Comparison of Structures of Crystalline Solids Predicted using PM6 with X-Ray (Home)

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230 Smithsonite_(ZnCO3)

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                      Unit Cell Parameters:       a      b      c   alpha   beta  gamma   Volume  Density
                                     X-Ray:     4.65   4.65  15.03  90.00  90.00 120.00    281.7   4.435
                                       PM6:     4.83   4.83  14.46  89.54  89.97 119.95    292.0   4.278

X-Ray Structure


Structure calculated using PM6


  X-Ray data set:
 MERS=(2,2,1) 1SCF
 Smithsonite_(ZnCO3)
 h=  hr=NIST
 Zn              0.00000000 +1    0.0000000 +1    0.0000000 +1                  0.0000
  O             -1.04000000 +1   -1.3430000 +1   -1.2520000 +1                  0.0000
  O             -2.96900000 +1   -0.2290000 +1   -1.2520000 +1                  0.0000
 Zn              2.32700000 +1    1.3430000 +1   -2.5040000 +1                  0.0000
  O             -2.96900000 +1   -2.4570000 +1   -1.2520000 +1                  0.0000
  O              0.64300000 +1    1.1130000 +1   -3.7560000 +1                  0.0000
  O              2.96900000 +1    2.4560000 +1    1.2520000 +1                  0.0000
  O             -1.28600000 +1    0.0000000 +1   -3.7560000 +1                  0.0000
  O              1.04000000 +1    1.3430000 +1    1.2520000 +1                  0.0000
  O              0.64400000 +1   -1.1140000 +1   -3.7560000 +1                  0.0000
  O              2.97000000 +1    0.2290000 +1    1.2520000 +1                  0.0000
  C             -2.32600000 +1   -1.3430000 +1   -1.2520010 +1                  0.0000
  C              0.00000000 +1    0.0000000 +1    3.7570000 +1                  0.0000
  O              1.28600000 +1    0.0000000 +1    3.7570000 +1                  0.0000
 Zn              2.32700000 +1    1.3430000 +1    5.0090000 +1                  0.0000
  O             -0.64300000 +1    1.1140000 +1    3.7570000 +1                  0.0000
 Zn             -2.32600000 +1   -1.3430000 +1    2.5050000 +1                  0.0000
  O             -0.64300000 +1   -1.1140000 +1    3.7570000 +1                  0.0000
  O             -1.68400000 +1   -0.2300000 +1    6.2610000 +1                  0.0000
  O             -3.61200000 +1   -1.3430000 +1    6.2610000 +1                  0.0000
  O             -1.68300000 +1   -2.4570000 +1    6.2610000 +1                  0.0000
  C              2.32700000 +1    1.3430000 +1   -6.2600010 +1                  0.0000
  O              3.61300000 +1    1.3430000 +1   -6.2600010 +1                  0.0000
 Zn             -2.32600000 +1   -1.3430000 +1   -5.0080010 +1                  0.0000
  O              1.68400000 +1    2.4570000 +1   -6.2600010 +1                  0.0000
 Zn              0.00100000 +1    0.0010000 +1   -7.5120010 +1                  0.0000
  O              1.68400000 +1    0.2300000 +1   -6.2600010 +1                  0.0000
  C             -2.32600000 +1   -1.3430000 +1    6.2610000 +1                  0.0000
  C              0.00000000 +1    0.0000000 +1   -3.7560000 +1                  0.0000
  C              2.32700000 +1    1.3430000 +1    1.2520000 +1                  0.0000
 Zn             -4.65300000 +1    0.0000000 +1    0.0000000 +1                  0.0000
  O             -5.69300000 +1   -1.3430000 +1   -1.2520000 +1                  0.0000
  O             -7.62200000 +1   -0.2290000 +1   -1.2520000 +1                  0.0000
 Zn             -2.32600000 +1    1.3430000 +1   -2.5040000 +1                  0.0000
  O             -7.62200000 +1   -2.4570000 +1   -1.2520000 +1                  0.0000
  O             -4.01000000 +1    1.1130000 +1   -3.7560000 +1                  0.0000
  O             -1.68400000 +1    2.4560000 +1    1.2520000 +1                  0.0000
  O             -5.93900000 +1    0.0000000 +1   -3.7560000 +1                  0.0000
  O             -3.61300000 +1    1.3430000 +1    1.2520000 +1                  0.0000
  O             -4.00900000 +1   -1.1140000 +1   -3.7560000 +1                  0.0000
  O             -1.68300000 +1    0.2290000 +1    1.2520000 +1                  0.0000
  C             -6.97900000 +1   -1.3430000 +1   -1.2520010 +1                  0.0000
  C             -4.65300000 +1    0.0000000 +1    3.7570000 +1                  0.0000
  O             -3.36700000 +1    0.0000000 +1    3.7570000 +1                  0.0000
 Zn             -2.32600000 +1    1.3430000 +1    5.0090000 +1                  0.0000
  O             -5.29600000 +1    1.1140000 +1    3.7570000 +1                  0.0000
 Zn             -6.97900000 +1   -1.3430000 +1    2.5050000 +1                  0.0000
  O             -5.29600000 +1   -1.1140000 +1    3.7570000 +1                  0.0000
  O             -6.33700000 +1   -0.2300000 +1    6.2610000 +1                  0.0000
  O             -8.26500000 +1   -1.3430000 +1    6.2610000 +1                  0.0000
  O             -6.33600000 +1   -2.4570000 +1    6.2610000 +1                  0.0000
  C             -2.32600000 +1    1.3430000 +1   -6.2600010 +1                  0.0000
  O             -1.04000000 +1    1.3430000 +1   -6.2600010 +1                  0.0000
 Zn             -6.97900000 +1   -1.3430000 +1   -5.0080010 +1                  0.0000
  O             -2.96900000 +1    2.4570000 +1   -6.2600010 +1                  0.0000
 Zn             -4.65200000 +1    0.0010000 +1   -7.5120010 +1                  0.0000
  O             -2.96900000 +1    0.2300000 +1   -6.2600010 +1                  0.0000
  C             -6.97900000 +1   -1.3430000 +1    6.2610000 +1                  0.0000
  C             -4.65300000 +1    0.0000000 +1   -3.7560000 +1                  0.0000
  C             -2.32600000 +1    1.3430000 +1    1.2520000 +1                  0.0000
 Zn              2.32600000 +1    4.0290000 +1    0.0000000 +1                  0.0000
  O              1.28600000 +1    2.6860000 +1   -1.2520000 +1                  0.0000
  O             -0.64300000 +1    3.8000000 +1   -1.2520000 +1                  0.0000
 Zn              4.65300000 +1    5.3720000 +1   -2.5040000 +1                  0.0000
  O             -0.64300000 +1    1.5720000 +1   -1.2520000 +1                  0.0000
  O              2.96900000 +1    5.1420000 +1   -3.7560000 +1                  0.0000
  O              5.29500000 +1    6.4850000 +1    1.2520000 +1                  0.0000
  O              1.04000000 +1    4.0290000 +1   -3.7560000 +1                  0.0000
  O              3.36600000 +1    5.3720000 +1    1.2520000 +1                  0.0000
  O              2.97000000 +1    2.9150000 +1   -3.7560000 +1                  0.0000
  O              5.29600000 +1    4.2580000 +1    1.2520000 +1                  0.0000
  C              0.00000000 +1    2.6860000 +1   -1.2520010 +1                  0.0000
  C              2.32600000 +1    4.0290000 +1    3.7570000 +1                  0.0000
  O              3.61200000 +1    4.0290000 +1    3.7570000 +1                  0.0000
 Zn              4.65300000 +1    5.3720000 +1    5.0090000 +1                  0.0000
  O              1.68300000 +1    5.1430000 +1    3.7570000 +1                  0.0000
 Zn              0.00000000 +1    2.6860000 +1    2.5050000 +1                  0.0000
  O              1.68300000 +1    2.9150000 +1    3.7570000 +1                  0.0000
  O              0.64200000 +1    3.7990000 +1    6.2610000 +1                  0.0000
  O             -1.28600000 +1    2.6860000 +1    6.2610000 +1                  0.0000
  O              0.64300000 +1    1.5720000 +1    6.2610000 +1                  0.0000
  C              4.65300000 +1    5.3720000 +1   -6.2600010 +1                  0.0000
  O              5.93900000 +1    5.3720000 +1   -6.2600010 +1                  0.0000
 Zn              0.00000000 +1    2.6860000 +1   -5.0080010 +1                  0.0000
  O              4.01000000 +1    6.4860000 +1   -6.2600010 +1                  0.0000
 Zn              2.32700000 +1    4.0300000 +1   -7.5120010 +1                  0.0000
  O              4.01000000 +1    4.2590000 +1   -6.2600010 +1                  0.0000
  C              0.00000000 +1    2.6860000 +1    6.2610000 +1                  0.0000
  C              2.32600000 +1    4.0290000 +1   -3.7560000 +1                  0.0000
  C              4.65300000 +1    5.3720000 +1    1.2520000 +1                  0.0000
 Zn             -2.32700000 +1    4.0290000 +1    0.0000000 +1                  0.0000
  O             -3.36700000 +1    2.6860000 +1   -1.2520000 +1                  0.0000
  O             -5.29600000 +1    3.8000000 +1   -1.2520000 +1                  0.0000
 Zn              0.00000000 +1    5.3720000 +1   -2.5040000 +1                  0.0000
  O             -5.29600000 +1    1.5720000 +1   -1.2520000 +1                  0.0000
  O             -1.68400000 +1    5.1420000 +1   -3.7560000 +1                  0.0000
  O              0.64200000 +1    6.4850000 +1    1.2520000 +1                  0.0000
  O             -3.61300000 +1    4.0290000 +1   -3.7560000 +1                  0.0000
  O             -1.28700000 +1    5.3720000 +1    1.2520000 +1                  0.0000
  O             -1.68300000 +1    2.9150000 +1   -3.7560000 +1                  0.0000
  O              0.64300000 +1    4.2580000 +1    1.2520000 +1                  0.0000
  C             -4.65300000 +1    2.6860000 +1   -1.2520010 +1                  0.0000
  C             -2.32700000 +1    4.0290000 +1    3.7570000 +1                  0.0000
  O             -1.04100000 +1    4.0290000 +1    3.7570000 +1                  0.0000
 Zn              0.00000000 +1    5.3720000 +1    5.0090000 +1                  0.0000
  O             -2.97000000 +1    5.1430000 +1    3.7570000 +1                  0.0000
 Zn             -4.65300000 +1    2.6860000 +1    2.5050000 +1                  0.0000
  O             -2.97000000 +1    2.9150000 +1    3.7570000 +1                  0.0000
  O             -4.01100000 +1    3.7990000 +1    6.2610000 +1                  0.0000
  O             -5.93900000 +1    2.6860000 +1    6.2610000 +1                  0.0000
  O             -4.01000000 +1    1.5720000 +1    6.2610000 +1                  0.0000
  C              0.00000000 +1    5.3720000 +1   -6.2600010 +1                  0.0000
  O              1.28600000 +1    5.3720000 +1   -6.2600010 +1                  0.0000
 Zn             -4.65300000 +1    2.6860000 +1   -5.0080010 +1                  0.0000
  O             -0.64300000 +1    6.4860000 +1   -6.2600010 +1                  0.0000
 Zn             -2.32600000 +1    4.0300000 +1   -7.5120010 +1                  0.0000
  O             -0.64300000 +1    4.2590000 +1   -6.2600010 +1                  0.0000
  C             -4.65300000 +1    2.6860000 +1    6.2610000 +1                  0.0000
  C             -2.32700000 +1    4.0290000 +1   -3.7560000 +1                  0.0000
  C              0.00000000 +1    5.3720000 +1    1.2520000 +1                  0.0000
 Tv             -9.30600000 +1    0.0000000 +1    0.0000000 +1 
 Tv              4.65200000 +1    8.0580000 +1    0.0000000 +1 
 Tv              0.00000000 +1    0.0000000 +1   15.0250010 +1 
 
  Optimized PM6 data set:
 MERS=(2,2,1) GNORM=5
 Smithsonite_(ZnCO3)
 h=  hr=NIST
 Zn        -0.03346538 +1   -0.0640887 +1    0.0119819 +1                      0.0000
  O        -1.14746888 +1   -1.4835087 +1   -1.2310941 +1                      0.0000
  O        -3.09404726 +1   -0.3408131 +1   -1.2309821 +1                      0.0000
 Zn         2.45547590 +1    1.2981270 +1   -2.5303666 +1                      0.0000
  O        -3.12382419 +1   -2.5794458 +1   -1.0923333 +1                      0.0000
  O         0.65410892 +1    1.0931296 +1   -3.6110745 +1                      0.0000
  O         3.08817893 +1    2.4839240 +1    1.1901781 +1                      0.0000
  O        -1.24507860 +1   -0.1108479 +1   -3.6608303 +1                      0.0000
  O         1.11195210 +1    1.4028549 +1    1.1412059 +1                      0.0000
  O         0.75828585 +1   -1.1434656 +1   -3.5348416 +1                      0.0000
  O         3.02791411 +1    0.2290830 +1    1.0351112 +1                      0.0000
  C        -2.44219789 +1   -1.4628974 +1   -1.2018225 +1                      0.0000
  C         0.05431394 +1    0.0155000 +1    3.6257509 +1                      0.0000
  O         1.35373459 +1    0.0693623 +1    3.5751438 +1                      0.0000
 Zn         2.53203664 +1    1.3576070 +1    4.8440753 +1                      0.0000
  O        -0.63616020 +1    1.1091542 +1    3.6142606 +1                      0.0000
 Zn        -2.23056825 +1   -1.5048366 +1    2.4755061 +1                      0.0000
  O        -0.53457794 +1   -1.1381338 +1    3.6442192 +1                      0.0000
  O        -1.69659835 +1   -0.3291660 +1    6.0267865 +1                      0.0000
  O        -3.64699008 +1   -1.4447283 +1    5.9226272 +1                      0.0000
  O        -1.70368130 +1   -2.5784930 +1    5.9346968 +1                      0.0000
  C         2.40682465 +1    1.3452305 +1   -6.0421421 +1                      0.0000
  O         3.70389561 +1    1.3326528 +1   -6.0621990 +1                      0.0000
 Zn        -2.35098450 +1   -1.5017427 +1   -4.8971200 +1                      0.0000
  O         1.76196044 +1    2.4701202 +1   -6.0587347 +1                      0.0000
 Zn         0.02896807 +1   -0.0960382 +1   -7.2570993 +1                      0.0000
  O         1.75094255 +1    0.2247949 +1   -5.9778496 +1                      0.0000
  C        -2.34700306 +1   -1.4510613 +1    5.9691842 +1                      0.0000
  C         0.04915012 +1   -0.0560122 +1   -3.6252448 +1                      0.0000
  C         2.40645015 +1    1.3792925 +1    1.1368902 +1                      0.0000
 Zn        -4.72639053 +1    0.1149922 +1    0.1127486 +1                      0.0000
  O        -5.92648049 +1   -1.7391487 +1   -0.5882276 +1                      0.0000
  O        -7.75318397 +1   -0.4612843 +1   -1.1205963 +1                      0.0000
 Zn        -2.34116191 +1    1.2909220 +1   -2.4966791 +1                      0.0000
  O        -7.90244983 +1   -2.7406400 +1   -1.1614762 +1                      0.0000
  O        -4.15978919 +1    0.9568013 +1   -3.6192035 +1                      0.0000
  O        -1.68275780 +1    2.4484538 +1    1.2311501 +1                      0.0000
  O        -6.03570240 +1   -0.2956465 +1   -3.3956196 +1                      0.0000
  O        -3.62301633 +1    1.3257579 +1    1.3464148 +1                      0.0000
  O        -4.02677494 +1   -1.2776490 +1   -3.4866377 +1                      0.0000
  O        -1.68189807 +1    0.1979777 +1    1.2872938 +1                      0.0000
  C        -7.34186658 +1   -1.6289678 +1   -0.9938852 +1                      0.0000
  C        -4.71799134 +1   -0.1345761 +1    3.5442283 +1                      0.0000
  O        -3.42643292 +1   -0.1005830 +1    3.6113386 +1                      0.0000
 Zn        -2.37757876 +1    1.3556546 +1    4.8707983 +1                      0.0000
  O        -5.41573109 +1    0.9574036 +1    3.5938297 +1                      0.0000
 Zn        -7.23585284 +1   -1.3653966 +1    2.5167886 +1                      0.0000
  O        -5.31363013 +1   -1.2884378 +1    3.3641010 +1                      0.0000
  O        -6.46831250 +1   -0.4205081 +1    5.9939871 +1                      0.0000
  O        -8.42174725 +1   -1.5298094 +1    6.0352989 +1                      0.0000
  O        -6.48774834 +1   -2.6657693 +1    5.9407509 +1                      0.0000
  C        -2.39002077 +1    1.2660593 +1   -6.0449277 +1                      0.0000
  O        -1.09260705 +1    1.2598788 +1   -6.0163794 +1                      0.0000
 Zn        -7.18928172 +1   -1.5219676 +1   -4.8000055 +1                      0.0000
  O        -3.03318409 +1    2.3939959 +1   -6.0464614 +1                      0.0000
 Zn        -4.81528607 +1   -0.0953929 +1   -7.2414407 +1                      0.0000
  O        -3.04532596 +1    0.1455312 +1   -6.0512122 +1                      0.0000
  C        -7.12633023 +1   -1.5373399 +1    6.0021620 +1                      0.0000
  C        -4.74542849 +1   -0.1896387 +1   -3.5281824 +1                      0.0000
  C        -2.32458436 +1    1.3205028 +1    1.2943297 +1                      0.0000
 Zn         2.53315450 +1    4.1274586 +1   -0.0570509 +1                      0.0000
  O         1.38707175 +1    2.6585273 +1   -1.1808877 +1                      0.0000
  O        -0.52838129 +1    3.8345716 +1   -1.0832301 +1                      0.0000
 Zn         4.73248591 +1    5.5727875 +1   -2.5175590 +1                      0.0000
  O        -0.58962827 +1    1.5790136 +1   -1.2350855 +1                      0.0000
  O         3.03893862 +1    5.2067349 +1   -3.6907009 +1                      0.0000
  O         5.62156756 +1    6.6426980 +1    1.0469980 +1                      0.0000
  O         1.15159534 +1    3.9976402 +1   -3.6238811 +1                      0.0000
  O         3.64467325 +1    5.5478536 +1    1.1887325 +1                      0.0000
  O         3.14367382 +1    2.9603178 +1   -3.6477519 +1                      0.0000
  O         5.59085066 +1    4.4044737 +1    1.1816850 +1                      0.0000
  C         0.09269306 +1    2.6836554 +1   -1.1807639 +1                      0.0000
  C         2.45569386 +1    4.1247068 +1    3.5798071 +1                      0.0000
  O         3.75025483 +1    4.1803628 +1    3.6104670 +1                      0.0000
 Zn         4.85249218 +1    5.5704886 +1    4.8520871 +1                      0.0000
  O         1.74635559 +1    5.2127024 +1    3.4971928 +1                      0.0000
 Zn         0.04723777 +1    2.7676275 +1    2.4884726 +1                      0.0000
  O         1.85158364 +1    2.9751260 +1    3.5631146 +1                      0.0000
  O         0.74681866 +1    3.8374038 +1    5.9339328 +1                      0.0000
  O        -1.20618862 +1    2.7295803 +1    6.0228760 +1                      0.0000
  O         0.73504873 +1    1.5916572 +1    6.0064565 +1                      0.0000
  C         4.84486319 +1    5.5132198 +1   -6.0129056 +1                      0.0000
  O         6.14460567 +1    5.5064402 +1   -5.9620303 +1                      0.0000
 Zn        -0.03060390 +1    2.7115487 +1   -4.8891193 +1                      0.0000
  O         4.20164834 +1    6.6407877 +1   -5.9850569 +1                      0.0000
 Zn         2.39880573 +1    4.1557076 +1   -7.2507317 +1                      0.0000
  O         4.19402518 +1    4.3917187 +1   -6.0695872 +1                      0.0000
  C         0.09081189 +1    2.7171839 +1    5.9977873 +1                      0.0000
  C         2.45135063 +1    4.0525943 +1   -3.6691628 +1                      0.0000
  C         4.93957898 +1    5.5269418 +1    1.1565733 +1                      0.0000
 Zn        -2.42283599 +1    3.8787224 +1   -0.1041741 +1                      0.0000
  O        -3.52380115 +1    2.6690659 +1   -1.3416841 +1                      0.0000
  O        -5.46453587 +1    3.7963273 +1   -1.2746674 +1                      0.0000
 Zn         0.08629156 +1    5.3545614 +1   -2.5117289 +1                      0.0000
  O        -5.46357210 +1    1.5457066 +1   -1.2237779 +1                      0.0000
  O        -1.83677619 +1    5.2786505 +1   -3.3548690 +1                      0.0000
  O         0.75484681 +1    6.7333516 +1    1.1689018 +1                      0.0000
  O        -3.72519788 +1    4.0926308 +1   -3.6018569 +1                      0.0000
  O        -1.22261070 +1    5.7321788 +1    0.5994007 +1                      0.0000
  O        -1.73658993 +1    3.0329993 +1   -3.5905447 +1                      0.0000
  O         0.60433295 +1    4.4540881 +1    1.1297639 +1                      0.0000
  C        -4.82242499 +1    2.6739419 +1   -1.2863839 +1                      0.0000
  C        -2.40521880 +1    4.1791807 +1    3.5359253 +1                      0.0000
  O        -1.11465477 +1    4.2852484 +1    3.4068603 +1                      0.0000
 Zn         0.03913619 +1    5.5115369 +1    4.8090521 +1                      0.0000
  O        -3.12378288 +1    5.2669390 +1    3.4917288 +1                      0.0000
 Zn        -4.80872174 +1    2.7000029 +1    2.5024601 +1                      0.0000
  O        -2.99057023 +1    3.0326331 +1    3.6275864 +1                      0.0000
  O        -4.10161421 +1    3.8510958 +1    6.0598282 +1                      0.0000
  O        -6.05353304 +1    2.7366166 +1    6.0195894 +1                      0.0000
  O        -4.11255409 +1    1.6030437 +1    6.0616460 +1                      0.0000
  C        -0.02024678 +1    5.5340722 +1   -5.9943686 +1                      0.0000
  O         1.27476660 +1    5.5274699 +1   -6.0335573 +1                      0.0000
 Zn        -4.77255548 +1    2.6337109 +1   -4.8619542 +1                      0.0000
  O        -0.65906539 +1    6.6623444 +1   -5.9269274 +1                      0.0000
 Zn        -2.40392528 +1    4.0872846 +1   -7.2085450 +1                      0.0000
  O        -0.67852722 +1    4.4169006 +1   -5.9852707 +1                      0.0000
  C        -4.75619878 +1    2.7300628 +1    6.0535987 +1                      0.0000
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