Comparison of Structures of Crystalline Solids Predicted using PM6 with X-Ray (Home)

(Back to Minerals by class)

199 Otavite (CdCO3)

(Previous)     (Back)     (Next)
                      Unit Cell Parameters:       a      b      c   alpha   beta  gamma   Volume  Density
                                     X-Ray:     4.93   4.27  16.27  90.00  90.00  90.00    342.5   5.016
                                       PM6:     5.56   4.71  15.59  90.04  88.89  90.91    408.3   4.208
                 X-Ray                               PM6
 
  X-Ray data set:
PL SYMMETRY RELSCF=1000 MERS=(2,2,1) 1SCF
 Otavite(ideal: a=b=4.93, c=16.27)

 Cd              2.54236586 +1    4.2519865 +1    0.0000000 +0                  0.0000
 Cd              7.47382792 +1    4.2519865 +0    0.0000000 +0                  0.0000
 Cd              0.00000000 +0    0.0000000 +0    0.0000000 +0                  0.0000
 XX              9.96606200 +1    0.0000000 +0    0.0000000 +0 
 XX              0.00000000 +0    8.6392833 +1    0.0000000 +0 
 Cd              4.93154690 +1    0.0000000 +0    0.0000000 +0                  0.0000
  O              3.19992104 +1    0.2737464 +1    1.3510921 +1                  0.0000
  O              8.13138261 +1    0.2737464 +0    1.3510921 +0                  0.0000
  O              0.63935556 +1    6.8252794 +1    1.3510921 +0                  0.0000
  O              5.57133875 +1    6.8252794 +0    1.3510921 +0                  0.0000
  O              0.63935556 +0    4.5567964 +1    1.3510921 +0                  0.0000
  O              5.57133875 +0    4.5567964 +0    1.3510921 +0                  0.0000
  C              0.00000000 +0    5.6912998 +1    1.3510921 +0                  0.0000
  C              4.93154690 +0    5.6912998 +0    1.3510921 +0                  0.0000
  C              2.54236586 +0    1.4062455 +1    1.3510921 +0                  0.0000
  C              7.47382792 +0    1.4062455 +0    1.3510921 +0                  0.0000
  O              3.62304938 +1    5.6912998 +0    1.3510921 +0                  0.0000
  O             -1.30892841 +1    5.6912998 +0    1.3510921 +0                  0.0000
  O              1.25950485 +1    1.4062455 +0    1.3510921 +0                  0.0000
  O              6.19096057 +1    1.4062455 +0    1.3510921 +0                  0.0000
  O              3.19992104 +0    2.5390001 +1    1.3510921 +0                  0.0000
  O              8.13138261 +0    2.5390001 +0    1.3510921 +0                  0.0000
 Cd              4.93154690 +0    2.8445441 +1    2.7137628 +1                  0.0000
 Cd              0.00000000 +0    2.8445441 +0    2.7137628 +0                  0.0000
 Cd              2.54236586 +0    7.1002609 +1    2.7137628 +0                  0.0000
 Cd              7.47382792 +0    7.1002609 +0    2.7137628 +0                  0.0000
  O             -0.65752249 +1   -1.1317034 +1    4.0722992 +1                  0.0000
  O              4.27401230 +1   -1.1317034 +0    4.0722992 +0                  0.0000
  O              6.83440282 +1    3.1197347 +1    4.0722992 +0                  0.0000
  O              1.90259183 +1    3.1197347 +0    4.0722992 +0                  0.0000
  O              1.29606702 +1    0.0000000 +0    4.0722992 +0                  0.0000
  O              6.22768005 +1    0.0000000 +0    4.0722992 +0                  0.0000
  O              8.78276251 +1    4.2519865 +0    4.0722992 +0                  0.0000
  O              3.85087680 +1    4.2519865 +0    4.0722992 +0                  0.0000
  O             -0.65752249 +0    1.1316649 +1    4.0722992 +0                  0.0000
  O              4.27401230 +0    1.1316649 +0    4.0722992 +0                  0.0000
  C              0.00000000 +0    0.0000000 +0    4.0722992 +0                  0.0000
  C              4.93154690 +0    0.0000000 +0    4.0722992 +0                  0.0000
  O              1.90259183 +0    5.3848950 +1    4.0722992 +0                  0.0000
  O              6.83440282 +0    5.3848950 +0    4.0722992 +0                  0.0000
  C              2.54236586 +0    4.2519865 +0    4.0722992 +0                  0.0000
  C              7.47382792 +0    4.2519865 +0    4.0722992 +0                  0.0000
 Cd              7.47382792 +0    1.4062455 +0    5.4262281 +1                  0.0000
 Cd              2.54236586 +0    1.4062455 +0    5.4262281 +0                  0.0000
 Cd              0.00000000 +0    5.6912998 +0    5.4262281 +0                  0.0000
 Cd              4.93154690 +0    5.6912998 +0    5.4262281 +0                  0.0000
  O              3.19992104 +0    8.2327919 +1    6.7765405 +1                  0.0000
  O              8.13138261 +0    8.2327919 +0    6.7765405 +0                  0.0000
  C              2.54236586 +0    7.1002609 +0    6.7765405 +0                  0.0000
  C              7.47382792 +0    7.1002609 +0    6.7765405 +0                  0.0000
  O              3.19992104 +0    5.9676360 +1    6.7765405 +0                  0.0000
  O              8.13138261 +0    5.9676360 +0    6.7765405 +0                  0.0000
  O              0.63935556 +0    3.9760219 +1    6.7765405 +0                  0.0000
  C              0.00000000 +0    2.8445441 +0    6.7765405 +0                  0.0000
  O              0.63935556 +0    1.7125265 +1    6.7765405 +0                  0.0000
  O             -1.30892841 +0    2.8445441 +0    6.7765405 +0                  0.0000
  O              5.57133875 +0    3.9760219 +0    6.7765405 +0                  0.0000
  C              4.93154690 +0    2.8445441 +0    6.7765405 +0                  0.0000
  O              3.62304938 +0    2.8445441 +0    6.7765405 +0                  0.0000
  O              5.57133875 +0    1.7125265 +0    6.7765405 +0                  0.0000
  O              1.25950485 +0    7.1002609 +0    6.7765405 +0                  0.0000
  O              6.19096057 +0    7.1002609 +0    6.7765405 +0                  0.0000
 Cd              2.54236586 +0    4.2519865 +0    8.1387677 +1                  0.0000
 Cd              7.47382792 +0    4.2519865 +0    8.1387677 +0                  0.0000
 Cd              0.00000000 +0    0.0000000 +0    8.1387677 +0                  0.0000
 Cd              4.93154690 +0    0.0000000 +0    8.1387677 +0                  0.0000
  O              1.25950485 +0    5.6912998 +0    9.4982788 +1                  0.0000
  O             -0.65752249 +0    6.8252794 +0    9.4982788 +0                  0.0000
  O             -0.65752249 +0    4.5567964 +0    9.4982788 +0                  0.0000
  O              4.27401230 +0    6.8252794 +0    9.4982788 +0                  0.0000
  C              0.00000000 +0    5.6912998 +0    9.4982788 +0                  0.0000
  O              6.19096057 +0    5.6912998 +0    9.4982788 +0                  0.0000
  O              4.27401230 +0    4.5567964 +0    9.4982788 +0                  0.0000
  C              4.93154690 +0    5.6912998 +0    9.4982788 +0                  0.0000
  O              3.85087680 +0    1.4062455 +0    9.4982788 +0                  0.0000
  O              8.78276251 +0    1.4062455 +0    9.4982788 +0                  0.0000
  C              2.54236586 +0    1.4062455 +0    9.4982788 +0                  0.0000
  C              7.47382792 +0    1.4062455 +0    9.4982788 +0                  0.0000
  O              1.90259183 +0    2.5390001 +0    9.4982788 +0                  0.0000
  O              6.83440282 +0    2.5390001 +0    9.4982788 +0                  0.0000
  O              1.90259183 +0    0.2737464 +0    9.4982788 +0                  0.0000
  O              6.83440282 +0    0.2737464 +0    9.4982788 +0                  0.0000
 Cd              7.47382792 +0    7.1002609 +0   10.8520879 +1                  0.0000
 Cd              2.54236586 +0    7.1002609 +0   10.8520879 +0                  0.0000
 Cd              0.00000000 +0    2.8445441 +0   10.8520879 +0                  0.0000
 Cd              4.93154690 +0    2.8445441 +0   10.8520879 +0                  0.0000
  O              8.13138261 +0    5.3848950 +0   12.2020049 +1                  0.0000
  O              3.19992104 +0    5.3848950 +0   12.2020049 +0                  0.0000
  C              7.47382792 +0    4.2519865 +0   12.2020049 +0                  0.0000
  C              2.54236586 +0    4.2519865 +0   12.2020049 +0                  0.0000
  O              8.13138261 +0    3.1197347 +0   12.2020049 +0                  0.0000
  O              3.19992104 +0    3.1197347 +0   12.2020049 +0                  0.0000
  O              6.19096057 +0    4.2519865 +0   12.2020049 +0                  0.0000
  O              1.25950485 +0    4.2519865 +0   12.2020049 +0                  0.0000
  O              0.63935556 +0    1.1316649 +0   12.2020049 +0                  0.0000
  O              5.57133875 +0    1.1316649 +0   12.2020049 +0                  0.0000
  C              4.93154690 +0    0.0000000 +0   12.2020049 +0                  0.0000
  C              0.00000000 +0    0.0000000 +0   12.2020049 +0                  0.0000
  O              5.57133875 +0   -1.1317034 +0   12.2020049 +0                  0.0000
  O              0.63935556 +0   -1.1317034 +0   12.2020049 +0                  0.0000
  O              3.62304938 +0    0.0000000 +0   12.2020049 +0                  0.0000
  O             -1.30892841 +0    0.0000000 +0   12.2020049 +0                  0.0000
 Cd              4.93154690 +0    5.6912998 +0   13.5621232 +1                  0.0000
 Cd              0.00000000 +0    5.6912998 +0   13.5621232 +0                  0.0000
 Cd              7.47382792 +0    1.4062455 +0   13.5621232 +0                  0.0000
 Cd              2.54236586 +0    1.4062455 +0   13.5621232 +0                  0.0000
  O              4.27401230 +0    1.7125265 +0   14.9178927 +1                  0.0000
  O             -0.65752249 +0    1.7125265 +0   14.9178927 +0                  0.0000
  O              6.83440282 +0    5.9676360 +0   14.9178927 +0                  0.0000
  O              1.90259183 +0    5.9676360 +0   14.9178927 +0                  0.0000
  O              8.78276251 +0    7.1002609 +0   14.9178927 +0                  0.0000
  O              3.85087680 +0    7.1002609 +0   14.9178927 +0                  0.0000
  O              6.22768005 +0    2.8445441 +0   14.9178927 +0                  0.0000
  O              1.29606702 +0    2.8445441 +0   14.9178927 +0                  0.0000
  O              4.27401230 +0    3.9760219 +0   14.9178927 +0                  0.0000
  O             -0.65752249 +0    3.9760219 +0   14.9178927 +0                  0.0000
  O              6.83440282 +0    8.2327919 +0   14.9178927 +0                  0.0000
  O              1.90259183 +0    8.2327919 +0   14.9178927 +0                  0.0000
  C              7.47382792 +0    7.1002609 +0   14.9178927 +0                  0.0000
  C              2.54236586 +0    7.1002609 +0   14.9178927 +0                  0.0000
  C              4.93154690 +0    2.8445441 +0   14.9178927 +0                  0.0000
  C              0.00000000 +0    2.8445441 +0   14.9178927 +0                  0.0000
 Tv              9.86000000 +0    0.0000000 +0    0.0000000 +0 
 Tv              0.00000000 +0    8.5390000 +0    0.0000000 +0 
 Tv              0.00000000 +0    0.0000000 +0   16.2700000 +0 
 
  Optimized PM6 data set:
PL RELSCF=10 MERS=(2,2,1) GNORM=5
 Otavite(ideal: a=b=4.93, c=16.27)

 Cd         2.34144440 +1    4.3748668 +1    0.3618559 +1                      0.0000
 Cd         7.98009464 +1    4.3159073 +1    0.4980939 +1                      0.0000
 Cd        -0.36297457 +1   -0.3224891 +1    0.2426279 +1                      0.0000
 XX         9.96606200 +1    0.0000000 +1    0.0000000 +1 
 XX         0.00000000 +1    8.6392833 +1    0.0000000 +1 
 Cd         5.24429356 +1   -0.4064682 +1    0.4640700 +1                      0.0000
  O         2.98813885 +1    0.0790836 +1    1.5438703 +1                      0.0000
  O         8.62213609 +1    0.0373147 +1    1.6213012 +1                      0.0000
  O         0.21848706 +1    7.1099647 +1    1.5352349 +1                      0.0000
  O         5.75072030 +1    7.0064818 +1    1.7800042 +1                      0.0000
  O         0.22228346 +1    4.8849245 +1    1.6275000 +1                      0.0000
  O         5.76716206 +1    4.7781687 +1    1.6437615 +1                      0.0000
  C        -0.42064057 +1    5.9920822 +1    1.5397782 +1                      0.0000
  C         5.12054169 +1    5.8879679 +1    1.6928538 +1                      0.0000
  C         2.35909620 +1    1.2013050 +1    1.5737189 +1                      0.0000
  C         7.98831045 +1    1.1584564 +1    1.6567730 +1                      0.0000
  O         3.83584908 +1    5.8894518 +1    1.6547730 +1                      0.0000
  O        -1.70371880 +1    5.9993648 +1    1.4442456 +1                      0.0000
  O         1.07455118 +1    1.2216980 +1    1.4828947 +1                      0.0000
  O         6.70885109 +1    1.1714294 +1    1.7274045 +1                      0.0000
  O         3.00433295 +1    2.3074644 +1    1.6698377 +1                      0.0000
  O         8.65928580 +1    2.2560917 +1    1.6059812 +1                      0.0000
 Cd         5.11437582 +1    2.7702087 +1    2.9327151 +1                      0.0000
 Cd        -0.41234567 +1    2.8128560 +1    2.8466412 +1                      0.0000
 Cd         2.30624701 +1    7.5069152 +1    2.9128478 +1                      0.0000
 Cd         7.89487249 +1    7.4503298 +1    3.0340905 +1                      0.0000
  O        -1.04905501 +1   -1.4296524 +1    4.0837941 +1                      0.0000
  O         4.42159194 +1   -1.4605542 +1    4.3410310 +1                      0.0000
  O         7.24855798 +1    3.2128378 +1    4.2377701 +1                      0.0000
  O         1.68367559 +1    3.2315459 +1    4.1880575 +1                      0.0000
  O         0.87754188 +1   -0.3279377 +1    4.2143112 +1                      0.0000
  O         6.37778395 +1   -0.3852534 +1    4.2556702 +1                      0.0000
  O         9.17242659 +1    4.3181185 +1    4.3406446 +1                      0.0000
  O         3.61125473 +1    4.3343723 +1    4.2860297 +1                      0.0000
  O        -1.04741299 +1    0.7984961 +1    4.1376048 +1                      0.0000
  O         4.46295063 +1    0.7555407 +1    4.2830637 +1                      0.0000
  C        -0.40670458 +1   -0.3169931 +1    4.1384238 +1                      0.0000
  C         5.09609104 +1   -0.3655865 +1    4.2874854 +1                      0.0000
  O         1.69069099 +1    5.4625876 +1    4.2082042 +1                      0.0000
  O         7.24684764 +1    5.4409671 +1    4.3099938 +1                      0.0000
  C         2.32619912 +1    4.3457075 +1    4.2216276 +1                      0.0000
  C         7.88791398 +1    4.3282098 +1    4.2948233 +1                      0.0000
 Cd         7.82341457 +1    1.1962093 +1    5.4800034 +1                      0.0000
 Cd         2.33213181 +1    1.2267814 +1    5.4732685 +1                      0.0000
 Cd        -0.44769451 +1    5.9349387 +1    5.4008946 +1                      0.0000
 Cd         5.03545249 +1    5.9155865 +1    5.4822462 +1                      0.0000
  O         2.68433153 +1    8.6891324 +1    7.3732143 +1                      0.0000
  O         8.38666674 +1    8.5876310 +1    6.9144796 +1                      0.0000
  C         2.13141160 +1    7.5701262 +1    7.0555429 +1                      0.0000
  C         7.76358092 +1    7.4571234 +1    6.8979398 +1                      0.0000
  O         2.81637316 +1    6.5016327 +1    6.8823222 +1                      0.0000
  O         8.44242984 +1    6.3702545 +1    6.9482889 +1                      0.0000
  O         0.16562760 +1    3.9239464 +1    6.7612104 +1                      0.0000
  C        -0.47486295 +1    2.8130943 +1    6.7878133 +1                      0.0000
  O         0.16772680 +1    1.6982970 +1    6.8330903 +1                      0.0000
  O        -1.76238005 +1    2.7987868 +1    6.7960346 +1                      0.0000
  O         5.69358918 +1    3.8563144 +1    6.8416442 +1                      0.0000
  C         5.05217824 +1    2.7436638 +1    6.8814099 +1                      0.0000
  O         3.76768642 +1    2.7335075 +1    6.9308639 +1                      0.0000
  O         5.69522877 +1    1.6285404 +1    6.8701010 +1                      0.0000
  O         0.84805955 +1    7.5436232 +1    6.9137590 +1                      0.0000
  O         6.48217813 +1    7.4437861 +1    6.8493720 +1                      0.0000
 Cd         2.31081911 +1    4.3850831 +1    7.9899281 +1                      0.0000
 Cd         7.80423583 +1    4.3057649 +1    8.0036256 +1                      0.0000
 Cd        -0.65666958 +1   -0.2889694 +1    7.7859514 +1                      0.0000
 Cd         5.12362881 +1   -0.3972189 +1    8.0866101 +1                      0.0000
  O         0.98199480 +1    6.1276930 +1    9.4889365 +1                      0.0000
  O        -0.86183357 +1    7.3136459 +1    9.8652875 +1                      0.0000
  O        -1.00508813 +1    5.1571262 +1    9.2714600 +1                      0.0000
  O         4.52215302 +1    6.9108070 +1    9.4674259 +1                      0.0000
  C        -0.30083223 +1    6.1975662 +1    9.5350808 +1                      0.0000
  O         6.45755589 +1    5.8159840 +1    9.4404846 +1                      0.0000
  O         4.53839357 +1    4.6841590 +1    9.3192047 +1                      0.0000
  C         5.16995503 +1    5.7984801 +1    9.4028324 +1                      0.0000
  O         3.42634868 +1    1.1962254 +1    9.5756813 +1                      0.0000
  O         9.12870547 +1    1.0745237 +1    9.7743402 +1                      0.0000
  C         2.20364641 +1    1.3580783 +1    9.7041357 +1                      0.0000
  C         7.85365827 +1    1.1102958 +1    9.5656083 +1                      0.0000
  O         1.39513299 +1    2.1547557 +1    9.1938029 +1                      0.0000
  O         7.23582599 +1    2.2365354 +1    9.5002889 +1                      0.0000
  O         1.67265620 +1    0.3631142 +1   10.5980347 +1                      0.0000
  O         7.21069838 +1    0.0050270 +1    9.4307250 +1                      0.0000
 Cd         7.77516746 +1    7.3544646 +1   10.7380539 +1                      0.0000
 Cd         2.66345915 +1    7.1616533 +1   10.8980035 +1                      0.0000
 Cd        -0.76416872 +1    3.1175550 +1   10.4639168 +1                      0.0000
 Cd         5.23798855 +1    2.7901970 +1   10.8149862 +1                      0.0000
  O         8.46077521 +1    5.4820236 +1   12.2453439 +1                      0.0000
  O         2.91310385 +1    5.1139749 +1   12.0687734 +1                      0.0000
  C         7.83080070 +1    4.3657233 +1   12.1722511 +1                      0.0000
  C         2.19278965 +1    4.0723826 +1   11.8643995 +1                      0.0000
  O         8.48690618 +1    3.2583904 +1   12.1328075 +1                      0.0000
  O         2.73960389 +1    2.9351070 +1   11.5872417 +1                      0.0000
  O         6.54379302 +1    4.3452755 +1   12.1210722 +1                      0.0000
  O         0.91059009 +1    4.1626552 +1   11.9060297 +1                      0.0000
  O         0.23447700 +1    0.4395308 +1   10.5152543 +1                      0.0000
  O         5.90092738 +1    0.7241187 +1   12.0784950 +1                      0.0000
  C         5.27401882 +1   -0.3958846 +1   12.0176265 +1                      0.0000
  C        -0.26915110 +1   -0.4441384 +1   11.5543170 +1                      0.0000
  O         5.91359868 +1   -1.5092783 +1   12.0884401 +1                      0.0000
  O         0.56773253 +1   -1.1355016 +1   12.1591316 +1                      0.0000
  O         3.99190196 +1   -0.3948992 +1   11.8789860 +1                      0.0000
  O        -1.49250905 +1   -0.2777880 +1   11.6660254 +1                      0.0000
 Cd         5.19962041 +1    5.8425909 +1   13.5653785 +1                      0.0000
 Cd        -0.43448969 +1    5.9014167 +1   13.3577885 +1                      0.0000
 Cd         7.97247693 +1    1.1569667 +1   13.4626376 +1                      0.0000
 Cd         2.62715506 +1    1.1167017 +1   13.5037708 +1                      0.0000
  O         4.61790690 +1    1.5722288 +1   14.6687934 +1                      0.0000
  O        -0.77096960 +1    1.6184342 +1   13.9169054 +1                      0.0000
  O         7.30291141 +1    6.3311971 +1   14.7555029 +1                      0.0000
  O         1.70883473 +1    6.3085304 +1   14.5832563 +1                      0.0000
  O         9.21306577 +1    7.4747206 +1   14.5451943 +1                      0.0000
  O         3.63551051 +1    7.4313349 +1   14.6135400 +1                      0.0000
  O         6.52371108 +1    2.7156185 +1   14.7292909 +1                      0.0000
  O         1.05666220 +1    2.7251656 +1   14.4771737 +1                      0.0000
  O         4.56380022 +1    3.7875781 +1   14.6083939 +1                      0.0000
  O        -0.90327532 +1    3.7847328 +1   14.5096169 +1                      0.0000
  O         7.28715846 +1    8.5602257 +1   14.7185959 +1                      0.0000
  O         1.69969820 +1    8.5232881 +1   14.4076869 +1                      0.0000
  C         7.93337233 +1    7.4469022 +1   14.6728159 +1                      0.0000
  C         2.35106038 +1    7.4220797 +1   14.5463056 +1                      0.0000
  C         5.24259140 +1    2.7016127 +1   14.6740183 +1                      0.0000
  C        -0.22205157 +1    2.7191979 +1   14.2973723 +1                      0.0000
 Tv        11.11671566 +1   -0.0896738 +1    0.2160510 +1 
 Tv        -0.07343188 +1    9.4248783 +1    0.0271325 +1 
 Tv        -0.00042727 +1   -0.0567206 +1   15.5880402 +1