Time stamp: Thu Mar 11 08:55:57 2021
XXI form 3 Gallic acid monohydrate
269 XXI form 3 Gallic acid monohydrate
(Previous) beta-D-Galactose (BDGLOS01)
(Back) Elements:
C 7
O 6
H 8
(Z = 4)
(Periodic Table)
(Next) XXI form 4 Gallic acid monohydrate
This is one of the solids used in the blind tests of crystal structure prediction.
See: "Significant progress in predicting the crystal structures of small organic molecules - a report on the fourth blind test", Acta Crys. B 865, 107-125 (2009), and
"Towards crystal structure prediction of complex organic compounds - a report on the fifth blind test", Bardwell, et. al Acta Cryst. (2011). B67, 535-551
The complete set consists of 22 solids.
Unit Cell Parameters: a b c alpha beta gamma Volume Density Heat of Formation (Kcal/mol)
X-ray: 15.58 7.51 7.12 111.50 91.05 100.53 758.93 1.647 -250.3 calc'd using PM7
PM7: 15.16 7.34 6.99 105.71 94.63 99.32 732.56 1.706 -310.0 calc'd using PM7 (ref: 0.0)
PM6_D3H4: 15.31 7.34 6.96 98.36 103.79 98.46 738.39 1.692 -299.3 calc'd using PM6_D3H4
X-Ray PM7 PM6_D3H4
|
Calc'd on: Feb 26 2021 @ 03:25:19 |
Feb 25 2021 @ 07:39:11
ARC file |
Feb 27 2021 @ 20:24:58 |
X-Ray data set:
MERS=(1,1,1) CHARGE=0 OUTPUT THREADS=1 1SCF GRADIENTS
XXI form 3 Gallic acid monohydrate
C 0.00000000 +1 0.0000000 +1 0.0000000 +1
C 2.50758700 +1 0.0000000 +1 0.0000000 +1
C 1.30002791 +1 0.7022585 +1 0.0000000 +1
C 3.68063028 +1 2.0929424 +1 -0.1545110 +1
C 1.27932480 +1 2.0951936 +1 -0.0575929 +1
C 3.70589849 +1 0.6996785 +1 -0.0743784 +1
C 2.47576104 +1 2.7803147 +1 -0.1352198 +1
O 0.08563898 +1 -1.3113114 +1 0.0778858 +1
O -1.08668506 +1 0.5794408 +1 -0.0716615 +1
O 2.54576035 +1 4.1393238 +1 -0.2353703 +1
H 1.79311082 +1 4.4437843 +1 -0.4527935 +1
O 4.80895865 +1 2.8425380 +1 -0.2721046 +1
O 4.94841045 +1 0.1447569 +1 -0.1096086 +1
H -0.73054699 +1 -1.6455615 +1 -0.0323106 +1
H 2.53184746 +1 -0.9810660 +1 0.0223344 +1
H 5.57724979 +1 2.2863090 +1 -0.2286504 +1
H 4.93502275 +1 -0.7339338 +1 0.0436298 +1
H 0.38948802 +1 2.5895293 +1 -0.0579443 +1
C 0.20823528 +1 -1.3371926 +1 3.2639978 +1
C -2.29935172 +1 -1.3371925 +1 3.2639980 +1
C -1.09138088 +1 -2.0386050 +1 3.2636608 +1
C -3.47263880 +1 -3.4296765 +1 3.4193635 +1
C -1.07067787 +1 -3.4315402 +1 3.3212535 +1
C -3.49790671 +1 -2.0364121 +1 3.3392306 +1
C -2.26735704 +1 -4.1162019 +1 3.3997350 +1
O 0.12235306 +1 -0.0254229 +1 3.1869666 +1
O 1.29533219 +1 -1.9157869 +1 3.3353218 +1
O -2.33752475 +1 -5.4765165 +1 3.4993682 +1
H -1.58470602 +1 -5.7796724 +1 3.7173089 +1
O -4.60096709 +1 -4.1792722 +1 3.5369571 +1
O -4.73976294 +1 -1.4811036 +1 3.3732694 +1
H 0.93895076 +1 0.3096740 +1 3.2968255 +1
H -2.32320066 +1 -0.3552807 +1 3.2413262 +1
H -5.36884596 +1 -3.6221971 +1 3.4931655 +1
H -4.72703033 +1 -0.6028011 +1 3.2212228 +1
H -0.18084109 +1 -3.9258759 +1 3.3216049 +1
C 3.58048408 +1 0.5369241 +1 3.2480342 +1
C 4.87663198 +1 1.2362305 +1 3.1736215 +1
C 6.08663576 +1 0.5362931 +1 3.1824327 +1
C 7.26441327 +1 2.6376906 +1 3.0282398 +1
C 6.05361519 +1 3.3173086 +1 3.0149009 +1
C 4.86012504 +1 2.6265956 +1 3.0998797 +1
C 7.28166274 +1 1.2407443 +1 3.1338117 +1
O 3.66350472 +1 -0.7748852 +1 3.2681023 +1
O 2.49559666 +1 1.1259474 +1 3.3004613 +1
O 8.52746085 +1 0.6889833 +1 3.1668617 +1
O 8.40841796 +1 3.3758312 +1 2.9692381 +1
O 6.04423742 +1 4.6926025 +1 2.9150050 +1
H 2.86754184 +1 -1.1481894 +1 3.3039945 +1
H 6.12468756 +1 -0.4473252 +1 3.2685740 +1
H 8.43879165 +1 -0.1937333 +1 3.3277469 +1
H 9.15044138 +1 2.8322226 +1 2.7632276 +1
H 3.96980167 +1 3.1218490 +1 3.1012372 +1
H 5.15589985 +1 5.1634832 +1 2.3179992 +1
C 3.43802528 +1 -5.0247509 +1 0.4236853 +1
C 2.14146521 +1 -5.7249041 +1 0.4984354 +1
C 0.93163027 +1 -5.0236609 +1 0.4901413 +1
C -0.24590416 +1 -7.1255180 +1 0.6434796 +1
C 0.96489371 +1 -7.8051363 +1 0.6568189 +1
C 2.15814137 +1 -7.1139639 +1 0.5726943 +1
C -0.26380843 +1 -5.7289586 +1 0.5390994 +1
O 3.35476167 +1 -3.7124822 +1 0.4044717 +1
O 4.52266951 +1 -5.6133158 +1 0.3721127 +1
O -1.50936333 +1 -5.1776563 +1 0.5051951 +1
O -1.38990894 +1 -7.8636583 +1 0.7024814 +1
O 0.97427166 +1 -9.1804312 +1 0.7567145 +1
H 4.15096790 +1 -3.3396366 +1 0.3677249 +1
H 0.89382177 +1 -4.0405013 +1 0.4031455 +1
H -1.42093758 +1 -4.2944812 +1 0.3451645 +1
H -2.13234417 +1 -7.3208967 +1 0.9088294 +1
H 3.04846470 +1 -7.6092174 +1 0.5713367 +1
H 1.86260948 +1 -9.6513114 +1 1.3537203 +1
O 3.98131306 +1 5.6793558 +1 1.4842855 +1
H 4.23834177 +1 6.3756229 +1 1.1203842 +1
H 3.63988591 +1 4.9970946 +1 0.9085626 +1
O 3.03678379 +1 -10.1680310 +1 2.1877712 +1
H 2.78016706 +1 -10.8634513 +1 2.5513350 +1
H 3.37862317 +1 -9.4849231 +1 2.7631570 +1
O -1.55153144 +1 -9.4974330 +1 3.1884347 +1
H -1.48564211 +1 -9.3441072 +1 2.4707152 +1
H -0.84175254 +1 -9.9719659 +1 3.3773202 +1
O -0.42965196 +1 -7.1723452 +1 4.1292674 +1
H -0.49554128 +1 -7.3256709 +1 4.8469869 +1
H -1.13984301 +1 -6.6986584 +1 3.9407193 +1
Tv 8.99945006 +1 12.1824067 +1 -3.6451277 +1
Tv -6.80986242 +1 3.1514814 +1 -0.4080587 +1
Tv 1.73153650 +1 -3.2662560 +1 -6.0827035 +1
Optimized PM7 data set:
MERS=(1,1,1) CHARGE=0 OUTPUT THREADS=1 PM7 GRADIENTS NOTXT EF
XXI form 3 Gallic acid monohydrate
C 0.09356821 +1 0.0330317 +1 -0.0619722 +1
C 2.58403552 +1 -0.0273534 +1 -0.1130668 +1
C 1.39665790 +1 0.7135923 +1 -0.0871792 +1
C 3.83279510 +1 2.0682524 +1 -0.2016510 +1
C 1.40690892 +1 2.1089601 +1 -0.1095213 +1
C 3.79449280 +1 0.6574272 +1 -0.1705044 +1
C 2.62689118 +1 2.7815040 +1 -0.1699946 +1
O 0.17215980 +1 -1.2724951 +1 0.1563413 +1
O -1.00113283 +1 0.5666547 +1 -0.2332685 +1
O 2.72700556 +1 4.1318830 +1 -0.1918837 +1
H 1.86570986 +1 4.5839298 +1 -0.4393816 +1
O 4.98863260 +1 2.7657343 +1 -0.2620773 +1
O 5.01667943 +1 0.1008140 +1 -0.2531306 +1
H -0.73071418 +1 -1.7684135 +1 0.1382100 +1
H 2.56210139 +1 -1.1193735 +1 -0.1009502 +1
H 5.77801095 +1 2.1428200 +1 -0.3368020 +1
H 5.08816948 +1 -0.8741138 +1 -0.0468137 +1
H 0.47739126 +1 2.6816531 +1 -0.0774720 +1
C 0.16662587 +1 -1.4668296 +1 3.2278204 +1
C -2.32276559 +1 -1.4121393 +1 3.2690639 +1
C -1.13148989 +1 -2.1477817 +1 3.2602327 +1
C -3.56988645 +1 -3.5017447 +1 3.3910482 +1
C -1.13611218 +1 -3.5444826 +1 3.3182675 +1
C -3.53607176 +1 -2.0940100 +1 3.3399381 +1
C -2.35425149 +1 -4.2114993 +1 3.3910149 +1
O 0.09158912 +1 -0.1609965 +1 2.9874131 +1
O 1.26473716 +1 -1.9898043 +1 3.4118980 +1
O -2.48017437 +1 -5.5492704 +1 3.4660658 +1
H -1.63648804 +1 -6.0321434 +1 3.8166313 +1
O -4.67675894 +1 -4.2500357 +1 3.4233017 +1
O -4.75468764 +1 -1.5285495 +1 3.4224350 +1
H 0.99096791 +1 0.3307471 +1 3.0075329 +1
H -2.30296862 +1 -0.3214580 +1 3.2342944 +1
H -5.53547154 +1 -3.7303160 +1 3.6004940 +1
H -4.80951104 +1 -0.5550146 +1 3.2204121 +1
H -0.20804988 +1 -4.1210306 +1 3.3112104 +1
C 3.51600771 +1 0.6211299 +1 3.2030089 +1
C 4.81630594 +1 1.2967741 +1 3.1784412 +1
C 6.01580400 +1 0.5758686 +1 3.1462315 +1
C 7.24564041 +1 2.6831013 +1 3.0849176 +1
C 6.02073370 +1 3.3771174 +1 3.1255808 +1
C 4.80989821 +1 2.6919827 +1 3.1728639 +1
C 7.22243807 +1 1.2726828 +1 3.0919420 +1
O 3.58816105 +1 -0.6848094 +1 3.4307297 +1
O 2.41915215 +1 1.1553903 +1 3.0378573 +1
O 8.43660054 +1 0.6921310 +1 2.9773831 +1
O 8.34463834 +1 3.4473508 +1 3.0492686 +1
O 6.09823157 +1 4.7225451 +1 3.1402212 +1
H 2.68382172 +1 -1.1753915 +1 3.4260483 +1
H 6.00630064 +1 -0.5156220 +1 3.1543972 +1
H 8.47235760 +1 -0.2763383 +1 3.2123728 +1
H 9.20151398 +1 2.9499358 +1 2.8175071 +1
H 3.87565335 +1 3.2582670 +1 3.2175377 +1
H 5.31044339 +1 5.1422875 +1 2.6555698 +1
C 3.42538145 +1 -5.0631894 +1 0.5068068 +1
C 2.12735544 +1 -5.7427270 +1 0.5295696 +1
C 0.92599246 +1 -5.0234117 +1 0.5285909 +1
C -0.29719298 +1 -7.1344963 +1 0.6317528 +1
C 0.92783646 +1 -7.8226769 +1 0.6514571 +1
C 2.13707357 +1 -7.1364697 +1 0.5788629 +1
C -0.27783026 +1 -5.7232686 +1 0.5765663 +1
O 3.34776417 +1 -3.7514265 +1 0.3073777 +1
O 4.52490583 +1 -5.5971223 +1 0.6502768 +1
O -1.49892721 +1 -5.1534166 +1 0.6272633 +1
O -1.41447210 +1 -7.8792084 +1 0.6652536 +1
O 0.86603097 +1 -9.1715328 +1 0.7721026 +1
H 4.24716309 +1 -3.2614275 +1 0.3095143 +1
H 0.93181776 +1 -3.9325082 +1 0.5030282 +1
H -1.52674350 +1 -4.1746635 +1 0.4388226 +1
H -2.26546165 +1 -7.3451392 +1 0.8441707 +1
H 3.07235558 +1 -7.7022613 +1 0.5570334 +1
H 1.74117959 +1 -9.5590860 +1 1.1259163 +1
O 4.00448543 +1 5.5476424 +1 1.7029083 +1
H 4.34089526 +1 6.2359672 +1 1.0928760 +1
H 3.68018372 +1 4.8358243 +1 1.1236581 +1
O 3.00234135 +1 -9.9739195 +1 2.0692408 +1
H 2.66367126 +1 -10.6814374 +1 2.6459395 +1
H 3.33375601 +1 -9.2817858 +1 2.6857516 +1
O -0.74407362 +1 -9.1738980 +1 2.9250573 +1
H -1.42422857 +1 -8.9067065 +1 2.2723501 +1
H -0.00890810 +1 -9.3360611 +1 2.2800599 +1
O -0.50573125 +1 -6.9273683 +1 4.3767950 +1
H -0.65595470 +1 -6.9777517 +1 5.3461712 +1
H -0.62386305 +1 -7.8193685 +1 3.9956944 +1
Tv 8.42251643 +1 12.0423173 +1 -3.7116327 +1
Tv -6.67808899 +1 3.0090817 +1 -0.5345732 +1
Tv 1.06784528 +1 -3.3224606 +1 -6.0540568 +1
Optimized PM6_D3H4 data set:
MERS=(1,1,1) CHARGE=0 EF OUTPUT THREADS=1 PM6-D3H4 GRADIENTS
XXI form 3 Gallic acid monohydrate (PM6-D3H4)
C 0.14585435 +1 0.2015116 +1 -0.1560125 +1
C 2.62563924 +1 0.1422477 +1 -0.1577198 +1
C 1.44519688 +1 0.8979539 +1 -0.2351265 +1
C 3.90659138 +1 2.2108385 +1 -0.4042835 +1
C 1.46530448 +1 2.2891250 +1 -0.4020006 +1
C 3.85340937 +1 0.8068024 +1 -0.2409646 +1
C 2.70132862 +1 2.9421821 +1 -0.4911464 +1
O 0.24575338 +1 -1.1352963 +1 -0.0965928 +1
O -0.98099691 +1 0.7168326 +1 -0.1376377 +1
O 2.86380054 +1 4.2818419 +1 -0.6484197 +1
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O 5.06303908 +1 2.9288149 +1 -0.4592507 +1
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