273 Dipyridinium bis(hydrogen-oxalate) oxalic acid (DUVLUB)
(Previous) beta-Maltose monohydrate (MALTOS11)
(Back) Elements:
O 12
C 16
H 16
N 2
(Z = 8)
(Periodic Table)
(Next) Valinomycin (CACYEK10)
Notes: In this crystal there are three oxalic acid molecules for every two pyridine molecules.
Both pyridines are ionized, so that leaves four protons to be shared by three oxalates. This
results in a chain of oxalate - (C2O4)-H-(C2O4)- plus one branch occurs every three oxalates.
The precursers to this co-crystal are Pyridine and Oxalic acid
List of co-crystals
Unit Cell Parameters: a b c alpha beta gamma Volume Density Heat of Formation (Kcal/mol)
X-ray: 26.84 8.91 7.45 90.00 87.06 90.00 1779.04 1.599 -452.9 calc'd using PM7
PM7: 26.91 8.46 7.47 89.82 87.69 90.15 1700.33 1.673 -562.0 calc'd using PM7
PM6: 27.06 8.45 7.36 89.87 86.86 90.05 1680.18 1.693 -506.7 calc'd using PM6
X-Ray PM7 PM6
For X-Ray structure, contact the CCDC: http://www.ccdc.cam.ac.uk/
Optimized PM7 data set:
MERS=(1,1,2) GNORM=4 MOZYME Z=4
Dipyridinium bis(hydrogen-oxalate) oxalic acid (DUVLUB)
O 0.14600731 +1 0.01789345 +1 0.00381741 +1
O -4.51920727 +1 2.11263501 +1 -10.25006891 +1
O -2.91645200 +1 2.45760150 +1 -7.20634364 +1
O -4.34502246 +1 0.87894211 +1 -7.86478926 +1
C -4.09953205 +1 2.78935772 +1 -9.29386664 +1
C -3.72219043 +1 2.02986213 +1 -8.00753236 +1
H -4.01329062 +1 0.32239186 +1 -7.05083362 +1
O -3.90377063 +1 4.01694813 +1 -9.27585813 +1
O -0.17118423 +1 -4.53266096 +1 -9.22483691 +1
O -0.79076011 +1 -6.44662941 +1 -10.16755281 +1
O 0.88923245 +1 -6.07231971 +1 -7.16585917 +1
O -0.55506626 +1 -7.65593895 +1 -7.76762641 +1
C -0.35486170 +1 -5.76174250 +1 -9.22378296 +1
C 0.06390279 +1 -6.50682147 +1 -7.94204176 +1
H -0.20019679 +1 -8.20750251 +1 -6.96030963 +1
O -3.33894562 +1 -0.22090592 +1 -5.64699616 +1
O -2.64830869 +1 -2.09139945 +1 -4.66917319 +1
O -4.30985782 +1 -1.81158528 +1 -7.69880427 +1
O -2.82098206 +1 -3.34077692 +1 -7.06716255 +1
C -3.10127064 +1 -1.44200691 +1 -5.62821167 +1
C -3.47937766 +1 -2.21117419 +1 -6.90882924 +1
H -3.15769964 +1 -3.90623972 +1 -7.86820387 +1
O 0.42326181 +1 -0.30490070 +1 -5.57627906 +1
O 1.02302439 +1 -2.22220279 +1 -4.62137551 +1
O -0.62582026 +1 -1.84189944 +1 -7.63857317 +1
O 0.83071986 +1 -3.41538226 +1 -7.02740134 +1
C 0.59781142 +1 -1.53562789 +1 -5.56983702 +1
C 0.19356963 +1 -2.27676868 +1 -6.85616133 +1
H 0.49762614 +1 -3.96259089 +1 -7.84626718 +1
O 1.65464551 +1 1.59088438 +1 7.78632298 +1
O 2.16888867 +1 3.51659613 +1 8.76286544 +1
O 0.55698871 +1 3.12423545 +1 5.72712331 +1
O 1.96912521 +1 4.72517509 +1 6.36150345 +1
C 1.78200158 +1 2.82873262 +1 7.80196054 +1
C 1.36343477 +1 3.56890099 +1 6.51815954 +1
H 1.62803676 +1 5.27049241 +1 5.53827823 +1
O -2.05883137 +1 -6.97823980 +1 7.82318699 +1
O -1.50193911 +1 -5.05528928 +1 8.78898334 +1
O -3.13168440 +1 -5.44157239 +1 5.76532163 +1
O -1.70993914 +1 -3.84639516 +1 6.39612469 +1
C -1.90561518 +1 -5.74318785 +1 7.83499807 +1
C -2.31895621 +1 -4.99930888 +1 6.55190780 +1
H -2.05135021 +1 -3.29879022 +1 5.57473216 +1
O 1.00976947 +1 -2.65227729 +1 4.18722514 +1
O 0.46215215 +1 -0.72102529 +1 3.23131792 +1
O 2.11478215 +1 -1.11522221 +1 6.24304375 +1
O 0.70096536 +1 0.48513462 +1 5.60786026 +1
C 0.87297336 +1 -1.41724818 +1 4.18043421 +1
C 1.30420264 +1 -0.67243576 +1 5.45558550 +1
H 1.03810031 +1 1.03620245 +1 6.43187129 +1
O -2.71058301 +1 -2.75088873 +1 4.22180526 +1
O -3.29261786 +1 -0.84506462 +1 3.24368301 +1
O -1.65557745 +1 -1.17240748 +1 6.26988175 +1
O -3.10848397 +1 0.38764396 +1 5.63103317 +1
C -2.88092620 +1 -1.51938315 +1 4.20540945 +1
C -2.47896890 +1 -0.75630638 +1 5.48034873 +1
H -2.77243189 +1 0.94735964 +1 6.44518065 +1
O -6.07534813 +1 -7.22197185 +1 13.38740143 +1
O -5.53228447 +1 -5.26631667 +1 14.32790463 +1
C -5.68833372 +1 -6.08045799 +1 13.30966520 +1
H -5.68480371 +1 -5.70901211 +1 15.31243669 +1
C -5.32743388 +1 -5.36336718 +1 11.99950405 +1
O -4.91940937 +1 -4.22790051 +1 11.92643288 +1
O -5.51260257 +1 -6.15810745 +1 10.97007475 +1
H -5.38180769 +1 -5.68397592 +1 9.99877333 +1
O -2.38509215 +1 -7.21570899 +1 13.45863244 +1
O -1.82489600 +1 -5.28402480 +1 14.43064867 +1
C -1.98720401 +1 -6.07592813 +1 13.39612798 +1
H -2.00018717 +1 -5.75275981 +1 15.39894240 +1
C -1.61808396 +1 -5.34936061 +1 12.09437027 +1
O -1.22925296 +1 -4.20767750 +1 12.02438766 +1
O -1.77132831 +1 -6.14898027 +1 11.06351180 +1
H -1.61378941 +1 -5.67754366 +1 10.09616115 +1
O 1.32043398 +1 -3.00994890 +1 -1.37291417 +1
O 0.75810173 +1 -1.09542677 +1 -2.37129785 +1
C 0.91820104 +1 -1.87122889 +1 -1.32595096 +1
H 0.91064985 +1 -1.59257646 +1 -3.33438592 +1
C 0.54395210 +1 -1.12353728 +1 -0.03909570 +1
O 0.69833967 +1 -1.89561584 +1 1.00896326 +1
H 0.54771514 +1 -1.38323875 +1 1.96831264 +1
O -2.38108207 +1 -2.98510516 +1 -1.44266893 +1
O -2.96709620 +1 -1.03798230 +1 -2.36618493 +1
C -2.79285367 +1 -1.85385674 +1 -1.34890173 +1
H -2.79867834 +1 -1.48595348 +1 -3.34045451 +1
C -3.17061484 +1 -1.16211117 +1 -0.03112402 +1
O -3.56803255 +1 -0.02439855 +1 0.05868135 +1
O -3.01776856 +1 -1.97834277 +1 0.98771338 +1
H -3.17427460 +1 -1.50492542 +1 1.95941219 +1
N -4.12986069 +1 -0.65217633 +1 8.54504617 +1
C -3.70222564 +1 0.13939694 +1 9.56687188 +1
C -3.14612029 +1 -0.43293355 +1 10.70964841 +1
C -3.03584372 +1 -1.81790672 +1 10.80638911 +1
C -3.48270255 +1 -2.61189879 +1 9.74865744 +1
C -4.03031129 +1 -2.01038758 +1 8.62074824 +1
H -4.55685658 +1 -0.21489533 +1 7.69661275 +1
H -3.81369035 +1 1.23471812 +1 9.44870559 +1
H -2.80156563 +1 0.22545865 +1 11.52300341 +1
H -2.60732254 +1 -2.29047095 +1 11.69946738 +1
H -3.41777074 +1 -3.70887380 +1 9.80202018 +1
H -4.40918025 +1 -2.60452422 +1 7.76094634 +1
N -0.39219535 +1 -0.65008307 +1 8.59165858 +1
C 0.04532505 +1 0.14229434 +1 9.60870452 +1
C 0.60872765 +1 -0.43022328 +1 10.74709489 +1
C 0.71996616 +1 -1.81594604 +1 10.84264021 +1
C 0.26358293 +1 -2.61043394 +1 9.79027215 +1
C -0.29525046 +1 -2.00790526 +1 8.66796146 +1
H -0.83400681 +1 -0.21229925 +1 7.75099990 +1
H -0.06192951 +1 1.23781500 +1 9.48706863 +1
H 0.95791001 +1 0.22790741 +1 11.55819177 +1
H 1.16003580 +1 -2.28712832 +1 11.73013023 +1
H 0.33070097 +1 -3.70756929 +1 9.83964107 +1
H -0.68310126 +1 -2.60278243 +1 7.81281598 +1
N -4.37926774 +1 -4.96278538 +1 3.37333148 +1
C -4.80424829 +1 -4.19503668 +1 2.33217972 +1
C -5.35049755 +1 -4.79368273 +1 1.19967715 +1
C -5.45997996 +1 -6.18151290 +1 1.13342882 +1
C -5.01579261 +1 -6.95084294 +1 2.20921263 +1
C -4.47266124 +1 -6.32376353 +1 3.32562909 +1
H -3.95452514 +1 -4.50529658 +1 4.21240946 +1
H -4.70507941 +1 -3.09708106 +1 2.43292572 +1
H -5.69354830 +1 -4.15389765 +1 0.37065144 +1
H -5.88918541 +1 -6.67372316 +1 0.25162838 +1
H -5.07947142 +1 -8.04922660 +1 2.18184284 +1
H -4.09794207 +1 -6.89889967 +1 4.19894005 +1
N -0.65478566 +1 -4.91759384 +1 3.37597354 +1
C -1.08363090 +1 -4.15054824 +1 2.33593040 +1
C -1.63710627 +1 -4.74958464 +1 1.20643748 +1
C -1.75057250 +1 -6.13647465 +1 1.14262645 +1
C -1.31114406 +1 -6.90550866 +1 2.22113085 +1
C -0.75653817 +1 -6.27762752 +1 3.33173134 +1
H -0.22119411 +1 -4.46096321 +1 4.20988633 +1
H -0.97806004 +1 -3.05289915 +1 2.43299317 +1
H -1.97851192 +1 -4.11089686 +1 0.37728636 +1
H -2.17818681 +1 -6.62794097 +1 0.25965143 +1
H -1.38699180 +1 -8.00268164 +1 2.19864254 +1
H -0.37421178 +1 -6.85351803 +1 4.20185550 +1
N 0.54513763 +1 -2.24595387 +1 16.81812521 +1
C 0.10450618 +1 -3.03383013 +1 15.79933736 +1
C -0.45911508 +1 -2.45738840 +1 14.66286963 +1
C -0.57896255 +1 -1.07215955 +1 14.57553914 +1
C -0.12401729 +1 -0.28189494 +1 15.63224197 +1
C 0.44394429 +1 -0.88691733 +1 16.74790841 +1
H 0.98926113 +1 -2.68465515 +1 17.65705482 +1
H 0.20686252 +1 -4.13038588 +1 15.91806742 +1
H -0.80621488 +1 -3.11305074 +1 13.84839734 +1
H -1.02584537 +1 -0.59836079 +1 13.69259462 +1
H -0.19879081 +1 0.81479845 +1 15.59015139 +1
H 0.83627881 +1 -0.29395707 +1 17.60325294 +1
N -3.17369349 +1 -2.27658455 +1 16.81429244 +1
C -3.60184839 +1 -3.05997920 +1 15.78712194 +1
C -4.15777738 +1 -2.47963403 +1 14.64841671 +1
C -4.27946457 +1 -1.09417408 +1 14.56773170 +1
C -3.83944468 +1 -0.30849493 +1 15.63437616 +1
C -3.28196591 +1 -0.91781007 +1 16.75308338 +1
H -2.76396767 +1 -2.72015322 +1 17.66497597 +1
H -3.49315318 +1 -4.15635372 +1 15.90012375 +1
H -4.49469854 +1 -3.13118574 +1 13.82609308 +1
H -4.71387304 +1 -0.61417622 +1 13.68175841 +1
H -3.91810221 +1 0.78850571 +1 15.59669561 +1
H -2.90377948 +1 -0.32807983 +1 17.61645249 +1
N -5.30469263 +1 -6.67822257 +1 -4.83971887 +1
C -4.87845247 +1 -7.45065886 +1 -3.80316257 +1
C -4.33030688 +1 -6.85596477 +1 -2.66692537 +1
C -4.21867683 +1 -5.46993339 +1 -2.59465078 +1
C -4.66031771 +1 -4.69622797 +1 -3.66969345 +1
C -5.20799155 +1 -5.31803224 +1 -4.78651790 +1
H -5.73449152 +1 -7.13073761 +1 -5.67779108 +1
H -4.98109706 +1 -8.54840235 +1 -3.90487217 +1
H -3.99246380 +1 -7.49839859 +1 -1.83847725 +1
H -3.79213315 +1 -4.98199427 +1 -1.70926374 +1
H -4.59464452 +1 -3.59903391 +1 -3.63818715 +1
H -5.59003986 +1 -4.73727789 +1 -5.65408750 +1
N -1.57635712 +1 -6.56958060 +1 -4.80797646 +1
C -1.13186396 +1 -7.36843149 +1 -3.79963046 +1
C -0.56701868 +1 -6.80369811 +1 -2.65759822 +1
C -0.45314626 +1 -5.42016676 +1 -2.55126360 +1
C -0.90994582 +1 -4.61857020 +1 -3.59917742 +1
C -1.47430228 +1 -5.21119769 +1 -4.72306418 +1
H -2.02506590 +1 -6.99982231 +1 -5.64985861 +1
H -1.23309803 +1 -8.46395432 +1 -3.92965692 +1
H -0.21689735 +1 -7.46926170 +1 -1.85244556 +1
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PM6 MERS=(1,1,2) GNORM=4 MOZYME Z=4
Dipyridinium bis(hydrogen-oxalate) oxalic acid (DUVLUB)
O 0.08384242 +1 0.00055012 +1 -0.06178692 +1
O -4.46871473 +1 1.99461313 +1 -10.26738858 +1
O -2.99836784 +1 2.39988572 +1 -7.10471148 +1
O -4.18914663 +1 0.68399185 +1 -7.93403564 +1
C -4.00068915 +1 2.65497869 +1 -9.31394140 +1
C -3.67430137 +1 1.90079489 +1 -7.99353147 +1
H -3.91261053 +1 0.13207014 +1 -7.05773967 +1
O -3.73870713 +1 3.87918478 +1 -9.31316886 +1
O -0.05767495 +1 -4.58771069 +1 -9.29802720 +1
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O -0.53538766 +1 -7.76636862 +1 -7.90066922 +1
C -0.30252164 +1 -5.81520599 +1 -9.30032228 +1
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O 1.25699788 +1 -2.21705140 +1 -4.71162794 +1
O -0.28224165 +1 -1.82917187 +1 -7.84908682 +1
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C 0.72665097 +1 -1.57312967 +1 -5.64335208 +1
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C 1.86431678 +1 2.85743726 +1 7.83700321 +1
C 1.49676755 +1 3.61127977 +1 6.52961275 +1
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C 1.16888526 +1 -0.61610893 +1 5.48906095 +1
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C -2.89373402 +1 -1.42412880 +1 4.19518291 +1
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C -5.67125653 +1 -6.09933213 +1 13.39071618 +1
H -5.81873072 +1 -5.81578534 +1 15.40687888 +1
C -5.19946936 +1 -5.35368580 +1 12.12152204 +1
O -4.72706403 +1 -4.23582809 +1 12.09283345 +1
O -5.37381001 +1 -6.11828700 +1 11.05335281 +1
H -5.08052693 +1 -5.61598264 +1 10.10397289 +1
O -2.46686296 +1 -7.19758901 +1 13.43011310 +1
O -1.82575148 +1 -5.31940949 +1 14.48191757 +1
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H -3.32592591 +1 -1.44013713 +1 1.93315763 +1
N -4.13684438 +1 -0.63648280 +1 8.69430094 +1
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