Time stamp: Thu Mar 11 08:55:57 2021
alpha-Chitin (SUSGIW)
253 alpha-Chitin (SUSGIW)
(Previous) Alpha-Chitin
(Back) Elements:
C 8
O 5
N 1
H 13
(Z = 8)
(Periodic Table)
(Next) Cinnamic acid 3-nitrobenzamide (OPUSOI)
Reference: D.Carlstrom, J.Biophys.Biochem.Cytol. (1957), 3, 669
Compare with alpha-Chitin: they are mirror images.
One or more hydroxyl groups are rotated.
Unit Cell Parameters: a b c alpha beta gamma Volume Density Heat of Formation (Kcal/mol)
X-ray: 10.28 18.85 4.76 90.00 90.00 90.00 922.38 1.463 -211.5 calc'd using PM7
PM7: 10.29 19.43 4.89 94.42 89.76 88.71 974.66 1.385 -240.0 calc'd using PM7 (ref: 0.0)
PM6_D3H4: 10.28 18.32 4.61 86.67 74.84 90.47 836.53 1.613 -257.2 calc'd using PM6_D3H4
X-Ray PM7 PM6_D3H4
|
Calc'd on: Feb 26 2021 @ 02:45:26 |
Feb 25 2021 @ 09:16:42
ARC file |
Feb 28 2021 @ 00:47:31 |
For X-Ray structure, contact the CCDC: http://www.ccdc.cam.ac.uk/
Optimized PM7 data set:
MERS=(1,1,2) CHARGE=0 OUTPUT THREADS=1 PM7 GRADIENTS NOTXT EF
alpha-Chitin (SUSGIW)
C -0.05354987 +1 0.0553756 +1 -0.1563642 +1
C 1.49622628 +1 -0.0054792 +1 -0.1065869 +1
C 2.03142705 +1 1.4452683 +1 0.0062946 +1
C 1.39357649 +1 2.1084366 +1 1.2438549 +1
C -0.15300628 +1 2.0583291 +1 1.1357990 +1
C -0.83711251 +1 2.5602768 +1 2.4119103 +1
C 2.69846069 +1 -1.8212383 +1 -1.2313804 +1
C 3.12941432 +1 -2.4533256 +1 -2.5132102 +1
O -0.47253508 +1 -1.2769517 +1 -0.0437372 +1
N 1.96064283 +1 -0.6629958 +1 -1.3185796 +1
O 3.42511862 +1 1.4126691 +1 0.0611337 +1
O 1.69121386 +1 3.4944197 +1 1.2369396 +1
O -0.53673539 +1 0.6933051 +1 1.0290779 +1
O -1.95907716 +1 3.3016804 +1 1.9549391 +1
O 2.94821957 +1 -2.2983328 +1 -0.1326532 +1
C -1.67179520 +1 -1.5817298 +1 -0.7374887 +1
C -2.86222923 +1 -1.4552205 +1 0.2387104 +1
C -4.13867023 +1 -1.9490617 +1 -0.4995421 +1
C 2.78444419 +1 3.8579629 +1 2.0424517 +1
H -0.46321862 +1 0.5738242 +1 -1.0472624 +1
H 1.81377486 +1 -0.5973006 +1 0.7951179 +1
O -2.71935161 +1 -3.4118001 +1 -1.8436594 +1
C -1.51372904 +1 -3.0496526 +1 -1.1921766 +1
C -0.42528705 +1 -3.2398323 +1 -2.2596833 +1
O 0.33256715 +1 -4.3919896 +1 -1.9642592 +1
N -5.30168242 +1 -2.0023511 +1 0.3687944 +1
C -6.43553205 +1 -1.2646892 +1 0.1046559 +1
C -7.55135235 +1 -1.4047476 +1 1.0899515 +1
O -6.51482571 +1 -0.5845184 +1 -0.9046087 +1
O -3.07186323 +1 -0.1040019 +1 0.5495763 +1
H 1.84485008 +1 2.0409966 +1 -0.9164935 +1
H 1.73943642 +1 1.6217440 +1 2.1830094 +1
H -0.51957589 +1 2.6263854 +1 0.2493966 +1
H -1.20495271 +1 1.7251070 +1 3.0405142 +1
H -0.17059933 +1 3.2127219 +1 3.0090044 +1
H 3.70587516 +1 -3.3789631 +1 -2.3165313 +1
H 2.27841190 +1 -2.7432450 +1 -3.1559501 +1
H 3.77149977 +1 -1.7828281 +1 -3.1033431 +1
H 1.88318544 +1 -0.1445700 +1 -2.1922099 +1
H 3.76754783 +1 1.1541691 +1 0.9402161 +1
H -2.32115281 +1 3.8580774 +1 2.6778806 +1
H -1.81331704 +1 -0.9076962 +1 -1.6113438 +1
H -2.68157831 +1 -2.0103067 +1 1.1869234 +1
H -4.34594097 +1 -1.2806720 +1 -1.3777065 +1
H 2.95278352 +1 3.1528026 +1 2.8833117 +1
H -1.33081717 +1 -3.7280182 +1 -0.3282466 +1
H 0.23701406 +1 -2.3587769 +1 -2.3372247 +1
H -0.85949467 +1 -3.4678679 +1 -3.2574936 +1
H 0.87685134 +1 -4.2516580 +1 -1.1599394 +1
H -5.19044941 +1 -2.4995383 +1 1.2463241 +1
H -7.31263518 +1 -2.0220494 +1 1.9723390 +1
H -8.45586715 +1 -1.8167697 +1 0.6246093 +1
H -7.84061324 +1 -0.4129824 +1 1.4912862 +1
H -2.23512554 +1 0.3065630 +1 0.8859003 +1
H 8.62538874 +1 2.5325086 +1 -6.2499725 +1
H 11.95104517 +1 2.8745560 +1 -4.0494974 +1
H 10.95052836 +1 3.3078145 +1 -7.0166500 +1
H 10.95797945 +1 0.6664989 +1 -5.3154719 +1
H 9.79847942 +1 2.0699534 +1 -3.3800817 +1
H 7.12461859 +1 2.8668724 +1 -4.1083504 +1
H 8.00463671 +1 4.4213863 +1 -3.7848562 +1
H 15.16874058 +1 1.6821562 +1 -7.1919076 +1
H 14.78018203 +1 1.7126394 +1 -8.9144250 +1
H 15.40111828 +1 3.1664629 +1 -8.1773800 +1
H 13.21208071 +1 1.5984947 +1 -5.9936834 +1
H 9.65933422 +1 0.1039805 +1 -7.2221536 +1
H 7.89761310 +1 2.2398448 +1 -1.9807670 +1
H 13.15086430 +1 4.4371426 +1 -3.3728075 +1
H 4.87522135 +1 -0.2845045 +1 -7.1682594 +1
H 6.59262781 +1 -0.9727891 +1 -4.6211126 +1
H 7.20845641 +1 1.1326441 +1 -6.8825342 +1
H 7.13415919 +1 -0.6707752 +1 -8.5895194 +1
H 9.29125945 +1 -2.5635979 +1 -7.6761288 +1
H 7.91450573 +1 -3.4092851 +1 -8.5042359 +1
H 9.40048959 +1 -2.6030375 +1 -10.0430470 +1
H 5.02691642 +1 1.5167890 +1 -5.3294074 +1
H 4.61263346 +1 1.9169063 +1 -1.6687735 +1
H 3.63870301 +1 2.1180662 +1 -3.1452663 +1
H 5.18330592 +1 2.9769668 +1 -2.9688266 +1
H 4.47891142 +1 -2.1331033 +1 -5.0728173 +1
C 9.12703156 +1 1.9052741 +1 -5.4810647 +1
C 11.45281179 +1 3.4369039 +1 -4.8657866 +1
C 11.39774435 +1 2.6579909 +1 -6.2161442 +1
C 10.49691577 +1 1.4123118 +1 -6.0003183 +1
C 9.31922003 +1 2.6965773 +1 -4.1662895 +1
C 8.01739745 +1 3.3188340 +1 -3.6401434 +1
C 13.33671252 +1 2.7556601 +1 -7.7271273 +1
C 14.73869230 +1 2.3132941 +1 -7.9828419 +1
O 12.10240609 +1 4.6458083 +1 -5.1752598 +1
N 12.76024195 +1 2.3020301 +1 -6.5643414 +1
O 10.34444969 +1 0.8175859 +1 -7.2624051 +1
O 10.13950517 +1 3.8098690 +1 -4.4727384 +1
O 7.94196132 +1 3.1848927 +1 -2.2395913 +1
O 12.72041198 +1 3.4832665 +1 -8.4911989 +1
C 12.83143773 +1 5.2136754 +1 -4.1031161 +1
C 5.33951214 +1 -0.9741369 +1 -6.4285963 +1
C 6.22878650 +1 -0.2392049 +1 -5.3934205 +1
C 7.45776287 +1 0.3484226 +1 -6.1400761 +1
O 8.32251162 +1 0.7909693 +1 -5.1291342 +1
O 8.17162981 +1 -0.7071348 +1 -6.7846330 +1
C 7.43497332 +1 -1.3877909 +1 -7.7920521 +1
C 8.41256996 +1 -2.4320044 +1 -8.3367614 +1
O 8.85100444 +1 -1.9289225 +1 -9.5924864 +1
N 5.52391296 +1 0.8504604 +1 -4.7389442 +1
C 5.37336950 +1 0.8520630 +1 -3.3703497 +1
C 4.66886152 +1 2.0208785 +1 -2.7703469 +1
O 5.83497583 +1 -0.0718693 +1 -2.7152126 +1
O 4.22508777 +1 -1.5513845 +1 -5.8180706 +1
C 1.38246965 +1 -2.7751335 +1 3.4208967 +1
C 2.93007964 +1 -2.8585270 +1 3.5365071 +1
C 3.48307291 +1 -1.4170666 +1 3.6554312 +1
C 2.79280420 +1 -0.7188452 +1 4.8461224 +1
C 1.25214706 +1 -0.7572673 +1 4.6930551 +1
C 0.55058491 +1 -0.2564281 +1 5.9612875 +1
C 4.14006992 +1 -4.7107793 +1 2.4595443 +1
C 4.59072025 +1 -5.3400861 +1 1.1856496 +1
O 0.94692997 +1 -4.1013187 +1 3.5326905 +1
N 3.43724953 +1 -3.5344544 +1 2.3535489 +1
O 4.86940302 +1 -1.4210520 +1 3.8297097 +1
O 3.10643211 +1 0.6639079 +1 4.8204066 +1
O 0.86042959 +1 -2.1191371 +1 4.5777136 +1
O -0.53029453 +1 0.5318094 +1 5.4876475 +1
O 4.35613188 +1 -5.1771838 +1 3.5692574 +1
C -0.26186822 +1 -4.3965231 +1 2.8522490 +1
C -1.43721483 +1 -4.3091285 +1 3.8524394 +1
C -2.72258690 +1 -4.8139264 +1 3.1349351 +1
C 4.21201037 +1 1.0170209 +1 5.6154480 +1
H 1.01768916 +1 -2.2650451 +1 2.5066097 +1
H 3.19316090 +1 -3.4471324 +1 4.4592507 +1
O -1.31258823 +1 -6.1842731 +1 1.7035888 +1
C -0.10316394 +1 -5.8553897 +1 2.3662384 +1
C 0.99449562 +1 -6.0399376 +1 1.3091857 +1
O 1.77483913 +1 -7.1730026 +1 1.6236844 +1
N -3.86433454 +1 -4.9144788 +1 4.0288770 +1
C -5.01703661 +1 -4.1986428 +1 3.7836115 +1
C -6.12072858 +1 -4.3239929 +1 4.7837121 +1
O -5.11684480 +1 -3.5162128 +1 2.7760117 +1
O -1.66962763 +1 -2.9662136 +1 4.1856243 +1
H 3.36425363 +1 -0.8317787 +1 2.7155410 +1
H 3.10431082 +1 -1.1857128 +1 5.8071793 +1
H 0.90529569 +1 -0.1872079 +1 3.8007523 +1
H 0.16877002 +1 -1.0937617 +1 6.5754722 +1
H 1.21735953 +1 0.3860109 +1 6.5718475 +1
H 5.18263055 +1 -6.2545259 +1 1.3784710 +1
H 3.74356750 +1 -5.6397247 +1 0.5417326 +1
H 5.22026568 +1 -4.6548381 +1 0.5949037 +1
H 3.35581023 +1 -3.0515258 +1 1.4689192 +1
H 5.15087614 +1 -2.0538309 +1 4.5258668 +1
H -1.05401933 +1 0.8853001 +1 6.2383868 +1
H -0.42450131 +1 -3.7044757 +1 1.9978468 +1
H -1.22443154 +1 -4.8710593 +1 4.7899881 +1
H -2.96518966 +1 -4.1233220 +1 2.2840820 +1
H 4.41366404 +1 0.2807843 +1 6.4206837 +1
H 0.06989120 +1 -6.5492194 +1 3.2207049 +1
H 1.64343527 +1 -5.1504898 +1 1.2233166 +1
H 0.56867617 +1 -6.2937563 +1 0.3137373 +1
H 2.29993351 +1 -7.0169313 +1 2.4373815 +1
H -3.71663345 +1 -5.4194972 +1 4.9020704 +1
H -5.88922683 +1 -4.9497678 +1 5.6598647 +1
H -7.03791521 +1 -4.7071782 +1 4.3180217 +1
H -6.38472064 +1 -3.3258073 +1 5.1893795 +1
H -0.82624419 +1 -2.5277504 +1 4.4612135 +1
H 10.07406517 +1 -0.3288794 +1 -2.7029192 +1
H 13.35110937 +1 0.0535371 +1 -0.4253916 +1
H 12.44435875 +1 0.4202680 +1 -3.4296436 +1
H 12.37103924 +1 -2.2028441 +1 -1.7063870 +1
H 11.22008027 +1 -0.7510147 +1 0.1835022 +1
H 8.54174542 +1 0.0237156 +1 -0.5480974 +1
H 9.41482369 +1 1.5840524 +1 -0.2233686 +1
H 16.66698711 +1 -1.2218025 +1 -3.5453996 +1
H 16.25721404 +1 -1.2284814 +1 -5.2649061 +1
H 16.86706783 +1 0.2457797 +1 -4.5628513 +1
H 14.66399441 +1 -1.3074502 +1 -2.3206608 +1
H 11.09231947 +1 -2.7246607 +1 -3.6546323 +1
H 9.35286561 +1 -0.6011184 +1 1.5778930 +1
H 14.63653902 +1 1.5638593 +1 0.1785508 +1
H 6.28595464 +1 -3.1778903 +1 -3.4997708 +1
H 8.10285647 +1 -3.8675271 +1 -1.0224328 +1
H 8.58720064 +1 -1.7104652 +1 -3.2709898 +1
H 8.53319465 +1 -3.5008784 +1 -5.0173785 +1
H 10.73242512 +1 -5.3626237 +1 -4.1379529 +1
H 9.35980344 +1 -6.2276312 +1 -4.9520687 +1
H 10.73525152 +1 -5.4306073 +1 -6.5532331 +1
H 6.48310795 +1 -1.3977698 +1 -1.6527839 +1
H 6.05987091 +1 -1.0268743 +1 1.9920799 +1
H 5.12276904 +1 -0.7894221 +1 0.4937625 +1
H 6.68496844 +1 0.0244463 +1 0.7089851 +1
H 5.99705858 +1 -5.0461595 +1 -1.4041523 +1
C 10.56229484 +1 -0.9424295 +1 -1.9158723 +1
C 12.88063076 +1 0.5940981 +1 -1.2722853 +1
C 12.86147457 +1 -0.2180980 +1 -2.6026454 +1
C 11.93931468 +1 -1.4503998 +1 -2.4030536 +1
C 10.73811046 +1 -0.1342063 +1 -0.6090358 +1
C 9.43332796 +1 0.4808189 +1 -0.0826740 +1
C 14.81409136 +1 -0.1763783 +1 -4.0852144 +1
C 16.21704182 +1 -0.6127975 +1 -4.3434445 +1
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C 8.85969609 +1 -4.2154628 +1 -4.2286090 +1
C 9.84666534 +1 -5.2445128 +1 -4.7921053 +1
O 10.27687056 +1 -4.7269897 +1 -6.0434838 +1
N 6.97860959 +1 -2.0704163 +1 -1.0834180 +1
C 6.82570323 +1 -2.0993150 +1 0.2862880 +1
C 6.14113805 +1 -0.9220351 +1 0.8937811 +1
O 7.31858293 +1 -3.0238963 +1 0.9173103 +1
O 5.71109465 +1 -4.4774348 +1 -2.1548126 +1
Tv -6.62866611 +1 -7.2637543 +1 -3.0164880 +1
Tv -14.26799986 +1 8.0727635 +1 10.4208518 +1
Tv 3.02602442 +1 -5.8324586 +1 7.2544040 +1
Optimized PM6_D3H4 data set:
MERS=(1,1,2) CHARGE=0 EF OUTPUT THREADS=1 PM6-D3H4 GRADIENTS
alpha-Chitin (SUSGIW) (PM6-D3H4)
C 0.13797936 +1 -0.3311016 +1 -0.4313134 +1
C 1.66951046 +1 -0.2003566 +1 -0.2636731 +1
C 2.13196570 +1 1.2382505 +1 0.0371952 +1
C 1.18874615 +1 2.0238267 +1 0.9783165 +1
C -0.30200781 +1 1.7641081 +1 0.6950388 +1
C -1.23433403 +1 2.2298673 +1 1.8185846 +1
C 2.93986116 +1 -1.9453931 +1 -1.4539289 +1
C 3.49228286 +1 -2.4926128 +1 -2.7073203 +1
O -0.13550157 +1 -1.7030643 +1 -0.1582134 +1
N 2.29942621 +1 -0.7176799 +1 -1.4908510 +1
O 3.38844752 +1 1.0379139 +1 0.7062846 +1
O 1.32789162 +1 3.4330006 +1 0.6178300 +1
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C 0.12772444 +1 -4.3614718 +1 -1.4826371 +1
O 1.16319542 +1 -4.6274648 +1 -0.5379231 +1
N -4.91265433 +1 -2.4331102 +1 0.4700296 +1
C -6.06114904 +1 -1.8360914 +1 -0.0396170 +1
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O -2.90006685 +1 -0.5085919 +1 -0.5472833 +1
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O 12.77539619 +1 3.7330983 +1 -8.4029612 +1
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