Comparison of Structures of Crystalline Solids Predicted using PM6 with X-Ray (Home)

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132 Ice-2

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                      Unit Cell Parameters:       a      b      c   alpha   beta  gamma   Volume  Density
                                     X-Ray:     7.78  12.98   6.24  90.00 105.52  90.00    607.6   1.182
                                       PM6:     7.22  12.26   5.91  89.85 106.46  90.96    502.0   1.430
                 X-Ray                               PM6
 
  X-Ray data set:
MERS=(1,1,2) 1SCF
 Ice-II

  O              0.00000000 +1    0.0000000 +1    0.0000000 +1                  0.0000
  H              2.74500000 +1   -6.2410000 +1    3.5570000 +1                  0.0000
  H              1.39199900 +1   -6.0670000 +1    3.2750000 +1                  0.0000
  O              2.15599900 +1   -5.4190000 +1    3.4070010 +1                  0.0000
  O              0.79700000 +1    1.2710000 +1    3.2510000 +1                  0.0000
  H              0.34400000 +1    1.4330000 +1    4.1360000 +1                  0.0000
  H              0.15199900 +1    1.7519990 +1    2.6350000 +1                  0.0000
  O              2.15599900 +1    1.7360000 +1    0.3530000 +1                  0.0000
  H              2.74500000 +1    0.9140000 +1    0.5020000 +1                  0.0000
  H              1.39199900 +1    1.0890000 +1    0.2210000 +1                  0.0000
  O              1.03700000 +1   -2.5100000 +1   -0.5220000 +1                  0.0000
  H              1.49000000 +1   -2.6720000 +1   -1.4070000 +1                  0.0000
  H              1.68100000 +1   -2.9920000 +1    0.0930000 +1                  0.0000
  H              0.37599900 +1   -0.9130000 +1   -0.1990000 +1                  0.0000
  H             -0.70400000 +1   -0.2480000 +1    0.6840000 +1                  0.0000
  O              2.28099900 +1   -2.9780000 +1   -2.9470000 +1                  0.0000
  H              2.11200000 +1   -2.3410000 +1   -3.7090000 +1                  0.0000
  H              2.23199900 +1   -3.8600000 +1   -3.4440000 +1                  0.0000
  O             -1.01600100 +1    2.6420000 +1    1.5650000 +1                  0.0000
  H             -0.77500100 +1    3.2110000 +1    0.7510000 +1                  0.0000
  H             -1.79600000 +1    2.3020000 +1    1.0220000 +1                  0.0000
  O              1.83400000 +1   -1.2390000 +1    2.7290000 +1                  0.0000
  H              1.45700000 +1   -0.3260000 +1    2.9270000 +1                  0.0000
  H              2.53800000 +1   -0.9920000 +1    2.0440000 +1                  0.0000
  O              3.51499900 +1   -5.3550000 +1   -1.1320000 +1                  0.0000
  H              3.26900000 +1   -4.8320000 +1   -0.2890000 +1                  0.0000
  H              2.52699900 +1   -5.5400000 +1   -1.2320000 +1                  0.0000
  O             -0.44800000 +1    1.7390000 +1   -2.1040000 +1                  0.0000
  H             -0.27900000 +1    1.1020000 +1   -1.3420000 +1                  0.0000
  H             -0.39900000 +1    2.6199990 +1   -1.6080000 +1                  0.0000
  O              2.84900000 +1   -3.8810000 +1    1.1630000 +1                  0.0000
  H              2.60899900 +1   -4.4510000 +1    1.9770000 +1                  0.0000
  H              3.62999900 +1   -3.5410000 +1    1.7070000 +1                  0.0000
  O             -1.68200000 +1    4.1150000 +1    3.8610000 +1                  0.0000
  H             -1.43600100 +1    3.5920000 +1    3.0180000 +1                  0.0000
  H             -0.69400000 +1    4.3010000 +1    3.9600000 +1                  0.0000
  O             -0.32200100 +1    4.1800000 +1   -0.6790000 +1                  0.0000
  H             -0.91200100 +1    5.0010000 +1   -0.8290000 +1                  0.0000
  H              0.44199900 +1    4.8270000 +1   -0.5470000 +1                  0.0000
  O             -4.42100000 +1    2.1160000 +1    2.5330000 +1                  0.0000
  H             -3.96800000 +1    1.9540000 +1    1.6480000 +1                  0.0000
  H             -3.77700000 +1    1.6340000 +1    3.1490000 +1                  0.0000
  O             -3.17700100 +1    1.6480000 +1    0.1080000 +1                  0.0000
  H             -3.34600000 +1    2.2850000 +1   -0.6540000 +1                  0.0000
  H             -3.22600100 +1    0.7670000 +1   -0.3889990 +1                  0.0000
  O             -1.94300100 +1   -0.7280000 +1    1.9230000 +1                  0.0000
  H             -2.18900000 +1   -0.2050000 +1    2.7660000 +1                  0.0000
  H             -2.93100100 +1   -0.9140000 +1    1.8230000 +1                  0.0000
  O             -2.60900000 +1    0.7450000 +1   -3.5620000 +1                  0.0000
  H             -2.84900100 +1    0.1750000 +1   -2.7470000 +1                  0.0000
  H             -1.82800100 +1    1.0850000 +1   -3.0180000 +1                  0.0000
  O             -3.62400000 +1    3.3870000 +1   -1.9960000 +1                  0.0000
  H             -4.00100000 +1    4.3000000 +1   -1.7980000 +1                  0.0000
  H             -2.92000000 +1    3.6340000 +1   -2.6810000 +1                  0.0000
  O              0.79700000 +1   -5.8840000 +1   -1.4739990 +1                  0.0000
  H              0.34400000 +1   -5.7220000 +1   -0.5890000 +1                  0.0000
  H              0.15300000 +1   -5.4030000 +1   -2.0900000 +1                  0.0000
  O              0.00000000 +1    7.1550000 +1   -3.0550000 +1                  0.0000
  H              0.37700000 +1    6.2420000 +1   -3.2540000 +1                  0.0000
  H             -0.70400000 +1    6.9080000 +1   -2.3710000 +1                  0.0000
  O             -1.68100100 +1   -3.0400000 +1   -0.8640000 +1                  0.0000
  H             -1.43500000 +1   -3.5630000 +1   -1.7070000 +1                  0.0000
  H             -0.69300000 +1   -2.8540000 +1   -0.7650000 +1                  0.0000
  O             -1.01500000 +1   -4.5130000 +1   -3.1590000 +1                  0.0000
  H             -0.77500000 +1   -3.9440000 +1   -3.9740000 +1                  0.0000
  H             -1.79600000 +1   -4.8530000 +1   -3.7030000 +1                  0.0000
  O             -0.44700000 +1   -5.4160000 +1    0.9510000 +1                  0.0000
  H             -0.27800000 +1   -6.0530000 +1    1.7130000 +1                  0.0000
  H             -0.39800100 +1   -4.5350000 +1    1.4470000 +1                  0.0000
  O             -0.32200000 +1   -2.9750000 +1    2.3760000 +1                  0.0000
  H             -0.91100100 +1   -2.1540000 +1    2.2260000 +1                  0.0000
  H              0.44200000 +1   -2.3280000 +1    2.5080000 +1                  0.0000
  O              5.45800000 +1    2.5290000 +1    1.6700000 +1                  0.0000
  H              8.20300000 +1   -3.7120000 +1    5.2270000 +1                  0.0000
  H              6.84999900 +1   -3.5380000 +1    4.9450000 +1                  0.0000
  O              7.61399900 +1   -2.8900000 +1    5.0770010 +1                  0.0000
  O              6.25500000 +1    3.8000000 +1    4.9210000 +1                  0.0000
  H              5.80200000 +1    3.9620000 +1    5.8060000 +1                  0.0000
  H              5.60999900 +1    4.2809990 +1    4.3050000 +1                  0.0000
  O              7.61399900 +1    4.2650000 +1    2.0230000 +1                  0.0000
  H              8.20300000 +1    3.4430000 +1    2.1720000 +1                  0.0000
  H              6.84999900 +1    3.6180000 +1    1.8910000 +1                  0.0000
  O              6.49500000 +1    0.0190000 +1    1.1480000 +1                  0.0000
  H              6.94800000 +1   -0.1430000 +1    0.2630000 +1                  0.0000
  H              7.13900000 +1   -0.4630000 +1    1.7630000 +1                  0.0000
  H              5.83399900 +1    1.6160000 +1    1.4710000 +1                  0.0000
  H              4.75400000 +1    2.2810000 +1    2.3540000 +1                  0.0000
  O              7.73899900 +1   -0.4490000 +1   -1.2770000 +1                  0.0000
  H              7.57000000 +1    0.1880000 +1   -2.0390000 +1                  0.0000
  H              7.68999900 +1   -1.3310000 +1   -1.7740000 +1                  0.0000
  O              4.44199900 +1    5.1710000 +1    3.2350000 +1                  0.0000
  H              4.68299900 +1    5.7400000 +1    2.4210000 +1                  0.0000
  H              3.66200000 +1    4.8310000 +1    2.6920000 +1                  0.0000
  O              7.29200000 +1    1.2900000 +1    4.3990000 +1                  0.0000
  H              6.91500000 +1    2.2030000 +1    4.5970000 +1                  0.0000
  H              7.99600000 +1    1.5370000 +1    3.7140000 +1                  0.0000
  O              8.97299900 +1   -2.8260000 +1    0.5380000 +1                  0.0000
  H              8.72700000 +1   -2.3030000 +1    1.3810000 +1                  0.0000
  H              7.98499900 +1   -3.0110000 +1    0.4380000 +1                  0.0000
  O              5.01000000 +1    4.2680000 +1   -0.4340000 +1                  0.0000
  H              5.17900000 +1    3.6310000 +1    0.3280000 +1                  0.0000
  H              5.05900000 +1    5.1489990 +1    0.0620000 +1                  0.0000
  O              8.30700000 +1   -1.3520000 +1    2.8330000 +1                  0.0000
  H              8.06699900 +1   -1.9220000 +1    3.6470000 +1                  0.0000
  H              9.08799900 +1   -1.0120000 +1    3.3770000 +1                  0.0000
  O              3.77600000 +1    6.6440000 +1    5.5310000 +1                  0.0000
  H              4.02199900 +1    6.1210000 +1    4.6880000 +1                  0.0000
  H              4.76400000 +1    6.8300000 +1    5.6300000 +1                  0.0000
  O              5.13599900 +1    6.7090000 +1    0.9910000 +1                  0.0000
  H              4.54599900 +1    7.5300000 +1    0.8410000 +1                  0.0000
  H              5.89999900 +1    7.3560000 +1    1.1230000 +1                  0.0000
  O              1.03700000 +1    4.6450000 +1    4.2030000 +1                  0.0000
  H              1.49000000 +1    4.4830000 +1    3.3180000 +1                  0.0000
  H              1.68100000 +1    4.1630000 +1    4.8190000 +1                  0.0000
  O              2.28099900 +1    4.1770000 +1    1.7780000 +1                  0.0000
  H              2.11200000 +1    4.8140000 +1    1.0160000 +1                  0.0000
  H              2.23199900 +1    3.2960000 +1    1.2810010 +1                  0.0000
  O              3.51499900 +1    1.8010000 +1    3.5930000 +1                  0.0000
  H              3.26900000 +1    2.3240000 +1    4.4360000 +1                  0.0000
  H              2.52699900 +1    1.6150000 +1    3.4930000 +1                  0.0000
  O              2.84900000 +1    3.2740000 +1   -1.8920000 +1                  0.0000
  H              2.60899900 +1    2.7040000 +1   -1.0770000 +1                  0.0000
  H              3.62999900 +1    3.6140000 +1   -1.3480000 +1                  0.0000
  O              1.83400000 +1    5.9160000 +1   -0.3260000 +1                  0.0000
  H              1.45700000 +1    6.8290000 +1   -0.1280000 +1                  0.0000
  H              2.53800000 +1    6.1630000 +1   -1.0110000 +1                  0.0000
  O              6.25500000 +1   -3.3550000 +1    0.1960010 +1                  0.0000
  H              5.80200000 +1   -3.1930000 +1    1.0810000 +1                  0.0000
  H              5.61100000 +1   -2.8740000 +1   -0.4200000 +1                  0.0000
  O              5.45800000 +1    9.6840000 +1   -1.3850000 +1                  0.0000
  H              5.83500000 +1    8.7710000 +1   -1.5840000 +1                  0.0000
  H              4.75400000 +1    9.4370000 +1   -0.7010000 +1                  0.0000
  O              3.77699900 +1   -0.5110000 +1    0.8060000 +1                  0.0000
  H              4.02300000 +1   -1.0340000 +1   -0.0370000 +1                  0.0000
  H              4.76500000 +1   -0.3250000 +1    0.9050000 +1                  0.0000
  O              4.44300000 +1   -1.9840000 +1   -1.4890000 +1                  0.0000
  H              4.68300000 +1   -1.4150000 +1   -2.3040000 +1                  0.0000
  H              3.66200000 +1   -2.3240000 +1   -2.0330000 +1                  0.0000
  O              5.01100000 +1   -2.8870000 +1    2.6210000 +1                  0.0000
  H              5.18000000 +1   -3.5240000 +1    3.3830000 +1                  0.0000
  H              5.05999900 +1   -2.0060000 +1    3.1170000 +1                  0.0000
  O              5.13600000 +1   -0.4460000 +1    4.0460000 +1                  0.0000
  H              4.54699900 +1    0.3750000 +1    3.8960000 +1                  0.0000
  H              5.90000000 +1    0.2010000 +1    4.1780000 +1                  0.0000
 Tv              0.00000000 +1    0.0000000 +1   -7.7800000 +1 
 Tv              5.45800000 +1  -11.7810000 +1    0.0000000 +1 
 Tv             10.91600000 +1    5.0580000 +1    3.3400000 +1 
 
  Optimized PM6 data set:
MERS=(1,1,2) GNORM=3
 Ice-II

  O         0.28792977 +1    0.2749118 +1    0.0053371 +1                      0.0000
  H         3.00058648 +1   -5.5730911 +1    3.2799254 +1                      0.0000
  H         1.43608624 +1   -5.3475168 +1    3.3704520 +1                      0.0000
  O         2.29819621 +1   -4.8546249 +1    3.2136130 +1                      0.0000
  O         1.22737190 +1    1.1474269 +1    3.0485666 +1                      0.0000
  H         0.79228972 +1    1.3788551 +1    3.9252974 +1                      0.0000
  H         0.66775513 +1    1.6169282 +1    2.3638824 +1                      0.0000
  O         2.25223004 +1    1.9250258 +1    0.3827143 +1                      0.0000
  H         2.93606990 +1    1.1903360 +1    0.4549658 +1                      0.0000
  H         1.37869764 +1    1.4552751 +1    0.5480156 +1                      0.0000
  O         0.78815163 +1   -2.2234429 +1   -0.4693784 +1                      0.0000
  H         1.21080161 +1   -2.4385032 +1   -1.3571410 +1                      0.0000
  H         1.35341303 +1   -2.7125883 +1    0.1963869 +1                      0.0000
  H         0.78496352 +1   -0.5622328 +1   -0.2397438 +1                      0.0000
  H        -0.39384926 +1   -0.0306778 +1    0.6750432 +1                      0.0000
  O         2.41010073 +1   -2.6712754 +1   -2.4834136 +1                      0.0000
  H         2.28584951 +1   -2.0353785 +1   -3.2510699 +1                      0.0000
  H         2.35064745 +1   -3.5788781 +1   -2.8989323 +1                      0.0000
  O        -0.55686053 +1    2.5751346 +1    1.6776067 +1                      0.0000
  H        -0.22146719 +1    3.2042813 +1    0.9643902 +1                      0.0000
  H        -1.23338735 +1    2.0114191 +1    1.1928474 +1                      0.0000
  O         1.73268079 +1   -1.3722078 +1    2.6026186 +1                      0.0000
  H         1.26701362 +1   -0.5164010 +1    2.8418112 +1                      0.0000
  H         2.40505013 +1   -1.1012052 +1    1.9085767 +1                      0.0000
  O         3.60969634 +1   -5.1233453 +1   -0.9737238 +1                      0.0000
  H         3.45612549 +1   -4.5531439 +1   -0.1557869 +1                      0.0000
  H         2.69147541 +1   -5.2071271 +1   -1.3753578 +1                      0.0000
  O        -0.51923248 +1    1.5910357 +1   -2.1266727 +1                      0.0000
  H        -0.38972711 +1    0.9346431 +1   -1.3771038 +1                      0.0000
  H        -0.45268981 +1    2.4872688 +1   -1.6901546 +1                      0.0000
  O         2.56380343 +1   -3.6597316 +1    0.9299216 +1                      0.0000
  H         2.22121691 +1   -4.2747671 +1    1.6514280 +1                      0.0000
  H         3.22818941 +1   -3.0830425 +1    1.4118621 +1                      0.0000
  O        -1.60326897 +1    4.0333736 +1    3.5879400 +1                      0.0000
  H        -1.44000554 +1    3.4534353 +1    2.7791977 +1                      0.0000
  H        -0.69102916 +1    4.1210575 +1    4.0005509 +1                      0.0000
  O        -0.28233287 +1    3.7776523 +1   -0.5940894 +1                      0.0000
  H        -0.99516420 +1    4.4822420 +1   -0.6738443 +1                      0.0000
  H         0.57407852 +1    4.2880668 +1   -0.7315222 +1                      0.0000
  O        -4.23632380 +1    2.1599454 +1    2.3250923 +1                      0.0000
  H        -3.89406393 +1    1.9384094 +1    1.4076361 +1                      0.0000
  H        -3.61004145 +1    1.6821391 +1    2.9424736 +1                      0.0000
  O        -2.65519095 +1    1.7304419 +1    0.3055007 +1                      0.0000
  H        -2.74672337 +1    2.4077270 +1   -0.4274412 +1                      0.0000
  H        -2.69617603 +1    0.8458752 +1   -0.1647932 +1                      0.0000
  O        -1.41494238 +1   -0.7105044 +1    1.8326949 +1                      0.0000
  H        -1.49227311 +1   -0.1492031 +1    2.6648107 +1                      0.0000
  H        -2.35878274 +1   -0.7496129 +1    1.4886098 +1                      0.0000
  O        -2.60352210 +1    0.7189340 +1   -3.4985522 +1                      0.0000
  H        -2.99971943 +1    0.0852329 +1   -2.8268071 +1                      0.0000
  H        -1.97237818 +1    1.2757945 +1   -2.9504212 +1                      0.0000
  O        -3.45730105 +1    3.0653804 +1   -1.8076847 +1                      0.0000
  H        -3.95635439 +1    3.9086202 +1   -1.5909388 +1                      0.0000
  H        -2.79718638 +1    3.3403975 +1   -2.5106352 +1                      0.0000
  O         1.05704732 +1   -5.5869618 +1   -1.3164756 +1                      0.0000
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  H         0.46174175 +1   -5.1178398 +1   -1.9739986 +1                      0.0000
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  H         0.72721675 +1    6.1983090 +1   -3.1075822 +1                      0.0000
  H        -0.44006512 +1    6.7535905 +1   -2.1931672 +1                      0.0000
  O        -1.77552094 +1   -2.7313696 +1   -0.8090213 +1                      0.0000
  H        -1.73103544 +1   -3.3055976 +1   -1.6316585 +1                      0.0000
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  H        -1.35986851 +1   -4.7560716 +1   -3.2045452 +1                      0.0000
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  H        -0.39714862 +1   -5.8386413 +1    1.4759509 +1                      0.0000
  H        -0.46518386 +1   -4.2808239 +1    1.1946178 +1                      0.0000
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  H        -0.97147696 +1   -2.2820347 +1    2.1682273 +1                      0.0000
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  H         6.58471545 +1   -2.9677859 +1    4.9575971 +1                      0.0000
  O         7.44979219 +1   -2.4749967 +1    4.8112368 +1                      0.0000
  O         6.39160007 +1    3.5255964 +1    4.6720604 +1                      0.0000
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  H         5.80499997 +1    4.0124700 +1    4.0222913 +1                      0.0000
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  H         4.80959943 +1    2.4061695 +1    2.3264247 +1                      0.0000
  O         7.55813111 +1   -0.2956593 +1   -0.8829486 +1                      0.0000
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  H         7.48187791 +1   -1.1936664 +1   -1.3179027 +1                      0.0000
  O         4.62263395 +1    4.9864455 +1    3.3011480 +1                      0.0000
  H         4.99958928 +1    5.6118629 +1    2.6067479 +1                      0.0000
  H         3.96905959 +1    4.4288837 +1    2.7816424 +1                      0.0000
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  H         6.43096347 +1    1.8635546 +1    4.4385690 +1                      0.0000
  H         7.61457752 +1    1.3318318 +1    3.5297527 +1                      0.0000
  O         8.83318728 +1   -2.7364241 +1    0.6390670 +1                      0.0000
  H         8.71451156 +1   -2.1552221 +1    1.4535860 +1                      0.0000
  H         7.89959275 +1   -2.8186655 +1    0.2733592 +1                      0.0000
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  H         4.72059650 +1    4.8791943 +1   -0.0646366 +1                      0.0000
  O         7.75814691 +1   -1.3056443 +1    2.5295497 +1                      0.0000
  H         7.40801486 +1   -1.9401089 +1    3.2287576 +1                      0.0000
  H         8.40627942 +1   -0.7313706 +1    3.0407078 +1                      0.0000
  O         3.56952276 +1    6.4244308 +1    5.2120841 +1                      0.0000
  H         3.71069124 +1    5.8561021 +1    4.3908030 +1                      0.0000
  H         4.49068819 +1    6.5008755 +1    5.6030083 +1                      0.0000
  O         4.92216269 +1    6.1514743 +1    1.0309910 +1                      0.0000
  H         4.22718321 +1    6.8753143 +1    0.9519255 +1                      0.0000
  H         5.78972724 +1    6.6320848 +1    0.8576441 +1                      0.0000
  O         0.94385875 +1    4.5317305 +1    3.9405330 +1                      0.0000
  H         1.33754907 +1    4.2878046 +1    3.0484836 +1                      0.0000
  H         1.53796148 +1    4.0781865 +1    4.6068653 +1                      0.0000
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  H         2.41119149 +1    4.7785661 +1    1.1759823 +1                      0.0000
  H         2.48741627 +1    3.2198547 +1    1.4484063 +1                      0.0000
  O         3.77839345 +1    1.6843949 +1    3.4430492 +1                      0.0000
  H         3.64392891 +1    2.2477100 +1    4.2684519 +1                      0.0000
  H         2.85346517 +1    1.6055138 +1    3.0582280 +1                      0.0000
  O         2.57164089 +1    3.1208931 +1   -1.8728435 +1                      0.0000
  H         2.19292172 +1    2.4867423 +1   -1.1880818 +1                      0.0000
  H         3.22195505 +1    3.6760918 +1   -1.3441238 +1                      0.0000
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  H         1.20466392 +1    6.2763503 +1    0.0400842 +1                      0.0000
  H         2.36447110 +1    5.7256395 +1   -0.8875833 +1                      0.0000
  O         6.26499463 +1   -3.2140326 +1    0.2957974 +1                      0.0000
  H         5.86138983 +1   -2.9629233 +1    1.1815787 +1                      0.0000
  H         5.69055467 +1   -2.7472613 +1   -0.3794652 +1                      0.0000
  O         5.45209631 +1    9.3828064 +1   -1.3047699 +1                      0.0000
  H         5.95065765 +1    8.5402274 +1   -1.5299801 +1                      0.0000
  H         4.77890750 +1    9.0974540 +1   -0.6193665 +1                      0.0000
  O         3.42355664 +1   -0.3662383 +1    0.7903329 +1                      0.0000
  H         3.55956878 +1   -0.9190118 +1   -0.0400998 +1                      0.0000
  H         4.34853053 +1   -0.2861557 +1    1.1759294 +1                      0.0000
  O         4.50035686 +1   -1.7922974 +1   -1.1112408 +1                      0.0000
  H         4.87345413 +1   -1.1606407 +1   -1.8028180 +1                      0.0000
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  O         4.65055174 +1   -2.7797157 +1    2.3129300 +1                      0.0000
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