Time stamp: Sun Jul 12 08:52:02 2020 Cytosine (CYTOSM03)

168 Cytosine (CYTOSM03)

(Previous)    Hydroquinone bis(aniline) (HIBFUT)
(Back)          Elements: O 2 C 4 N 3 H 7 (Z = 4)     (Periodic Table)
(Next)          XV 2-amino-4-methylpyrimidine and 2-methylbenzoic acid
                      Unit Cell Parameters:       a      b      c   alpha   beta  gamma   Volume  Density       Heat of Formation (Kcal/mol)
                                     X-ray:     9.82   7.52   7.73  79.50  90.00  90.00    560.95  1.529         -124.3 calc'd using PM7
                                       PM7:     9.57   7.41   7.70  84.68  90.27  89.49    543.00  1.579         -132.5 calc'd using PM7 (ref:     0.0)
                                  PM6_D3H4:    10.28   7.07   7.46  83.14  92.45  88.09    537.60  1.595         -119.2 calc'd using PM6_D3H4
                                  X-Ray                                             PM7                                            PM6_D3H4
Calc'd on: Feb 28 2020 @ 18:25:22 Feb 24 2020 @ 04:26:21 ARC file May 23 2020 @ 08:59:15
 For X-Ray structure, contact the CCDC: http://www.ccdc.cam.ac.uk/

  Optimized PM7 data set:
 MERS=(1,1,1) GNORM=4
 Cytosine (CYTOSM03)

  O     0.02142077 +1    0.1194521 +1   -0.2579000 +1
  C     0.69267408 +1   -2.3763868 +1    3.2446879 +1
  O    -0.53491890 +1   -2.3538510 +1    3.4109348 +1
  N     1.43618078 +1   -1.2473698 +1    3.0819994 +1
  C     2.76770622 +1   -1.3518777 +1    2.7839263 +1
  N     3.46861466 +1   -0.1966033 +1    2.7148984 +1
  C     3.38139828 +1   -2.6382956 +1    2.6024009 +1
  C     2.62418412 +1   -3.7591276 +1    2.8179857 +1
  H     0.72019603 +1   -4.4872696 +1    3.3798676 +1
  H     4.41694095 +1   -0.2185677 +1    2.3415982 +1
  H     2.99794859 +1    0.6933941 +1    2.8295998 +1
  H     4.42507103 +1   -2.7000325 +1    2.3000060 +1
  H     3.02727551 +1   -4.7867462 +1    2.7227209 +1
  N     1.30921950 +1   -3.6487572 +1    3.1934172 +1
  N     0.79136736 +1    1.2405717 +1   -3.7958103 +1
  C     1.56568305 +1    2.4240679 +1   -3.8145581 +1
  O     2.78778912 +1    2.2869841 +1   -3.9802638 +1
  N     0.97541302 +1    3.6335051 +1   -3.6059323 +1
  C    -0.36017684 +1    3.6875389 +1   -3.3112156 +1
  N    -0.91635112 +1    4.9165263 +1   -3.1945895 +1
  C    -1.13510750 +1    2.4880008 +1   -3.1682151 +1
  C    -0.52411010 +1    1.2872768 +1   -3.4110897 +1
  H     1.28099374 +1    0.3352271 +1   -3.9556647 +1
  H    -1.86059660 +1    5.0018805 +1   -2.8205653 +1
  H    -0.33511349 +1    5.7435220 +1   -3.2640507 +1
  H    -2.18105003 +1    2.5507688 +1   -2.8768411 +1
  H    -1.05681019 +1    0.3182225 +1   -3.3308289 +1
  N     0.61554130 +1    6.0308543 +1   -0.0090445 +1
  C     1.24052221 +1    4.7635753 +1   -0.0789496 +1
  O     2.45844033 +1    4.7540942 +1   -0.3131718 +1
  N     0.51864937 +1    3.6279058 +1    0.1320855 +1
  C    -0.80091251 +1    3.7251018 +1    0.4822893 +1
  N    -1.47648435 +1    2.5715460 +1    0.6869562 +1
  C    -1.42844902 +1    5.0083838 +1    0.6414584 +1
  C    -0.69190197 +1    6.1343650 +1    0.3933662 +1
  H     1.19055694 +1    6.8702308 +1   -0.2219087 +1
  H    -2.47604903 +1    2.6113394 +1    0.8739182 +1
  H    -1.02680737 +1    1.6803549 +1    0.5393719 +1
  H    -2.46525970 +1    5.0623940 +1    0.9684152 +1
  H    -1.10848492 +1    7.1563897 +1    0.4859964 +1
  N     2.01196242 +1    1.1699783 +1   -0.4784635 +1
  C     1.24243811 +1   -0.0181767 +1   -0.4305589 +1
  N     1.83481327 +1   -1.2291661 +1   -0.6248700 +1
  C     3.18030207 +1   -1.2844551 +1   -0.8695194 +1
  N     3.72975297 +1   -2.5161835 +1   -0.9945922 +1
  C     3.97335425 +1   -0.0893310 +1   -0.9363809 +1
  C     3.35895615 +1    1.1144643 +1   -0.7208550 +1
  H     1.52963544 +1    2.0682581 +1   -0.2675640 +1
  H     4.67349339 +1   -2.5987972 +1   -1.3673484 +1
  H     3.13731771 +1   -3.3385787 +1   -0.9636163 +1
  H     5.03621773 +1   -0.1604734 +1   -1.1557056 +1
  H     3.89992129 +1    2.0805294 +1   -0.7429838 +1
  O    -1.65608920 +1   -0.6134357 +1    1.7042954 +1
  H    -0.97563333 +1   -0.4023498 +1    1.0609735 +1
  H    -1.26251130 +1   -1.2183428 +1    2.3445323 +1
  O     4.10433842 +1    3.8232894 +1   -2.2186192 +1
  H     3.44781877 +1    4.1291780 +1   -1.5895114 +1
  H     3.64982080 +1    3.2720502 +1   -2.8690773 +1
  O     3.59265615 +1    3.0404167 +1    1.4137696 +1
  H     2.90824748 +1    2.8135768 +1    2.0513321 +1
  H     3.20769496 +1    3.6537574 +1    0.7770007 +1
  O    -1.29476762 +1   -1.4560299 +1   -1.9839722 +1
  H    -0.63992091 +1   -1.7475816 +1   -2.6236856 +1
  H    -0.84115088 +1   -0.9065054 +1   -1.3319221 +1
 Tv    -0.62836855 +1   -9.5438702 +1   -0.1812109 +1 
 Tv     0.83971104 +1    0.0186444 +1   -7.3608208 +1 
 Tv     7.67908828 +1   -0.4717554 +1    0.1566485 +1 
 

  Optimized PM6_D3H4 data set:
 MERS=(1,1,1) GNORM=4 PM6-D3H4 THREADS=1
 Cytosine (CYTOSM03) (PM6-D3H4)

  O    -0.06984416 +1    0.2873344 +1   -0.1141514 +1
  C     0.58699954 +1   -2.7892324 +1    3.1979608 +1
  O    -0.65186401 +1   -2.8772366 +1    3.3466180 +1
  N     1.24286811 +1   -1.5860702 +1    3.1349957 +1
  C     2.60124764 +1   -1.5877968 +1    2.8492531 +1
  N     3.21661829 +1   -0.3869964 +1    2.7043366 +1
  C     3.31701076 +1   -2.8288143 +1    2.6746397 +1
  C     2.64067171 +1   -4.0127311 +1    2.7377997 +1
  H     0.73727718 +1   -4.9198978 +1    3.0627941 +1
  H     4.21988545 +1   -0.3673765 +1    2.4051020 +1
  H     2.71557802 +1    0.4968937 +1    2.8862216 +1
  H     4.38723786 +1   -2.8002795 +1    2.4699952 +1
  H     3.09806564 +1   -5.0061633 +1    2.5488460 +1
  N     1.27962153 +1   -4.0215943 +1    3.0148707 +1
  N     0.95179196 +1    0.9458627 +1   -3.6200835 +1
  C     1.72087083 +1    2.1481217 +1   -3.6909207 +1
  O     2.95523617 +1    2.0071143 +1   -3.7818358 +1
  N     1.11088387 +1    3.3758060 +1   -3.5928821 +1
  C    -0.25119579 +1    3.4346625 +1   -3.3499898 +1
  N    -0.82211108 +1    4.6538963 +1   -3.1771887 +1
  C    -1.03360411 +1    2.2264195 +1   -3.2625051 +1
  C    -0.41689174 +1    1.0162532 +1   -3.3825697 +1
  H     1.44023366 +1    0.0234336 +1   -3.6700036 +1
  H    -1.80986558 +1    4.6912042 +1   -2.8448058 +1
  H    -0.24972213 +1    5.5154031 +1   -3.2445950 +1
  H    -2.10614951 +1    2.2963904 +1   -3.0787111 +1
  H    -0.94456571 +1    0.0559713 +1   -3.2684082 +1
  N     0.58585791 +1    6.4833668 +1   -0.0164506 +1
  C     1.28638736 +1    5.2580572 +1   -0.2177501 +1
  O     2.51976930 +1    5.3688872 +1   -0.3774260 +1
  N     0.63805276 +1    4.0502317 +1   -0.1525391 +1
  C    -0.71518413 +1    4.0387512 +1    0.1572655 +1
  N    -1.31864077 +1    2.8329707 +1    0.3108211 +1
  C    -1.43769594 +1    5.2726250 +1    0.3496760 +1
  C    -0.77110151 +1    6.4620467 +1    0.2847230 +1
  H     1.12674618 +1    7.3766589 +1   -0.0334262 +1
  H    -2.31431095 +1    2.8046988 +1    0.6275209 +1
  H    -0.80452815 +1    1.9529462 +1    0.1309055 +1
  H    -2.50508255 +1    5.2372015 +1    0.5681804 +1
  H    -1.23476760 +1    7.4482386 +1    0.4861016 +1
  N     1.92967048 +1    1.3410722 +1   -0.3479150 +1
  C     1.16606391 +1    0.1406019 +1   -0.2368736 +1
  N     1.75996102 +1   -1.0926660 +1   -0.3418343 +1
  C     3.11431706 +1   -1.1546439 +1   -0.6262391 +1
  N     3.67736816 +1   -2.3776785 +1   -0.8088509 +1
  C     3.89897293 +1    0.0509614 +1   -0.7479365 +1
  C     3.29111725 +1    1.2656278 +1   -0.6268129 +1
  H     1.43352401 +1    2.2630648 +1   -0.3301123 +1
  H     4.65718462 +1   -2.4206036 +1   -1.1527554 +1
  H     3.10500887 +1   -3.2364904 +1   -0.7356960 +1
  H     4.96735137 +1   -0.0191206 +1   -0.9611501 +1
  H     3.82089931 +1    2.2220375 +1   -0.7655673 +1
  O    -1.70611439 +1   -1.0893231 +1    1.5651135 +1
  H    -1.14117472 +1   -0.4813463 +1    1.0026076 +1
  H    -1.13109338 +1   -1.5219053 +1    2.2351597 +1
  O     4.04965697 +1    3.9357399 +1   -2.0684385 +1
  H     3.48666427 +1    4.4801300 +1   -1.4672297 +1
  H     3.48006536 +1    3.4550202 +1   -2.6932363 +1
  O     3.58425943 +1    3.5839660 +1    1.4468768 +1
  H     3.00818259 +1    2.9646145 +1    1.9698548 +1
  H     3.03778872 +1    3.9907844 +1    0.7196943 +1
  O    -1.15309032 +1   -1.5952207 +1   -1.9258260 +1
  H    -0.57041675 +1   -2.1535794 +1   -2.4902802 +1
  H    -0.60504278 +1   -1.1598274 +1   -1.2252021 +1
 Tv    -0.25941705 +1  -10.2780736 +1   -0.0051455 +1 
 Tv     0.94295461 +1   -0.2556300 +1   -7.0058993 +1 
 Tv     7.45592582 +1    0.1305495 +1    0.0990078 +1