Comparison of Structures of Crystalline Solids Predicted using PM6 with X-Ray (Home)

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1 (Z_Z)-N_N'-Dimethylurea_(NIJHUJ)

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                      Unit Cell Parameters:       a      b      c   alpha   beta  gamma   Volume  Density
                                     X-Ray:    10.35   4.57  11.40  90.00  90.00 102.74    525.7   1.113
                                       PM6:     9.69   4.36  11.38  90.86  92.26  96.42    477.5   1.226
                 X-Ray                               PM6
 
  X-Ray data set:
 MERS=(1,2,1) 1SCF
 (Z_Z)-N_N'-Dimethylurea (NIJHUJ)

  O              0.00000000 +1    0.0000000 +1    0.0000000 +1                  0.0000
  C              1.24200000 +1   -0.0179990 +1    0.0090000 +1                  0.0000
  N              1.93900000 +1    0.9170000 +1    0.6600000 +1                  0.0000
  H              3.01600000 +1    0.9010000 +1    0.5760000 +1                  0.0000
  N              1.93100000 +1   -0.9379990 +1   -0.6440000 +1                  0.0000
  H              3.00600000 +1   -0.9469990 +1   -0.5380000 +1                  0.0000
  C              1.32000000 +1    1.9320010 +1    1.4850000 +1                  0.0000
  H              2.08500000 +1    2.5580000 +1    1.9190000 +1                  0.0000
  H              0.75300000 +1    1.4580010 +1    2.2720000 +1                  0.0000
  H              0.66100000 +1    2.5350000 +1    0.8790000 +1                  0.0000
  C              1.33000000 +1   -1.9480000 +1   -1.4750000 +1                  0.0000
  H              2.10100000 +1   -2.5860000 +1   -1.8790000 +1                  0.0000
  H              0.79300000 +1   -1.4740000 +1   -2.2840000 +1                  0.0000
  H              0.64600000 +1   -2.5380000 +1   -0.8840000 +1                  0.0000
  O              1.14100000 +1    2.8240010 +1   -5.0460000 +1                  0.0000
  C              2.38300000 +1    2.8420010 +1   -5.0370000 +1                  0.0000
  N              3.08000000 +1    1.9070020 +1   -4.3860000 +1                  0.0000
  H              4.15700000 +1    1.9230010 +1   -4.4700000 +1                  0.0000
  N              3.07200000 +1    3.7620010 +1   -5.6900000 +1                  0.0000
  H              4.14700000 +1    3.7710010 +1   -5.5840000 +1                  0.0000
  C              2.46100000 +1    0.8920020 +1   -3.5620000 +1                  0.0000
  H              3.22600000 +1    0.2660010 +1   -3.1280000 +1                  0.0000
  H              1.89400000 +1    1.3660020 +1   -2.7740000 +1                  0.0000
  H              1.80200000 +1    0.2890010 +1   -4.1670000 +1                  0.0000
  C              2.47100000 +1    4.7720010 +1   -6.5210000 +1                  0.0000
  H              3.24200000 +1    5.4100010 +1   -6.9260000 +1                  0.0000
  H              1.93400000 +1    4.2980010 +1   -7.3300000 +1                  0.0000
  H              1.78700000 +1    5.3620020 +1   -5.9310000 +1                  0.0000
  O             -2.28400000 +1    5.7000020 +1    0.0000000 +1                  0.0000
  C             -1.04300000 +1    5.6820010 +1    0.0090000 +1                  0.0000
  N             -0.34500000 +1    6.6170010 +1    0.6600000 +1                  0.0000
  H              0.73200000 +1    6.6010020 +1    0.5760000 +1                  0.0000
  N             -0.35400000 +1    4.7620010 +1   -0.6440000 +1                  0.0000
  H              0.72100000 +1    4.7530020 +1   -0.5380000 +1                  0.0000
  C             -0.96400000 +1    7.6320010 +1    1.4850000 +1                  0.0000
  H             -0.19900000 +1    8.2580020 +1    1.9190000 +1                  0.0000
  H             -1.53200000 +1    7.1580010 +1    2.2720000 +1                  0.0000
  H             -1.62400000 +1    8.2350010 +1    0.8790000 +1                  0.0000
  C             -0.95400000 +1    3.7520010 +1   -1.4750000 +1                  0.0000
  H             -0.18300000 +1    3.1140020 +1   -1.8790000 +1                  0.0000
  H             -1.49100000 +1    4.2260010 +1   -2.2840000 +1                  0.0000
  H             -1.63900000 +1    3.1620020 +1   -0.8840000 +1                  0.0000
  O             -1.14300000 +1   -2.8759990 +1   -5.0460000 +1                  0.0000
  C              0.09800000 +1   -2.8579990 +1   -5.0370000 +1                  0.0000
  N              0.79600000 +1   -3.7929990 +1   -4.3860000 +1                  0.0000
  H              1.87200000 +1   -3.7770000 +1   -4.4700000 +1                  0.0000
  N              0.78700000 +1   -1.9379990 +1   -5.6900000 +1                  0.0000
  H              1.86200000 +1   -1.9289990 +1   -5.5840000 +1                  0.0000
  C              0.17700000 +1   -4.8080000 +1   -3.5620000 +1                  0.0000
  H              0.94200000 +1   -5.4340000 +1   -3.1280000 +1                  0.0000
  H             -0.39100000 +1   -4.3340000 +1   -2.7740000 +1                  0.0000
  H             -0.48300000 +1   -5.4109990 +1   -4.1670000 +1                  0.0000
  C              0.18700000 +1   -0.9279990 +1   -6.5210000 +1                  0.0000
  H              0.95800000 +1   -0.2900000 +1   -6.9260000 +1                  0.0000
  H             -0.35000000 +1   -1.4019990 +1   -7.3300000 +1                  0.0000
  H             -0.49800000 +1   -0.3380000 +1   -5.9310000 +1                  0.0000
  O              4.56900000 +1    0.0000000 +1    0.0000000 +1                  0.0000
  C              5.81100000 +1   -0.0179990 +1    0.0090000 +1                  0.0000
  N              6.50800000 +1    0.9170000 +1    0.6600000 +1                  0.0000
  H              7.58500000 +1    0.9010000 +1    0.5760000 +1                  0.0000
  N              6.50000000 +1   -0.9379990 +1   -0.6440000 +1                  0.0000
  H              7.57500000 +1   -0.9469990 +1   -0.5380000 +1                  0.0000
  C              5.88900000 +1    1.9320010 +1    1.4850000 +1                  0.0000
  H              6.65400000 +1    2.5580000 +1    1.9190000 +1                  0.0000
  H              5.32200000 +1    1.4580010 +1    2.2720000 +1                  0.0000
  H              5.23000000 +1    2.5350000 +1    0.8790000 +1                  0.0000
  C              5.89900000 +1   -1.9480000 +1   -1.4750000 +1                  0.0000
  H              6.67000000 +1   -2.5860000 +1   -1.8790000 +1                  0.0000
  H              5.36200000 +1   -1.4740000 +1   -2.2840000 +1                  0.0000
  H              5.21500000 +1   -2.5380000 +1   -0.8840000 +1                  0.0000
  O              5.71000000 +1    2.8240010 +1   -5.0460000 +1                  0.0000
  C              6.95200000 +1    2.8420010 +1   -5.0370000 +1                  0.0000
  N              7.64900000 +1    1.9070020 +1   -4.3860000 +1                  0.0000
  H              8.72600000 +1    1.9230010 +1   -4.4700000 +1                  0.0000
  N              7.64100000 +1    3.7620010 +1   -5.6900000 +1                  0.0000
  H              8.71600000 +1    3.7710010 +1   -5.5840000 +1                  0.0000
  C              7.03000000 +1    0.8920020 +1   -3.5620000 +1                  0.0000
  H              7.79500000 +1    0.2660010 +1   -3.1280000 +1                  0.0000
  H              6.46300000 +1    1.3660020 +1   -2.7740000 +1                  0.0000
  H              6.37100000 +1    0.2890010 +1   -4.1670000 +1                  0.0000
  C              7.04000000 +1    4.7720010 +1   -6.5210000 +1                  0.0000
  H              7.81100000 +1    5.4100010 +1   -6.9260000 +1                  0.0000
  H              6.50300000 +1    4.2980010 +1   -7.3300000 +1                  0.0000
  H              6.35600000 +1    5.3620020 +1   -5.9310000 +1                  0.0000
  O              2.28500000 +1    5.7000020 +1    0.0000000 +1                  0.0000
  C              3.52600000 +1    5.6820010 +1    0.0090000 +1                  0.0000
  N              4.22400000 +1    6.6170010 +1    0.6600000 +1                  0.0000
  H              5.30100000 +1    6.6010020 +1    0.5760000 +1                  0.0000
  N              4.21500000 +1    4.7620010 +1   -0.6440000 +1                  0.0000
  H              5.29000000 +1    4.7530020 +1   -0.5380000 +1                  0.0000
  C              3.60500000 +1    7.6320010 +1    1.4850000 +1                  0.0000
  H              4.37000000 +1    8.2580020 +1    1.9190000 +1                  0.0000
  H              3.03700000 +1    7.1580010 +1    2.2720000 +1                  0.0000
  H              2.94500000 +1    8.2350010 +1    0.8790000 +1                  0.0000
  C              3.61500000 +1    3.7520010 +1   -1.4750000 +1                  0.0000
  H              4.38600000 +1    3.1140020 +1   -1.8790000 +1                  0.0000
  H              3.07800000 +1    4.2260010 +1   -2.2840000 +1                  0.0000
  H              2.93000000 +1    3.1620020 +1   -0.8840000 +1                  0.0000
  O              3.42600000 +1   -2.8759990 +1   -5.0460000 +1                  0.0000
  C              4.66700000 +1   -2.8579990 +1   -5.0370000 +1                  0.0000
  N              5.36500000 +1   -3.7929990 +1   -4.3860000 +1                  0.0000
  H              6.44100000 +1   -3.7770000 +1   -4.4700000 +1                  0.0000
  N              5.35600000 +1   -1.9379990 +1   -5.6900000 +1                  0.0000
  H              6.43100000 +1   -1.9289990 +1   -5.5840000 +1                  0.0000
  C              4.74600000 +1   -4.8080000 +1   -3.5620000 +1                  0.0000
  H              5.51100000 +1   -5.4340000 +1   -3.1280000 +1                  0.0000
  H              4.17800000 +1   -4.3340000 +1   -2.7740000 +1                  0.0000
  H              4.08600000 +1   -5.4109990 +1   -4.1670000 +1                  0.0000
  C              4.75600000 +1   -0.9279990 +1   -6.5210000 +1                  0.0000
  H              5.52700000 +1   -0.2900000 +1   -6.9260000 +1                  0.0000
  H              4.21900000 +1   -1.4019990 +1   -7.3300000 +1                  0.0000
  H              4.07100000 +1   -0.3380000 +1   -5.9310000 +1                  0.0000
 Tv             -2.28200000 +1    0.0000000 +1   10.0930000 +1 
 Tv              9.13800000 +1    0.0000000 +1    0.0000000 +1 
 Tv              0.00000000 +1  -11.4000010 +1    0.0000000 +1 
 
  Optimized PM6 data set:
 MERS=(1,2,1) GNORM=20
 (Z_Z)-N_N'-Dimethylurea (NIJHUJ)

  O        -0.02486566 +1    0.4385132 +1   -0.7465165 +1                      0.0000
  C         1.13931901 +1    0.1690843 +1   -0.3948269 +1                      0.0000
  N         1.93355892 +1    1.1039789 +1    0.2864388 +1                      0.0000
  H         2.85869995 +1    0.8014397 +1    0.6453267 +1                      0.0000
  N         1.72517962 +1   -1.0777711 +1   -0.6599351 +1                      0.0000
  H         2.73792102 +1   -1.1971842 +1   -0.4680900 +1                      0.0000
  C         1.26974275 +1    2.1454335 +1    1.0995650 +1                      0.0000
  H         1.87051982 +1    3.0791125 +1    1.0499267 +1                      0.0000
  H         1.15614479 +1    1.8516671 +1    2.1586540 +1                      0.0000
  H         0.26247132 +1    2.3783808 +1    0.7101335 +1                      0.0000
  C         1.22962579 +1   -1.8831756 +1   -1.7992998 +1                      0.0000
  H         0.98679211 +1   -2.8999521 +1   -1.4360404 +1                      0.0000
  H         1.98993371 +1   -1.9710775 +1   -2.5989065 +1                      0.0000
  H         0.31254432 +1   -1.4565089 +1   -2.2413506 +1                      0.0000
  O         1.27272960 +1    2.2410653 +1   -5.3889888 +1                      0.0000
  C         2.42103986 +1    2.5831591 +1   -5.0486016 +1                      0.0000
  N         3.29343426 +1    1.7002471 +1   -4.3978703 +1                      0.0000
  H         4.22169833 +1    2.0511902 +1   -4.0902254 +1                      0.0000
  N         2.90908844 +1    3.8742304 +1   -5.3045677 +1                      0.0000
  H         3.92310133 +1    4.0526486 +1   -5.1906406 +1                      0.0000
  C         2.72792234 +1    0.6262225 +1   -3.5533909 +1                      0.0000
  H         3.29803480 +1   -0.3125497 +1   -3.7304014 +1                      0.0000
  H         2.77828352 +1    0.8748867 +1   -2.4807160 +1                      0.0000
  H         1.67066903 +1    0.4251178 +1   -3.8068046 +1                      0.0000
  C         2.26833219 +1    4.6707083 +1   -6.3741161 +1                      0.0000
  H         2.32725713 +1    5.7413142 +1   -6.1028925 +1                      0.0000
  H         2.75435484 +1    4.5289007 +1   -7.3611232 +1                      0.0000
  H         1.20018040 +1    4.4082087 +1   -6.4805950 +1                      0.0000
  O        -1.99109081 +1    6.1908695 +1   -0.4963922 +1                      0.0000
  C        -0.80775274 +1    5.9188220 +1   -0.2169039 +1                      0.0000
  N         0.03318609 +1    6.8533099 +1    0.3990673 +1                      0.0000
  H         0.98260777 +1    6.5536332 +1    0.7015160 +1                      0.0000
  N        -0.25245796 +1    4.6622226 +1   -0.5016664 +1                      0.0000
  H         0.77739202 +1    4.5516287 +1   -0.4451629 +1                      0.0000
  C        -0.57324318 +1    7.9170442 +1    1.2283044 +1                      0.0000
  H         0.01391489 +1    8.8455284 +1    1.1032975 +1                      0.0000
  H        -0.61238119 +1    7.6490507 +1    2.2986655 +1                      0.0000
  H        -1.60805814 +1    8.1393741 +1    0.9063498 +1                      0.0000
  C        -0.90869510 +1    3.7965160 +1   -1.5041399 +1                      0.0000
  H        -0.58947132 +1    2.7464232 +1   -1.3357004 +1                      0.0000
  H        -0.66277326 +1    4.0798732 +1   -2.5411368 +1                      0.0000
  H        -2.00931748 +1    3.8364587 +1   -1.4003548 +1                      0.0000
  O        -0.78477035 +1   -3.3282487 +1   -5.4992618 +1                      0.0000
  C         0.37903632 +1   -3.0615014 +1   -5.1510320 +1                      0.0000
  N         1.22029368 +1   -4.0406368 +1   -4.5958251 +1                      0.0000
  H         2.15598317 +1   -3.7507261 +1   -4.2433088 +1                      0.0000
  N         0.93446699 +1   -1.7834986 +1   -5.3113645 +1                      0.0000
  H         1.96102284 +1   -1.6756981 +1   -5.2207811 +1                      0.0000
  C         0.60196667 +1   -5.1459961 +1   -3.8312907 +1                      0.0000
  H         1.21816494 +1   -6.0558316 +1   -3.9629137 +1                      0.0000
  H         0.52241138 +1   -4.9187667 +1   -2.7557493 +1                      0.0000
  H        -0.41142607 +1   -5.3760455 +1   -4.2112515 +1                      0.0000
  C         0.28578688 +1   -0.8175875 +1   -6.2237097 +1                      0.0000
  H         0.69536086 +1    0.1962691 +1   -6.0223098 +1                      0.0000
  H         0.44125671 +1   -1.0568181 +1   -7.2885572 +1                      0.0000
  H        -0.80328473 +1   -0.7827384 +1   -6.0369898 +1                      0.0000
  O         4.35415804 +1   -0.4594006 +1    0.4003233 +1                      0.0000
  C         5.51914363 +1   -0.2071558 +1    0.0393956 +1                      0.0000
  N         6.13043879 +1    1.0260892 +1    0.3172610 +1                      0.0000
  H         7.15006443 +1    1.1217070 +1    0.1535938 +1                      0.0000
  N         6.28888000 +1   -1.1390214 +1   -0.6671966 +1                      0.0000
  H         7.22124146 +1   -0.8547949 +1   -1.0226412 +1                      0.0000
  C         5.60615398 +1    1.8584371 +1    1.4218217 +1                      0.0000
  H         5.84223153 +1    2.9179987 +1    1.2074153 +1                      0.0000
  H         6.03594278 +1    1.5877248 +1    2.4014891 +1                      0.0000
  H         4.50634372 +1    1.7763586 +1    1.4908309 +1                      0.0000
  C         5.59785361 +1   -2.1570140 +1   -1.4872795 +1                      0.0000
  H         6.17803768 +1   -3.1056319 +1   -1.4505843 +1                      0.0000
  H         5.49235390 +1   -1.8421140 +1   -2.5381097 +1                      0.0000
  H         4.58642497 +1   -2.3734252 +1   -1.0980589 +1                      0.0000
  O         5.63667390 +1    3.4051233 +1   -4.3825756 +1                      0.0000
  C         6.77483197 +1    3.0800036 +1   -4.7667329 +1                      0.0000
  N         7.29919290 +1    1.7975970 +1   -4.5222810 +1                      0.0000
  H         8.31258983 +1    1.6432933 +1   -4.6875252 +1                      0.0000
  N         7.60130022 +1    3.9649187 +1   -5.4706533 +1                      0.0000
  H         8.52071803 +1    3.6291106 +1   -5.8235492 +1                      0.0000
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