Comparison of Structures of Crystalline Solids Predicted using PM6 with X-Ray (Home)

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113 Garnet (Al2O3(CaO)3(SiO2)3)

                      Unit Cell Parameters:       a      b      c   alpha   beta  gamma   Volume  Density
                                     X-Ray:    11.86  11.85  11.85  90.00  90.00  90.00   1666.1   3.592
                                       PM6:    11.75  11.75  11.75  90.02  90.00  89.99   1623.4   3.686

                 X-Ray                               PM6

X-Ray data set: 1SCF MERS=(1,1,1) Garnet Al 0.00000000 +1 0.0000000 +1 0.0000000 +1 0.0000 Ca 0.00001300 +1 -1.9884130 +1 -2.6510840 +1 0.0000 Ca 1.48187700 +1 1.3255920 +1 -2.6511140 +1 0.0000 Ca 2.96388800 +1 -1.3254960 +1 -0.6627880 +1 0.0000 Ca -0.00018000 +1 4.6393460 +1 -2.6511720 +1 0.0000 Ca 4.44594100 +1 -1.3254240 +1 2.6512110 +1 0.0000 Ca -2.96398800 +1 -3.9767280 +1 -1.9883390 +1 0.0000 Ca 5.92710700 +1 0.6628460 +1 5.3021940 +1 0.0000 Ca -4.44577100 +1 -6.6270340 +1 0.0005790 +1 0.0000 Ca -2.96409600 +1 6.6273520 +1 -3.3131140 +1 0.0000 Ca 5.92707400 +1 -3.3136390 +1 0.0002020 +1 0.0000 Ca -1.48194700 +1 -3.9757980 +1 -5.3017740 +1 0.0000 Ca 2.96385100 +1 3.9761010 +1 -4.6386130 +1 0.0000 Ca 0.00007900 +1 1.9882870 +1 2.6510920 +1 0.0000 Ca -1.48190400 +1 -1.3258020 +1 2.6511350 +1 0.0000 Ca -2.96409000 +1 1.3253230 +1 0.6626750 +1 0.0000 Ca -0.00010900 +1 -4.6394020 +1 2.6510640 +1 0.0000 Ca -4.44601600 +1 1.3255070 +1 -2.6510880 +1 0.0000 Ca 2.96400000 +1 3.9766860 +1 1.9883300 +1 0.0000 Ca 5.92686600 +1 -0.6627060 +1 -5.3022370 +1 0.0000 Ca 4.44597800 +1 -3.9755170 +1 -5.3016450 +1 0.0000 Ca 2.96390000 +1 -1.3259280 +1 -7.2896560 +1 0.0000 Ca 5.92680700 +1 3.3137920 +1 -0.0000760 +1 0.0000 Ca 1.48193800 +1 -6.6267500 +1 0.0005430 +1 0.0000 Ca -2.96393700 +1 1.3249290 +1 -5.9639660 +1 0.0000 Al 5.92697800 +1 -5.3010560 +1 -2.6505000 +1 0.0000 Al -0.00007500 +1 -2.6504760 +1 -7.9519490 +1 0.0000 Al 5.92692300 +1 2.6506580 +1 -5.3012930 +1 0.0000 Al 2.96390400 +1 -1.3254340 +1 -3.9766330 +1 0.0000 Al -2.96395900 +1 3.9766240 +1 -1.3255970 +1 0.0000 Al 2.96402900 +1 1.3255230 +1 3.9766580 +1 0.0000 Al -2.96398400 +1 -3.9767560 +1 1.3255750 +1 0.0000 Al 5.92707100 +1 -2.6505770 +1 -7.9517550 +1 0.0000 Al 0.00018700 +1 2.6508060 +1 -5.3011950 +1 0.0000 Al 5.92674500 +1 0.0000470 +1 -0.0000790 +1 0.0000 Al -0.00001300 +1 -5.3015750 +1 -2.6506660 +1 0.0000 Al -2.96401800 +1 1.3252840 +1 3.9766610 +1 0.0000 Al 2.96393400 +1 -3.9765150 +1 1.3255970 +1 0.0000 Al -2.96399500 +1 -1.3256880 +1 -3.9765480 +1 0.0000 Al 2.96401400 +1 3.9766370 +1 -1.3254960 +1 0.0000 Si -0.00011000 +1 -0.6627120 +1 -5.3022070 +1 0.0000 Si 4.44586500 +1 1.3256200 +1 -2.6511140 +1 0.0000 Si 2.96390000 +1 -3.9765850 +1 -1.9883270 +1 0.0000 Si -0.00008500 +1 3.3139190 +1 -0.0000270 +1 0.0000 Si 1.48195300 +1 -1.3255930 +1 2.6511660 +1 0.0000 Si -2.96403900 +1 -1.3256290 +1 -0.6628220 +1 0.0000 Si -5.92780600 +1 1.9881970 +1 2.6511450 +1 0.0000 Si -1.48183900 +1 3.9762590 +1 5.3022340 +1 0.0000 Si -2.96397800 +1 3.9763500 +1 -4.6387910 +1 0.0000 Si 5.92701800 +1 -4.6391640 +1 2.6512820 +1 0.0000 Si -4.44592100 +1 -3.9758680 +1 -5.3017440 +1 0.0000 Si 2.96374800 +1 6.6272310 +1 -3.3131910 +1 0.0000 Si -0.00005800 +1 0.6629210 +1 5.3019960 +1 0.0000 Si -4.44577400 +1 -1.3256330 +1 2.6511490 +1 0.0000 Si -2.96389100 +1 3.9763470 +1 1.9884250 +1 0.0000 Si 0.00004400 +1 -3.3141300 +1 0.0000330 +1 0.0000 Si -1.48216200 +1 1.3252350 +1 -2.6512070 +1 0.0000 Si 2.96415900 +1 1.3256530 +1 0.6628480 +1 0.0000 Si 5.92690400 +1 -1.9883300 +1 -2.6511900 +1 0.0000 Si 1.48198900 +1 -3.9754860 +1 -5.3015430 +1 0.0000 Si 2.96382500 +1 1.3251460 +1 -5.9641310 +1 0.0000 Si 5.92705900 +1 4.6395800 +1 -2.6510540 +1 0.0000 Si 4.44611200 +1 -6.6267810 +1 0.0006760 +1 0.0000 Si -2.96401400 +1 -1.3261710 +1 -7.2894830 +1 0.0000 O 0.54203400 +1 -1.8062930 +1 -0.3967040 +1 0.0000 O 5.38604600 +1 4.0523340 +1 -4.0950910 +1 0.0000 O 6.46892300 +1 -3.4958580 +1 -2.2544370 +1 0.0000 O -0.54213800 +1 1.2500440 +1 6.7460500 +1 0.0000 O -0.45301000 +1 0.3169840 +1 -1.8460900 +1 0.0000 O -5.47483800 +1 -1.3645110 +1 3.9409820 +1 0.0000 O 5.47507800 +1 -5.6192880 +1 -0.8048000 +1 0.0000 O 0.45284400 +1 -3.9367560 +1 -6.5916230 +1 0.0000 O 1.79292300 +1 0.6476310 +1 -0.2821630 +1 0.0000 O 4.13491300 +1 2.4879900 +1 -5.9885750 +1 0.0000 O -4.13484500 +1 4.6542840 +1 2.9334230 +1 0.0000 O -1.79311800 +1 -2.4881370 +1 -7.2659540 +1 0.0000 O 4.75586600 +1 -2.0119870 +1 -3.8134910 +1 0.0000 O 2.51100500 +1 -2.6861590 +1 -5.2616460 +1 0.0000 O 3.50488200 +1 -0.1189440 +1 -5.3769350 +1 0.0000 O 1.17102400 +1 1.6077160 +1 4.6242140 +1 0.0000 O 3.41699400 +1 -7.4325250 +1 -1.0083480 +1 0.0000 O 2.42209400 +1 1.7222580 +1 2.1703620 +1 0.0000 O -1.17096500 +1 -3.2895010 +1 1.1627950 +1 0.0000 O -3.41690900 +1 -2.6155350 +1 2.6123270 +1 0.0000 O -2.42194800 +1 0.1183370 +1 -7.8775900 +1 0.0000 O 7.09875200 +1 3.6943190 +1 -1.9732220 +1 0.0000 O -2.51108400 +1 2.1302230 +1 -1.6427270 +1 0.0000 O -2.51109300 +1 3.5797070 +1 0.4806260 +1 0.0000 O 6.46904800 +1 6.1470860 +1 -3.0477280 +1 0.0000 O -0.54183700 +1 -3.9011830 +1 -1.4438970 +1 0.0000 O 0.54185900 +1 -0.8450010 +1 5.6988030 +1 0.0000 O 5.38590500 +1 -1.4010880 +1 -1.2070480 +1 0.0000 O 5.47517800 +1 -7.6351380 +1 0.8055060 +1 0.0000 O 0.45288500 +1 -4.0154900 +1 -4.0124030 +1 0.0000 O -0.45299300 +1 2.3341700 +1 -3.4562630 +1 0.0000 O -5.47497200 +1 -1.2866120 +1 1.3614660 +1 0.0000 O -4.13471400 +1 -2.0042530 +1 -8.2344850 +1 0.0000 O -1.79298000 +1 5.1392640 +1 1.9636780 +1 0.0000 O 1.79282600 +1 2.0035790 +1 -5.0200100 +1 0.0000 O 4.13514100 +1 0.1628420 +1 0.6874090 +1 0.0000 O -1.17086200 +1 0.6378880 +1 4.1395870 +1 0.0000 O -3.41686500 +1 -0.0360760 +1 2.6901220 +1 0.0000 O -2.42185200 +1 2.5323620 +1 2.5757520 +1 0.0000 O 7.09908900 +1 -1.0432630 +1 -3.3289190 +1 0.0000 O -2.51098400 +1 0.5200710 +1 -3.6585380 +1 0.0000 O -3.50599700 +1 -0.9293190 +1 -5.7820620 +1 0.0000 O 4.75583300 +1 4.6641750 +1 -1.4883660 +1 0.0000 O 2.51096400 +1 -5.2661410 +1 -5.3409540 +1 0.0000 O 3.50490800 +1 2.7697490 +1 0.0755280 +1 0.0000 O 1.17093200 +1 -4.2579420 +1 0.6784400 +1 0.0000 O 3.41688800 +1 -5.8218020 +1 1.0088770 +1 0.0000 O 3.41686700 +1 0.9289420 +1 -7.4725100 +1 0.0000 O -0.54208800 +1 1.8060850 +1 0.3965970 +1 0.0000 O 6.46885000 +1 -4.0521470 +1 4.0951560 +1 0.0000 O -6.46889200 +1 3.4958710 +1 2.2546690 +1 0.0000 O 0.54188900 +1 -1.2499610 +1 -6.7462970 +1 0.0000 O 0.45320600 +1 -0.3170910 +1 1.8461030 +1 0.0000 O 5.47492400 +1 1.3644610 +1 -3.9409640 +1 0.0000 O -5.47490800 +1 -4.9842270 +1 -4.4968060 +1 0.0000 O -0.45305900 +1 3.9364830 +1 6.5915580 +1 0.0000 O -1.79295800 +1 -0.6478480 +1 0.2822440 +1 0.0000 O -4.13519700 +1 2.8135670 +1 -4.6148710 +1 0.0000 O 4.13512100 +1 -4.6545090 +1 -2.9332190 +1 0.0000 O 1.79288500 +1 7.7900190 +1 -3.3376310 +1 0.0000 O -4.75579800 +1 2.0128330 +1 3.8139330 +1 0.0000 O -2.51083200 +1 2.6856420 +1 5.2628780 +1 0.0000 O -3.50583000 +1 5.4206120 +1 -5.2265290 +1 0.0000 O -1.17101100 +1 -1.6070070 +1 -4.6237290 +1 0.0000 O -3.41695500 +1 -3.1708510 +1 -4.2932570 +1 0.0000 O -2.42196500 +1 -1.7222960 +1 -2.1702970 +1 0.0000 O 1.17087400 +1 3.2892510 +1 -1.1628040 +1 0.0000 O 3.41680500 +1 2.6149320 +1 -2.6113860 +1 0.0000 O 2.42178500 +1 5.1832590 +1 -2.7259130 +1 0.0000 O 4.75605300 +1 -3.6942940 +1 1.9731970 +1 0.0000 O 2.51095000 +1 -2.1304340 +1 1.6426830 +1 0.0000 O 2.51108500 +1 -3.5798600 +1 -0.4807160 +1 0.0000 O 5.38586600 +1 -6.1469570 +1 3.0477270 +1 0.0000 O 0.54196100 +1 3.9011230 +1 1.4442340 +1 0.0000 O -0.54190900 +1 0.8445890 +1 -5.6988360 +1 0.0000 O -5.38588200 +1 1.4008270 +1 1.2071470 +1 0.0000 O -5.47480700 +1 -2.9680980 +1 -6.1075470 +1 0.0000 O -0.45292100 +1 4.0152580 +1 4.0125860 +1 0.0000 O 0.45277000 +1 -2.3340520 +1 3.4561360 +1 0.0000 O 5.47477300 +1 1.2865390 +1 -1.3613710 +1 0.0000 O 4.13480100 +1 7.3059430 +1 -2.3687640 +1 0.0000 O 1.79296800 +1 -5.1392860 +1 -1.9636220 +1 0.0000 O -1.79289300 +1 3.2979800 +1 -5.5832960 +1 0.0000 O -4.13510100 +1 -0.1626770 +1 -0.6872670 +1 0.0000 O 1.17090100 +1 -0.6381480 +1 -4.1394660 +1 0.0000 O 3.41688200 +1 0.0358620 +1 -2.6899540 +1 0.0000 O 2.42190300 +1 -2.5325600 +1 -2.5755760 +1 0.0000 O -7.09879600 +1 1.0432400 +1 3.3290670 +1 0.0000 O 2.51113200 +1 -0.5204540 +1 3.6596060 +1 0.0000 O 3.50507400 +1 6.2311660 +1 -4.8213550 +1 0.0000 O 7.09915500 +1 -4.6631960 +1 1.4889540 +1 0.0000 O -2.51086100 +1 5.2660820 +1 5.3411930 +1 0.0000 O -3.50585800 +1 -2.7698490 +1 -0.0754120 +1 0.0000 O -1.17102800 +1 4.2588920 +1 -0.6782060 +1 0.0000 O -3.41701900 +1 -4.7820310 +1 -6.3099510 +1 0.0000 O -3.41695500 +1 4.3729230 +1 -3.1312880 +1 0.0000 Tv 0.00002400 +1 -5.3017690 +1 10.6034630 +1 Tv -0.00004200 +1 10.6033610 +1 5.3017210 +1 Tv 11.85489600 +1 0.0001710 +1 -0.0000300 +1

Optimized PM6 data set: MERS=(1,1,1) GNORM=5 Garnet Al 0.00250347 +1 0.0012894 +1 -0.0119000 +1 0.0000 Ca 0.00369411 +1 -1.9715614 +1 -2.6373223 +1 0.0000 Ca 1.47541961 +1 1.3083280 +1 -2.6392378 +1 0.0000 Ca 2.93837421 +1 -1.3193180 +1 -0.6630493 +1 0.0000 Ca 0.01349544 +1 4.5992755 +1 -2.6448109 +1 0.0000 Ca 4.40872403 +1 -1.3184719 +1 2.6213350 +1 0.0000 Ca -2.93742543 +1 -3.9396782 +1 -1.9866894 +1 0.0000 Ca 5.87165395 +1 0.6502386 +1 5.2518100 +1 0.0000 Ca -4.41167854 +1 -6.5614467 +1 -0.0133215 +1 0.0000 Ca -2.92368215 +1 6.5710033 +1 -3.3030531 +1 0.0000 Ca 5.87685086 +1 -3.2930655 +1 -0.0045377 +1 0.0000 Ca -1.46115130 +1 -3.9403945 +1 -5.2676690 +1 0.0000 Ca 2.95292084 +1 3.9314104 +1 -4.6107926 +1 0.0000 Ca 0.00147575 +1 1.9753868 +1 2.6105462 +1 0.0000 Ca -1.46531775 +1 -1.3105404 +1 2.6166811 +1 0.0000 Ca -2.93657628 +1 1.3157527 +1 0.6409333 +1 0.0000 Ca -0.00518007 +1 -4.5981040 +1 2.6189370 +1 0.0000 Ca -4.40063109 +1 1.3209160 +1 -2.6489069 +1 0.0000 Ca 2.94515662 +1 3.9381120 +1 1.9616405 +1 0.0000 Ca 5.88732383 +1 -0.6698500 +1 -5.2618073 +1 0.0000 Ca 4.41498135 +1 -3.9536737 +1 -5.2630150 +1 0.0000 Ca 2.95094180 +1 -1.3251076 +1 -7.2362426 +1 0.0000 Ca 5.88420172 +1 3.2733681 +1 -0.0078923 +1 0.0000 Ca 1.46462976 +1 -6.5732903 +1 -0.0069867 +1 0.0000 Ca -2.92543368 +1 1.3169505 +1 -5.9324625 +1 0.0000 Al 5.87705044 +1 -5.2656056 +1 -2.6308137 +1 0.0000 Al 0.01048303 +1 -2.6309207 +1 -7.8957378 +1 0.0000 Al 5.88991136 +1 2.6135047 +1 -5.2642158 +1 0.0000 Al 2.94653174 +1 -1.3222629 +1 -3.9488171 +1 0.0000 Al -2.92816361 +1 3.9444063 +1 -1.3305562 +1 0.0000 Al 2.93754355 +1 1.3095764 +1 3.9306918 +1 0.0000 Al -2.93924038 +1 -3.9347807 +1 1.2981502 +1 0.0000 Al 5.88812733 +1 -2.6398236 +1 -7.8872790 +1 0.0000 Al 0.01509065 +1 2.6240421 +1 -5.2681663 +1 0.0000 Al 5.87996229 +1 -0.0116275 +1 -0.0079665 +1 0.0000 Al 0.00159081 +1 -5.2540883 +1 -2.6378038 +1 0.0000 Al -2.93752487 +1 1.3161892 +1 3.9274859 +1 0.0000 Al 2.93348752 +1 -3.9434840 +1 1.3093063 +1 0.0000 Al -2.92931498 +1 -1.3082043 +1 -3.9527246 +1 0.0000 Al 2.94474519 +1 3.9301524 +1 -1.3219781 +1 0.0000 Si 0.01158035 +1 -0.6583243 +1 -5.2670473 +1 0.0000 Si 4.41424479 +1 1.3016559 +1 -2.6358278 +1 0.0000 Si 2.93980191 +1 -3.9451749 +1 -1.9768147 +1 0.0000 Si 0.00596487 +1 3.2858354 +1 -0.0139983 +1 0.0000 Si 1.46777883 +1 -1.3142240 +1 2.6186813 +1 0.0000 Si -2.93454420 +1 -1.3078162 +1 -0.6712075 +1 0.0000 Si -5.87213467 +1 1.9827325 +1 2.6051541 +1 0.0000 Si -1.46732158 +1 3.9430430 +1 5.2384234 +1 0.0000 Si -2.92201703 +1 3.9400702 +1 -4.6143961 +1 0.0000 Si 5.86826858 +1 -4.6051287 +1 2.6213550 +1 0.0000 Si -4.39824628 +1 -3.9347057 +1 -5.2719275 +1 0.0000 Si 2.95477474 +1 6.5563676 +1 -3.2968759 +1 0.0000 Si -0.00294034 +1 0.6610555 +1 5.2403380 +1 0.0000 Si -4.40607271 +1 -1.3066990 +1 2.6102803 +1 0.0000 Si -2.93293764 +1 3.9443975 +1 1.9524823 +1 0.0000 Si -0.00036442 +1 -3.2853632 +1 -0.0103792 +1 0.0000 Si -1.46133530 +1 1.3170491 +1 -2.6417258 +1 0.0000 Si 2.94264077 +1 1.3066070 +1 0.6472732 +1 0.0000 Si 5.88026760 +1 -1.9822952 +1 -2.6321866 +1 0.0000 Si 1.47636928 +1 -3.9448885 +1 -5.2643653 +1 0.0000 Si 2.95190018 +1 1.3043551 +1 -5.9207915 +1 0.0000 Si 5.88542205 +1 4.5854911 +1 -2.6363452 +1 0.0000 Si 4.40017274 +1 -6.5726594 +1 -0.0030401 +1 0.0000 Si -2.92326584 +1 -1.3095910 +1 -7.2368766 +1 0.0000 O 0.61977514 +1 -1.7696120 +1 -0.4243923 +1 0.0000 O 5.26942122 +1 4.0082729 +1 -4.1005776 +1 0.0000 O 6.49844057 +1 -3.4983966 +1 -2.2151251 +1 0.0000 O -0.62528058 +1 1.2400245 +1 6.7005675 +1 0.0000 O -0.41633788 +1 0.2367938 +1 -1.8704134 +1 0.0000 O -5.45808383 +1 -1.2739043 +1 3.9316982 +1 0.0000 O 5.45499265 +1 -5.5000586 +1 -0.7727650 +1 0.0000 O 0.42858525 +1 -3.9738453 +1 -6.5891042 +1 0.0000 O 1.77150755 +1 0.6495459 +1 -0.3775054 +1 0.0000 O 4.12369981 +1 2.5178963 +1 -6.0075878 +1 0.0000 O -4.10413005 +1 4.6089356 +1 2.9732417 +1 0.0000 O -1.75635589 +1 -2.5292947 +1 -7.1541227 +1 0.0000 O 4.71308945 +1 -2.0671751 +1 -3.8506451 +1 0.0000 O 2.52934297 +1 -2.6242301 +1 -5.2952909 +1 0.0000 O 3.56848153 +1 -0.1581490 +1 -5.3431091 +1 0.0000 O 1.16957793 +1 1.6817947 +1 4.5772150 +1 0.0000 O 3.35372940 +1 -7.3447829 +1 -1.0813675 +1 0.0000 O 2.32194027 +1 1.7254420 +1 2.1611140 +1 0.0000 O -1.17058391 +1 -3.1976150 +1 1.2049019 +1 0.0000 O -3.35663209 +1 -2.6307688 +1 2.6422182 +1 0.0000 O -2.30212073 +1 0.1493345 +1 -7.8200291 +1 0.0000 O 7.05626735 +1 3.5648438 +1 -1.9725608 +1 0.0000 O -2.51363420 +1 2.0856116 +1 -1.5662236 +1 0.0000 O -3.55167717 +1 3.5292684 +1 0.4356817 +1 0.0000 O 6.50714840 +1 6.1011449 +1 -3.0522311 +1 0.0000 O -0.62089324 +1 -3.8619097 +1 -1.4723879 +1 0.0000 O 0.61181571 +1 -0.8557323 +1 5.6568594 +1 0.0000 O 5.25656237 +1 -1.4039735 +1 -1.1721051 +1 0.0000 O 5.44868951 +1 -7.6478696 +1 0.7707289 +1 0.0000 O 0.42524385 +1 -3.9102873 +1 -3.9416537 +1 0.0000 O -0.40879466 +1 2.3929469 +1 -3.4100028 +1 0.0000 O -5.45236256 +1 -1.3331313 +1 1.2843232 +1 0.0000 O 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