Comparison of Structures of Crystalline Solids Predicted using PM6 with X-Ray (Home)

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76 Cinnabar (HgS)

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                      Unit Cell Parameters:       a      b      c   alpha   beta  gamma   Volume  Density
                                     X-Ray:     4.15   4.15   9.51  90.00  90.00  60.00    141.8   8.171
                                       PM6:     4.31   4.31   9.87  90.00  90.00  60.00    158.8   7.299
                 X-Ray                               PM6
 
  X-Ray data set:
 MERS=(3,3,2) 1SCF SYMMETRY
      Cinnabar
  h=-13.9 hr=crc05
 Hg              0.00000000 +0    0.0000000 +0    0.0000000 +0                  0.0000
  S              2.87281064 +1    0.0000000 +0    0.0000000 +0    1    0    0   0.0000
  S              2.87281064 +0  180.0000000 +1    0.0000000 +0    1    2    0   0.0000
 Hg              3.97362756 +1   86.4021016 +1    0.0000000 +1    1    2    3   0.0000
  S              2.87281064 +0   86.4021016 +0  180.0000000 +1    4    1    2   0.0000
 Hg              3.97362756 +0   93.5978984 +1  180.0000000 +0    1    2    4   0.0000
 Hg              2.87281064 +0   92.4874232 +1   46.3002199 +1    2    1    4   0.0000
  S              2.87281064 +0   92.4874232 +0  180.0000000 +0    7    2    1   0.0000
  S              2.87281064 +0   87.5125768 +1    0.0000000 +0    7    2    1   0.0000
 Hg              3.97362756 +0  133.7562442 +1  -92.6003553 +1    7    2    1   0.0000
  S              2.87281064 +0   86.4021016 +0   90.0000000 +1   10    7    2   0.0000
 Hg              2.87281064 +0   87.5125768 +0   87.3995602 +1    2    1    9   0.0000
 Hg              2.87281064 +0   92.4874232 +0 -180.0000000 +0    8    7    2   0.0000
  S              2.87281064 +0   92.4874232 +0  180.0000000 +0   13    8    7   0.0000
  S              2.87281064 +0   87.5125768 +0    0.0000000 +0   13    8    7   0.0000
 Hg              3.97362756 +0  133.7562442 +0  -92.6003553 +0   13    8    7   0.0000
  S              2.87281064 +0   86.4021016 +0   90.0000000 +0   16   13    8   0.0000
 Hg              2.87281064 +0   87.5125768 +0  -92.6003553 +0    8    7    2   0.0000
 Hg              2.87281064 +0   92.4874232 +0  -92.6003553 +0    2    1    9   0.0000
  S              2.87281064 +0   92.4874232 +0  180.0000000 +0   19    2    1   0.0000
  S              2.87281064 +0   87.5125768 +0    0.0000000 +0   19    2    1   0.0000
 Hg              3.97362756 +0  133.7562442 +0   92.6003553 +0   19    2    1   0.0000
  S              2.87281064 +0   86.4021016 +0  -90.0000000 +0   22   19    2   0.0000
 Hg              2.87281064 +0   87.5125768 +0  180.0000000 +0    2    1    9   0.0000
 Hg              2.87281064 +0   92.4874232 +0   87.3995602 +0    8    7    2   0.0000
  S              2.87281064 +0   92.4874232 +0  180.0000000 +0   25    8    7   0.0000
  S              2.87281064 +0   93.5978984 +0    0.0000000 +0    4    1    2   0.0000
 Hg              3.97362756 +0  133.7562442 +0   92.6003553 +0   25    8    7   0.0000
  S              2.87281064 +0   86.4021016 +0  -90.0000000 +0   28   25    8   0.0000
 Hg              2.87281064 +0  180.0000000 +0    0.0000000 +0    2    1    9   0.0000
 Hg              2.87281064 +0   92.4874232 +0   87.3995602 +0   14   13    8   0.0000
  S              2.87281064 +0   92.4874232 +0  180.0000000 +0   31   14   13   0.0000
  S              2.87281064 +0   93.5978984 +0  -90.0000000 +0   10    7    2   0.0000
 Hg              3.97362756 +0  133.7562442 +0   92.6003553 +0   31   14   13   0.0000
  S              2.87281064 +0   86.4021016 +0  -90.0000000 +0   34   31   14   0.0000
 Hg              2.87281064 +0  180.0000000 +0    0.0000000 +0    8    7    2   0.0000
 Hg              2.87281064 +0   92.4874232 +0  180.0000000 +0   20   19    2   0.0000
  S              2.87281064 +0   92.4874232 +0  180.0000000 +0   37   20   19   0.0000
  S              2.87281064 +0   87.5125768 +0    0.0000000 +0   37   20   19   0.0000
 Hg              3.97362756 +0  133.7562442 +0   92.6003553 +0   37   20   19   0.0000
  S              2.87281064 +0   86.4021016 +0  -90.0000000 +0   40   37   20   0.0000
 Hg              2.87281064 +0   87.5125768 +0   92.6003553 +0   20   19    2   0.0000
 Hg              2.87281064 +0   92.4874232 +0 -180.0000000 +0   26   25    8   0.0000
  S              2.87281064 +0   92.4874232 +0  180.0000000 +0   43   26   25   0.0000
  S              2.87281064 +0   93.5978984 +0   90.0000000 +0   22   19    2   0.0000
 Hg              3.97362756 +0  133.7562442 +0   92.6003553 +0   43   26   25   0.0000
  S              2.87281064 +0   86.4021016 +0  -90.0000000 +0   46   43   26   0.0000
 Hg              2.87281064 +0  180.0000000 +0    0.0000000 +0   20   19    2   0.0000
 Hg              2.87281064 +0   92.4874232 +0  180.0000000 +0   32   31   14   0.0000
  S              2.87281064 +0   92.4874232 +0  180.0000000 +0   49   32   31   0.0000
  S              2.87281064 +0   87.5125768 +0    0.0000000 +0   49   32   31   0.0000
 Hg              3.97362756 +0  133.7562442 +0   92.6003553 +0   49   32   31   0.0000
  S              2.87281064 +0   86.4021016 +0  -90.0000000 +0   52   49   32   0.0000
 Hg              2.87281064 +0  180.0000000 +0    0.0000000 +0   26   25    8   0.0000
 Hg              6.77764089 +1  122.2142203 +1    0.0000000 +0    6    1    2   0.0000
  S              2.87281064 +0  144.1878813 +1    0.0000000 +0   55    6    1   0.0000
  S              2.87281064 +0   35.8121187 +1 -180.0000000 +0   55    6    1   0.0000
 Hg              3.97362756 +0   86.4021016 +0  133.6997801 +1   30    2    7   0.0000
  S              2.87281064 +0   86.4021016 +0    0.0000000 +0    6    1    2   0.0000
 Hg              3.97362756 +0  122.2142203 +0 -180.0000000 +0   55    6    1   0.0000
 Hg              2.87281064 +0   92.4874232 +0   46.3002199 +0   56   55    6   0.0000
  S              2.87281064 +0   92.4874232 +0  180.0000000 +0   61   56   55   0.0000
  S              2.87281064 +0   87.5125768 +0    0.0000000 +0   61   56   55   0.0000
 Hg              3.97362756 +0   86.4021016 +0  133.6997801 +0   36    8   13   0.0000
  S              2.87281064 +0   87.5125768 +0  180.0000000 +0   12    2    1   0.0000
 Hg              2.87281064 +0   87.5125768 +0  133.6997801 +0   56   55    6   0.0000
 Hg              2.87281064 +0   92.4874232 +0 -180.0000000 +0   62   61   56   0.0000
  S              2.87281064 +0   92.4874232 +0  180.0000000 +0   67   62   61   0.0000
  S              2.87281064 +0   87.5125768 +0    0.0000000 +0   67   62   61   0.0000
 Hg              3.97362756 +0  133.7562442 +0  -92.6003553 +0   67   62   61   0.0000
  S              2.87281064 +0   87.5125768 +0  180.0000000 +0   18    8    7   0.0000
 Hg              2.87281064 +0   87.5125768 +0  -92.6003553 +0   62   61   56   0.0000
 Hg              2.87281064 +0   92.4874232 +0  -46.3002199 +0   56   55    6   0.0000
  S              2.87281064 +0   92.4874232 +0  180.0000000 +0   73   56   55   0.0000
  S              2.87281064 +0   87.5125768 +0    0.0000000 +0   73   56   55   0.0000
 Hg              3.97362756 +0   86.4021016 +0  133.6997801 +0   48   20   25   0.0000
  S              2.87281064 +0   87.5125768 +0  180.0000000 +0   24    2    1   0.0000
 Hg              2.87281064 +0   87.5125768 +0 -133.6997801 +0   56   55    6   0.0000
 Hg              2.87281064 +0   92.4874232 +0   87.3995602 +0   62   61   56   0.0000
  S              2.87281064 +0   92.4874232 +0  180.0000000 +0   79   62   61   0.0000
  S              2.87281064 +0   86.4021016 +0  180.0000000 +0   58   30    2   0.0000
 Hg              3.97362756 +0  133.7562442 +0   92.6003553 +0   79   62   61   0.0000
  S              2.87281064 +0  180.0000000 +0    0.0000000 +0   30    2    7   0.0000
 Hg              2.87281064 +0  180.0000000 +0    0.0000000 +0   56   55    6   0.0000
 Hg              2.87281064 +0   92.4874232 +0   87.3995602 +0   68   67   62   0.0000
  S              2.87281064 +0   92.4874232 +0  180.0000000 +0   85   68   67   0.0000
  S              2.87281064 +0   86.4021016 +0  180.0000000 +0   64   36    8   0.0000
 Hg              3.97362756 +0  133.7562442 +0   92.6003553 +0   85   68   67   0.0000
  S              2.87281064 +0  180.0000000 +0    0.0000000 +0   36    8   13   0.0000
 Hg              2.87281064 +0  180.0000000 +0    0.0000000 +0   62   61   56   0.0000
 Hg              2.87281064 +0   92.4874232 +0  180.0000000 +0   74   73   56   0.0000
  S              2.87281064 +0   92.4874232 +0  180.0000000 +0   91   74   73   0.0000
  S              2.87281064 +0   87.5125768 +0    0.0000000 +0   91   74   73   0.0000
 Hg              3.97362756 +0  133.7562442 +0   92.6003553 +0   91   74   73   0.0000
  S              2.87281064 +0   87.5125768 +0  180.0000000 +0   42   20   19   0.0000
 Hg              2.87281064 +0   87.5125768 +0   92.6003553 +0   74   73   56   0.0000
 Hg              2.87281064 +0   92.4874232 +0  180.0000000 +0   80   79   62   0.0000
  S              2.87281064 +0   92.4874232 +0  180.0000000 +0   97   80   79   0.0000
  S              2.87281064 +0   86.4021016 +0  180.0000000 +0   76   48   20   0.0000
 Hg              3.97362756 +0  133.7562442 +0   92.6003553 +0   97   80   79   0.0000
  S              2.87281064 +0  180.0000000 +0    0.0000000 +0   48   20   25   0.0000
 Hg              2.87281064 +0  180.0000000 +0    0.0000000 +0   74   73   56   0.0000
 Hg              2.87281064 +0   92.4874232 +0  180.0000000 +0   86   85   68   0.0000
  S              2.87281064 +0   92.4874232 +0  180.0000000 +0  103   86   85   0.0000
  S              2.87281064 +0   87.5125768 +0    0.0000000 +0  103   86   85   0.0000
 Hg              3.97362756 +0  133.7562442 +0   92.6003553 +0  103   86   85   0.0000
  S              2.87281064 +0  180.0000000 +0    0.0000000 +0   54   26   31   0.0000
 Hg              2.87281064 +0  180.0000000 +0    0.0000000 +0   80   79   62   0.0000
 Tv              2.87281064 +0   92.4874232 +0  180.0000000 +0   14   13    8
 Tv              2.87281064 +0   92.4874232 +0 -180.0000000 +0   38   37   20
 Tv              6.77764089 +0  122.2142203 +0  180.0000000 +0   60   55    6
 
  Optimized PM6 data set:
 MERS=(3,3,2) SYMMETRY
      Cinnabar
  h=-13.9 hr=crc05 Hg-S = 2.8728
 Hg         0.00000000 +0    0.0000000 +0    0.0000000 +0                      0.0000
  S         2.98286122 +1    0.0000000 +0    0.0000000 +0    1    0    0       0.0000
  S         2.98286122 +0  180.0000000 +1    0.0000000 +0    1    2    0       0.0000
 Hg         4.12584920 +1   86.4021016 +1    0.0000000 +1    1    2    3       0.0000
  S         2.98286122 +0   86.4021016 +0  180.0000000 +1    4    1    2       0.0000
 Hg         4.12584920 +0   93.5978984 +1  180.0000000 +0    1    2    4       0.0000
 Hg         2.98286122 +0   92.4874232 +1   46.3002199 +1    2    1    4       0.0000
  S         2.98286122 +0   92.4874232 +0  180.0000000 +0    7    2    1       0.0000
  S         2.98286122 +0   87.5125768 +1    0.0000000 +0    7    2    1       0.0000
 Hg         4.12584920 +0  133.7562442 +1  -92.6003553 +1    7    2    1       0.0000
  S         2.98286122 +0   86.4021016 +0   90.0000000 +1   10    7    2       0.0000
 Hg         2.98286122 +0   87.5125768 +0   87.3995602 +1    2    1    9       0.0000
 Hg         2.98286122 +0   92.4874232 +0 -180.0000000 +0    8    7    2       0.0000
  S         2.98286122 +0   92.4874232 +0  180.0000000 +0   13    8    7       0.0000
  S         2.98286122 +0   87.5125768 +0    0.0000000 +0   13    8    7       0.0000
 Hg         4.12584920 +0  133.7562442 +0  -92.6003553 +0   13    8    7       0.0000
  S         2.98286122 +0   86.4021016 +0   90.0000000 +0   16   13    8       0.0000
 Hg         2.98286122 +0   87.5125768 +0  -92.6003553 +0    8    7    2       0.0000
 Hg         2.98286122 +0   92.4874232 +0  -92.6003553 +0    2    1    9       0.0000
  S         2.98286122 +0   92.4874232 +0  180.0000000 +0   19    2    1       0.0000
  S         2.98286122 +0   87.5125768 +0    0.0000000 +0   19    2    1       0.0000
 Hg         4.12584920 +0  133.7562442 +0   92.6003553 +0   19    2    1       0.0000
  S         2.98286122 +0   86.4021016 +0  -90.0000000 +0   22   19    2       0.0000
 Hg         2.98286122 +0   87.5125768 +0  180.0000000 +0    2    1    9       0.0000
 Hg         2.98286122 +0   92.4874232 +0   87.3995602 +0    8    7    2       0.0000
  S         2.98286122 +0   92.4874232 +0  180.0000000 +0   25    8    7       0.0000
  S         2.98286122 +0   93.5978984 +0    0.0000000 +0    4    1    2       0.0000
 Hg         4.12584920 +0  133.7562442 +0   92.6003553 +0   25    8    7       0.0000
  S         2.98286122 +0   86.4021016 +0  -90.0000000 +0   28   25    8       0.0000
 Hg         2.98286122 +0  180.0000000 +0    0.0000000 +0    2    1    9       0.0000
 Hg         2.98286122 +0   92.4874232 +0   87.3995602 +0   14   13    8       0.0000
  S         2.98286122 +0   92.4874232 +0  180.0000000 +0   31   14   13       0.0000
  S         2.98286122 +0   93.5978984 +0  -90.0000000 +0   10    7    2       0.0000
 Hg         4.12584920 +0  133.7562442 +0   92.6003553 +0   31   14   13       0.0000
  S         2.98286122 +0   86.4021016 +0  -90.0000000 +0   34   31   14       0.0000
 Hg         2.98286122 +0  180.0000000 +0    0.0000000 +0    8    7    2       0.0000
 Hg         2.98286122 +0   92.4874232 +0  180.0000000 +0   20   19    2       0.0000
  S         2.98286122 +0   92.4874232 +0  180.0000000 +0   37   20   19       0.0000
  S         2.98286122 +0   87.5125768 +0    0.0000000 +0   37   20   19       0.0000
 Hg         4.12584920 +0  133.7562442 +0   92.6003553 +0   37   20   19       0.0000
  S         2.98286122 +0   86.4021016 +0  -90.0000000 +0   40   37   20       0.0000
 Hg         2.98286122 +0   87.5125768 +0   92.6003553 +0   20   19    2       0.0000
 Hg         2.98286122 +0   92.4874232 +0 -180.0000000 +0   26   25    8       0.0000
  S         2.98286122 +0   92.4874232 +0  180.0000000 +0   43   26   25       0.0000
  S         2.98286122 +0   93.5978984 +0   90.0000000 +0   22   19    2       0.0000
 Hg         4.12584920 +0  133.7562442 +0   92.6003553 +0   43   26   25       0.0000
  S         2.98286122 +0   86.4021016 +0  -90.0000000 +0   46   43   26       0.0000
 Hg         2.98286122 +0  180.0000000 +0    0.0000000 +0   20   19    2       0.0000
 Hg         2.98286122 +0   92.4874232 +0  180.0000000 +0   32   31   14       0.0000
  S         2.98286122 +0   92.4874232 +0  180.0000000 +0   49   32   31       0.0000
  S         2.98286122 +0   87.5125768 +0    0.0000000 +0   49   32   31       0.0000
 Hg         4.12584920 +0  133.7562442 +0   92.6003553 +0   49   32   31       0.0000
  S         2.98286122 +0   86.4021016 +0  -90.0000000 +0   52   49   32       0.0000
 Hg         2.98286122 +0  180.0000000 +0    0.0000000 +0   26   25    8       0.0000
 Hg         7.03727685 +1  122.2142203 +1    0.0000000 +0    6    1    2       0.0000
  S         2.98286122 +0  144.1878813 +1    0.0000000 +0   55    6    1       0.0000
  S         2.98286122 +0   35.8121187 +1 -180.0000000 +0   55    6    1       0.0000
 Hg         4.12584920 +0   86.4021016 +0  133.6997801 +1   30    2    7       0.0000
  S         2.98286122 +0   86.4021016 +0    0.0000000 +0    6    1    2       0.0000
 Hg         4.12584920 +0  122.2142203 +0 -180.0000000 +0   55    6    1       0.0000
 Hg         2.98286122 +0   92.4874232 +0   46.3002199 +0   56   55    6       0.0000
  S         2.98286122 +0   92.4874232 +0  180.0000000 +0   61   56   55       0.0000
  S         2.98286122 +0   87.5125768 +0    0.0000000 +0   61   56   55       0.0000
 Hg         4.12584920 +0   86.4021016 +0  133.6997801 +0   36    8   13       0.0000
  S         2.98286122 +0   87.5125768 +0  180.0000000 +0   12    2    1       0.0000
 Hg         2.98286122 +0   87.5125768 +0  133.6997801 +0   56   55    6       0.0000
 Hg         2.98286122 +0   92.4874232 +0 -180.0000000 +0   62   61   56       0.0000
  S         2.98286122 +0   92.4874232 +0  180.0000000 +0   67   62   61       0.0000
  S         2.98286122 +0   87.5125768 +0    0.0000000 +0   67   62   61       0.0000
 Hg         4.12584920 +0  133.7562442 +0  -92.6003553 +0   67   62   61       0.0000
  S         2.98286122 +0   87.5125768 +0  180.0000000 +0   18    8    7       0.0000
 Hg         2.98286122 +0   87.5125768 +0  -92.6003553 +0   62   61   56       0.0000
 Hg         2.98286122 +0   92.4874232 +0  -46.3002199 +0   56   55    6       0.0000
  S         2.98286122 +0   92.4874232 +0  180.0000000 +0   73   56   55       0.0000
  S         2.98286122 +0   87.5125768 +0    0.0000000 +0   73   56   55       0.0000
 Hg         4.12584920 +0   86.4021016 +0  133.6997801 +0   48   20   25       0.0000
  S         2.98286122 +0   87.5125768 +0  180.0000000 +0   24    2    1       0.0000
 Hg         2.98286122 +0   87.5125768 +0 -133.6997801 +0   56   55    6       0.0000
 Hg         2.98286122 +0   92.4874232 +0   87.3995602 +0   62   61   56       0.0000
  S         2.98286122 +0   92.4874232 +0  180.0000000 +0   79   62   61       0.0000
  S         2.98286122 +0   86.4021016 +0  180.0000000 +0   58   30    2       0.0000
 Hg         4.12584920 +0  133.7562442 +0   92.6003553 +0   79   62   61       0.0000
  S         2.98286122 +0  180.0000000 +0    0.0000000 +0   30    2    7       0.0000
 Hg         2.98286122 +0  180.0000000 +0    0.0000000 +0   56   55    6       0.0000
 Hg         2.98286122 +0   92.4874232 +0   87.3995602 +0   68   67   62       0.0000
  S         2.98286122 +0   92.4874232 +0  180.0000000 +0   85   68   67       0.0000
  S         2.98286122 +0   86.4021016 +0  180.0000000 +0   64   36    8       0.0000
 Hg         4.12584920 +0  133.7562442 +0   92.6003553 +0   85   68   67       0.0000
  S         2.98286122 +0  180.0000000 +0    0.0000000 +0   36    8   13       0.0000
 Hg         2.98286122 +0  180.0000000 +0    0.0000000 +0   62   61   56       0.0000
 Hg         2.98286122 +0   92.4874232 +0  180.0000000 +0   74   73   56       0.0000
  S         2.98286122 +0   92.4874232 +0  180.0000000 +0   91   74   73       0.0000
  S         2.98286122 +0   87.5125768 +0    0.0000000 +0   91   74   73       0.0000
 Hg         4.12584920 +0  133.7562442 +0   92.6003553 +0   91   74   73       0.0000
  S         2.98286122 +0   87.5125768 +0  180.0000000 +0   42   20   19       0.0000
 Hg         2.98286122 +0   87.5125768 +0   92.6003553 +0   74   73   56       0.0000
 Hg         2.98286122 +0   92.4874232 +0  180.0000000 +0   80   79   62       0.0000
  S         2.98286122 +0   92.4874232 +0  180.0000000 +0   97   80   79       0.0000
  S         2.98286122 +0   86.4021016 +0  180.0000000 +0   76   48   20       0.0000
 Hg         4.12584920 +0  133.7562442 +0   92.6003553 +0   97   80   79       0.0000
  S         2.98286122 +0  180.0000000 +0    0.0000000 +0   48   20   25       0.0000
 Hg         2.98286122 +0  180.0000000 +0    0.0000000 +0   74   73   56       0.0000
 Hg         2.98286122 +0   92.4874232 +0  180.0000000 +0   86   85   68       0.0000
  S         2.98286122 +0   92.4874232 +0  180.0000000 +0  103   86   85       0.0000
  S         2.98286122 +0   87.5125768 +0    0.0000000 +0  103   86   85       0.0000
 Hg         4.12584920 +0  133.7562442 +0   92.6003553 +0  103   86   85       0.0000
  S         2.98286122 +0  180.0000000 +0    0.0000000 +0   54   26   31       0.0000
 Hg         2.98286122 +0  180.0000000 +0    0.0000000 +0   80   79   62       0.0000
 Tv         2.98286122 +0   92.4874232 +0  180.0000000 +0   14   13    8
 Tv         2.98286122 +0   92.4874232 +0 -180.0000000 +0   38   37   20
 Tv         7.03727685 +0  122.2142203 +0  180.0000000 +0   60   55    6