Time stamp: Thu Mar 11 08:55:57 2021
9-(2-Hydroxyethyl)adenine (FABFUJ)
119 9-(2-Hydroxyethyl)adenine (FABFUJ)
(Previous) Guanine
(Back) Elements:
O 1
C 7
N 5
H 9
(Z = 4)
(Periodic Table)
(Next) 8-Azaguanine (AZGUAN01)
Unit Cell Parameters: a b c alpha beta gamma Volume Density Heat of Formation (Kcal/mol)
X-ray: 7.34 8.27 13.57 90.00 90.00 90.00 823.58 1.445 38.4 calc'd using PM7
PM7: 7.59 8.15 13.56 89.36 93.59 97.59 830.31 1.433 -26.7 calc'd using PM7 (ref: 0.0)
PM6_D3H4: 7.38 8.03 14.08 92.01 90.47 89.45 832.83 1.429 -12.7 calc'd using PM6_D3H4
X-Ray PM7 PM6_D3H4
|
Calc'd on: Feb 25 2021 @ 12:17:31 |
Feb 23 2021 @ 01:38:58
ARC file |
Feb 23 2021 @ 20:44:15 |
For X-Ray structure, contact the CCDC: http://www.ccdc.cam.ac.uk/
Optimized PM7 data set:
MERS=(1,1,1) CHARGE=0 OUTPUT THREADS=1 PM7 GRADIENTS NOTXT EF
9-(2-Hydroxyethyl)adenine (FABFUJ)
O -0.01622030 +1 0.0917830 +1 -0.4944699 +1
C -4.03191397 +1 -4.1134407 +1 -2.5083320 +1
N -5.09335858 +1 -3.2808937 +1 -2.4690710 +1
C -4.78911741 +1 -1.9814088 +1 -2.7407677 +1
C -3.46231379 +1 -1.5132302 +1 -3.0370710 +1
C -2.43126172 +1 -2.4977607 +1 -3.1257408 +1
N -1.17145072 +1 -2.2378665 +1 -3.5159302 +1
N -3.49951344 +1 -0.1336311 +1 -3.2134743 +1
C -4.77282274 +1 0.2383087 +1 -3.0556974 +1
N -5.60378634 +1 -0.8622699 +1 -2.7654218 +1
C -7.05563839 +1 -0.8366078 +1 -2.6788728 +1
C -7.67293236 +1 -1.8218810 +1 -3.6957680 +1
O -9.06003230 +1 -1.6197740 +1 -3.7522748 +1
H -0.86791581 +1 -1.2771302 +1 -3.6892694 +1
H -0.44877565 +1 -2.9509174 +1 -3.4702856 +1
H -5.16315492 +1 1.2494590 +1 -3.1333444 +1
H -7.42524672 +1 0.2026870 +1 -2.8639469 +1
H -7.23089417 +1 -1.7163842 +1 -4.7030452 +1
H -9.28460610 +1 -0.7404514 +1 -4.1442485 +1
N -2.75937715 +1 -3.8012573 +1 -2.8355865 +1
N 4.15467948 +1 -2.0314210 +1 -0.2597036 +1
C 2.90372810 +1 -1.6363296 +1 -0.5827333 +1
N 1.79594062 +1 -2.4037773 +1 -0.6498685 +1
C 2.02301388 +1 -3.7245464 +1 -0.4038466 +1
C 3.31485983 +1 -4.2777196 +1 -0.0997923 +1
C 4.40844221 +1 -3.3619538 +1 -0.0211365 +1
N 5.67084873 +1 -3.7081073 +1 0.2812118 +1
N 3.18927817 +1 -5.6539957 +1 0.0664567 +1
C 1.89606651 +1 -5.9434088 +1 -0.1067048 +1
N 1.14138168 +1 -4.7917428 +1 -0.4039019 +1
C -0.30835657 +1 -4.7152253 +1 -0.4994453 +1
C -0.85112536 +1 -3.8458076 +1 0.6554601 +1
O -2.24501904 +1 -3.9656813 +1 0.7231393 +1
H 5.91653658 +1 -4.6604165 +1 0.5194721 +1
H 6.43385372 +1 -3.0404213 +1 0.1976465 +1
H 1.43953019 +1 -6.9272255 +1 -0.0406174 +1
H -0.74758381 +1 -5.7421333 +1 -0.4649841 +1
H -0.39301157 +1 -4.1111260 +1 1.6252824 +1
H -2.53162021 +1 -4.8653956 +1 1.0124633 +1
N 0.36868851 +1 0.2035629 +1 -4.1461062 +1
C 1.64759148 +1 -0.2152295 +1 -4.3059695 +1
N 2.76539811 +1 0.5012875 +1 -4.0882680 +1
C 2.52440504 +1 1.7820946 +1 -3.6909061 +1
C 1.21755788 +1 2.3544635 +1 -3.5200056 +1
C 0.10538702 +1 1.4860425 +1 -3.7309304 +1
N -1.18506169 +1 1.8547435 +1 -3.6038868 +1
N 1.35344386 +1 3.6935172 +1 -3.1652115 +1
C 2.66580288 +1 3.9395326 +1 -3.1000636 +1
N 3.42444596 +1 2.7923637 +1 -3.4091040 +1
C 4.87118793 +1 2.6646429 +1 -3.4437533 +1
C 5.40307916 +1 2.3533559 +1 -2.0251337 +1
O 6.79473916 +1 2.1702504 +1 -2.1198002 +1
H -1.43704694 +1 2.7138703 +1 -3.1265235 +1
H -1.93314205 +1 1.1763830 +1 -3.7254774 +1
H 3.12911009 +1 4.8877999 +1 -2.8379063 +1
H 5.32661020 +1 3.5989341 +1 -3.8496381 +1
H 5.16048246 +1 3.1583397 +1 -1.3138143 +1
H 7.27037498 +1 3.0084462 +1 -1.9023419 +1
N -6.28313004 +1 2.2071565 +1 1.5949104 +1
C -4.99142815 +1 2.5775772 +1 1.7673248 +1
N -3.90145830 +1 1.8118096 +1 1.5779491 +1
C -4.19297806 +1 0.5378455 +1 1.1923035 +1
C -5.51820954 +1 0.0180404 +1 1.0004803 +1
C -6.59903131 +1 0.9280659 +1 1.2055864 +1
N -7.90085955 +1 0.6037169 +1 1.0966585 +1
N -5.43237661 +1 -1.3255624 +1 0.6422845 +1
C -4.13077377 +1 -1.6266873 +1 0.6068291 +1
N -3.33090458 +1 -0.5156987 +1 0.9493569 +1
C -1.88199638 +1 -0.4183293 +1 0.9202698 +1
C -1.41521140 +1 -0.0354961 +1 -0.5045889 +1
H -8.18160337 +1 -0.2737846 +1 0.6564998 +1
H -8.62853764 +1 1.2994509 +1 1.2371121 +1
H -3.70211942 +1 -2.5943248 +1 0.3539057 +1
H -1.43087464 +1 -1.3874417 +1 1.2454106 +1
H -1.73363594 +1 -0.7806126 +1 -1.2516764 +1
H 0.41613205 +1 -0.7898781 +1 -0.6102847 +1
H -4.82529207 +1 3.6233385 +1 2.0898277 +1
H -7.37886483 +1 -1.1037017 +1 -1.6400127 +1
H -7.57024814 +1 -2.8688602 +1 -3.3484321 +1
H -0.60291633 +1 -4.2840015 +1 -1.4896741 +1
H -0.68584196 +1 -2.7678562 +1 0.4541546 +1
H 5.16409128 +1 1.8426160 +1 -4.1469054 +1
H 5.01416723 +1 1.3952962 +1 -1.6320305 +1
H -1.53576326 +1 0.3476650 +1 1.6601102 +1
H -1.78499354 +1 0.9625165 +1 -0.8075801 +1
H -4.22304363 +1 -5.1724276 +1 -2.2543096 +1
H 2.77755990 +1 -0.5606341 +1 -0.8064302 +1
H 1.77822964 +1 -1.2613428 +1 -4.6409241 +1
Tv -0.43528275 +1 -0.4083779 +1 -7.5716099 +1
Tv 0.28725119 +1 8.1217467 +1 0.6258395 +1
Tv 13.55316967 +1 -0.3336974 +1 0.0901804 +1
Optimized PM6_D3H4 data set:
MERS=(1,1,1) CHARGE=0 EF OUTPUT THREADS=1 PM6-D3H4 GRADIENTS
9-(2-Hydroxyethyl)adenine (FABFUJ) (PM6-D3H4)
O -0.20667610 +1 0.1534037 +1 -0.3243852 +1
C -3.86477301 +1 -4.4791116 +1 -2.3860509 +1
N -4.99052730 +1 -3.7257750 +1 -2.4887788 +1
C -4.74071178 +1 -2.4019805 +1 -2.7922247 +1
C -3.42436742 +1 -1.8572098 +1 -3.0033910 +1
C -2.31246073 +1 -2.7601856 +1 -2.9210848 +1
N -1.02376897 +1 -2.3797329 +1 -3.1090070 +1
N -3.51539206 +1 -0.4816156 +1 -3.2648442 +1
C -4.82471119 +1 -0.1850500 +1 -3.2268862 +1
N -5.62003447 +1 -1.3283781 +1 -2.9299757 +1
C -7.08766264 +1 -1.3534987 +1 -2.8685591 +1
C -7.65621928 +1 -1.8306831 +1 -4.2210002 +1
O -9.06416943 +1 -2.0355549 +1 -4.0844256 +1
H -0.80899522 +1 -1.4147549 +1 -3.4335397 +1
H -0.26093819 +1 -3.0667109 +1 -3.0388847 +1
H -5.27722745 +1 0.7884296 +1 -3.3988226 +1
H -7.44532851 +1 -0.3158278 +1 -2.6228641 +1
H -7.45414195 +1 -1.0988124 +1 -5.0324537 +1
H -9.54819890 +1 -1.1665523 +1 -4.1356312 +1
N -2.57080743 +1 -4.0853084 +1 -2.5925652 +1
N 4.33127800 +1 -1.6558154 +1 -0.1840871 +1
C 3.02029640 +1 -1.3186478 +1 -0.3871309 +1
N 1.94119891 +1 -2.1410128 +1 -0.3504504 +1
C 2.27027478 +1 -3.4637991 +1 -0.1293778 +1
C 3.61371840 +1 -3.9535086 +1 0.0503185 +1
C 4.66401919 +1 -2.9792821 +1 0.0723579 +1
N 5.96324699 +1 -3.2625261 +1 0.3460539 +1
N 3.59597684 +1 -5.3484860 +1 0.2182025 +1
C 2.30044929 +1 -5.7030948 +1 0.1744076 +1
N 1.44466252 +1 -4.5829517 +1 -0.0413259 +1
C -0.02536968 +1 -4.5907709 +1 -0.0593979 +1
C -0.58246489 +1 -3.9042136 +1 1.2051530 +1
O -1.99632878 +1 -3.7449329 +1 1.0561938 +1
H 6.26558572 +1 -4.2260333 +1 0.5606379 +1
H 6.67459303 +1 -2.5174975 +1 0.3417162 +1
H 1.89200737 +1 -6.7082795 +1 0.2781016 +1
H -0.37102599 +1 -5.6571842 +1 -0.1006026 +1
H -0.36960757 +1 -4.5049155 +1 2.1162282 +1
H -2.44002963 +1 -4.6369697 +1 1.1147860 +1
N 0.37330242 +1 0.0788401 +1 -3.9340204 +1
C 1.68656152 +1 -0.2604676 +1 -4.1245457 +1
N 2.76880123 +1 0.5473963 +1 -4.0054570 +1
C 2.44176432 +1 1.8538525 +1 -3.6988854 +1
C 1.10287557 +1 2.3388796 +1 -3.4868004 +1
C 0.04345711 +1 1.3794524 +1 -3.5762838 +1
N -1.26726999 +1 1.6630570 +1 -3.3628639 +1
N 1.13157286 +1 3.7164447 +1 -3.2102917 +1
C 2.42834666 +1 4.0678891 +1 -3.2413068 +1
N 3.27275964 +1 2.9615376 +1 -3.5465643 +1
C 4.73947025 +1 2.9555300 +1 -3.6216126 +1
C 5.32170850 +1 2.3640804 +1 -2.3212474 +1
O 6.73741747 +1 2.2253751 +1 -2.4791688 +1
H -1.55930517 +1 2.5895596 +1 -3.0192111 +1
H -1.97449781 +1 0.9097444 +1 -3.4308082 +1
H 2.84555365 +1 5.0593415 +1 -3.0648438 +1
H 5.09650952 +1 4.0052848 +1 -3.7854673 +1
H 5.09827743 +1 3.0059837 +1 -1.4423364 +1
H 7.17471923 +1 3.1147251 +1 -2.3923704 +1
N -6.82145955 +1 2.0992256 +1 0.9742236 +1
C -5.55317388 +1 2.5415486 +1 1.2315503 +1
N -4.40057367 +1 1.8248821 +1 1.1871189 +1
C -4.59315192 +1 0.4920109 +1 0.8835207 +1
C -5.88274277 +1 -0.1012500 +1 0.6286524 +1
C -7.02263759 +1 0.7669931 +1 0.6368502 +1
N -8.28440449 +1 0.3705636 +1 0.3303919 +1
N -5.73669804 +1 -1.4748710 +1 0.3805564 +1
C -4.41803596 +1 -1.7196265 +1 0.4567906 +1
N -3.67172925 +1 -0.5474933 +1 0.7720540 +1
C -2.20689129 +1 -0.4709685 +1 0.8683889 +1
C -1.61984637 +1 -0.0057473 +1 -0.4793332 +1
H -8.48232246 +1 -0.6098997 +1 0.0635579 +1
H -9.05599889 +1 1.0539997 +1 0.3286667 +1
H -3.91704223 +1 -2.6724877 +1 0.3026550 +1
H -1.81627482 +1 -1.4931178 +1 1.1358004 +1
H -1.83308673 +1 -0.7346410 +1 -1.2879730 +1
H 0.24698215 +1 -0.7288724 +1 -0.4260246 +1
H -5.47075026 +1 3.6075033 +1 1.5067981 +1
H -7.41999766 +1 -2.0547119 +1 -2.0585663 +1
H -7.25813714 +1 -2.8404158 +1 -4.4732482 +1
H -0.39454426 +1 -4.0432356 +1 -0.9693858 +1
H -0.20241605 +1 -2.8605052 +1 1.2976777 +1
H 5.06213809 +1 2.3168528 +1 -4.4878345 +1
H 4.96112412 +1 1.3194309 +1 -2.1694061 +1
H -1.91643264 +1 0.2522445 +1 1.6749321 +1
H -1.98946806 +1 1.0113124 +1 -0.7497464 +1
H -3.99942178 +1 -5.5378209 +1 -2.1007255 +1
H 2.83316830 +1 -0.2510404 +1 -0.5978626 +1
H 1.86920449 +1 -1.3136293 +1 -4.4023342 +1
Tv 0.17282099 +1 0.3225296 +1 -7.3672448 +1
Tv -0.52117958 +1 8.0050268 +1 0.2610457 +1
Tv 14.06349310 +1 0.4048338 +1 0.4631327 +1