SUMMARY OF PM7 CALCULATION, Site No: 23746
MOPAC2016 (Version: 21.053M)
Tue Feb 23 15:56:53 2021
No. of days remaining = 364
Empirical Formula: C96 H120 N72 O24 = 312 atoms
MERS=(1,2,3) CHARGE=0 OUTPUT THREADS=1 PM7 GRADIENTS NOTXT EF
Cytosine
GEOMETRY OPTIMISED USING EIGENVECTOR FOLLOWING (EF).
SCF FIELD WAS ACHIEVED
HEAT OF FORMATION = -1492.40486 KCAL/MOL = -6244.22193 KJ/MOL
H.o.F. per unit cell = -62.18354 KCAL, for 24 unit cells, unit cell = C4 H5 N3 O1
TOTAL ENERGY = -33927.93767 EV
ELECTRONIC ENERGY = -179798316.19702 EV
CORE-CORE REPULSION = 179764388.25936 EV
VOLUME OF UNIT CELL = 462.628 CUBIC ANGSTROMS
DENSITY = 1.595 GRAMS/CC
A = 12.887 ANGSTROMS
B = 9.524 ANGSTROMS
C = 3.769 ANGSTROMS
ALPHA = 90.643 DEGREES
BETA = 90.007 DEGREES
GAMMA = 90.040 DEGREES
VOLUME OF CLUSTER = 2775.76504 ANGSTROMS**3 = 1671.604 CM**3/MOLE
GRADIENT NORM = 16614.25095 = 940.59679 PER ATOM
NO. OF FILLED LEVELS = 504
IONIZATION POTENTIAL = 10.009475 EV
HOMO LUMO ENERGIES (EV) = -10.009 -0.892
MOLECULAR WEIGHT = 2666.4720
Pressure required to constrain translation vectors
Tv( 313) Pressure: 0.02 GPa
Tv( 314) Pressure: 0.01 GPa
Tv( 315) Pressure: -0.02 GPa
SCF CALCULATIONS = 33
WALL-CLOCK TIME = 29 MINUTES AND 48.383 SECONDS
COMPUTATION TIME = 29 MINUTES AND 37.215 SECONDS
FINAL GEOMETRY OBTAINED
MERS=(1,2,3) CHARGE=0 OUTPUT THREADS=1 PM7 GRADIENTS NOTXT EF
Cytosine
C -0.28339617 +1 1.51528743 +1 -2.44738214 +1
C 1.70441261 +1 2.48833656 +1 -1.61237973 +1
C 2.20939188 +1 1.21605242 +1 -1.19140737 +1
C 1.39710654 +1 0.12346929 +1 -1.36945626 +1
H -0.37559042 +1 -0.58807299 +1 -2.20161339 +1
H 1.92289416 +1 4.53211630 +1 -1.65090632 +1
H 3.33099894 +1 3.65972628 +1 -1.14174903 +1
H 3.19319339 +1 1.14870113 +1 -0.74123759 +1
H 1.68341658 +1 -0.90124286 +1 -1.06377401 +1
N 0.15576279 +1 0.25980610 +1 -1.93066627 +1
N 0.52324036 +1 2.60239333 +1 -2.27152899 +1
N 2.34192895 +1 3.66192247 +1 -1.34530815 +1
O -1.34916632 +1 1.55735267 +1 -3.05393638 +1
C -6.79540320 +1 -6.27629515 +1 -1.22406379 +1
C -4.82394369 +1 -7.30156924 +1 -2.01919695 +1
C -4.31465789 +1 -6.05542873 +1 -2.51256872 +1
C -5.10371208 +1 -4.94246372 +1 -2.35998377 +1
H -6.84894780 +1 -4.17745147 +1 -1.51302533 +1
H -4.59296690 +1 -9.33488434 +1 -1.84588430 +1
H -3.19774401 +1 -8.49418028 +1 -2.43426316 +1
H -3.34516026 +1 -6.02015680 +1 -2.99698711 +1
H -4.80722090 +1 -3.93426303 +1 -2.70894181 +1
N -6.33576328 +1 -5.04068007 +1 -1.77159558 +1
N -6.00731396 +1 -7.38356948 +1 -1.35645233 +1
N -4.18489487 +1 -8.48717101 +1 -2.21738033 +1
O -7.86744925 +1 -6.28494699 +1 -0.62661931 +1
C 0.15530882 +1 -3.22501489 +1 0.68069548 +1
C -1.80787200 +1 -2.24598017 +1 -0.20706384 +1
C -2.29180692 +1 -3.51594473 +1 -0.66309386 +1
C -1.49902344 +1 -4.61503730 +1 -0.44291181 +1
H 0.21841801 +1 -5.33563437 +1 0.49736444 +1
H -2.05451497 +1 -0.20729085 +1 -0.12875054 +1
H -3.43490176 +1 -1.08060536 +1 -0.70500949 +1
H -3.24649565 +1 -3.58035163 +1 -1.17255853 +1
H -1.77791910 +1 -5.63589762 +1 -0.76607403 +1
N -0.28638262 +1 -4.48910707 +1 0.18069503 +1
N -0.63965098 +1 -2.13305317 +1 0.47668025 +1
N -2.45331426 +1 -1.07519668 +1 -0.46221638 +1
O 1.21640013 +1 -3.18663155 +1 1.29409680 +1
C -6.25834345 +1 -1.52816534 +1 -0.56647720 +1
C -8.23809626 +1 -2.50931546 +1 0.27345696 +1
C -8.75056567 +1 -1.23689072 +1 0.68545985 +1
C -7.94697717 +1 -0.13924004 +1 0.50069855 +1
H -6.17509025 +1 0.57862842 +1 -0.33521818 +1
H -8.45960096 +1 -4.55137360 +1 0.23583976 +1
H -9.86655591 +1 -3.67863825 +1 0.73888898 +1
H -9.73525553 +1 -1.17520578 +1 1.13347181 +1
H -8.24329778 +1 0.88405483 +1 0.79990984 +1
N -6.70544047 +1 -0.27040029 +1 -0.06138834 +1
N -7.05631239 +1 -2.62199212 +1 -0.38434281 +1
N -8.87352194 +1 -3.68195481 +1 0.55369836 +1
O -5.19355085 +1 -1.56836110 +1 -1.17466083 +1
C -0.23739162 +1 11.03608983 +1 -2.54404644 +1
C 1.75481529 +1 12.00862106 +1 -1.72418825 +1
C 2.22624275 +1 10.74671415 +1 -1.23506532 +1
C 1.40162634 +1 9.65907258 +1 -1.38585105 +1
H -0.36399843 +1 8.94286331 +1 -2.23072512 +1
H 2.03153142 +1 14.04025760 +1 -1.87702354 +1
H 3.40941927 +1 13.16519650 +1 -1.30562620 +1
H 3.19525441 +1 10.68214936 +1 -0.75487424 +1
H 1.66748052 +1 8.64365192 +1 -1.03464925 +1
N 0.17448765 +1 9.79120271 +1 -1.97783135 +1
N 0.58008880 +1 12.11983703 +1 -2.39646862 +1
N 2.42156383 +1 13.17795636 +1 -1.51845182 +1
O -1.29352614 +1 11.06958382 +1 -3.16713574 +1
C -6.71733691 +1 3.21488527 +1 -1.27039429 +1
C -4.73671567 +1 2.22913688 +1 -2.10805196 +1
C -4.24496767 +1 3.49471387 +1 -2.56643084 +1
C -5.05163994 +1 4.59166279 +1 -2.39088802 +1
H -6.80804825 +1 5.31661705 +1 -1.53438087 +1
H -4.49515520 +1 0.19114640 +1 -2.01717134 +1
H -3.10860180 +1 1.05762202 +1 -2.58533509 +1
H -3.27499216 +1 3.55536928 +1 -3.04553558 +1
H -4.77126069 +1 5.61033018 +1 -2.72191095 +1
N -6.28134734 +1 4.46586864 +1 -1.80331374 +1
N -5.91148453 +1 2.12427520 +1 -1.43376531 +1
N -4.09460613 +1 1.05521861 +1 -2.36069472 +1
O -7.78752432 +1 3.18426045 +1 -0.67082762 +1
C 0.17436740 +1 6.28442318 +1 0.62137238 +1
C -1.79349981 +1 7.25195556 +1 -0.26051386 +1
C -2.28705005 +1 5.97647566 +1 -0.68864899 +1
C -1.48029975 +1 4.88375644 +1 -0.48715831 +1
H 0.27525391 +1 4.17927789 +1 0.39203677 +1
H -2.01208973 +1 9.29275319 +1 -0.24458820 +1
H -3.41029113 +1 8.42412463 +1 -0.77736280 +1
H -3.25624913 +1 5.90404766 +1 -1.16765102 +1
H -1.75897552 +1 3.85850389 +1 -0.79832321 +1
N -0.25387681 +1 5.02347818 +1 0.10419943 +1
N -0.62728068 +1 7.37313441 +1 0.42510419 +1
N -2.42300918 +1 8.42291491 +1 -0.55841393 +1
O 1.23335872 +1 6.32557249 +1 1.23955060 +1
C -6.23260433 +1 7.99337649 +1 -0.65108091 +1
C -8.21205412 +1 7.02496201 +1 0.20728676 +1
C -8.70047022 +1 8.29895125 +1 0.64477280 +1
C -7.89766996 +1 9.39392056 +1 0.43805468 +1
H -6.15290569 +1 10.10493511 +1 -0.46484178 +1
H -8.46565064 +1 4.98598781 +1 0.13794393 +1
H -9.85479491 +1 5.87211142 +1 0.67157696 +1
H -9.66870772 +1 8.36635546 +1 1.12786354 +1
H -8.18104441 +1 10.41569091 +1 0.75376955 +1
N -6.67450213 +1 9.26156064 +1 -0.16299329 +1
N -7.03563257 +1 6.90497814 +1 -0.45846824 +1
N -8.86592181 +1 5.85747414 +1 0.46337970 +1
O -5.16761257 +1 7.94100330 +1 -1.25660154 +1
C -0.27539414 +1 1.53148971 +1 1.32023746 +1
C 1.71307817 +1 2.50741366 +1 2.14582751 +1
C 2.21715162 +1 1.23571635 +1 2.57181940 +1
C 1.40577325 +1 0.14197177 +1 2.39693709 +1
H -0.36927044 +1 -0.57334875 +1 1.56408388 +1
H 1.94548316 +1 4.54767626 +1 2.08856412 +1
H 3.34822889 +1 3.67025161 +1 2.60501213 +1
H 3.20005352 +1 1.17047995 +1 3.02504991 +1
H 1.69380294 +1 -0.88070803 +1 2.70753321 +1
N 0.16584960 +1 0.27490140 +1 1.83234553 +1
N 0.52979591 +1 2.62174332 +1 1.49045848 +1
N 2.35685402 +1 3.67906318 +1 2.40837466 +1
O -1.34498619 +1 1.57453645 +1 0.72061273 +1
C -6.77985641 +1 -6.27660903 +1 2.54912072 +1
C -4.80530645 +1 -7.29945013 +1 1.75804236 +1
C -4.29112063 +1 -6.04972480 +1 1.27826183 +1
C -5.08089989 +1 -4.93737377 +1 1.43235924 +1
H -6.83410350 +1 -4.17672466 +1 2.26837092 +1
H -4.57263215 +1 -9.33294284 +1 1.92463145 +1
H -3.17449238 +1 -8.48790138 +1 1.35206359 +1
H -3.31638409 +1 -6.01168891 +1 0.80460480 +1
H -4.77686385 +1 -3.92699779 +1 1.09776468 +1
N -6.31848447 +1 -5.03786648 +1 2.00881553 +1
N -5.99222048 +1 -7.38407139 +1 2.41416266 +1
N -4.16490375 +1 -8.48376280 +1 1.55648202 +1
O -7.85365681 +1 -6.28700577 +1 3.14346631 +1
C 0.15696444 +1 -3.22443717 +1 4.47469567 +1
C -1.80132170 +1 -2.24626289 +1 3.57682723 +1
C -2.28976798 +1 -3.51866807 +1 3.13238967 +1
C -1.49959997 +1 -4.61836866 +1 3.35944870 +1
H 0.22114511 +1 -5.33517297 +1 4.29653490 +1
H -2.04731757 +1 -0.20818296 +1 3.64863628 +1
H -3.42387135 +1 -1.08109074 +1 3.06704081 +1
H -3.24687186 +1 -3.58452593 +1 2.62805765 +1
H -1.78221238 +1 -5.64058953 +1 3.04440712 +1
N -0.28665896 +1 -4.49060202 +1 3.98148924 +1
N -0.63490508 +1 -2.13159892 +1 4.26360463 +1
N -2.44221371 +1 -1.07534930 +1 3.30964767 +1
O 1.21692971 +1 -3.18537047 +1 5.09028966 +1
C -6.25165224 +1 -1.53161365 +1 3.22465890 +1
C -8.23127970 +1 -2.51184924 +1 4.06585429 +1
C -8.74318155 +1 -1.23892201 +1 4.47646013 +1
C -7.93995395 +1 -0.14090967 +1 4.29009281 +1
H -6.16648943 +1 0.57509433 +1 3.45481150 +1
H -8.45564522 +1 -4.55403380 +1 4.03105474 +1
H -9.85613721 +1 -3.67927152 +1 4.54965501 +1
H -9.72820393 +1 -1.17638452 +1 4.92365891 +1
H -8.23652166 +1 0.88199988 +1 4.58995321 +1
N -6.69915865 +1 -0.27247059 +1 3.72749718 +1
N -7.05046566 +1 -2.62502427 +1 3.40602017 +1
N -8.86546345 +1 -3.68386143 +1 4.35190900 +1
O -5.18453538 +1 -1.57168232 +1 2.62096096 +1
C -0.22877737 +1 11.05310726 +1 1.22518103 +1
C 1.76360857 +1 12.02669829 +1 2.04117544 +1
C 2.23293440 +1 10.76468942 +1 2.53376915 +1
C 1.40952851 +1 9.67606210 +1 2.38206223 +1
H -0.35595888 +1 8.95768921 +1 1.52945175 +1
H 2.05500514 +1 14.05402243 +1 1.87354340 +1
H 3.42318375 +1 13.17418300 +1 2.46276435 +1
H 3.20065453 +1 10.70069295 +1 3.01778533 +1
H 1.67672756 +1 8.66198633 +1 2.73578278 +1
N 0.18497998 +1 9.80531840 +1 1.78458121 +1
N 0.58713187 +1 12.13891955 +1 1.37156457 +1
N 2.43590788 +1 13.19310434 +1 2.24452326 +1
O -1.28763487 +1 11.08777023 +1 0.60712299 +1
C -6.70359096 +1 3.21597695 +1 2.49981766 +1
C -4.71643661 +1 2.23292735 +1 1.67681747 +1
C -4.21882615 +1 3.50048695 +1 1.22965089 +1
C -5.02619121 +1 4.59719243 +1 1.40291043 +1
H -6.79160688 +1 5.31880549 +1 2.24498282 +1
H -4.47173704 +1 0.19619570 +1 1.76967114 +1
H -3.08510371 +1 1.06573612 +1 1.20296848 +1
H -3.24302494 +1 3.56270895 +1 0.76258915 +1
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