Comparison of Structures of Crystalline Solids Predicted using PM6 with X-Ray (Home)

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138 Ikaite ((CaO)(CO2)(H2O)6)

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                      Unit Cell Parameters:       a      b      c   alpha   beta  gamma   Volume  Density
                                     X-Ray:     8.87   8.23  11.02  90.00  69.81  90.00    755.1   1.831
                                       PM6:     8.72   7.85  10.81  91.32  71.27  90.32    700.7   1.974
                 X-Ray                               PM6
 
  X-Ray data set:
 1SCF MERS=(2,2,1)
      Ikaite

 XX              0.00000000 +1    0.0000000 +1    0.0000000 +1 
  C             12.07691000 +1    0.0000000 +1    0.0000000 +1                  0.0000
  C              6.10405428 +1    2.1900452 +1    0.0000000 +1                  0.0000
  C             12.80850774 +1    4.1227131 +1   -4.3689304 +1                  0.0000
  C             10.72640402 +1    4.9558040 +1    2.7575378 +1                  0.0000
  H             13.14354434 +1    0.1649232 +1   -4.2519720 +1                  0.0000
  H             12.41436048 +1   -3.9546844 +1    0.1162318 +1                  0.0000
  H              7.98176887 +1    0.8858266 +1   -1.2965925 +1                  0.0000
  H             12.60411857 +1    3.6515854 +1    1.4609452 +1                  0.0000
  H              5.03500609 +1    2.0220165 +1    4.2526988 +1                  0.0000
  H              5.76849440 +1    6.1440700 +1   -0.1127691 +1                  0.0000
  H             10.19919541 +1    1.3042185 +1    1.2965926 +1                  0.0000
  H              5.57873583 +1   -1.4621989 +1   -1.4574820 +1                  0.0000
  H             12.20465120 +1    1.1781767 +1   -4.8679108 +1                  0.0000
  H             11.47546732 +1   -2.9414308 +1   -0.4997069 +1                  0.0000
  H              7.83926753 +1    0.2497246 +1   -2.6613824 +1                  0.0000
  H             12.46161726 +1    3.0154833 +1    0.0961554 +1                  0.0000
  H              5.97389923 +1    1.0087630 +1    4.8686376 +1                  0.0000
  H              6.70738755 +1    5.1308164 +1    0.5031697 +1                  0.0000
  H             10.34169677 +1    1.9403205 +1    2.6613824 +1                  0.0000
  H              5.72123720 +1   -0.8260969 +1   -0.0926922 +1                  0.0000
  H             12.00658690 +1    3.3024224 +1   -2.1051036 +1                  0.0000
  H             11.27498952 +1   -0.8202909 +1    2.2638268 +1                  0.0000
  H              9.88114162 +1   -2.5136285 +1   -2.0521369 +1                  0.0000
  H             14.50349113 +1    0.2521306 +1    0.7054010 +1                  0.0000
  H              6.17694572 +1   -1.1148096 +1    2.1032379 +1                  0.0000
  H              6.90854353 +1    3.0079030 +1   -2.2656924 +1                  0.0000
  H              8.29982246 +1    4.7036735 +1    2.0521366 +1                  0.0000
  H              3.67747315 +1    1.9379145 +1   -0.7054010 +1                  0.0000
  H             10.72192356 +1    3.3405191 +1   -1.2994465 +1                  0.0000
  H              9.99032609 +1   -0.7821942 +1    3.0694837 +1                  0.0000
  H             11.24263998 +1   -2.5769850 +1   -2.7104904 +1                  0.0000
  H             15.86498940 +1    0.1887740 +1    0.0470473 +1                  0.0000
  H              7.45904090 +1   -1.1504733 +1    1.2994461 +1                  0.0000
  H              8.19063880 +1    2.9722393 +1   -3.0694840 +1                  0.0000
  H              6.93832410 +1    4.7670301 +1    2.7104902 +1                  0.0000
  H              2.31597488 +1    2.0012712 +1   -0.0470473 +1                  0.0000
  H             10.37759793 +1    3.0104012 +1   -4.0529025 +1                  0.0000
  H              9.64410978 +1   -1.1116521 +1    0.3125649 +1                  0.0000
  H              9.23149454 +1   -1.4308488 +1   -4.2728379 +1                  0.0000
  H             13.85195344 +1    1.3355697 +1   -1.5187629 +1                  0.0000
  H              7.80525727 +1   -0.8210155 +1    4.0563650 +1                  0.0000
  H              8.53444069 +1    3.2985922 +1   -0.3118388 +1                  0.0000
  H              8.95136012 +1    3.6202345 +1    4.2763006 +1                  0.0000
  H              4.32901083 +1    0.8544755 +1    1.5187629 +1                  0.0000
  H              9.45661541 +1    1.9414626 +1   -4.6130387 +1                  0.0000
  H              8.72743139 +1   -2.1781447 +1   -0.2448352 +1                  0.0000
  H              9.44919263 +1   -0.1166299 +1   -5.0008676 +1                  0.0000
  H             14.07154205 +1    2.6491296 +1   -2.2433301 +1                  0.0000
  H              8.72434946 +1    0.2485827 +1    4.6130386 +1                  0.0000
  H              9.45353289 +1    4.3681904 +1    0.2448348 +1                  0.0000
  H              8.73177145 +1    2.3066747 +1    5.0008678 +1                  0.0000
  H              4.10942222 +1   -0.4590844 +1    2.2433301 +1                  0.0000
  O             12.68377653 +1   -0.2116533 +1    1.1115628 +1                  0.0000
  O              5.49907830 +1    2.4010390 +1   -1.1081000 +1                  0.0000
  O             13.41537426 +1    3.9110599 +1   -3.2573675 +1                  0.0000
  O             10.11953749 +1    5.1674571 +1    1.6459750 +1                  0.0000
  O             12.73393232 +1   -0.0225842 +1   -1.1069108 +1                  0.0000
  O              8.11399697 +1   -2.7852378 +1   -3.8651746 +1                  0.0000
  O             10.81128568 +1    0.2293580 +1   -0.0092540 +1                  0.0000
  O             11.54288341 +1    4.3520710 +1   -4.3781845 +1                  0.0000
  O              5.44461807 +1    2.2095237 +1    1.1076373 +1                  0.0000
  O             10.06696790 +1    4.9752825 +1    3.8651752 +1                  0.0000
  O              7.36967859 +1    1.9606871 +1    0.0092541 +1                  0.0000
  O              6.63808187 +1   -2.1620262 +1    4.3781844 +1                  0.0000
  O             12.49669164 +1    0.8339839 +1   -4.0255500 +1                  0.0000
  O             11.76561709 +1   -3.2849643 +1    0.3391910 +1                  0.0000
  O              8.42066131 +1    0.2892949 +1   -1.9039238 +1                  0.0000
  O             13.04112051 +1    3.0557132 +1    0.8501510 +1                  0.0000
  O              5.68616327 +1    1.3554020 +1    4.0290135 +1                  0.0000
  O              6.41534718 +1    5.4750094 +1   -0.3391911 +1                  0.0000
  O              9.76219362 +1    1.9000908 +1    1.9073867 +1                  0.0000
  O              5.13984332 +1   -0.8656674 +1   -0.8501507 +1                  0.0000
  O             11.46114477 +1    2.7655659 +1   -1.5214143 +1                  0.0000
  O             10.72765614 +1   -1.3564877 +1    2.8440536 +1                  0.0000
  O             10.74178308 +1   -2.0906495 +1   -2.0533473 +1                  0.0000
  O             15.36224201 +1    0.6757687 +1    0.7007276 +1                  0.0000
  O              6.72171047 +1   -0.5761796 +1    1.5248766 +1                  0.0000
  O              7.45330826 +1    3.5465330 +1   -2.8440536 +1                  0.0000
  O              7.43865772 +1    4.2769296 +1    2.0575364 +1                  0.0000
  O              2.81872227 +1    1.5142764 +1   -0.7007276 +1                  0.0000
  O              9.76549974 +1    2.3172985 +1   -3.7860090 +1                  0.0000
  O              9.03442508 +1   -1.8016495 +1    0.5787312 +1                  0.0000
  O              9.89652839 +1   -0.7562082 +1   -4.4427722 +1                  0.0000
  O             14.51698699 +1    2.0102109 +1   -1.6886977 +1                  0.0000
  O              8.41494171 +1   -0.1310184 +1    3.7901983 +1                  0.0000
  O              9.14653920 +1    3.9916953 +1   -0.5787316 +1                  0.0000
  O              8.28632646 +1    2.9455933 +1    4.4462354 +1                  0.0000
  O              3.66397728 +1    0.1798343 +1    1.6886978 +1                  0.0000
 Ca             10.75163345 +1    0.4622087 +1   -2.4274311 +1                  0.0000
 Ca              7.42933046 +1    1.7278364 +1    2.4274315 +1                  0.0000
 Ca             15.37398371 +1    3.2279676 +1    0.3301064 +1                  0.0000
 Ca              8.16092710 +1    5.8505497 +1   -1.9414988 +1                  0.0000
 XX              3.89075171 +1   -1.3569537 +1    7.1264688 +1 
  C             15.96766171 +1   -1.3569537 +1    7.1264688 +1                  0.0000
  C              9.99480599 +1    0.8330915 +1    7.1264688 +1                  0.0000
  C             16.69925944 +1    2.7657594 +1    2.7575384 +1                  0.0000
  C             14.61715572 +1    3.5988503 +1    9.8840066 +1                  0.0000
  H             17.03429605 +1   -1.1920305 +1    2.8744967 +1                  0.0000
  H             16.30511219 +1   -5.3116381 +1    7.2427006 +1                  0.0000
  H             11.87252058 +1   -0.4711271 +1    5.8298762 +1                  0.0000
  H             16.49487028 +1    2.2946317 +1    8.5874140 +1                  0.0000
  H              8.92575779 +1    0.6650628 +1   11.3791676 +1                  0.0000
  H              9.65924611 +1    4.7871163 +1    7.0136997 +1                  0.0000
  H             14.08994712 +1   -0.0527352 +1    8.4230614 +1                  0.0000
  H              9.46948754 +1   -2.8191526 +1    5.6689868 +1                  0.0000
  H             16.09540291 +1   -0.1787770 +1    2.2585580 +1                  0.0000
  H             15.36621903 +1   -4.2983845 +1    6.6267619 +1                  0.0000
  H             11.73001924 +1   -1.1072291 +1    4.4650864 +1                  0.0000
  H             16.35236896 +1    1.6585296 +1    7.2226242 +1                  0.0000
  H              9.86465094 +1   -0.3481907 +1   11.9951064 +1                  0.0000
  H             10.59813925 +1    3.7738627 +1    7.6296385 +1                  0.0000
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  H              9.61198891 +1   -2.1830506 +1    7.0337766 +1                  0.0000
  H             15.89733860 +1    1.9454687 +1    5.0213651 +1                  0.0000
  H             15.16574123 +1   -2.1772446 +1    9.3902956 +1                  0.0000
  H             13.77189333 +1   -3.8705822 +1    5.0743319 +1                  0.0000
  H             18.39424284 +1   -1.1048231 +1    7.8318698 +1                  0.0000
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  H             15.13339169 +1   -3.9339387 +1    4.4159784 +1                  0.0000
  H             19.75574111 +1   -1.1681797 +1    7.1735161 +1                  0.0000
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  H             13.53486149 +1   -2.4686058 +1    7.4390337 +1                  0.0000
  H             13.12224625 +1   -2.7878025 +1    2.8536309 +1                  0.0000
  H             17.74270515 +1   -0.0213840 +1    5.6077059 +1                  0.0000
  H             11.69600897 +1   -2.1779692 +1   11.1828338 +1                  0.0000
  H             12.42519240 +1    1.9416385 +1    6.8146300 +1                  0.0000
  H             12.84211182 +1    2.2632808 +1   11.4027694 +1                  0.0000
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  H             12.61818309 +1   -3.5350984 +1    6.8816336 +1                  0.0000
  H             13.33994434 +1   -1.4735836 +1    2.1256011 +1                  0.0000
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  H             12.61510116 +1   -1.1083710 +1   11.7395074 +1                  0.0000
  H             13.34428460 +1    3.0112367 +1    7.3713035 +1                  0.0000
  H             12.62252315 +1    0.9497210 +1   12.1273366 +1                  0.0000
  H              8.00017392 +1   -1.8160381 +1    9.3697989 +1                  0.0000
  O             16.57452824 +1   -1.5686070 +1    8.2380316 +1                  0.0000
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  O             17.30612597 +1    2.5541062 +1    3.8691012 +1                  0.0000
  O             14.01028919 +1    3.8105034 +1    8.7724437 +1                  0.0000
  O             16.62468403 +1   -1.3795379 +1    6.0195579 +1                  0.0000
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  O             15.43363511 +1    2.9951173 +1    2.7482843 +1                  0.0000
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  O             13.95771961 +1    3.6183288 +1   10.9916439 +1                  0.0000
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  O             15.65636880 +1   -4.6419180 +1    7.4656597 +1                  0.0000
  O             12.31141302 +1   -1.0676588 +1    5.2225450 +1                  0.0000
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  O             13.65625145 +1    0.9603448 +1    3.3404597 +1                  0.0000
  O             12.92517679 +1   -3.1586032 +1    7.7052000 +1                  0.0000
  O             13.78728010 +1   -2.1131619 +1    2.6836966 +1                  0.0000
  O             18.40773870 +1    0.6532572 +1    5.4377711 +1                  0.0000
  O             12.30569342 +1   -1.4879721 +1   10.9166671 +1                  0.0000
  O             13.03729090 +1    2.6347416 +1    6.5477371 +1                  0.0000
  O             12.17707816 +1    1.5886396 +1   11.5727042 +1                  0.0000
  O              7.55472898 +1   -1.1771194 +1    8.8151665 +1                  0.0000
 Ca             14.64238516 +1   -0.8947450 +1    4.6990376 +1                  0.0000
 Ca             11.32008217 +1    0.3708827 +1    9.5539003 +1                  0.0000
 Ca             19.26473542 +1    1.8710138 +1    7.4565752 +1                  0.0000
 Ca             12.05167880 +1    4.4935960 +1    5.1849700 +1                  0.0000
 XX              5.35153345 +1    6.8853662 +1   -1.6106660 +1 
  C             17.42844345 +1    6.8853662 +1   -1.6106660 +1                  0.0000
  C             11.45558773 +1    9.0754114 +1   -1.6106660 +1                  0.0000
  C             18.16004119 +1   11.0080793 +1   -5.9795964 +1                  0.0000
  C             16.07793747 +1   11.8411702 +1    1.1468718 +1                  0.0000
  H             18.49507779 +1    7.0502894 +1   -5.8626380 +1                  0.0000
  H             17.76589393 +1    2.9306819 +1   -1.4944342 +1                  0.0000
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  O             19.86852044 +1    8.8955772 +1   -3.2993637 +1                  0.0000
  O             13.76647517 +1    6.7543479 +1    2.1795323 +1                  0.0000
  O             14.49807265 +1   10.8770615 +1   -2.1893976 +1                  0.0000
  O             13.63785991 +1    9.8309595 +1    2.8355694 +1                  0.0000
  O              9.01551073 +1    7.0652005 +1    0.0780318 +1                  0.0000
 Ca             16.10316690 +1    7.3475749 +1   -4.0380971 +1                  0.0000
 Ca             12.78086391 +1    8.6132026 +1    0.8167655 +1                  0.0000
 Ca             20.72551716 +1   10.1133338 +1   -1.2805596 +1                  0.0000
 Ca             13.51246055 +1   12.7359160 +1   -3.5521648 +1                  0.0000
 XX              9.24228516 +1    5.5284125 +1    5.5158028 +1 
  C             21.31919516 +1    5.5284125 +1    5.5158028 +1                  0.0000
  C             15.34633944 +1    7.7184577 +1    5.5158028 +1                  0.0000
  C             22.05079290 +1    9.6511256 +1    1.1468724 +1                  0.0000
  C             19.96868918 +1   10.4842165 +1    8.2733406 +1                  0.0000
  H             22.38582950 +1    5.6933357 +1    1.2638307 +1                  0.0000
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  O             23.75927215 +1    7.5386235 +1    3.8271051 +1                  0.0000
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  O             12.90626243 +1    5.7082468 +1    7.2045005 +1                  0.0000
 Ca             19.99391861 +1    5.9906212 +1    3.0883717 +1                  0.0000
 Ca             16.67161562 +1    7.2562489 +1    7.9432343 +1                  0.0000
 Ca             24.61626887 +1    8.7563801 +1    5.8459092 +1                  0.0000
 Ca             17.40321226 +1   11.3789623 +1    3.5743040 +1                  0.0000
 Tv             10.70306690 +1   13.7707325 +1   -3.2213320 +1 
 Tv              7.78150341 +1   -2.7139074 +1   14.2529375 +1 
 Tv              8.93867931 +1   -3.3383674 +1   -5.5158020 +1 
 
  Optimized PM6 data set:
 MERS=(2,2,1) GNORM=5
      Ikaite

 XX             -0.00200000 +1   -0.0020000 +1   -0.0020000 +1 
  C        12.17115280 +1    0.0172158 +1    0.1639250 +1                      0.0000
  C         6.23220955 +1    2.2356682 +1    0.1220471 +1                      0.0000
  C        12.97710196 +1    4.1078897 +1   -3.9873061 +1                      0.0000
  C        10.73871246 +1    4.8991496 +1    2.6931033 +1                      0.0000
  H        13.29486716 +1    0.2589681 +1   -4.0117873 +1                      0.0000
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  O         8.43952923 +1   -0.1440355 +1    3.5873572 +1                      0.0000
  O         9.24258750 +1    3.8899591 +1   -0.5732362 +1                      0.0000
  O         8.29189688 +1    2.9951047 +1    4.3842606 +1                      0.0000
  O         3.83263933 +1    0.3273627 +1    1.8175667 +1                      0.0000
 Ca        10.95480283 +1    0.5310986 +1   -2.1854013 +1                      0.0000
 Ca         7.52393304 +1    1.7565925 +1    2.4289988 +1                      0.0000
 Ca        15.45033552 +1    3.2695104 +1    0.4608130 +1                      0.0000
 Ca         8.29509426 +1    5.7689345 +1   -1.7610604 +1                      0.0000
 XX         3.88875281 +1   -1.3588578 +1    7.1242787 +1 
  C        15.84474994 +1   -1.3080505 +1    6.9879610 +1                      0.0000
  C         9.97016480 +1    0.8503402 +1    6.9518388 +1                      0.0000
  C        16.68758361 +1    2.8230549 +1    2.8186624 +1                      0.0000
  C        14.44955518 +1    3.6146531 +1    9.4971064 +1                      0.0000
  H        17.03864633 +1   -1.0385245 +1    2.8054858 +1                      0.0000
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  O        12.95139843 +1    2.5795953 +1    6.2485342 +1                      0.0000
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  O         7.53693145 +1   -0.9580005 +1    8.6123315 +1                      0.0000
 Ca        14.67609292 +1   -0.7781459 +1    4.6184598 +1                      0.0000
 Ca        11.24765125 +1    0.4897014 +1    9.2982140 +1                      0.0000
 Ca        19.13018641 +1    1.9576341 +1    7.2713680 +1                      0.0000
 Ca        11.97261741 +1    4.4486804 +1    5.0510010 +1                      0.0000
 XX         5.34953425 +1    6.8833715 +1   -1.6124189 +1 
  C        17.46067639 +1    6.8702612 +1   -1.4438128 +1                      0.0000
  C        11.58563297 +1    9.0288013 +1   -1.4782484 +1                      0.0000
  C        18.20085561 +1   10.8654175 +1   -5.6007073 +1                      0.0000
  C        16.03251010 +1   11.6997796 +1    1.1204589 +1                      0.0000
  H        18.55655713 +1    6.9999468 +1   -5.5821448 +1                      0.0000
  H        17.76666398 +1    2.9539134 +1   -1.4044224 +1                      0.0000
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  O        15.23011538 +1    9.1417139 +1   -4.9524893 +1                      0.0000
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  O        19.89312463 +1    8.6812931 +1   -3.1020822 +1                      0.0000
  O        13.68477784 +1    6.6289006 +1    2.1046116 +1                      0.0000
  O        14.48298876 +1   10.7158041 +1   -2.2078371 +1                      0.0000
  O        13.55038083 +1    9.8370914 +1    2.7613447 +1                      0.0000
  O         9.08082558 +1    7.0733355 +1    0.1403199 +1                      0.0000
 Ca        16.17696975 +1    7.2313255 +1   -3.7871840 +1                      0.0000
 Ca        12.75133226 +1    8.4996271 +1    0.8907317 +1                      0.0000
 Ca        20.69367727 +1    9.9749953 +1   -1.1980597 +1                      0.0000
 Ca        13.56197103 +1   12.6349958 +1   -3.3569955 +1                      0.0000
 XX         9.24028531 +1    5.5264422 +1    5.5137033 +1 
  C        21.18794769 +1    5.4925721 +1    5.3858131 +1                      0.0000
  C        15.25349538 +1    7.7025026 +1    5.3447954 +1                      0.0000
  C        21.90108431 +1    9.5647355 +1    1.1662376 +1                      0.0000
  C        19.71846321 +1   10.3940512 +1    7.8924264 +1                      0.0000
  H        22.24773150 +1    5.7021736 +1    1.2377284 +1                      0.0000
  H        21.48543037 +1    1.6509670 +1    5.4297835 +1                      0.0000
  H        17.11157281 +1    6.2525380 +1    4.2407524 +1                      0.0000
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