Comparison of Structures of Crystalline Solids Predicted using PM6 with X-Ray (Home)

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275 bis(Pyridinium) oxalate oxalic acid

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Notes: Two protons have transferred from one oxalate to the pyridines.
In this cluster, one oxalate has been cut in two, to give two [COO](-)
fragments. The fragments join up when the Periodic Boundary Conditions
are imposed.

                      Unit Cell Parameters:       a      b      c   alpha   beta  gamma   Volume  Density
                                     X-Ray:     4.00  11.32   8.44 102.04  97.31  88.64    370.5   1.516
                                       PM6:     4.12  11.39   7.77 102.05  99.75  91.01    350.7   1.602

                 X-Ray                               PM6

For X-Ray structure, contact the CCDC: http://www.ccdc.cam.ac.uk/

Optimized PM6 data set: MERS=(2,1,1) GNORM=5 Bis(Pyridinium) oxalate oxalic acid N 0.18164197 +1 -0.0566359 +1 -0.1331734 +1 0.0000 O 2.72676454 +1 5.1346088 +1 4.1016952 +1 0.0000 C 2.11325196 +1 4.0828316 +1 4.1522396 +1 0.0000 H 1.96236527 +1 4.0975880 +1 6.2230559 +1 0.0000 C 1.73103465 +1 3.2465478 +1 2.9064544 +1 0.0000 O 2.15296523 +1 3.8277181 +1 1.8012669 +1 0.0000 O 1.12489827 +1 2.1901605 +1 2.9357358 +1 0.0000 H 1.88556741 +1 3.2605963 +1 0.8478856 +1 0.0000 O 1.68945060 +1 3.5178956 +1 5.2616986 +1 0.0000 O 2.22314384 +1 4.9074903 +1 7.3493892 +1 0.0000 O 1.54995280 +1 3.2424601 +1 8.6758566 +1 0.0000 C 1.95229279 +1 4.4014931 +1 8.4864879 +1 0.0000 C 1.91512964 +1 2.9190727 +1 -1.4329678 +1 0.0000 O 1.60343262 +1 2.4397671 +1 -0.2986308 +1 0.0000 O 2.36111576 +1 4.0580300 +1 -1.6438905 +1 0.0000 N -1.60468459 +1 -3.0547311 +1 -3.7354681 +1 0.0000 C -1.10200850 +1 -3.6545282 +1 -4.8601848 +1 0.0000 C -0.37535316 +1 -2.9007816 +1 -5.7878467 +1 0.0000 C -0.15854683 +1 -1.5414429 +1 -5.5631749 +1 0.0000 C -0.64882392 +1 -0.9513281 +1 -4.3891200 +1 0.0000 C -1.38664251 +1 -1.7171331 +1 -3.4916732 +1 0.0000 H -2.17237933 +1 -3.6379844 +1 -3.0307659 +1 0.0000 H -1.31529014 +1 -4.7340121 +1 -5.0096127 +1 0.0000 H 0.02182508 +1 -3.3956591 +1 -6.6842155 +1 0.0000 H 0.38806178 +1 -0.9246631 +1 -6.3018696 +1 0.0000 H -0.45511126 +1 0.1090741 +1 -4.1743750 +1 0.0000 H -1.83795328 +1 -1.2718919 +1 -2.5857334 +1 0.0000 C -0.31324465 +1 0.5419500 +1 0.9960731 +1 0.0000 C -1.05854210 +1 -0.2056669 +1 1.9131062 +1 0.0000 C -1.28530223 +1 -1.5629575 +1 1.6820771 +1 0.0000 C -0.79603009 +1 -2.1531130 +1 0.5076708 +1 0.0000 C -0.05141641 +1 -1.3898939 +1 -0.3867594 +1 0.0000 H 0.76059418 +1 0.5243299 +1 -0.8293323 +1 0.0000 H -0.07818220 +1 1.6157249 +1 1.1556690 +1 0.0000 H -1.46563746 +1 0.2928173 +1 2.8029670 +1 0.0000 H -1.83933630 +1 -2.1781133 +1 2.4166804 +1 0.0000 H -1.00030408 +1 -3.2117760 +1 0.2874825 +1 0.0000 H 0.39465682 +1 -1.8332875 +1 -1.2966083 +1 0.0000 N -3.95274478 +1 -0.2329790 +1 0.0236885 +1 0.0000 O -1.35006181 +1 4.9169252 +1 4.2873553 +1 0.0000 C -1.98945809 +1 3.8801507 +1 4.3234607 +1 0.0000 H -2.15656964 +1 3.8960461 +1 6.3854420 +1 0.0000 C -2.37951405 +1 3.0486869 +1 3.0764665 +1 0.0000 O -1.97467684 +1 3.6314485 +1 1.9652629 +1 0.0000 O -2.97813268 +1 1.9883484 +1 3.1106083 +1 0.0000 H -2.25486184 +1 3.0585353 +1 1.0187948 +1 0.0000 O -2.44135828 +1 3.3251696 +1 5.4283903 +1 0.0000 O -1.88181236 +1 4.7113657 +1 7.5220119 +1 0.0000 O -2.56086123 +1 3.0400292 +1 8.8368021 +1 0.0000 C -2.15886875 +1 4.2008514 +1 8.6546077 +1 0.0000 C -2.20651815 +1 2.7053303 +1 -1.2511369 +1 0.0000 O -2.55446417 +1 2.2293918 +1 -0.1256586 +1 0.0000 O -1.73450526 +1 3.8388440 +1 -1.4389594 +1 0.0000 N -5.73403968 +1 -3.2438316 +1 -3.5656627 +1 0.0000 C -5.23367378 +1 -3.8521441 +1 -4.6872678 +1 0.0000 C -4.51365980 +1 -3.1065725 +1 -5.6275805 +1 0.0000 C -4.29473300 +1 -1.7458359 +1 -5.4150786 +1 0.0000 C -4.78516480 +1 -1.1454592 +1 -4.2457873 +1 0.0000 C -5.52296152 +1 -1.9013498 +1 -3.3400471 +1 0.0000 H -6.29804909 +1 -3.8209472 +1 -2.8555679 +1 0.0000 H -5.44100907 +1 -4.9346421 +1 -4.8239315 +1 0.0000 H -4.12065785 +1 -3.6089421 +1 -6.5213769 +1 0.0000 H -3.74610445 +1 -1.1351479 +1 -6.1578919 +1 0.0000 H -4.59137051 +1 -0.0827445 +1 -4.0432015 +1 0.0000 H -5.98070745 +1 -1.4442385 +1 -2.4420899 +1 0.0000 C -4.45236701 +1 0.3642881 +1 1.1512489 +1 0.0000 C -5.19569941 +1 -0.3862400 +1 2.0680196 +1 0.0000 C -5.41608876 +1 -1.7445359 +1 1.8377770 +1 0.0000 C -4.92639990 +1 -2.3317183 +1 0.6615289 +1 0.0000 C -4.18336420 +1 -1.5663409 +1 -0.2324018 +1 0.0000 H -3.37435232 +1 0.3494291 +1 -0.6727429 +1 0.0000 H -4.22385871 +1 1.4395565 +1 1.3102565 +1 0.0000 H -5.60519494 +1 0.1122178 +1 2.9572545 +1 0.0000 H -5.96662133 +1 -2.3608603 +1 2.5741208 +1 0.0000 H -5.12925257 +1 -3.3898042 +1 0.4368227 +1 0.0000 H -3.73846684 +1 -2.0058757 +1 -1.1439983 +1 0.0000 Tv -8.20974285 +1 -0.4091263 +1 0.4215622 +1 Tv -0.24715138 +1 -2.4554813 +1 -11.1217704 +1 Tv 0.93150299 +1 7.7171543 +1 -0.0618004 +1