 alpha, Cellulose 1 beta.
                      Unit Cell Parameters:       a      b      c   alpha   beta  gamma   Volume  Density       Heat of Formation (Kcal/mol)
                                     X-ray:    10.38   8.20   7.78  96.55  90.00  90.00    658.26  1.636         -224.2 calc'd using PM7
                                       PM7:    10.27   8.88   7.39  93.11  90.10  99.95    662.77  1.625         -236.0 calc'd using PM7
                                       PM6:    10.43   7.95   7.39  93.22  86.91  95.53    607.94  1.772         -230.0 calc'd using PM6
                                  X-Ray                                             PM7                                            PM6
  X-Ray data set:
 MERS=(1,1,1) GNORM=4 NOOPT OPT-H
 Cellulose 1 beta (ja0257319 s1)

  C     0.00000000 +0   0.00000000 +0   0.00000000 +0
  H     0.93707779 +1   0.07466712 +1   0.59503217 +1
  C    -0.84128541 +0   1.27781032 +0   0.00000000 +0
  H    -1.65232025 +1   1.23690646 +1  -0.77000306 +1
  C    -1.38821471 +0   1.57077752 +0   1.37570024 +0
  H    -0.57531668 +1   1.98171408 +1   2.04164384 +1
  C    -1.99051632 +0   0.33711315 +0   2.01782490 +0
  H    -2.96799339 +1   0.14039635 +1   1.48183427 +1
  C    -1.13784349 +0  -0.88624007 +0   1.89591242 +0
  H    -0.17232174 +1  -0.76519138 +1   2.46267163 +1
  C    -1.81688568 +0  -2.17581130 +0   2.32872794 +0
  H    -2.83521029 +1  -2.31855653 +1   1.92443119 +1
  H    -1.19827203 +1  -3.05492572 +1   2.06302555 +1
  O     0.05848128 +0   2.30691167 +0  -0.41873731 +0
  O    -2.36695553 +0   2.62668420 +0   1.29216028 +0
  O    -2.31602076 +0   0.56273251 +0   3.40297512 +0
  O    -0.78510284 +0  -1.07444872 +0   0.51158561 +0
  O    -1.98596941 +0  -2.18991997 +0   3.73456912 +0
  C    -3.62967794 +0   1.03290797 +0   3.64007188 +0
  O     0.26040399 +0  -0.32349259 +0  -1.35296508 +0
  C     2.78783707 +0  -3.05738027 +0  -1.99230927 +0
  H     3.57927251 +1  -2.98400646 +1  -1.20466898 +1
  C     1.50211833 +0  -2.42629603 +0  -1.51673322 +0
  H     0.64186869 +1  -2.81870615 +1  -2.11803831 +1
  C     1.55064856 +0  -0.91328985 +0  -1.60130650 +0
  H     2.23466168 +1  -0.56442588 +1  -0.76847083 +1
  C     2.09906699 +0  -0.39566192 +0  -2.89340943 +0
  H     1.42039696 +1  -0.65232057 +1  -3.74786387 +1
  C     2.36834911 +0   1.10051716 +0  -2.91229982 +0
  H     2.99906302 +1   1.44004124 +1  -2.06813408 +1
  H     2.84963172 +1   1.42157774 +1  -3.85687154 +1
  O     2.59487299 +0  -4.44286319 +0  -2.28755923 +0
  O     1.22638412 +0  -2.84967544 +0  -0.16596605 +0
  O     3.36875369 +0  -1.02708655 +0  -3.14878861 +0
  O     1.14637142 +0   1.81602251 +0  -2.91293856 +0
  C    -0.84458708 +0   1.52156282 +0  -5.64165722 +0
  H     0.11047221 +1   1.73346495 +1  -5.10996687 +1
  C    -1.79233454 +0   2.71416568 +0  -5.70451820 +0
  H    -2.62358383 +1   2.53373953 +1  -6.43902782 +1
  C    -2.31395273 +0   3.03033517 +0  -4.31832838 +0
  H    -1.49077034 +1   3.35985592 +1  -3.63743290 +1
  C    -2.99947269 +0   1.77832255 +0  -3.76734206 +0
  H    -3.90480600 +1   1.53412485 +1  -4.36336185 +1
  C    -1.99988040 +0   0.60985749 +0  -3.76523825 +0
  H    -1.16557248 +1   0.78503715 +1  -3.05231642 +1
  C    -2.74714858 +0  -0.71727929 +0  -3.43496057 +0
  H    -3.78601871 +1  -0.70746339 +1  -3.80421835 +1
  H    -2.20251690 +1  -1.58066695 +1  -3.85836840 +1
  O    -1.14368118 +0   3.84324683 +0  -6.28588150 +0
  O    -3.19919281 +0   4.13118360 +0  -4.43326616 +0
  O    -3.36026221 +0   1.96402729 +0  -2.38674702 +0
  O    -1.44942282 +0   0.39712785 +0  -5.05208291 +0
  O    -2.91216379 +0  -0.87663593 +0  -2.03769461 +0
  C    -4.69753780 +0   2.40517312 +0  -2.14809095 +0
  O    -0.59851878 +0   1.16435983 +0  -7.00244068 +0
  H    -5.37020504 +1   2.05261150 +1  -2.95681148 +1
  C     1.82639097 +0  -1.59903266 +0  -7.71809597 +0
  H     2.64337484 +1  -1.34671070 +1  -6.98615812 +1
  C     0.51880877 +0  -0.99300899 +0  -7.25464080 +0
  H    -0.34696527 +1  -1.34582675 +1  -7.85864356 +1
  C     0.66726505 +0   0.52979852 +0  -7.26310465 +0
  H     1.41609033 +1   0.86811023 +1  -6.51131256 +1
  C     1.06191836 +0   0.99538275 +0  -8.67547665 +0
  H     0.24464613 +1   0.83480104 +1  -9.40707916 +1
  C     1.44791255 +0   2.50540885 +0  -8.63948972 +0
  H     2.03414798 +1   2.74550539 +1  -7.73965272 +1
  H     2.00331443 +1   2.78966189 +1  -9.55279535 +1
  O     1.76461408 +0  -3.02329730 +0  -7.72825690 +0
  O     0.23895214 +0  -1.50627560 +0  -5.96461302 +0
  O     2.23276410 +0   0.33935358 +0  -9.12690215 +0
  O     0.29750102 +0   3.32717576 +0  -8.70742565 +0
  H    -0.39381560 +1   3.17657991 +1  -0.28379856 +1
  H    -2.49988147 +1   2.98758579 +1   2.20382033 +1
  H    -1.45748848 +1  -1.47337709 +1   4.16058759 +1
  H     3.44683376 +1  -4.86439183 +1  -2.55161155 +1
  H     1.32525589 +1  -3.83475484 +1  -0.11913501 +1
  H     0.71116538 +1   1.75673471 +1  -2.02733560 +1
  H    -0.80127153 +1   4.43247665 +1  -5.57559647 +1
  H    -3.48253441 +1   4.42756339 +1  -3.53636523 +1
  H    -2.07984848 +1  -1.18553251 +1  -1.62239519 +1
  H     2.62242791 +1  -3.36290759 +1  -8.08874330 +1
  H     0.16647746 +1  -0.78546504 +1  -5.30786913 +1
  H    -0.23540477 +1   3.21125460 +1  -7.88830140 +1
  H    -4.30292107 +1   0.82357036 +1   2.77877757 +1
 Tv     6.88237351 +0  -3.47020821 +0  -6.95233506 +0 
 Tv    -0.30972726 +0  -7.45041767 +0   3.41221201 +0 
 Tv     5.81511377 +0   2.74423935 +0   4.38682915 +0 
 

  Optimized PM7 data set:
 MERS=(1,1,1) GNORM=4 OPT
 Cellulose 1 beta (ja0257319 s1)

  C    -0.04270515 +1  -0.02762465 +1  -0.00280949 +1
  H     0.87956512 +1   0.04216953 +1   0.61609376 +1
  C    -0.88813687 +1   1.27696802 +1  -0.01888953 +1
  H    -1.72091943 +1   1.23580139 +1  -0.75904637 +1
  C    -1.38944610 +1   1.54994662 +1   1.40905704 +1
  H    -0.56068481 +1   1.83012421 +1   2.10792227 +1
  C    -2.13875318 +1   0.29530458 +1   1.89545597 +1
  H    -3.06522439 +1   0.11953393 +1   1.30000380 +1
  C    -1.18747740 +1  -0.91657088 +1   1.84019501 +1
  H    -0.25913072 +1  -0.73194741 +1   2.44364264 +1
  C    -1.85596844 +1  -2.21390629 +1   2.30459627 +1
  H    -2.91653383 +1  -2.29360143 +1   1.99780045 +1
  H    -1.28029873 +1  -3.09840219 +1   1.95786092 +1
  O     0.02177585 +1   2.28236431 +1  -0.42514978 +1
  O    -2.26461747 +1   2.64841281 +1   1.33694839 +1
  O    -2.41516310 +1   0.44699529 +1   3.27211352 +1
  O    -0.85427198 +1  -1.10413668 +1   0.47321213 +1
  O    -1.91670294 +1  -2.26054550 +1   3.72276040 +1
  C    -3.70621252 +1   0.88838342 +1   3.57208792 +1
  O     0.21196658 +1  -0.32355678 +1  -1.34496393 +1
  C     2.67706877 +1  -2.99254570 +1  -2.15500980 +1
  H     3.52182945 +1  -2.75368704 +1  -1.45901954 +1
  C     1.33965773 +1  -2.44476955 +1  -1.63883377 +1
  H     0.46791625 +1  -2.77005595 +1  -2.25275952 +1
  C     1.48347921 +1  -0.90583295 +1  -1.60481122 +1
  H     2.23487848 +1  -0.61364214 +1  -0.83691004 +1
  C     1.85134133 +1  -0.34347756 +1  -3.00072669 +1
  H     1.02887061 +1  -0.53413545 +1  -3.72807408 +1
  C     2.20416429 +1   1.15823735 +1  -2.96298868 +1
  H     2.87460630 +1   1.41563704 +1  -2.12344451 +1
  H     2.67787557 +1   1.47754830 +1  -3.91281927 +1
  O     2.55655945 +1  -4.38585144 +1  -2.26236822 +1
  O     1.03643498 +1  -2.87885303 +1  -0.33748860 +1
  O     3.04402855 +1  -0.96260011 +1  -3.45468906 +1
  O     1.01929295 +1   1.91138185 +1  -2.89911717 +1
  C    -0.71981305 +1   1.49886347 +1  -5.59151857 +1
  H     0.23632214 +1   1.66520883 +1  -5.04422588 +1
  C    -1.63116208 +1   2.75044188 +1  -5.64962637 +1
  H    -2.40293661 +1   2.68530111 +1  -6.45706727 +1
  C    -2.26334047 +1   3.00795082 +1  -4.27912022 +1
  H    -1.52372635 +1   3.44018650 +1  -3.56773196 +1
  C    -2.88014662 +1   1.71476544 +1  -3.71092507 +1
  H    -3.78482917 +1   1.42067663 +1  -4.28868905 +1
  C    -1.83551768 +1   0.58146603 +1  -3.68800652 +1
  H    -0.97001793 +1   0.82845801 +1  -3.02915838 +1
  C    -2.47486878 +1  -0.76380976 +1  -3.30053332 +1
  H    -3.46983434 +1  -0.88190615 +1  -3.77545490 +1
  H    -1.82279873 +1  -1.61809842 +1  -3.56991241 +1
  O    -0.82106380 +1   3.81519754 +1  -6.08089149 +1
  O    -3.30033095 +1   3.94283032 +1  -4.47916525 +1
  O    -3.17970801 +1   1.94473525 +1  -2.34465160 +1
  O    -1.39042988 +1   0.37278067 +1  -5.02018759 +1
  O    -2.75854512 +1  -0.78825069 +1  -1.92432611 +1
  C    -4.50443292 +1   2.29139796 +1  -2.04585870 +1
  O    -0.55166785 +1   1.14526615 +1  -6.93607775 +1
  H    -5.24651869 +1   1.90553886 +1  -2.77604595 +1
  C     1.93525736 +1  -1.51728193 +1  -7.72874447 +1
  H     2.80556476 +1  -1.27638822 +1  -7.07328723 +1
  C     0.63054028 +1  -0.94085009 +1  -7.16105563 +1
  H    -0.27144096 +1  -1.36199509 +1  -7.66030482 +1
  C     0.71953602 +1   0.59817626 +1  -7.26246969 +1
  H     1.51469792 +1   0.98184526 +1  -6.57894829 +1
  C     0.96435473 +1   1.07371130 +1  -8.70776048 +1
  H     0.09656799 +1   0.84306911 +1  -9.36593101 +1
  C     1.33318747 +1   2.57577788 +1  -8.74473955 +1
  H     2.11320193 +1   2.81599222 +1  -7.99639024 +1
  H     1.68223375 +1   2.88322673 +1  -9.75235590 +1
  O     1.78084217 +1  -2.91039772 +1  -7.81209790 +1
  O     0.59040628 +1  -1.28917633 +1  -5.79608427 +1
  O     2.12554024 +1   0.44256386 +1  -9.21675039 +1
  O     0.18616926 +1   3.35599073 +1  -8.53866388 +1
  H    -0.43820688 +1   3.16626859 +1  -0.44255119 +1
  H    -2.79126712 +1   2.71349378 +1   2.17524258 +1
  H    -1.08143702 +1  -1.90557610 +1   4.11667409 +1
  H     3.34887991 +1  -4.78507781 +1  -2.71090374 +1
  H     1.76619750 +1  -3.42018420 +1   0.04086817 +1
  H     0.64572488 +1   1.92707249 +1  -1.98304584 +1
  H    -0.15121872 +1   4.09949478 +1  -5.41059220 +1
  H    -3.70551061 +1   4.16808429 +1  -3.59963661 +1
  H    -1.96063410 +1  -1.02347505 +1  -1.39578813 +1
  H     2.58320526 +1  -3.32652591 +1  -8.21378184 +1
  H    -0.22628879 +1  -0.90773401 +1  -5.39159740 +1
  H    -0.12772953 +1   3.34307132 +1  -7.60595230 +1
  H    -4.46666185 +1   0.63862494 +1   2.79954903 +1
 Tv     6.63593608 +1  -3.27682589 +1  -7.12459507 +1 
 Tv    -1.28150385 +1  -7.55376688 +1   4.49341617 +1 
 Tv     5.62920581 +1   2.07819997 +1   4.30632196 +1 
 

  Optimized PM6 data set:
 MERS=(1,1,1) GNORM=4 PM6 OPT
 Cellulose 1 beta (ja0257319 s1)

  C    -0.01346776 +1  -0.05251852 +1  -0.01572444 +1
  H     0.88684833 +1  -0.07120817 +1   0.64100664 +1
  C    -0.79515739 +1   1.28595048 +1  -0.00942695 +1
  H    -1.57914653 +1   1.31741115 +1  -0.81553276 +1
  C    -1.39525824 +1   1.56482333 +1   1.38585652 +1
  H    -0.61181296 +1   1.87384771 +1   2.13447512 +1
  C    -2.16859237 +1   0.32718473 +1   1.87004394 +1
  H    -3.12609876 +1   0.20814240 +1   1.31026181 +1
  C    -1.28130290 +1  -0.93515916 +1   1.78824320 +1
  H    -0.32959364 +1  -0.80122535 +1   2.37557994 +1
  C    -2.02104681 +1  -2.16899964 +1   2.30364916 +1
  H    -3.10823738 +1  -2.19341410 +1   2.07769693 +1
  H    -1.56044574 +1  -3.11758427 +1   1.95380983 +1
  O     0.20906222 +1   2.27503544 +1  -0.30321169 +1
  O    -2.29348910 +1   2.66489952 +1   1.20784368 +1
  O    -2.41230078 +1   0.47547128 +1   3.29499964 +1
  O    -0.92917128 +1  -1.12396902 +1   0.39851244 +1
  O    -1.89080919 +1  -2.20453421 +1   3.74365138 +1
  C    -3.72001758 +1   0.90705440 +1   3.65024593 +1
  O     0.28092218 +1  -0.36119070 +1  -1.36854965 +1
  C     2.80810077 +1  -3.08461722 +1  -2.09469222 +1
  H     3.70938531 +1  -3.02969022 +1  -1.42997846 +1
  C     1.59326997 +1  -2.39453840 +1  -1.44490194 +1
  H     0.64781923 +1  -2.82795886 +1  -1.85873788 +1
  C     1.63338106 +1  -0.85970588 +1  -1.59818023 +1
  H     2.33543120 +1  -0.43210430 +1  -0.84244705 +1
  C     1.97598084 +1  -0.38050743 +1  -3.02536224 +1
  H     1.15526723 +1  -0.62020167 +1  -3.74917637 +1
  C     2.36341522 +1   1.10511164 +1  -3.10664058 +1
  H     3.07500385 +1   1.42022730 +1  -2.31153833 +1
  H     2.80196982 +1   1.34791296 +1  -4.10029821 +1
  O     2.39499519 +1  -4.44840532 +1  -2.28156416 +1
  O     1.62654454 +1  -2.58141296 +1  -0.03279959 +1
  O     3.20125045 +1  -1.04698410 +1  -3.42642272 +1
  O     1.17789664 +1   1.91703892 +1  -3.05099533 +1
  C    -0.72247279 +1   1.50984856 +1  -5.56217194 +1
  H     0.22319758 +1   1.60141280 +1  -4.98233352 +1
  C    -1.57879019 +1   2.80526085 +1  -5.62148603 +1
  H    -2.28450419 +1   2.78536726 +1  -6.50693755 +1
  C    -2.32423033 +1   3.09256568 +1  -4.31155666 +1
  H    -1.65314976 +1   3.60880254 +1  -3.58229877 +1
  C    -2.92226321 +1   1.81529324 +1  -3.69895007 +1
  H    -3.85245210 +1   1.52925804 +1  -4.24615183 +1
  C    -1.91559834 +1   0.64821607 +1  -3.66536127 +1
  H    -1.01949667 +1   0.87523340 +1  -3.03490655 +1
  C    -2.59061997 +1  -0.64729739 +1  -3.19642854 +1
  H    -3.63121674 +1  -0.74176909 +1  -3.56658658 +1
  H    -1.99404495 +1  -1.54008190 +1  -3.47011931 +1
  O    -0.70943663 +1   3.89551322 +1  -5.93574273 +1
  O    -3.39775474 +1   3.98475095 +1  -4.65502609 +1
  O    -3.19876622 +1   2.08982373 +1  -2.30232406 +1
  O    -1.50827747 +1   0.41139296 +1  -5.03171921 +1
  O    -2.68984983 +1  -0.50975534 +1  -1.76771810 +1
  C    -4.56178678 +1   2.32318879 +1  -1.99967865 +1
  O    -0.52224377 +1   1.12575008 +1  -6.91949661 +1
  H    -5.26840318 +1   1.90112694 +1  -2.75519678 +1
  C     2.02126680 +1  -1.57918585 +1  -7.70388596 +1
  H     2.92574505 +1  -1.37259182 +1  -7.06728026 +1
  C     0.74822102 +1  -0.96904391 +1  -7.07581428 +1
  H    -0.17894167 +1  -1.40594618 +1  -7.50991565 +1
  C     0.78671398 +1   0.57179979 +1  -7.22705573 +1
  H     1.55832780 +1   1.01332421 +1  -6.54918899 +1
  C     0.99040663 +1   0.99997669 +1  -8.70036358 +1
  H     0.11491268 +1   0.68451554 +1  -9.32546482 +1
  C     1.28996889 +1   2.49809577 +1  -8.89851248 +1
  H     2.12342060 +1   2.83406669 +1  -8.24558862 +1
  H     1.53599366 +1   2.72493105 +1  -9.96372777 +1
  O     1.79330151 +1  -2.99066882 +1  -7.76571721 +1
  O     0.81533838 +1  -1.25765734 +1  -5.67672680 +1
  O     2.18403174 +1   0.38567182 +1  -9.22204558 +1
  O     0.13513055 +1   3.29465205 +1  -8.64889480 +1
  H    -0.15261258 +1   3.18637902 +1  -0.02248667 +1
  H    -2.77573428 +1   2.83817645 +1   2.08082432 +1
  H    -1.76208869 +1  -1.27335546 +1   4.10895691 +1
  H     3.16812190 +1  -5.02416647 +1  -2.57436050 +1
  H     1.24309568 +1  -3.48041339 +1   0.22919373 +1
  H     0.79933116 +1   1.90018498 +1  -2.11226009 +1
  H    -0.18425035 +1   4.21340606 +1  -5.13776765 +1
  H    -3.86922563 +1   4.25983416 +1  -3.80972146 +1
  H    -2.21760431 +1  -1.26587718 +1  -1.31644122 +1
  H     2.60647613 +1  -3.45031507 +1  -8.18462541 +1
  H     0.07467859 +1  -1.89789441 +1  -5.43250191 +1
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  H    -4.48596402 +1   0.63575122 +1   2.88194092 +1
 Tv     6.79590316 +1  -3.39442205 +1  -7.14549335 +1 
 Tv    -0.66602589 +1  -6.95598857 +1   3.79000880 +1 
 Tv     5.85354866 +1   2.08949580 +1   3.99367554 +1