Time stamp: Thu Mar 11 08:55:57 2021
Dodecahydroxycyclohexane dihydrate (SANTEH)
290 Dodecahydroxycyclohexane dihydrate (SANTEH)
(Previous) Caffeine monohydrate (CAFINE01)
(Back) Elements:
O 7
H 8
C 3
(Z = 16)
(Periodic Table)
(Next) Citric acid (CITRAC10)
Unit Cell Parameters: a b c alpha beta gamma Volume Density Heat of Formation (Kcal/mol)
X-ray: 7.30 7.07 6.18 63.97 80.15 70.44 270.13 1.919 -324.1 calc'd using PM7
PM7: 7.17 6.81 5.80 59.22 78.50 71.19 229.77 2.256 -407.9 calc'd using PM7 (ref: 0.0)
PM6_D3H4: 7.04 6.93 6.12 57.26 78.43 69.75 235.34 2.203 -399.5 calc'd using PM6_D3H4
X-Ray PM7 PM6_D3H4
|
Calc'd on: Feb 25 2021 @ 19:35:54 |
Feb 23 2021 @ 18:15:01
ARC file |
Feb 24 2021 @ 23:39:55 |
For X-Ray structure, contact the CCDC: http://www.ccdc.cam.ac.uk/
Optimized PM7 data set:
MERS=(2,2,2) CHARGE=0 OUTPUT THREADS=1 PM7 GRADIENTS NOTXT EF
Dodecahydroxycyclohexane dihydrate (SANTEH)
O 0.07833115 +1 0.1460087 +1 0.1632227 +1
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H -2.96885505 +1 0.4270402 +1 0.1011112 +1
O -1.78207195 +1 0.5189595 +1 -1.7521836 +1
H -1.34146185 +1 -0.3898093 +1 -1.6187399 +1
O 0.19728981 +1 1.5886232 +1 -2.2887201 +1
H 0.11177505 +1 1.0778504 +1 -3.1377296 +1
C -0.41306890 +1 1.4197166 +1 0.0069659 +1
C -1.57899083 +1 1.5707699 +1 1.0399143 +1
C -0.91967720 +1 1.5506740 +1 -1.4725046 +1
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H -4.33398593 +1 4.3684929 +1 -1.0826948 +1
O -3.80038295 +1 2.0220653 +1 -0.8055191 +1
H -3.97779607 +1 1.7833971 +1 -1.7551161 +1
O -2.23002552 +1 2.8634913 +1 -2.9370744 +1
H -2.63722376 +1 3.7660586 +1 -3.2508647 +1
O -0.81865632 +1 3.9546754 +1 -1.6000221 +1
H -0.30597823 +1 3.9987699 +1 -0.7281227 +1
O -1.50782381 +1 3.9226276 +1 1.1402023 +1
H -1.94244957 +1 4.8375580 +1 1.0084504 +1
O -3.49635490 +1 2.8618849 +1 1.6409600 +1
H -3.37691170 +1 3.2097572 +1 2.5611009 +1
C -2.87836527 +1 3.0308147 +1 -0.6399071 +1
C -1.71121184 +1 2.8788564 +1 -1.6739898 +1
C -2.37173358 +1 2.8978053 +1 0.8409446 +1
O 1.27652523 +1 -1.9869799 +1 -3.6220815 +1
H 0.56363322 +1 -2.1847959 +1 -2.9754408 +1
H 1.20152591 +1 -2.6581636 +1 -4.3250440 +1
O 3.17719760 +1 -3.9045967 +1 -4.3386063 +1
H 3.89387788 +1 -3.6919876 +1 -4.9744006 +1
H 3.22087604 +1 -3.2246145 +1 -3.6388675 +1
O -1.30390506 +1 1.4286260 +1 7.0897337 +1
H -0.35268533 +1 1.3565037 +1 7.3700044 +1
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H -0.71454116 +1 3.9496389 +1 8.0449210 +1
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H -2.03154701 +1 1.9766235 +1 9.5314107 +1
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O -1.17841835 +1 2.8721273 +1 4.6435280 +1
H -1.29596242 +1 2.5245651 +1 3.7228087 +1
C -1.80292981 +1 2.6983005 +1 6.9229006 +1
C -2.96922653 +1 2.8544047 +1 7.9587798 +1
C -2.30507565 +1 2.8364183 +1 5.4412363 +1
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H -5.35511701 +1 3.0697141 +1 5.1511126 +1
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H -4.03450868 +1 5.0366974 +1 3.6698963 +1
O -2.21472416 +1 5.2442459 +1 5.3110959 +1
H -1.71906550 +1 5.3139166 +1 6.1902399 +1
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H -3.34013863 +1 6.1279639 +1 7.9138796 +1
O -4.87556210 +1 4.1402403 +1 8.5755424 +1
H -4.80048760 +1 4.6738216 +1 9.4113081 +1
C -4.26425322 +1 4.3119797 +1 6.2783751 +1
C -3.09918989 +1 4.1629852 +1 5.2447432 +1
C -3.75897917 +1 4.1836522 +1 7.7577827 +1
O -0.14611898 +1 -0.6355193 +1 3.2695945 +1
H -0.84790099 +1 -0.8223951 +1 3.9297327 +1
H -0.22389539 +1 -1.3155960 +1 2.5774978 +1
O 1.76894590 +1 -2.6011903 +1 2.5566665 +1
H 2.47216206 +1 -2.4177178 +1 1.8962576 +1
H 1.84124818 +1 -1.9123877 +1 3.2413646 +1
O -5.92203129 +1 3.3244805 +1 0.5996556 +1
H -4.97593838 +1 3.2489363 +1 0.8994368 +1
O -5.48808279 +1 5.6009307 +1 0.6210054 +1
H -5.32210218 +1 5.8346006 +1 1.5755175 +1
O -7.05585050 +1 4.7684874 +1 2.7410792 +1
H -6.64263763 +1 3.8759580 +1 3.0537629 +1
O -8.46514663 +1 3.6675525 +1 1.4134030 +1
H -8.96273743 +1 3.6012278 +1 0.5346854 +1
O -7.78346427 +1 3.6986999 +1 -1.3202099 +1
H -7.34204895 +1 2.7898820 +1 -1.1936523 +1
O -5.80632857 +1 4.7709271 +1 -1.8527657 +1
H -5.88703946 +1 4.2545721 +1 -2.6985822 +1
C -6.41408371 +1 4.5976903 +1 0.4449418 +1
C -7.57949707 +1 4.7484224 +1 1.4787699 +1
C -6.92162493 +1 4.7293520 +1 -1.0339363 +1
O -9.38007985 +1 7.4789472 +1 -0.3673744 +1
H -10.32859548 +1 7.5496484 +1 -0.6546446 +1
O -9.79975921 +1 5.2010528 +1 -0.3686756 +1
H -9.96750113 +1 4.9578975 +1 -1.3177891 +1
O -8.23444870 +1 6.0368034 +1 -2.4960364 +1
H -8.64689580 +1 6.9402009 +1 -2.8055178 +1
O -6.81889959 +1 7.1335653 +1 -1.1657316 +1
H -6.30987980 +1 7.1829661 +1 -0.2923724 +1
O -7.50965497 +1 7.0992264 +1 1.5837334 +1
H -7.94215287 +1 8.0141372 +1 1.4528219 +1
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H -9.38260395 +1 6.3870646 +1 2.9985180 +1
C -8.87790045 +1 6.2108111 +1 -0.2001420 +1
C -7.71120240 +1 6.0581797 +1 -1.2344075 +1
C -8.37365403 +1 6.0755306 +1 1.2811010 +1
O -4.72568760 +1 1.1875244 +1 -3.1890751 +1
H -5.41925792 +1 0.9204399 +1 -2.5492491 +1
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H -2.77878391 +1 -0.0727438 +1 -3.1684337 +1
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H -10.38380483 +1 4.9139227 +1 7.4638620 +1
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H -8.73920056 +1 4.0787209 +1 5.7078511 +1
O -7.18107429 +1 6.0506827 +1 5.0817717 +1
H -7.29853235 +1 5.7058910 +1 4.1605224 +1
C -7.80359851 +1 5.8772960 +1 7.3613063 +1
C -8.97043376 +1 6.0337321 +1 8.3965635 +1
C -8.30717468 +1 6.0145648 +1 5.8798826 +1
O -10.75951884 +1 8.7640149 +1 6.5583857 +1
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H -11.35931143 +1 6.2518841 +1 5.5837323 +1
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H -10.79621808 +1 7.8394678 +1 9.8567431 +1
C -10.26820878 +1 7.4903397 +1 6.7146199 +1
C -9.10122337 +1 7.3408754 +1 5.6827591 +1
C -9.76259058 +1 7.3615119 +1 8.1945553 +1
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H -4.16181956 +1 1.2664682 +1 3.6795240 +1
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H 0.71836158 +1 5.8579334 +1 0.4902394 +1
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H -0.95193438 +1 6.4811996 +1 2.6446781 +1
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H -0.19462782 +1 6.8612784 +1 -3.1065234 +1
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C -1.88642772 +1 7.3547043 +1 1.0685756 +1
C -1.22770148 +1 7.3347104 +1 -1.4432113 +1
O -3.68537121 +1 10.0870221 +1 -0.7775148 +1
H -4.64299135 +1 10.1553874 +1 -1.0434556 +1
O -4.10839382 +1 7.8107095 +1 -0.7785600 +1
H -4.28469881 +1 7.5733587 +1 -1.7287760 +1
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C -2.01815447 +1 8.6640112 +1 -1.6455878 +1
C -2.67818913 +1 8.6823349 +1 0.8697585 +1
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H -3.04637345 +1 6.6806337 +1 5.2961553 +1
O -1.48632291 +1 8.6555315 +1 4.6738168 +1
H -1.60509144 +1 8.3110353 +1 3.7521966 +1
C -2.11014799 +1 8.4838372 +1 6.9523228 +1
C -3.27629976 +1 8.6392332 +1 7.9877846 +1
C -2.61369990 +1 8.6195680 +1 5.4707020 +1
O -5.06398989 +1 11.3724695 +1 6.1550169 +1
H -6.01096993 +1 11.4469691 +1 5.8567613 +1
O -5.49703082 +1 9.0952241 +1 6.1322976 +1
H -5.66373965 +1 8.8600701 +1 5.1785339 +1
O -3.93109891 +1 9.9283772 +1 4.0114169 +1
H -4.33979546 +1 10.8250497 +1 3.7002536 +1
O -2.51915388 +1 11.0275998 +1 5.3363275 +1
H -2.02076647 +1 11.0948962 +1 6.2142792 +1
O -3.20377748 +1 10.9999349 +1 8.0717918 +1
H -3.64267145 +1 11.9092929 +1 7.9402744 +1
O -5.18130465 +1 9.9260677 +1 8.6051767 +1
H -5.10688724 +1 10.4574710 +1 9.4417160 +1
C -4.57124366 +1 10.0990762 +1 6.3074747 +1
C -3.40627474 +1 9.9476536 +1 5.2734413 +1
C -4.06535817 +1 9.9685934 +1 7.7865965 +1
O -0.44946294 +1 5.1494644 +1 3.2951700 +1
H -1.15217348 +1 4.9565997 +1 3.9537572 +1
H -0.52545746 +1 4.4701530 +1 2.6008849 +1
O 1.46409539 +1 3.1835585 +1 2.5831568 +1
H 2.16608110 +1 3.3701594 +1 1.9227623 +1
H 1.53185146 +1 3.8706274 +1 3.2680570 +1
O -6.22776943 +1 9.1101854 +1 0.6304359 +1
H -5.28274716 +1 9.0360731 +1 0.9322566 +1
O -5.79613075 +1 11.3867450 +1 0.6476202 +1
H -5.62802095 +1 11.6226834 +1 1.6007293 +1
O -7.36714536 +1 10.5530487 +1 2.7699743 +1
H -6.95753928 +1 9.6555027 +1 3.0812485 +1
O -8.77354606 +1 9.4522430 +1 1.4378408 +1
H -9.27516242 +1 9.3910381 +1 0.5608564 +1
O -8.09244838 +1 9.4830239 +1 -1.2907081 +1
H -7.65239253 +1 8.5700971 +1 -1.1622086 +1
O -6.11416570 +1 10.5562888 +1 -1.8229820 +1
H -6.19385665 +1 10.0369770 +1 -2.6670960 +1
C -6.72165564 +1 10.3822903 +1 0.4739950 +1
C -7.88773824 +1 10.5331774 +1 1.5064982 +1
C -7.23021775 +1 10.5122687 +1 -1.0049158 +1
O -9.68598295 +1 13.2669804 +1 -0.3376727 +1
H -10.63627239 +1 13.3383611 +1 -0.6202376 +1
O -10.11046579 +1 10.9905140 +1 -0.3423464 +1
H -10.27775852 +1 10.7505324 +1 -1.2924841 +1
O -8.54425852 +1 11.8245713 +1 -2.4668316 +1
H -8.95235037 +1 12.7304961 +1 -2.7735135 +1
O -7.12478453 +1 12.9164973 +1 -1.1400977 +1
H -6.62155603 +1 12.9704417 +1 -0.2636203 +1
O -7.81412169 +1 12.8842286 +1 1.6106177 +1
H -8.24594129 +1 13.7954827 +1 1.4778687 +1
O -9.80665620 +1 11.8253464 +1 2.1074284 +1
H -9.68834216 +1 12.1732117 +1 3.0281514 +1
C -9.18591307 +1 11.9976086 +1 -0.1713267 +1
C -8.01938505 +1 11.8419304 +1 -1.2057396 +1
C -8.68059868 +1 11.8602235 +1 1.3092095 +1
O -5.02732909 +1 6.9741805 +1 -3.1642161 +1
H -5.72124942 +1 6.6990748 +1 -2.5281307 +1
H -5.04926236 +1 6.3298761 +1 -3.8941954 +1
O -3.13162476 +1 5.0681865 +1 -3.8736695 +1
H -2.43729927 +1 5.3347900 +1 -4.5133835 +1
H -3.08756434 +1 5.7076014 +1 -3.1377531 +1
O -7.60979834 +1 10.3938037 +1 7.5584870 +1
H -6.65499253 +1 10.3249401 +1 7.8330402 +1
O -7.18648003 +1 12.6692001 +1 7.5596388 +1
H -7.01680680 +1 12.9076398 +1 8.5090055 +1
O -8.75545585 +1 11.8376444 +1 9.6864227 +1
H -8.35496734 +1 10.9351911 +1 10.0038919 +1
O -10.17306661 +1 10.7441674 +1 8.3573247 +1
H -10.70014686 +1 10.7075381 +1 7.4938101 +1
O -9.48057710 +1 10.7749717 +1 5.6029064 +1
H -9.05040810 +1 9.8593423 +1 5.7352034 +1
O -7.48854809 +1 11.8345220 +1 5.1112927 +1
H -7.60455364 +1 11.4874233 +1 4.1907247 +1
C -8.11128945 +1 11.6618955 +1 7.3898382 +1
C -9.27814771 +1 11.8183277 +1 8.4243231 +1
C -8.61554261 +1 11.7972579 +1 5.9084682 +1
O -11.06442964 +1 14.5520198 +1 6.5858783 +1
H -12.00961766 +1 14.6285528 +1 6.2905109 +1
O -11.50180819 +1 12.2748739 +1 6.5643874 +1
H -11.66631581 +1 12.0412464 +1 5.6103327 +1
O -9.93223291 +1 13.1064178 +1 4.4489346 +1
H -10.34196770 +1 14.0033788 +1 4.1395854 +1
O -8.52030280 +1 14.2053494 +1 5.7751023 +1
H -8.02529918 +1 14.2744034 +1 6.6548080 +1
O -9.20523257 +1 14.1794693 +1 8.5030078 +1
H -9.64359356 +1 15.0911766 +1 8.3703504 +1
O -11.18481184 +1 13.1084177 +1 9.0408340 +1
H -11.10180192 +1 13.6241222 +1 9.8868934 +1
C -10.57446240 +1 13.2776391 +1 6.7432881 +1
C -9.40753794 +1 13.1252790 +1 5.7111146 +1
C -10.06855349 +1 13.1481008 +1 8.2229075 +1
O -6.45079181 +1 8.3303514 +1 3.7340910 +1
H -7.15215868 +1 8.1373278 +1 4.3948271 +1
H -6.52191238 +1 7.6476469 +1 3.0439654 +1
O -4.53706651 +1 6.3648503 +1 3.0197616 +1
H -3.83511113 +1 6.5565814 +1 2.3601041 +1
H -4.46457257 +1 7.0459429 +1 3.7107678 +1
Tv -2.83405693 +1 2.6551220 +1 13.7992862 +1
Tv -12.00992832 +1 6.3506393 +1 0.8704367 +1
Tv -0.59999435 +1 11.5767739 +1 0.0498477 +1
Optimized PM6_D3H4 data set:
MERS=(2,2,2) CHARGE=0 EF OUTPUT THREADS=1 PM6-D3H4 GRADIENTS
Dodecahydroxycyclohexane dihydrate (SANTEH) (PM6-D3H4)
O -0.04834501 +1 -0.0280416 +1 0.1262769 +1
H 0.89622601 +1 -0.2069553 +1 -0.2200233 +1
O 0.56628227 +1 2.1686507 +1 0.0428087 +1
H 0.73065377 +1 2.2967099 +1 1.0510274 +1
O -1.09791805 +1 1.6255805 +1 2.1891328 +1
H -0.99215597 +1 0.6481475 +1 2.6821238 +1
O -2.54428142 +1 0.4433566 +1 0.9664156 +1
H -3.24415835 +1 0.5347570 +1 0.2441115 +1
O -1.65981499 +1 0.3792369 +1 -2.1466817 +1
H -1.33328469 +1 -0.5119697 +1 -1.7527275 +1
O 0.23268864 +1 1.6485462 +1 -2.3650925 +1
H 0.05131974 +1 1.5391500 +1 -3.3693217 +1
C -0.49918829 +1 1.2719889 +1 -0.1323290 +1
C -1.63779206 +1 1.5381357 +1 0.9202182 +1
C -0.94808637 +1 1.4580326 +1 -1.6195737 +1
O -3.28222872 +1 4.4201661 +1 -1.0120149 +1
H -4.27248690 +1 4.5472620 +1 -0.7858824 +1
O -3.99051805 +1 2.2340753 +1 -0.9518752 +1
H -4.23579863 +1 2.1455798 +1 -1.9755024 +1
O -2.37539985 +1 2.6642056 +1 -3.1010021 +1
H -2.42587541 +1 3.6642601 +1 -3.6411535 +1
O -0.87913204 +1 3.8681637 +1 -1.9555274 +1
H -0.20355122 +1 3.8478123 +1 -1.1983713 +1
O -1.54816080 +1 3.8788707 +1 1.1338567 +1
H -1.79897059 +1 4.8115116 +1 0.8163199 +1
O -3.56700981 +1 2.8138139 +1 1.4760399 +1
H -3.33102979 +1 2.9252335 +1 2.4714915 +1
C -2.89098181 +1 3.0804601 +1 -0.7931369 +1
C -1.78867854 +1 2.7635527 +1 -1.8635753 +1
C -2.41338315 +1 2.8815839 +1 0.6819234 +1
O 1.25992632 +1 -1.6275188 +1 -3.9401918 +1
H 0.72980194 +1 -2.4501025 +1 -3.7310386 +1
H 1.77071982 +1 -1.6669844 +1 -4.8141983 +1
O 3.65990372 +1 -4.4149606 +1 -4.4565119 +1
H 4.15980572 +1 -3.5936549 +1 -4.8230788 +1
H 2.98154652 +1 -4.1361804 +1 -3.7810805 +1
O -1.40719929 +1 1.1620432 +1 6.9202779 +1
H -0.45098773 +1 0.9966178 +1 6.5993320 +1
O -0.79234161 +1 3.3684132 +1 6.8812090 +1
H -0.62575509 +1 3.4789530 +1 7.8937585 +1
O -2.43255993 +1 2.8466913 +1 8.9963114 +1
H -2.30945807 +1 1.8826734 +1 9.4989536 +1
O -3.90085556 +1 1.6539886 +1 7.7996411 +1
H -4.64442901 +1 1.7732324 +1 7.1265694 +1
O -2.98648591 +1 1.5994872 +1 4.6565667 +1
H -2.66286151 +1 0.7099793 +1 5.0544206 +1
O -1.11185414 +1 2.9016231 +1 4.4597938 +1
H -1.27610744 +1 2.6988674 +1 3.4714367 +1
C -1.85234292 +1 2.4739877 +1 6.6862531 +1
C -2.98221891 +1 2.7362887 +1 7.7392477 +1
C -2.29524260 +1 2.6803868 +1 5.2020190 +1
O -4.59537910 +1 5.6468186 +1 5.8783375 +1
H -5.58394421 +1 5.7963059 +1 6.0830111 +1
O -5.35849950 +1 3.4725910 +1 5.9152438 +1
H -5.61028355 +1 3.3856792 +1 4.9065514 +1
O -3.72414239 +1 3.9084557 +1 3.7437281 +1
H -3.78527341 +1 4.9262278 +1 3.2296449 +1
O -2.24057803 +1 5.0976149 +1 4.9221870 +1
H -1.72729012 +1 5.1886983 +1 5.7894998 +1
O -2.91769291 +1 5.0942053 +1 7.9984559 +1
H -3.22418863 +1 6.0200873 +1 7.6917768 +1
O -4.91111599 +1 3.9659745 +1 8.3197667 +1
H -4.68033824 +1 4.0125675 +1 9.3292552 +1
C -4.23849665 +1 4.2959743 +1 6.0646312 +1
C -3.14766138 +1 3.9819296 +1 4.9795222 +1
C -3.75806493 +1 4.0778982 +1 7.5309873 +1
O -0.11009860 +1 -0.4223267 +1 2.9133033 +1
H -0.55487071 +1 -1.3120583 +1 3.1097246 +1
H 0.40322971 +1 -0.4363420 +1 2.0428454 +1
O 2.28227991 +1 -3.2677150 +1 2.3130392 +1
H 2.72434971 +1 -2.4176376 +1 1.9850079 +1
H 1.64382918 +1 -3.1009583 +1 3.0585353 +1
O -6.24932478 +1 3.0446581 +1 0.7451929 +1
H -5.29075604 +1 2.8986073 +1 0.4307599 +1
O -5.61449109 +1 5.2391101 +1 0.6821238 +1
H -5.42535755 +1 5.3576283 +1 1.6878150 +1
O -7.26298069 +1 4.7029208 +1 2.8527946 +1
H -7.16370690 +1 3.7006657 +1 3.3511372 +1
O -8.70213796 +1 3.5166719 +1 1.6446634 +1
H -9.34588950 +1 3.5465565 +1 0.8639200 +1
O -7.86538222 +1 3.4690843 +1 -1.4625853 +1
H -7.50789779 +1 2.5787733 +1 -1.0704491 +1
O -5.96340633 +1 4.7120990 +1 -1.7166568 +1
H -6.15593871 +1 4.6032255 +1 -2.7226508 +1
C -6.69271682 +1 4.3599911 +1 0.5218247 +1
C -7.81577448 +1 4.6195086 +1 1.5936127 +1
C -7.14083084 +1 4.5518066 +1 -0.9649270 +1
O -9.39939808 +1 7.5579676 +1 -0.3088487 +1
H -10.39554323 +1 7.6973684 +1 -0.1058668 +1
O -10.14681585 +1 5.3899666 +1 -0.3020786 +1
H -10.34126782 +1 5.2973323 +1 -1.3517559 +1
O -8.57041615 +1 5.8163817 +1 -2.4125799 +1
H -8.63282329 +1 6.8530231 +1 -2.8889295 +1
O -7.01775609 +1 6.9553089 +1 -1.2624015 +1
H -6.30591166 +1 6.8649610 +1 -0.5450434 +1
O -7.76808150 +1 6.9536894 +1 1.8890867 +1
H -7.95987545 +1 7.8811855 +1 1.5203551 +1
O -9.77506352 +1 5.8743768 +1 2.1427903 +1
H -9.56724701 +1 6.0728934 +1 3.1274613 +1
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C -8.59977486 +1 5.9627264 +1 1.3709154 +1
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