Time stamp: Thu Mar 11 08:55:57 2021
Hydroxylapatite (Ca5(PO4)3(OH))
781 Hydroxylapatite (Ca5(PO4)3(OH))
(Previous) Fluorapophyllite (KCa4Si8O20 8(H2O)
(Back) Elements:
Ca 5
P 3
O 13
H 1
(Z = 8)
(Periodic Table)
(Next) Fluorapatite (Ca5(PO4)3F)
Moh's scale: 1: talc, 2: gypsum, 3: calcite, 4: fluorite, 5: apatite, 6: orthoclase, 7: quartz, 8: topaz, 9: corundum, and 10: diamond
See also: Chlorapatite and Fluorapatite
Unit Cell Parameters: a b c alpha beta gamma Volume Density Heat of Formation (Kcal/mol)
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X-Ray PM7 PM6_D3H4
|
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Feb 25 2021 @ 05:18:49 |
X-Ray data set:
MERS=(2,1,1) CHARGE=0 OUTPUT THREADS=1 1SCF GRADIENTS
Hydroxylapatite (Ca5(PO4)3(OH))
h=-1590 hr=guess
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O 1.67017600 +1 2.8428950 +1 0.4989510 +1
O -0.59495400 +1 2.9355300 +1 1.4668510 +1
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Ca -0.77440900 +1 5.6888750 +1 2.0185390 +1
Ca 0.70061400 +1 -3.1630810 +1 -2.4304300 +1
Ca 2.38228400 +1 5.5590010 +1 0.6703400 +1
Ca -2.57831000 +1 2.3403970 +1 -1.8596500 +1
Ca -4.25998200 +1 -6.3816840 +1 -4.9604220 +1
Ca 0.59562900 +1 2.2105960 +1 -3.2158880 +1
Ca -1.08604300 +1 -6.5114860 +1 -6.3166590 +1
Ca -2.45586600 +1 -3.0339940 +1 -1.0816540 +1
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O -2.79519700 +1 -1.3065740 +1 -3.2762750 +1
Ca -2.31241900 +1 -2.9523660 +1 -5.1290840 +1
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O -8.21030400 +1 -0.6170090 +1 -7.2439800 +1
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Ca -6.39643600 +1 -3.0717580 +1 -5.9017300 +1
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O -4.19590800 +1 0.6364120 +1 -1.1068380 +1
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P -5.23022100 +1 2.2842670 +1 -3.6851050 +1
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P 1.25137800 +1 -2.3843370 +1 -14.3878330 +1
O 1.31442300 +1 -0.8427570 +1 -14.3878330 +1
O 1.78607300 +1 -2.9101190 +1 -13.0861930 +1
O 2.09427300 +1 -2.9793190 +1 -15.4959000 +1
O -0.17085700 +1 -2.8866840 +1 -14.5280020 +1
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Optimized PM7 data set:
MERS=(2,1,1) CHARGE=0 OUTPUT THREADS=1 PM7 GRADIENTS NOTXT EF
Hydroxylapatite (Ca5(PO4)3(OH))
h=-1590 hr=guess
Ca 0.22641060 +1 -0.0387613 +1 -0.0599984 +1
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O -4.26963145 +1 -2.5311745 +1 -10.5581008 +1
O -4.16806428 +1 -2.7796438 +1 -13.0059327 +1
O -6.30152496 +1 -2.7081488 +1 -11.8812381 +1
Ca -0.39102878 +1 5.7915292 +1 -2.0235948 +1
O 0.77955058 +1 -0.0846518 +1 2.0648366 +1
H 0.09891859 +1 0.3793010 +1 2.5478926 +1
P 0.55357657 +1 -3.1405237 +1 0.6792362 +1
O 1.10052986 +1 -3.6765523 +1 2.0072166 +1
O 0.06133676 +1 -4.1068888 +1 -0.4652390 +1
O -0.70145836 +1 -2.2123400 +1 0.7984445 +1
O 1.54786901 +1 -2.2287172 +1 -0.0874109 +1
P 0.43304666 +1 3.2851060 +1 0.1299869 +1
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O 0.19741489 +1 4.8092721 +1 -0.0466375 +1
O 1.95857287 +1 3.2495145 +1 0.4727832 +1
O -0.16518767 +1 2.8621383 +1 1.5037679 +1
Ca 1.76115803 +1 2.8148724 +1 2.9162258 +1
Ca -0.46004744 +1 5.9081042 +1 1.9738870 +1
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Ca 2.60238848 +1 5.6846429 +1 0.5721848 +1
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Ca -3.98403528 +1 -6.3695877 +1 -5.4593485 +1
Ca 0.77803835 +1 2.2521186 +1 -3.1322731 +1
Ca -1.00981799 +1 -6.4404377 +1 -6.4740651 +1
Ca -2.11209279 +1 -2.9025394 +1 -1.0070595 +1
P -3.27107293 +1 -4.2033036 +1 -7.9089821 +1
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O -4.16001598 +1 0.8987553 +1 1.0278576 +1
Ca -3.48193678 +1 -1.1866872 +1 -8.7951767 +1
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Ca -2.14163056 +1 -1.8094919 +1 2.5208653 +1
Ca -2.23097122 +1 1.0638954 +1 -5.7068247 +1
Ca -2.30803176 +1 2.3332500 +1 2.0745478 +1
P -1.11267484 +1 -0.6295919 +1 -3.1480488 +1
O -1.04177664 +1 0.8989062 +1 -3.3353000 +1
O -0.13828056 +1 -1.5071421 +1 -4.0084323 +1
O -2.47780414 +1 -1.0927307 +1 -3.7249394 +1
Ca -1.89981756 +1 -2.7644707 +1 -5.3575880 +1
O -2.90228688 +1 -1.0405904 +1 -6.3332258 +1
H -3.78768851 +1 -1.0548092 +1 -5.9473162 +1
O -2.77440571 +1 -4.8718660 +1 -6.6001454 +1
P -1.71332509 +1 -5.3515049 +1 -3.2149439 +1
O -1.99101781 +1 -6.1863961 +1 -4.4743768 +1
O -1.05886639 +1 -3.9933182 +1 -3.3629945 +1
O -1.27350029 +1 -6.3906483 +1 -2.2034818 +1
O -3.17103370 +1 -4.9111344 +1 -2.5864633 +1
O -5.47961642 +1 3.0666726 +1 -5.1043557 +1
O -4.24052120 +1 -2.7998220 +1 -2.1777796 +1
O -3.22437696 +1 -1.4563790 +1 0.3549058 +1
O -4.23339246 +1 1.1008044 +1 -4.5346762 +1
O -6.22707440 +1 -4.0026871 +1 -3.3299890 +1
O -5.62143228 +1 -0.7659072 +1 -8.0418438 +1
O -5.80646139 +1 1.7149779 +1 -2.8061961 +1
O -4.22016885 +1 -3.9640886 +1 -4.5932659 +1
O -7.95977553 +1 -0.3991469 +1 -7.6811090 +1
Ca -4.61178366 +1 -0.6799305 +1 -2.9767490 +1
Ca -5.94179260 +1 -3.1435937 +1 -6.0324994 +1
Ca -6.02125257 +1 0.7400868 +1 -6.3336319 +1
P -6.63924652 +1 -6.2706790 +1 -7.1368003 +1
O -6.22351133 +1 -5.3699447 +1 -5.9199755 +1
O -2.04821512 +1 0.6021977 +1 3.5895463 +1
H -2.93181132 +1 0.5136013 +1 3.9596067 +1
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O -3.12153650 +1 3.3556323 +1 0.2276617 +1
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O -3.66458096 +1 0.5773066 +1 -1.3273719 +1
P -4.50116508 +1 -4.0011442 +1 -3.0972027 +1
P -6.99644800 +1 -1.2449907 +1 -8.5838217 +1
O -3.93117404 +1 3.2611647 +1 -3.0389622 +1
O -5.54275735 +1 -5.0280245 +1 -2.3956191 +1
O -7.32875542 +1 -0.6684039 +1 -9.9837801 +1
P -4.86921118 +1 2.3637465 +1 -3.8541767 +1
O -5.96857976 +1 -1.1559121 +1 -4.9254707 +1
H -6.87389040 +1 -1.0872320 +1 -4.5788981 +1
Ca 6.31222415 +1 -0.1958692 +1 -2.6609207 +1
P 1.03698274 +1 -2.2098010 +1 -14.5925837 +1
O 1.10382734 +1 -0.6673442 +1 -14.7175407 +1
O 1.34335910 +1 -2.8135806 +1 -13.1852516 +1
O 2.03848387 +1 -3.0246135 +1 -15.4565150 +1
O -0.33834139 +1 -2.6845440 +1 -15.0909699 +1
Ca 5.60475317 +1 5.6218730 +1 -4.7465842 +1
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P 6.52592460 +1 -3.3364429 +1 -1.9078596 +1
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O 6.38047413 +1 -4.2914239 +1 -3.1122007 +1
O 5.11287840 +1 -2.6842205 +1 -1.8634630 +1
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P 6.39519689 +1 3.0912080 +1 -2.6095859 +1
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O 6.59667149 +1 4.5811435 +1 -2.9829063 +1
O 7.74889981 +1 2.5088382 +1 -2.1117739 +1
O 5.62914391 +1 3.2214464 +1 -1.2471083 +1
Ca 7.57694440 +1 2.4825403 +1 0.2322458 +1
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Ca 8.55802825 +1 5.5354063 +1 -2.0900270 +1
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Ca 6.66828021 +1 1.9953284 +1 -5.8260229 +1
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P 2.76212813 +1 -4.4591091 +1 -10.5388412 +1
O -1.11020638 +1 -5.8738531 +1 -10.9947317 +1
O 3.37706711 +1 5.6892860 +1 -1.6078791 +1
O -1.06874234 +1 -3.0474309 +1 -11.0712392 +1
O 5.70232566 +1 -1.4458627 +1 -4.4293014 +1
O 2.27217717 +1 -5.3946523 +1 -11.6808202 +1
O 1.56762366 +1 -3.4811180 +1 -10.3408790 +1
O 0.58901703 +1 -7.4621401 +1 -9.9192581 +1
O 1.34747207 +1 4.7904010 +1 -3.0194830 +1
O 4.18189872 +1 0.3224106 +1 -1.9594329 +1
O -1.53052491 +1 -7.1742471 +1 -8.7638135 +1
O 3.79807318 +1 -3.4966551 +1 -11.1844330 +1
O 3.46353049 +1 5.0966917 +1 -4.0931813 +1
O 1.81479495 +1 0.5999730 +1 -1.4819610 +1
Ca 2.32969675 +1 -1.5706275 +1 -11.6340680 +1
Ca 5.15818306 +1 0.6522496 +1 2.8104863 +1
Ca 3.74853100 +1 -2.3384623 +1 -0.1801744 +1
Ca 3.88851902 +1 0.8321226 +1 -8.2251672 +1
Ca 3.72828909 +1 2.2457536 +1 -0.5274825 +1
P 4.94109577 +1 -0.9344684 +1 -5.6799231 +1
O 4.81866402 +1 0.5760855 +1 -5.9496380 +1
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O 3.59823619 +1 -1.7206374 +1 -5.5725118 +1
Ca 4.01460916 +1 -3.2057851 +1 -7.6990260 +1
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O 0.50713081 +1 2.5525345 +1 -7.8261189 +1
O 1.78653540 +1 -3.2178418 +1 -4.6680831 +1
O 2.73302382 +1 -1.7445276 +1 -2.2735902 +1
O 2.27825154 +1 1.0179554 +1 -6.6305789 +1
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O -1.98707820 +1 -0.6809054 +1 -10.3732180 +1
Ca 1.56057165 +1 -0.9342479 +1 -5.3328044 +1
Ca -0.01960269 +1 -3.2295813 +1 -8.7478713 +1
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O 1.41331576 +1 2.8440891 +1 -5.3322285 +1
O 0.79809875 +1 -5.5060372 +1 -5.3655821 +1
O -1.53102804 +1 -0.9615616 +1 -12.7193353 +1
P 1.01041925 +1 1.9070171 +1 -6.5101724 +1
O -0.07558354 +1 -1.1330396 +1 -8.1969925 +1
H -0.52709492 +1 -0.9995244 +1 -7.3665113 +1
Tv 11.95683062 +1 -0.4832624 +1 -5.2784933 +1
Tv 2.11485962 +1 -7.3780660 +1 5.3859018 +1
Tv 5.49320986 +1 10.1670614 +1 11.8003674 +1
Optimized PM6_D3H4 data set:
MERS=(2,1,1) CHARGE=0 EF OUTPUT THREADS=1 PM6-D3H4 GRADIENTS
Hydroxylapatite (Ca5(PO4)3(OH)) (PM6-D3H4)
h=-1590 hr=guess
Ca -0.00914108 +1 -0.0592080 +1 -0.0803739 +1
P -5.13027169 +1 -2.0050994 +1 -11.4698071 +1
O -5.25501196 +1 -0.4357905 +1 -11.5433126 +1
O -4.12292764 +1 -2.4800297 +1 -10.3874627 +1
O -4.67703044 +1 -2.3642614 +1 -12.9426117 +1
O -6.46244821 +1 -2.7813149 +1 -11.1620664 +1
Ca -0.64924639 +1 5.5611655 +1 -2.0644586 +1
O 0.35435766 +1 0.1454643 +1 2.1891646 +1
H -0.51705010 +1 0.2712643 +1 2.6014543 +1
P 0.08096475 +1 -2.9893322 +1 0.6454327 +1
O 0.65608425 +1 -3.5124874 +1 1.9995774 +1
O -0.40039148 +1 -4.0595221 +1 -0.4163959 +1
O -1.17881747 +1 -2.0375262 +1 0.7643646 +1
O 1.17155430 +1 -2.1490536 +1 -0.1354506 +1
P 0.26000784 +1 3.1420821 +1 0.2286957 +1
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O 0.42756921 +1 4.6390356 +1 -0.2493035 +1
O 1.65197857 +1 2.5721557 +1 0.6448513 +1
O -0.70204441 +1 3.2332206 +1 1.4584657 +1
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Ca -0.92049125 +1 5.5181671 +1 1.9515643 +1
Ca 0.77205790 +1 -3.0929140 +1 -2.3177964 +1
Ca 2.41579278 +1 5.4481843 +1 0.6661735 +1
Ca -2.57722723 +1 2.3227183 +1 -1.6426011 +1
Ca -4.25977122 +1 -6.2196079 +1 -4.6510895 +1
Ca 0.61121876 +1 2.1255495 +1 -3.1300280 +1
Ca -1.07160458 +1 -6.4166941 +1 -6.1488160 +1
Ca -2.56091477 +1 -3.0182341 +1 -1.0231958 +1
P -3.52137342 +1 -4.2767507 +1 -7.7236824 +1
O -7.64109775 +1 -5.6570274 +1 -7.9415232 +1
O -3.33821050 +1 5.6502932 +1 1.0707045 +1
O -7.33136273 +1 -2.6954612 +1 -7.9126614 +1
O -0.57851687 +1 -1.2426480 +1 -2.0047528 +1
O -4.01012040 +1 -5.3281881 +1 -8.8063361 +1
O -4.77169711 +1 -3.3156876 +1 -7.5918266 +1
O -6.32259304 +1 -7.6647148 +1 -7.3593849 +1
O -5.27980069 +1 4.7843601 +1 -0.4952565 +1
O -2.34506384 +1 0.7783883 +1 0.2900446 +1
O -7.97366291 +1 -6.8999882 +1 -5.5984881 +1
O -2.41734997 +1 -3.4394317 +1 -8.4891401 +1
O -2.89198585 +1 4.7937682 +1 -1.3356854 +1
O -4.70187333 +1 0.8848033 +1 1.2573485 +1
Ca -3.57366557 +1 -1.3374644 +1 -8.4087479 +1
Ca -1.57287741 +1 0.5678810 +1 5.5492115 +1
Ca -2.75715355 +1 -1.8555584 +1 2.5887775 +1
Ca -2.19433950 +1 0.8801002 +1 -5.4473309 +1
Ca -2.78549537 +1 2.1239506 +1 2.2078083 +1
P -1.55227796 +1 -0.7404736 +1 -3.1106813 +1
O -1.66044643 +1 0.8272546 +1 -3.1590037 +1
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O -2.88181414 +1 -1.5329986 +1 -2.8266409 +1
Ca -2.29600797 +1 -2.9912347 +1 -5.0481912 +1
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Ca -5.16336523 +1 -0.7645215 +1 -2.7902491 +1
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O -4.32391143 +1 3.0912947 +1 -2.9756376 +1
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O -7.97075023 +1 -0.6516115 +1 -9.4962925 +1
P -5.31958541 +1 2.1242682 +1 -3.6749765 +1
O -6.42992649 +1 -1.0981826 +1 -4.7249300 +1
H -7.33930969 +1 -1.0362365 +1 -4.3789223 +1
Ca 6.54202196 +1 -0.2608228 +1 -2.8414669 +1
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O 2.35001080 +1 -2.7221927 +1 -13.1117937 +1
O 1.85477928 +1 -2.5985848 +1 -15.6800328 +1
O 0.04447891 +1 -3.0276588 +1 -13.9311429 +1
Ca 5.88174738 +1 5.3346294 +1 -4.8305073 +1
O 6.87226323 +1 -0.0888970 +1 -0.5591793 +1
H 5.99872207 +1 0.0329361 +1 -0.1541798 +1
P 6.60859846 +1 -3.2078328 +1 -2.1302454 +1
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O 6.13020692 +1 -4.2860053 +1 -3.1860891 +1
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P 6.77143787 +1 2.8756408 +1 -2.5945342 +1
O 6.15528068 +1 1.9567226 +1 -3.7343967 +1
O 7.08133515 +1 4.3258696 +1 -3.1249558 +1
O 8.06524148 +1 2.1295748 +1 -2.1363509 +1
O 5.77898524 +1 3.0838855 +1 -1.4074895 +1
Ca 7.88345779 +1 1.9770015 +1 0.1064526 +1
Ca 5.61353331 +1 5.3211128 +1 -0.7869612 +1
Ca 7.29388498 +1 -3.3003671 +1 -5.0960885 +1
Ca 8.93970013 +1 5.2674364 +1 -2.1115340 +1
Ca 3.93279932 +1 2.0926905 +1 -4.4162609 +1
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Ca 7.13178856 +1 1.9139359 +1 -5.9177313 +1
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Ca 4.22792221 +1 -3.2090185 +1 -7.8081578 +1
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O 0.52931754 +1 2.6353155 +1 -7.6865345 +1
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O -0.44736070 +1 -3.9865837 +1 -6.2586822 +1
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O 0.19224205 +1 1.4248617 +1 -5.3420583 +1
O 1.94967595 +1 -3.9803228 +1 -7.0763498 +1
O -1.75693222 +1 -0.6279186 +1 -9.8103215 +1
Ca 1.34951751 +1 -0.9785797 +1 -5.5589955 +1
Ca 0.15845358 +1 -3.3720956 +1 -8.5205192 +1
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