Comparison of Structures of Crystalline Solids Predicted using PM6 with X-Ray (Home)

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169 Magnesite_(MgCO3)

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                      Unit Cell Parameters:       a      b      c   alpha   beta  gamma   Volume  Density
                                     X-Ray:    15.02   4.63   8.03  90.00  90.00  90.00    558.3   3.009
                                       PM6:    14.91   4.57   7.95  90.00  90.21  89.99    541.0   3.105
                 X-Ray                               PM6
 
  X-Ray data set:
 MERS=(1,2,1) 1SCF
 Magnesite_(MgCO3)

  C              0.00000000 +1    0.0000000 +1    0.0000000 +1                  0.0000
  O              1.28600000 +1    0.0000000 +1   -7.5080000 +1                  0.0000
 Mg             -2.31600000 +1    1.3370000 +1   -6.2570000 +1                  0.0000
  O             -0.64300000 +1    1.1140000 +1   -7.5080000 +1                  0.0000
 Mg              0.00000000 +1    2.6750000 +1    6.2570000 +1                  0.0000
  O             -0.64300000 +1   -1.1140000 +1   -7.5080000 +1                  0.0000
 Mg              2.31600000 +1   -1.3370000 +1    6.2570000 +1                  0.0000
 Mg              0.00000000 +1   -2.6750000 +1   -6.2570000 +1                  0.0000
  O             -1.03000000 +1   -4.0120000 +1    7.5080000 +1                  0.0000
  O              0.64300000 +1   -1.5610000 +1    5.0050000 +1                  0.0000
  O             -1.67300000 +1    2.4510000 +1    5.0050000 +1                  0.0000
  O              0.64300000 +1    3.7890000 +1   -5.0050000 +1                  0.0000
  O             -1.67300000 +1   -0.2240000 +1   -5.0050000 +1                  0.0000
  O             -2.96000000 +1   -2.8980000 +1    7.5080000 +1                  0.0000
  O             -1.28600000 +1   -2.6750000 +1    5.0050000 +1                  0.0000
  O             -3.60300000 +1    1.3370000 +1    5.0050000 +1                  0.0000
  O             -3.60300000 +1   -1.3370000 +1   -5.0050000 +1                  0.0000
  O             -1.28600000 +1    2.6750000 +1   -5.0050000 +1                  0.0000
  O             -2.96000000 +1   -5.1270000 +1    7.5080000 +1                  0.0000
  O             -1.67300000 +1    0.2240000 +1    5.0050000 +1                  0.0000
  O              0.64300000 +1   -3.7890000 +1    5.0050000 +1                  0.0000
  O             -1.67300000 +1   -2.4510000 +1   -5.0050000 +1                  0.0000
  O              0.64300000 +1    1.5610000 +1   -5.0050000 +1                  0.0000
  C              0.00000000 +1    0.0000000 +1   -7.5079990 +1                  0.0000
  C             -2.31600000 +1   -4.0130000 +1    7.5080000 +1                  0.0000
  C             -2.31600000 +1    1.3370000 +1   -2.5030000 +1                  0.0000
  O             -1.03000000 +1    1.3370000 +1   -2.5030000 +1                  0.0000
 Mg              0.00000000 +1    2.6750000 +1   -1.2510000 +1                  0.0000
  O             -2.96000000 +1    2.4510000 +1   -2.5030000 +1                  0.0000
 Mg             -2.31600000 +1    4.0120000 +1   -3.7540000 +1                  0.0000
  O             -2.96000000 +1    0.2240000 +1   -2.5030000 +1                  0.0000
 Mg              0.00000000 +1    0.0000000 +1   -3.7540000 +1                  0.0000
 Mg             -2.31600000 +1   -1.3370000 +1   -1.2510000 +1                  0.0000
  O              1.28600000 +1   -2.6750000 +1   -2.5030000 +1                  0.0000
  O             -1.67300000 +1    5.1270000 +1    0.0000000 +1                  0.0000
  O              0.64300000 +1    1.1140000 +1    0.0000000 +1                  0.0000
  O             -0.64300000 +1   -1.5610000 +1   -2.5030000 +1                  0.0000
  O             -1.28600000 +1    0.0000000 +1    0.0000000 +1                  0.0000
  O             -3.60300000 +1    4.0120000 +1    0.0000000 +1                  0.0000
  O             -0.64300000 +1   -3.7890000 +1   -2.5030000 +1                  0.0000
  O              0.64300000 +1   -1.1140000 +1    0.0000000 +1                  0.0000
  O             -1.67300000 +1    2.8980000 +1    0.0000000 +1                  0.0000
  C              0.00000000 +1   -2.6750000 +1   -2.5030000 +1                  0.0000
  C              0.00000000 +1    2.6750000 +1    2.5030000 +1                  0.0000
  O              1.28600000 +1    2.6750000 +1    2.5030000 +1                  0.0000
 Mg             -2.31600000 +1    4.0120000 +1    3.7540000 +1                  0.0000
  O             -0.64300000 +1    3.7890000 +1    2.5030000 +1                  0.0000
 Mg              0.00000000 +1   -2.6750000 +1    1.2510000 +1                  0.0000
  O             -0.64300000 +1    1.5610000 +1    2.5030000 +1                  0.0000
 Mg             -2.31600000 +1    1.3370000 +1    1.2510000 +1                  0.0000
 Mg              0.00000000 +1    0.0000000 +1    3.7540000 +1                  0.0000
  O             -1.03000000 +1   -1.3370000 +1    2.5030000 +1                  0.0000
  O             -2.96000000 +1   -0.2240000 +1    2.5030000 +1                  0.0000
  O             -2.96000000 +1   -2.4520000 +1    2.5030000 +1                  0.0000
  C             -2.31600000 +1   -1.3380000 +1    2.5030000 +1                  0.0000
  C             -2.31600000 +1    4.0120000 +1    0.0000000 +1                  0.0000
  C             -2.31600000 +1    1.3370000 +1    5.0050000 +1                  0.0000
  C              0.00000000 +1   -2.6750000 +1    5.0050000 +1                  0.0000
  C              0.00000000 +1    2.6750000 +1   -5.0050000 +1                  0.0000
  C             -2.31600000 +1   -1.3380000 +1   -5.0050000 +1                  0.0000
  C              4.63300000 +1    0.0000000 +1    0.0000000 +1                  0.0000
  O              5.91900000 +1    0.0000000 +1   -7.5080000 +1                  0.0000
 Mg              2.31700000 +1    1.3370000 +1   -6.2570000 +1                  0.0000
  O              3.99000000 +1    1.1140000 +1   -7.5080000 +1                  0.0000
 Mg              4.63300000 +1    2.6750000 +1    6.2570000 +1                  0.0000
  O              3.99000000 +1   -1.1140000 +1   -7.5080000 +1                  0.0000
 Mg              6.94900000 +1   -1.3370000 +1    6.2570000 +1                  0.0000
 Mg              4.63300000 +1   -2.6750000 +1   -6.2570000 +1                  0.0000
  O              3.60300000 +1   -4.0120000 +1    7.5080000 +1                  0.0000
  O              5.27600000 +1   -1.5610000 +1    5.0050000 +1                  0.0000
  O              2.96000000 +1    2.4510000 +1    5.0050000 +1                  0.0000
  O              5.27600000 +1    3.7890000 +1   -5.0050000 +1                  0.0000
  O              2.96000000 +1   -0.2240000 +1   -5.0050000 +1                  0.0000
  O              1.67300000 +1   -2.8980000 +1    7.5080000 +1                  0.0000
  O              3.34700000 +1   -2.6750000 +1    5.0050000 +1                  0.0000
  O              1.03000000 +1    1.3370000 +1    5.0050000 +1                  0.0000
  O              1.03000000 +1   -1.3370000 +1   -5.0050000 +1                  0.0000
  O              3.34700000 +1    2.6750000 +1   -5.0050000 +1                  0.0000
  O              1.67300000 +1   -5.1270000 +1    7.5080000 +1                  0.0000
  O              2.96000000 +1    0.2240000 +1    5.0050000 +1                  0.0000
  O              5.27600000 +1   -3.7890000 +1    5.0050000 +1                  0.0000
  O              2.96000000 +1   -2.4510000 +1   -5.0050000 +1                  0.0000
  O              5.27600000 +1    1.5610000 +1   -5.0050000 +1                  0.0000
  C              4.63300000 +1    0.0000000 +1   -7.5079990 +1                  0.0000
  C              2.31700000 +1   -4.0130000 +1    7.5080000 +1                  0.0000
  C              2.31700000 +1    1.3370000 +1   -2.5030000 +1                  0.0000
  O              3.60300000 +1    1.3370000 +1   -2.5030000 +1                  0.0000
 Mg              4.63300000 +1    2.6750000 +1   -1.2510000 +1                  0.0000
  O              1.67300000 +1    2.4510000 +1   -2.5030000 +1                  0.0000
 Mg              2.31700000 +1    4.0120000 +1   -3.7540000 +1                  0.0000
  O              1.67300000 +1    0.2240000 +1   -2.5030000 +1                  0.0000
 Mg              4.63300000 +1    0.0000000 +1   -3.7540000 +1                  0.0000
 Mg              2.31700000 +1   -1.3370000 +1   -1.2510000 +1                  0.0000
  O              5.91900000 +1   -2.6750000 +1   -2.5030000 +1                  0.0000
  O              2.96000000 +1    5.1270000 +1    0.0000000 +1                  0.0000
  O              5.27600000 +1    1.1140000 +1    0.0000000 +1                  0.0000
  O              3.99000000 +1   -1.5610000 +1   -2.5030000 +1                  0.0000
  O              3.34700000 +1    0.0000000 +1    0.0000000 +1                  0.0000
  O              1.03000000 +1    4.0120000 +1    0.0000000 +1                  0.0000
  O              3.99000000 +1   -3.7890000 +1   -2.5030000 +1                  0.0000
  O              5.27600000 +1   -1.1140000 +1    0.0000000 +1                  0.0000
  O              2.96000000 +1    2.8980000 +1    0.0000000 +1                  0.0000
  C              4.63300000 +1   -2.6750000 +1   -2.5030000 +1                  0.0000
  C              4.63300000 +1    2.6750000 +1    2.5030000 +1                  0.0000
  O              5.91900000 +1    2.6750000 +1    2.5030000 +1                  0.0000
 Mg              2.31700000 +1    4.0120000 +1    3.7540000 +1                  0.0000
  O              3.99000000 +1    3.7890000 +1    2.5030000 +1                  0.0000
 Mg              4.63300000 +1   -2.6750000 +1    1.2510000 +1                  0.0000
  O              3.99000000 +1    1.5610000 +1    2.5030000 +1                  0.0000
 Mg              2.31700000 +1    1.3370000 +1    1.2510000 +1                  0.0000
 Mg              4.63300000 +1    0.0000000 +1    3.7540000 +1                  0.0000
  O              3.60300000 +1   -1.3370000 +1    2.5030000 +1                  0.0000
  O              1.67300000 +1   -0.2240000 +1    2.5030000 +1                  0.0000
  O              1.67300000 +1   -2.4520000 +1    2.5030000 +1                  0.0000
  C              2.31700000 +1   -1.3380000 +1    2.5030000 +1                  0.0000
  C              2.31700000 +1    4.0120000 +1    0.0000000 +1                  0.0000
  C              2.31700000 +1    1.3370000 +1    5.0050000 +1                  0.0000
  C              4.63300000 +1   -2.6750000 +1    5.0050000 +1                  0.0000
  C              4.63300000 +1    2.6750000 +1   -5.0050000 +1                  0.0000
  C              2.31700000 +1   -1.3380000 +1   -5.0050000 +1                  0.0000
 Tv              0.00000000 +1    0.0000000 +1  -15.0160000 +1 
 Tv              9.26600000 +1    0.0000000 +1    0.0000000 +1 
 Tv              0.00000000 +1    8.0250000 +1    0.0000000 +1 
 
  Optimized PM6 data set:
 MERS=(1,2,1)
 Magnesite_(MgCO3)

  C         0.01177397 +1   -0.0001848 +1   -0.0051716 +1                      0.0000
  O         1.32414881 +1    0.0030817 +1   -7.4551000 +1                      0.0000
 Mg        -2.26010146 +1    1.3295162 +1   -6.2107426 +1                      0.0000
  O        -0.61171118 +1    1.1287518 +1   -7.4347029 +1                      0.0000
 Mg         0.01213984 +1    2.6480550 +1    6.2174731 +1                      0.0000
  O        -0.61435969 +1   -1.1177566 +1   -7.4788926 +1                      0.0000
 Mg         2.29436347 +1   -1.3253485 +1    6.2033340 +1                      0.0000
 Mg         0.01978530 +1   -2.6460861 +1   -6.2270023 +1                      0.0000
  O        -0.97488689 +1   -3.9745378 +1    7.4319778 +1                      0.0000
  O         0.64839175 +1   -1.5262379 +1    4.9755747 +1                      0.0000
  O        -1.63388695 +1    2.4489763 +1    4.9893702 +1                      0.0000
  O         0.65899023 +1    3.7765426 +1   -4.9405469 +1                      0.0000
  O        -1.62799562 +1   -0.1978645 +1   -4.9567837 +1                      0.0000
  O        -2.91164965 +1   -2.8505479 +1    7.4504068 +1                      0.0000
  O        -1.28918752 +1   -2.6486492 +1    4.9532671 +1                      0.0000
  O        -3.57157611 +1    1.3269870 +1    4.9636821 +1                      0.0000
  O        -3.56511867 +1   -1.3214785 +1   -4.9792600 +1                      0.0000
  O        -1.27737686 +1    2.6521674 +1   -4.9617700 +1                      0.0000
  O        -2.91259392 +1   -5.0972603 +1    7.4105834 +1                      0.0000
  O        -1.63465859 +1    0.2027310 +1    4.9458505 +1                      0.0000
  O         0.64789811 +1   -3.7726563 +1    4.9336765 +1                      0.0000
  O        -1.62803703 +1   -2.4443748 +1   -5.0021102 +1                      0.0000
  O         0.66041510 +1    1.5299136 +1   -4.9800570 +1                      0.0000
  C         0.02974318 +1    0.0046558 +1   -7.4560255 +1                      0.0000
  C        -2.26929880 +1   -3.9741061 +1    7.4310237 +1                      0.0000
  C        -2.25922361 +1    1.3274309 +1   -2.4849722 +1                      0.0000
  O        -0.96483257 +1    1.3275753 +1   -2.4856057 +1                      0.0000
 Mg         0.01784496 +1    2.6492792 +1   -1.2366520 +1                      0.0000
  O        -2.90229595 +1    2.4505437 +1   -2.4654071 +1                      0.0000
 Mg        -2.26206462 +1    3.9768337 +1   -3.7165678 +1                      0.0000
  O        -2.90197730 +1    0.2041503 +1   -2.5048980 +1                      0.0000
 Mg         0.01887622 +1    0.0022693 +1   -3.7304779 +1                      0.0000
 Mg        -2.26570798 +1   -1.3224443 +1   -1.2534560 +1                      0.0000
  O         1.31891255 +1   -2.6499338 +1   -2.4968329 +1                      0.0000
  O        -1.62996987 +1    5.0977059 +1    0.0324245 +1                      0.0000
  O         0.65588817 +1    1.1223137 +1    0.0145906 +1                      0.0000
  O        -0.61676489 +1   -1.5242432 +1   -2.4765255 +1                      0.0000
  O        -1.28261157 +1    0.0012528 +1   -0.0057525 +1                      0.0000
  O        -3.56760291 +1    3.9759079 +1    0.0067909 +1                      0.0000
  O        -0.61950995 +1   -3.7708746 +1   -2.5214775 +1                      0.0000
  O         0.65320160 +1   -1.1242416 +1   -0.0247052 +1                      0.0000
  O        -1.63112059 +1    2.8511520 +1   -0.0128974 +1                      0.0000
  C         0.02450169 +1   -2.6482999 +1   -2.4984363 +1                      0.0000
  C         0.02417144 +1    2.6487104 +1    2.4895190 +1                      0.0000
  O         1.31866227 +1    2.6485571 +1    2.4898010 +1                      0.0000
 Mg        -2.26772291 +1    3.9744471 +1    3.7360150 +1                      0.0000
  O        -0.61841026 +1    3.7718073 +1    2.5127002 +1                      0.0000
 Mg         0.01361744 +1   -2.6496184 +1    1.2262546 +1                      0.0000
  O        -0.61839153 +1    1.5253539 +1    2.4659939 +1                      0.0000
 Mg        -2.26565428 +1    1.3247684 +1    1.2408640 +1                      0.0000
 Mg         0.01334505 +1   -0.0010953 +1    3.7207639 +1                      0.0000
  O        -0.96935607 +1   -1.3251261 +1    2.4732010 +1                      0.0000
  O        -2.90675189 +1   -0.2022566 +1    2.4908497 +1                      0.0000
  O        -2.90627474 +1   -2.4487909 +1    2.4496904 +1                      0.0000
  C        -2.26378886 +1   -1.3252522 +1    2.4712092 +1                      0.0000
  C        -2.27307268 +1    3.9747400 +1    0.0088801 +1                      0.0000
  C        -2.27723553 +1    1.3260867 +1    4.9662150 +1                      0.0000
  C         0.00526643 +1   -2.6494077 +1    4.9541093 +1                      0.0000
  C         0.01693704 +1    2.6526930 +1   -4.9606198 +1                      0.0000
  C        -2.27062493 +1   -1.3211278 +1   -4.9793354 +1                      0.0000
  C         4.57873717 +1   -0.0019677 +1   -0.0018366 +1                      0.0000
  O         5.89110604 +1    0.0012912 +1   -7.4534111 +1                      0.0000
 Mg         2.30679024 +1    1.3277130 +1   -6.2076090 +1                      0.0000
  O         3.95508395 +1    1.1266251 +1   -7.4328937 +1                      0.0000
 Mg         4.57874300 +1    2.6466658 +1    6.2199688 +1                      0.0000
  O         3.95273717 +1   -1.1198339 +1   -7.4770605 +1                      0.0000
 Mg         6.86143130 +1   -1.3265115 +1    6.2056171 +1                      0.0000
 Mg         4.58703846 +1   -2.6471958 +1   -6.2244268 +1                      0.0000
  O         3.59222515 +1   -3.9761451 +1    7.4354082 +1                      0.0000
  O         5.21531056 +1   -1.5281842 +1    4.9775064 +1                      0.0000
  O         2.93248911 +1    2.4469606 +1    4.9929150 +1                      0.0000
  O         5.22589549 +1    3.7746206 +1   -4.9387379 +1                      0.0000
  O         2.93864324 +1   -0.1998370 +1   -4.9541490 +1                      0.0000
  O         1.65519504 +1   -2.8524498 +1    7.4545632 +1                      0.0000
  O         3.27744943 +1   -2.6502013 +1    4.9558259 +1                      0.0000
  O         0.99511438 +1    1.3243009 +1    4.9687427 +1                      0.0000
  O         1.00163488 +1   -1.3237352 +1   -4.9759739 +1                      0.0000
  O         3.28958190 +1    2.6502984 +1   -4.9596908 +1                      0.0000
  O         1.65471488 +1   -5.0990768 +1    7.4141300 +1                      0.0000
  O         2.93221413 +1    0.2005494 +1    4.9493617 +1                      0.0000
  O         5.21429632 +1   -3.7745636 +1    4.9355737 +1                      0.0000
  O         2.93910608 +1   -2.4461857 +1   -4.9994943 +1                      0.0000
  O         5.22745699 +1    1.5280106 +1   -4.9777643 +1                      0.0000
  C         4.59672900 +1    0.0027111 +1   -7.4545433 +1                      0.0000
  C         2.29783430 +1   -3.9758343 +1    7.4347171 +1                      0.0000
  C         2.30762588 +1    1.3254306 +1   -2.4823918 +1                      0.0000
  O         3.60205035 +1    1.3252962 +1   -2.4825716 +1                      0.0000
 Mg         4.58424948 +1    2.6473248 +1   -1.2332147 +1                      0.0000
  O         1.66508656 +1    2.4487990 +1   -2.4628488 +1                      0.0000
 Mg         2.30556277 +1    3.9750349 +1   -3.7137495 +1                      0.0000
  O         1.66455196 +1    0.2023238 +1   -2.5021465 +1                      0.0000
 Mg         4.58579309 +1    0.0006292 +1   -3.7275298 +1                      0.0000
 Mg         2.30085975 +1   -1.3241440 +1   -1.2502408 +1                      0.0000
  O         5.88542852 +1   -2.6480161 +1   -2.4970884 +1                      0.0000
  O         2.93653545 +1    5.0959353 +1    0.0358549 +1                      0.0000
  O         5.22279740 +1    1.1205492 +1    0.0179743 +1                      0.0000
  O         3.94835001 +1   -1.5254559 +1   -2.4743406 +1                      0.0000
  O         3.28437945 +1   -0.0007957 +1   -0.0024731 +1                      0.0000
  O         0.99897468 +1    3.9738418 +1    0.0107549 +1                      0.0000
  O         3.94861868 +1   -3.7722445 +1   -2.5189878 +1                      0.0000
  O         5.22044219 +1   -1.1259210 +1   -0.0213629 +1                      0.0000
  O         2.93531160 +1    2.8493846 +1   -0.0102846 +1                      0.0000
  C         4.59094599 +1   -2.6488285 +1   -2.4966489 +1                      0.0000
  C         4.59073982 +1    2.6470314 +1    2.4921728 +1                      0.0000
  O         5.88517285 +1    2.6470955 +1    2.4923131 +1                      0.0000
 Mg         2.29893105 +1    3.9725428 +1    3.7393969 +1                      0.0000
  O         3.94796606 +1    3.7701565 +1    2.5150688 +1                      0.0000
 Mg         4.58042145 +1   -2.6514375 +1    1.2291487 +1                      0.0000
  O         3.94805217 +1    1.5238447 +1    2.4688717 +1                      0.0000
 Mg         2.30060101 +1    1.3230379 +1    1.2436178 +1                      0.0000
 Mg         4.57978261 +1   -0.0026104 +1    3.7234416 +1                      0.0000
  O         3.59754911 +1   -1.3266574 +1    2.4758386 +1                      0.0000
  O         1.65999278 +1   -0.2040542 +1    2.4939967 +1                      0.0000
  O         1.66082660 +1   -2.4506691 +1    2.4526722 +1                      0.0000
  C         2.30312185 +1   -1.3270799 +1    2.4741131 +1                      0.0000
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