Comparison of Structures of Crystalline Solids Predicted using PM6 with X-Ray (Home)

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72 Chlorite ((MgO)10(Al2O3)3(SiO2)4(H2O)9)

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Notes: This is a first attempt at modeling a very non-stoichiometric solid.
The formula for chlorite is not well defined. The formula used here is an
approximation to the true formula, but there are too many hydrogen atoms.
This is a consequence of the requirement that all atoms be oxidized properly.

The fault could likely be corrected by changing four magnesium atoms into aluminums.

                      Unit Cell Parameters:       a      b      c   alpha   beta  gamma   Volume  Density
                                     X-Ray:     5.32   9.23  14.36  89.36  97.35  90.02    699.7   2.638
                                       PM6:     5.45   9.39  14.16  89.29  97.22  89.15    719.3   2.566

                 X-Ray                               PM6

X-Ray data set: 1SCF MERS=(2,2,1) Chlorite Mg 0.00000000 +1 0.0000000 +1 0.0000000 +1 0.0000 Al 1.61600000 +1 11.5120000 +1 -2.5920000 +1 0.0000 Al 6.22800000 +1 11.5280000 +1 -5.2520000 +1 0.0000 Al 3.06400000 +1 2.7440000 +1 -3.5440000 +1 0.0000 Al -1.54400000 +1 2.7279990 +1 -0.8800000 +1 0.0000 Al 4.65200000 +1 7.1320000 +1 0.9240000 +1 0.0000 Al 0.03600000 +1 7.1199990 +1 -1.7360000 +1 0.0000 Mg 4.61200000 +1 0.0159990 +1 -2.6600000 +1 0.0000 Mg 1.60800000 +1 14.2439990 +1 -0.8200000 +1 0.0000 Mg 3.07200000 +1 0.0120000 +1 -5.3120000 +1 0.0000 Mg 6.14800000 +1 0.0200000 +1 -0.0080000 +1 0.0000 Mg 7.68800000 +1 0.0240000 +1 -2.6560000 +1 0.0000 Mg 1.57600000 +1 7.1200000 +1 0.9240000 +1 0.0000 Mg 7.72000000 +1 7.1440000 +1 -4.3960000 +1 0.0000 Mg 3.11200000 +1 7.1320000 +1 -1.7320000 +1 0.0000 Mg 6.18800000 +1 7.1400000 +1 -1.7440000 +1 0.0000 O 1.60800000 +1 13.1520000 +1 -2.5840000 +1 0.0000 O 6.22000000 +1 13.1680000 +1 -5.2480000 +1 0.0000 O 3.07200000 +1 1.1040000 +1 -3.5440000 +1 0.0000 O -1.54000000 +1 1.0880000 +1 -0.8840000 +1 0.0000 O 0.07600000 +1 13.1479990 +1 0.0800000 +1 0.0000 O 4.68800000 +1 13.1639990 +1 -2.5840000 +1 0.0000 O -0.00800100 +1 1.0920000 +1 -3.5480000 +1 0.0000 O 4.60400000 +1 1.1120000 +1 -6.2120000 +1 0.0000 O 3.15600000 +1 10.9280000 +1 -2.7840000 +1 0.0000 O -1.45600100 +1 10.9160000 +1 -0.1200000 +1 0.0000 O 1.52400000 +1 3.3280000 +1 -3.3480000 +1 0.0000 O 6.13600000 +1 3.3440000 +1 -6.0120000 +1 0.0000 O 1.01999900 +1 10.9200000 +1 -1.1600000 +1 0.0000 O 5.63200000 +1 10.9360000 +1 -3.8240000 +1 0.0000 O 3.66000000 +1 3.3359990 +1 -4.9720000 +1 0.0000 O -0.95200000 +1 3.3199990 +1 -2.3040000 +1 0.0000 O 0.67599900 +1 10.9280000 +1 -3.8240000 +1 0.0000 O 5.29200000 +1 10.9399990 +1 -1.1640000 +1 0.0000 O 4.00400000 +1 3.3280000 +1 -2.3040000 +1 0.0000 O -0.61200100 +1 3.3160000 +1 -4.9680000 +1 0.0000 O 3.14800000 +1 13.2120000 +1 0.0720000 +1 0.0000 O 7.76000000 +1 13.2320000 +1 -2.5880000 +1 0.0000 O 1.53600000 +1 1.0400000 +1 -0.8800000 +1 0.0000 O 6.14800000 +1 1.0559990 +1 -3.5440000 +1 0.0000 O 0.04000000 +1 6.1279990 +1 -0.0440000 +1 0.0000 O 4.65200000 +1 6.1440000 +1 -2.7040000 +1 0.0000 O 9.25599900 +1 8.1360000 +1 -3.4280000 +1 0.0000 O 4.64800000 +1 8.1239990 +1 -0.7680000 +1 0.0000 O 1.50800000 +1 6.1320000 +1 -2.5800000 +1 0.0000 O 3.17200000 +1 8.1200000 +1 -3.5480000 +1 0.0000 O 6.12400000 +1 6.1439990 +1 0.0800000 +1 0.0000 O 7.78800000 +1 8.1359990 +1 -0.8920000 +1 0.0000 O 3.18400000 +1 6.1360000 +1 0.0800000 +1 0.0000 O 1.50000000 +1 8.1120000 +1 -0.8880000 +1 0.0000 O 7.79600000 +1 6.1519990 +1 -2.5840000 +1 0.0000 O 6.11200000 +1 8.1320000 +1 -3.5520000 +1 0.0000 Si 0.08000000 +1 11.5080000 +1 0.0760000 +1 0.0000 Si 4.69200000 +1 11.5240000 +1 -2.5880000 +1 0.0000 Si -0.01200000 +1 2.7320000 +1 -3.5440000 +1 0.0000 Si 4.60000000 +1 2.7520000 +1 -6.2080000 +1 0.0000 H 3.26071300 +1 12.2732460 +1 0.1466930 +1 0.0000 H 7.70579800 +1 12.2911860 +1 -2.6103530 +1 0.0000 H 1.42821000 +1 1.9798350 +1 -0.8744440 +1 0.0000 H 6.32166300 +1 1.9853520 +1 -3.5074290 +1 0.0000 H 0.01663300 +1 5.1737050 +1 -0.0535790 +1 0.0000 H 4.67417000 +1 5.1940930 +1 -2.7167160 +1 0.0000 H 9.23308200 +1 9.0874050 +1 -3.4165920 +1 0.0000 H 4.67336500 +1 9.0772170 +1 -0.7576400 +1 0.0000 H 1.45477900 +1 5.1831570 +1 -2.5281400 +1 0.0000 H 3.21628400 +1 9.0673840 +1 -3.6119750 +1 0.0000 H 6.10039300 +1 5.1913570 +1 0.1161030 +1 0.0000 H 7.81594800 +1 9.0888390 +1 -0.9329170 +1 0.0000 H 3.22033700 +1 5.1838340 +1 0.1400050 +1 0.0000 H 1.44525700 +1 9.0646690 +1 -0.9419000 +1 0.0000 H 7.84447400 +1 5.1939440 +1 -2.5229120 +1 0.0000 H 6.07351800 +1 9.0892980 +1 -3.6108350 +1 0.0000 H 1.75428100 +1 14.1767780 +1 -2.4802570 +1 0.0000 H 3.24082500 +1 0.0708170 +1 -3.6241010 +1 0.0000 Mg 9.22800000 +1 0.0280000 +1 -0.0040000 +1 0.0000 Al 10.84400000 +1 11.5400000 +1 -2.5960000 +1 0.0000 Al 15.45600000 +1 11.5560000 +1 -5.2560000 +1 0.0000 Al 12.29200000 +1 2.7720000 +1 -3.5480000 +1 0.0000 Al 7.68400000 +1 2.7559990 +1 -0.8840000 +1 0.0000 Al 13.88000000 +1 7.1600000 +1 0.9200000 +1 0.0000 Al 9.26400000 +1 7.1479990 +1 -1.7400000 +1 0.0000 Mg 13.84000000 +1 0.0439990 +1 -2.6640000 +1 0.0000 Mg 10.83600000 +1 14.2719990 +1 -0.8240000 +1 0.0000 Mg 12.30000000 +1 0.0400000 +1 -5.3160000 +1 0.0000 Mg 15.37600000 +1 0.0480000 +1 -0.0120000 +1 0.0000 Mg 16.91600000 +1 0.0520000 +1 -2.6600000 +1 0.0000 Mg 10.80400000 +1 7.1480000 +1 0.9200000 +1 0.0000 Mg 16.94800000 +1 7.1720000 +1 -4.4000000 +1 0.0000 Mg 12.34000000 +1 7.1600000 +1 -1.7360000 +1 0.0000 Mg 15.41600000 +1 7.1680000 +1 -1.7480000 +1 0.0000 O 10.83600000 +1 13.1800000 +1 -2.5880000 +1 0.0000 O 15.44800000 +1 13.1960000 +1 -5.2520000 +1 0.0000 O 12.30000000 +1 1.1320000 +1 -3.5480000 +1 0.0000 O 7.68800000 +1 1.1160000 +1 -0.8880000 +1 0.0000 O 9.30400000 +1 13.1759990 +1 0.0760000 +1 0.0000 O 13.91600000 +1 13.1919990 +1 -2.5880000 +1 0.0000 O 9.21999900 +1 1.1200000 +1 -3.5520000 +1 0.0000 O 13.83200000 +1 1.1400000 +1 -6.2160000 +1 0.0000 O 12.38400000 +1 10.9560000 +1 -2.7880000 +1 0.0000 O 7.77199900 +1 10.9440000 +1 -0.1240000 +1 0.0000 O 10.75200000 +1 3.3560000 +1 -3.3520000 +1 0.0000 O 15.36400000 +1 3.3720000 +1 -6.0160000 +1 0.0000 O 10.24799900 +1 10.9480000 +1 -1.1640000 +1 0.0000 O 14.86000000 +1 10.9640000 +1 -3.8280000 +1 0.0000 O 12.88800000 +1 3.3639990 +1 -4.9760000 +1 0.0000 O 8.27600000 +1 3.3479990 +1 -2.3080000 +1 0.0000 O 9.90399900 +1 10.9560000 +1 -3.8280000 +1 0.0000 O 14.52000000 +1 10.9679990 +1 -1.1680000 +1 0.0000 O 13.23200000 +1 3.3560000 +1 -2.3080000 +1 0.0000 O 8.61599900 +1 3.3440000 +1 -4.9720000 +1 0.0000 O 12.37600000 +1 13.2400000 +1 0.0680000 +1 0.0000 O 16.98800000 +1 13.2600000 +1 -2.5920000 +1 0.0000 O 10.76400000 +1 1.0680000 +1 -0.8840000 +1 0.0000 O 15.37600000 +1 1.0839990 +1 -3.5480000 +1 0.0000 O 9.26800000 +1 6.1559990 +1 -0.0480000 +1 0.0000 O 13.88000000 +1 6.1720000 +1 -2.7080000 +1 0.0000 O 18.48399900 +1 8.1640000 +1 -3.4320000 +1 0.0000 O 13.87600000 +1 8.1519990 +1 -0.7720000 +1 0.0000 O 10.73600000 +1 6.1600000 +1 -2.5840000 +1 0.0000 O 12.40000000 +1 8.1480000 +1 -3.5520000 +1 0.0000 O 15.35200000 +1 6.1719990 +1 0.0760000 +1 0.0000 O 17.01600000 +1 8.1639990 +1 -0.8960000 +1 0.0000 O 12.41200000 +1 6.1640000 +1 0.0760000 +1 0.0000 O 10.72800000 +1 8.1400000 +1 -0.8920000 +1 0.0000 O 17.02400000 +1 6.1799990 +1 -2.5880000 +1 0.0000 O 15.34000000 +1 8.1600000 +1 -3.5560000 +1 0.0000 Si 9.30800000 +1 11.5360000 +1 0.0720000 +1 0.0000 Si 13.92000000 +1 11.5520000 +1 -2.5920000 +1 0.0000 Si 9.21600000 +1 2.7600000 +1 -3.5480000 +1 0.0000 Si 13.82800000 +1 2.7800000 +1 -6.2120000 +1 0.0000 H 12.48871300 +1 12.3012460 +1 0.1426930 +1 0.0000 H 16.93379800 +1 12.3191860 +1 -2.6143530 +1 0.0000 H 10.65621000 +1 2.0078350 +1 -0.8784440 +1 0.0000 H 15.54966300 +1 2.0133520 +1 -3.5114290 +1 0.0000 H 9.24463300 +1 5.2017050 +1 -0.0575790 +1 0.0000 H 13.90217000 +1 5.2220930 +1 -2.7207160 +1 0.0000 H 18.46108200 +1 9.1154050 +1 -3.4205920 +1 0.0000 H 13.90136500 +1 9.1052170 +1 -0.7616400 +1 0.0000 H 10.68277900 +1 5.2111570 +1 -2.5321400 +1 0.0000 H 12.44428400 +1 9.0953840 +1 -3.6159750 +1 0.0000 H 15.32839300 +1 5.2193570 +1 0.1121030 +1 0.0000 H 17.04394800 +1 9.1168390 +1 -0.9369170 +1 0.0000 H 12.44833700 +1 5.2118340 +1 0.1360050 +1 0.0000 H 10.67325700 +1 9.0926690 +1 -0.9459000 +1 0.0000 H 17.07247400 +1 5.2219440 +1 -2.5269120 +1 0.0000 H 15.30151800 +1 9.1172980 +1 -3.6148350 +1 0.0000 H 10.98228100 +1 14.2047780 +1 -2.4842570 +1 0.0000 H 12.46882500 +1 0.0988170 +1 -3.6281010 +1 0.0000 Mg -0.00400000 +1 0.0040000 +1 -5.3240000 +1 0.0000 Al 1.61200000 +1 11.5160000 +1 -7.9160000 +1 0.0000 Al 6.22400000 +1 11.5320000 +1 -10.5760000 +1 0.0000 Al 3.06000000 +1 2.7480000 +1 -8.8680000 +1 0.0000 Al -1.54800000 +1 2.7319990 +1 -6.2040000 +1 0.0000 Al 4.64800000 +1 7.1360000 +1 -4.4000000 +1 0.0000 Al 0.03200000 +1 7.1239990 +1 -7.0600000 +1 0.0000 Mg 4.60800000 +1 0.0199990 +1 -7.9840000 +1 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+1 -7.8509120 +1 0.0000 H 15.29751800 +1 9.1212980 +1 -8.9388350 +1 0.0000 H 10.97828100 +1 14.2087780 +1 -7.8082570 +1 0.0000 H 12.46482500 +1 0.1028170 +1 -8.9521010 +1 0.0000 Tv -0.00800000 +1 0.0080000 +1 -10.6480000 +1 Tv 18.45600000 +1 0.0560000 +1 -0.0080000 +1 Tv 0.07600000 +1 14.2400000 +1 1.8480000 +1

Optimized PM6 data set: MERS=(2,2,1) GNORM=10 Chlorite Mg -0.24920736 +1 0.1175731 +1 0.1090458 +1 0.0000 Al 1.38034551 +1 11.3490600 +1 -2.5326625 +1 0.0000 Al 6.19201970 +1 11.4498465 +1 -5.3012804 +1 0.0000 Al 2.83869581 +1 3.0631203 +1 -3.3249688 +1 0.0000 Al -1.76444162 +1 2.9558568 +1 -0.8203128 +1 0.0000 Al 4.57584383 +1 7.1885690 +1 1.1012870 +1 0.0000 Al -0.10888218 +1 7.4265042 +1 -1.6374860 +1 0.0000 Mg 4.66344697 +1 0.3154857 +1 -2.7119660 +1 0.0000 Mg 1.15907092 +1 14.1116187 +1 -0.7643979 +1 0.0000 Mg 3.09250601 +1 -0.4055421 +1 -5.8244422 +1 0.0000 Mg 5.98643790 +1 0.1834237 +1 0.1445622 +1 0.0000 Mg 7.60181560 +1 0.2521186 +1 -2.5223824 +1 0.0000 Mg 1.41714240 +1 7.0106901 +1 1.1120317 +1 0.0000 Mg 7.78613083 +1 6.8944387 +1 -4.3900447 +1 0.0000 Mg 3.02274918 +1 7.0272946 +1 -1.6447989 +1 0.0000 Mg 6.17769115 +1 7.0065679 +1 -1.6018316 +1 0.0000 O 1.56172771 +1 13.1490125 +1 -2.5816039 +1 0.0000 O 6.10499539 +1 13.2351651 +1 -5.2610635 +1 0.0000 O 2.81505506 +1 1.1758962 +1 -3.2331385 +1 0.0000 O -1.71533937 +1 1.1624293 +1 -0.8752862 +1 0.0000 O -0.21680393 +1 12.9814898 +1 0.1560618 +1 0.0000 O 4.54481391 +1 13.1072094 +1 -2.5329430 +1 0.0000 O -0.16617753 +1 1.3440679 +1 -3.5878442 +1 0.0000 O 4.32672061 +1 1.1516695 +1 -6.2946650 +1 0.0000 O 3.08282046 +1 10.8351993 +1 -3.0059375 +1 0.0000 O -1.66050045 +1 10.6882949 +1 -0.2501842 +1 0.0000 O 1.20340272 +1 3.6480278 +1 -3.0332866 +1 0.0000 O 5.89306933 +1 3.4206041 +1 -5.6611280 +1 0.0000 O 0.94268525 +1 10.7517291 +1 -0.8936609 +1 0.0000 O 5.62673763 +1 10.7977900 +1 -3.7060503 +1 0.0000 O 3.36995286 +1 3.3229388 +1 -5.0250062 +1 0.0000 O -1.29854250 +1 3.5929237 +1 -2.4409103 +1 0.0000 O 0.29088081 +1 10.7577910 +1 -3.8345532 +1 0.0000 O 4.87940587 +1 10.8817560 +1 -1.0865580 +1 0.0000 O 4.04661438 +1 3.5729370 +1 -2.1266584 +1 0.0000 O -0.56491721 +1 3.6442766 +1 -5.0041939 +1 0.0000 O 2.81074403 +1 12.2934846 +1 0.0438922 +1 0.0000 O 7.57604559 +1 13.1757336 +1 -2.4054131 +1 0.0000 O 1.51947281 +1 0.8121981 +1 -0.7981830 +1 0.0000 O 6.12957917 +1 1.3041731 +1 -3.5704947 +1 0.0000 O -0.07909142 +1 6.2425979 +1 -0.0431048 +1 0.0000 O 4.61441771 +1 6.2230341 +1 -2.6878094 +1 0.0000 O 9.27341222 +1 8.1171077 +1 -3.4369054 +1 0.0000 O 4.59415916 +1 8.0041860 +1 -0.6376850 +1 0.0000 O 1.30144332 +1 6.2993064 +1 -2.4501826 +1 0.0000 O 3.12914890 +1 8.0484305 +1 -3.4884139 +1 0.0000 O 5.97985340 +1 6.1287915 +1 0.2602084 +1 0.0000 O 7.76462025 +1 8.0680257 +1 -0.7156129 +1 0.0000 O 3.12936939 +1 6.2073962 +1 0.2495956 +1 0.0000 O 1.42373864 +1 8.0708628 +1 -0.7318716 +1 0.0000 O 7.91149281 +1 6.3145735 +1 -2.4399498 +1 0.0000 O 6.16774702 +1 7.9794644 +1 -3.4755079 +1 0.0000 Si -0.21440296 +1 11.3535367 +1 0.1648581 +1 0.0000 Si 4.57766836 +1 11.4307358 +1 -2.6238127 +1 0.0000 Si -0.22890739 +1 2.9772975 +1 -3.5389625 +1 0.0000 Si 4.45268685 +1 2.8163775 +1 -6.1382333 +1 0.0000 H 2.36254714 +1 11.4282697 +1 0.2995201 +1 0.0000 H 7.51828777 +1 12.2276012 +1 -2.3644308 +1 0.0000 H 1.64055595 +1 1.7639171 +1 -0.7661978 +1 0.0000 H 6.15734885 +1 2.2586165 +1 -3.5731135 +1 0.0000 H -0.02857922 +1 5.2756813 +1 -0.2059685 +1 0.0000 H 4.65823066 +1 5.2475374 +1 -2.7696997 +1 0.0000 H 9.17655357 +1 9.0899720 +1 -3.5846702 +1 0.0000 H 4.58409743 +1 8.9810970 +1 -0.6787104 +1 0.0000 H 1.10992055 +1 5.3340736 +1 -2.3755125 +1 0.0000 H 3.13436980 +1 9.0352579 +1 -3.4460084 +1 0.0000 H 5.81214186 +1 5.1517964 +1 0.2760103 +1 0.0000 H 7.69827912 +1 9.0494367 +1 -0.5832592 +1 0.0000 H 3.24367048 +1 5.2283553 +1 0.2290050 +1 0.0000 H 1.46324080 +1 9.0529573 +1 -0.6360814 +1 0.0000 H 8.09370128 +1 5.3470982 +1 -2.3118824 +1 0.0000 H 6.21282649 +1 8.9608211 +1 -3.4488429 +1 0.0000 H 2.70346553 +1 14.9845114 +1 -2.3355532 +1 0.0000 H 3.39882283 +1 -2.0693869 +1 -2.4530440 +1 0.0000 Mg 9.08893603 +1 0.0748677 +1 0.1697419 +1 0.0000 Al 10.80809825 +1 11.3944226 +1 -2.6185904 +1 0.0000 Al 15.54506045 +1 11.4986491 +1 -5.4223455 +1 0.0000 Al 12.13092076 +1 3.0825075 +1 -2.3549498 +1 0.0000 Al 7.61615710 +1 2.9781136 +1 -0.5727390 +1 0.0000 Al 13.95711998 +1 7.1662539 +1 1.0579523 +1 0.0000 Al 9.28883501 +1 7.5005088 +1 -1.6566021 +1 0.0000 Mg 14.12587497 +1 0.3892740 +1 -2.9307463 +1 0.0000 Mg 10.66865640 +1 14.1650146 +1 -0.8069473 +1 0.0000 Mg 12.40640255 +1 -0.1378764 +1 -5.7335914 +1 0.0000 Mg 15.43479878 +1 0.2068555 +1 -0.0658780 +1 0.0000 Mg 16.98922663 +1 0.2496317 +1 -2.7186904 +1 0.0000 Mg 10.81130408 +1 7.1624651 +1 1.0776870 +1 0.0000 Mg 17.16816644 +1 6.9714362 +1 -4.4403447 +1 0.0000 Mg 12.41183407 +1 6.9338057 +1 -1.6862690 +1 0.0000 Mg 15.55480152 +1 6.9708233 +1 -1.6596184 +1 0.0000 O 10.88234339 +1 13.2281229 +1 -2.6952044 +1 0.0000 O 15.49684101 +1 13.2841138 +1 -5.4419004 +1 0.0000 O 12.18146595 +1 1.3573374 +1 -3.2202461 +1 0.0000 O 7.61823543 +1 1.1857061 +1 -0.7048531 +1 0.0000 O 9.23700903 +1 13.0533393 +1 0.1412855 +1 0.0000 O 13.89496916 +1 13.1615184 +1 -2.6289281 +1 0.0000 O 9.20353737 +1 1.3447959 +1 -3.5529706 +1 0.0000 O 13.81454460 +1 1.1898930 +1 -6.4108241 +1 0.0000 O 12.46468254 +1 10.8651537 +1 -3.1026028 +1 0.0000 O 7.73643033 +1 10.7803981 +1 -0.2856458 +1 0.0000 O 10.63523166 +1 3.6891562 +1 -3.0235844 +1 0.0000 O 15.40143059 +1 3.5715558 +1 -5.9557094 +1 0.0000 O 10.35023673 +1 10.8527857 +1 -0.9622909 +1 0.0000 O 14.98121154 +1 10.8841842 +1 -3.8071675 +1 0.0000 O 12.67059761 +1 3.4585633 +1 -5.7573227 +1 0.0000 O 8.19562583 +1 3.5714735 +1 -2.1811882 +1 0.0000 O 9.67239875 +1 10.7884364 +1 -3.8731056 +1 0.0000 O 14.24971961 +1 10.9217219 +1 -1.1943862 +1 0.0000 O 13.90994946 +1 3.3559437 +1 -2.7354798 +1 0.0000 O 8.70961244 +1 3.6643052 +1 -4.7899698 +1 0.0000 O 12.15994748 +1 12.6210686 +1 -0.0151729 +1 0.0000 O 17.10634654 +1 13.3119687 +1 -2.6461422 +1 0.0000 O 10.78175325 +1 0.9217339 +1 -0.7572514 +1 0.0000 O 15.57804629 +1 1.3509785 +1 -3.8126252 +1 0.0000 O 9.33494015 +1 6.2925078 +1 -0.0625620 +1 0.0000 O 13.99896650 +1 6.1781306 +1 -2.7728158 +1 0.0000 O 18.67115636 +1 8.1459880 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