Comparison of Structures of Crystalline Solids Predicted using PM6 with X-Ray (Home)

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136 Ice-Ih

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Notes: This is normal ice, the kind found in snowflakes.
Rotating the structure reveals the hexagonal symmetry.
                      Unit Cell Parameters:       a      b      c   alpha   beta  gamma   Volume  Density
                                     X-Ray:     7.83   4.52   7.38  90.00  90.01  90.00    261.1   0.916
                                       PM6:     7.45   4.36   7.09  90.48  90.28  89.25    230.5   1.038
                 X-Ray                               PM6
 
  X-Ray data set:
 MERS=(2,4,2) 1SCF
 Ice-Ih

  O              0.00000000 +1    0.0000000 +1    0.0000000 +1                  0.0000
  H             -0.01600000 +1   -1.7680010 +1    0.0070000 +1                  0.0000
  H              0.44200000 +1   -3.1090010 +1   -0.8040010 +1                  0.0000
  O              1.27100000 +1   -3.6950010 +1    2.2739990 +1                  0.0000
  H              0.80200000 +1   -3.3590000 +1    1.4559990 +1                  0.0000
  H              2.21600000 +1   -3.3690010 +1    2.2719990 +1                  0.0000
  O             -3.94000000 +1   -2.7220020 +1    2.2699990 +1                  0.0000
  H             -3.93000000 +1   -1.7220020 +1    2.2659990 +1                  0.0000
  H             -3.47200000 +1   -3.0630020 +1    1.4549990 +1                  0.0000
  O             -2.64500000 +1   -3.6660020 +1    0.0149990 +1                  0.0000
  H             -3.11200000 +1   -3.3310020 +1   -0.8030010 +1                  0.0000
  H             -1.69800000 +1   -3.3410010 +1    0.0129990 +1                  0.0000
  H             -0.94000000 +1    0.3430000 +1   -0.0009990 +1                  0.0000
  H              0.47400000 +1    0.3330000 +1    0.8150010 +1                  0.0000
  O              1.31400000 +1    0.9020000 +1   -2.2630000 +1                  0.0000
  H              1.32300000 +1    1.9020000 +1   -2.2670000 +1                  0.0000
  H              0.83800000 +1    0.5760000 +1   -1.4450000 +1                  0.0000
  O              3.91400000 +1   -0.0460000 +1   -2.2600000 +1                  0.0000
  H              2.97400000 +1    0.2970010 +1   -2.2610000 +1                  0.0000
  H              4.38800000 +1    0.2870010 +1   -1.4440000 +1                  0.0000
  O             -2.60200000 +1    0.9480000 +1   -0.0029990 +1                  0.0000
  H             -2.59200000 +1    1.9480000 +1   -0.0070000 +1                  0.0000
  H             -3.07600000 +1    0.6230000 +1    0.8140000 +1                  0.0000
  O             -0.02600000 +1   -2.7680010 +1    0.0109990 +1                  0.0000
  O              7.82800000 +1   -0.0739990 +1    0.0000000 +1                  0.0000
  H              7.81200000 +1   -1.8420000 +1    0.0070000 +1                  0.0000
  H              8.27000000 +1   -3.1830000 +1   -0.8040010 +1                  0.0000
  O              9.09900000 +1   -3.7690000 +1    2.2739990 +1                  0.0000
  H              8.63000000 +1   -3.4329990 +1    1.4559990 +1                  0.0000
  H             10.04400000 +1   -3.4430000 +1    2.2719990 +1                  0.0000
  O              3.88800000 +1   -2.7960010 +1    2.2699990 +1                  0.0000
  H              3.89800000 +1   -1.7960010 +1    2.2659990 +1                  0.0000
  H              4.35600000 +1   -3.1370010 +1    1.4549990 +1                  0.0000
  O              5.18300000 +1   -3.7400010 +1    0.0149990 +1                  0.0000
  H              4.71600000 +1   -3.4050010 +1   -0.8030010 +1                  0.0000
  H              6.13000000 +1   -3.4150000 +1    0.0129990 +1                  0.0000
  H              6.88800000 +1    0.2690010 +1   -0.0009990 +1                  0.0000
  H              8.30200000 +1    0.2590010 +1    0.8150010 +1                  0.0000
  O              9.14200000 +1    0.8280010 +1   -2.2630000 +1                  0.0000
  H              9.15100000 +1    1.8280010 +1   -2.2670000 +1                  0.0000
  H              8.66600000 +1    0.5020010 +1   -1.4450000 +1                  0.0000
  O             11.74200000 +1   -0.1199990 +1   -2.2600000 +1                  0.0000
  H             10.80200000 +1    0.2230020 +1   -2.2610000 +1                  0.0000
  H             12.21600000 +1    0.2130020 +1   -1.4440000 +1                  0.0000
  O              5.22600000 +1    0.8740010 +1   -0.0029990 +1                  0.0000
  H              5.23600000 +1    1.8740010 +1   -0.0070000 +1                  0.0000
  H              4.75200000 +1    0.5490010 +1    0.8140000 +1                  0.0000
  O              7.80200000 +1   -2.8420000 +1    0.0109990 +1                  0.0000
  O              0.00000000 +1   -0.0180000 +1   -4.5190000 +1                  0.0000
  H             -0.01600000 +1   -1.7860010 +1   -4.5120000 +1                  0.0000
  H              0.44200000 +1   -3.1270010 +1   -5.3230010 +1                  0.0000
  O              1.27100000 +1   -3.7130010 +1   -2.2450010 +1                  0.0000
  H              0.80200000 +1   -3.3770000 +1   -3.0630010 +1                  0.0000
  H              2.21600000 +1   -3.3870010 +1   -2.2470010 +1                  0.0000
  O             -3.94000000 +1   -2.7400020 +1   -2.2490010 +1                  0.0000
  H             -3.93000000 +1   -1.7400020 +1   -2.2530010 +1                  0.0000
  H             -3.47200000 +1   -3.0810020 +1   -3.0640010 +1                  0.0000
  O             -2.64500000 +1   -3.6840020 +1   -4.5040010 +1                  0.0000
  H             -3.11200000 +1   -3.3490020 +1   -5.3220010 +1                  0.0000
  H             -1.69800000 +1   -3.3590010 +1   -4.5060010 +1                  0.0000
  H             -0.94000000 +1    0.3250000 +1   -4.5199990 +1                  0.0000
  H              0.47400000 +1    0.3150000 +1   -3.7039990 +1                  0.0000
  O              1.31400000 +1    0.8840000 +1   -6.7820000 +1                  0.0000
  H              1.32300000 +1    1.8840000 +1   -6.7860000 +1                  0.0000
  H              0.83800000 +1    0.5580000 +1   -5.9640000 +1                  0.0000
  O              3.91400000 +1   -0.0640000 +1   -6.7790000 +1                  0.0000
  H              2.97400000 +1    0.2790010 +1   -6.7800000 +1                  0.0000
  H              4.38800000 +1    0.2690010 +1   -5.9630000 +1                  0.0000
  O             -2.60200000 +1    0.9300000 +1   -4.5219990 +1                  0.0000
  H             -2.59200000 +1    1.9300000 +1   -4.5260000 +1                  0.0000
  H             -3.07600000 +1    0.6050000 +1   -3.7050000 +1                  0.0000
  O             -0.02600000 +1   -2.7860010 +1   -4.5080010 +1                  0.0000
  O              7.82800000 +1   -0.0919990 +1   -4.5190000 +1                  0.0000
  H              7.81200000 +1   -1.8600000 +1   -4.5120000 +1                  0.0000
  H              8.27000000 +1   -3.2010000 +1   -5.3230010 +1                  0.0000
  O              9.09900000 +1   -3.7870000 +1   -2.2450010 +1                  0.0000
  H              8.63000000 +1   -3.4509990 +1   -3.0630010 +1                  0.0000
  H             10.04400000 +1   -3.4610000 +1   -2.2470010 +1                  0.0000
  O              3.88800000 +1   -2.8140010 +1   -2.2490010 +1                  0.0000
  H              3.89800000 +1   -1.8140010 +1   -2.2530010 +1                  0.0000
  H              4.35600000 +1   -3.1550010 +1   -3.0640010 +1                  0.0000
  O              5.18300000 +1   -3.7580010 +1   -4.5040010 +1                  0.0000
  H              4.71600000 +1   -3.4230010 +1   -5.3220010 +1                  0.0000
  H              6.13000000 +1   -3.4330000 +1   -4.5060010 +1                  0.0000
  H              6.88800000 +1    0.2510010 +1   -4.5199990 +1                  0.0000
  H              8.30200000 +1    0.2410010 +1   -3.7039990 +1                  0.0000
  O              9.14200000 +1    0.8100010 +1   -6.7820000 +1                  0.0000
  H              9.15100000 +1    1.8100010 +1   -6.7860000 +1                  0.0000
  H              8.66600000 +1    0.4840010 +1   -5.9640000 +1                  0.0000
  O             11.74200000 +1   -0.1379990 +1   -6.7790000 +1                  0.0000
  H             10.80200000 +1    0.2050020 +1   -6.7800000 +1                  0.0000
  H             12.21600000 +1    0.1950020 +1   -5.9630000 +1                  0.0000
  O              5.22600000 +1    0.8560010 +1   -4.5219990 +1                  0.0000
  H              5.23600000 +1    1.8560010 +1   -4.5260000 +1                  0.0000
  H              4.75200000 +1    0.5310010 +1   -3.7050000 +1                  0.0000
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  H              4.82100000 +1    7.8760020 +1  -12.7719990 +1                  0.0000
  O              7.87100000 +1    4.4850010 +1  -13.5750000 +1                  0.0000
 Tv             15.65600000 +1   -0.1479980 +1    0.0000000 +1 
 Tv              0.00000000 +1   -0.0720000 +1  -18.0760000 +1 
 Tv              0.13800000 +1   14.7620020 +1   -0.0579980 +1 
 
  Optimized PM6 data set:
 MERS=(2,4,2) GNORM=3
 Ice-Ih

  O         0.26148708 +1    0.0401501 +1   -0.4002830 +1                      0.0000
  H         0.11202821 +1   -1.5915322 +1   -0.1891248 +1                      0.0000
  H         0.51508863 +1   -2.9569092 +1   -0.9138583 +1                      0.0000
  O         1.25382784 +1   -3.5415827 +1    2.0790351 +1                      0.0000
  H         0.80000917 +1   -3.1574656 +1    1.2663248 +1                      0.0000
  H         2.18245524 +1   -3.1497518 +1    2.0659686 +1                      0.0000
  O        -3.69929019 +1   -2.5935437 +1    2.1107292 +1                      0.0000
  H        -3.62071428 +1   -1.5946429 +1    1.9976444 +1                      0.0000
  H        -3.23833588 +1   -2.9823200 +1    1.3058863 +1                      0.0000
  O        -2.44816990 +1   -3.5025292 +1   -0.0577668 +1                      0.0000
  H        -2.89963276 +1   -3.1041681 +1   -0.8647751 +1                      0.0000
  H        -1.51581129 +1   -3.1203026 +1   -0.0681172 +1                      0.0000
  H        -0.66621395 +1    0.4325800 +1   -0.3746604 +1                      0.0000
  H         0.72148608 +1    0.4054853 +1    0.4161821 +1                      0.0000
  O         1.51579714 +1    0.9569033 +1   -2.5665760 +1                      0.0000
  H         1.47236181 +1    1.9595243 +1   -2.4646108 +1                      0.0000
  H         1.03618325 +1    0.5950058 +1   -1.7605315 +1                      0.0000
  O         4.00325181 +1    0.0097396 +1   -2.5854316 +1                      0.0000
  H         3.07368791 +1    0.3979192 +1   -2.5631228 +1                      0.0000
  H         4.46008641 +1    0.3812709 +1   -1.7684123 +1                      0.0000
  O        -2.22975768 +1    0.9758292 +1   -0.3814615 +1                      0.0000
  H        -2.27923825 +1    1.9782783 +1   -0.2810692 +1                      0.0000
  H        -2.71194987 +1    0.6106884 +1    0.4214433 +1                      0.0000
  O         0.05010355 +1   -2.5932923 +1   -0.0996267 +1                      0.0000
  O         7.70912755 +1   -0.0220702 +1   -0.4424510 +1                      0.0000
  H         7.56508651 +1   -1.6508148 +1   -0.2254232 +1                      0.0000
  H         7.97318570 +1   -3.0268952 +1   -0.9271910 +1                      0.0000
  O         8.70195316 +1   -3.5918545 +1    2.0577107 +1                      0.0000
  H         8.24435127 +1   -3.1935055 +1    1.2527305 +1                      0.0000
  H         9.63089074 +1   -3.2021243 +1    2.0473774 +1                      0.0000
  O         3.75192215 +1   -2.6501476 +1    2.0554943 +1                      0.0000
  H         3.82754064 +1   -1.6486395 +1    1.9621418 +1                      0.0000
  H         4.21498414 +1   -3.0227403 +1    1.2435924 +1                      0.0000
  O         4.99889430 +1   -3.5563868 +1   -0.1121528 +1                      0.0000
  H         4.54565575 +1   -3.1735387 +1   -0.9259730 +1                      0.0000
  H         5.92947201 +1   -3.1698181 +1   -0.1262615 +1                      0.0000
  H         6.77988537 +1    0.3658779 +1   -0.4201985 +1                      0.0000
  H         8.16179059 +1    0.3437966 +1    0.3794197 +1                      0.0000
  O         8.96167577 +1    0.9055969 +1   -2.6069180 +1                      0.0000
  H         8.91041522 +1    1.9078429 +1   -2.5104948 +1                      0.0000
  H         8.49091884 +1    0.5437591 +1   -1.7959343 +1                      0.0000
  O        11.45529763 +1   -0.0307465 +1   -2.6611323 +1                      0.0000
  H        10.52699936 +1    0.3589152 +1   -2.6265065 +1                      0.0000
  H        11.92302404 +1    0.3424128 +1   -1.8517359 +1                      0.0000
  O         5.21941566 +1    0.9159140 +1   -0.3973006 +1                      0.0000
  H         5.16783397 +1    1.9191245 +1   -0.3022608 +1                      0.0000
  H         4.74841693 +1    0.5541446 +1    0.4139699 +1                      0.0000
  O         7.49886135 +1   -2.6523506 +1   -0.1223634 +1                      0.0000
  O         0.29108402 +1    0.0463886 +1   -4.7554239 +1                      0.0000
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  H         0.55165053 +1   -2.9538694 +1   -5.2671477 +1                      0.0000
  O         1.30136542 +1   -3.5189618 +1   -2.2666989 +1                      0.0000
  H         0.85487086 +1   -3.1384062 +1   -3.0849256 +1                      0.0000
  H         2.23456773 +1   -3.1376167 +1   -2.2798680 +1                      0.0000
  O        -3.65334604 +1   -2.5612405 +1   -2.2358111 +1                      0.0000
  H        -3.58706023 +1   -1.5603814 +1   -2.3422049 +1                      0.0000
  H        -3.19161737 +1   -2.9402245 +1   -3.0444069 +1                      0.0000
  O        -2.41830507 +1   -3.4898643 +1   -4.4127996 +1                      0.0000
  H        -2.86610455 +1   -3.0911912 +1   -5.2205691 +1                      0.0000
  H        -1.48235923 +1   -3.1182272 +1   -4.4245515 +1                      0.0000
  H        -0.63809262 +1    0.4348988 +1   -4.7330712 +1                      0.0000
  H         0.75187051 +1    0.4250698 +1   -3.9446986 +1                      0.0000
  O         1.53046501 +1    0.9457646 +1   -6.9381580 +1                      0.0000
  H         1.48466818 +1    1.9478946 +1   -6.8390145 +1                      0.0000
  H         1.05697445 +1    0.5866573 +1   -6.1266164 +1                      0.0000
  O         4.02502671 +1    0.0048804 +1   -6.9501286 +1                      0.0000
  H         3.09452195 +1    0.3905619 +1   -6.9292311 +1                      0.0000
  H         4.48020678 +1    0.3769818 +1   -6.1331023 +1                      0.0000
  O        -2.20462100 +1    0.9818971 +1   -4.7485012 +1                      0.0000
  H        -2.25468560 +1    1.9832945 +1   -4.6418682 +1                      0.0000
  H        -2.68298353 +1    0.6141817 +1   -3.9446801 +1                      0.0000
  O         0.08934014 +1   -2.5905479 +1   -4.4514719 +1                      0.0000
  O         7.74321354 +1   -0.0141484 +1   -4.7946151 +1                      0.0000
  H         7.60836135 +1   -1.6487206 +1   -4.5784224 +1                      0.0000
  H         8.01264007 +1   -3.0244227 +1   -5.2820544 +1                      0.0000
  O         8.75091384 +1   -3.5690677 +1   -2.2878680 +1                      0.0000
  H         8.29875742 +1   -3.1760234 +1   -3.0978771 +1                      0.0000
  H         9.68327617 +1   -3.1874370 +1   -2.2997222 +1                      0.0000
  O         3.79949590 +1   -2.6197112 +1   -2.2914695 +1                      0.0000
  H         3.86306023 +1   -1.6162723 +1   -2.3773750 +1                      0.0000
  H         4.26459818 +1   -2.9811901 +1   -3.1069860 +1                      0.0000
  O         5.03286373 +1   -3.5441095 +1   -4.4671757 +1                      0.0000
  H         4.58145644 +1   -3.1634486 +1   -5.2824913 +1                      0.0000
  H         5.96672388 +1   -3.1672857 +1   -4.4854252 +1                      0.0000
  H         6.81298315 +1    0.3708202 +1   -4.7714535 +1                      0.0000
  H         8.20020393 +1    0.3629539 +1   -3.9806770 +1                      0.0000
  O         8.97512536 +1    0.8929207 +1   -6.9803214 +1                      0.0000
  H         8.92563301 +1    1.8952224 +1   -6.8883294 +1                      0.0000
  H         8.51175089 +1    0.5371247 +1   -6.1618838 +1                      0.0000
  O        11.47400808 +1   -0.0364810 +1   -7.0299222 +1                      0.0000
  H        10.54320284 +1    0.3477282 +1   -7.0010941 +1                      0.0000
  H        11.93610006 +1    0.3418507 +1   -6.2201735 +1                      0.0000
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  H         5.19292566 +1    1.9224990 +1   -4.6574464 +1                      0.0000
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  H         4.61018559 +1   -3.1806238 +1  -14.0129323 +1                      0.0000
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  H         8.22945164 +1    0.3198987 +1  -12.7046291 +1                      0.0000
  O         9.04288721 +1    0.8963072 +1  -15.6811638 +1                      0.0000
  H         8.99121253 +1    1.8987622 +1  -15.5833492 +1                      0.0000
  H         8.57056254 +1    0.5314071 +1  -14.8717045 +1                      0.0000
  O        11.53863952 +1   -0.0323296 +1  -15.7512342 +1                      0.0000
  H        10.60625521 +1    0.3477480 +1  -15.7198247 +1                      0.0000
  H        11.99656219 +1    0.3395389 +1  -14.9352264 +1                      0.0000
  O         5.29741739 +1    0.9043704 +1  -13.4761402 +1                      0.0000
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