Comparison of Structures of Crystalline Solids Predicted using PM6 with X-Ray (Home)

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52 Bertrandite ((BeO)4(SiO2)2(H2O)

                      Unit Cell Parameters:       a      b      c   alpha   beta  gamma   Volume  Density
                                     X-Ray:    15.27   4.57   8.71  90.00  90.00  90.00    607.8   2.604
                                       PM6:    16.26   4.92   8.75  90.05  90.03  90.02    700.1   2.260

                 X-Ray                               PM6

X-Ray data set: MERS=(1,3,2) 1SCF Bertrandite Si 0.00000000 +1 -15.2680000 +1 0.0000000 +1 0.0000 O 3.34900000 +1 -20.5030000 +1 1.6100000 +1 0.0000 O 4.08400000 +1 -17.9670000 +1 1.5860000 +1 0.0000 O -2.83300000 +1 -19.8670000 +1 -2.5690000 +1 0.0000 Si -1.30900000 +1 -19.4180000 +1 -2.2840000 +1 0.0000 O 4.05000000 +1 -19.2620000 +1 -0.7040000 +1 0.0000 Si 4.35700000 +1 -19.4180000 +1 2.2840000 +1 0.0000 Si 0.00000000 +1 -11.7839990 +1 2.2840000 +1 0.0000 O -1.00800000 +1 -12.8689990 +1 1.6100000 +1 0.0000 O -0.27300000 +1 -10.3330000 +1 1.5860000 +1 0.0000 O 1.52300000 +1 -12.2330000 +1 1.9990000 +1 0.0000 Si 3.04700100 +1 -11.7839990 +1 -2.2840000 +1 0.0000 O -0.30700000 +1 -11.6280000 +1 -0.7040000 +1 0.0000 Si -1.30900000 +1 -7.6340000 +1 0.0000000 +1 0.0000 O -0.30200000 +1 -21.8170000 +1 -0.6740000 +1 0.0000 O -1.03700000 +1 -9.0850000 +1 -0.6990000 +1 0.0000 O -2.83300000 +1 -7.1849990 +1 -0.2860000 +1 0.0000 Si 4.35700000 +1 -7.6340000 +1 0.0000000 +1 0.0000 O -1.00300000 +1 -7.7900000 +1 1.5800000 +1 0.0000 Si 3.04800000 +1 -15.2680000 +1 0.0000000 +1 0.0000 O 4.05500000 +1 -14.1830000 +1 -0.6740000 +1 0.0000 O 3.32100000 +1 -16.7190000 +1 -0.6990000 +1 0.0000 O 1.52400000 +1 -14.8190000 +1 -0.2860000 +1 0.0000 O 3.35500000 +1 -15.4240000 +1 1.5800000 +1 0.0000 O 3.34900000 +1 -21.8170000 +1 -0.6740000 +1 0.0000 O 4.08400000 +1 -9.0850000 +1 -0.6990000 +1 0.0000 O 4.05000000 +1 -7.7900000 +1 -2.9880000 +1 0.0000 O -1.00800000 +1 -14.1830000 +1 -0.6740000 +1 0.0000 O -0.27300000 +1 -16.7190000 +1 -0.6990000 +1 0.0000 O -0.30700000 +1 -15.4240000 +1 1.5800000 +1 0.0000 O -0.30200000 +1 -20.5030000 +1 -2.9580000 +1 0.0000 O -1.03700000 +1 -17.9670000 +1 -2.9820000 +1 0.0000 O -1.00300000 +1 -19.2620000 +1 -0.7040000 +1 0.0000 O 4.05500000 +1 -12.8689990 +1 -2.9580000 +1 0.0000 O 3.32100000 +1 -10.3330000 +1 -2.9820000 +1 0.0000 O 3.35500000 +1 -11.6280000 +1 -0.7040000 +1 0.0000 Be 3.02800000 +1 -20.3590000 +1 0.0100000 +1 0.0000 Be -1.32900000 +1 -12.7249990 +1 0.0100000 +1 0.0000 Be 0.02000000 +1 -21.9610000 +1 -2.2740000 +1 0.0000 Be 4.37700000 +1 -14.3270000 +1 -2.2740000 +1 0.0000 Be 3.02800000 +1 -21.9610000 +1 2.2940000 +1 0.0000 Be -1.32900000 +1 -14.3270000 +1 -2.2740000 +1 0.0000 Be 0.02000000 +1 -20.3590000 +1 0.0100000 +1 0.0000 Be 4.37700000 +1 -12.7249990 +1 0.0100000 +1 0.0000 Be 4.36800000 +1 -17.7980000 +1 -0.0150000 +1 0.0000 Be 0.01100000 +1 -10.1640000 +1 -0.0150000 +1 0.0000 Be -1.32100000 +1 -9.2540000 +1 2.2700000 +1 0.0000 Be 3.03700000 +1 -16.8880000 +1 -2.2980000 +1 0.0000 Be 4.36800000 +1 -9.2540000 +1 -2.2980000 +1 0.0000 Be 0.01100000 +1 -16.8880000 +1 -2.2980000 +1 0.0000 Be -1.32100000 +1 -17.7980000 +1 -0.0150000 +1 0.0000 Be 3.03700000 +1 -10.1640000 +1 -0.0150000 +1 0.0000 H 1.52400000 +1 -18.0970000 +1 -3.3520000 +1 0.0000 O 1.52400000 +1 -17.4240000 +1 -2.5870000 +1 0.0000 H -2.83300000 +1 -10.4630000 +1 1.2160000 +1 0.0000 O -2.83300000 +1 -9.7900000 +1 1.9810000 +1 0.0000 H 1.52400000 +1 -8.9550000 +1 -1.0680000 +1 0.0000 O 1.52400000 +1 -9.6280000 +1 -0.3030000 +1 0.0000 H -2.83300000 +1 -16.5890000 +1 -1.0680000 +1 0.0000 O -2.83300000 +1 -17.2620000 +1 -0.3030000 +1 0.0000 H -2.83300000 +1 -15.5490000 +1 -3.2030000 +1 0.0000 O -2.83300000 +1 -14.8630000 +1 -2.5410000 +1 0.0000 H 1.52400000 +1 -23.1830000 +1 -3.2030000 +1 0.0000 O 1.52400000 +1 -22.4970000 +1 -2.5410000 +1 0.0000 H -2.83300000 +1 -11.5030000 +1 -0.9190000 +1 0.0000 O -2.83300000 +1 -12.1890000 +1 -0.2570000 +1 0.0000 H 1.52400000 +1 -19.1370000 +1 -0.9190000 +1 0.0000 O 1.52400000 +1 -19.8230000 +1 -0.2570000 +1 0.0000 Si 0.00000000 +1 -15.2680000 +1 -4.5680000 +1 0.0000 O 3.34900000 +1 -20.5030000 +1 -2.9580000 +1 0.0000 O 4.08400000 +1 -17.9670000 +1 -2.9820000 +1 0.0000 O -2.83300000 +1 -19.8670000 +1 -7.1370000 +1 0.0000 Si -1.30900000 +1 -19.4180000 +1 -6.8520000 +1 0.0000 O 4.05000000 +1 -19.2620000 +1 -5.2720000 +1 0.0000 Si 4.35700000 +1 -19.4180000 +1 -2.2840000 +1 0.0000 Si 0.00000000 +1 -11.7839990 +1 -2.2840000 +1 0.0000 O -1.00800000 +1 -12.8689990 +1 -2.9580000 +1 0.0000 O -0.27300000 +1 -10.3330000 +1 -2.9820000 +1 0.0000 O 1.52300000 +1 -12.2330000 +1 -2.5690000 +1 0.0000 Si 3.04700100 +1 -11.7839990 +1 -6.8520000 +1 0.0000 O -0.30700000 +1 -11.6280000 +1 -5.2720000 +1 0.0000 Si -1.30900000 +1 -7.6340000 +1 -4.5680000 +1 0.0000 O -0.30200000 +1 -21.8170000 +1 -5.2420000 +1 0.0000 O -1.03700000 +1 -9.0850000 +1 -5.2670000 +1 0.0000 O -2.83300000 +1 -7.1849990 +1 -4.8540000 +1 0.0000 Si 4.35700000 +1 -7.6340000 +1 -4.5680000 +1 0.0000 O -1.00300000 +1 -7.7900000 +1 -2.9880000 +1 0.0000 Si 3.04800000 +1 -15.2680000 +1 -4.5680000 +1 0.0000 O 4.05500000 +1 -14.1830000 +1 -5.2420000 +1 0.0000 O 3.32100000 +1 -16.7190000 +1 -5.2670000 +1 0.0000 O 1.52400000 +1 -14.8190000 +1 -4.8540000 +1 0.0000 O 3.35500000 +1 -15.4240000 +1 -2.9880000 +1 0.0000 O 3.34900000 +1 -21.8170000 +1 -5.2420000 +1 0.0000 O 4.08400000 +1 -9.0850000 +1 -5.2670000 +1 0.0000 O 4.05000000 +1 -7.7900000 +1 -7.5560000 +1 0.0000 O -1.00800000 +1 -14.1830000 +1 -5.2420000 +1 0.0000 O -0.27300000 +1 -16.7190000 +1 -5.2670000 +1 0.0000 O -0.30700000 +1 -15.4240000 +1 -2.9880000 +1 0.0000 O -0.30200000 +1 -20.5030000 +1 -7.5260000 +1 0.0000 O -1.03700000 +1 -17.9670000 +1 -7.5500000 +1 0.0000 O -1.00300000 +1 -19.2620000 +1 -5.2720000 +1 0.0000 O 4.05500000 +1 -12.8689990 +1 -7.5260000 +1 0.0000 O 3.32100000 +1 -10.3330000 +1 -7.5500000 +1 0.0000 O 3.35500000 +1 -11.6280000 +1 -5.2720000 +1 0.0000 Be 3.02800000 +1 -20.3590000 +1 -4.5580000 +1 0.0000 Be -1.32900000 +1 -12.7249990 +1 -4.5580000 +1 0.0000 Be 0.02000000 +1 -21.9610000 +1 -6.8420000 +1 0.0000 Be 4.37700000 +1 -14.3270000 +1 -6.8420000 +1 0.0000 Be 3.02800000 +1 -21.9610000 +1 -2.2740000 +1 0.0000 Be -1.32900000 +1 -14.3270000 +1 -6.8420000 +1 0.0000 Be 0.02000000 +1 -20.3590000 +1 -4.5580000 +1 0.0000 Be 4.37700000 +1 -12.7249990 +1 -4.5580000 +1 0.0000 Be 4.36800000 +1 -17.7980000 +1 -4.5830000 +1 0.0000 Be 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Optimized PM6 data set: MERS=(1,3,2) GNORM=5 Bertrandite Si -0.08400628 +1 -15.3199096 +1 0.3387463 +1 0.0000 O 3.36397332 +1 -20.9159806 +1 2.0367427 +1 0.0000 O 3.90768405 +1 -18.2308022 +1 1.9930207 +1 0.0000 O -2.86564223 +1 -20.0416757 +1 -2.2827529 +1 0.0000 Si -1.28088837 +1 -19.7009509 +1 -2.1270464 +1 0.0000 O 3.85532384 +1 -19.5060614 +1 -0.4861987 +1 0.0000 Si 4.29148793 +1 -19.6969839 +1 2.7998743 +1 0.0000 Si -0.08696534 +1 -11.5891457 +1 2.7979770 +1 0.0000 O -1.03090408 +1 -12.8002957 +1 2.0386027 +1 0.0000 O -0.46771670 +1 -10.1217740 +1 1.9919304 +1 0.0000 O 1.49920378 +1 -11.9337825 +1 2.6495359 +1 0.0000 Si 3.08954478 +1 -11.5801030 +1 -2.1148720 +1 0.0000 O -0.52470303 +1 -11.3941936 +1 -0.4871657 +1 0.0000 Si -1.28587847 +1 -7.1981454 +1 0.3409969 +1 0.0000 O -0.34735692 +1 -22.2336753 +1 -0.4267003 +1 0.0000 O -0.89909802 +1 -8.6623486 +1 -0.4682496 +1 0.0000 O -2.87479719 +1 -6.8741140 +1 0.1903085 +1 0.0000 Si 4.28680518 +1 -7.1925360 +1 0.3487131 +1 0.0000 O -0.84687164 +1 -7.3878247 +1 1.9776541 +1 0.0000 Si 3.08734746 +1 -15.3128570 +1 0.3431051 +1 0.0000 O 4.03260563 +1 -14.1031115 +1 -0.4134486 +1 0.0000 O 3.46921493 +1 -16.7786381 +1 -0.4644254 +1 0.0000 O 1.50242859 +1 -14.9683093 +1 0.1889928 +1 0.0000 O 3.52500836 +1 -15.5064535 +1 1.9799073 +1 0.0000 O 3.36652482 +1 -22.2320336 +1 -0.4225979 +1 0.0000 O 3.90568940 +1 -8.6588944 +1 -0.4592230 +1 0.0000 O 3.84895586 +1 -7.3785041 +1 -2.9361587 +1 0.0000 O -1.02771534 +1 -14.1120791 +1 -0.4212622 +1 0.0000 O -0.46020841 +1 -16.7864392 +1 -0.4684598 +1 0.0000 O -0.52464843 +1 -15.5127705 +1 1.9736677 +1 0.0000 O -0.34508452 +1 -20.9153538 +1 -2.8865131 +1 0.0000 O -0.89978634 +1 -18.2336491 +1 -2.9320439 +1 0.0000 O -0.84314118 +1 -19.5131255 +1 -0.4894075 +1 0.0000 O 4.03536015 +1 -12.7894729 +1 -2.8720557 +1 0.0000 O 3.47061106 +1 -10.1115210 +1 -2.9190794 +1 0.0000 O 3.52885504 +1 -11.3893066 +1 -0.4784015 +1 0.0000 Be 2.96992305 +1 -20.7774097 +1 0.3656986 +1 0.0000 Be -1.41787139 +1 -12.6580302 +1 0.3663536 +1 0.0000 Be 0.04798568 +1 -22.3683098 +1 -2.0969600 +1 0.0000 Be 4.42519277 +1 -14.2448929 +1 -2.0848469 +1 0.0000 Be 2.97294543 +1 -22.3708144 +1 2.8278756 +1 0.0000 Be -1.41523091 +1 -14.2503910 +1 -2.0926152 +1 0.0000 Be 0.04349634 +1 -20.7805034 +1 0.3651960 +1 0.0000 Be 4.42156336 +1 -12.6500759 +1 0.3775333 +1 0.0000 Be 4.30491254 +1 -18.0601968 +1 0.3381070 +1 0.0000 Be -0.07390035 +1 -9.9505585 +1 0.3371605 +1 0.0000 Be -1.30148068 +1 -8.8366010 +1 2.7972532 +1 0.0000 Be 3.08022804 +1 -16.9468212 +1 -2.1207290 +1 0.0000 Be 4.30236268 +1 -8.8266114 +1 -2.1147105 +1 0.0000 Be -0.06883840 +1 -16.9520039 +1 -2.1248127 +1 0.0000 Be -1.29663491 +1 -18.0694403 +1 0.3336335 +1 0.0000 Be 3.07666248 +1 -9.9462586 +1 0.3455770 +1 0.0000 H 1.50851683 +1 -18.2846710 +1 -2.8472989 +1 0.0000 O 1.50637320 +1 -17.4487374 +1 -2.3236532 +1 0.0000 H -2.87499033 +1 -10.1748059 +1 2.0787544 +1 0.0000 O -2.87548698 +1 -9.3362637 +1 2.5987286 +1 0.0000 H 1.50233870 +1 -8.6304267 +1 -0.4077807 +1 0.0000 O 1.50160589 +1 -9.4553911 +1 0.1350241 +1 0.0000 H -2.87123397 +1 -16.7315338 +1 -0.3841094 +1 0.0000 O -2.86979765 +1 -17.5721928 +1 0.1334777 +1 0.0000 H -2.86717885 +1 -15.7579406 +1 -2.7904162 +1 0.0000 O -2.86814262 +1 -14.9031513 +1 -2.3066830 +1 0.0000 H 1.51396559 +1 -23.8391342 +1 -2.8219086 +1 0.0000 O 1.51259201 +1 -22.9953678 +1 -2.3177250 +1 0.0000 H -2.87667596 +1 -11.1610754 +1 -0.3360579 +1 0.0000 O -2.87430515 +1 -12.0139187 +1 0.1504218 +1 0.0000 H 1.50541991 +1 -19.2828489 +1 -0.3242583 +1 0.0000 O 1.50622507 +1 -20.1413814 +1 0.1558925 +1 0.0000 Si -0.07894183 +1 -15.3124440 +1 -4.5819251 +1 0.0000 O 3.36647151 +1 -20.9104782 +1 -2.8829215 +1 0.0000 O 3.91497911 +1 -18.2273941 +1 -2.9272304 +1 0.0000 O -2.86327726 +1 -20.0368674 +1 -7.1974074 +1 0.0000 Si -1.27912585 +1 -19.6962949 +1 -7.0456979 +1 0.0000 O 3.85806943 +1 -19.4993616 +1 -5.4054736 +1 0.0000 Si 4.29815100 +1 -19.6938057 +1 -2.1218967 +1 0.0000 Si -0.07894166 +1 -11.5855520 +1 -2.1219861 +1 0.0000 O -1.02561428 +1 -12.7942940 +1 -2.8803616 +1 0.0000 O -0.46231827 +1 -10.1168869 +1 -2.9272909 +1 0.0000 O 1.50513014 +1 -11.9289600 +1 -2.2703172 +1 0.0000 Si 3.09136237 +1 -11.5743218 +1 -7.0331814 +1 0.0000 O -0.52146170 +1 -11.3877116 +1 -5.4051729 +1 0.0000 Si -1.28359394 +1 -7.1921662 +1 -4.5785574 +1 0.0000 O -0.34342985 +1 -22.2293807 +1 -5.3463077 +1 0.0000 O -0.89825127 +1 -8.6576742 +1 -5.3873099 +1 0.0000 O -2.87159056 +1 -6.8633739 +1 -4.7284385 +1 0.0000 Si 4.29005274 +1 -7.1852522 +1 -4.5712277 +1 0.0000 O -0.84337038 +1 -7.3834729 +1 -2.9426887 +1 0.0000 Si 3.08923039 +1 -15.3073545 +1 -4.5765746 +1 0.0000 O 4.03485354 +1 -14.0976271 +1 -5.3326772 +1 0.0000 O 3.47044676 +1 -16.7730634 +1 -5.3843075 +1 0.0000 O 1.50508863 +1 -14.9587982 +1 -4.7303658 +1 0.0000 O 3.52887904 +1 -15.5021735 +1 -2.9411994 +1 0.0000 O 3.36836260 +1 -22.2262305 +1 -5.3411627 +1 0.0000 O 3.90923702 +1 -8.6520745 +1 -5.3787431 +1 0.0000 O 3.84995371 +1 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