Time stamp: Thu Mar 11 08:55:57 2021
L-Lysyl-L-glutamic acid dihydrate (VEVGOS)
294 L-Lysyl-L-glutamic acid dihydrate (VEVGOS)
(Previous) Picric acid (PICRAC)
(Back) Elements:
N 3
O 7
C 11
H 25
(Z = 4)
(Periodic Table)
(Next) L-Histidinium L-aspartate monohydrate (LHLASP01)
Unit Cell Parameters: a b c alpha beta gamma Volume Density Heat of Formation (Kcal/mol)
X-ray: 5.02 12.47 13.16 65.31 90.00 90.00 748.55 1.381 -101.7 calc'd using PM7
PM7: 4.78 12.14 13.07 65.82 90.76 89.94 691.83 1.495 -491.9 calc'd using PM7 (ref: 0.0)
PM6_D3H4: 4.71 12.83 12.80 66.17 90.83 90.89 707.83 1.461 -489.7 calc'd using PM6_D3H4
X-Ray PM7 PM6_D3H4
|
Calc'd on: Feb 25 2021 @ 23:43:46 |
Feb 24 2021 @ 01:58:57
ARC file |
Feb 25 2021 @ 11:31:51 |
For X-Ray structure, contact the CCDC: http://www.ccdc.cam.ac.uk/
Optimized PM7 data set:
MERS=(2,1,1) CHARGE=0 OUTPUT THREADS=1 PM7 GRADIENTS NOTXT EF
L-Lysyl-L-glutamic acid dihydrate (VEVGOS)
N -0.05156866 +1 0.0175925 +1 0.1290234 +1
N 1.46968958 +1 -6.3141299 +1 1.5854243 +1
N 4.83221413 +1 -4.7402105 +1 1.4721548 +1
O 3.46096681 +1 -5.5228953 +1 3.1086174 +1
O 6.88407234 +1 -2.2140776 +1 2.0373140 +1
O 5.13065933 +1 -2.3936126 +1 3.3046850 +1
O 5.99173210 +1 -8.0247917 +1 2.9920857 +1
O 7.37689770 +1 -6.7464378 +1 4.0627460 +1
C 0.61093915 +1 -1.0423955 +1 0.9731442 +1
C 0.96492079 +1 -2.2423817 +1 0.0957191 +1
C 1.58497650 +1 -3.3370891 +1 0.9667310 +1
C 2.12325950 +1 -4.4548875 +1 0.0747999 +1
C 2.62697870 +1 -5.6526141 +1 0.8735225 +1
C 3.68614573 +1 -5.2965743 +1 1.9221928 +1
C 5.94765343 +1 -4.4409060 +1 2.3689863 +1
C 7.26864501 +1 -4.9638077 +1 1.7821906 +1
C 7.29666160 +1 -6.4901702 +1 1.6825214 +1
C 6.87470129 +1 -7.1415231 +1 2.9792110 +1
C 5.98807240 +1 -2.9068145 +1 2.5590053 +1
H -0.03354228 +1 0.9427925 +1 0.6220971 +1
H -1.06466645 +1 -0.2600655 +1 -0.0552959 +1
H 0.44087135 +1 0.1168642 +1 -0.7869039 +1
H 1.52800463 +1 -0.6182481 +1 1.4496362 +1
H -0.08432965 +1 -1.3382896 +1 1.7905232 +1
H 1.68061695 +1 -1.9370908 +1 -0.7005020 +1
H 0.05864807 +1 -2.6340346 +1 -0.4122804 +1
H 2.40333375 +1 -2.9183516 +1 1.5881242 +1
H 0.81598107 +1 -3.7308855 +1 1.6644614 +1
H 2.93879355 +1 -4.0638121 +1 -0.5767983 +1
H 1.32165717 +1 -4.7949293 +1 -0.6247496 +1
H 3.06208515 +1 -6.4188906 +1 0.1551909 +1
H 1.15994260 +1 -5.7977135 +1 2.4330415 +1
H 0.65874575 +1 -6.3975403 +1 0.9295177 +1
H 1.74594776 +1 -7.2690737 +1 1.8740611 +1
H 5.76847333 +1 -4.9019258 +1 3.3819934 +1
H 8.11275730 +1 -4.5961924 +1 2.3991786 +1
H 7.44147143 +1 -4.5226824 +1 0.7775573 +1
H 8.31622212 +1 -6.8386564 +1 1.4115399 +1
H 6.65153794 +1 -6.8404444 +1 0.8509447 +1
N 5.64653983 +1 -12.3363058 +1 9.4013673 +1
N 4.56452965 +1 -7.2508092 +1 5.1189179 +1
N 1.20546319 +1 -8.7711923 +1 5.5656662 +1
O 2.21425562 +1 -6.8486957 +1 6.2463375 +1
O -1.22750262 +1 -10.1851953 +1 7.3728620 +1
O 0.35840643 +1 -9.1032930 +1 8.3922732 +1
O 0.05650583 +1 -5.6721304 +1 3.7500959 +1
O -1.68842450 +1 -5.8364467 +1 5.0430229 +1
C 4.95700821 +1 -11.0628435 +1 8.9750481 +1
C 4.96822248 +1 -10.9642096 +1 7.4501942 +1
C 4.28821966 +1 -9.6636239 +1 7.0146772 +1
C 4.11502005 +1 -9.6673207 +1 5.4956579 +1
C 3.54972279 +1 -8.3559122 +1 4.9568448 +1
C 2.25387585 +1 -7.9212792 +1 5.6491554 +1
C -0.10662564 +1 -8.4393887 +1 6.1165759 +1
C -1.20417178 +1 -8.6837221 +1 5.0635917 +1
C -1.04891444 +1 -7.7939616 +1 3.8291516 +1
C -0.88599308 +1 -6.3417111 +1 4.2084395 +1
C -0.32701394 +1 -9.3190534 +1 7.3746853 +1
H 5.39409280 +1 -12.5782315 +1 10.3879291 +1
H 6.69986166 +1 -12.2101270 +1 9.3241826 +1
H 5.36260582 +1 -13.1333422 +1 8.7901666 +1
H 3.90913518 +1 -11.0622663 +1 9.3626949 +1
H 5.48483126 +1 -10.1955979 +1 9.4331712 +1
H 4.43589047 +1 -11.8367391 +1 7.0086924 +1
H 6.01160743 +1 -10.9862949 +1 7.0677405 +1
H 3.30046792 +1 -9.5600020 +1 7.5093041 +1
H 4.90347060 +1 -8.7969166 +1 7.3361849 +1
H 3.45148014 +1 -10.5117152 +1 5.1936409 +1
H 5.09840610 +1 -9.8700111 +1 5.0066095 +1
H 3.35418902 +1 -8.4678111 +1 3.8423189 +1
H 4.68775987 +1 -6.9502863 +1 6.1175487 +1
H 5.48862821 +1 -7.5730968 +1 4.7509893 +1
H 4.27617946 +1 -6.4248998 +1 4.5673107 +1
H -0.13225497 +1 -7.3623047 +1 6.4482131 +1
H -2.19703779 +1 -8.5219015 +1 5.5309159 +1
H -1.20482740 +1 -9.7475016 +1 4.7489640 +1
H -1.93419567 +1 -7.8999221 +1 3.1651587 +1
H -0.18841904 +1 -8.1162630 +1 3.2073425 +1
O 13.57026176 +1 -6.0534298 +1 4.0994610 +1
H 12.99996322 +1 -5.4800350 +1 3.5684682 +1
H 13.68531832 +1 -6.8607781 +1 3.5711580 +1
O 13.30105983 +1 -6.1817347 +1 6.7702498 +1
H 13.93708031 +1 -6.8744765 +1 7.0151960 +1
H 13.40415492 +1 -6.0640996 +1 5.8132625 +1
O 7.58972075 +1 -9.0950292 +1 5.9555538 +1
H 7.60700445 +1 -8.3102336 +1 5.3990053 +1
H 7.98058151 +1 -9.8058006 +1 5.4184999 +1
O 8.63873161 +1 -10.9305183 +1 4.2956111 +1
H 8.58072216 +1 -11.8733724 +1 4.5293463 +1
H 8.47323980 +1 -10.8980434 +1 3.3410032 +1
H 5.04945342 +1 -4.6878564 +1 0.4552862 +1
H 1.23372080 +1 -9.6034425 +1 4.9438741 +1
N -0.66535525 +1 1.9987255 +1 4.4384010 +1
N 0.84321392 +1 -4.3675046 +1 5.9088523 +1
N 4.20885768 +1 -2.7933640 +1 5.7989381 +1
O 2.83452418 +1 -3.5619212 +1 7.4378577 +1
O 6.23016910 +1 -0.2383002 +1 6.3464036 +1
O 4.47826183 +1 -0.4009895 +1 7.6160929 +1
O 5.39635178 +1 -6.0646036 +1 7.3392318 +1
O 6.76595351 +1 -4.7811240 +1 8.4346508 +1
C -0.03212425 +1 0.9580950 +1 5.3303354 +1
C 0.31172310 +1 -0.2671246 +1 4.4881841 +1
C 0.93873614 +1 -1.3556035 +1 5.3618985 +1
C 1.47249468 +1 -2.4588763 +1 4.4475530 +1
C 1.98781287 +1 -3.6758650 +1 5.2071202 +1
C 3.05618365 +1 -3.3362101 +1 6.2500341 +1
C 5.30041571 +1 -2.4622846 +1 6.7147879 +1
C 6.64484636 +1 -2.9732026 +1 6.1762694 +1
C 6.68698163 +1 -4.4969345 +1 6.0599242 +1
C 6.26564809 +1 -5.1702032 +1 7.3473264 +1
C 5.33438085 +1 -0.9247743 +1 6.8772108 +1
H -0.65325630 +1 2.9338473 +1 4.9107265 +1
H -1.67885244 +1 1.7207628 +1 4.2524753 +1
H -0.15536235 +1 2.0736197 +1 3.5298482 +1
H 0.88017441 +1 1.3856018 +1 5.8123365 +1
H -0.74757508 +1 0.6993937 +1 6.1436137 +1
H 1.02078373 +1 0.0185846 +1 3.6785131 +1
H -0.60234574 +1 -0.6652472 +1 3.9984040 +1
H 1.75921370 +1 -0.9359351 +1 5.9796194 +1
H 0.17815611 +1 -1.7581853 +1 6.0636633 +1
H 2.28162220 +1 -2.0501431 +1 3.7986873 +1
H 0.66533206 +1 -2.7843043 +1 3.7474668 +1
H 2.42172030 +1 -4.4168494 +1 4.4618319 +1
H 0.53626172 +1 -3.8720990 +1 6.7872851 +1
H 0.02829868 +1 -4.4438039 +1 5.2587169 +1
H 1.13060376 +1 -5.3278640 +1 6.1684799 +1
H 5.10061321 +1 -2.9060754 +1 7.7332115 +1
H 7.45754094 +1 -2.6041977 +1 6.8334710 +1
H 6.85440722 +1 -2.5188666 +1 5.1843302 +1
H 7.71073281 +1 -4.8314624 +1 5.7892249 +1
H 6.04604137 +1 -4.8408564 +1 5.2238225 +1
N 5.02949367 +1 -10.3923866 +1 13.7270517 +1
N 3.91840962 +1 -5.3070633 +1 9.4406173 +1
N 0.55112530 +1 -6.8096771 +1 9.8864540 +1
O 1.56201168 +1 -4.8944713 +1 10.5780148 +1
O -1.85356428 +1 -8.2243173 +1 11.7177966 +1
O -0.26037345 +1 -7.1470486 +1 12.7389081 +1
O -0.57924668 +1 -3.7218799 +1 8.0740436 +1
O -2.31038180 +1 -3.8478461 +1 9.3906957 +1
C 4.34006425 +1 -9.1002963 +1 13.3563027 +1
C 4.34105685 +1 -8.9629560 +1 11.8360485 +1
C 3.64088046 +1 -7.6717572 +1 11.4061111 +1
C 3.46429480 +1 -7.7095106 +1 9.8867088 +1
C 2.90386854 +1 -6.4147836 +1 9.3070655 +1
C 1.60632789 +1 -5.9686522 +1 9.9836457 +1
C -0.74262842 +1 -6.4695565 +1 10.4741600 +1
C -1.87434587 +1 -6.6886401 +1 9.4550247 +1
C -1.71076751 +1 -5.8297397 +1 8.2009074 +1
C -1.52316683 +1 -4.3737513 +1 8.5540308 +1
C -0.95132712 +1 -7.3595288 +1 11.7254517 +1
H 4.77409305 +1 -10.6783421 +1 14.7030053 +1
H 6.08117914 +1 -10.2560735 +1 13.6629047 +1
H 4.75159006 +1 -11.1615097 +1 13.0779341 +1
H 3.29823671 +1 -9.1063293 +1 13.7591582 +1
H 4.87891444 +1 -8.2524629 +1 13.8369774 +1
H 3.82269009 +1 -9.8370040 +1 11.3803676 +1
H 5.38473897 +1 -8.9604124 +1 11.4519498 +1
H 2.65561743 +1 -7.5743050 +1 11.9064078 +1
H 4.24637233 +1 -6.7927477 +1 11.7124028 +1
H 2.79920665 +1 -8.5608912 +1 9.6091860 +1
H 4.44718793 +1 -7.9282449 +1 9.4042039 +1
H 2.70761044 +1 -6.5625780 +1 8.1969613 +1
H 4.00688330 +1 -4.9429418 +1 10.4335800 +1
H 4.85287068 +1 -5.6503505 +1 9.1215053 +1
H 3.65518849 +1 -4.5138498 +1 8.8310732 +1
H -0.74473171 +1 -5.3945184 +1 10.8196426 +1
H -2.84461173 +1 -6.4760562 +1 9.9486795 +1
H -1.92592879 +1 -7.7568870 +1 9.1628953 +1
H -2.59984354 +1 -5.9363836 +1 7.5430628 +1
H -0.85658298 +1 -6.1795339 +1 7.5865105 +1
O 12.90517313 +1 -4.0847281 +1 8.4064308 +1
H 12.34198966 +1 -3.5176081 +1 7.8612137 +1
H 13.04965867 +1 -4.8885821 +1 7.8785447 +1
O 12.62917932 +1 -4.2116282 +1 11.0754771 +1
H 13.27837386 +1 -4.8873803 +1 11.3315436 +1
H 12.74154522 +1 -4.1009218 +1 10.1165112 +1
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H 0.56966973 +1 -7.6488978 +1 9.2850907 +1
Tv -1.25792583 +1 3.9295767 +1 8.6289755 +1
Tv 9.86532029 +1 -5.7708626 +1 4.0808358 +1
Tv 11.13643702 +1 6.6497533 +1 -1.5966719 +1
Optimized PM6_D3H4 data set:
MERS=(2,1,1) RELSCF=1 CHARGE=0 EF OUTPUT THREADS=1 PM6-D3H4 GRADIENTS
L-Lysyl-L-glutamic acid dihydrate (VEVGOS) (PM6-D3H4)
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N 4.80301895 +1 -4.7821199 +1 1.4478357 +1
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