Time stamp: Thu Mar 11 08:55:57 2021
XVI 2-Diazo-3,5-cyclohexadiene-1-one
107 XVI 2-Diazo-3,5-cyclohexadiene-1-one
(Previous) Tetramethylurea (TIDBIR)
(Back) Elements:
C 6
H 4
O 1
N 2
(Z = 8)
(Periodic Table)
(Next) Isonicotinamide (EHOWIH)
This is one of the solids used in the blind tests of crystal structure prediction.
See: "Significant progress in predicting the crystal structures of small organic molecules - a report on the fourth blind test", Acta Crys. B 865, 107-125 (2009), and
"Towards crystal structure prediction of complex organic compounds - a report on the fifth blind test", Bardwell, et. al Acta Cryst. (2011). B67, 535-551
The complete set consists of 22 solids.
Unit Cell Parameters: a b c alpha beta gamma Volume Density Heat of Formation (Kcal/mol)
X-ray: 16.18 7.38 9.64 90.00 90.00 90.00 1152.21 1.385 55.1 calc'd using PM7
PM7: 15.60 7.79 9.17 89.48 89.80 89.90 1114.31 1.432 25.6 calc'd using PM7 (ref: 0.0)
PM6_D3H4: 16.26 7.34 9.94 90.07 90.06 90.21 1186.76 1.344 28.5 calc'd using PM6_D3H4
X-Ray PM7 PM6_D3H4
|
Calc'd on: Feb 26 2021 @ 03:26:00 |
Feb 25 2021 @ 07:29:07
ARC file |
Feb 27 2021 @ 20:04:36 |
X-Ray data set:
MERS=(1,1,1) CHARGE=0 OUTPUT THREADS=1 1SCF GRADIENTS
XVI 2-Diazo-3,5-cyclohexadiene-1-one
C 0.00000000 +1 0.0000000 +1 0.0000000 +1
C 1.45466900 +1 0.0000000 +1 0.0000000 +1
C 2.28513930 +1 1.1524123 +1 0.0000000 +1
H 3.24124701 +1 1.0297599 +1 0.0020956 +1
C 1.67544907 +1 2.3652019 +1 -0.0239377 +1
H 2.18383630 +1 3.1610246 +1 -0.0179647 +1
C 0.25467431 +1 2.4425605 +1 -0.0495661 +1
H -0.15002464 +1 3.3259190 +1 -0.0654109 +1
C -0.54326756 +1 1.3428840 +1 -0.0311851 +1
H -1.49202451 +1 1.4081597 +1 -0.0597926 +1
O -0.67853983 +1 -1.0478026 +1 0.0234101 +1
N 1.99842895 +1 -1.2418090 +1 -0.0463556 +1
N 2.31663567 +1 -2.3022108 +1 -0.0885090 +1
C -0.70450090 +1 -7.9550986 +1 2.0861981 +1
C -2.13152724 +1 -8.2369751 +1 2.1384144 +1
C -3.16802258 +1 -7.3449187 +1 1.7565710 +1
H -4.08243201 +1 -7.6430376 +1 1.8326668 +1
C -2.80687705 +1 -6.1106000 +1 1.3223698 +1
H -3.45842980 +1 -5.4830670 +1 1.0507093 +1
C -1.42995527 +1 -5.7546468 +1 1.2669634 +1
H -1.20395954 +1 -4.8635010 +1 0.9514516 +1
C -0.43393122 +1 -6.6122103 +1 1.6146111 +1
H 0.48342174 +1 -6.3584403 +1 1.5840515 +1
O 0.16439973 +1 -8.7882417 +1 2.4145490 +1
N -2.42496113 +1 -9.4598807 +1 2.6462015 +1
N -2.53407383 +1 -10.4742696 +1 3.0758688 +1
C 2.48903074 +1 -8.7937082 +1 6.8072928 +1
C 1.72597740 +1 -8.9534954 +1 5.5785957 +1
C 1.16308802 +1 -10.1677275 +1 5.1032223 +1
H 0.67293078 +1 -10.1527268 +1 4.2733362 +1
C 1.37018894 +1 -11.2875059 +1 5.8423854 +1
H 1.01191160 +1 -12.1185887 +1 5.5720988 +1
C 2.12917907 +1 -11.2129247 +1 7.0440749 +1
H 2.25849923 +1 -12.0326606 +1 7.5491475 +1
C 2.65310500 +1 -10.0489858 +1 7.5121410 +1
H 3.16856702 +1 -10.0141551 +1 8.3105246 +1
O 2.94103092 +1 -7.6945229 +1 7.1867046 +1
N 1.61686748 +1 -7.8117302 +1 4.8547749 +1
N 1.60056548 +1 -6.8224108 +1 4.3589285 +1
C -2.79833357 +1 -3.0750662 +1 -3.9896853 +1
C -2.06292179 +1 -2.6334023 +1 -2.8132040 +1
C -1.29400773 +1 -3.4636381 +1 -1.9559874 +1
H -0.84554909 +1 -3.0578681 +1 -1.2042922 +1
C -1.25256359 +1 -4.7909691 +1 -2.2370112 +1
H -0.75025352 +1 -5.3830664 +1 -1.7005715 +1
C -1.96770019 +1 -5.2988624 +1 -3.3576655 +1
H -1.91831706 +1 -6.2536300 +1 -3.5313813 +1
C -2.68970860 +1 -4.5055613 +1 -4.1917607 +1
H -3.17376659 +1 -4.8594371 +1 -4.9309766 +1
O -3.44069461 +1 -2.2933062 +1 -4.7208582 +1
N -2.20327032 +1 -1.3102776 +1 -2.5503490 +1
N -2.39692988 +1 -0.2249830 +1 -2.4424821 +1
C 2.87577557 +1 -1.1530936 +1 3.2169080 +1
C 1.42110657 +1 -1.1530936 +1 3.2169081 +1
C 0.59063622 +1 -2.3055059 +1 3.2169082 +1
H -0.36547149 +1 -2.1828534 +1 3.2148127 +1
C 1.20032636 +1 -3.5182955 +1 3.2408459 +1
H 0.69280693 +1 -4.3139436 +1 3.2353385 +1
C 2.62110109 +1 -3.5956546 +1 3.2664744 +1
H 3.02580026 +1 -4.4790129 +1 3.2823191 +1
C 3.41904301 +1 -2.4959782 +1 3.2480933 +1
H 4.36779999 +1 -2.5612533 +1 3.2767011 +1
O 3.55431582 +1 -0.1052913 +1 3.1934983 +1
N 0.87821391 +1 0.0888906 +1 3.2637293 +1
N 0.55913983 +1 1.1491170 +1 3.3054172 +1
C -3.18507727 +1 -10.7156809 +1 -0.3992995 +1
C -1.75805094 +1 -10.4338043 +1 -0.4515157 +1
C -0.72155587 +1 -11.3258611 +1 -0.0696724 +1
H 0.19285385 +1 -11.0277429 +1 -0.1457678 +1
C -1.08270096 +1 -12.5601799 +1 0.3645288 +1
H -0.43114876 +1 -13.1877121 +1 0.6361889 +1
C -2.45962275 +1 -12.9161331 +1 0.4199353 +1
H -2.68561855 +1 -13.8072788 +1 0.7354472 +1
C -3.45564662 +1 -12.0585694 +1 0.0722874 +1
H -4.37299960 +1 -12.3123393 +1 0.1028472 +1
O -4.05397822 +1 -9.8825381 +1 -0.7276502 +1
N -1.46461686 +1 -9.2108986 +1 -0.9593025 +1
N -1.35550437 +1 -8.1965099 +1 -1.3889702 +1
C 1.98892456 +1 -8.1904324 +1 -0.6297778 +1
C 2.75197807 +1 -8.0306451 +1 0.5989192 +1
C 3.31486744 +1 -6.8164130 +1 1.0742926 +1
H 3.80502450 +1 -6.8314144 +1 1.9041787 +1
C 3.10776664 +1 -5.6966355 +1 0.3351299 +1
H 3.46691163 +1 -4.8653774 +1 0.6058823 +1
C 2.34877652 +1 -5.7712167 +1 -0.8665597 +1
H 2.21945636 +1 -4.9514807 +1 -1.3716321 +1
C 1.82485051 +1 -6.9351556 +1 -1.3346258 +1
H 1.30938854 +1 -6.9699863 +1 -2.1330095 +1
O 1.53692472 +1 -9.2896178 +1 -1.0091895 +1
N 2.86195551 +1 -9.1722351 +1 1.3232053 +1
N 2.87739004 +1 -10.1617299 +1 1.8185864 +1
C -2.69342399 +1 0.2353341 +1 2.7159760 +1
C -3.42883557 +1 -0.2063299 +1 1.5394946 +1
C -4.19775041 +1 0.6239062 +1 0.6822773 +1
H -4.64620856 +1 0.2181365 +1 -0.0694171 +1
C -4.23919423 +1 1.9512361 +1 0.9633012 +1
H -4.74150455 +1 2.5433334 +1 0.4268617 +1
C -3.52405754 +1 2.4591290 +1 2.0839556 +1
H -3.57344067 +1 3.4138976 +1 2.2576713 +1
C -2.80204915 +1 1.6658280 +1 2.9180508 +1
H -2.31799135 +1 2.0197043 +1 3.6572666 +1
O -2.05106317 +1 -0.5464266 +1 3.4471484 +1
N -3.28848668 +1 -1.5294546 +1 1.2766396 +1
N -3.09482741 +1 -2.6147503 +1 1.1687727 +1
Tv -1.60217882 +1 15.8310469 +1 -2.9606079 +1
Tv 3.59747151 +1 -0.8311411 +1 -6.3911324 +1
Tv 8.36753399 +1 1.6866386 +1 4.4906171 +1
Optimized PM7 data set:
MERS=(1,1,1) CHARGE=0 OUTPUT THREADS=1 PM7 GRADIENTS NOTXT EF
XVI 2-Diazo-3,5-cyclohexadiene-1-one
C 0.01170058 +1 -0.0713244 +1 -0.0903272 +1
C 1.44888498 +1 -0.2544291 +1 -0.2697344 +1
C 2.34435971 +1 0.8400944 +1 -0.0642512 +1
H 3.41377279 +1 0.6687336 +1 -0.2306132 +1
C 1.86656162 +1 2.0537606 +1 0.3211270 +1
H 2.53474923 +1 2.8980974 +1 0.4926667 +1
C 0.46205087 +1 2.2525474 +1 0.5083041 +1
H 0.12595035 +1 3.2524135 +1 0.8032014 +1
C -0.42780864 +1 1.2449021 +1 0.3192197 +1
H -1.50011761 +1 1.3715076 +1 0.4666828 +1
O -0.76451904 +1 -1.0065170 +1 -0.2809701 +1
N 1.88467629 +1 -1.4568499 +1 -0.6369035 +1
N 2.19874487 +1 -2.4966677 +1 -0.9117304 +1
C -0.72164319 +1 -7.7012630 +1 2.1665867 +1
C -2.10888572 +1 -8.0671381 +1 2.4377303 +1
C -3.17699184 +1 -7.2918551 +1 1.8894599 +1
H -4.20456430 +1 -7.5853223 +1 2.1319901 +1
C -2.90880101 +1 -6.2215872 +1 1.0944149 +1
H -3.71088227 +1 -5.6248535 +1 0.6592111 +1
C -1.55653349 +1 -5.8483081 +1 0.8120969 +1
H -1.39348635 +1 -4.9699207 +1 0.1780000 +1
C -0.50922073 +1 -6.5498675 +1 1.3161338 +1
H 0.52814209 +1 -6.2909662 +1 1.1060377 +1
O 0.20144232 +1 -8.3584791 +1 2.6456547 +1
N -2.33679006 +1 -9.1272233 +1 3.2084663 +1
N -2.47223685 +1 -10.0483899 +1 3.8319481 +1
C 2.36508665 +1 -8.7847396 +1 6.7752652 +1
C 1.71474289 +1 -8.8068740 +1 5.4688652 +1
C 0.92912780 +1 -9.9341373 +1 5.0764880 +1
H 0.47717323 +1 -9.9244884 +1 4.0780116 +1
C 0.75996832 +1 -10.9813391 +1 5.9274344 +1
H 0.15588880 +1 -11.8452859 +1 5.6499239 +1
C 1.38016797 +1 -10.9750000 +1 7.2168059 +1
H 1.22291209 +1 -11.8476300 +1 7.8602371 +1
C 2.14386147 +1 -9.9311569 +1 7.6294337 +1
H 2.61800153 +1 -9.9010145 +1 8.6099133 +1
O 3.05813371 +1 -7.8242841 +1 7.1086310 +1
N 1.88129481 +1 -7.7565105 +1 4.6696314 +1
N 2.02311763 +1 -6.8335331 +1 4.0502254 +1
C -2.69639179 +1 -3.2534909 +1 -3.9222637 +1
C -2.08971359 +1 -2.6969894 +1 -2.7169312 +1
C -1.13260060 +1 -3.4581652 +1 -1.9774890 +1
H -0.71813280 +1 -3.0151012 +1 -1.0653668 +1
C -0.76265906 +1 -4.6948175 +1 -2.4051786 +1
H -0.02694547 +1 -5.2867976 +1 -1.8602976 +1
C -1.33787364 +1 -5.2543739 +1 -3.5898780 +1
H -1.01594073 +1 -6.2594294 +1 -3.8843140 +1
C -2.25665147 +1 -4.5728843 +1 -4.3207675 +1
H -2.69934302 +1 -4.9746515 +1 -5.2313711 +1
O -3.53549474 +1 -2.6084242 +1 -4.5496308 +1
N -2.46278595 +1 -1.4781760 +1 -2.3355967 +1
N -2.78670096 +1 -0.4366328 +1 -2.0789864 +1
C 2.82125771 +1 -1.4616881 +1 3.1338960 +1
C 1.38762932 +1 -1.2306825 +1 3.2838337 +1
C 0.46158119 +1 -2.2957994 +1 3.0597790 +1
H -0.60394100 +1 -2.0935012 +1 3.2139667 +1
C 0.90570630 +1 -3.5211575 +1 2.6726904 +1
H 0.21093208 +1 -4.3396257 +1 2.4843095 +1
C 2.30561688 +1 -3.7635943 +1 2.5039262 +1
H 2.61316573 +1 -4.7691972 +1 2.1967926 +1
C 3.22475209 +1 -2.7889820 +1 2.7233963 +1
H 4.29421671 +1 -2.9506667 +1 2.5940578 +1
O 3.62353189 +1 -0.5526895 +1 3.3434827 +1
N 0.98152406 +1 -0.0137424 +1 3.6372304 +1
N 0.69048267 +1 1.0360215 +1 3.8991689 +1
C -3.12088181 +1 -10.6171510 +1 -0.2594244 +1
C -1.74653378 +1 -10.2013571 +1 -0.5251114 +1
C -0.65392889 +1 -10.9431922 +1 0.0218364 +1
H 0.36307887 +1 -10.6172716 +1 -0.2206560 +1
C -0.88673630 +1 -12.0243305 +1 0.8125759 +1
H -0.06466466 +1 -12.5956345 +1 1.2447658 +1
C -2.22616577 +1 -12.4410727 +1 1.0948646 +1
H -2.36083898 +1 -13.3228779 +1 1.7313330 +1
C -3.29599196 +1 -11.7764675 +1 0.5885039 +1
H -4.32317796 +1 -12.0717175 +1 0.7979607 +1
O -4.06375655 +1 -9.9899529 +1 -0.7403770 +1
N -1.55163913 +1 -9.1304966 +1 -1.2905900 +1
N -1.44317741 +1 -8.2032957 +1 -1.9104506 +1
C 1.89445169 +1 -7.9513346 +1 -0.8653818 +1
C 2.56862872 +1 -7.9752556 +1 0.4295777 +1
C 3.39250176 +1 -6.8781762 +1 0.8299646 +1
H 3.85114861 +1 -6.9157909 +1 1.8239394 +1
C 3.58664010 +1 -5.8254883 +1 -0.0083537 +1
H 4.22244447 +1 -4.9866601 +1 0.2757543 +1
C 2.95336170 +1 -5.7925603 +1 -1.2913100 +1
H 3.13968300 +1 -4.9214512 +1 -1.9291582 +1
C 2.14213954 +1 -6.7991482 +1 -1.7046281 +1
H 1.65335791 +1 -6.7973096 +1 -2.6782000 +1
O 1.16688109 +1 -8.8837809 +1 -1.2037040 +1
N 2.38990854 +1 -9.0395097 +1 1.2072532 +1
N 2.23577121 +1 -9.9756747 +1 1.8036502 +1
C -2.59505942 +1 0.3104532 +1 2.9274889 +1
C -3.21242564 +1 -0.2930436 +1 1.7502391 +1
C -4.19792110 +1 0.4286180 +1 1.0082801 +1
H -4.61294203 +1 -0.0420876 +1 0.1107264 +1
C -4.59325414 +1 1.6644036 +1 1.4145339 +1
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C -4.01469092 +1 2.2655993 +1 2.5774833 +1
H -4.36364346 +1 3.2650510 +1 2.8611148 +1
C -3.06035334 +1 1.6280438 +1 3.3022084 +1
H -2.61122784 +1 2.0627797 +1 4.1942689 +1
O -1.73086862 +1 -0.2998802 +1 3.5555793 +1
N -2.82626932 +1 -1.5171620 +1 1.4000332 +1
N -2.49159599 +1 -2.5621982 +1 1.1729131 +1
Tv -1.36117331 +1 15.2877175 +1 -2.7932260 +1
Tv 3.63003117 +1 -0.9109237 +1 -6.8328270 +1
Tv 8.10806932 +1 1.4886838 +1 4.0140699 +1
Optimized PM6_D3H4 data set:
MERS=(1,1,1) CHARGE=0 EF OUTPUT THREADS=1 PM6-D3H4 GRADIENTS
XVI 2-Diazo-3,5-cyclohexadiene-1-one (PM6-D3H4)
C 0.01472790 +1 0.0107458 +1 -0.0234662 +1
C 1.47716779 +1 -0.1500274 +1 0.0462711 +1
C 2.32712680 +1 1.0011286 +1 0.2309318 +1
H 3.41241988 +1 0.8327222 +1 0.2592538 +1
C 1.78415025 +1 2.2394859 +1 0.3624604 +1
H 2.40639234 +1 3.1222251 +1 0.5067256 +1
C 0.35485651 +1 2.4213401 +1 0.3086882 +1
H -0.02436891 +1 3.4431370 +1 0.4148939 +1
C -0.48484911 +1 1.3695441 +1 0.1332928 +1
H -1.56998862 +1 1.4830410 +1 0.0987841 +1
O -0.71898973 +1 -0.9689753 +1 -0.1957970 +1
N 1.99168828 +1 -1.3720197 +1 -0.1173155 +1
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C -0.69778672 +1 -7.9321327 +1 2.1414055 +1
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C -3.15782582 +1 -7.5136655 +1 1.7269260 +1
H -4.19097476 +1 -7.8785311 +1 1.8117742 +1
C -2.86154829 +1 -6.3045070 +1 1.1827956 +1
H -3.64239022 +1 -5.6428441 +1 0.8078327 +1
C -1.49272929 +1 -5.8605789 +1 1.0879736 +1
H -1.31410575 +1 -4.8745066 +1 0.6461420 +1
C -0.46580080 +1 -6.6316011 +1 1.5286799 +1
H 0.57924237 +1 -6.3231271 +1 1.4525435 +1
O 0.20571997 +1 -8.6518220 +1 2.5819006 +1
N -2.37725942 +1 -9.5403710 +1 2.7974392 +1
N -2.56655931 +1 -10.5331428 +1 3.2790687 +1
C 2.65938878 +1 -8.8118384 +1 6.8023639 +1
C 1.88824505 +1 -8.8045506 +1 5.5464321 +1
C 1.19776885 +1 -9.9955061 +1 5.1123246 +1
H 0.66189414 +1 -9.9512855 +1 4.1542066 +1
C 1.21950494 +1 -11.1187820 +1 5.8761787 +1
H 0.70217862 +1 -12.0271826 +1 5.5684721 +1
C 1.93998741 +1 -11.1389601 +1 7.1255529 +1
H 1.92383140 +1 -12.0679450 +1 7.7044761 +1
C 2.61673299 +1 -10.0493837 +1 7.5685751 +1
H 3.16733083 +1 -10.0417447 +1 8.5113086 +1
O 3.28893056 +1 -7.8116141 +1 7.1629825 +1
N 1.88289812 +1 -7.6947934 +1 4.8026333 +1
N 1.88050244 +1 -6.7390434 +1 4.2194185 +1
C -2.95166611 +1 -3.0818945 +1 -3.9706118 +1
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H -0.50276497 +1 -5.2364273 +1 -1.7258258 +1
C -1.82630073 +1 -5.2023547 +1 -3.4543060 +1
H -1.62575987 +1 -6.2594843 +1 -3.6561545 +1
C -2.66868638 +1 -4.4844617 +1 -4.2397129 +1
H -3.17816111 +1 -4.9143261 +1 -5.1042074 +1
O -3.73089910 +1 -2.4025633 +1 -4.6477770 +1
N -2.48828232 +1 -1.2111110 +1 -2.5162279 +1
N -2.70806389 +1 -0.1343222 +1 -2.3019128 +1
C 2.92841857 +1 -1.1292805 +1 3.4512051 +1
C 1.46494399 +1 -0.9701926 +1 3.3871187 +1
C 0.61462692 +1 -2.1205257 +1 3.1983650 +1
H -0.47143837 +1 -1.9528105 +1 3.1763674 +1
C 1.15837178 +1 -3.3573595 +1 3.0553162 +1
H 0.53693914 +1 -4.2406792 +1 2.9080567 +1
C 2.58862478 +1 -3.5368778 +1 3.1000934 +1
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C 3.42873532 +1 -2.4861428 +1 3.2810495 +1
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O 3.66004139 +1 -0.1498149 +1 3.6330936 +1
N 0.95023136 +1 0.2507329 +1 3.5585982 +1
N 0.56106889 +1 1.2926429 +1 3.6854140 +1
C -3.25888948 +1 -10.7942257 +1 -0.6280112 +1
C -1.85986685 +1 -10.3314830 +1 -0.6567932 +1
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O -4.16186084 +1 -10.0921995 +1 -1.0964525 +1
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C 1.93448310 +1 -8.1825477 +1 -0.5565807 +1
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C 2.63455516 +1 -5.8504922 +1 -0.8772883 +1
H 2.63814543 +1 -4.9192201 +1 -1.4528405 +1
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O 1.30767712 +1 -9.1856894 +1 -0.9154452 +1
N 2.73406291 +1 -9.3056142 +1 1.4298548 +1
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