Time stamp: Thu Mar 11 08:55:57 2021
8-Azaguanine (AZGUAN01)
120 8-Azaguanine (AZGUAN01)
(Previous) 9-(2-Hydroxyethyl)adenine (FABFUJ)
(Back) Elements:
O 1
C 4
H 4
N 6
(Z = 12)
(Periodic Table)
(Next) Oxygen (O2) (ICSD 18311)
In this system a water molecule that should be present is missing.
See also: 8-Azaguanine hydrate (AZGUAN)
Unit Cell Parameters: a b c alpha beta gamma Volume Density Heat of Formation (Kcal/mol)
X-ray: 3.56 11.44 16.47 90.00 95.13 90.00 668.56 1.511 32.2 calc'd using PM7
PM7: 3.62 11.38 16.61 90.14 97.93 89.21 678.29 1.490 -8.7 calc'd using PM7 (ref: 0.0)
PM6_D3H4: 3.64 11.89 16.35 89.32 102.46 89.14 691.15 1.462 0.6 calc'd using PM6_D3H4
X-Ray PM7 PM6_D3H4
|
Calc'd on: Feb 25 2021 @ 12:17:24 |
Feb 23 2021 @ 01:40:10
ARC file |
Feb 23 2021 @ 20:43:00 |
For X-Ray structure, contact the CCDC: http://www.ccdc.cam.ac.uk/
Optimized PM7 data set:
MERS=(3,1,1) CHARGE=0 OUTPUT THREADS=1 PM7 GRADIENTS NOTXT EF
8-Azaguanine (AZGUAN01)
O -0.12865763 +1 -0.2045949 +1 -0.1119576 +1
C 0.46154238 +1 -0.1083162 +1 6.7828173 +1
C -0.06541651 +1 0.3943541 +1 8.0145199 +1
C -0.59095622 +1 -0.5095602 +1 8.9923753 +1
H -0.98083764 +1 -2.5690647 +1 9.1999250 +1
H -0.49688526 +1 -4.2655807 +1 7.6466491 +1
H 0.20213036 +1 -3.9046260 +1 6.1081026 +1
H 1.29163982 +1 1.0785051 +1 5.1648173 +1
N -0.53550603 +1 -1.8727637 +1 8.5732513 +1
N -0.00100349 +1 -3.6057584 +1 7.0505512 +1
N 0.51060291 +1 -1.4159334 +1 6.4222136 +1
N 0.04470686 +1 1.7800781 +1 7.9653891 +1
N 0.59718652 +1 2.1273878 +1 6.8593155 +1
N 0.85103278 +1 1.0188297 +1 6.0831990 +1
O -1.09034329 +1 -0.2703515 +1 10.0683768 +1
C -0.02669439 +1 -2.2769905 +1 7.3383353 +1
C -0.48526987 +1 3.4603185 +1 -5.6867890 +1
C -0.88383906 +1 5.6514853 +1 -5.1460908 +1
C -0.28561874 +1 6.1277483 +1 -6.3540801 +1
C 0.22773573 +1 5.1975768 +1 -7.3125854 +1
H 0.51710996 +1 3.1219870 +1 -7.5120140 +1
H -0.07222046 +1 1.4481153 +1 -5.9350040 +1
H -0.78672834 +1 1.8780541 +1 -4.4214611 +1
H -1.55180180 +1 6.8596761 +1 -3.4834262 +1
N 0.07442729 +1 3.8361921 +1 -6.9063893 +1
N -0.55831750 +1 2.1392269 +1 -5.3697904 +1
N -1.01736050 +1 4.3478940 +1 -4.7943932 +1
N -0.29831665 +1 7.5177268 +1 -6.2873940 +1
N -0.83641912 +1 7.8909058 +1 -5.1830800 +1
N -1.25301711 +1 6.7941893 +1 -4.4595294 +1
O 0.79481701 +1 5.4096586 +1 -8.3606168 +1
C -1.15584688 +1 1.7357780 +1 2.6785557 +1
C -1.58849728 +1 -0.4539326 +1 3.2040278 +1
C -1.09385875 +1 -0.9278121 +1 1.9484767 +1
C -0.61199937 +1 0.0060552 +1 0.9764742 +1
H -0.30213323 +1 2.0796033 +1 0.7782147 +1
H -0.72938981 +1 3.7453232 +1 2.4316961 +1
H -1.37396936 +1 3.3055462 +1 3.9740482 +1
H -2.36560349 +1 -1.6684372 +1 4.8244080 +1
N -0.69629996 +1 1.3638238 +1 1.4157346 +1
N -1.20837609 +1 3.0574475 +1 3.0074188 +1
N -1.63380753 +1 0.8441271 +1 3.5945551 +1
N -1.19370177 +1 -2.3160051 +1 1.9753750 +1
N -1.71723132 +1 -2.6826839 +1 3.0905571 +1
N -1.95441827 +1 -1.5939774 +1 3.8915687 +1
C 0.82035872 +1 -3.9606207 +1 -0.8723672 +1
C 1.19106186 +1 -6.1404113 +1 -1.4639099 +1
C 0.65490905 +1 -6.6371461 +1 -0.2336274 +1
C 0.20189200 +1 -5.7225389 +1 0.7699365 +1
H -0.05141462 +1 -3.6485190 +1 1.0201332 +1
H 0.41077212 +1 -1.9577603 +1 -0.5593794 +1
H 1.07289584 +1 -2.3429002 +1 -2.1034811 +1
H 1.87642424 +1 -7.3314086 +1 -3.1370779 +1
N 0.33782427 +1 -4.3570295 +1 0.3745386 +1
N 0.88532631 +1 -2.6310515 +1 -1.1549181 +1
N 1.29379288 +1 -4.8329911 +1 -1.8129478 +1
N 0.68730746 +1 -8.0261451 +1 -0.3105473 +1
N 1.20287857 +1 -8.3818066 +1 -1.4317447 +1
N 1.54971061 +1 -7.2726468 +1 -2.1724447 +1
O -0.29323501 +1 -5.9517290 +1 1.8503069 +1
O -3.80116955 +1 -0.2175474 +1 -0.0933965 +1
C -3.16266436 +1 -0.0854691 +1 6.9354744 +1
C -3.67041720 +1 0.3998374 +1 8.1817906 +1
C -4.18151220 +1 -0.5210867 +1 9.1520555 +1
H -4.57795032 +1 -2.5824138 +1 9.3205051 +1
H -4.09923333 +1 -4.2594287 +1 7.7273644 +1
H -3.39386886 +1 -3.8660579 +1 6.2030382 +1
H -2.34347781 +1 1.1142504 +1 5.3231866 +1
N -4.12680651 +1 -1.8780222 +1 8.7086434 +1
N -3.58830271 +1 -3.5904814 +1 7.1555326 +1
N -3.12181168 +1 -1.3861388 +1 6.5512365 +1
N -3.55796800 +1 1.7858071 +1 8.1474462 +1
N -3.01610539 +1 2.1445870 +1 7.0383879 +1
N -2.78055836 +1 1.0485889 +1 6.2458955 +1
O -4.67107952 +1 -0.2991528 +1 10.2358404 +1
C -3.63486312 +1 -2.2637574 +1 7.4621601 +1
C -4.08364702 +1 3.4699484 +1 -5.6394905 +1
C -4.48637284 +1 5.6566552 +1 -5.0925872 +1
C -3.90589980 +1 6.1365160 +1 -6.3082518 +1
C -3.40608934 +1 5.2102308 +1 -7.2773601 +1
H -3.10814713 +1 3.1376350 +1 -7.4770462 +1
H -3.65269127 +1 1.4638835 +1 -5.8935419 +1
H -4.35434273 +1 1.8814825 +1 -4.3746513 +1
H -5.14354822 +1 6.8628797 +1 -3.4225921 +1
N -3.55097760 +1 3.8502194 +1 -6.8699091 +1
N -4.14619160 +1 2.1469652 +1 -5.3263293 +1
N -4.60572450 +1 4.3532635 +1 -4.7369770 +1
N -3.92247022 +1 7.5251387 +1 -6.2389052 +1
N -4.45938383 +1 7.8964661 +1 -5.1331007 +1
N -4.84980093 +1 6.7974422 +1 -4.3996767 +1
O -2.85884671 +1 5.4261540 +1 -8.3354404 +1
C -4.75692089 +1 1.7372447 +1 2.7132081 +1
C -5.19263600 +1 -0.4443659 +1 3.2561382 +1
C -4.72823653 +1 -0.9243667 +1 1.9909619 +1
C -4.25914884 +1 0.0021849 +1 1.0047365 +1
H -3.92522927 +1 2.0725657 +1 0.8047544 +1
H -4.30292282 +1 3.7384975 +1 2.4536372 +1
H -4.95030495 +1 3.3181576 +1 3.9984488 +1
H -5.94371365 +1 -1.6525544 +1 4.8951399 +1
N -4.32268608 +1 1.3595876 +1 1.4433248 +1
N -4.78743599 +1 3.0597622 +1 3.0354280 +1
N -5.22398673 +1 0.8542398 +1 3.6444691 +1
N -4.83133900 +1 -2.3116236 +1 2.0272633 +1
N -5.32634300 +1 -2.6742976 +1 3.1564698 +1
N -5.54269789 +1 -1.5816321 +1 3.9583986 +1
C -2.77184489 +1 -3.9536675 +1 -0.7533429 +1
C -2.39044668 +1 -6.1414559 +1 -1.3111199 +1
C -2.93431412 +1 -6.6227204 +1 -0.0793218 +1
C -3.39222432 +1 -5.6957948 +1 0.9098530 +1
H -3.65036427 +1 -3.6212803 +1 1.1316683 +1
H -3.20673674 +1 -1.9484063 +1 -0.4895506 +1
H -2.55068813 +1 -2.3648433 +1 -2.0266903 +1
H -1.76022655 +1 -7.3438057 +1 -2.9919766 +1
N -3.25255526 +1 -4.3356183 +1 0.4977188 +1
N -2.72035240 +1 -2.6292872 +1 -1.0667040 +1
N -2.28545199 +1 -4.8382433 +1 -1.6735563 +1
N -2.91513503 +1 -8.0117960 +1 -0.1477569 +1
N -2.40639249 +1 -8.3817396 +1 -1.2672979 +1
N -2.03997381 +1 -7.2816886 +1 -2.0109064 +1
O -3.89563843 +1 -5.9116897 +1 1.9888228 +1
O -7.48230237 +1 -0.2468629 +1 0.0602959 +1
C -6.75860800 +1 -0.0864965 +1 7.0131705 +1
C -7.27277583 +1 0.3971888 +1 8.2574451 +1
C -7.77862767 +1 -0.5251440 +1 9.2293817 +1
H -8.16502759 +1 -2.5875950 +1 9.4044684 +1
H -7.69918158 +1 -4.2644109 +1 7.7989297 +1
H -7.01843276 +1 -3.8585249 +1 6.2635663 +1
H -5.93173218 +1 1.1146532 +1 5.4067720 +1
N -7.71968732 +1 -1.8834719 +1 8.7888158 +1
N -7.19999245 +1 -3.5913222 +1 7.2217829 +1
N -6.71873247 +1 -1.3876759 +1 6.6289407 +1
N -7.16602382 +1 1.7842454 +1 8.2245318 +1
N -6.61553473 +1 2.1447852 +1 7.1206438 +1
N -6.37116966 +1 1.0485611 +1 6.3276498 +1
O -8.26325946 +1 -0.3036253 +1 10.3151522 +1
C -7.23535773 +1 -2.2662467 +1 7.5377758 +1
C -7.64803017 +1 3.4715888 +1 -5.4598016 +1
C -8.04273921 +1 5.6521575 +1 -4.8791241 +1
C -7.50792203 +1 6.1451118 +1 -6.1111948 +1
C -7.02972040 +1 5.2302438 +1 -7.1024572 +1
H -6.74160907 +1 3.1573093 +1 -7.3370813 +1
H -7.23354668 +1 1.4679836 +1 -5.7644452 +1
H -7.93498650 +1 1.8515056 +1 -4.2361677 +1
H -8.72495494 +1 6.8507251 +1 -3.2097429 +1
N -7.15489584 +1 3.8644123 +1 -6.7043491 +1
N -7.71744610 +1 2.1419387 +1 -5.1776283 +1
N -8.13176771 +1 4.3445649 +1 -4.5249902 +1
N -7.55611138 +1 7.5342224 +1 -6.0447928 +1
N -8.07386743 +1 7.8938950 +1 -4.9268538 +1
N -8.42130033 +1 6.7857151 +1 -4.1818227 +1
O -6.51585010 +1 5.4584930 +1 -8.1745872 +1
C -8.35358748 +1 1.7461297 +1 2.8681447 +1
C -8.79729944 +1 -0.4264904 +1 3.4456684 +1
C -8.35455728 +1 -0.9255435 +1 2.1798365 +1
C -7.89861405 +1 -0.0151865 +1 1.1721602 +1
H -7.58740761 +1 2.0564109 +1 0.9256243 +1
H -7.91094322 +1 3.7431530 +1 2.5597879 +1
H -8.52433880 +1 3.3515874 +1 4.1258352 +1
H -9.50921247 +1 -1.6163543 +1 5.1164262 +1
N -7.89654581 +1 1.3444581 +1 1.6127161 +1
N -8.38503867 +1 3.0756503 +1 3.1633800 +1
N -8.82761858 +1 0.8798826 +1 3.8123634 +1
N -8.44832232 +1 -2.3130978 +1 2.2393027 +1
N -8.91367050 +1 -2.6620247 +1 3.3845028 +1
N -9.12528690 +1 -1.5548871 +1 4.1733700 +1
C -6.38760714 +1 -3.9399266 +1 -0.6817212 +1
C -5.99219073 +1 -6.1253609 +1 -1.2442718 +1
C -6.54424464 +1 -6.6092599 +1 -0.0168245 +1
C -6.99612574 +1 -5.6861036 +1 0.9787597 +1
H -7.25396558 +1 -3.6103241 +1 1.2124589 +1
H -6.85026995 +1 -1.9404836 +1 -0.4269492 +1
H -6.18089305 +1 -2.3551144 +1 -1.9620021 +1
H -5.35198912 +1 -7.3267458 +1 -2.9228287 +1
N -6.86362979 +1 -4.3225915 +1 0.5713004 +1
N -6.35552513 +1 -2.6169473 +1 -1.0021091 +1
N -5.89166067 +1 -4.8201523 +1 -1.6021709 +1
N -6.53187329 +1 -7.9989558 +1 -0.0888591 +1
N -6.01387888 +1 -8.3659799 +1 -1.2047141 +1
N -5.63452110 +1 -7.2642320 +1 -1.9423568 +1
O -7.48671089 +1 -5.9067127 +1 2.0623629 +1
Tv -10.85880778 +1 0.0205534 +1 0.4520558 +1
Tv -0.17959632 +1 -11.3819219 +1 -0.0032922 +1
Tv 1.60548361 +1 0.0198853 +1 -16.5304587 +1
Optimized PM6_D3H4 data set:
MERS=(3,1,1) CHARGE=0 EF OUTPUT THREADS=1 PM6-D3H4 GRADIENTS
8-Azaguanine (AZGUAN01) (PM6-D3H4)
O -0.24145111 +1 -0.4494936 +1 -0.3807721 +1
C 0.19471544 +1 0.1386624 +1 6.4048358 +1
C -0.25443575 +1 0.6700645 +1 7.6569989 +1
C -0.75004448 +1 -0.1956886 +1 8.6935683 +1
H -0.98549579 +1 -2.2803261 +1 9.0320665 +1
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