Time stamp: Thu Mar 11 08:55:57 2021
H5Be2PO7 (ICSD 1710400)
457 H5Be2PO7 (ICSD 1710400)
(Previous) DL-2-Amino-4-phosphonobutyric acid monohydrate (CAXDIO01)
(Back) Elements:
Be 2
P 1
O 7
H 5
(Z = 8)
(Periodic Table)
(Next) Phosphatidylcholine (LYPCHL)
Unit Cell Parameters: a b c alpha beta gamma Volume Density Heat of Formation (Kcal/mol)
X-ray: 8.83 11.09 6.32 90.00 117.67 90.00 547.60 2.014 -652.5 calc'd using PM7
PM7: 7.22 10.52 6.61 90.00 115.42 90.25 453.64 2.431 -768.3 calc'd using PM7 (ref: 0.0)
PM6_D3H4: 9.04 10.93 6.58 90.07 119.06 89.93 568.02 1.942 -628.3 calc'd using PM6_D3H4
X-Ray PM7 PM6_D3H4
|
Calc'd on: Feb 25 2021 @ 21:36:46 |
Feb 23 2021 @ 20:49:14
ARC file |
Feb 25 2021 @ 02:01:14 |
For X-Ray structure, contact the ICSD: https://icsd.fiz-karlsruhe.de/search/index.xhtml/
Optimized PM7 data set:
MERS=(1,1,2) CHARGE=0 OUTPUT THREADS=1 PM7 GRADIENTS NOTXT EF
H5Be2PO7 (ICSD 1710400)
Be 0.02499667 +1 0.4688889 +1 -0.3825935 +1
Be -3.73595652 +1 3.2172722 +1 3.3110049 +1
Be 4.00543912 +1 -0.4643458 +1 -4.7378628 +1
Be -0.06516125 +1 -3.2311169 +1 -1.4301909 +1
P 3.65486026 +1 1.0847858 +1 -2.8363664 +1
P -0.80054077 +1 2.4068225 +1 -0.0247451 +1
P 0.37488279 +1 -1.1279745 +1 -2.3167164 +1
P -1.76258477 +1 4.6454857 +1 3.1732381 +1
O 4.54833602 +1 0.9161844 +1 -4.0660336 +1
O 0.51813427 +1 2.3729813 +1 -0.8139730 +1
O -0.47905051 +1 -0.9109007 +1 -1.0834154 +1
O -3.17559588 +1 4.6862110 +1 3.7477547 +1
O 4.14393795 +1 2.4045886 +1 -2.2024840 +1
O -1.51514699 +1 1.1445424 +1 -0.5451402 +1
O -0.08160987 +1 -2.4746482 +1 -2.8837771 +1
O 5.48612428 +1 -1.2030725 +1 -4.4932624 +1
O -0.81591122 +1 2.1739944 +1 1.5011130 +1
O 2.15381200 +1 1.3196828 +1 -3.0400587 +1
O -1.44837531 +1 4.7484200 +1 1.6559352 +1
O 1.93543105 +1 -1.3014781 +1 -2.1887980 +1
O 1.67781192 +1 0.4646506 +1 -0.1021275 +1
O -3.64565794 +1 3.0646864 +1 1.6656765 +1
O 2.31451317 +1 -0.5514179 +1 -4.9092050 +1
O -0.10897148 +1 -2.9510666 +1 0.1768535 +1
O -0.12399229 +1 -0.4543803 +1 1.1673450 +1
O -5.32489934 +1 4.1019608 +1 3.1237119 +1
O 4.03472390 +1 0.4106044 +1 -6.2869991 +1
O 1.49889182 +1 -4.0670402 +1 -1.2278094 +1
O 4.05199017 +1 -0.0756372 +1 -1.9086738 +1
O -1.54970313 +1 3.6450346 +1 -0.5298141 +1
O 0.05905438 +1 -0.0068747 +1 -3.3314816 +1
O -1.06461080 +1 3.3989500 +1 3.7201389 +1
Be 2.65282522 +1 -0.2933291 +1 -1.1077744 +1
Be -2.45797346 +1 3.7757811 +1 0.8350968 +1
Be 1.70616166 +1 -0.1557900 +1 -3.4655732 +1
Be -0.21964552 +1 3.4739022 +1 2.2333024 +1
O 3.52609083 +1 -1.1642193 +1 0.1102256 +1
O -3.63899583 +1 4.6593298 +1 -0.1335187 +1
O 0.36718072 +1 1.1574632 +1 -5.5790073 +1
O 1.17937311 +1 2.8165930 +1 3.3239374 +1
H 2.09693396 +1 -4.0222295 +1 -2.0162204 +1
H 4.86280450 +1 0.3298779 +1 -6.8261344 +1
H -5.97956177 +1 3.9049012 +1 3.8327298 +1
H -0.97781197 +1 -0.4273550 +1 1.6530913 +1
H 2.05747259 +1 1.3488872 +1 0.0763047 +1
H -3.76864184 +1 2.1547537 +1 1.3305505 +1
H 1.97023869 +1 -1.4519857 +1 -5.1300463 +1
H -0.00761039 +1 -2.0156395 +1 0.4579650 +1
H 0.58839316 +1 -0.3233889 +1 1.8159194 +1
H -5.79442835 +1 3.9009287 +1 2.2936198 +1
H 3.30723024 +1 0.2663395 +1 -6.9034095 +1
H 2.04600486 +1 -3.8004432 +1 -0.4747463 +1
H 3.00805395 +1 -1.3735481 +1 0.8968681 +1
H -4.43172062 +1 4.8133840 +1 0.4029094 +1
H 1.14907239 +1 0.5758064 +1 -5.5276168 +1
H 1.95261187 +1 2.7652344 +1 2.7392213 +1
H 3.73249204 +1 -2.0306562 +1 -0.3784258 +1
H -3.15887842 +1 5.5404302 +1 -0.2677352 +1
H 0.28372678 +1 1.4822645 +1 -6.4856032 +1
H 0.94983144 +1 1.9089296 +1 3.5927550 +1
Be 3.43139204 +1 -3.7067146 +1 3.6003339 +1
Be -0.36345646 +1 -0.8950859 +1 7.1768147 +1
Be 7.38503046 +1 -4.4110747 +1 -0.9021920 +1
Be 3.33657485 +1 -7.2407769 +1 2.5242995 +1
P 7.04203222 +1 -2.9936571 +1 1.0275269 +1
P 2.42547579 +1 -1.6655295 +1 3.8505462 +1
P 3.73609929 +1 -5.2204372 +1 1.6619437 +1
P 1.63873995 +1 0.6717996 +1 7.0191470 +1
O 7.89769637 +1 -3.0102466 +1 -0.2441033 +1
O 3.81992874 +1 -1.6125774 +1 3.2530513 +1
O 2.94984084 +1 -5.1225471 +1 2.9532509 +1
O 0.30925923 +1 0.4917755 +1 7.7307768 +1
O 7.50741048 +1 -1.6896342 +1 1.7013592 +1
O 1.91998822 +1 -3.0414216 +1 3.4039822 +1
O 3.27649415 +1 -6.5438237 +1 1.0330786 +1
O 8.84402909 +1 -5.1416093 +1 -0.7184584 +1
O 2.19059344 +1 -1.6540799 +1 5.3876130 +1
O 5.52174574 +1 -2.8031728 +1 0.9092488 +1
O 1.66522138 +1 0.8207286 +1 5.4483739 +1
O 5.30002373 +1 -5.4081905 +1 1.7245156 +1
O 5.07997750 +1 -3.5910121 +1 3.7340985 +1
O -0.42772906 +1 -0.9719404 +1 5.4983506 +1
O 5.73099304 +1 -4.6430063 +1 -0.9466004 +1
O 3.29304616 +1 -7.0882870 +1 4.2031433 +1
O 3.44912105 +1 -4.5903019 +1 5.1975995 +1
O -1.91273033 +1 0.0281409 +1 7.0725871 +1
O 7.35341980 +1 -3.6258046 +1 -2.4682496 +1
O 4.85650266 +1 -8.1045637 +1 2.6422348 +1
O 7.46998785 +1 -4.2012358 +1 1.8708341 +1
O 1.57220866 +1 -0.5369832 +1 3.2386015 +1
O 3.38423746 +1 -4.0635293 +1 0.7046095 +1
O 2.62224630 +1 -0.4279351 +1 7.4932527 +1
Be 6.06809872 +1 -4.3429852 +1 2.7109973 +1
Be 0.89712950 +1 -0.4739104 +1 4.7525650 +1
Be 5.03233713 +1 -4.2573688 +1 0.4631233 +1
Be 2.93974482 +1 -0.2944324 +1 5.8832290 +1
O 6.88140263 +1 -5.2801117 +1 3.9043469 +1
O -0.42208713 +1 0.7133346 +1 3.7453291 +1
O 3.76606825 +1 -3.0401971 +1 -1.6015981 +1
O 4.85818665 +1 -1.7253783 +1 7.4527526 +1
H 5.44882114 +1 -8.0505564 +1 1.8404984 +1
H 8.18296721 +1 -3.7270565 +1 -2.9963861 +1
H -2.54980052 +1 -0.1586430 +1 7.8009359 +1
H 2.66128971 +1 -4.4004129 +1 5.7562817 +1
H 5.40768534 +1 -2.6783138 +1 3.8823412 +1
H -0.63283329 +1 -1.8559816 +1 5.1335980 +1
H 5.44328532 +1 -5.5620599 +1 -1.1779487 +1
H 3.55823037 +1 -6.2044353 +1 4.5538678 +1
H 4.21763351 +1 -4.4035054 +1 5.7715420 +1
H -2.41402659 +1 -0.1698974 +1 6.2532206 +1
H 6.62061574 +1 -3.8527083 +1 -3.0808298 +1
H 5.44074984 +1 -7.9428508 +1 3.3973539 +1
H 6.29651355 +1 -5.4976171 +1 4.6400475 +1
H -1.26867915 +1 0.5280278 +1 4.1755345 +1
H 4.56935703 +1 -3.5996611 +1 -1.6413321 +1
H 4.90146179 +1 -1.1503337 +1 6.6704841 +1
H 7.07659208 +1 -6.1365580 +1 3.3744943 +1
H -0.63583120 +1 1.0669277 +1 2.8770649 +1
H 3.65316259 +1 -2.6233790 +1 -2.4685381 +1
H 5.74933696 +1 -2.0584487 +1 7.6355575 +1
Tv 1.15737473 +1 7.0268006 +1 1.2003842 +1
Tv 7.82843544 +1 -0.1360506 +1 -7.0225784 +1
Tv 6.80622094 +1 -8.2786651 +1 7.7482047 +1
Optimized PM6_D3H4 data set:
MERS=(1,1,2) CHARGE=0 EF OUTPUT THREADS=1 PM6-D3H4 GRADIENTS
H5Be2PO7 (ICSD 1710400) (PM6-D3H4)
Be -0.01376342 +1 0.0927298 +1 0.0217549 +1
Be -4.28354465 +1 3.8567023 +1 3.6001790 +1
Be 4.17315854 +1 -0.1970588 +1 -5.1235828 +1
Be 0.35557435 +1 -4.2903211 +1 -1.3908201 +1
P 3.42838321 +1 1.4551917 +1 -2.8965851 +1
P -0.99679362 +1 2.8078459 +1 0.3955758 +1
P 0.69474478 +1 -1.5308147 +1 -2.2336279 +1
P -2.07883648 +1 5.6399716 +1 3.1590347 +1
O 4.46796236 +1 0.8585520 +1 -3.9212886 +1
O 0.08660092 +1 3.4974922 +1 -0.5153901 +1
O -0.33156934 +1 -0.9418144 +1 -1.1939521 +1
O -3.17070611 +1 4.9527882 +1 4.0621576 +1
O 3.65877816 +1 2.9919187 +1 -2.6958082 +1
O -1.11021486 +1 1.2699356 +1 0.1131730 +1
O 0.48999127 +1 -3.0715266 +1 -2.4396582 +1
O 5.27345991 +1 -1.3702343 +1 -5.2252945 +1
O -0.54628092 +1 2.9403456 +1 1.8981090 +1
O 1.98271153 +1 1.2777727 +1 -3.4857605 +1
O -2.51900994 +1 5.5060415 +1 1.6532209 +1
O 2.15122774 +1 -1.3709769 +1 -1.6525201 +1
O 1.52856019 +1 0.5958886 +1 0.1065872 +1
O -4.16757827 +1 3.3857135 +1 2.0498921 +1
O 2.63539199 +1 -0.7119450 +1 -5.2009604 +1
O 0.25939012 +1 -3.8363363 +1 0.1687296 +1
O -0.22879663 +1 -0.8998712 +1 1.3553037 +1
O -5.68003118 +1 4.7874893 +1 3.7057884 +1
O 4.39959580 +1 0.8063520 +1 -6.4535260 +1
O 1.74422944 +1 -5.2185816 +1 -1.5082602 +1
O 3.63305194 +1 0.8237667 +1 -1.4852559 +1
O -2.40885452 +1 3.3830248 +1 0.0771199 +1
O 0.48043181 +1 -0.8857196 +1 -3.6352794 +1
O -0.66680180 +1 5.0614657 +1 3.4791217 +1
Be 2.70528699 +1 -0.2173988 +1 -0.6520145 +1
Be -3.38950019 +1 4.3107783 +1 0.9725000 +1
Be 1.44109259 +1 0.1115807 +1 -4.4811985 +1
Be 0.32031958 +1 4.1363472 +1 2.5786871 +1
O 3.60842475 +1 -0.9467466 +1 0.5075326 +1
O -4.50903366 +1 4.9924911 +1 -0.0159116 +1
O 0.55616450 +1 0.8231770 +1 -5.6635641 +1
O 1.37519627 +1 3.3866435 +1 3.5877821 +1
H 2.14532330 +1 -5.3762052 +1 -2.4231297 +1
H 5.35535378 +1 1.0133532 +1 -6.7294694 +1
H -6.05687828 +1 4.9637037 +1 4.6301447 +1
H -1.17658494 +1 -1.1037706 +1 1.6502001 +1
H 1.67662102 +1 1.5219737 +1 0.3175859 +1
H -4.27672193 +1 2.4492759 +1 1.8611948 +1
H 2.49895226 +1 -1.6446626 +1 -5.3933674 +1
H 0.38001039 +1 -2.9023670 +1 0.3647718 +1
H 0.37781770 +1 -0.8220542 +1 2.1710638 +1
H -6.44282473 +1 4.6446178 +1 3.0470718 +1
H 3.81885033 +1 0.6966374 +1 -7.2795043 +1
H 2.47769621 +1 -5.1588918 +1 -0.8054088 +1
H 3.53468019 +1 -0.7511470 +1 1.4953029 +1
H -5.47492042 +1 4.7113955 +1 -0.0740843 +1
H 0.58210219 +1 0.5453044 +1 -6.6415446 +1
H 2.36576841 +1 3.5980409 +1 3.6530134 +1
H 4.31470017 +1 -1.6398651 +1 0.3101464 +1
H -4.29937797 +1 5.7614081 +1 -0.6380565 +1
H -0.08897011 +1 1.5724381 +1 -5.5028733 +1
H 1.10643111 +1 2.6474184 +1 4.2129925 +1
Be 3.47331057 +1 -4.0885219 +1 3.7287148 +1
Be -0.81196656 +1 -0.3267034 +1 7.3149188 +1
Be 7.65363734 +1 -4.3751317 +1 -1.4232002 +1
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