Time stamp: Thu Mar 11 08:55:57 2021 alpha-Ketoglutaric acid (COTPAC)

249 alpha-Ketoglutaric acid (COTPAC)

(Previous)    5-Nitrouracil triphenylguanidinium
(Back)          Elements: O 5 C 5 H 6 (Z = 16)     (Periodic Table)
(Next)          Cellulose 1 alpha (ja037055wsi20030711 112804)
                      Unit Cell Parameters:       a      b      c   alpha   beta  gamma   Volume  Density       Heat of Formation (Kcal/mol)
                                     X-ray:     5.53   6.38  16.71  90.00  94.73  90.00    586.64  1.654         -207.6 calc'd using PM7
                                       PM7:     5.02   6.05  16.48  90.35  96.74  90.16    497.29  1.951         -252.0 calc'd using PM7 (ref:     0.0)
                                  PM6_D3H4:     5.34   6.52  17.07  89.72 100.84  90.26    583.55  1.663         -247.6 calc'd using PM6_D3H4
                                  X-Ray                                             PM7                                            PM6_D3H4
Calc'd on: Feb 26 2021 @ 02:45:52 Feb 25 2021 @ 09:31:09 ARC file Feb 27 2021 @ 23:11:13
 For X-Ray structure, contact the CCDC: http://www.ccdc.cam.ac.uk/

  Optimized PM7 data set:
 MERS=(2,2,1) CHARGE=0 OUTPUT THREADS=1 PM7 GRADIENTS NOTXT EF
 alpha-Ketoglutaric acid (COTPAC)
 h=-245.7 hr=nist
  O     0.28888042 +1   -0.0316462 +1    0.3356881 +1
  O     2.39266279 +1    0.0670230 +1   -0.4459416 +1
  O     0.16876903 +1    2.6699433 +1   -0.0934008 +1
  O     4.59090164 +1    4.4458481 +1    1.3248091 +1
  O     3.16254181 +1    5.9577972 +1    2.1274837 +1
  C     1.36722140 +1    0.6032398 +1   -0.0615998 +1
  C     1.23034612 +1    2.1232201 +1    0.0405982 +1
  C     2.51307724 +1    2.8403972 +1    0.3212852 +1
  C     2.23109239 +1    4.2486889 +1    0.8274779 +1
  C     3.45063662 +1    4.8795647 +1    1.4125578 +1
  H     0.37944658 +1   -1.0618176 +1    0.3780051 +1
  H     3.96227159 +1    6.4044670 +1    2.5971022 +1
  H     3.14053952 +1    2.8709175 +1   -0.6021987 +1
  H     3.12305629 +1    2.2616670 +1    1.0585832 +1
  H     1.41759146 +1    4.2246990 +1    1.5881878 +1
  H     1.84329772 +1    4.9020084 +1    0.0014010 +1
  O     4.96190804 +1   12.6327687 +1    7.0618061 +1
  O     4.79230085 +1   12.4930696 +1    4.8273879 +1
  O     5.29834790 +1    9.9207131 +1    7.0688975 +1
  O     2.36402613 +1    8.1284606 +1    3.4900750 +1
  O     2.15833173 +1    6.6012164 +1    5.0997736 +1
  C     4.85928600 +1   11.9762822 +1    5.9300685 +1
  C     4.78574725 +1   10.4603585 +1    6.1259817 +1
  C     4.03058006 +1    9.7418702 +1    5.0533284 +1
  C     3.71237561 +1    8.3162498 +1    5.4867633 +1
  C     2.71354173 +1    7.6842422 +1    4.5748879 +1
  H     4.91987492 +1   13.6634640 +1    6.9728032 +1
  H     1.42053727 +1    6.1632591 +1    4.5288008 +1
  H     4.62133732 +1    9.7447857 +1    4.1049940 +1
  H     3.09476792 +1   10.3019720 +1    4.8025173 +1
  H     3.32999003 +1    8.3091763 +1    6.5328596 +1
  H     4.64077534 +1    7.6861122 +1    5.5095078 +1
  O     5.70709515 +1   13.6353812 +1    1.7295107 +1
  O     3.60640972 +1   13.5453906 +1    2.5221908 +1
  O     5.81782374 +1   10.9331858 +1    2.1811024 +1
  O     1.39347103 +1    9.1629755 +1    0.7725906 +1
  O     2.82424074 +1    7.6599305 +1   -0.0401429 +1
  C     4.62855162 +1   13.0051051 +1    2.1348457 +1
  C     4.75932770 +1   11.4845241 +1    2.0426524 +1
  C     3.47297231 +1   10.7723104 +1    1.7678006 +1
  C     3.75100417 +1    9.3574039 +1    1.2789963 +1
  C     2.53447186 +1    8.7310735 +1    0.6841975 +1
  H     5.62121198 +1   14.6654274 +1    1.6898239 +1
  H     2.02060997 +1    7.2102900 +1   -0.5047770 +1
  H     2.84312931 +1   10.7594329 +1    2.6894539 +1
  H     2.86701099 +1   11.3423695 +1    1.0205336 +1
  H     4.57436570 +1    9.3700644 +1    0.5286171 +1
  H     4.12581216 +1    8.7087872 +1    2.1147892 +1
  O    -2.29299204 +1    0.9128287 +1   -0.0119394 +1
  O    -2.11674890 +1    1.0507575 +1    2.2235165 +1
  O    -2.62852398 +1    3.6317820 +1   -0.0000110 +1
  O     0.27259998 +1    5.4051443 +1    3.6273118 +1
  O     0.48453717 +1    6.9288810 +1    2.0141980 +1
  C    -2.18623417 +1    1.5666947 +1    1.1209619 +1
  C    -2.12228884 +1    3.0843278 +1    0.9416971 +1
  C    -1.39322749 +1    3.7947249 +1    2.0383809 +1
  C    -1.06867060 +1    5.2226377 +1    1.6221457 +1
  C    -0.07141159 +1    5.8469968 +1    2.5398701 +1
  H    -2.24497954 +1   -0.1175133 +1    0.0764869 +1
  H     1.21747210 +1    7.3695406 +1    2.5899458 +1
  H    -2.00703222 +1    3.7843873 +1    2.9712492 +1
  H    -0.46537436 +1    3.2314448 +1    2.3091193 +1
  H    -0.68185532 +1    5.2380194 +1    0.5776128 +1
  H    -1.99460131 +1    5.8558231 +1    1.6037439 +1
  O     4.12067535 +1   -2.0364313 +1    2.8894806 +1
  O     6.23170317 +1   -1.9422872 +1    2.1284191 +1
  O     4.00931964 +1    0.6656055 +1    2.4652115 +1
  O     8.42124568 +1    2.4361464 +1    3.8903725 +1
  O     6.99250673 +1    3.9524116 +1    4.6834219 +1
  C     5.20398642 +1   -1.4030929 +1    2.5032977 +1
  C     5.06912311 +1    0.1160753 +1    2.6006605 +1
  C     6.35286956 +1    0.8302147 +1    2.8826500 +1
  C     6.06510191 +1    2.2389240 +1    3.3840072 +1
  C     7.28120704 +1    2.8723681 +1    3.9714003 +1
  H     4.21365664 +1   -3.0661858 +1    2.9392281 +1
  H     7.79705160 +1    4.3973211 +1    5.1516826 +1
  H     6.98223895 +1    0.8558623 +1    1.9606283 +1
  H     6.96150443 +1    0.2551013 +1    3.6246870 +1
  H     5.24928467 +1    2.2133781 +1    4.1428224 +1
  H     5.67614863 +1    2.8886315 +1    2.5555654 +1
  O     8.79956838 +1   10.6344939 +1    9.6056035 +1
  O     8.61847774 +1   10.4861778 +1    7.3726714 +1
  O     9.14372828 +1    7.9203492 +1    9.6226968 +1
  O     6.19005414 +1    6.1382402 +1    6.0362235 +1
  O     6.00070956 +1    4.6022547 +1    7.6398631 +1
  C     8.69605221 +1    9.9733926 +1    8.4768408 +1
  C     8.62888424 +1    8.4568419 +1    8.6795988 +1
  C     7.87485066 +1    7.7390533 +1    7.6062212 +1
  C     7.55272123 +1    6.3126981 +1    8.0291544 +1
  C     6.54757538 +1    5.6907532 +1    7.1171617 +1
  H     8.74233872 +1   11.6642168 +1    9.5177048 +1
  H     5.26631601 +1    4.1602300 +1    7.0684716 +1
  H     8.46682824 +1    7.7456175 +1    6.6585916 +1
  H     6.94103951 +1    8.3020658 +1    7.3566437 +1
  H     7.17731875 +1    6.2951156 +1    9.0770251 +1
  H     8.47665499 +1    5.6763070 +1    8.0417678 +1
  O     9.53960632 +1   11.6451156 +1    4.2928422 +1
  O     7.44353883 +1   11.5482956 +1    5.0893389 +1
  O     9.65695341 +1    8.9371652 +1    4.7399540 +1
  O     5.21382321 +1    7.1771312 +1    3.3372806 +1
  O     6.63984383 +1    5.6618902 +1    2.5407974 +1
  C     8.46627632 +1   11.0092768 +1    4.7014578 +1
  C     8.59750324 +1    9.4882526 +1    4.6080824 +1
  C     7.30792404 +1    8.7795194 +1    4.3368444 +1
  C     7.57465983 +1    7.3629443 +1    3.8471852 +1
  C     6.35329154 +1    6.7399617 +1    3.2571974 +1
  H     9.45180969 +1   12.6768029 +1    4.2610690 +1
  H     5.83853933 +1    5.2223229 +1    2.0642543 +1
  H     6.67983259 +1    8.7693830 +1    5.2599017 +1
  H     6.70386329 +1    9.3553144 +1    3.5918358 +1
  H     8.39315412 +1    7.3699629 +1    3.0912942 +1
  H     7.94934480 +1    6.7122407 +1    4.6809864 +1
  O     1.53586177 +1   -1.0924025 +1    2.5435459 +1
  O     1.69041274 +1   -0.9486717 +1    4.7790935 +1
  O     1.18972324 +1    1.6340887 +1    2.5519039 +1
  O     4.10999933 +1    3.4053056 +1    6.1733493 +1
  O     4.32375157 +1    4.9221683 +1    4.5543008 +1
  C     1.62835094 +1   -0.4345503 +1    3.6750263 +1
  C     1.69611781 +1    1.0831062 +1    3.4912176 +1
  C     2.43888427 +1    1.7879157 +1    4.5823173 +1
  C     2.76550724 +1    3.2167693 +1    4.1695067 +1
  C     3.76529900 +1    3.8427531 +1    5.0846232 +1
  H     1.58518705 +1   -2.1238602 +1    2.6298455 +1
  H     5.06137334 +1    5.3614705 +1    5.1241282 +1
  H     1.83418830 +1    1.7727518 +1    5.5205924 +1
  H     3.36801488 +1    1.2207816 +1    4.8405286 +1
  H     3.15085692 +1    3.2332269 +1    3.1236950 +1
  H     1.83956879 +1    3.8508339 +1    4.1553660 +1
  O     3.60520933 +1   -0.0389731 +1   -4.6687792 +1
  O     5.71251662 +1    0.0716311 +1   -5.4376343 +1
  O     3.48471557 +1    2.6710882 +1   -5.0757670 +1
  O     7.92945255 +1    4.4699571 +1   -3.7431300 +1
  O     6.49061494 +1    5.9475411 +1   -2.8962724 +1
  C     4.68333817 +1    0.6027218 +1   -5.0571185 +1
  C     4.54707629 +1    2.1237328 +1   -4.9535838 +1
  C     5.83624914 +1    2.8374121 +1   -4.6908582 +1
  C     5.56996520 +1    4.2696076 +1   -4.2446299 +1
  C     6.78616846 +1    4.8921103 +1   -3.6424275 +1
  H     3.70359216 +1   -1.0675996 +1   -4.6241931 +1
  H     7.28647415 +1    6.3926271 +1   -2.4177025 +1
  H     6.47496955 +1    2.8165618 +1   -5.6069325 +1
  H     6.43102553 +1    2.2826638 +1   -3.9229586 +1
  H     4.72865634 +1    4.2961391 +1   -3.5148716 +1
  H     5.22805235 +1    4.9021438 +1   -5.1060328 +1
  O     8.24468640 +1   12.6703112 +1    2.0933894 +1
  O     8.12287181 +1   12.5308064 +1   -0.1443444 +1
  O     8.60803739 +1    9.9486293 +1    2.0828137 +1
  O     5.68943583 +1    8.1689738 +1   -1.5308231 +1
  O     5.46441473 +1    6.6631211 +1    0.0961438 +1
  C     8.16860795 +1   12.0143341 +1    0.9593886 +1
  C     8.10085390 +1   10.4968908 +1    1.1421798 +1
  C     7.36472681 +1    9.7870901 +1    0.0498041 +1
  C     7.03497575 +1    8.3614115 +1    0.4707906 +1
  C     6.03090664 +1    7.7351723 +1   -0.4395494 +1
  H     8.19503000 +1   13.7015982 +1    2.0065012 +1
  H     4.72645999 +1    6.2237340 +1   -0.4731362 +1
  H     7.97491616 +1    9.7959228 +1   -0.8859768 +1
  H     6.43734435 +1   10.3518297 +1   -0.2169843 +1
  H     6.65278158 +1    8.3512352 +1    1.5173219 +1
  H     7.95837372 +1    7.7250433 +1    0.4886439 +1
  O     9.05225909 +1   13.6497681 +1   -3.2784414 +1
  O     6.95018667 +1   13.5441324 +1   -2.4916852 +1
  O     9.16565295 +1   10.9411802 +1   -2.8853320 +1
  O     4.72568486 +1    9.1690808 +1   -4.2625094 +1
  O     6.15811844 +1    7.6734859 +1   -5.0843644 +1
  C     7.97403136 +1   13.0123662 +1   -2.8861009 +1
  C     8.10620648 +1   11.4937732 +1   -3.0090237 +1
  C     6.81798333 +1   10.7884692 +1   -3.2924012 +1
  C     7.08609561 +1    9.3641191 +1   -3.7588794 +1
  C     5.86781934 +1    8.7421986 +1   -4.3557465 +1
  H     8.96148354 +1   14.6803984 +1   -3.3122528 +1
  H     5.35726212 +1    7.2341949 +1   -5.5610036 +1
  H     6.17504361 +1   10.7930338 +1   -2.3787309 +1
  H     6.22965483 +1   11.3570231 +1   -4.0549177 +1
  H     7.92139392 +1    9.3512492 +1   -4.4961466 +1
  H     7.44083881 +1    8.7228889 +1   -2.9082984 +1
  O     1.01768465 +1    0.9478215 +1   -4.9701380 +1
  O     1.17018286 +1    1.0915801 +1   -2.7342515 +1
  O     0.66641746 +1    3.6598182 +1   -4.9781688 +1
  O     3.59080276 +1    5.4510231 +1   -1.3798137 +1
  O     3.78188566 +1    6.9864430 +1   -2.9849098 +1
  C     1.10986685 +1    1.6055951 +1   -3.8387428 +1
  C     1.17800504 +1    3.1211823 +1   -4.0341514 +1
  C     1.92452059 +1    3.8402666 +1   -2.9561048 +1
  C     2.24427136 +1    5.2666288 +1   -3.3820320 +1
  C     3.23981224 +1    5.8948629 +1   -2.4642864 +1
  H     1.07027149 +1   -0.0821678 +1   -4.8830509 +1
  H     4.52410424 +1    7.4221144 +1   -2.4184905 +1
  H     1.32739509 +1    3.8342175 +1   -2.0111740 +1
  H     2.85692780 +1    3.2781584 +1   -2.7002772 +1
  H     2.62515735 +1    5.2842718 +1   -4.4283865 +1
  H     1.31725504 +1    5.8982144 +1   -3.4006911 +1
  O     7.43903593 +1   -2.0392085 +1   -2.1171381 +1
  O     9.55487432 +1   -1.9309911 +1   -2.8674654 +1
  O     7.32582470 +1    0.6714421 +1   -2.5145494 +1
  O    11.76352275 +1    2.4632419 +1   -1.1820794 +1
  O    10.32634253 +1    3.9475562 +1   -0.3454410 +1
  C     8.52151249 +1   -1.4003042 +1   -2.4969862 +1
  C     8.38590114 +1    0.1196367 +1   -2.3941695 +1
  C     9.67623702 +1    0.8301830 +1   -2.1307316 +1
  C     9.40751880 +1    2.2630711 +1   -1.6893518 +1
  C    10.62080672 +1    2.8882527 +1   -1.0864664 +1
  H     7.53548444 +1   -3.0675347 +1   -2.0633930 +1
  H    11.12516821 +1    4.3899818 +1    0.1324897 +1
  H    10.31481685 +1    0.8040563 +1   -3.0459487 +1
  H    10.27075175 +1    0.2751524 +1   -1.3628457 +1
  H     8.56521727 +1    2.2895077 +1   -0.9603631 +1
  H     9.06415577 +1    2.8916383 +1   -2.5533495 +1
  O    12.04660728 +1   10.6718509 +1    4.6515386 +1
  O    11.94159213 +1   10.5404769 +1    2.4116977 +1
  O    12.44251965 +1    7.9513334 +1    4.6260176 +1
  O     9.51771687 +1    6.1781331 +1    1.0216104 +1
  O     9.30212092 +1    4.6623711 +1    2.6416050 +1
  C    11.98257918 +1   10.0192960 +1    3.5135117 +1
  C    11.93130293 +1    8.4993861 +1    3.6874124 +1
  C    11.20141785 +1    7.7852391 +1    2.5930570 +1
  C    10.87479615 +1    6.3583441 +1    3.0148330 +1
  C     9.86509455 +1    5.7371158 +1    2.1083246 +1
  H    11.97327112 +1   11.7001264 +1    4.5628683 +1
  H     8.56259298 +1    4.2261710 +1    2.0706685 +1
  H    11.81368481 +1    7.7925769 +1    1.6591291 +1
  H    10.27425692 +1    8.3483429 +1    2.3207547 +1
  H    10.49978975 +1    6.3462576 +1    4.0639347 +1
  H    11.79706699 +1    5.7186799 +1    3.0232082 +1
  O    12.87989667 +1   11.6518407 +1   -0.7121422 +1
  O    10.78066785 +1   11.5402726 +1    0.0741999 +1
  O    12.99964259 +1    8.9382579 +1   -0.3249814 +1
  O     8.54314479 +1    7.1710804 +1   -1.6909723 +1
  O     9.97648588 +1    5.6715431 +1   -2.5094148 +1
  C    11.80491486 +1   11.0089721 +1   -0.3205121 +1
  C    11.94017475 +1    9.4908068 +1   -0.4480561 +1
  C    10.64959795 +1    8.7908527 +1   -0.7323956 +1
  C    10.90539859 +1    7.3612766 +1   -1.1879347 +1
  C     9.68438438 +1    6.7411854 +1   -1.7821474 +1
  H    12.78267175 +1   12.6825850 +1   -0.7412094 +1
  H     9.17992723 +1    5.2387413 +1   -2.9974935 +1
  H    10.00253668 +1    8.8080328 +1    0.1778925 +1
  H    10.06838198 +1    9.3622199 +1   -1.4984957 +1
  H    11.73776117 +1    7.3364542 +1   -1.9276391 +1
  H    11.25485030 +1    6.7243939 +1   -0.3322510 +1
  O     4.87025454 +1   -1.0397980 +1   -2.4352039 +1
  O     4.93554990 +1   -0.9087949 +1   -0.1949703 +1
  O     4.49503273 +1    1.6762338 +1   -2.4284811 +1
  O     7.41785406 +1    3.4583193 +1    1.1735388 +1
  O     7.61842861 +1    4.9862613 +1   -0.4352416 +1
  C     4.92010189 +1   -0.3868369 +1   -1.2972216 +1
  C     5.00316610 +1    1.1297547 +1   -1.4869433 +1
  C     5.75711661 +1    1.8427117 +1   -0.4101662 +1
  C     6.07360325 +1    3.2716081 +1   -0.8304005 +1
  C     7.06842609 +1    3.8997209 +1    0.0878509 +1
  H     4.91232729 +1   -2.0708399 +1   -2.3472560 +1
  H     8.35691863 +1    5.4239755 +1    0.1348526 +1
  H     5.16785880 +1    1.8344276 +1    0.5389736 +1
  H     6.69158971 +1    1.2789158 +1   -0.1660095 +1
  H     6.45813856 +1    3.2913118 +1   -1.8755432 +1
  H     5.14612949 +1    3.9038192 +1   -0.8485260 +1
 Tv     7.65707448 +1   -4.0038089 +1    5.1223935 +1 
 Tv     6.72582184 +1    0.0813099 +1  -10.0558464 +1 
 Tv    -6.90152234 +1  -14.2411044 +1   -4.6090001 +1 
 

  Optimized PM6_D3H4 data set:
 MERS=(2,2,1) CHARGE=0 EF OUTPUT THREADS=1 PM6-D3H4 GRADIENTS
 alpha-Ketoglutaric acid (COTPAC) (PM6-D3H4)

  O    -0.16120948 +1    0.0514216 +1    0.0033253 +1
  O     2.07183057 +1   -0.0379698 +1   -0.2687979 +1
  O     0.00077737 +1    2.7712374 +1   -0.2771984 +1
  O     4.45122366 +1    4.2901568 +1    1.6225611 +1
  O     3.04158365 +1    5.9617796 +1    2.0988630 +1
  C     1.04307719 +1    0.6037581 +1   -0.1132203 +1
  C     0.99830432 +1    2.1528911 +1   -0.0062855 +1
  C     2.30679104 +1    2.7479392 +1    0.4353244 +1
  C     2.11149702 +1    4.1970049 +1    0.8741030 +1
  C     3.32538640 +1    4.7730141 +1    1.5320865 +1
  H    -0.14776680 +1   -0.9971832 +1   -0.0310985 +1
  H     3.85224179 +1    6.4226975 +1    2.5607033 +1
  H     3.03338258 +1    2.6985208 +1   -0.4253642 +1
  H     2.75700400 +1    2.1270437 +1    1.2644086 +1
  H     1.24566101 +1    4.2679982 +1    1.5851510 +1
  H     1.85816580 +1    4.8456345 +1   -0.0211637 +1
  O     5.05410984 +1   12.6682744 +1    7.3325477 +1
  O     4.46459997 +1   12.7473736 +1    5.1601330 +1
  O     5.26820549 +1    9.9554137 +1    7.0827637 +1
  O     1.82641949 +1    8.3765651 +1    3.7174927 +1
  O     1.89401273 +1    6.7355437 +1    5.2374721 +1
  C     4.70655591 +1   12.1129299 +1    6.1759164 +1
  C     4.62542741 +1   10.5642158 +1    6.2669683 +1
  C     3.70549411 +1    9.9573040 +1    5.2451625 +1
  C     3.31604678 +1    8.5428467 +1    5.6672540 +1
  C     2.30257361 +1    7.9261814 +1    4.7559761 +1
  H     5.08293982 +1   13.7173881 +1    7.3040989 +1
  H     1.18748388 +1    6.2528812 +1    4.6477803 +1
  H     4.23607814 +1    9.9351391 +1    4.2483875 +1
  H     2.79031247 +1   10.6037548 +1    5.1042415 +1
  H     2.89600411 +1    8.5560377 +1    6.7114138 +1
  H     4.23200483 +1    7.8759471 +1    5.6867194 +1
  O     5.58666821 +1   13.5959181 +1    2.0219044 +1
  O     3.35473996 +1   13.6931577 +1    2.3097340 +1
  O     5.42009154 +1   10.8848806 +1    2.3247075 +1
  O     0.97018371 +1    9.3513256 +1    0.4338191 +1
  O     2.38754138 +1    7.7135371 +1   -0.1219207 +1
  C     4.38212056 +1   13.0508092 +1    2.1496612 +1
  C     4.42319248 +1   11.5007053 +1    2.0486586 +1
  C     3.11708849 +1   10.9031825 +1    1.6029893 +1
  C     3.35744929 +1    9.5207447 +1    1.0025861 +1
  C     2.11297740 +1    8.9014498 +1    0.4509927 +1
  H     5.58021747 +1   14.6462076 +1    2.0503604 +1
  H     1.56248175 +1    7.2314547 +1   -0.5317140 +1
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