Comparison of Structures of Crystalline Solids Predicted using PM6 with X-Ray (Home)

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182 NN-Dimethylurea_(WIFKEB)

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                      Unit Cell Parameters:       a      b      c   alpha   beta  gamma   Volume  Density
                                     X-Ray:     9.27   8.60   6.04  90.00  90.00 108.79    455.4   1.285
                                       PM6:     9.27   8.49   6.06  90.41  89.55 109.34    450.4   1.299

X-Ray Structure


Structure calculated using PM6


  X-Ray data set:
 MERS=(1,1,2) 1SCF
 NN-Dimethylurea (WIFKEB)

  O              0.00000000 +1    0.0000000 +1    0.0000000 +1                  0.0000
  N             -1.37400000 +1   -0.1230000 +1   -1.7870000 +1                  0.0000
  N              0.18000000 +1    1.5820000 +1   -1.6170000 +1                  0.0000
  C             -0.38900000 +1    0.4780000 +1   -1.0870000 +1                  0.0000
  C             -0.29800000 +1    2.2280000 +1   -2.8280000 +1                  0.0000
  C              1.18600000 +1    2.3120000 +1   -0.8810000 +1                  0.0000
  H             -1.69800000 +1    0.2290000 +1   -2.5190000 +1                  0.0000
  H             -1.73300000 +1   -0.8840000 +1   -1.4560000 +1                  0.0000
  H              0.37600000 +1    2.6990000 +1   -3.2990000 +1                  0.0000
  H             -0.54800000 +1    1.6360000 +1   -3.4320000 +1                  0.0000
  H             -1.00300000 +1    2.8510000 +1   -2.6330000 +1                  0.0000
  H              1.98300000 +1    2.4150000 +1   -1.3850000 +1                  0.0000
  H              1.47000000 +1    1.9200000 +1   -0.1060000 +1                  0.0000
  H              0.85000000 +1    3.2360000 +1   -0.7090000 +1                  0.0000
  O              3.06400000 +1   -3.0180000 +1   -4.9590000 +1                  0.0000
  N              4.43800000 +1   -3.1400000 +1   -3.1720000 +1                  0.0000
  N              2.88400000 +1   -1.4360000 +1   -3.3420000 +1                  0.0000
  C              3.45300000 +1   -2.5400000 +1   -3.8720000 +1                  0.0000
  C              3.36200000 +1   -0.7900000 +1   -2.1320000 +1                  0.0000
  C              1.87800000 +1   -0.7050000 +1   -4.0780000 +1                  0.0000
  H              4.76200000 +1   -2.7880000 +1   -2.4400000 +1                  0.0000
  H              4.79700000 +1   -3.9020000 +1   -3.5030000 +1                  0.0000
  H              2.68800000 +1   -0.3180000 +1   -1.6610000 +1                  0.0000
  H              3.61200000 +1   -1.3820000 +1   -1.5270000 +1                  0.0000
  H              4.06700000 +1   -0.1660000 +1   -2.3260000 +1                  0.0000
  H              1.08100000 +1   -0.6020000 +1   -3.5740000 +1                  0.0000
  H              1.59400000 +1   -1.0970000 +1   -4.8530000 +1                  0.0000
  H              2.21400000 +1    0.2180000 +1   -4.2500000 +1                  0.0000
  O             -2.72800000 +1    3.6170000 +1   -0.5710000 +1                  0.0000
  N             -1.35500000 +1    3.7400000 +1    1.2160000 +1                  0.0000
  N             -2.90800000 +1    2.0350000 +1    1.0460000 +1                  0.0000
  C             -2.33900000 +1    3.1390000 +1    0.5160000 +1                  0.0000
  C             -2.43000000 +1    1.3890000 +1    2.2570000 +1                  0.0000
  C             -3.91400000 +1    1.3050000 +1    0.3100000 +1                  0.0000
  H             -1.03000000 +1    3.3880000 +1    1.9480000 +1                  0.0000
  H             -0.99600000 +1    4.5010000 +1    0.8850000 +1                  0.0000
  H             -3.10400000 +1    0.9180000 +1    2.7280000 +1                  0.0000
  H             -2.18000000 +1    1.9810000 +1    2.8610000 +1                  0.0000
  H             -1.72500000 +1    0.7660000 +1    2.0620000 +1                  0.0000
  H             -4.71100000 +1    1.2020000 +1    0.8140000 +1                  0.0000
  H             -4.19800000 +1    1.6970000 +1   -0.4650000 +1                  0.0000
  H             -3.57800000 +1    0.3810000 +1    0.1380000 +1                  0.0000
  O              2.80600000 +1    0.6000000 +1    4.3880000 +1                  0.0000
  N              1.43200000 +1    0.7220000 +1    2.6010000 +1                  0.0000
  N              2.98600000 +1   -0.9820000 +1    2.7710000 +1                  0.0000
  C              2.41700000 +1    0.1220000 +1    3.3010000 +1                  0.0000
  C              2.50800000 +1   -1.6280000 +1    1.5610000 +1                  0.0000
  C              3.99200000 +1   -1.7130000 +1    3.5070000 +1                  0.0000
  H              1.10800000 +1    0.3700000 +1    1.8690000 +1                  0.0000
  H              1.07300000 +1    1.4840000 +1    2.9320000 +1                  0.0000
  H              3.18100000 +1   -2.1000000 +1    1.0900000 +1                  0.0000
  H              2.25800000 +1   -1.0360000 +1    0.9560000 +1                  0.0000
  H              1.80300000 +1   -2.2520000 +1    1.7550000 +1                  0.0000
  H              4.78900000 +1   -1.8160000 +1    3.0030000 +1                  0.0000
  H              4.27600000 +1   -1.3210000 +1    4.2820010 +1                  0.0000
  H              3.65600000 +1   -2.6360000 +1    3.6790000 +1                  0.0000
  O              0.00000000 +1   -6.0350000 +1    0.0000000 +1                  0.0000
  N             -1.37400000 +1   -6.1580000 +1   -1.7870000 +1                  0.0000
  N              0.18000000 +1   -4.4530000 +1   -1.6170000 +1                  0.0000
  C             -0.38900000 +1   -5.5570000 +1   -1.0870000 +1                  0.0000
  C             -0.29800000 +1   -3.8070000 +1   -2.8280000 +1                  0.0000
  C              1.18600000 +1   -3.7230000 +1   -0.8810000 +1                  0.0000
  H             -1.69800000 +1   -5.8060000 +1   -2.5190000 +1                  0.0000
  H             -1.73300000 +1   -6.9190000 +1   -1.4560000 +1                  0.0000
  H              0.37600000 +1   -3.3360000 +1   -3.2990000 +1                  0.0000
  H             -0.54800000 +1   -4.3990000 +1   -3.4320000 +1                  0.0000
  H             -1.00300000 +1   -3.1840000 +1   -2.6330000 +1                  0.0000
  H              1.98300000 +1   -3.6200000 +1   -1.3850000 +1                  0.0000
  H              1.47000000 +1   -4.1150000 +1   -0.1060000 +1                  0.0000
  H              0.85000000 +1   -2.7990000 +1   -0.7090000 +1                  0.0000
  O              3.06400000 +1   -9.0530000 +1   -4.9590000 +1                  0.0000
  N              4.43800000 +1   -9.1750000 +1   -3.1720000 +1                  0.0000
  N              2.88400000 +1   -7.4710000 +1   -3.3420000 +1                  0.0000
  C              3.45300000 +1   -8.5750000 +1   -3.8720000 +1                  0.0000
  C              3.36200000 +1   -6.8250000 +1   -2.1320000 +1                  0.0000
  C              1.87800000 +1   -6.7400000 +1   -4.0780000 +1                  0.0000
  H              4.76200000 +1   -8.8230000 +1   -2.4400000 +1                  0.0000
  H              4.79700000 +1   -9.9370000 +1   -3.5030000 +1                  0.0000
  H              2.68800000 +1   -6.3530000 +1   -1.6610000 +1                  0.0000
  H              3.61200000 +1   -7.4170000 +1   -1.5270000 +1                  0.0000
  H              4.06700000 +1   -6.2010000 +1   -2.3260000 +1                  0.0000
  H              1.08100000 +1   -6.6370000 +1   -3.5740000 +1                  0.0000
  H              1.59400000 +1   -7.1320000 +1   -4.8530000 +1                  0.0000
  H              2.21400000 +1   -5.8170000 +1   -4.2500000 +1                  0.0000
  O             -2.72800000 +1   -2.4180000 +1   -0.5710000 +1                  0.0000
  N             -1.35500000 +1   -2.2950000 +1    1.2160000 +1                  0.0000
  N             -2.90800000 +1   -4.0000000 +1    1.0460000 +1                  0.0000
  C             -2.33900000 +1   -2.8960000 +1    0.5160000 +1                  0.0000
  C             -2.43000000 +1   -4.6460000 +1    2.2570000 +1                  0.0000
  C             -3.91400000 +1   -4.7300000 +1    0.3100000 +1                  0.0000
  H             -1.03000000 +1   -2.6470000 +1    1.9480000 +1                  0.0000
  H             -0.99600000 +1   -1.5340000 +1    0.8850000 +1                  0.0000
  H             -3.10400000 +1   -5.1170000 +1    2.7280000 +1                  0.0000
  H             -2.18000000 +1   -4.0540000 +1    2.8610000 +1                  0.0000
  H             -1.72500000 +1   -5.2690000 +1    2.0620000 +1                  0.0000
  H             -4.71100000 +1   -4.8330000 +1    0.8140000 +1                  0.0000
  H             -4.19800000 +1   -4.3380000 +1   -0.4650000 +1                  0.0000
  H             -3.57800000 +1   -5.6540000 +1    0.1380000 +1                  0.0000
  O              2.80600000 +1   -5.4350000 +1    4.3880000 +1                  0.0000
  N              1.43200000 +1   -5.3130000 +1    2.6010000 +1                  0.0000
  N              2.98600000 +1   -7.0170000 +1    2.7710000 +1                  0.0000
  C              2.41700000 +1   -5.9130000 +1    3.3010000 +1                  0.0000
  C              2.50800000 +1   -7.6630000 +1    1.5610000 +1                  0.0000
  C              3.99200000 +1   -7.7480000 +1    3.5070000 +1                  0.0000
  H              1.10800000 +1   -5.6650000 +1    1.8690000 +1                  0.0000
  H              1.07300000 +1   -4.5510000 +1    2.9320000 +1                  0.0000
  H              3.18100000 +1   -8.1350000 +1    1.0900000 +1                  0.0000
  H              2.25800000 +1   -7.0710000 +1    0.9560000 +1                  0.0000
  H              1.80300000 +1   -8.2870000 +1    1.7550000 +1                  0.0000
  H              4.78900000 +1   -7.8510000 +1    3.0030000 +1                  0.0000
  H              4.27600000 +1   -7.3560000 +1    4.2820010 +1                  0.0000
  H              3.65600000 +1   -8.6710000 +1    3.6790000 +1                  0.0000
 Tv             -2.98600000 +1    0.0000000 +1    8.7770000 +1 
 Tv              8.59800000 +1    0.0000000 +1    0.0000000 +1 
 Tv              0.00000000 +1  -12.0700000 +1    0.0000000 +1 
 
  Optimized PM6 data set:
 MERS=(1,1,2) GNORM=10
 NN-Dimethylurea (WIFKEB)

  O         0.04011350 +1    0.0438032 +1    0.0309908 +1                      0.0000
  N        -1.37085410 +1   -0.1812864 +1   -1.7413944 +1                      0.0000
  N         0.36643740 +1    1.5041912 +1   -1.7391136 +1                      0.0000
  C        -0.34532901 +1    0.4707110 +1   -1.0807541 +1                      0.0000
  C        -0.29076135 +1    2.2513814 +1   -2.8416182 +1                      0.0000
  C         1.22244585 +1    2.3659105 +1   -0.8817895 +1                      0.0000
  H        -1.76991409 +1    0.1460251 +1   -2.6217643 +1                      0.0000
  H        -1.81572110 +1   -1.0018843 +1   -1.3057404 +1                      0.0000
  H         0.47043907 +1    2.8701696 +1   -3.3540937 +1                      0.0000
  H        -0.71524236 +1    1.5578701 +1   -3.5945897 +1                      0.0000
  H        -1.09754121 +1    2.9185365 +1   -2.4874518 +1                      0.0000
  H         2.16022173 +1    2.5704780 +1   -1.4295110 +1                      0.0000
  H         1.47076913 +1    1.8596879 +1    0.0672159 +1                      0.0000
  H         0.75235385 +1    3.3371427 +1   -0.6461972 +1                      0.0000
  O         3.04806809 +1   -2.9995888 +1   -4.9846644 +1                      0.0000
  N         4.44663485 +1   -3.2070372 +1   -3.2007053 +1                      0.0000
  N         2.70997618 +1   -1.5288478 +1   -3.2249417 +1                      0.0000
  C         3.42638382 +1   -2.5606350 +1   -3.8754752 +1                      0.0000
  C         3.35918506 +1   -0.7761861 +1   -2.1215182 +1                      0.0000
  C         1.84802053 +1   -0.6740623 +1   -4.0846273 +1                      0.0000
  H         4.86024762 +1   -2.8526471 +1   -2.3380985 +1                      0.0000
  H         4.91476741 +1   -4.0130832 +1   -3.6390482 +1                      0.0000
  H         2.59169585 +1   -0.1630408 +1   -1.6108468 +1                      0.0000
  H         3.78488542 +1   -1.4669059 +1   -1.3667773 +1                      0.0000
  H         4.16298380 +1   -0.1053931 +1   -2.4745726 +1                      0.0000
  H         0.90874826 +1   -0.4748958 +1   -3.5367322 +1                      0.0000
  H         1.60228784 +1   -1.1830632 +1   -5.0322128 +1                      0.0000
  H         2.31413882 +1    0.2984876 +1   -4.3237124 +1                      0.0000
  O        -2.72528892 +1    3.6196453 +1   -0.6169743 +1                      0.0000
  N        -1.31452769 +1    3.8317841 +1    1.1565530 +1                      0.0000
  N        -3.05375286 +1    2.1488446 +1    1.1406285 +1                      0.0000
  C        -2.33953228 +1    3.1819759 +1    0.4894234 +1                      0.0000
  C        -2.41183551 +1    1.3977690 +1    2.2493878 +1                      0.0000
  C        -3.92406701 +1    1.2969850 +1    0.2868189 +1                      0.0000
  H        -0.88874340 +1    3.4768809 +1    2.0121995 +1                      0.0000
  H        -0.85736823 +1    4.6403583 +1    0.7131739 +1                      0.0000
  H        -3.18487028 +1    0.7923413 +1    2.7618245 +1                      0.0000
  H        -1.98022412 +1    2.0876326 +1    2.9993604 +1                      0.0000
  H        -1.61516885 +1    0.7161455 +1    1.9001370 +1                      0.0000
  H        -4.86772097 +1    1.1149779 +1    0.8345256 +1                      0.0000
  H        -4.16115466 +1    1.7978887 +1   -0.6662091 +1                      0.0000
  H        -3.47020499 +1    0.3146102 +1    0.0640044 +1                      0.0000
  O         2.81809566 +1    0.5837951 +1    4.4001040 +1                      0.0000
  N         1.37568875 +1    0.7569992 +1    2.6492085 +1                      0.0000
  N         3.14433839 +1   -0.8936676 +1    2.6459249 +1                      0.0000
  C         2.42644112 +1    0.1371088 +1    3.2979561 +1                      0.0000
  C         2.49372028 +1   -1.6462845 +1    1.5441024 +1                      0.0000
  C         4.00667803 +1   -1.7463841 +1    3.5064658 +1                      0.0000
  H         0.98934479 +1    0.4307172 +1    1.7629222 +1                      0.0000
  H         0.95828287 +1    1.6095241 +1    3.0500409 +1                      0.0000
  H         3.26134583 +1   -2.2576464 +1    1.0306882 +1                      0.0000
  H         2.06214943 +1   -0.9573085 +1    0.7927890 +1                      0.0000
  H         1.69448892 +1   -2.3215923 +1    1.8988203 +1                      0.0000
  H         4.95138358 +1   -1.9349592 +1    2.9629910 +1                      0.0000
  H         4.24535372 +1   -1.2411513 +1    4.4577597 +1                      0.0000
  H         3.54710021 +1   -2.7245430 +1    3.7343106 +1                      0.0000
  O         0.00687242 +1   -6.0283318 +1    0.0544953 +1                      0.0000
  N        -1.39669708 +1   -6.2474275 +1   -1.7233660 +1                      0.0000
  N         0.34726317 +1   -4.5714131 +1   -1.7188108 +1                      0.0000
  C        -0.37062909 +1   -5.5992876 +1   -1.0590731 +1                      0.0000
  C        -0.30393695 +1   -3.8202206 +1   -2.8218686 +1                      0.0000
  C         1.20759560 +1   -3.7092011 +1   -0.8646180 +1                      0.0000
  H        -1.79129881 +1   -5.9190309 +1   -2.6044278 +1                      0.0000
  H        -1.85498227 +1   -7.0576832 +1   -1.2831555 +1                      0.0000
  H         0.46299681 +1   -3.2090371 +1   -3.3361601 +1                      0.0000
  H        -0.73575478 +1   -4.5096903 +1   -3.5732995 +1                      0.0000
  H        -1.10289771 +1   -3.1447725 +1   -2.4667663 +1                      0.0000
  H         2.14702408 +1   -3.5133386 +1   -1.4149601 +1                      0.0000
  H         1.45432028 +1   -4.2087841 +1    0.0873152 +1                      0.0000
  H         0.74191785 +1   -2.7336615 +1   -0.6366147 +1                      0.0000
  O         3.03001092 +1   -9.0380558 +1   -4.9712707 +1                      0.0000
  N         4.48598766 +1   -9.1961746 +1   -3.2274883 +1                      0.0000
  N         2.69861460 +1   -7.5660538 +1   -3.2132128 +1                      0.0000
  C         3.41953358 +1   -8.5929259 +1   -3.8680038 +1                      0.0000
  C         3.35379615 +1   -6.8112906 +1   -2.1133754 +1                      0.0000
  C         1.84825017 +1   -6.7041751 +1   -4.0778118 +1                      0.0000
  H         4.82354651 +1   -8.9082852 +1   -2.3092336 +1                      0.0000
  H         4.89126743 +1  -10.0608633 +1   -3.6168492 +1                      0.0000
  H         2.59034693 +1   -6.1923827 +1   -1.6041128 +1                      0.0000
  H         3.77938809 +1   -7.5009381 +1   -1.3577338 +1                      0.0000
  H         4.15893595 +1   -6.1442499 +1   -2.4706662 +1                      0.0000
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  H         1.60600395 +1   -7.2106487 +1   -5.0277417 +1                      0.0000
  H         2.32068298 +1   -5.7326063 +1   -4.3098307 +1                      0.0000
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  N        -3.07378840 +1   -3.9158950 +1    1.1647217 +1                      0.0000
  C        -2.36111347 +1   -2.8807672 +1    0.5135539 +1                      0.0000
  C        -2.42246276 +1   -4.6646294 +1    2.2678244 +1                      0.0000
  C        -3.94173602 +1   -4.7656213 +1    0.3087321 +1                      0.0000
  H        -0.92432362 +1   -2.5773734 +1    2.0461969 +1                      0.0000
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  H        -3.18790001 +1   -5.2787945 +1    2.7808713 +1                      0.0000
  H        -1.99453077 +1   -3.9743204 +1    3.0205172 +1                      0.0000
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  C         2.42483108 +1   -5.8927879 +1    3.2986322 +1                      0.0000
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