Time stamp: Thu Mar 11 08:55:57 2021
alpha-Ketoglutaric acid (COTPAC)
249 alpha-Ketoglutaric acid (COTPAC)
(Previous) 5-Nitrouracil triphenylguanidinium
(Back) Elements:
O 5
C 5
H 6
(Z = 16)
(Periodic Table)
(Next) Cellulose 1 alpha (ja037055wsi20030711 112804)
Unit Cell Parameters: a b c alpha beta gamma Volume Density Heat of Formation (Kcal/mol)
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PM7: 5.02 6.05 16.48 90.35 96.74 90.16 497.29 1.951 -252.0 calc'd using PM7 (ref: 0.0)
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X-Ray PM7 PM6_D3H4
|
Calc'd on: Feb 26 2021 @ 02:45:52 |
Feb 25 2021 @ 09:31:09
ARC file |
Feb 27 2021 @ 23:11:13 |
For X-Ray structure, contact the CCDC: http://www.ccdc.cam.ac.uk/
Optimized PM7 data set:
MERS=(2,2,1) CHARGE=0 OUTPUT THREADS=1 PM7 GRADIENTS NOTXT EF
alpha-Ketoglutaric acid (COTPAC)
h=-245.7 hr=nist
O 0.28888042 +1 -0.0316462 +1 0.3356881 +1
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O 0.16876903 +1 2.6699433 +1 -0.0934008 +1
O 4.59090164 +1 4.4458481 +1 1.3248091 +1
O 3.16254181 +1 5.9577972 +1 2.1274837 +1
C 1.36722140 +1 0.6032398 +1 -0.0615998 +1
C 1.23034612 +1 2.1232201 +1 0.0405982 +1
C 2.51307724 +1 2.8403972 +1 0.3212852 +1
C 2.23109239 +1 4.2486889 +1 0.8274779 +1
C 3.45063662 +1 4.8795647 +1 1.4125578 +1
H 0.37944658 +1 -1.0618176 +1 0.3780051 +1
H 3.96227159 +1 6.4044670 +1 2.5971022 +1
H 3.14053952 +1 2.8709175 +1 -0.6021987 +1
H 3.12305629 +1 2.2616670 +1 1.0585832 +1
H 1.41759146 +1 4.2246990 +1 1.5881878 +1
H 1.84329772 +1 4.9020084 +1 0.0014010 +1
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O 5.29834790 +1 9.9207131 +1 7.0688975 +1
O 2.36402613 +1 8.1284606 +1 3.4900750 +1
O 2.15833173 +1 6.6012164 +1 5.0997736 +1
C 4.85928600 +1 11.9762822 +1 5.9300685 +1
C 4.78574725 +1 10.4603585 +1 6.1259817 +1
C 4.03058006 +1 9.7418702 +1 5.0533284 +1
C 3.71237561 +1 8.3162498 +1 5.4867633 +1
C 2.71354173 +1 7.6842422 +1 4.5748879 +1
H 4.91987492 +1 13.6634640 +1 6.9728032 +1
H 1.42053727 +1 6.1632591 +1 4.5288008 +1
H 4.62133732 +1 9.7447857 +1 4.1049940 +1
H 3.09476792 +1 10.3019720 +1 4.8025173 +1
H 3.32999003 +1 8.3091763 +1 6.5328596 +1
H 4.64077534 +1 7.6861122 +1 5.5095078 +1
O 5.70709515 +1 13.6353812 +1 1.7295107 +1
O 3.60640972 +1 13.5453906 +1 2.5221908 +1
O 5.81782374 +1 10.9331858 +1 2.1811024 +1
O 1.39347103 +1 9.1629755 +1 0.7725906 +1
O 2.82424074 +1 7.6599305 +1 -0.0401429 +1
C 4.62855162 +1 13.0051051 +1 2.1348457 +1
C 4.75932770 +1 11.4845241 +1 2.0426524 +1
C 3.47297231 +1 10.7723104 +1 1.7678006 +1
C 3.75100417 +1 9.3574039 +1 1.2789963 +1
C 2.53447186 +1 8.7310735 +1 0.6841975 +1
H 5.62121198 +1 14.6654274 +1 1.6898239 +1
H 2.02060997 +1 7.2102900 +1 -0.5047770 +1
H 2.84312931 +1 10.7594329 +1 2.6894539 +1
H 2.86701099 +1 11.3423695 +1 1.0205336 +1
H 4.57436570 +1 9.3700644 +1 0.5286171 +1
H 4.12581216 +1 8.7087872 +1 2.1147892 +1
O -2.29299204 +1 0.9128287 +1 -0.0119394 +1
O -2.11674890 +1 1.0507575 +1 2.2235165 +1
O -2.62852398 +1 3.6317820 +1 -0.0000110 +1
O 0.27259998 +1 5.4051443 +1 3.6273118 +1
O 0.48453717 +1 6.9288810 +1 2.0141980 +1
C -2.18623417 +1 1.5666947 +1 1.1209619 +1
C -2.12228884 +1 3.0843278 +1 0.9416971 +1
C -1.39322749 +1 3.7947249 +1 2.0383809 +1
C -1.06867060 +1 5.2226377 +1 1.6221457 +1
C -0.07141159 +1 5.8469968 +1 2.5398701 +1
H -2.24497954 +1 -0.1175133 +1 0.0764869 +1
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H -0.46537436 +1 3.2314448 +1 2.3091193 +1
H -0.68185532 +1 5.2380194 +1 0.5776128 +1
H -1.99460131 +1 5.8558231 +1 1.6037439 +1
O 4.12067535 +1 -2.0364313 +1 2.8894806 +1
O 6.23170317 +1 -1.9422872 +1 2.1284191 +1
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O 8.42124568 +1 2.4361464 +1 3.8903725 +1
O 6.99250673 +1 3.9524116 +1 4.6834219 +1
C 5.20398642 +1 -1.4030929 +1 2.5032977 +1
C 5.06912311 +1 0.1160753 +1 2.6006605 +1
C 6.35286956 +1 0.8302147 +1 2.8826500 +1
C 6.06510191 +1 2.2389240 +1 3.3840072 +1
C 7.28120704 +1 2.8723681 +1 3.9714003 +1
H 4.21365664 +1 -3.0661858 +1 2.9392281 +1
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O 6.00070956 +1 4.6022547 +1 7.6398631 +1
C 8.69605221 +1 9.9733926 +1 8.4768408 +1
C 8.62888424 +1 8.4568419 +1 8.6795988 +1
C 7.87485066 +1 7.7390533 +1 7.6062212 +1
C 7.55272123 +1 6.3126981 +1 8.0291544 +1
C 6.54757538 +1 5.6907532 +1 7.1171617 +1
H 8.74233872 +1 11.6642168 +1 9.5177048 +1
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H 8.47665499 +1 5.6763070 +1 8.0417678 +1
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O 7.44353883 +1 11.5482956 +1 5.0893389 +1
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O 4.32375157 +1 4.9221683 +1 4.5543008 +1
C 1.62835094 +1 -0.4345503 +1 3.6750263 +1
C 1.69611781 +1 1.0831062 +1 3.4912176 +1
C 2.43888427 +1 1.7879157 +1 4.5823173 +1
C 2.76550724 +1 3.2167693 +1 4.1695067 +1
C 3.76529900 +1 3.8427531 +1 5.0846232 +1
H 1.58518705 +1 -2.1238602 +1 2.6298455 +1
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H 3.36801488 +1 1.2207816 +1 4.8405286 +1
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C 5.83624914 +1 2.8374121 +1 -4.6908582 +1
C 5.56996520 +1 4.2696076 +1 -4.2446299 +1
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O 8.24468640 +1 12.6703112 +1 2.0933894 +1
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O 5.68943583 +1 8.1689738 +1 -1.5308231 +1
O 5.46441473 +1 6.6631211 +1 0.0961438 +1
C 8.16860795 +1 12.0143341 +1 0.9593886 +1
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C 7.36472681 +1 9.7870901 +1 0.0498041 +1
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C 6.03090664 +1 7.7351723 +1 -0.4395494 +1
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H 6.43734435 +1 10.3518297 +1 -0.2169843 +1
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H 1.32739509 +1 3.8342175 +1 -2.0111740 +1
H 2.85692780 +1 3.2781584 +1 -2.7002772 +1
H 2.62515735 +1 5.2842718 +1 -4.4283865 +1
H 1.31725504 +1 5.8982144 +1 -3.4006911 +1
O 7.43903593 +1 -2.0392085 +1 -2.1171381 +1
O 9.55487432 +1 -1.9309911 +1 -2.8674654 +1
O 7.32582470 +1 0.6714421 +1 -2.5145494 +1
O 11.76352275 +1 2.4632419 +1 -1.1820794 +1
O 10.32634253 +1 3.9475562 +1 -0.3454410 +1
C 8.52151249 +1 -1.4003042 +1 -2.4969862 +1
C 8.38590114 +1 0.1196367 +1 -2.3941695 +1
C 9.67623702 +1 0.8301830 +1 -2.1307316 +1
C 9.40751880 +1 2.2630711 +1 -1.6893518 +1
C 10.62080672 +1 2.8882527 +1 -1.0864664 +1
H 7.53548444 +1 -3.0675347 +1 -2.0633930 +1
H 11.12516821 +1 4.3899818 +1 0.1324897 +1
H 10.31481685 +1 0.8040563 +1 -3.0459487 +1
H 10.27075175 +1 0.2751524 +1 -1.3628457 +1
H 8.56521727 +1 2.2895077 +1 -0.9603631 +1
H 9.06415577 +1 2.8916383 +1 -2.5533495 +1
O 12.04660728 +1 10.6718509 +1 4.6515386 +1
O 11.94159213 +1 10.5404769 +1 2.4116977 +1
O 12.44251965 +1 7.9513334 +1 4.6260176 +1
O 9.51771687 +1 6.1781331 +1 1.0216104 +1
O 9.30212092 +1 4.6623711 +1 2.6416050 +1
C 11.98257918 +1 10.0192960 +1 3.5135117 +1
C 11.93130293 +1 8.4993861 +1 3.6874124 +1
C 11.20141785 +1 7.7852391 +1 2.5930570 +1
C 10.87479615 +1 6.3583441 +1 3.0148330 +1
C 9.86509455 +1 5.7371158 +1 2.1083246 +1
H 11.97327112 +1 11.7001264 +1 4.5628683 +1
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H 11.81368481 +1 7.7925769 +1 1.6591291 +1
H 10.27425692 +1 8.3483429 +1 2.3207547 +1
H 10.49978975 +1 6.3462576 +1 4.0639347 +1
H 11.79706699 +1 5.7186799 +1 3.0232082 +1
O 12.87989667 +1 11.6518407 +1 -0.7121422 +1
O 10.78066785 +1 11.5402726 +1 0.0741999 +1
O 12.99964259 +1 8.9382579 +1 -0.3249814 +1
O 8.54314479 +1 7.1710804 +1 -1.6909723 +1
O 9.97648588 +1 5.6715431 +1 -2.5094148 +1
C 11.80491486 +1 11.0089721 +1 -0.3205121 +1
C 11.94017475 +1 9.4908068 +1 -0.4480561 +1
C 10.64959795 +1 8.7908527 +1 -0.7323956 +1
C 10.90539859 +1 7.3612766 +1 -1.1879347 +1
C 9.68438438 +1 6.7411854 +1 -1.7821474 +1
H 12.78267175 +1 12.6825850 +1 -0.7412094 +1
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H 10.00253668 +1 8.8080328 +1 0.1778925 +1
H 10.06838198 +1 9.3622199 +1 -1.4984957 +1
H 11.73776117 +1 7.3364542 +1 -1.9276391 +1
H 11.25485030 +1 6.7243939 +1 -0.3322510 +1
O 4.87025454 +1 -1.0397980 +1 -2.4352039 +1
O 4.93554990 +1 -0.9087949 +1 -0.1949703 +1
O 4.49503273 +1 1.6762338 +1 -2.4284811 +1
O 7.41785406 +1 3.4583193 +1 1.1735388 +1
O 7.61842861 +1 4.9862613 +1 -0.4352416 +1
C 4.92010189 +1 -0.3868369 +1 -1.2972216 +1
C 5.00316610 +1 1.1297547 +1 -1.4869433 +1
C 5.75711661 +1 1.8427117 +1 -0.4101662 +1
C 6.07360325 +1 3.2716081 +1 -0.8304005 +1
C 7.06842609 +1 3.8997209 +1 0.0878509 +1
H 4.91232729 +1 -2.0708399 +1 -2.3472560 +1
H 8.35691863 +1 5.4239755 +1 0.1348526 +1
H 5.16785880 +1 1.8344276 +1 0.5389736 +1
H 6.69158971 +1 1.2789158 +1 -0.1660095 +1
H 6.45813856 +1 3.2913118 +1 -1.8755432 +1
H 5.14612949 +1 3.9038192 +1 -0.8485260 +1
Tv 7.65707448 +1 -4.0038089 +1 5.1223935 +1
Tv 6.72582184 +1 0.0813099 +1 -10.0558464 +1
Tv -6.90152234 +1 -14.2411044 +1 -4.6090001 +1
Optimized PM6_D3H4 data set:
MERS=(2,2,1) CHARGE=0 EF OUTPUT THREADS=1 PM6-D3H4 GRADIENTS
alpha-Ketoglutaric acid (COTPAC) (PM6-D3H4)
O -0.16120948 +1 0.0514216 +1 0.0033253 +1
O 2.07183057 +1 -0.0379698 +1 -0.2687979 +1
O 0.00077737 +1 2.7712374 +1 -0.2771984 +1
O 4.45122366 +1 4.2901568 +1 1.6225611 +1
O 3.04158365 +1 5.9617796 +1 2.0988630 +1
C 1.04307719 +1 0.6037581 +1 -0.1132203 +1
C 0.99830432 +1 2.1528911 +1 -0.0062855 +1
C 2.30679104 +1 2.7479392 +1 0.4353244 +1
C 2.11149702 +1 4.1970049 +1 0.8741030 +1
C 3.32538640 +1 4.7730141 +1 1.5320865 +1
H -0.14776680 +1 -0.9971832 +1 -0.0310985 +1
H 3.85224179 +1 6.4226975 +1 2.5607033 +1
H 3.03338258 +1 2.6985208 +1 -0.4253642 +1
H 2.75700400 +1 2.1270437 +1 1.2644086 +1
H 1.24566101 +1 4.2679982 +1 1.5851510 +1
H 1.85816580 +1 4.8456345 +1 -0.0211637 +1
O 5.05410984 +1 12.6682744 +1 7.3325477 +1
O 4.46459997 +1 12.7473736 +1 5.1601330 +1
O 5.26820549 +1 9.9554137 +1 7.0827637 +1
O 1.82641949 +1 8.3765651 +1 3.7174927 +1
O 1.89401273 +1 6.7355437 +1 5.2374721 +1
C 4.70655591 +1 12.1129299 +1 6.1759164 +1
C 4.62542741 +1 10.5642158 +1 6.2669683 +1
C 3.70549411 +1 9.9573040 +1 5.2451625 +1
C 3.31604678 +1 8.5428467 +1 5.6672540 +1
C 2.30257361 +1 7.9261814 +1 4.7559761 +1
H 5.08293982 +1 13.7173881 +1 7.3040989 +1
H 1.18748388 +1 6.2528812 +1 4.6477803 +1
H 4.23607814 +1 9.9351391 +1 4.2483875 +1
H 2.79031247 +1 10.6037548 +1 5.1042415 +1
H 2.89600411 +1 8.5560377 +1 6.7114138 +1
H 4.23200483 +1 7.8759471 +1 5.6867194 +1
O 5.58666821 +1 13.5959181 +1 2.0219044 +1
O 3.35473996 +1 13.6931577 +1 2.3097340 +1
O 5.42009154 +1 10.8848806 +1 2.3247075 +1
O 0.97018371 +1 9.3513256 +1 0.4338191 +1
O 2.38754138 +1 7.7135371 +1 -0.1219207 +1
C 4.38212056 +1 13.0508092 +1 2.1496612 +1
C 4.42319248 +1 11.5007053 +1 2.0486586 +1
C 3.11708849 +1 10.9031825 +1 1.6029893 +1
C 3.35744929 +1 9.5207447 +1 1.0025861 +1
C 2.11297740 +1 8.9014498 +1 0.4509927 +1
H 5.58021747 +1 14.6462076 +1 2.0503604 +1
H 1.56248175 +1 7.2314547 +1 -0.5317140 +1
H 2.43300741 +1 10.8264737 +1 2.4969198 +1
H 2.60325115 +1 11.5801304 +1 0.8577790 +1
H 4.11305537 +1 9.6000085 +1 0.1689566 +1
H 3.78778170 +1 8.8257661 +1 1.7858095 +1
O -3.15135865 +1 1.0640960 +1 0.0774867 +1
O -2.59801337 +1 0.9764569 +1 2.2584507 +1
O -3.37597231 +1 3.7828650 +1 0.3434696 +1
O 0.07988638 +1 5.2939759 +1 3.7469617 +1
O 0.06530523 +1 6.9178317 +1 2.2084162 +1
C -2.82637268 +1 1.6160667 +1 1.2433499 +1
C -2.75088297 +1 3.1657744 +1 1.1674862 +1
C -1.85474408 +1 3.7617066 +1 2.2187216 +1
C -1.45572802 +1 5.1819953 +1 1.8264369 +1
C -0.39821767 +1 5.7569984 +1 2.7146097 +1
H -3.16497059 +1 0.0156665 +1 0.0977415 +1
H 0.80877948 +1 7.3699111 +1 2.7805016 +1
H -2.40765355 +1 3.7686070 +1 3.2027543 +1
H -0.94263502 +1 3.1127346 +1 2.3730422 +1
H -1.07542475 +1 5.1883847 +1 0.7675745 +1
H -2.35836549 +1 5.8655293 +1 1.8630803 +1
O 3.98197779 +1 -1.8944807 +1 2.7664804 +1
O 6.21469655 +1 -1.9907329 +1 2.4816184 +1
O 4.14895123 +1 0.8159119 +1 2.4608398 +1
O 8.59787085 +1 2.3448385 +1 4.3592367 +1
O 7.18220225 +1 3.9862593 +1 4.9085010 +1
C 5.18627373 +1 -1.3492101 +1 2.6381552 +1
C 5.14755110 +1 0.2004725 +1 2.7347580 +1
C 6.45245936 +1 0.8017612 +1 3.1756380 +1
C 6.21187601 +1 2.1834269 +1 3.7782876 +1
C 7.45637428 +1 2.7979349 +1 4.3365996 +1
H 3.98917586 +1 -2.9453241 +1 2.7397366 +1
H 8.00671149 +1 4.4656804 +1 5.3225720 +1
H 7.13038730 +1 0.8822981 +1 2.2771866 +1
H 6.97048795 +1 0.1256295 +1 3.9164506 +1
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H 5.78860144 +1 2.8810769 +1 2.9922194 +1
O 9.15542998 +1 10.6423152 +1 10.0605841 +1
O 8.58699375 +1 10.7226124 +1 7.8838723 +1
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O 5.91216332 +1 6.4117308 +1 6.4209764 +1
O 5.93123663 +1 4.7868747 +1 7.9582149 +1
C 8.82234319 +1 10.0859683 +1 8.9000668 +1
C 8.74696136 +1 8.5364759 +1 8.9867394 +1
C 7.86876445 +1 7.9293928 +1 7.9275663 +1
C 7.49130726 +1 6.4984785 +1 8.3043956 +1
C 6.39930351 +1 5.9418994 +1 7.4460799 +1
H 9.17429267 +1 11.6909995 +1 10.0338336 +1
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H 7.16186752 +1 6.4570499 +1 9.3777333 +1
H 8.39500558 +1 5.8191324 +1 8.2090995 +1
O 9.72919184 +1 11.6498032 +1 4.7898149 +1
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O 5.11581633 +1 7.4043792 +1 3.1724414 +1
O 6.52943937 +1 5.7372950 +1 2.6891521 +1
C 8.52450552 +1 11.0974664 +1 4.9040396 +1
C 8.56927150 +1 9.5486660 +1 4.7955653 +1
C 7.26344115 +1 8.9544373 +1 4.3459778 +1
C 7.46051522 +1 7.5054517 +1 3.9082103 +1
C 6.24369359 +1 6.9252538 +1 3.2583323 +1
H 9.71590730 +1 12.6981331 +1 4.8242395 +1
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H 7.72209685 +1 6.8596393 +1 4.8027109 +1
O 0.94988371 +1 -0.9617499 +1 2.8042207 +1
O 1.52351009 +1 -1.0453382 +1 4.9808356 +1
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O 4.09871363 +1 4.9742462 +1 4.9244651 +1
C 1.29009259 +1 -0.4083051 +1 3.9654559 +1
C 1.37364574 +1 1.1406036 +1 3.8826359 +1
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C 2.72075495 +1 3.1422145 +1 4.4607342 +1
C 3.70083567 +1 3.7753274 +1 5.3971281 +1
H 0.92517740 +1 -2.0098138 +1 2.8281907 +1
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