225 Cellulose 1 alpha (ja037055wsi20030711 112804)
(Previous) alpha-Ketoglutaric acid (COTPAC)
(Back) Elements:
O 5
C 6
H 10
(Z = 8)
(Periodic Table)
(Next) Cellulose 1 beta (ja0257319 s1)
Reference: "Crystal Structure and Hydrogen Bonding System in Cellulose I alpha from Synchrotron X-ray and Neutron Fiber Diffraction"
Yoshiharu Nishiyama, Junji Sugiyama, Henri Chanzy, and Paul Langan, Journal of the American Chemical Society 2003 125 (47), 14300-14306
Carbohydrates: Glucose, beta-Maltose monohydrate, Sucrose,
alpha-Lactose monohydrate, beta-D-Fructose, beta-D-Galactose,
beta-Cellobiose, Cellulose 1 alpha, Cellulose 1 beta.
Unit Cell Parameters: a b c alpha beta gamma Volume Density Heat of Formation (Kcal/mol)
X-ray: 10.40 5.96 6.72 80.37 114.79 118.08 333.33 1.615 -230.9 calc'd using PM7
PM7: 10.30 5.77 6.66 79.34 109.87 118.91 325.65 1.654 -243.1 calc'd using PM7
PM6: 10.48 5.75 6.37 80.49 113.78 120.44 302.52 1.780 -232.0 calc'd using PM6
X-Ray PM7 PM6
X-Ray data set:
MERS=(1,2,2) GNORM=4 1SCF
Cellulose 1 alpha (ja037055wsi20030711 112804)
O 0.00000000 +0 0.00000000 +0 0.00000000 +0
C 1.43085700 +0 0.00000000 +0 0.00000000 +0
H 1.78907461 +1 1.04755614 +1 0.01964766 +1
O 1.83404748 +0 -0.73503219 +0 1.11800438 +0
C 1.89219801 +0 -0.81553528 +0 -1.22827233 +0
H 1.52940775 +1 -1.87075039 +1 -1.16070584 +1
C 1.36726574 +0 -0.13240981 +0 -2.45973004 +0
H 1.87076106 +1 0.85574797 +1 -2.61555680 +1
C -0.13519529 +0 0.06891445 +0 -2.38756779 +0
H -0.61414131 +1 -0.94835111 +1 -2.48594575 +1
C -0.59940237 +0 0.70372731 +0 -1.09714943 +0
H -0.28835128 +1 1.77589469 +1 -1.02825572 +1
C -2.10828983 +0 0.57536095 +0 -0.88885533 +0
H -2.47285768 +1 -0.45057496 +1 -1.08307057 +1
H -2.41345148 +1 0.91150173 +1 0.12045459 +1
O 3.31689243 +0 -0.84127812 +0 -1.21465880 +0
O 1.72399238 +0 -0.93752689 +0 -3.58828617 +0
O -2.77098139 +0 1.48081940 +0 -1.74931908 +0
O 3.73960268 +0 0.00820535 +0 4.12344090 +0
C -1.12634704 +0 0.21573314 +0 -4.57882720 +0
H -1.35631414 +1 -0.84814046 +1 -4.34726359 +1
O -0.63970255 +0 0.89310793 +0 -3.44387849 +0
C 1.50057391 +0 0.75686184 +0 4.56425382 +0
H 1.69279754 +1 1.84848546 +1 4.45437257 +1
C 1.04472800 +0 0.07440219 +0 3.28899573 +0
H 0.65901626 +1 -0.95783244 +1 3.49604520 +1
C 2.18957027 +0 0.02726698 +0 2.28329931 +0
H 2.42374670 +1 1.07451409 +1 1.96307031 +1
C 3.43054541 +0 -0.61805842 +0 2.87009242 +0
H 3.25708651 +1 -1.70675056 +1 3.07154706 +1
C 4.65120577 +0 -0.45097587 +0 1.99153617 +0
H 4.73589557 +1 0.56000727 +1 1.55193700 +1
H 5.58534358 +1 -0.66118079 +1 2.55328013 +1
O 0.48048265 +0 0.70865520 +0 5.56337024 +0
O -0.06445754 +0 0.79394000 +0 2.75954469 +0
O 4.57900308 +0 -1.29697807 +0 0.86159394 +0
H 3.59422076 +1 -1.35634438 +1 -0.41207076 +1
H 2.70849119 +1 -1.01877184 +1 -3.62530217 +1
H -2.48735315 +1 1.35006443 +1 -2.68037124 +1
H -0.18694053 +1 0.01776822 +1 5.36033653 +1
H -0.31088047 +1 0.42153636 +1 1.87632539 +1
H 5.13734826 +1 -2.09685888 +1 0.99191608 +1
O 0.59164918 +0 -4.87733553 +0 -3.37637683 +0
C 2.02250619 +0 -4.87733553 +0 -3.37637683 +0
H 2.38069428 +1 -3.82982421 +1 -3.35695046 +1
O 2.42569667 +0 -5.61236772 +0 -2.25837245 +0
C 2.48384720 +0 -5.69287082 +0 -4.60464916 +0
H 2.12146507 +1 -6.74784791 +1 -4.53735516 +1
C 1.95891492 +0 -5.00974534 +0 -5.83610687 +0
H 2.46218136 +1 -4.02143030 +1 -5.99224879 +1
C 0.45645390 +0 -4.80842109 +0 -5.76394462 +0
H -0.02219008 +1 -5.82571862 +1 -5.86243996 +1
C -0.00775318 +0 -4.17360823 +0 -4.47352626 +0
H 0.30324384 +1 -3.10144797 +1 -4.40457569 +1
C -1.51664065 +0 -4.30197458 +0 -4.26523216 +0
H -1.88105464 +1 -5.32799818 +1 -4.45823522 +1
H -1.82185600 +1 -3.96485678 +1 -3.25618423 +1
O 3.90854161 +0 -5.71861365 +0 -4.59103563 +0
O 2.31564157 +0 -5.81486242 +0 -6.96466300 +0
O -2.17933221 +0 -3.39651614 +0 -5.12569591 +0
O 4.33125187 +0 -4.86913018 +0 0.74706407 +0
C -0.53469785 +0 -4.66160239 +0 -7.95520403 +0
H -0.76445372 +1 -5.72594851 +1 -7.72336438 +1
O -0.04805337 +0 -3.98422760 +0 -6.82025532 +0
C 2.09222310 +0 -4.12047369 +0 1.18787699 +0
H 2.28065411 +1 -3.02828030 +1 1.07952609 +1
C 1.63637719 +0 -4.80293334 +0 -0.08738111 +0
H 1.25076825 +1 -5.83521813 +1 0.11938672 +1
C 2.78121945 +0 -4.85006855 +0 -1.09307752 +0
H 3.01548853 +1 -3.80291371 +1 -1.41333646 +1
C 4.02219459 +0 -5.49539395 +0 -0.50628441 +0
H 3.84896621 +1 -6.58406600 +1 -0.30493869 +1
C 5.24285495 +0 -5.32831141 +0 -1.38484066 +0
H 5.32747723 +1 -4.31678094 +1 -1.82340238 +1
H 6.17695955 +1 -5.53846795 +1 -0.82288981 +1
O 1.07213183 +0 -4.16868033 +0 2.18699341 +0
O 0.52719164 +0 -4.08339553 +0 -0.61683215 +0
O 5.17065227 +0 -6.17431360 +0 -2.51478289 +0
H 4.18532449 +1 -6.23608983 +1 -3.79049958 +1
H 3.30082520 +1 -5.88832973 +1 -7.00579473 +1
H -1.90239481 +1 -3.53245419 +1 -6.05910856 +1
H 0.45533939 +1 -4.91811685 +1 2.03164968 +1
H 0.27903400 +1 -4.45809655 +1 -1.49874064 +1
H 5.73777876 +1 -6.96920756 +1 -2.38641447 +1
O -6.45228469 +0 -1.79280209 +0 -0.52437503 +0
C -5.02142769 +0 -1.79280209 +0 -0.52437503 +0
H -4.66316835 +1 -0.74521529 +1 -0.50471700 +1
O -4.61823721 +0 -2.52783428 +0 0.59362936 +0
C -4.56008668 +0 -2.60833737 +0 -1.75264736 +0
H -4.92252151 +1 -3.66315951 +1 -1.68548371 +1
C -5.08501896 +0 -1.92521189 +0 -2.98410506 +0
H -4.58040333 +1 -0.93755889 +1 -3.14000236 +1
C -6.58747998 +0 -1.72388764 +0 -2.91194282 +0
H -7.06599058 +1 -2.74115512 +1 -3.01038411 +1
C -7.05168706 +0 -1.08907478 +0 -1.62152446 +0
H -6.74080398 +1 -0.01689474 +1 -1.55263564 +1
C -8.56057452 +0 -1.21744114 +0 -1.41323036 +0
H -8.92443599 +1 -2.24387294 +1 -1.60466375 +1
H -8.86483650 +1 -0.87956912 +1 -0.40409944 +1
O -3.13539226 +0 -2.63408021 +0 -1.73903383 +0
O -4.72829231 +0 -2.73032898 +0 -4.11266120 +0
O -9.22326608 +0 -0.31198269 +0 -2.27369411 +0
O -2.71268201 +0 -1.78459674 +0 3.59906587 +0
C -7.57863173 +0 -1.57706894 +0 -5.10320223 +0
H -7.80781020 +1 -2.64108628 +1 -4.87184944 +1
O -7.09198724 +0 -0.89969416 +0 -3.96825352 +0
C -4.95171078 +0 -1.03594025 +0 4.03987880 +0
H -4.76397288 +1 0.05643713 +1 3.93198953 +1
C -5.40755669 +0 -1.71839990 +0 2.76462070 +0
H -5.79197510 +1 -2.75117315 +1 2.97175417 +1
C -4.26271443 +0 -1.76553511 +0 1.75892428 +0
H -4.02879936 +1 -0.71827543 +1 1.43870561 +1
C -3.02173929 +0 -2.41086051 +0 2.34571739 +0
H -3.19486400 +1 -3.49947598 +1 2.54711984 +1
C -1.80107893 +0 -2.24377796 +0 1.46716114 +0
H -1.71677083 +1 -1.23252325 +1 1.02799877 +1
H -0.86697049 +1 -2.45328930 +1 2.02914555 +1
O -5.97180205 +0 -1.08414688 +0 5.03899521 +0
O -6.51674223 +0 -0.99886208 +0 2.23516966 +0
O -1.87328161 +0 -3.08978016 +0 0.33721891 +0
H -2.85975514 +1 -3.15693329 +1 -0.94383352 +1
H -3.74285469 +1 -2.79366933 +1 -4.16028695 +1
H -8.95983191 +1 -0.46265158 +1 -3.20977005 +1
H -6.57182884 +1 -1.85052691 +1 4.89823827 +1
H -6.77717960 +1 -1.39064807 +1 1.36311982 +1
H -1.31032588 +1 -3.88711293 +1 0.46747013 +1
O -5.86063551 +0 -6.67013762 +0 -3.90075186 +0
C -4.42977851 +0 -6.67013762 +0 -3.90075186 +0
H -4.07147721 +1 -5.62263729 +1 -3.88111448 +1
O -4.02658802 +0 -7.40516981 +0 -2.78274748 +0
C -3.96843749 +0 -7.48567290 +0 -5.12902419 +0
H -4.33023272 +1 -8.54042444 +1 -5.06183912 +1
C -4.49336977 +0 -6.80254743 +0 -6.36048190 +0
H -3.98988100 +1 -5.81439789 +1 -6.51650612 +1
C -5.99583080 +0 -6.60122318 +0 -6.28831965 +0
H -6.47473984 +1 -7.61847167 +1 -6.38681436 +1
C -6.46003787 +0 -5.96641032 +0 -4.99790129 +0
H -6.14891721 +1 -4.89429202 +1 -4.92883761 +1
C -7.96892534 +0 -6.09477667 +0 -4.78960719 +0
H -8.33361911 +1 -7.12050517 +1 -4.98423279 +1
H -8.27474506 +1 -5.75829600 +1 -3.78069065 +1
O -2.54374308 +0 -7.51141574 +0 -5.11541066 +0
O -4.13664312 +0 -7.60766451 +0 -7.48903803 +0
O -8.63161690 +0 -5.18931822 +0 -5.65007094 +0
O -2.12103282 +0 -6.66193227 +0 0.22268904 +0
C -6.98698254 +0 -6.45440448 +0 -8.47957906 +0
H -7.21661519 +1 -7.51845247 +1 -8.24805740 +1
O -6.50033806 +0 -5.77702969 +0 -7.34463035 +0
C -4.36006159 +0 -5.91327578 +0 0.66350196 +0
H -4.17076651 +1 -4.82115553 +1 0.55471775 +1
C -4.81590750 +0 -6.59573543 +0 -0.61175613 +0
H -5.20095502 +1 -7.62818405 +1 -0.40452412 +1
C -3.67106524 +0 -6.64287064 +0 -1.61745255 +0
H -3.43705249 +1 -5.59560943 +1 -1.93771046 +1
C -2.43009010 +0 -7.28819604 +0 -1.03065944 +0
H -2.60372218 +1 -8.37690114 +1 -0.82902450 +1
C -1.20942974 +0 -7.12111349 +0 -1.90921569 +0
H -1.12523179 +1 -6.10997793 +1 -2.34890488 +1
H -0.27529759 +1 -7.32967843 +1 -1.34713222 +1
O -5.38015286 +0 -5.96148242 +0 1.66261838 +0
O -5.92509305 +0 -5.87619762 +0 -1.14120717 +0
O -1.28163242 +0 -7.96711569 +0 -3.03915792 +0
H -2.26732693 +1 -8.03263064 +1 -4.31880505 +1
H -3.15197189 +1 -7.68565284 +1 -7.52762458 +1
H -8.34477062 +1 -5.31313480 +1 -6.58166317 +1
H -6.01525345 +1 -6.69034338 +1 1.49146256 +1
H -6.17510740 +1 -6.25512767 +1 -2.01998197 +1
H -0.72005897 +1 -8.76477587 +1 -2.91129848 +1
Tv 3.82316229 +0 -0.24616838 +0 9.66865230 +0
Tv 1.18329837 +0 -9.75467107 +0 -6.75275366 +0
Tv -12.90456939 +0 -3.58560417 +0 -1.04875005 +0
Optimized PM7 data set:
MERS=(1,2,2) GNORM=4 OPT
Cellulose 1 alpha (ja037055wsi20030711 112804)
O 0.13335954 +1 0.10423012 +1 -0.03697518 +1
C 1.56513427 +1 0.04024510 +1 -0.06800083 +1
H 1.96605819 +1 1.07670632 +1 -0.05989607 +1
O 1.91596925 +1 -0.71256547 +1 1.06008578 +1
C 2.06735408 +1 -0.83505193 +1 -1.23541678 +1
H 1.86815180 +1 -1.91698770 +1 -1.04560049 +1
C 1.45643658 +1 -0.38651887 +1 -2.57066956 +1
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