Time stamp: Thu Mar 11 08:55:57 2021
Uric acid (URICAC)
201 Uric acid (URICAC)
(Previous) 2-(2-(3-Carboxypyridyl))-4-isopropyl-4-methyl-5-oxo-imidazole (JAZCOC01)
(Back) Elements:
C 5
H 4
N 4
O 3
(Z = 8)
(Periodic Table)
(Next) Theophylline urea
Unit Cell Parameters: a b c alpha beta gamma Volume Density Heat of Formation (Kcal/mol)
X-ray: 6.21 7.40 14.46 90.00 65.09 90.00 602.84 1.852 -104.7 calc'd using PM7
PM7: 6.23 7.47 14.65 88.63 65.54 89.79 620.92 1.798 -147.3 calc'd using PM7 (ref: 0.0)
PM6_D3H4: 6.31 7.66 14.88 88.20 63.77 89.84 644.83 1.732 -147.9 calc'd using PM6_D3H4
X-Ray PM7 PM6_D3H4
|
Calc'd on: Feb 26 2021 @ 03:32:08 |
Feb 25 2021 @ 05:45:49
ARC file |
Feb 27 2021 @ 18:07:21 |
For X-Ray structure, contact the CCDC: http://www.ccdc.cam.ac.uk/
Optimized PM7 data set:
MERS=(2,1,1) CHARGE=0 OUTPUT THREADS=1 PM7 GRADIENTS NOTXT EF
Uric acid (URICAC)
h=-147.9 hr=nist
C -0.02356362 +1 0.0330783 +1 0.0013824 +1
C 2.35893566 +1 0.0051911 +1 -0.0256763 +1
C 2.41078799 +1 1.4134529 +1 -0.0289620 +1
C 1.22845594 +1 2.2044581 +1 0.0310402 +1
C 4.53607516 +1 0.6429243 +1 -0.0453535 +1
H -0.85446021 +1 1.9551640 +1 0.1053616 +1
H 1.14861993 +1 -1.7127207 +1 -0.2099611 +1
H 4.09156770 +1 2.7457649 +1 0.0324092 +1
H 3.95376828 +1 -1.4454952 +1 -0.0820397 +1
N 0.04137291 +1 1.4316035 +1 0.0807032 +1
N 1.17927167 +1 -0.6919701 +1 -0.0338284 +1
N 3.76573204 +1 1.7922015 +1 -0.1050385 +1
N 3.65439548 +1 -0.4751340 +1 -0.0195561 +1
O -1.09258336 +1 -0.5514134 +1 -0.0180326 +1
O 1.13634080 +1 3.4166163 +1 0.0687463 +1
O 5.75885328 +1 0.5625405 +1 -0.0886306 +1
C 8.00607045 +1 -2.4893432 +1 0.4615082 +1
C 6.73885330 +1 -1.9159307 +1 2.3948784 +1
C 7.06680163 +1 -3.1404570 +1 3.0118343 +1
C 7.90329636 +1 -4.0993336 +1 2.3778441 +1
C 5.73756601 +1 -1.9812997 +1 4.4288386 +1
H 8.98856243 +1 -4.3391683 +1 0.5947595 +1
H 6.80310156 +1 -0.7607618 +1 0.6278844 +1
H 6.54283134 +1 -3.9077045 +1 4.9499850 +1
H 5.48543735 +1 -0.3005219 +1 3.0708787 +1
N 8.37020321 +1 -3.6786963 +1 1.1056032 +1
N 7.17732814 +1 -1.5791528 +1 1.1437483 +1
N 6.42273280 +1 -3.1722596 +1 4.2620767 +1
N 5.94875019 +1 -1.1873539 +1 3.2671339 +1
O 8.40190747 +1 -2.2225444 +1 -0.6599448 +1
O 8.25076419 +1 -5.1868011 +1 2.7973245 +1
O 5.03865870 +1 -1.6857554 +1 5.3916904 +1
C 5.54735715 +1 4.3163934 +1 3.0001142 +1
C 3.16003094 +1 4.3664553 +1 3.0314763 +1
C 3.10211760 +1 2.9595313 +1 3.0168871 +1
C 4.27904879 +1 2.1620078 +1 2.9516444 +1
C 0.97875672 +1 3.7392242 +1 3.0204206 +1
H 6.37148922 +1 2.3884156 +1 2.8885686 +1
H 4.39026528 +1 6.0732256 +1 3.2026050 +1
H 1.42290397 +1 1.6282816 +1 2.9347026 +1
H 1.57065902 +1 5.8193785 +1 3.1003204 +1
N 5.47841905 +1 2.9164665 +1 2.9122002 +1
N 4.34507688 +1 5.0511716 +1 3.0506298 +1
N 1.74401927 +1 2.5848370 +1 3.0808170 +1
N 1.86860154 +1 4.8552732 +1 3.0136457 +1
O 6.61588629 +1 4.8966912 +1 3.0028414 +1
O 4.33575875 +1 0.9490197 +1 2.8839125 +1
O -0.23959085 +1 3.8478155 +1 3.0533537 +1
C 4.96333006 +1 -5.5598055 +1 1.7451368 +1
C 6.24056989 +1 -6.1392912 +1 -0.1782103 +1
C 5.91326807 +1 -4.9185940 +1 -0.7996266 +1
C 5.06846700 +1 -3.9623147 +1 -0.1728532 +1
C 7.22669906 +1 -6.0920640 +1 -2.2219540 +1
H 3.95924499 +1 -3.7166021 +1 1.6015301 +1
H 6.15616418 +1 -7.2946508 +1 1.5901859 +1
H 6.42130445 +1 -4.1627165 +1 -2.7444785 +1
H 7.47370122 +1 -7.7632395 +1 -0.8528391 +1
N 4.62216282 +1 -4.3599854 +1 1.1145936 +1
N 5.80984786 +1 -6.4637270 +1 1.0784326 +1
N 6.56246815 +1 -4.8878967 +1 -2.0483575 +1
N 7.02124780 +1 -6.8760035 +1 -1.0482114 +1
O 4.55371812 +1 -5.8399117 +1 2.8624045 +1
O 4.72171221 +1 -2.8844791 +1 -0.6132856 +1
O 7.91588864 +1 -6.4173789 +1 -3.1768108 +1
C -5.34270032 +1 -0.3027452 +1 3.1987631 +1
C -2.95968074 +1 -0.3343357 +1 3.1736599 +1
C -2.90453316 +1 1.0733007 +1 3.1697787 +1
C -4.08566488 +1 1.8671059 +1 3.2249883 +1
C -0.78130968 +1 0.2943835 +1 3.1585361 +1
H -6.17013618 +1 1.6211071 +1 3.3008665 +1
H -4.17464456 +1 -2.0526378 +1 2.9980920 +1
H -1.22228868 +1 2.4015541 +1 3.2287724 +1
H -1.37117340 +1 -1.7906367 +1 3.1109250 +1
N -5.27651388 +1 1.0973558 +1 3.2784683 +1
N -4.13633385 +1 -1.0289641 +1 3.1597641 +1
N -1.54749327 +1 1.4470094 +1 3.0940088 +1
N -1.66633473 +1 -0.8199429 +1 3.1863471 +1
O -6.41192533 +1 -0.8832305 +1 3.1837024 +1
O -4.17138159 +1 3.0797788 +1 3.2623038 +1
O 0.44083933 +1 0.2092363 +1 3.1180161 +1
C 2.68349743 +1 -2.8266342 +1 3.6568703 +1
C 1.42054760 +1 -2.2532227 +1 5.5920761 +1
C 1.75088714 +1 -3.4756498 +1 6.2106912 +1
C 2.58955133 +1 -4.4358906 +1 5.5765906 +1
C 0.42601052 +1 -2.3145755 +1 7.6280290 +1
H 3.67311804 +1 -4.6727898 +1 3.7926625 +1
H 1.48072875 +1 -1.0983037 +1 3.8216964 +1
H 1.23022106 +1 -4.2382787 +1 8.1505291 +1
H 0.18063394 +1 -0.6301262 +1 6.2698178 +1
N 3.05145762 +1 -4.0122143 +1 4.3029739 +1
N 1.84433865 +1 -1.9254286 +1 4.3323583 +1
N 1.10685932 +1 -3.5074433 +1 7.4604332 +1
N 0.63297706 +1 -1.5237511 +1 6.4634030 +1
O 3.09019721 +1 -2.5504951 +1 2.5398620 +1
O 2.93999929 +1 -5.5214057 +1 5.9928066 +1
O -0.27048215 +1 -2.0188049 +1 8.5920285 +1
C 0.22991258 +1 3.9824684 +1 6.1910088 +1
C -2.15533734 +1 4.0284680 +1 6.2215615 +1
C -2.21433849 +1 2.6225674 +1 6.2120528 +1
C -1.03852527 +1 1.8227969 +1 6.1465059 +1
C -4.33840436 +1 3.3996403 +1 6.2175379 +1
H 1.05346011 +1 2.0523143 +1 6.0829154 +1
H -0.93038318 +1 5.7371508 +1 6.3897847 +1
H -3.89454845 +1 1.2910773 +1 6.1312210 +1
H -3.74143128 +1 5.4824975 +1 6.2901590 +1
N 0.15864273 +1 2.5825219 +1 6.1065226 +1
N -0.97541855 +1 4.7175588 +1 6.2332219 +1
N -3.57190516 +1 2.2472161 +1 6.2795927 +1
N -3.44723138 +1 4.5164456 +1 6.2113247 +1
O 1.29813707 +1 4.5648430 +1 6.1982320 +1
O -0.97740766 +1 0.6110499 +1 6.0806344 +1
O -5.55717172 +1 3.5047895 +1 6.2486655 +1
C -0.35269836 +1 -5.8931504 +1 4.9489557 +1
C 0.92481382 +1 -6.4775560 +1 3.0206942 +1
C 0.60103166 +1 -5.2560286 +1 2.4004040 +1
C -0.24000930 +1 -4.2969315 +1 3.0287931 +1
C 1.90795128 +1 -6.4302671 +1 0.9740212 +1
H -1.34506355 +1 -4.0446187 +1 4.8054417 +1
H 0.83815891 +1 -7.6294526 +1 4.7880189 +1
H 1.10183169 +1 -4.5005221 +1 0.4530947 +1
H 2.16561397 +1 -8.0972431 +1 2.3474413 +1
N -0.71920983 +1 -4.7091395 +1 4.2991671 +1
N 0.48437232 +1 -6.8044019 +1 4.2749067 +1
N 1.25481136 +1 -5.2212532 +1 1.1529778 +1
N 1.70414393 +1 -7.2151789 +1 2.1476022 +1
O -0.76241465 +1 -6.1700698 +1 6.0627378 +1
O -0.58703223 +1 -3.2200837 +1 2.5810116 +1
O 2.59963797 +1 -6.7557664 +1 0.0169870 +1
Tv -10.67417364 +1 -0.6698470 +1 6.3958806 +1
Tv -3.69711748 +1 -1.6330748 +1 -6.2878024 +1
Tv -7.45453397 +1 12.5930161 +1 0.6955384 +1
Optimized PM6_D3H4 data set:
MERS=(2,1,1) CHARGE=0 EF OUTPUT THREADS=1 PM6-D3H4 GRADIENTS
Uric acid (URICAC) (PM6-D3H4)
C -0.12960320 +1 0.0722906 +1 -0.0531745 +1
C 2.29084254 +1 -0.0091310 +1 -0.0191507 +1
C 2.36218002 +1 1.3983615 +1 -0.0861422 +1
C 1.20091240 +1 2.2398026 +1 -0.1030005 +1
C 4.50193643 +1 0.5998304 +1 -0.0084359 +1
H -0.92422176 +1 2.0284711 +1 -0.0847532 +1
H 1.02353130 +1 -1.7270811 +1 -0.0716201 +1
H 4.07419578 +1 2.7346817 +1 -0.1168666 +1
H 3.87188643 +1 -1.5107371 +1 0.0720750 +1
N -0.02412804 +1 1.4852017 +1 -0.0764632 +1
N 1.07627648 +1 -0.6835721 +1 -0.0211363 +1
N 3.73402246 +1 1.7624633 +1 -0.1047950 +1
N 3.59098164 +1 -0.5141064 +1 0.0288629 +1
O -1.21651957 +1 -0.4881278 +1 -0.0621092 +1
O 1.12658666 +1 3.4559274 +1 -0.1481644 +1
O 5.72883704 +1 0.5276608 +1 0.0066782 +1
C 8.14092183 +1 -2.4821327 +1 0.4303809 +1
C 6.87061942 +1 -1.9316116 +1 2.4134575 +1
C 7.17705421 +1 -3.1827196 +1 2.9886266 +1
C 8.02992135 +1 -4.1437746 +1 2.3536947 +1
C 5.86912520 +1 -2.0392159 +1 4.4748048 +1
H 9.10888153 +1 -4.3569296 +1 0.5247915 +1
H 7.03108278 +1 -0.6701300 +1 0.6966872 +1
H 6.63839488 +1 -4.0254461 +1 4.9168877 +1
H 5.68594212 +1 -0.2653126 +1 3.1780796 +1
N 8.47364688 +1 -3.7089521 +1 1.0554767 +1
N 7.31285169 +1 -1.5732080 +1 1.1463591 +1
N 6.51681322 +1 -3.2549966 +1 4.2446910 +1
N 6.06527854 +1 -1.2222471 +1 3.3050876 +1
O 8.53632414 +1 -2.2133701 +1 -0.6963332 +1
O 8.39650316 +1 -5.2379265 +1 2.7465736 +1
O 5.19643584 +1 -1.7303028 +1 5.4560980 +1
C 5.59896082 +1 4.3882923 +1 3.0412435 +1
C 3.17895171 +1 4.4726277 +1 3.0081353 +1
C 3.10622441 +1 3.0651296 +1 3.0649998 +1
C 4.26656076 +1 2.2235238 +1 3.0834026 +1
C 0.96577138 +1 3.8650615 +1 2.9969751 +1
H 6.39112212 +1 2.4296507 +1 3.0694379 +1
H 4.44777042 +1 6.1862351 +1 3.0724863 +1
H 1.39324705 +1 1.7283696 +1 3.0884726 +1
H 1.59582430 +1 5.9731058 +1 2.9236621 +1
N 5.49329272 +1 2.9744461 +1 3.0564421 +1
N 4.39527509 +1 5.1450024 +1 3.0083608 +1
N 1.73411793 +1 2.7012915 +1 3.0809965 +1
N 1.87863331 +1 4.9784538 +1 2.9718117 +1
O 6.68809514 +1 4.9459389 +1 3.0541811 +1
O 4.33399180 +1 1.0069141 +1 3.1284128 +1
O -0.26055360 +1 3.9368533 +1 2.9808775 +1
C 5.10215909 +1 -5.6596664 +1 1.7071356 +1
C 6.37747765 +1 -6.2354029 +1 -0.2681314 +1
C 6.04145077 +1 -5.0045385 +1 -0.8689765 +1
C 5.18567043 +1 -4.0372649 +1 -0.2472888 +1
C 7.36553896 +1 -6.1511225 +1 -2.3368708 +1
H 4.11436349 +1 -3.7972892 +1 1.5850423 +1
H 6.26350694 +1 -7.4440892 +1 1.4869458 +1
H 6.56078376 +1 -4.1830698 +1 -2.8111300 +1
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