Comparison of Structures of Crystalline Solids Predicted using PM6 with X-Ray (Home)

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252 Topaz (Al2SiO4F2)

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                      Unit Cell Parameters:       a      b      c   alpha   beta  gamma   Volume  Density
                                     X-Ray:     9.33   4.42   8.39  90.00  90.00  90.00    345.4   3.539
                                       PM6:     7.11   4.18   8.95  89.74  89.07  89.63    265.9   4.597
                 X-Ray                               PM6
 
  X-Ray data set:
 1SCF MERS=(1,2,1)
      Topaz

 Al              0.00000000 +1    0.0000000 +1    0.0000000 +1                  0.0000
  O              0.22600000 +1    3.4170000 +1    2.7809990 +1                  0.0000
 Al              0.88900000 +1    2.3130000 +1    4.1919990 +1                  0.0000
  O             -3.26900000 +1   -2.9770000 +1    2.7809990 +1                  0.0000
  O             -0.91000000 +1    5.4780000 +1    4.0969990 +1                  0.0000
  F              2.31200000 +1    3.3940000 +1    4.3749990 +1                  0.0000
 Al              0.88900000 +1    2.3130000 +1    1.3689990 +1                  0.0000
  O             -0.91000000 +1   -3.3560000 +1    1.4649990 +1                  0.0000
  F              2.31200000 +1    3.3940000 +1    1.1859990 +1                  0.0000
 Al              3.22000000 +1    4.4170000 +1   -0.0010010 +1                  0.0000
 Al             -2.33100000 +1   -2.1040000 +1    1.3689990 +1                  0.0000
 Al             -2.33100000 +1   -2.1040000 +1    4.1919990 +1                  0.0000
 Al              3.22000000 +1    4.4170000 +1   -2.8230000 +1                  0.0000
  O              1.82600000 +1    1.4400000 +1    2.7809990 +1                  0.0000
  O              1.42200000 +1    1.2520000 +1   -0.0970010 +1                  0.0000
  O             -0.53300000 +1    1.0610000 +1    1.4649990 +1                  0.0000
  O             -0.53300000 +1    1.0610000 +1    4.0969990 +1                  0.0000
  O              1.42200000 +1    1.2520000 +1   -2.7280000 +1                  0.0000
  F             -0.01900000 +1    3.3360000 +1    0.1819990 +1                  0.0000
  F             -0.01900000 +1    3.3360000 +1    5.3799990 +1                  0.0000
 Si             -0.02000000 +1    5.0510000 +1    2.7809990 +1                  0.0000
 Si              0.90800000 +1   -2.7390000 +1   -1.4120000 +1                  0.0000
  O              0.66300000 +1   -1.1050000 +1   -1.4120000 +1                  0.0000
  O             -0.50500000 +1   -3.5450000 +1   -1.4120000 +1                  0.0000
  O              1.79800000 +1   -3.1660000 +1   -0.0960000 +1                  0.0000
  F             -1.42400000 +1   -1.0820000 +1    0.1819990 +1                  0.0000
 Al              0.00000000 +1    0.0000000 +1   -2.8230000 +1                  0.0000
  O              1.79800000 +1   -3.1660000 +1   -2.7280000 +1                  0.0000
  F             -1.42400000 +1   -1.0820000 +1   -3.0060000 +1                  0.0000
  O             -0.93700000 +1    0.8730000 +1   -1.4120000 +1                  0.0000
  F              0.90800000 +1   -1.0230000 +1   -4.0110000 +1                  0.0000
  F              0.90800000 +1   -1.0230000 +1    1.1870000 +1                  0.0000
 Si              2.31200000 +1    1.6780000 +1   -1.4120000 +1                  0.0000
  O              2.55700000 +1    3.3130000 +1   -1.4120000 +1                  0.0000
 Si             -1.42300000 +1    0.6340000 +1    2.7809990 +1                  0.0000
  O             -1.66900000 +1   -1.0000000 +1    2.7809990 +1                  0.0000
 Al              4.66300000 +1    0.0000000 +1    0.0000000 +1                  0.0000
  O              4.88900000 +1    3.4170000 +1    2.7809990 +1                  0.0000
 Al              5.55200000 +1    2.3130000 +1    4.1919990 +1                  0.0000
  O              1.39400000 +1   -2.9770000 +1    2.7809990 +1                  0.0000
  O              3.75300000 +1    5.4780000 +1    4.0969990 +1                  0.0000
  F              6.97500000 +1    3.3940000 +1    4.3749990 +1                  0.0000
 Al              5.55200000 +1    2.3130000 +1    1.3689990 +1                  0.0000
  O              3.75300000 +1   -3.3560000 +1    1.4649990 +1                  0.0000
  F              6.97500000 +1    3.3940000 +1    1.1859990 +1                  0.0000
 Al              7.88300000 +1    4.4170000 +1   -0.0010010 +1                  0.0000
 Al              2.33200000 +1   -2.1040000 +1    1.3689990 +1                  0.0000
 Al              2.33200000 +1   -2.1040000 +1    4.1919990 +1                  0.0000
 Al              7.88300000 +1    4.4170000 +1   -2.8230000 +1                  0.0000
  O              6.48900000 +1    1.4400000 +1    2.7809990 +1                  0.0000
  O              6.08500000 +1    1.2520000 +1   -0.0970010 +1                  0.0000
  O              4.13000000 +1    1.0610000 +1    1.4649990 +1                  0.0000
  O              4.13000000 +1    1.0610000 +1    4.0969990 +1                  0.0000
  O              6.08500000 +1    1.2520000 +1   -2.7280000 +1                  0.0000
  F              4.64400000 +1    3.3360000 +1    0.1819990 +1                  0.0000
  F              4.64400000 +1    3.3360000 +1    5.3799990 +1                  0.0000
 Si              4.64300000 +1    5.0510000 +1    2.7809990 +1                  0.0000
 Si              5.57100000 +1   -2.7390000 +1   -1.4120000 +1                  0.0000
  O              5.32600000 +1   -1.1050000 +1   -1.4120000 +1                  0.0000
  O              4.15800000 +1   -3.5450000 +1   -1.4120000 +1                  0.0000
  O              6.46100000 +1   -3.1660000 +1   -0.0960000 +1                  0.0000
  F              3.23900000 +1   -1.0820000 +1    0.1819990 +1                  0.0000
 Al              4.66300000 +1    0.0000000 +1   -2.8230000 +1                  0.0000
  O              6.46100000 +1   -3.1660000 +1   -2.7280000 +1                  0.0000
  F              3.23900000 +1   -1.0820000 +1   -3.0060000 +1                  0.0000
  O              3.72600000 +1    0.8730000 +1   -1.4120000 +1                  0.0000
  F              5.57100000 +1   -1.0230000 +1   -4.0110000 +1                  0.0000
  F              5.57100000 +1   -1.0230000 +1    1.1870000 +1                  0.0000
 Si              6.97500000 +1    1.6780000 +1   -1.4120000 +1                  0.0000
  O              7.22000000 +1    3.3130000 +1   -1.4120000 +1                  0.0000
 Si              3.24000000 +1    0.6340000 +1    2.7809990 +1                  0.0000
  O              2.99400000 +1   -1.0000000 +1    2.7809990 +1                  0.0000
 Tv              9.32600000 +1    0.0000000 +1    0.0000000 +1 
 Tv              0.00000000 +1   -8.8340000 +1    0.0000000 +1 
 Tv              0.00000000 +1    0.0000000 +1   -8.3859990 +1 
 
  Optimized PM6 data set:
 MERS=(1,2,1) GNORM=5
      Topaz

 Al         0.20262749 +1    0.1752953 +1   -0.2069442 +1                      0.0000
  O         0.75423477 +1    2.9881174 +1    2.7887796 +1                      0.0000
 Al         1.58000633 +1    2.1599898 +1    4.2543159 +1                      0.0000
  O        -1.70280608 +1   -3.4167255 +1    2.9188712 +1                      0.0000
  O        -0.02239912 +1    5.6083813 +1    4.1927991 +1                      0.0000
  F         2.75921210 +1    3.5798440 +1    4.3573338 +1                      0.0000
 Al         1.71138491 +1    2.0628723 +1    1.4546306 +1                      0.0000
  O         0.16049374 +1   -2.8412374 +1    1.4579171 +1                      0.0000
  F         2.83801222 +1    3.5109183 +1    1.3160329 +1                      0.0000
 Al         3.53294212 +1    4.3338623 +1   -0.2397298 +1                      0.0000
 Al        -1.61524471 +1   -2.1126206 +1    1.4655394 +1                      0.0000
 Al        -1.74564414 +1   -2.0191260 +1    4.2721846 +1                      0.0000
 Al         3.66409969 +1    4.2489773 +1   -3.0413712 +1                      0.0000
  O         1.68990728 +1    0.7639809 +1    2.8987566 +1                      0.0000
  O         1.96743767 +1    0.8997234 +1   -0.0882939 +1                      0.0000
  O        -0.05662139 +1    1.3352436 +1    1.3438223 +1                      0.0000
  O        -0.18625925 +1    1.4240925 +1    4.3127942 +1                      0.0000
  O         2.10629772 +1    0.7968703 +1   -3.0656198 +1                      0.0000
  F         1.15328624 +1    2.9162953 +1   -0.1409892 +1                      0.0000
  F         0.87344272 +1    3.0860424 +1    5.7438617 +1                      0.0000
 Si         0.02550700 +1    4.5473837 +1    2.7353424 +1                      0.0000
 Si         1.89910102 +1   -2.3159969 +1   -1.4965494 +1                      0.0000
  O         1.17062425 +1   -0.7549294 +1   -1.5365684 +1                      0.0000
  O         0.12117200 +1   -2.7212233 +1   -1.5458194 +1                      0.0000
  O         1.81141239 +1   -3.2870862 +1    0.0188297 +1                      0.0000
  F        -0.88802407 +1   -1.2984363 +1   -0.0822282 +1                      0.0000
 Al         0.34338388 +1    0.0592941 +1   -3.0086440 +1                      0.0000
  O         1.94188656 +1   -3.3820600 +1   -2.9554780 +1                      0.0000
  F        -0.85082368 +1   -1.3498279 +1   -3.1185168 +1                      0.0000
  O         0.22718716 +1    1.4648963 +1   -1.6555036 +1                      0.0000
  F         1.03244082 +1   -0.8734603 +1   -4.5044710 +1                      0.0000
  F         0.76900085 +1   -0.6808460 +1    1.3848112 +1                      0.0000
 Si         1.99415769 +1    1.8565311 +1   -1.6146735 +1                      0.0000
  O         2.70438537 +1    3.4180439 +1   -1.6491426 +1                      0.0000
 Si        -0.07928277 +1    0.3661129 +1    2.8596589 +1                      0.0000
  O        -0.79199365 +1   -1.1948763 +1    2.8762122 +1                      0.0000
 Al         3.75804271 +1    0.1699872 +1   -0.1145324 +1                      0.0000
  O         4.29363651 +1    2.9780028 +1    2.8868960 +1                      0.0000
 Al         5.12938534 +1    2.1601482 +1    4.3541405 +1                      0.0000
  O         1.85388291 +1   -3.4085036 +1    3.0139725 +1                      0.0000
  O         3.53298536 +1    5.6088380 +1    4.2820889 +1                      0.0000
  F         6.31737583 +1    3.5726980 +1    4.4408286 +1                      0.0000
 Al         5.26615195 +1    2.0644488 +1    1.5542129 +1                      0.0000
  O         3.71229049 +1   -2.8451411 +1    1.5442432 +1                      0.0000
  F         6.38914567 +1    3.5145250 +1    1.4083093 +1                      0.0000
 Al         7.08883138 +1    4.3407988 +1   -0.1450070 +1                      0.0000
 Al         1.94216149 +1   -2.1084746 +1    1.5625986 +1                      0.0000
 Al         1.81047501 +1   -2.0175597 +1    4.3680858 +1                      0.0000
 Al         7.22052440 +1    4.2377207 +1   -2.9497663 +1                      0.0000
  O         5.24272960 +1    0.7628747 +1    2.9956704 +1                      0.0000
  O         5.52537558 +1    0.8955604 +1    0.0089426 +1                      0.0000
  O         3.50021241 +1    1.3316725 +1    1.4279919 +1                      0.0000
  O         3.36724716 +1    1.4217764 +1    4.4086766 +1                      0.0000
  O         5.66242254 +1    0.7993670 +1   -2.9699231 +1                      0.0000
  F         4.70563706 +1    2.9097059 +1   -0.0453456 +1                      0.0000
  F         4.42111094 +1    3.0884813 +1    5.8452308 +1                      0.0000
 Si         3.57905184 +1    4.5439605 +1    2.8248893 +1                      0.0000
 Si         5.45649801 +1   -2.3201251 +1   -1.4125433 +1                      0.0000
  O         4.73080194 +1   -0.7574161 +1   -1.4436653 +1                      0.0000
  O         3.67392851 +1   -2.7187347 +1   -1.4492255 +1                      0.0000
  O         5.36395477 +1   -3.2893805 +1    0.1058311 +1                      0.0000
  F         2.64743535 +1   -1.2867349 +1    0.0116496 +1                      0.0000
 Al         3.89828853 +1    0.0592527 +1   -2.9125322 +1                      0.0000
  O         5.49999727 +1   -3.3883177 +1   -2.8700935 +1                      0.0000
  F         2.70420942 +1   -1.3495716 +1   -3.0218041 +1                      0.0000
  O         3.77992261 +1    1.4581098 +1   -1.5578584 +1                      0.0000
  F         4.58955033 +1   -0.8715669 +1   -4.4054263 +1                      0.0000
  F         4.32101410 +1   -0.6865428 +1    1.4754679 +1                      0.0000
 Si         5.54953691 +1    1.8561234 +1   -1.5154601 +1                      0.0000
  O         6.25899971 +1    3.4180030 +1   -1.5506901 +1                      0.0000
 Si         3.47604686 +1    0.3706755 +1    2.9508291 +1                      0.0000
  O         2.77088123 +1   -1.1940061 +1    2.9729898 +1                      0.0000
 Tv         7.10894672 +1   -0.0002345 +1    0.1833893 +1 
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