Time stamp: Thu Mar 11 08:55:57 2021
alpha Glycine
143 alpha Glycine
(Previous) Cholesteryl acetate (CHOLAD04)
(Back) Elements:
N 1
C 2
O 2
H 5
(Z = 16)
(Periodic Table)
(Next) beta Glycine
Unit Cell Parameters: a b c alpha beta gamma Volume Density Heat of Formation (Kcal/mol)
X-ray: 5.10 5.46 11.97 90.00 90.00 68.30 309.77 1.610 -120.2 calc'd using PM7
PM7: 4.97 5.33 11.61 89.31 89.51 65.86 280.28 1.779 -134.0 calc'd using PM7 (ref: 0.0)
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X-Ray PM7 PM6_D3H4
|
Calc'd on: Feb 26 2021 @ 02:45:23 |
Feb 25 2021 @ 09:25:45
ARC file |
Feb 28 2021 @ 00:08:39 |
X-Ray data set:
MERS=(2,2,1) CHARGE=0 OUTPUT THREADS=1 1SCF GRADIENTS
alpha_glycLR_p1_8
h=-126.3 hr=crc
N 0.00000000 +1 0.0000000 +1 0.0000000 +1
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C -1.07800000 +1 0.7240000 +1 0.7090000 +1
O -0.11000000 +1 0.2060000 +1 2.7520000 +1
O -2.17700000 +1 0.5210000 +1 2.7290000 +1
H -0.08400000 +1 0.1210000 +1 -1.0620000 +1
H 0.96800000 +1 0.3080000 +1 0.2930000 +1
H -0.07500000 +1 -1.0150000 +1 0.2100000 +1
H -0.94100000 +1 1.7970000 +1 0.5490000 +1
H -2.03000000 +1 0.4440000 +1 0.2580000 +1
C 0.70800000 +1 -5.5360000 +1 -1.9500000 +1
C 0.66600000 +1 -5.2620000 +1 -0.4480000 +1
N -0.41200000 +1 -5.9860000 +1 0.2610000 +1
O -0.30200000 +1 -5.7800000 +1 -2.4910000 +1
O 1.76600000 +1 -5.4640000 +1 -2.4680000 +1
H -0.32800000 +1 -5.8640000 +1 1.3230000 +1
H -1.38000000 +1 -5.6780000 +1 -0.0320000 +1
H -0.33600000 +1 -7.0010000 +1 0.0510000 +1
H 0.52900000 +1 -4.1880000 +1 -0.2880000 +1
H 1.61800000 +1 -5.5420000 +1 0.0030000 +1
C -1.66300000 +1 -2.5040000 +1 1.7230000 +1
C -1.70500000 +1 -2.7780000 +1 3.2250000 +1
N -2.78300000 +1 -2.0540000 +1 3.9340000 +1
O -2.67300000 +1 -2.2600000 +1 1.1820000 +1
O -0.60500000 +1 -2.5750000 +1 1.2050000 +1
H -2.69800000 +1 -2.1750000 +1 4.9960000 +1
H -3.75100000 +1 -2.3620000 +1 3.6410000 +1
H -2.70700000 +1 -1.0390000 +1 3.7240000 +1
H -1.84200000 +1 -3.8520000 +1 3.3850000 +1
H -0.75300000 +1 -2.4980000 +1 3.6760000 +1
C 1.25100000 +1 3.4820000 +1 -1.4610000 +1
C 1.29200000 +1 3.2070000 +1 -2.9630000 +1
N 2.37100000 +1 3.9320000 +1 -3.6720000 +1
O 2.26000000 +1 3.7250000 +1 -0.9200000 +1
O 0.19300000 +1 3.4100000 +1 -0.9430000 +1
H 2.28600000 +1 3.8100000 +1 -4.7340000 +1
H 3.33800000 +1 3.6230000 +1 -3.3790000 +1
H 2.29500000 +1 4.9470000 +1 -3.4620000 +1
H 1.42900000 +1 2.1340000 +1 -3.1230000 +1
H 0.34000000 +1 3.4880000 +1 -3.4140000 +1
N -4.74100000 +1 0.0000000 +1 1.8870000 +1
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C -5.81900000 +1 0.7240000 +1 2.5960000 +1
O -4.85100000 +1 0.2060000 +1 4.6390000 +1
O -6.91800000 +1 0.5210000 +1 4.6160000 +1
H -4.82500000 +1 0.1210000 +1 0.8250000 +1
H -3.77300000 +1 0.3080000 +1 2.1800000 +1
H -4.81600000 +1 -1.0150000 +1 2.0970000 +1
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H -6.77100000 +1 0.4440000 +1 2.1450000 +1
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C -4.07500000 +1 -5.2620000 +1 1.4390000 +1
N -5.15300000 +1 -5.9860000 +1 2.1480000 +1
O -5.04300000 +1 -5.7800000 +1 -0.6040000 +1
O -2.97500000 +1 -5.4640000 +1 -0.5810000 +1
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H -6.12100000 +1 -5.6780000 +1 1.8550000 +1
H -5.07700000 +1 -7.0010000 +1 1.9380000 +1
H -4.21200000 +1 -4.1880000 +1 1.5990000 +1
H -3.12300000 +1 -5.5420000 +1 1.8900000 +1
C -6.40400000 +1 -2.5040000 +1 3.6100000 +1
C -6.44600000 +1 -2.7780000 +1 5.1120000 +1
N -7.52400000 +1 -2.0540000 +1 5.8210000 +1
O -7.41400000 +1 -2.2600000 +1 3.0690000 +1
O -5.34600000 +1 -2.5750000 +1 3.0920000 +1
H -7.43900000 +1 -2.1750000 +1 6.8830000 +1
H -8.49200000 +1 -2.3620000 +1 5.5280000 +1
H -7.44800000 +1 -1.0390000 +1 5.6110000 +1
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C -3.44900000 +1 3.2070000 +1 -1.0760000 +1
N -2.37000000 +1 3.9320000 +1 -1.7850000 +1
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H -3.31200000 +1 2.1340000 +1 -1.2360000 +1
H -4.40100000 +1 3.4880000 +1 -1.5270000 +1
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C -1.12000000 +1 0.4500000 +1 7.6690000 +1
C -1.07800000 +1 0.7240000 +1 6.1670000 +1
O -0.11000000 +1 0.2060000 +1 8.2100000 +1
O -2.17700000 +1 0.5210000 +1 8.1870000 +1
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H -2.03000000 +1 0.4440000 +1 5.7160000 +1
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C 0.66600000 +1 -5.2620000 +1 5.0100000 +1
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Optimized PM7 data set:
MERS=(2,2,1) CHARGE=0 OUTPUT THREADS=1 PM7 GRADIENTS NOTXT EF
alpha_glycLR_p1_8
h=-126.3 hr=crc
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H -2.77572730 +1 -2.1962967 +1 5.0587003 +1
H -3.72464876 +1 -2.3661124 +1 3.6482112 +1
H -2.71911094 +1 -1.0348662 +1 3.8208634 +1
H -1.79862811 +1 -3.9015287 +1 3.5002555 +1
H -0.69759631 +1 -2.5261701 +1 3.7889240 +1
C 1.27308241 +1 3.4093957 +1 -1.4288359 +1
C 1.24739360 +1 3.1440615 +1 -2.9331099 +1
N 2.35345162 +1 3.9154806 +1 -3.5805949 +1
O 2.36253423 +1 3.7902028 +1 -0.9433323 +1
O 0.24176071 +1 3.2424451 +1 -0.7585911 +1
H 2.34931725 +1 3.8104311 +1 -4.6391314 +1
H 3.28575099 +1 3.5889370 +1 -3.2318683 +1
H 2.27505798 +1 4.9284226 +1 -3.3472480 +1
H 1.38487682 +1 2.0447121 +1 -3.1234737 +1
H 0.26490522 +1 3.4122994 +1 -3.3823929 +1
N -4.59389458 +1 0.0097654 +1 1.9085194 +1
C -5.70663413 +1 0.4408520 +1 4.0639945 +1
C -5.73505272 +1 0.7290281 +1 2.5643633 +1
O -4.61513955 +1 0.0701040 +1 4.5430051 +1
O -6.74203165 +1 0.5712145 +1 4.7395162 +1
H -4.59749674 +1 0.1453881 +1 0.8529491 +1
H -3.67862475 +1 0.3526326 +1 2.2831777 +1
H -4.64931625 +1 -1.0071339 +1 2.1085999 +1
H -5.64451527 +1 1.8352219 +1 2.3884735 +1
H -6.70612078 +1 0.4302697 +1 2.1062236 +1
C -3.93234044 +1 -5.3589335 +1 0.0199856 +1
C -3.89709491 +1 -5.0910498 +1 1.5226933 +1
N -4.99043431 +1 -5.8687344 +1 2.1805311 +1
O -5.03019867 +1 -5.7215116 +1 -0.4612406 +1
O -2.90112529 +1 -5.2104239 +1 -0.6540138 +1
H -4.98563727 +1 -5.7501657 +1 3.2223570 +1
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H -4.91107323 +1 -6.8815314 +1 1.9503224 +1
H -4.03926908 +1 -3.9925669 +1 1.7170039 +1
H -2.90986544 +1 -5.3569977 +1 1.9607862 +1
C -6.34437219 +1 -2.5196141 +1 3.7218917 +1
C -6.29677535 +1 -2.8328123 +1 5.2146470 +1
N -7.39411232 +1 -2.0789350 +1 5.8993730 +1
O -7.45119008 +1 -2.1650835 +1 3.2577569 +1
O -5.31233074 +1 -2.6285402 +1 3.0396802 +1
H -7.37543451 +1 -2.2066491 +1 6.9376433 +1
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H -7.32856476 +1 -1.0659849 +1 5.6860926 +1
H -6.43508888 +1 -3.9384355 +1 5.3670644 +1
H -5.31127330 +1 -2.5768831 +1 5.6614511 +1
C -3.33986623 +1 3.3613908 +1 0.4377613 +1
C -3.37335080 +1 3.1014378 +1 -1.0669105 +1
N -2.25073513 +1 3.8506156 +1 -1.7120567 +1
O -2.25061250 +1 3.7429867 +1 0.9207635 +1
O -4.36496868 +1 3.1868171 +1 1.1174902 +1
H -2.25600738 +1 3.7485673 +1 -2.7707747 +1
H -1.32509100 +1 3.5141037 +1 -1.3577209 +1
H -2.31736387 +1 4.8640757 +1 -1.4794810 +1
H -3.25988988 +1 2.0005986 +1 -1.2612511 +1
H -4.35126608 +1 3.3940699 +1 -1.5138404 +1
N -0.14521843 +1 -0.0221391 +1 5.3491223 +1
C -1.20325283 +1 0.4184891 +1 7.5256807 +1
C -1.24058969 +1 0.7355659 +1 6.0331246 +1
O -0.10733805 +1 0.0316387 +1 7.9901486 +1
O -2.23293239 +1 0.5523207 +1 8.2072434 +1
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H -2.22751391 +1 0.4873177 +1 5.5842394 +1
C 0.56444733 +1 -5.3722928 +1 3.4888091 +1
C 0.60598297 +1 -5.1101526 +1 4.9936856 +1
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O -0.52319612 +1 -5.7655990 +1 3.0136867 +1
O 1.58586653 +1 -5.1914405 +1 2.8048245 +1
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H 1.58118787 +1 -5.4188083 +1 5.4368831 +1
C -1.84316562 +1 -2.5178602 +1 7.1885099 +1
C -1.80814228 +1 -2.8129608 +1 8.6866982 +1
N -2.95036502 +1 -2.1000331 +1 9.3458526 +1
O -2.93460517 +1 -2.1294138 +1 6.7172625 +1
O -0.81761200 +1 -2.6760831 +1 6.5037854 +1
H -2.94658293 +1 -2.2342479 +1 10.4008421 +1
H -3.86531374 +1 -2.4488694 +1 8.9716240 +1
H -2.90163318 +1 -1.0843149 +1 9.1437757 +1
H -1.89750942 +1 -3.9202744 +1 8.8536026 +1
H -0.83780958 +1 -2.5139270 +1 9.1460663 +1
C 1.15215778 +1 3.3559005 +1 3.9090833 +1
C 1.11555365 +1 3.0857229 +1 2.4079470 +1
N 2.20713900 +1 3.8652847 +1 1.7441727 +1
O 2.24847114 +1 3.7277060 +1 4.3881836 +1
O 0.12381440 +1 3.1979594 +1 4.5855383 +1
H 2.20221174 +1 3.7375175 +1 0.7040614 +1
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H 2.12109928 +1 4.8805684 +1 1.9694818 +1
H 1.25817262 +1 1.9856006 +1 2.2207277 +1
H 0.12783207 +1 3.3444656 +1 1.9681612 +1
N -4.74288164 +1 -0.0399320 +1 7.2330442 +1
C -5.81800770 +1 0.3857535 +1 9.4064317 +1
C -5.85420439 +1 0.6995730 +1 7.9136992 +1
O -4.71860322 +1 0.0145148 +1 9.8759178 +1
O -6.85077947 +1 0.5087043 +1 10.0847395 +1
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H -5.73075038 +1 1.8067577 +1 7.7579687 +1
H -6.83687708 +1 0.4349476 +1 7.4620979 +1
C -4.05417756 +1 -5.3977214 +1 5.3528427 +1
C -4.01528952 +1 -5.1249255 +1 6.8563634 +1
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O -5.14849283 +1 -5.7723233 +1 4.8762657 +1
O -3.02413676 +1 -5.2452154 +1 4.6762951 +1
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H -3.03502863 +1 -5.4097959 +1 7.3014434 +1
C -6.45519366 +1 -2.5405479 +1 9.0620092 +1
C -6.42016427 +1 -2.8514214 +1 10.5575091 +1
N -7.54989691 +1 -2.1312750 +1 11.2238826 +1
O -7.54981111 +1 -2.1562816 +1 8.5947610 +1
O -5.42705004 +1 -2.6799288 +1 8.3779460 +1
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H -8.47154922 +1 -2.4796594 +1 10.8626827 +1
H -7.50175119 +1 -1.1178288 +1 11.0162892 +1
H -6.52716156 +1 -3.9589708 +1 10.7120282 +1
H -5.44680844 +1 -2.5659676 +1 11.0173466 +1
C -3.45825507 +1 3.3064483 +1 5.7765930 +1
C -3.50643239 +1 3.0392516 +1 4.2752480 +1
N -2.39738859 +1 3.7947701 +1 3.6124634 +1
O -2.35929489 +1 3.6715663 +1 6.2515357 +1
O -4.48248695 +1 3.1506031 +1 6.4612957 +1
H -2.40838494 +1 3.6747576 +1 2.5719464 +1
H -1.46258436 +1 3.4788146 +1 3.9783824 +1
H -2.46931097 +1 4.8106580 +1 3.8383477 +1
H -3.39056832 +1 1.9372523 +1 4.0851516 +1
H -4.48954363 +1 3.3241687 +1 3.8380895 +1
Tv -9.19168393 +1 -0.1228335 +1 3.7727244 +1
Tv -0.33826592 +1 -0.1011882 +1 10.6467923 +1
Tv -0.16154202 +1 11.6038464 +1 0.2454878 +1
Optimized PM6_D3H4 data set:
MERS=(2,2,1) CHARGE=0 EF OUTPUT THREADS=1 PM6-D3H4 GRADIENTS
alpha Glycine (PM6-D3H4)
N 0.13003157 +1 0.3142786 +1 -0.0579932 +1
C -0.98412793 +1 0.5022927 +1 2.1974525 +1
C -1.09380652 +1 0.7348519 +1 0.6967414 +1
O 0.13095476 +1 0.1502007 +1 2.6665905 +1
O -1.98728823 +1 0.7389273 +1 2.9106506 +1
H -0.07068570 +1 0.4705582 +1 -1.1051078 +1
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H 0.34553033 +1 -0.7051440 +1 0.1111423 +1
H -1.20030526 +1 1.8650351 +1 0.5609459 +1
H -2.00199578 +1 0.2164566 +1 0.2823853 +1
C 0.49766954 +1 -5.0668476 +1 -1.9669121 +1
C 0.59371615 +1 -4.8530495 +1 -0.4640069 +1
N -0.62779686 +1 -5.2961577 +1 0.2849026 +1
O -0.57635731 +1 -5.5202094 +1 -2.4420875 +1
O 1.47013235 +1 -4.7245918 +1 -2.6863660 +1
H -0.41244295 +1 -5.1529900 +1 1.3349975 +1
H -1.47736719 +1 -4.7112468 +1 -0.0108732 +1
H -0.84974649 +1 -6.3115704 +1 0.1032151 +1
H 0.69011456 +1 -3.7238347 +1 -0.3091122 +1
H 1.50846660 +1 -5.3697757 +1 -0.0562007 +1
C -1.87422229 +1 -2.4886714 +1 1.7256012 +1
C -1.75902664 +1 -2.7063943 +1 3.2268571 +1
N -2.99032121 +1 -2.2941904 +1 3.9757540 +1
O -2.98208516 +1 -2.1251552 +1 1.2505729 +1
O -0.88008369 +1 -2.7480609 +1 1.0035558 +1
H -2.77945095 +1 -2.4292798 +1 5.0269930 +1
H -3.82807288 +1 -2.8939556 +1 3.6757831 +1
H -3.21729441 +1 -1.2780643 +1 3.7870784 +1
H -1.62903235 +1 -3.8322013 +1 3.3819368 +1
H -0.86029266 +1 -2.1669511 +1 3.6372598 +1
C 1.35526771 +1 3.2001536 +1 -1.4659517 +1
C 1.24888001 +1 2.9953199 +1 -2.9710277 +1
N 2.47095580 +1 3.4252089 +1 -3.7248976 +1
O 2.44509964 +1 3.6245409 +1 -0.9988798 +1
O 0.37477593 +1 2.8805016 +1 -0.7509356 +1
H 2.26402377 +1 3.2776527 +1 -4.7729310 +1
H 3.32065105 +1 2.8358573 +1 -3.4290778 +1
H 2.69981005 +1 4.4396588 +1 -3.5510177 +1
H 1.13447361 +1 1.8712458 +1 -3.1334500 +1
H 0.33806856 +1 3.5307026 +1 -3.3648034 +1
N -4.45356296 +1 0.1942358 +1 1.7923591 +1
C -5.55842773 +1 0.3974155 +1 4.0464200 +1
C -5.68407699 +1 0.6058020 +1 2.5431189 +1
O -4.44173425 +1 0.0412780 +1 4.5092637 +1
O -6.54782522 +1 0.6508853 +1 4.7738159 +1
H -4.65387207 +1 0.3353971 +1 0.7424012 +1
H -3.61512762 +1 0.7924079 +1 2.0987162 +1
H -4.22764968 +1 -0.8226842 +1 1.9775520 +1
H -5.81276736 +1 1.7286386 +1 2.3907983 +1
H -6.58489683 +1 0.0620511 +1 2.1405958 +1
C -4.07385688 +1 -5.1623797 +1 -0.1144448 +1
C -3.97822581 +1 -4.9409090 +1 1.3873572 +1
N -5.19821050 +1 -5.3765259 +1 2.1420299 +1
O -5.15195250 +1 -5.6091815 +1 -0.5877110 +1
O -3.09620109 +1 -4.8317999 +1 -0.8305423 +1
H -4.97872749 +1 -5.2335822 +1 3.1908118 +1
H -6.04748814 +1 -4.7861161 +1 1.8511513 +1
H -5.42566914 +1 -6.3905229 +1 1.9674387 +1
H -3.87735089 +1 -3.8112904 +1 1.5387849 +1
H -3.06529808 +1 -5.4592158 +1 1.7953174 +1
C -6.44625109 +1 -2.5807184 +1 3.5708319 +1
C -6.34238476 +1 -2.8215657 +1 5.0701821 +1
N -7.56509648 +1 -2.4034126 +1 5.8289587 +1
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