Comparison of Structures of Crystalline Solids Predicted using PM6 with X-Ray (Home)

(Back to Minerals by class)

284 o-Aminophenol_(AMPHOM02)

(Previous)     (Back)     (Next)
                      Unit Cell Parameters:       a      b      c   alpha   beta  gamma   Volume  Density
                                     X-Ray:     7.85   7.25  19.75  90.00  90.00  90.00   1124.4   1.289
                                       PM6:     7.50   8.10  19.70  89.98  90.50  89.98   1196.7   1.211

X-Ray Structure


Structure calculated using PM6


  X-Ray data set:
 MERS=(1,1,1) 1SCF
 o-Aminophenol (AMPHOM02)

  O              0.00000000 +1    0.0000000 +1    0.0000000 +1                  0.0000
  C              1.28800000 +1   -0.1180000 +1   -0.4530000 +1                  0.0000
  C              1.80900000 +1    0.6330000 +1   -1.4830000 +1                  0.0000
  C              3.11300000 +1    0.4510000 +1   -1.8910000 +1                  0.0000
  C              3.90900000 +1   -0.4800000 +1   -1.2580000 +1                  0.0000
  C              3.39100000 +1   -1.2390000 +1   -0.2200000 +1                  0.0000
  N              1.48100000 +1   -1.8930000 +1    1.1730010 +1                  0.0000
  H              1.18900000 +1    1.2690000 +1   -1.9550000 +1                  0.0000
  H              3.46000000 +1    0.9710000 +1   -2.6380000 +1                  0.0000
  H              4.80300000 +1   -0.6160000 +1   -1.5540000 +1                  0.0000
  H              3.93400000 +1   -1.9210000 +1    0.2830000 +1                  0.0000
  H             -0.51000000 +1    0.6380000 +1   -0.6120000 +1                  0.0000
  H              2.11700000 +1   -2.3490000 +1    1.6490000 +1                  0.0000
  H              0.87300000 +1   -1.3990000 +1    1.7360000 +1                  0.0000
  C              2.08400000 +1   -1.0680000 +1    0.1920000 +1                  0.0000
  C              7.64200000 +1    2.5570000 +1    0.1920010 +1                  0.0000
  C              8.43800000 +1    3.5070000 +1   -0.4530000 +1                  0.0000
  C              7.91600000 +1    4.2580000 +1   -1.4830000 +1                  0.0000
  C              6.61300000 +1    4.0760000 +1   -1.8910000 +1                  0.0000
  C              5.81700000 +1    3.1450000 +1   -1.2580000 +1                  0.0000
  C              6.33400000 +1    2.3860000 +1   -0.2200000 +1                  0.0000
  O              9.72500000 +1    3.6250000 +1    0.0000000 +1                  0.0000
  N              8.24400000 +1    1.7320000 +1    1.1730010 +1                  0.0000
  H              8.53600000 +1    4.8940000 +1   -1.9550000 +1                  0.0000
  H              6.26500000 +1    4.5960000 +1   -2.6380000 +1                  0.0000
  H              4.92200000 +1    3.0090000 +1   -1.5540000 +1                  0.0000
  H              5.79100000 +1    1.7040000 +1    0.2830000 +1                  0.0000
  H             10.23500000 +1    4.2630000 +1   -0.6120000 +1                  0.0000
  H              7.60800000 +1    1.2760000 +1    1.6490000 +1                  0.0000
  H              8.85200000 +1    2.2260000 +1    1.7360000 +1                  0.0000
  C              2.08400000 +1    3.7210000 +1    4.1180010 +1                  0.0000
  C              1.28800000 +1    2.7710000 +1    3.4730000 +1                  0.0000
  C              1.80900000 +1    2.0200000 +1    2.4430000 +1                  0.0000
  C              3.11300000 +1    2.2020000 +1    2.0350000 +1                  0.0000
  C              3.90900000 +1    3.1330000 +1    2.6680000 +1                  0.0000
  C              3.39100000 +1    3.8920000 +1    3.7060000 +1                  0.0000
  O              0.00000000 +1    2.6530000 +1    3.9260000 +1                  0.0000
  N              1.48100000 +1    4.5460000 +1    5.0990000 +1                  0.0000
  H              1.18900000 +1    1.3850000 +1    1.9710000 +1                  0.0000
  H              3.46000000 +1    1.6820000 +1    1.2880000 +1                  0.0000
  H              4.80300000 +1    3.2690000 +1    2.3720000 +1                  0.0000
  H              3.93400000 +1    4.5740000 +1    4.2090000 +1                  0.0000
  H             -0.51000000 +1    2.0150000 +1    3.3140000 +1                  0.0000
  H              2.11700000 +1    5.0020000 +1    5.5750000 +1                  0.0000
  H              0.87300000 +1    4.0520000 +1    5.6620000 +1                  0.0000
  C              7.64200000 +1    0.0960000 +1    4.1180010 +1                  0.0000
  C              8.43800000 +1   -0.8540000 +1    3.4730000 +1                  0.0000
  C              7.91600000 +1   -1.6050000 +1    2.4430000 +1                  0.0000
  C              6.61300000 +1   -1.4230000 +1    2.0350000 +1                  0.0000
  C              5.81700000 +1   -0.4920000 +1    2.6680000 +1                  0.0000
  C              6.33400000 +1    0.2670000 +1    3.7060000 +1                  0.0000
  O              9.72500000 +1   -0.9720000 +1    3.9260000 +1                  0.0000
  N              8.24400000 +1    0.9210000 +1    5.0990000 +1                  0.0000
  H              8.53600000 +1   -2.2410000 +1    1.9710000 +1                  0.0000
  H              6.26500000 +1   -1.9430000 +1    1.2880000 +1                  0.0000
  H              4.92200000 +1   -0.3560000 +1    2.3720000 +1                  0.0000
  H              5.79100000 +1    0.9490000 +1    4.2090000 +1                  0.0000
  H             10.23500000 +1   -1.6100000 +1    3.3140000 +1                  0.0000
  H              7.60800000 +1    1.3770000 +1    5.5750000 +1                  0.0000
  H              8.85200000 +1    0.4270000 +1    5.6620000 +1                  0.0000
  C             -2.23400100 +1    0.0960000 +1   -4.3840000 +1                  0.0000
  C             -1.43800000 +1   -0.8540000 +1   -3.7390000 +1                  0.0000
  C             -1.95899900 +1   -1.6050000 +1   -2.7090000 +1                  0.0000
  C             -3.26300000 +1   -1.4230000 +1   -2.3010000 +1                  0.0000
  C             -4.05900000 +1   -0.4920000 +1   -2.9340000 +1                  0.0000
  C             -3.54100000 +1    0.2670000 +1   -3.9720000 +1                  0.0000
  O             -0.14999900 +1   -0.9720000 +1   -4.1920000 +1                  0.0000
  N             -1.63100000 +1    0.9210000 +1   -5.3650000 +1                  0.0000
  H             -1.33900000 +1   -2.2410000 +1   -2.2370000 +1                  0.0000
  H             -3.61000000 +1   -1.9430000 +1   -1.5540000 +1                  0.0000
  H             -4.95300000 +1   -0.3560000 +1   -2.6380000 +1                  0.0000
  H             -4.08400000 +1    0.9490000 +1   -4.4750000 +1                  0.0000
  H              0.36000100 +1   -1.6100000 +1   -3.5800000 +1                  0.0000
  H             -2.26700000 +1    1.3770000 +1   -5.8410000 +1                  0.0000
  H             -1.02300100 +1    0.4270000 +1   -5.9280000 +1                  0.0000
  C             -7.79200000 +1    3.7210000 +1   -4.3840000 +1                  0.0000
  C             -8.58800000 +1    2.7710000 +1   -3.7390000 +1                  0.0000
  C             -8.06600000 +1    2.0200000 +1   -2.7090000 +1                  0.0000
  C             -6.76300000 +1    2.2020000 +1   -2.3010000 +1                  0.0000
  C             -5.96700000 +1    3.1330000 +1   -2.9340000 +1                  0.0000
  C             -6.48400000 +1    3.8920000 +1   -3.9720000 +1                  0.0000
  O             -9.87500000 +1    2.6530000 +1   -4.1920000 +1                  0.0000
  N             -8.39400000 +1    4.5460000 +1   -5.3650000 +1                  0.0000
  H             -8.68600000 +1    1.3850000 +1   -2.2370000 +1                  0.0000
  H             -6.41500000 +1    1.6820000 +1   -1.5540000 +1                  0.0000
  H             -5.07200000 +1    3.2690000 +1   -2.6380000 +1                  0.0000
  H             -5.94100000 +1    4.5740000 +1   -4.4750000 +1                  0.0000
  H            -10.38500000 +1    2.0150000 +1   -3.5800000 +1                  0.0000
  H             -7.75800000 +1    5.0020000 +1   -5.8410000 +1                  0.0000
  H             -9.00200000 +1    4.0520000 +1   -5.9280000 +1                  0.0000
  C             -2.23400100 +1    2.5570000 +1   -0.4579990 +1                  0.0000
  C             -1.43800000 +1    3.5070000 +1    0.1870010 +1                  0.0000
  C             -1.95899900 +1    4.2580000 +1    1.2170000 +1                  0.0000
  C             -3.26300000 +1    4.0760000 +1    1.6250000 +1                  0.0000
  C             -4.05900000 +1    3.1450000 +1    0.9920000 +1                  0.0000
  C             -3.54100000 +1    2.3860000 +1   -0.0460000 +1                  0.0000
  O             -0.14999900 +1    3.6250000 +1   -0.2660000 +1                  0.0000
  N             -1.63100000 +1    1.7320000 +1   -1.4389990 +1                  0.0000
  H             -1.33900000 +1    4.8940000 +1    1.6890000 +1                  0.0000
  H             -3.61000000 +1    4.5960000 +1    2.3720000 +1                  0.0000
  H             -4.95300000 +1    3.0090000 +1    1.2880000 +1                  0.0000
  H             -4.08400000 +1    1.7040000 +1   -0.5490000 +1                  0.0000
  H              0.36000100 +1    4.2630000 +1    0.3460000 +1                  0.0000
  H             -2.26700000 +1    1.2760000 +1   -1.9150000 +1                  0.0000
  H             -1.02300100 +1    2.2260000 +1   -2.0020000 +1                  0.0000
  C             -7.79200000 +1   -1.0680000 +1   -0.4579990 +1                  0.0000
  C             -8.58800000 +1   -0.1180000 +1    0.1870010 +1                  0.0000
  C             -8.06600000 +1    0.6330000 +1    1.2170000 +1                  0.0000
  C             -6.76300000 +1    0.4510000 +1    1.6250000 +1                  0.0000
  C             -5.96700000 +1   -0.4800000 +1    0.9920000 +1                  0.0000
  C             -6.48400000 +1   -1.2390000 +1   -0.0460000 +1                  0.0000
  O             -9.87500000 +1    0.0000000 +1   -0.2660000 +1                  0.0000
  N             -8.39400000 +1   -1.8930000 +1   -1.4389990 +1                  0.0000
  H             -8.68600000 +1    1.2690000 +1    1.6890000 +1                  0.0000
  H             -6.41500000 +1    0.9710000 +1    2.3720000 +1                  0.0000
  H             -5.07200000 +1   -0.6160000 +1    1.2880000 +1                  0.0000
  H             -5.94100000 +1   -1.9210000 +1   -0.5490000 +1                  0.0000
  H            -10.38500000 +1    0.6380000 +1    0.3460000 +1                  0.0000
  H             -7.75800000 +1   -2.3490000 +1   -1.9150000 +1                  0.0000
  H             -9.00200000 +1   -1.3990000 +1   -2.0020000 +1                  0.0000
 Tv              0.00000000 +1    0.0000000 +1   -7.8520000 +1 
 Tv              0.00000000 +1    7.2500000 +1    0.0000000 +1 
 Tv             19.75100000 +1    0.0000000 +1    0.0000000 +1 
 
  Optimized PM6 data set:
 MERS=(1,1,1) GNORM=5
 o-Aminophenol (AMPHOM02)

  O         0.22631072 +1    0.0577563 +1    0.0305273 +1                      0.0000
  C         1.38987226 +1   -0.3745631 +1   -0.2645567 +1                      0.0000
  C         2.22503553 +1    0.2623914 +1   -1.2405582 +1                      0.0000
  C         3.48383703 +1   -0.2270081 +1   -1.5074359 +1                      0.0000
  C         3.98440622 +1   -1.3711404 +1   -0.8419133 +1                      0.0000
  C         3.19352832 +1   -2.0298050 +1    0.0848767 +1                      0.0000
  N         1.01441589 +1   -2.2785170 +1    1.2838715 +1                      0.0000
  H         1.84074202 +1    1.1409891 +1   -1.7519793 +1                      0.0000
  H         4.11659142 +1    0.2658995 +1   -2.2504248 +1                      0.0000
  H         4.99138515 +1   -1.7187743 +1   -1.0580677 +1                      0.0000
  H         3.56808995 +1   -2.9216379 +1    0.5963876 +1                      0.0000
  H        -0.50099544 +1    1.1272805 +1   -1.0119838 +1                      0.0000
  H         1.54679281 +1   -2.8395584 +1    1.9648239 +1                      0.0000
  H         0.41296303 +1   -1.6002206 +1    1.8265795 +1                      0.0000
  C         1.89981748 +1   -1.5610716 +1    0.3576591 +1                      0.0000
  C         7.81316973 +1    2.4891239 +1    0.3310883 +1                      0.0000
  C         8.29204432 +1    3.6911845 +1   -0.2863286 +1                      0.0000
  C         7.42780538 +1    4.3286286 +1   -1.2359993 +1                      0.0000
  C         6.17124691 +1    3.8242281 +1   -1.4844370 +1                      0.0000
  C         5.70258357 +1    2.6625601 +1   -0.8259404 +1                      0.0000
  C         6.52192760 +1    2.0039641 +1    0.0760222 +1                      0.0000
  O         9.45438991 +1    4.1384374 +1   -0.0086455 +1                      0.0000
  N         8.72909852 +1    1.7745383 +1    1.2295719 +1                      0.0000
  H         7.78809640 +1    5.2207718 +1   -1.7423413 +1                      0.0000
  H         5.51571603 +1    4.3189173 +1   -2.2063236 +1                      0.0000
  H         4.69694109 +1    2.3011128 +1   -1.0269462 +1                      0.0000
  H         6.17109748 +1    1.0994192 +1    0.5819672 +1                      0.0000
  H        10.14790674 +1    5.2207006 +1   -1.0625253 +1                      0.0000
  H         8.22414030 +1    1.1635929 +1    1.8877508 +1                      0.0000
  H         9.30454173 +1    2.4546560 +1    1.7968786 +1                      0.0000
  C         1.97318878 +1    4.2141691 +1    4.0956202 +1                      0.0000
  C         1.45571358 +1    3.0309745 +1    3.4726886 +1                      0.0000
  C         2.28598263 +1    2.3892728 +1    2.4961002 +1                      0.0000
  C         3.54885945 +1    2.8692816 +1    2.2307858 +1                      0.0000
  C         4.05889803 +1    4.0071890 +1    2.9001011 +1                      0.0000
  C         3.27216080 +1    4.6709376 +1    3.8269400 +1                      0.0000
  O         0.28914858 +1    2.6072044 +1    3.7689987 +1                      0.0000
  N         1.08617455 +1    4.9385383 +1    5.0151870 +1                      0.0000
  H         1.89446719 +1    1.5151746 +1    1.9819950 +1                      0.0000
  H         4.17773087 +1    2.3732328 +1    1.4865176 +1                      0.0000
  H         5.06900557 +1    4.3470632 +1    2.6854959 +1                      0.0000
  H         3.65504632 +1    5.5577437 +1    4.3410334 +1                      0.0000
  H        -0.44490477 +1    1.5254916 +1    2.7457090 +1                      0.0000
  H         1.61418910 +1    5.5282027 +1    5.6746502 +1                      0.0000
  H         0.50385943 +1    4.2631187 +1    5.5817812 +1                      0.0000
  C         7.88211265 +1    0.1615360 +1    4.0888044 +1                      0.0000
  C         8.35548969 +1   -1.0411838 +1    3.4688237 +1                      0.0000
  C         7.49115378 +1   -1.6700483 +1    2.5136461 +1                      0.0000
  C         6.23601293 +1   -1.1605798 +1    2.2672522 +1                      0.0000
  C         5.77008665 +1   -0.0023950 +1    2.9331240 +1                      0.0000
  C         6.59152105 +1    0.6501936 +1    3.8381033 +1                      0.0000
  O         9.51396909 +1   -1.4966087 +1    3.7493153 +1                      0.0000
  N         8.80538273 +1    0.8702536 +1    4.9844136 +1                      0.0000
  H         7.84934866 +1   -2.5600499 +1    2.0025270 +1                      0.0000
  H         5.57972942 +1   -1.6490849 +1    1.5419709 +1                      0.0000
  H         4.76435821 +1    0.3611122 +1    2.7361850 +1                      0.0000
  H         6.24033237 +1    1.5513916 +1    4.3497552 +1                      0.0000
  H        10.19520511 +1   -2.5678711 +1    2.6828684 +1                      0.0000
  H         8.30645099 +1    1.4783853 +1    5.6496668 +1                      0.0000
  H         9.38428109 +1    0.1865488 +1    5.5434562 +1                      0.0000
  C        -2.12319617 +1    0.1628375 +1   -4.3765190 +1                      0.0000
  C        -1.60340181 +1   -1.0207317 +1   -3.7567513 +1                      0.0000
  C        -2.43126359 +1   -1.6640038 +1   -2.7786447 +1                      0.0000
  C        -3.69330595 +1   -1.1850983 +1   -2.5087599 +1                      0.0000
  C        -4.20515000 +1   -0.0454938 +1   -3.1739127 +1                      0.0000
  C        -3.42139862 +1    0.6191264 +1   -4.1024048 +1                      0.0000
  O        -0.43846444 +1   -1.4462555 +1   -4.0561692 +1                      0.0000
  N        -1.24475541 +1    0.8907861 +1   -5.3014918 +1                      0.0000
  H        -2.03886378 +1   -2.5401182 +1   -2.2684648 +1                      0.0000
  H        -4.32087978 +1   -1.6835391 +1   -1.7650094 +1                      0.0000
  H        -5.21473461 +1    0.2937588 +1   -2.9562784 +1                      0.0000
  H        -3.80547325 +1    1.5059710 +1   -4.6153508 +1                      0.0000
  H         0.28198091 +1   -2.5359781 +1   -3.0297069 +1                      0.0000
  H        -1.78100688 +1    1.4792393 +1   -5.9559882 +1                      0.0000
  H        -0.66337469 +1    0.2191760 +1   -5.8732882 +1                      0.0000
  C        -8.03502832 +1    4.2095871 +1   -4.3440222 +1                      0.0000
  C        -8.50460843 +1    3.0074593 +1   -3.7201750 +1                      0.0000
  C        -7.63627601 +1    2.3808560 +1   -2.7675557 +1                      0.0000
  C        -6.38210279 +1    2.8945667 +1   -2.5241677 +1                      0.0000
  C        -5.92123163 +1    4.0539962 +1   -3.1913667 +1                      0.0000
  C        -6.74592852 +1    4.7028354 +1   -4.0960092 +1                      0.0000
  O        -9.66488195 +1    2.5528951 +1   -3.9956994 +1                      0.0000
  N        -8.96229428 +1    4.9127130 +1   -5.2395414 +1                      0.0000
  H        -7.99112948 +1    1.4907475 +1   -2.2541538 +1                      0.0000
  H        -5.72317477 +1    2.4086540 +1   -1.7995456 +1                      0.0000
  H        -4.91765403 +1    4.4229182 +1   -2.9944567 +1                      0.0000
  H        -6.39920371 +1    5.6052096 +1   -4.6085947 +1                      0.0000
  H       -10.34418355 +1    1.4818834 +1   -2.9341902 +1                      0.0000
  H        -8.46696842 +1    5.5038864 +1   -5.9222697 +1                      0.0000
  H        -9.55378228 +1    4.2243142 +1   -5.7803933 +1                      0.0000
  C        -2.05094942 +1    2.4909438 +1   -0.6363392 +1                      0.0000
  C        -1.53641659 +1    3.6760423 +1   -0.0150869 +1                      0.0000
  C        -2.36657043 +1    4.3136263 +1    0.9649309 +1                      0.0000
  C        -3.62703594 +1    3.8296126 +1    1.2331153 +1                      0.0000
  C        -4.13363625 +1    2.6891351 +1    0.5658729 +1                      0.0000
  C        -3.34663491 +1    2.0278727 +1   -0.3623762 +1                      0.0000
  O        -0.37404089 +1    4.1075420 +1   -0.3152943 +1                      0.0000
  N        -1.16887397 +1    1.7685802 +1   -1.5618667 +1                      0.0000
  H        -1.97722489 +1    5.1896228 +1    1.4774981 +1                      0.0000
  H        -4.25730392 +1    4.3240984 +1    1.9773793 +1                      0.0000
  H        -5.14276806 +1    2.3470331 +1    0.7817041 +1                      0.0000
  H        -3.72576415 +1    1.1384109 +1   -0.8744307 +1                      0.0000
  H         0.36419328 +1    5.1672255 +1    0.7309044 +1                      0.0000
  H        -1.70395005 +1    1.1916445 +1   -2.2270441 +1                      0.0000
  H        -0.57909349 +1    2.4433705 +1   -2.1216846 +1                      0.0000
  C        -7.96186694 +1   -1.5549766 +1   -0.5820645 +1                      0.0000
  C        -8.43612576 +1   -0.3522852 +1    0.0374703 +1                      0.0000
  C        -7.57000724 +1    0.2806357 +1    0.9883863 +1                      0.0000
  C        -6.31471677 +1   -0.2283977 +1    1.2345571 +1                      0.0000
  C        -5.84890319 +1   -1.3882803 +1    0.5710498 +1                      0.0000
  C        -6.67101367 +1   -2.0432009 +1   -0.3311207 +1                      0.0000
  O        -9.59785258 +1    0.0970321 +1   -0.2398316 +1                      0.0000
  N        -8.88454040 +1   -2.2647123 +1   -1.4775001 +1                      0.0000
  H        -7.92822357 +1    1.1712104 +1    1.4988938 +1                      0.0000
  H        -5.65865501 +1    0.2617346 +1    1.9591347 +1                      0.0000
  H        -4.84355693 +1   -1.7521191 +1    0.7693729 +1                      0.0000
  H        -6.32203680 +1   -2.9467809 +1   -0.8397239 +1                      0.0000
  H       -10.29362229 +1    1.1743759 +1    0.8099455 +1                      0.0000
  H        -8.38488134 +1   -2.8709655 +1   -2.1439216 +1                      0.0000
  H        -9.46464228 +1   -1.5812796 +1   -2.0361523 +1                      0.0000
 Tv        -0.12386357 +1   -0.0028777 +1   -7.4961781 +1 
 Tv         0.00521671 +1    8.1011889 +1   -0.0061078 +1 
 Tv        19.70394482 +1   -0.0061377 +1   -0.1527911 +1