Comparison of Structures of Crystalline Solids Predicted using PM6 with X-Ray (Home)

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40 Aquamarine ((NaOH)(Al2O3)(BeO)3(SiO2)6)

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                      Unit Cell Parameters:       a      b      c   alpha   beta  gamma   Volume  Density
                                     X-Ray:     9.29   9.29   9.19  90.00  90.00  60.00    687.4   2.790
                                       PM6:     9.45   9.67   9.03  90.00  88.99  59.12    708.1   2.709
                 X-Ray                               PM6
 
  X-Ray data set:
 T=5D 1SCF MERS=(1,1,1)
      Aquamarine

 Na              0.00000000 +1    0.0000000 +1    0.0000000 +1                  0.0000
 Al              4.64600000 +1    2.6820000 +1    2.2980000 +1                  0.0000
  O              1.76300000 +1    1.8490000 +1    0.0000000 +1                  0.0000
  O              3.93700000 +1    1.1390000 +1    1.3330000 +1                  0.0000
  O             -2.95500000 +1    2.8410000 +1    1.3330000 +1                  0.0000
  O             -0.98300000 +1   -3.9790000 +1    1.3330000 +1                  0.0000
  O              3.93700000 +1    1.1390000 +1   -1.3330000 +1                  0.0000
  O              2.48300000 +1   -0.6020000 +1    0.0000000 +1                  0.0000
 Si              0.74700000 +1    3.1010000 +1    0.0000000 +1                  0.0000
  O              0.98300000 +1   -3.9790000 +1    3.2640000 +1                  0.0000
  O             -3.93700000 +1    1.1390000 +1    3.2640000 +1                  0.0000
  O              2.95500000 +1    2.8410000 +1    3.2640000 +1                  0.0000
 Si             -2.31200000 +1    2.1980000 +1    0.0000000 +1                  0.0000
  O             -2.48300000 +1    0.6020000 +1    0.0000000 +1                  0.0000
  O             -2.95500000 +1    2.8410000 +1   -1.3330000 +1                  0.0000
  O             -0.72000100 +1    2.4510000 +1    0.0000000 +1                  0.0000
 Si             -3.05900000 +1   -0.9030000 +1    0.0000000 +1                  0.0000
 Si             -0.74700000 +1   -3.1010000 +1    0.0000000 +1                  0.0000
  O              0.72000000 +1   -2.4510000 +1    0.0000000 +1                  0.0000
  O             -0.98300000 +1   -3.9790000 +1   -1.3330000 +1                  0.0000
  O             -1.76300000 +1   -1.8490000 +1    0.0000000 +1                  0.0000
 Si              2.31200000 +1   -2.1980000 +1    0.0000000 +1                  0.0000
 Al             -4.64600000 +1   -2.6830000 +1   -2.2980000 +1                  0.0000
  O              2.95500000 +1   -2.8410000 +1   -1.3330000 +1                  0.0000
  O             -0.98300000 +1    3.9790000 +1   -3.2640000 +1                  0.0000
  O              3.93700000 +1   -1.1390000 +1   -3.2640000 +1                  0.0000
  O              2.95500000 +1   -2.8410000 +1    1.3330000 +1                  0.0000
  O              0.98300000 +1    3.9790000 +1   -1.3330000 +1                  0.0000
  O             -3.93700000 +1   -1.1390000 +1   -1.3330000 +1                  0.0000
  O             -2.95500000 +1   -2.8410000 +1   -3.2640000 +1                  0.0000
  O              0.98300000 +1    3.9790000 +1    1.3330000 +1                  0.0000
  O             -3.93700000 +1   -1.1390000 +1    1.3330000 +1                  0.0000
 Si              3.05900000 +1    0.9030000 +1    0.0000000 +1                  0.0000
 Al              4.64600000 +1    2.6820000 +1   -2.2980000 +1                  0.0000
  O              0.98300000 +1   -3.9790000 +1   -3.2640000 +1                  0.0000
  O             -3.93700000 +1    1.1390000 +1   -3.2640000 +1                  0.0000
  O              2.95500000 +1    2.8410000 +1   -3.2640000 +1                  0.0000
 Al             -4.64600000 +1   -2.6830000 +1    2.2980000 +1                  0.0000
  O             -0.98300000 +1    3.9790000 +1    3.2640000 +1                  0.0000
  O              3.93700000 +1   -1.1390000 +1    3.2640000 +1                  0.0000
  O             -2.95500000 +1   -2.8410000 +1    3.2640000 +1                  0.0000
 Si             -0.74700000 +1    3.1010000 +1   -4.5960000 +1                  0.0000
  O              0.72000000 +1    2.4510000 +1   -4.5960000 +1                  0.0000
  O             -1.76300000 +1    1.8490000 +1   -4.5960000 +1                  0.0000
 Si              2.31200000 +1    2.1980000 +1   -4.5960000 +1                  0.0000
 Si              3.05900000 +1   -0.9030000 +1   -4.5960000 +1                  0.0000
  O              1.76300000 +1   -1.8490000 +1   -4.5960000 +1                  0.0000
  O              2.48300000 +1    0.6020000 +1   -4.5960000 +1                  0.0000
 Si              0.74700000 +1   -3.1010000 +1   -4.5960000 +1                  0.0000
 Si             -2.31200000 +1   -2.1980000 +1   -4.5960000 +1                  0.0000
  O             -2.48300000 +1   -0.6020000 +1   -4.5960000 +1                  0.0000
  O             -0.72000000 +1   -2.4510000 +1   -4.5960000 +1                  0.0000
 Si             -3.05900000 +1    0.9030000 +1   -4.5960000 +1                  0.0000
 Be             -4.64600000 +1    0.0000000 +1    2.2980000 +1                  0.0000
 Be              2.32300000 +1   -4.0230000 +1    2.2980000 +1                  0.0000
 Be             -2.32300000 +1   -4.0230000 +1    2.2980000 +1                  0.0000
 Be             -4.64600000 +1    0.0000000 +1   -2.2980000 +1                  0.0000
 Be              2.32300000 +1   -4.0230000 +1   -2.2980000 +1                  0.0000
 Be             -2.32300000 +1   -4.0230000 +1   -2.2980000 +1                  0.0000
  O              0.00000000 +1    0.0000000 +1    2.2980000 +1                  0.0000
  O              0.00000000 +1    0.0000000 +1   -2.2980000 +1                  0.0000
 Na              0.00000000 +1    0.0000000 +1   -4.5960000 +1                  0.0000
  H              1.04000000 +1    0.0000000 +1    2.2980000 +1                  0.0000
  H              1.04000000 +1    0.0000000 +1   -2.2980000 +1                  0.0000
 Tv              9.29200000 +1    0.0000000 +1    0.0000000 +1 
 Tv              4.64600000 +1    8.0470000 +1    0.0000000 +1 
 Tv              0.00000000 +1    0.0000000 +1   -9.1930000 +1 
 
  Optimized PM6 data set:
T=5D MERS=(1,1,1) GNORM=5
      Aquamarine

 Na        -0.68504552 +1   -0.4791575 +1    2.1263810 +1                      0.0000
 Al         4.66383701 +1    2.9822085 +1    2.1860535 +1                      0.0000
  O         1.66996216 +1    2.2089193 +1   -0.0462844 +1                      0.0000
  O         4.03219920 +1    1.4441349 +1    1.2560998 +1                      0.0000
  O        -3.08502810 +1    2.8916215 +1    1.2755160 +1                      0.0000
  O        -1.16444147 +1   -4.0334985 +1    1.3154161 +1                      0.0000
  O         3.91907986 +1    1.3050465 +1   -1.5064066 +1                      0.0000
  O         2.60365138 +1   -0.2486352 +1    0.1212244 +1                      0.0000
 Si         0.46845841 +1    3.3762970 +1   -0.0613746 +1                      0.0000
  O         0.81878619 +1   -3.9902679 +1    3.0003390 +1                      0.0000
  O        -3.98977103 +1    1.2345216 +1    3.0770946 +1                      0.0000
  O         2.97765639 +1    3.1053618 +1    3.1015232 +1                      0.0000
 Si        -2.54962812 +1    2.0595108 +1   -0.0463414 +1                      0.0000
  O        -2.62701870 +1    0.4149108 +1   -0.1343297 +1                      0.0000
  O        -3.02639324 +1    2.7768365 +1   -1.4441767 +1                      0.0000
  O        -0.90726028 +1    2.4289811 +1   -0.0105815 +1                      0.0000
 Si        -3.21844207 +1   -1.1719848 +1   -0.1857327 +1                      0.0000
 Si        -0.69266263 +1   -3.2842416 +1   -0.0760783 +1                      0.0000
  O         0.71091897 +1   -2.5531220 +1    0.0105580 +1                      0.0000
  O        -1.07679272 +1   -4.1637052 +1   -1.4207509 +1                      0.0000
  O        -1.85309584 +1   -2.0666280 +1   -0.1741412 +1                      0.0000
 Si         2.27679328 +1   -1.8668423 +1   -0.3511040 +1                      0.0000
 Al        -4.91622365 +1   -2.7961676 +1   -2.4953648 +1                      0.0000
  O         2.97593385 +1   -2.9408444 +1   -1.4850569 +1                      0.0000
  O        -0.97213756 +1    4.0508297 +1   -3.2692562 +1                      0.0000
  O         3.87192095 +1   -1.0975792 +1   -3.4360156 +1                      0.0000
  O         2.86171647 +1   -2.7432220 +1    1.0708501 +1                      0.0000
  O         0.84542636 +1    4.1676054 +1   -1.4702849 +1                      0.0000
  O        -4.15293514 +1   -1.2559640 +1   -1.5323429 +1                      0.0000
  O        -3.15103418 +1   -2.9347402 +1   -3.2381459 +1                      0.0000
  O         0.86069125 +1    4.2515068 +1    1.2862511 +1                      0.0000
  O        -4.05221828 +1   -1.1863975 +1    1.2289452 +1                      0.0000
 Si         3.06250652 +1    1.3208857 +1   -0.0874428 +1                      0.0000
 Al         4.68213031 +1    2.8409671 +1   -2.3360758 +1                      0.0000
  O         0.88186335 +1   -4.2172885 +1   -3.2690840 +1                      0.0000
  O        -4.00641421 +1    1.1391135 +1   -3.2404979 +1                      0.0000
  O         2.96892477 +1    3.0298886 +1   -3.1957820 +1                      0.0000
 Al        -4.96424969 +1   -2.7029200 +1    2.0196621 +1                      0.0000
  O        -1.09187243 +1    4.2451481 +1    2.9992472 +1                      0.0000
  O         4.01749335 +1   -1.0065117 +1    3.0345588 +1                      0.0000
  O        -3.23058979 +1   -2.7950485 +1    3.0442076 +1                      0.0000
 Si        -0.55255193 +1    3.3308121 +1   -4.6852650 +1                      0.0000
  O         0.91836254 +1    2.6170717 +1   -4.6724793 +1                      0.0000
  O        -1.61956616 +1    2.0145965 +1   -4.6334824 +1                      0.0000
 Si         2.56122542 +1    2.2477672 +1   -4.5881351 +1                      0.0000
 Si         2.85891037 +1   -1.0338789 +1   -4.8842867 +1                      0.0000
  O         1.62559971 +1   -2.1373711 +1   -4.4224641 +1                      0.0000
  O         2.66471575 +1    0.6692301 +1   -4.5254804 +1                      0.0000
 Si         0.49943548 +1   -3.3253178 +1   -4.6158573 +1                      0.0000
 Si        -2.59374140 +1   -2.1461771 +1   -4.5798749 +1                      0.0000
  O        -2.48163395 +1   -0.4810704 +1   -4.5199938 +1                      0.0000
  O        -0.97696953 +1   -2.5847090 +1   -4.5789573 +1                      0.0000
 Si        -3.00344712 +1    1.1178787 +1   -4.5529307 +1                      0.0000
 Be        -4.71575820 +1    0.0176244 +1    2.2014507 +1                      0.0000
 Be         2.18526794 +1   -3.9298636 +1    2.0043652 +1                      0.0000
 Be        -2.56053891 +1   -4.0683105 +1    2.2084637 +1                      0.0000
 Be        -4.89650235 +1   -0.0951829 +1   -2.4776170 +1                      0.0000
 Be         2.29454686 +1   -4.1718887 +1   -2.3422572 +1                      0.0000
 Be        -2.50726925 +1   -4.1508723 +1   -2.3059028 +1                      0.0000
  O         1.58289134 +1   -0.5941142 +1    2.7967332 +1                      0.0000
  O         1.38800468 +1   -1.0680982 +1   -1.7113010 +1                      0.0000
 Na         0.11482868 +1    0.8000336 +1   -2.3803156 +1                      0.0000
  H         1.98869929 +1   -0.1586957 +1    2.0308126 +1                      0.0000
  H         1.35143897 +1   -1.5826091 +1   -2.5332421 +1                      0.0000
 Tv         9.44539823 +1    0.1887818 +1   -0.0298684 +1 
 Tv         4.79614337 +1    8.3963560 +1    0.0057838 +1 
 Tv         0.13196988 +1   -0.0692415 +1   -9.0323465 +1