Time stamp: Thu Mar 11 08:55:57 2021
beta-Cellobiose (CELLOB04)
308 beta-Cellobiose (CELLOB04)
(Previous) Sucrose (SUCROS01)
(Back) Elements:
O 11
H 22
C 12
(Z = 4)
(Periodic Table)
(Next) Aconitine (ACONTO10)
Carbohydrates: Glucose, beta-Maltose monohydrate, Sucrose,
alpha-Lactose monohydrate, beta-D-Fructose, beta-D-Galactose,
beta-Cellobiose, Cellulose 1 alpha, Cellulose 1 beta.
Unit Cell Parameters: a b c alpha beta gamma Volume Density Heat of Formation (Kcal/mol)
X-ray: 10.95 13.02 5.06 90.00 90.81 90.00 721.53 1.576 -412.6 calc'd using PM7
PM7: 10.82 12.72 4.73 89.93 91.19 89.97 650.62 1.747 -562.4 calc'd using PM7 (ref: 0.0)
PM6_D3H4: 10.77 12.99 4.78 88.95 90.31 90.54 668.76 1.700 -584.2 calc'd using PM6_D3H4
X-Ray PM7 PM6_D3H4
|
Calc'd on: Feb 26 2021 @ 02:43:45 |
Feb 25 2021 @ 09:31:58
ARC file |
Feb 27 2021 @ 23:56:25 |
For X-Ray structure, contact the CCDC: http://www.ccdc.cam.ac.uk/
Optimized PM7 data set:
MERS=(1,1,2) CHARGE=0 OUTPUT THREADS=1 PM7 GRADIENTS NOTXT EF
beta-Cellobiose (CELLOB04)
O 0.12240406 +1 0.1049000 +1 0.0847289 +1
O 3.69065834 +1 0.1998333 +1 0.3408581 +1
O 5.21242858 +1 1.7951070 +1 0.1447933 +1
H 5.79408853 +1 1.6368024 +1 0.9441213 +1
O 3.06493471 +1 3.7381525 +1 -0.0789792 +1
H 3.96769447 +1 4.1379363 +1 -0.1979540 +1
O 0.93609990 +1 2.5419469 +1 -1.5162129 +1
H 0.07999578 +1 2.1064300 +1 -1.7527638 +1
O 3.17050522 +1 -2.4492813 +1 1.2257436 +1
H 4.15323936 +1 -2.3125581 +1 1.1379154 +1
O -1.12569558 +1 0.7993797 +1 -1.6250525 +1
O -4.16954125 +1 -0.4631548 +1 -3.1032539 +1
H -4.86599507 +1 0.2153544 +1 -3.3412932 +1
O -4.16766230 +1 -1.8784338 +1 -0.6593679 +1
H -4.60988876 +1 -1.2533755 +1 -0.0028984 +1
O -1.63531729 +1 -1.8985734 +1 0.7261254 +1
H -1.54464467 +1 -2.7755957 +1 0.2688912 +1
O -1.24498120 +1 2.7582769 +1 -3.1396493 +1
H -0.83198545 +1 2.7564780 +1 -4.0435557 +1
C 1.41123747 +1 0.4378350 +1 -0.4181999 +1
H 1.54647786 +1 0.0860925 +1 -1.4659115 +1
C 2.38146212 +1 -0.2787351 +1 0.5427022 +1
H 2.10193613 +1 -0.1267756 +1 1.6096576 +1
C 3.88344998 +1 1.6025194 +1 0.5038251 +1
H 3.70218499 +1 1.8701013 +1 1.5655637 +1
C 3.02275595 +1 2.3968212 +1 -0.5007810 +1
H 3.39153920 +1 2.3170855 +1 -1.5476650 +1
C 1.54100539 +1 1.9762677 +1 -0.3865223 +1
H 1.05793874 +1 2.4199454 +1 0.5168204 +1
C 2.46882073 +1 -1.7817316 +1 0.2110518 +1
H 1.46180076 +1 -2.2470308 +1 0.2169344 +1
H 2.97220152 +1 -1.9674017 +1 -0.7588929 +1
C -0.77110059 +1 -0.3587155 +1 -0.8960565 +1
H -0.29905296 +1 -1.1109231 +1 -1.5630575 +1
C -2.13288163 +1 0.6172396 +1 -2.6077781 +1
H -1.71242768 +1 0.0071982 +1 -3.4405474 +1
C -3.39737564 +1 -0.0418912 +1 -2.0100146 +1
H -3.98430795 +1 0.6596630 +1 -1.3651598 +1
C -3.02172334 +1 -1.3133260 +1 -1.2154966 +1
H -2.63263586 +1 -2.1410444 +1 -1.8564417 +1
C -2.01220458 +1 -0.8746196 +1 -0.1398282 +1
H -2.44696143 +1 -0.0969644 +1 0.5381013 +1
C -2.45599046 +1 2.0568820 +1 -3.0460577 +1
H -3.00881748 +1 2.0679835 +1 -4.0022071 +1
H -3.02595411 +1 2.6107968 +1 -2.2707537 +1
O 0.18045081 +1 7.4686180 +1 -5.6973424 +1
O 0.41938100 +1 10.2524567 +1 -7.9330242 +1
O 1.95127190 +1 10.9721245 +1 -9.3617470 +1
H 1.38809575 +1 11.2033604 +1 -10.1538066 +1
O 3.44986570 +1 8.5272860 +1 -8.8562368 +1
H 3.96428869 +1 9.1639720 +1 -9.4256553 +1
O 3.15078755 +1 7.9653268 +1 -6.0466501 +1
H 2.86369254 +1 7.5022675 +1 -5.2204181 +1
O -2.32059211 +1 10.3552277 +1 -7.2618213 +1
H -2.13139141 +1 11.2189306 +1 -7.7229464 +1
O 1.61723110 +1 6.9076735 +1 -4.0901482 +1
O 1.19101153 +1 5.5261652 +1 -0.7826585 +1
H 1.81868652 +1 4.7867974 +1 -0.5343726 +1
O -1.37411682 +1 5.0648635 +1 -1.8512586 +1
H -1.27521574 +1 4.1756221 +1 -2.3121091 +1
O -1.97626932 +1 6.5865005 +1 -4.2555516 +1
H -2.43048604 +1 7.1429057 +1 -3.5686768 +1
O 4.06992228 +1 6.7330011 +1 -3.7961512 +1
H 4.62279481 +1 7.4624500 +1 -3.4039029 +1
C 0.83665239 +1 8.6182450 +1 -6.2218067 +1
H 1.13716364 +1 9.3219349 +1 -5.4129659 +1
C -0.20705859 +1 9.2578171 +1 -7.1566486 +1
H -0.67876898 +1 8.5088410 +1 -7.8325657 +1
C 1.47701854 +1 9.8052815 +1 -8.7766237 +1
H 1.06498808 +1 9.1073116 +1 -9.5345784 +1
C 2.62966044 +1 9.2126469 +1 -7.9376955 +1
H 3.22134224 +1 9.9913118 +1 -7.4050981 +1
C 2.10400082 +1 8.1357856 +1 -6.9629088 +1
H 1.93771897 +1 7.1624646 +1 -7.4840713 +1
C -1.29047268 +1 10.0186564 +1 -6.3677340 +1
H -1.76852130 +1 9.3601529 +1 -5.6144292 +1
H -0.89744557 +1 10.9338714 +1 -5.8854218 +1
C 0.28717992 +1 7.3398737 +1 -4.3010498 +1
H 0.10106357 +1 8.3049498 +1 -3.7836085 +1
C 1.94360103 +1 6.5883595 +1 -2.7467876 +1
H 1.94443362 +1 7.5259141 +1 -2.1441483 +1
C 0.95967195 +1 5.5468262 +1 -2.1668456 +1
H 1.10423208 +1 4.5260445 +1 -2.6020967 +1
C -0.49816318 +1 6.0151501 +1 -2.3718089 +1
H -0.76002146 +1 6.9299306 +1 -1.7872666 +1
C -0.68543284 +1 6.2152387 +1 -3.8869941 +1
H -0.50558779 +1 5.2668070 +1 -4.4522265 +1
C 3.34931334 +1 5.9730124 +1 -2.8619178 +1
H 3.85615313 +1 5.9435869 +1 -1.8802999 +1
H 3.32335708 +1 4.9570643 +1 -3.3071883 +1
O 0.70045691 +1 2.3159105 +1 4.2469763 +1
O 4.27086038 +1 2.4419628 +1 4.4778957 +1
O 5.78813002 +1 4.0371923 +1 4.2680681 +1
H 6.39699682 +1 3.8410017 +1 5.0349040 +1
O 3.59846686 +1 5.9747213 +1 4.1944262 +1
H 4.48188820 +1 6.4061999 +1 4.0270552 +1
O 1.51308256 +1 4.7361752 +1 2.6323563 +1
H 0.65998577 +1 4.2926518 +1 2.3974765 +1
O 3.77846228 +1 -0.0995776 +1 5.5659935 +1
H 4.75953353 +1 -0.0935451 +1 5.3871193 +1
O -0.53646182 +1 2.9795074 +1 2.5149003 +1
O -3.61255905 +1 1.7425693 +1 1.0746062 +1
H -4.31071431 +1 2.4290038 +1 0.8689205 +1
O -3.57288346 +1 0.2936814 +1 3.4929955 +1
H -4.02001047 +1 0.9101273 +1 4.1511629 +1
O -1.02772283 +1 0.2849247 +1 4.8735487 +1
H -0.98727723 +1 -0.6009395 +1 4.4241485 +1
O -0.66763714 +1 4.9340301 +1 1.0167972 +1
H -0.22608128 +1 4.9461065 +1 0.1232594 +1
C 1.99227783 +1 2.6574107 +1 3.7580592 +1
H 2.14492539 +1 2.2969559 +1 2.7163032 +1
C 2.96697754 +1 1.9733330 +1 4.7341488 +1
H 2.70397639 +1 2.1761149 +1 5.7972830 +1
C 4.46980159 +1 3.8402425 +1 4.6606205 +1
H 4.31920528 +1 4.0905703 +1 5.7315783 +1
C 3.57882366 +1 4.6545963 +1 3.6982134 +1
H 3.94999850 +1 4.6381852 +1 2.6486215 +1
C 2.10563417 +1 4.1982016 +1 3.7826947 +1
H 1.59432740 +1 4.6400731 +1 4.6717724 +1
C 3.06238581 +1 0.4555318 +1 4.4916810 +1
H 2.06122126 +1 -0.0180495 +1 4.5352990 +1
H 3.56366683 +1 0.2102497 +1 3.5362330 +1
C -0.17829923 +1 1.8327882 +1 3.2608281 +1
H 0.30896455 +1 1.0789719 +1 2.6073097 +1
C -1.54639418 +1 2.7842908 +1 1.5372573 +1
H -1.13114729 +1 2.1546650 +1 0.7164567 +1
C -2.81176591 +1 2.1446476 +1 2.1547820 +1
H -3.37713941 +1 2.8512501 +1 2.8131091 +1
C -2.43089541 +1 0.8692825 +1 2.9390694 +1
H -2.03624963 +1 0.0481507 +1 2.2933701 +1
C -1.41944310 +1 1.3084273 +1 4.0135238 +1
H -1.85469863 +1 2.0813803 +1 4.6959325 +1
C -1.87002153 +1 4.2137500 +1 1.0658832 +1
H -2.38062441 +1 4.2031289 +1 0.0856275 +1
H -2.48179303 +1 4.7676799 +1 1.8067405 +1
O 0.71751922 +1 9.6500565 +1 -1.5047821 +1
O 0.92552497 +1 12.4262964 +1 -3.7523828 +1
O 2.44609058 +1 13.1445837 +1 -5.1905909 +1
H 1.89732648 +1 13.3267061 +1 -6.0087291 +1
O 3.99946446 +1 10.7432513 +1 -4.6441558 +1
H 4.45835719 +1 11.3743175 +1 -5.2611149 +1
O 3.68694073 +1 10.1316540 +1 -1.8798632 +1
H 3.40492977 +1 9.6657012 +1 -1.0535605 +1
O -1.79089275 +1 12.6159651 +1 -2.9479276 +1
H -1.54759669 +1 13.4035652 +1 -3.5073679 +1
O 2.16484071 +1 9.0906906 +1 0.0945748 +1
O 1.74057427 +1 7.7486284 +1 3.4194910 +1
H 2.36665830 +1 7.0200364 +1 3.7016121 +1
O -0.80556712 +1 7.2105164 +1 2.3237150 +1
H -0.70478298 +1 6.3265509 +1 1.8482969 +1
O -1.42682820 +1 8.7131503 +1 -0.0678480 +1
H -1.86568194 +1 9.3226948 +1 0.5815873 +1
O 4.62270536 +1 8.8996833 +1 0.3700712 +1
H 5.16778359 +1 9.6287770 +1 0.7686714 +1
C 1.37115720 +1 10.8006029 +1 -2.0291800 +1
H 1.68152412 +1 11.4997422 +1 -1.2198714 +1
C 0.31380804 +1 11.4459765 +1 -2.9470361 +1
H -0.18555686 +1 10.6979210 +1 -3.6028665 +1
C 1.98845055 +1 11.9780533 +1 -4.5892833 +1
H 1.58335545 +1 11.2640870 +1 -5.3360841 +1
C 3.14886632 +1 11.4115429 +1 -3.7445560 +1
H 3.71677246 +1 12.2001274 +1 -3.2025275 +1
C 2.63127823 +1 10.3196161 +1 -2.7820843 +1
H 2.45691969 +1 9.3551885 +1 -3.3161132 +1
C -0.72653554 +1 12.2274428 +1 -2.1204957 +1
H -1.19317102 +1 11.5758210 +1 -1.3536114 +1
H -0.29056584 +1 13.1283257 +1 -1.6445550 +1
C 0.83217122 +1 9.5152619 +1 -0.1100741 +1
H 0.64326434 +1 10.4763299 +1 0.4136651 +1
C 2.50249391 +1 8.7657163 +1 1.4340647 +1
H 2.52134370 +1 9.7042744 +1 2.0351033 +1
C 1.52163758 +1 7.7325858 +1 2.0334133 +1
H 1.67840207 +1 6.7030761 +1 1.6245385 +1
C 0.05843274 +1 8.1768468 +1 1.8120496 +1
H -0.22373943 +1 9.0854546 +1 2.3980681 +1
C -0.12494433 +1 8.3761407 +1 0.2971930 +1
H 0.07568325 +1 7.4315609 +1 -0.2689366 +1
C 3.89881192 +1 8.1336445 +1 1.2948248 +1
H 4.41255083 +1 8.0792601 +1 2.2709257 +1
H 3.85691014 +1 7.1260689 +1 0.8301482 +1
Tv 7.21017657 +1 -7.5806285 +1 2.7557679 +1
Tv -9.33113171 +1 -7.0795079 +1 4.9619785 +1
Tv 1.10429378 +1 4.3567338 +1 8.3211644 +1
Optimized PM6_D3H4 data set:
MERS=(1,1,2) CHARGE=0 EF OUTPUT THREADS=1 PM6-D3H4 GRADIENTS
beta-Cellobiose (CELLOB04) (PM6-D3H4)
O -0.01127774 +1 0.1767994 +1 0.0163021 +1
O 3.61621982 +1 0.1441895 +1 0.2162492 +1
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H 5.84397037 +1 1.5704247 +1 0.7359922 +1
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