420 Adenosine-3'-phosphate dihydrate (ADPOSD)
(Previous) Phosphatidylcholine (LYPCHL)
(Back) Elements:
O 9
C 10
H 18
N 5
P 1
(Z = 4)
(Periodic Table)
(Next) Phosphorus pentafluoride (PF5)
Unit Cell Parameters: a b c alpha beta gamma Volume Density Heat of Formation (Kcal/mol)
X-ray: 6.34 11.90 9.94 87.78 90.00 90.00 749.39 1.698 -313.7 calc'd using PM7
PM7: 6.35 11.82 9.78 88.09 90.15 89.91 733.56 1.735 -520.5 calc'd using PM7
PM6: 5.91 11.62 10.55 88.61 89.95 90.20 724.72 1.756 -474.5 calc'd using PM6
X-Ray PM7 PM6
For X-Ray structure, contact the CCDC: http://www.ccdc.cam.ac.uk/
Optimized PM7 data set:
MERS=(2,1,1) CCDC GNORM=4
Adenosine-3'-phosphate dihydrate (ADPOSD)
O -0.08826416 +1 0.14489549 +1 0.17922439 +1
C -4.72667869 +1 0.39610856 +1 3.05452921 +1
C -4.15715399 +1 1.83609048 +1 3.22874485 +1
C -4.59469235 +1 2.47316617 +1 4.54515577 +1
C -0.23693932 +1 -3.30644676 +1 1.88155365 +1
C -1.02919301 +1 -1.58564236 +1 3.13740005 +1
C -0.44573393 +1 -2.11054989 +1 4.33100740 +1
C 0.35564128 +1 -3.28919619 +1 4.23537582 +1
C -1.46790825 +1 -0.25915791 +1 4.89062980 +1
C -2.38853990 +1 0.45583598 +1 2.56274047 +1
H 0.94769215 +1 -4.83739344 +1 2.80747990 +1
H -4.48413872 +1 1.78297144 +1 5.40545015 +1
H -5.65110459 +1 2.80568533 +1 4.47294449 +1
H -4.29670963 +1 4.31573857 +1 5.24279528 +1
H -7.02101619 +1 -2.25980336 +1 2.20867996 +1
H -4.61091184 +1 0.68240469 +1 0.56465994 +1
H -0.15645255 +1 -3.87327203 +1 0.92607614 +1
H 0.95412845 +1 -3.40560820 +1 6.18740669 +1
H 1.65225537 +1 -4.61786198 +1 5.18440079 +1
H -1.85895689 +1 0.59731937 +1 5.44756218 +1
H -1.70926197 +1 0.75718929 +1 1.72253568 +1
H -3.67577254 +1 -1.34919677 +1 2.11756404 +1
H -4.64534551 +1 -0.14121768 +1 4.03802137 +1
H -4.33079762 +1 2.50326622 +1 2.35393258 +1
N 0.41859574 +1 -3.86582918 +1 2.96813574 +1
N -0.93135799 +1 -2.18155592 +1 1.90327139 +1
N 0.99682072 +1 -3.83971688 +1 5.26943681 +1
N -0.74473865 +1 -1.26542353 +1 5.39407482 +1
N -1.66489147 +1 -0.41378434 +1 3.50057569 +1
O -2.72877174 +1 1.62261492 +1 3.27792164 +1
O -3.84811333 +1 0.07850734 +1 0.73382989 +1
O -6.00804242 +1 0.41776505 +1 2.46221031 +1
O -3.75759050 +1 3.59162945 +1 4.80631454 +1
O -8.37393970 +1 0.11272192 +1 2.29975643 +1
O -7.00447575 +1 -1.88616260 +1 3.17616336 +1
O -7.28495027 +1 0.05901989 +1 4.65220915 +1
P -7.25394939 +1 -0.32707076 +1 3.21193523 +1
C -3.70334944 +1 -0.23901683 +1 2.08210845 +1
C -3.36919570 +1 2.94281934 +1 -1.14849472 +1
C -2.34801286 +1 3.58022657 +1 -2.12130611 +1
C -2.91950426 +1 5.01955047 +1 -2.29763861 +1
C -2.46576280 +1 5.64891103 +1 -3.61218913 +1
C -6.84196754 +1 -0.13365350 +1 -0.94066822 +1
C -6.04687045 +1 1.58867144 +1 -2.19653652 +1
C -6.63116803 +1 1.06288574 +1 -3.38916525 +1
C -7.43579862 +1 -0.11425848 +1 -3.29352727 +1
C -5.60851939 +1 2.91383908 +1 -3.95099422 +1
C -4.68538580 +1 3.63460026 +1 -1.62847900 +1
H -8.02587553 +1 -1.66460068 +1 -1.87123825 +1
H -2.59299985 +1 4.96129206 +1 -4.47291882 +1
H -1.40052241 +1 5.95226972 +1 -3.53819198 +1
H -2.70729399 +1 7.50126748 +1 -4.31117335 +1
H -0.05767518 +1 0.92874046 +1 -1.27619731 +1
H -2.44993077 +1 3.84434328 +1 0.37436808 +1
H -6.92322507 +1 -0.69944552 +1 0.01546758 +1
H -8.03036411 +1 -0.23139122 +1 -5.24717870 +1
H -8.74238205 +1 -1.43437895 +1 -4.24219828 +1
H -5.21526104 +1 3.76826670 +1 -4.50952472 +1
H -5.36253755 +1 3.93737794 +1 -0.78685164 +1
H -3.39454632 +1 1.83255316 +1 -1.18507116 +1
H -2.42774137 +1 3.04221935 +1 -3.10488280 +1
H -2.75223532 +1 5.69189805 +1 -1.42549832 +1
N -7.49681162 +1 -0.69292896 +1 -2.02671992 +1
N -6.14742038 +1 0.99164530 +1 -0.96256387 +1
N -8.08112927 +1 -0.66129711 +1 -4.32720068 +1
N -6.33323887 +1 1.90769315 +1 -4.45259775 +1
N -5.41107572 +1 2.76057605 +1 -2.56085335 +1
O -4.34732412 +1 4.79957778 +1 -2.35048430 +1
O -3.22778090 +1 3.26079785 +1 0.20004347 +1
O -1.06681738 +1 3.60634380 +1 -1.53030061 +1
O -3.26854506 +1 6.79127102 +1 -3.87711891 +1
O 1.29411895 +1 3.30756551 +1 -1.35808031 +1
O -0.06743771 +1 1.30530857 +1 -2.24192768 +1
O 0.23209602 +1 3.25445135 +1 -3.71430635 +1
P 0.18221735 +1 2.86461085 +1 -2.27623420 +1
H 4.32006166 +1 -0.52674300 +1 -6.00268777 +1
H 5.47432222 +1 -0.30701071 +1 -4.95420215 +1
O 5.08816188 +1 -0.93330814 +1 -5.57871307 +1
H -1.00940071 +1 2.64161144 +1 -4.75686236 +1
H -2.15459773 +1 2.85097598 +1 -5.81891279 +1
O -1.76374153 +1 2.22241798 +1 -5.19811231 +1
H -7.71367478 +1 -3.13186947 +1 0.12082811 +1
H -6.59188730 +1 -3.90329450 +1 0.82154984 +1
O -6.99711562 +1 -3.02917685 +1 0.74976621 +1
H 0.62266910 +1 0.04773739 +1 0.81354641 +1
H -0.49346086 +1 -0.73030974 +1 0.11070877 +1
O -0.09023754 +1 -6.21543745 +1 0.16636041 +1
C -4.73172503 +1 -5.94905341 +1 3.05073298 +1
C -4.16088457 +1 -4.50949893 +1 3.22575746 +1
C -4.59962199 +1 -3.87017171 +1 4.54067674 +1
C -0.24881719 +1 -9.65245765 +1 1.87248895 +1
C -1.03414805 +1 -7.93243852 +1 3.13136942 +1
C -0.44675518 +1 -8.45789964 +1 4.32272398 +1
C 0.34947186 +1 -9.63937805 +1 4.22568434 +1
C -1.46350333 +1 -6.60583450 +1 4.88741211 +1
C -2.39204050 +1 -5.89049822 +1 2.56183668 +1
H 0.94341761 +1 -11.17591835 +1 2.79273373 +1
H -4.48586064 +1 -4.55750659 +1 5.40295671 +1
H -5.65687730 +1 -3.54078975 +1 4.46905314 +1
H -4.30529455 +1 -2.02631809 +1 5.23745344 +1
H -7.02844648 +1 -8.60826768 +1 2.19163310 +1
H -4.62103205 +1 -5.68573465 +1 0.55732013 +1
H -0.17039514 +1 -10.21795367 +1 0.91560551 +1
H 0.95104067 +1 -9.75758715 +1 6.17488917 +1
H 1.64287391 +1 -10.97521857 +1 5.17014371 +1
H -1.85282047 +1 -5.75021344 +1 5.44669615 +1
H -1.71415361 +1 -5.58969006 +1 1.71996140 +1
H -3.67908971 +1 -7.69631696 +1 2.12083673 +1
H -4.65363757 +1 -6.48515130 +1 4.03537918 +1
H -4.33245426 +1 -3.84247761 +1 2.35067707 +1
N 0.40697294 +1 -10.21202134 +1 2.95753313 +1
N -0.94262103 +1 -8.52806670 +1 1.89677584 +1
N 0.99766529 +1 -10.18736760 +1 5.25624067 +1
N -0.73864568 +1 -7.61257698 +1 5.38701154 +1
N -1.66635615 +1 -6.75953599 +1 3.49801834 +1
O -2.73269330 +1 -4.72396972 +1 3.27735208 +1
O -3.84325725 +1 -6.26877997 +1 0.73227128 +1
O -6.01170644 +1 -5.92522955 +1 2.45508603 +1
O -3.76577396 +1 -2.74798997 +1 4.79797126 +1
O -8.37911670 +1 -6.23306432 +1 2.28634560 +1
O -7.00171509 +1 -8.23207894 +1 3.15794080 +1
O -7.29689292 +1 -6.29349859 +1 4.64023651 +1
P -7.25905546 +1 -6.67439201 +1 3.19835906 +1
C -3.70608796 +1 -6.58625883 +1 2.08175809 +1
C -3.37600646 +1 -3.40486196 +1 -1.15398651 +1
C -2.35510373 +1 -2.76854211 +1 -2.12855842 +1
C -2.92936062 +1 -1.32952449 +1 -2.30482861 +1
C -2.47845957 +1 -0.69819496 +1 -3.61933199 +1
C -6.84842044 +1 -6.48274189 +1 -0.94430258 +1
C -6.05578443 +1 -4.76167753 +1 -2.19770818 +1
C -6.63964433 +1 -5.28613637 +1 -3.39179311 +1
C -7.43865216 +1 -6.46573161 +1 -3.30026513 +1
C -5.62129990 +1 -3.43426630 +1 -3.95204267 +1
C -4.69430823 +1 -2.71430805 +1 -1.63080995 +1
H -8.04710978 +1 -7.99645699 +1 -1.87209689 +1
H -2.60552250 +1 -1.38646694 +1 -4.47914189 +1
H -1.41372361 +1 -0.39308725 +1 -3.54577935 +1
H -2.72303996 +1 1.14940074 +1 -4.32927305 +1
H -0.07248671 +1 -5.43198045 +1 -1.28679959 +1
H -2.46688641 +1 -2.48638791 +1 0.36615032 +1
H -6.92962137 +1 -7.05191714 +1 0.01066649 +1
H -8.03500280 +1 -6.58625356 +1 -5.25303021 +1
H -8.73781678 +1 -7.79442843 +1 -4.24697452 +1
H -5.22794245 +1 -2.58012739 +1 -4.50986659 +1
H -5.37052415 +1 -2.41127713 +1 -0.78806718 +1
H -3.40152051 +1 -4.51507241 +1 -1.18889573 +1
H -2.43521872 +1 -3.30563368 +1 -3.11303851 +1
H -2.76158056 +1 -0.65490901 +1 -1.43506488 +1
N -7.50298669 +1 -7.03897910 +1 -2.03235137 +1
N -6.15207134 +1 -5.36010213 +1 -0.96472833 +1
N -8.08421817 +1 -7.01349469 +1 -4.33317684 +1
N -6.34528803 +1 -4.43999011 +1 -4.45441696 +1
N -5.42287594 +1 -3.58774483 +1 -2.56145425 +1
O -4.35710587 +1 -1.55024378 +1 -2.35457436 +1
O -3.23232644 +1 -3.08557272 +1 0.19401043 +1
O -1.07318728 +1 -2.74161883 +1 -1.53732433 +1
O -3.28225952 +1 0.44382958 +1 -3.88406273 +1
O 1.29508756 +1 -3.05675982 +1 -1.36784679 +1
O -0.08771883 +1 -5.04914908 +1 -2.25046302 +1
O 0.22141323 +1 -3.09957493 +1 -3.71884933 +1
P 0.17392541 +1 -3.49193004 +1 -2.27947022 +1
H 4.30620422 +1 -6.87907604 +1 -6.01260825 +1
H 5.46010812 +1 -6.65113193 +1 -4.96366373 +1
O 5.07487350 +1 -7.27919896 +1 -5.58673977 +1
H -1.02422856 +1 -3.70476172 +1 -4.76432847 +1
H -2.16545447 +1 -3.49841311 +1 -5.83167960 +1
O -1.77652830 +1 -4.12357445 +1 -5.20684635 +1
H -7.73251161 +1 -9.47950432 +1 0.10067486 +1
H -6.62607261 +1 -10.26834188 +1 0.80667326 +1
O -7.02129165 +1 -9.38772007 +1 0.73801151 +1
H 0.61451156 +1 -6.31339561 +1 0.80758656 +1
H -0.48863925 +1 -7.09472553 +1 0.09194601 +1
Tv -0.02728819 +1 -12.69197103 +1 -0.01399599 +1
Tv 0.54744189 +1 -0.00632968 +1 -11.81176911 +1
Tv 9.78052016 +1 0.00462437 +1 0.12706773 +1
Optimized PM6 data set:
MERS=(2,1,1) GNORM=4 PM6
Adenosine-3'-phosphate dihydrate (ADPOSD)
O -0.11667417 +1 -0.18384791 +1 0.26819416 +1
C -5.00882955 +1 -0.03465320 +1 3.22356278 +1
C -4.43974267 +1 1.38634777 +1 3.45277177 +1
C -4.51868580 +1 1.84819616 +1 4.90900505 +1
C -0.16279499 +1 -3.47471394 +1 1.85118718 +1
C -0.95258345 +1 -1.68228912 +1 3.03446963 +1
C -0.21673482 +1 -2.04681828 +1 4.20699251 +1
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C -1.33250009 +1 -0.22488023 +1 4.70784731 +1
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