Time stamp: Thu Mar 11 08:55:57 2021
Cucurbituril calcium bisulfate sulfuric acid tridecahydrate (BEBDOB)
770 Cucurbituril calcium bisulfate sulfuric acid tridecahydrate (BEBDOB)
(Previous) Calcium phosphate (Ca2P2O7) (ICSD 22225)
(Back) Elements:
Ca 2
S 4
O 41
C 36
N 24
H 66
(Periodic Table)
(Next) Parahilgardite ((CaO)2(B2O3)5(Na2O)(H2O)2)
The formula given in the CSD is (C36H36N24O12), 2[Ca]2+, 4[HO4S]-, 13(H2O), but the positions of the hydrogen atoms
on the water and sulfate moieties were not defined. The species used at the start of the geometry optimization were
the cucurbituril, four sulfate dianions, four hydroxonium cations, and nine water molecules, in addition to the two
calcium ions. When the optimization finished, three protons had migrated from the hydroxonium ions to the sulfate ions to give
three hydrogen sulfate anions, one sulfate dianion, one hydroxonium, and 12 water molecules. The single hydroxonium
ion was located inside the cucurbituril ring. No attempt has been made to determine if this is the lowest energy
system, or whether four hydrogen sulfate anions and 13 water molecules would be more stable.
Unit Cell Parameters: a b c alpha beta gamma Volume Density Heat of Formation (Kcal/mol)
X-ray: 15.67 10.39 11.95 109.66 115.18 92.15 1620.09 1.742 -1200.3 calc'd using PM7
PM7: 15.68 9.70 11.60 107.48 115.77 91.29 1491.60 1.892 -2431.1 calc'd using PM7 (ref: 0.0)
PM6_D3H4: 14.89 9.96 12.25 103.00 118.24 91.59 1540.39 1.832 -2304.7 calc'd using PM6_D3H4
X-Ray PM7 PM6_D3H4
|
Calc'd on: Feb 25 2021 @ 18:17:55 |
Feb 23 2021 @ 15:08:10
ARC file |
Feb 24 2021 @ 15:04:07 |
For X-Ray structure, contact the CCDC: http://www.ccdc.cam.ac.uk/
Optimized PM7 data set:
MERS=(1,1,1) CHARGE=0 OUTPUT THREADS=1 PM7 GRADIENTS NOTXT EF
Cucurbituril calcium bisulfate sulfuric acid tridecahydrate (BEBDOB)
Ca -0.30532286 +1 0.2911035 +1 -0.6241690 +1
Ca 6.61369516 +1 0.0458550 +1 0.0664793 +1
S 1.24451273 +1 9.0403859 +1 -0.5962360 +1
O 2.69340431 +1 9.3494787 +1 -0.2998130 +1
O 0.72184238 +1 8.0661022 +1 0.3665438 +1
O 0.45647438 +1 10.2219153 +1 -0.9709531 +1
O 1.33537704 +1 8.1606046 +1 -1.9975107 +1
S 5.16738848 +1 -8.7544645 +1 0.1357052 +1
O 3.72332068 +1 -9.1634052 +1 0.0584690 +1
O 5.49943900 +1 -7.7442704 +1 -0.8712924 +1
O 6.04983986 +1 -9.9324051 +1 0.3079382 +1
O 5.28902207 +1 -7.9459580 +1 1.5557908 +1
S 0.96546262 +1 6.4014083 +1 -5.9678624 +1
O 2.03461101 +1 5.7661730 +1 -4.8540191 +1
O 0.34694611 +1 7.5409901 +1 -5.2140984 +1
O 0.02750323 +1 5.3071729 +1 -6.2588765 +1
O 1.79131900 +1 6.9023380 +1 -7.0524328 +1
S 5.82878491 +1 -6.1027365 +1 5.2614572 +1
O 5.88340126 +1 -4.9932689 +1 4.2368696 +1
O 6.90708513 +1 -7.1870316 +1 4.7655772 +1
O 6.28580984 +1 -5.6464673 +1 6.5850513 +1
O 4.51667901 +1 -6.7900898 +1 5.2121267 +1
O 3.02279042 +1 -2.7169054 +1 -0.7767895 +1
C 2.99691334 +1 -3.7876850 +1 -1.3654173 +1
N 1.83142316 +1 -4.3708823 +1 -1.8876636 +1
N 4.05867727 +1 -4.6654439 +1 -1.4959601 +1
C 0.58273253 +1 -3.6017615 +1 -1.9541386 +1
C 3.66577964 +1 -5.8983298 +1 -2.2107111 +1
O 0.86619491 +1 -0.6766113 +1 -2.2606183 +1
C 0.33552577 +1 -1.3826760 +1 -3.0979663 +1
N -0.41432115 +1 -0.9582133 +1 -4.1968954 +1
N 0.48688966 +1 -2.7857801 +1 -3.1544333 +1
C -0.56889794 +1 0.4456052 +1 -4.5727795 +1
C -0.23690452 +1 -3.3492806 +1 -4.3047718 +1
O 1.75934560 +1 1.8836714 +1 -3.6342995 +1
C 1.52102614 +1 1.7497225 +1 -4.8232072 +1
N 2.12186222 +1 2.4795898 +1 -5.8521861 +1
N 0.57079316 +1 0.8862571 +1 -5.3689542 +1
C 3.27000669 +1 3.3296535 +1 -5.6640662 +1
C 0.45891770 +1 1.0841369 +1 -6.8382971 +1
O 3.98622522 +1 -5.7908747 +1 -5.7362667 +1
C 3.64952955 +1 -5.6816134 +1 -4.5717488 +1
N 4.36758339 +1 -6.1442413 +1 -3.4667491 +1
N 2.35318435 +1 -5.3272715 +1 -4.1430159 +1
C 1.22062688 +1 -5.2950380 +1 -5.0675767 +1
C 2.15970846 +1 -5.5441236 +1 -2.7050314 +1
O 1.73307043 +1 -3.4732922 +1 -7.2317309 +1
C 0.88935947 +1 -3.1949340 +1 -6.3943218 +1
N 0.72922260 +1 -3.9440270 +1 -5.2281014 +1
N 0.00413810 +1 -2.1307640 +1 -6.3617107 +1
C -0.22291785 +1 -1.2456045 +1 -7.5014430 +1
C -0.76136639 +1 -2.0596732 +1 -5.1027312 +1
O 2.65730855 +1 -1.1884786 +1 -8.4226831 +1
C 2.06385808 +1 -0.2289300 +1 -7.9679948 +1
N 2.68903803 +1 1.0230981 +1 -7.7413015 +1
N 0.75212287 +1 -0.1771045 +1 -7.5187282 +1
C 5.21645412 +1 -4.6168257 +1 -0.5889608 +1
C 1.72058427 +1 1.9969315 +1 -7.1794506 +1
H -0.26533088 +1 -4.3442334 +1 -1.9195755 +1
H 0.54677029 +1 -2.9370942 +1 -1.0385853 +1
H -1.52130809 +1 0.5468844 +1 -5.1641665 +1
H -0.65723899 +1 1.0760966 +1 -3.6323398 +1
H 3.21282256 +1 4.1682524 +1 -6.4356339 +1
H 3.22297629 +1 3.7656239 +1 -4.6222550 +1
H 1.55289145 +1 -5.6863421 +1 -6.0734226 +1
H 0.38492259 +1 -5.9380087 +1 -4.6492482 +1
H -0.20356715 +1 -1.8316608 +1 -8.4644205 +1
H -1.25571925 +1 -0.7911062 +1 -7.4163967 +1
H 5.00374338 +1 -3.9001612 +1 0.2575509 +1
H 5.39012977 +1 -5.6571505 +1 -0.1706607 +1
H 3.74293600 +1 -6.8059142 +1 -1.5491339 +1
H -1.05655211 +1 -4.0610343 +1 -3.9991664 +1
H -0.52144568 +1 1.5183957 +1 -7.1693060 +1
H 1.40907025 +1 -6.3590597 +1 -2.5148046 +1
H -1.86952490 +1 -2.0550744 +1 -5.2991043 +1
H 1.51345161 +1 2.8645532 +1 -7.8731362 +1
N 4.55263147 +1 2.6337509 +1 -5.8053630 +1
C 5.76094050 +1 -6.6066088 +1 -3.5177517 +1
C 3.68913147 +1 1.5229579 +1 -8.6789770 +1
N 6.40994004 +1 -4.2096044 +1 -1.2959114 +1
C 5.32736723 +1 2.6910745 +1 -7.0403868 +1
C 5.33349712 +1 2.3207981 +1 -4.6920723 +1
N 6.74028096 +1 -5.5734744 +1 -3.2731092 +1
H 5.88080053 +1 -7.4311540 +1 -2.7417747 +1
H 5.94775300 +1 -7.0320057 +1 -4.5501383 +1
N 5.01856699 +1 1.6848224 +1 -8.0656521 +1
H 3.78148373 +1 0.8154553 +1 -9.5520628 +1
H 3.38357189 +1 2.5434086 +1 -9.0658022 +1
C 7.00565271 +1 -2.9508809 +1 -1.2117477 +1
C 7.26900616 +1 -5.2071172 +1 -1.9647917 +1
C 6.81900793 +1 2.2636196 +1 -6.5466334 +1
H 5.26622216 +1 3.7173398 +1 -7.5049905 +1
O 4.96087801 +1 2.3989599 +1 -3.5395763 +1
N 6.65728832 +1 2.1353546 +1 -5.1040995 +1
C 7.38846863 +1 -4.9150281 +1 -4.3186051 +1
C 5.99397965 +1 0.6902456 +1 -8.1148991 +1
O 6.42062364 +1 -1.9546316 +1 -0.8207028 +1
N 8.34480226 +1 -3.0842849 +1 -1.5770883 +1
C 8.56305409 +1 -4.3262745 +1 -2.3357033 +1
H 7.45833381 +1 -6.1040148 +1 -1.3084284 +1
N 7.05940681 +1 1.0172491 +1 -7.2819199 +1
H 7.61281327 +1 3.0196519 +1 -6.7868430 +1
C 7.76600709 +1 2.0350475 +1 -4.1602404 +1
O 7.07498051 +1 -5.0285104 +1 -5.4829384 +1
N 8.40352508 +1 -4.1037900 +1 -3.7898976 +1
O 6.01757923 +1 -0.1963572 +1 -8.9633174 +1
C 9.29123770 +1 -1.9839195 +1 -1.7096539 +1
H 9.55183542 +1 -4.7855203 +1 -2.0571727 +1
C 8.34853531 +1 0.3172631 +1 -7.2825106 +1
N 8.25472638 +1 0.6839002 +1 -3.9901996 +1
H 7.40965848 +1 2.4147562 +1 -3.1529472 +1
H 8.60687911 +1 2.6810155 +1 -4.5547464 +1
C 9.53783492 +1 -3.7072078 +1 -4.6201789 +1
N 8.95039783 +1 -1.1684225 +1 -2.8704598 +1
H 9.29355548 +1 -1.3698612 +1 -0.7693785 +1
H 10.32855159 +1 -2.4320048 +1 -1.8249728 +1
N 8.54749858 +1 -0.4823034 +1 -6.0829268 +1
H 9.16085672 +1 1.0981625 +1 -7.3387725 +1
H 8.38797047 +1 -0.3491229 +1 -8.1982294 +1
C 9.22259249 +1 0.0901748 +1 -4.9053110 +1
C 8.16290093 +1 -0.0248377 +1 -2.7907363 +1
N 9.42464488 +1 -2.3037165 +1 -5.0163961 +1
H 10.50402168 +1 -3.8332243 +1 -4.0476049 +1
H 9.58032398 +1 -4.3465646 +1 -5.5493733 +1
C 9.75418585 +1 -1.1959278 +1 -4.1027419 +1
C 8.65044194 +1 -1.8735643 +1 -6.0925950 +1
H 10.03946584 +1 0.8170642 +1 -5.1754220 +1
O 7.45252467 +1 0.3392424 +1 -1.8716790 +1
H 10.85852049 +1 -1.1822304 +1 -3.8887060 +1
O 8.07529550 +1 -2.6171045 +1 -6.8903196 +1
O -1.68616887 +1 1.3829103 +1 -1.7840238 +1
O 8.22003172 +1 -1.0243039 +1 1.1905808 +1
O 1.52754573 +1 -0.9648779 +1 0.6228892 +1
O 5.34657231 +1 1.5794583 +1 -1.0114090 +1
O 1.82356634 +1 1.1868984 +1 -1.0292918 +1
O 4.61533500 +1 -1.0407157 +1 0.5707881 +1
O 7.43571150 +1 -2.8348159 +1 4.2985137 +1
O 7.67098385 +1 -7.7527568 +1 2.3525286 +1
O 2.44322511 +1 4.2618976 +1 -2.6165998 +1
O 4.65580391 +1 -5.3496895 +1 1.8893109 +1
O 4.06326294 +1 -1.3164426 +1 -3.0336660 +1
O 2.75793800 +1 0.9781425 +1 1.6613025 +1
O 1.49603433 +1 0.3258581 +1 3.7418028 +1
H -1.64863786 +1 2.6121240 +1 -2.1483040 +1
H -2.54587832 +1 1.0741955 +1 -2.0231531 +1
H 9.05423231 +1 -0.5356337 +1 1.3556340 +1
H 8.39064417 +1 -1.9488845 +1 1.5275114 +1
H 1.36819420 +1 -1.4683085 +1 1.4483252 +1
H 2.08548520 +1 -1.5421905 +1 0.0661090 +1
H 4.45198959 +1 1.8242438 +1 -0.7257989 +1
H 5.30981422 +1 1.7075633 +1 -1.9761489 +1
H 2.18525001 +1 1.9542220 +1 -0.5655423 +1
H 1.95239543 +1 1.3887646 +1 -1.9676538 +1
H 4.18143126 +1 -1.7110012 +1 0.0284716 +1
H 4.55332935 +1 -1.3724421 +1 1.4827856 +1
H 6.84288085 +1 -3.6311929 +1 4.3704286 +1
H 7.88365724 +1 -2.9727010 +1 3.4412768 +1
H 8.99215979 +1 -2.8639553 +1 4.9166029 +1
H 6.27863266 +1 -7.8962390 +1 1.9417448 +1
H 7.98004553 +1 -6.9354881 +1 1.8894854 +1
H 7.47853607 +1 -7.5006250 +1 3.3063669 +1
H 1.73370285 +1 5.1393112 +1 -4.1903230 +1
H 2.10419746 +1 3.4294740 +1 -2.9913550 +1
H 2.90794033 +1 3.9684628 +1 -1.8349199 +1
H 4.97284401 +1 -6.2530291 +1 1.7860387 +1
H 5.12882545 +1 -5.0292207 +1 2.6969220 +1
H 3.17392985 +1 -1.1987642 +1 -2.6745145 +1
H 4.62910626 +1 -1.5885789 +1 -2.3059113 +1
H 2.38876109 +1 0.1540873 +1 1.0516722 +1
H 3.74689701 +1 0.8107710 +1 1.7648825 +1
H 0.56179216 +1 0.3452944 +1 3.4943433 +1
H 2.29356321 +1 0.7126665 +1 2.5976130 +1
H 1.57330868 +1 1.0331872 +1 4.4467202 +1
Tv -8.55908132 +1 10.8906555 +1 -7.3423015 +1
Tv -2.64082598 +1 3.4556161 +1 8.6719445 +1
Tv -3.95129142 +1 -10.8830223 +1 -0.7664735 +1
Optimized PM6_D3H4 data set:
MERS=(1,1,1) CHARGE=0 EF OUTPUT THREADS=1 PM6-D3H4 GRADIENTS
Cucurbituril calcium bisulfate sulfuric acid tridecahydrate (BEBDOB) (PM6-D3H4)
Ca -0.02832275 +1 -0.2376642 +1 -0.1406982 +1
Ca 6.08320376 +1 -0.2535170 +1 -0.0273290 +1
S 0.87964846 +1 8.8353881 +1 -0.3897393 +1
O 2.23077897 +1 9.4266805 +1 -0.1821507 +1
O 0.48896204 +1 7.8303757 +1 0.6085099 +1
O -0.13635718 +1 9.8375391 +1 -0.7681578 +1
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