Time stamp: Thu Mar 11 08:55:57 2021
5-Nitrouracil dioxane
306 5-Nitrouracil dioxane
(Previous) Tetra-aqua-beryllium 4-oxo-4H-pyran-2,6-dicarboxylate (CICXOC)
(Back) Elements:
N 6
C 12
O 10
H 14
(Z = 8)
(Periodic Table)
(Next) Sucrose (SUCROS01)
Unit Cell Parameters: a b c alpha beta gamma Volume Density Heat of Formation (Kcal/mol)
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X-Ray PM7 PM6_D3H4
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Feb 23 2021 @ 20:48:10 |
X-Ray data set:
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5-Nitrouracil dioxane (Ref)
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O 0.43138423 +1 1.4080000 +1 -10.3565939 +1
C 1.14338423 +1 3.7430000 +1 -9.3545939 +1
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H 3.94738423 +1 5.6890000 +1 -10.7345939 +1
H 0.26838423 +1 3.2780000 +1 -8.9335939 +1
N -4.27161577 +1 4.7260000 +1 -1.1175939 +1
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H 2.94588423 +1 3.1500000 +1 -6.4375939 +1
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C -0.43700000 +1 5.1427000 +1 0.3230000 +1
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H -0.18300000 +1 6.4327000 +1 -1.9310000 +1
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O -1.22961577 +1 2.8620000 +1 -7.3965939 +1
C -2.13261577 +1 1.9290000 +1 -8.0075939 +1
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H -2.38661577 +1 3.2190000 +1 -5.7545939 +1
N 4.27100000 +1 8.1287000 +1 1.1170000 +1
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Tv 16.70700000 +1 0.0000000 +1 0.0000000 +1
Tv 0.00000000 +1 12.8554000 +1 0.0000000 +1
Tv -3.21388423 +1 0.0000000 +1 15.3705939 +1
Optimized PM7 data set:
MERS=(2,2,1) Z=2 CHARGE=0 OUTPUT THREADS=1 PM7 GRADIENTS NOTXT EF
5-Nitrouracil dioxane
N -3.55548061 +1 1.8069179 +1 1.4084486 +1
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O -4.93163513 +1 3.6362111 +1 1.2708024 +1
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C -5.04954543 +1 0.9516886 +1 3.6416448 +1
O -5.63834854 +1 0.7798895 +1 4.6869839 +1
C -4.10289939 +1 0.0871520 +1 2.9635572 +1
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H -3.02241346 +1 2.1770386 +1 0.5941259 +1
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O 3.08138349 +1 0.5234682 +1 -8.7362565 +1
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C 1.91083033 +1 -2.7079048 +1 -10.8416749 +1
N 1.55810191 +1 -3.9161370 +1 -11.4947224 +1
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O 0.78224288 +1 -4.6693252 +1 -10.9099382 +1
C 1.21905352 +1 -2.3030828 +1 -9.7021873 +1
H 1.08786860 +1 -0.8642931 +1 -8.1793571 +1
H 4.22817723 +1 -0.3007851 +1 -10.8538994 +1
H 0.34741118 +1 -2.8831747 +1 -9.3107544 +1
N -3.76564604 +1 -1.4180002 +1 -1.0531204 +1
C -2.72242312 +1 -2.2612025 +1 -1.5508126 +1
O -2.46276225 +1 -3.2994537 +1 -0.9738687 +1
N -2.07323044 +1 -1.8532121 +1 -2.6985966 +1
C -2.37155845 +1 -0.6565768 +1 -3.3927531 +1
O -1.78142292 +1 -0.4934998 +1 -4.4404099 +1
C -3.35160358 +1 0.1989383 +1 -2.7506427 +1
N -3.59931156 +1 1.4855418 +1 -3.2748364 +1
O -3.09129695 +1 1.8394283 +1 -4.3304682 +1
O -4.31260589 +1 2.2427381 +1 -2.6175395 +1
C -4.07490550 +1 -0.2490542 +1 -1.6435070 +1
H -4.30065620 +1 -1.7926192 +1 -0.2405395 +1
H -1.21740516 +1 -2.3628974 +1 -2.9965396 +1
H -4.91657181 +1 0.3468168 +1 -1.2115970 +1
N 1.90434390 +1 -4.5170849 +1 -6.8805403 +1
C 0.80243462 +1 -5.3433651 +1 -6.4924296 +1
O 0.46153333 +1 -6.2786098 +1 -7.1865874 +1
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C 0.45487462 +1 -3.8691425 +1 -4.5386018 +1
O -0.18674257 +1 -3.7487131 +1 -3.5170497 +1
C 1.47600973 +1 -3.0001911 +1 -5.0914394 +1
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O 1.31997697 +1 -1.5410617 +1 -3.3302390 +1
O 2.44293743 +1 -0.9539061 +1 -5.0591386 +1
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H 2.40297382 +1 -4.8038484 +1 -7.7422339 +1
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C 1.52748237 +1 4.0211513 +1 -9.2239193 +1
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N -3.74030163 +1 4.8544608 +1 -0.8916805 +1
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H -1.71890298 +1 3.6084543 +1 -5.3703751 +1
N 4.11187158 +1 7.9085627 +1 1.6744602 +1
C 3.00171446 +1 8.6700989 +1 2.1567837 +1
O 2.67141325 +1 9.6879152 +1 1.5777486 +1
N 2.35958892 +1 8.1926716 +1 3.2796959 +1
C 2.64802492 +1 6.9417927 +1 3.8830884 +1
O 2.04666880 +1 6.7053126 +1 4.9083720 +1
C 3.62714774 +1 6.1301470 +1 3.1831762 +1
N 3.82966666 +1 4.7869154 +1 3.5751772 +1
O 3.38797359 +1 4.3764561 +1 4.6399061 +1
O 4.44046274 +1 4.0532284 +1 2.8004377 +1
C 4.37030336 +1 6.6679406 +1 2.1334865 +1
H 4.64311494 +1 8.3230798 +1 0.8792466 +1
H 1.47865538 +1 8.6560896 +1 3.5827233 +1
H 5.19722775 +1 6.1014832 +1 1.6405746 +1
N 9.40736286 +1 5.1504891 +1 -8.7985921 +1
C 10.55612064 +1 5.9257445 +1 -9.1521767 +1
O 10.92316204 +1 6.8350406 +1 -8.4354930 +1
N 11.17924898 +1 5.5984875 +1 -10.3408521 +1
C 10.83190916 +1 4.4809646 +1 -11.1392526 +1
O 11.44930432 +1 4.3726349 +1 -12.1781123 +1
C 9.77499497 +1 3.6415876 +1 -10.6097264 +1
N 9.46731660 +1 2.4122834 +1 -11.2471618 +1
O 9.93566539 +1 2.1442483 +1 -12.3427319 +1
O 8.75450102 +1 1.6196533 +1 -10.6339149 +1
C 9.06439760 +1 4.0353514 +1 -9.4768672 +1
H 8.93402905 +1 5.4253578 +1 -7.9184402 +1
H 12.09225871 +1 6.0533765 +1 -10.5556577 +1
H 8.19753850 +1 3.4453449 +1 -9.0937356 +1
N 3.64932614 +1 4.6845699 +1 -1.1116352 +1
C 4.73671879 +1 3.8861871 +1 -1.5857814 +1
O 5.01881226 +1 2.8457919 +1 -1.0234207 +1
N 5.41507339 +1 4.3514976 +1 -2.6954470 +1
C 5.21120524 +1 5.6316540 +1 -3.2705343 +1
O 5.87174031 +1 5.8812021 +1 -4.2558428 +1
C 4.24133443 +1 6.4623264 +1 -2.5821756 +1
N 4.10679420 +1 7.8149689 +1 -2.9586167 +1
O 4.59649402 +1 8.2265038 +1 -4.0018431 +1
O 3.49559034 +1 8.5589584 +1 -2.1920806 +1
C 3.44169962 +1 5.9369031 +1 -1.5657537 +1
H 3.08419719 +1 4.2754701 +1 -0.3402438 +1
H 6.28214911 +1 3.8586500 +1 -2.9861257 +1
H 2.61835192 +1 6.5265492 +1 -1.0947888 +1
N 9.58675792 +1 1.6129322 +1 -6.5799445 +1
C 8.43160020 +1 0.8646906 +1 -6.1990928 +1
O 8.06928684 +1 -0.0761963 +1 -6.8805614 +1
N 7.78476010 +1 1.2571626 +1 -5.0450940 +1
C 8.12772438 +1 2.4149611 +1 -4.2984214 +1
O 7.50369460 +1 2.5707684 +1 -3.2707496 +1
C 9.18984789 +1 3.2218714 +1 -4.8674298 +1
N 9.53098433 +1 4.4549528 +1 -4.2672495 +1
O 9.02598279 +1 4.7932588 +1 -3.2057964 +1
O 10.33047628 +1 5.1784359 +1 -4.8598001 +1
C 9.92463272 +1 2.7614869 +1 -5.9604199 +1
H 10.10788650 +1 1.2526103 +1 -7.4063612 +1
H 6.87080934 +1 0.8183001 +1 -4.8160901 +1
H 10.81019674 +1 3.3236542 +1 -6.3496611 +1
O 8.90787844 +1 6.6511136 +1 0.5263806 +1
C 8.02156901 +1 7.5571393 +1 -0.1182853 +1
C 8.20354085 +1 5.6526689 +1 1.2535263 +1
H 8.69195594 +1 8.2449815 +1 -0.6708624 +1
H 7.46574327 +1 8.1271697 +1 0.6477136 +1
H 9.00723776 +1 5.0124659 +1 1.6617365 +1
H 7.65689817 +1 6.1334667 +1 2.0842415 +1
O 6.38533979 +1 5.7845994 +1 -0.3206873 +1
C 7.26846739 +1 4.8783814 +1 0.3275789 +1
C 7.09582266 +1 6.7801182 +1 -1.0471877 +1
H 6.59463826 +1 4.2011590 +1 0.8870589 +1
H 7.81598774 +1 4.2990766 +1 -0.4378782 +1
H 6.29925254 +1 7.4278243 +1 -1.4545293 +1
H 7.65082080 +1 6.2973746 +1 -1.8715891 +1
O 4.46140117 +1 3.8613064 +1 -8.0441557 +1
C 5.35906547 +1 4.7351912 +1 -7.3707653 +1
C 5.15289164 +1 2.8899754 +1 -8.8192382 +1
H 4.69553950 +1 5.4064767 +1 -6.7923139 +1
H 5.91684098 +1 5.3267664 +1 -8.1197771 +1
H 4.34340444 +1 2.2697544 +1 -9.2487084 +1
H 5.69830217 +1 3.3977161 +1 -9.6356045 +1
O 6.97868470 +1 2.9477236 +1 -7.2409406 +1
C 6.09042270 +1 2.0766393 +1 -7.9310620 +1
C 6.27993539 +1 3.9174710 +1 -6.4701772 +1
H 6.76471627 +1 1.4271932 +1 -8.5226339 +1
H 5.54427471 +1 1.4633196 +1 -7.1915330 +1
H 7.08392641 +1 4.5337585 +1 -6.0259343 +1
H 5.71720896 +1 3.4057975 +1 -5.6678311 +1
Tv 14.92992345 +1 -0.3754617 +1 -0.4060711 +1
Tv 0.49967831 +1 12.7176094 +1 0.9056841 +1
Tv -3.68945752 +1 -0.6316784 +1 15.4834315 +1
Optimized PM6_D3H4 data set:
MERS=(2,2,1) Z=2 CHARGE=0 EF OUTPUT THREADS=1 PM6-D3H4 GRADIENTS
5-Nitrouracil dioxane (PM6-D3H4)
N -4.05847414 +1 1.7057663 +1 1.0944662 +1
C -5.18698620 +1 2.4530039 +1 1.6023097 +1
O -5.51383293 +1 3.5038731 +1 1.0688753 +1
N -5.81914563 +1 1.9255677 +1 2.7223874 +1
C -5.47199941 +1 0.6766854 +1 3.3442423 +1
O -6.14393844 +1 0.3690627 +1 4.3082310 +1
C -4.36280748 +1 -0.0267756 +1 2.7155021 +1
N -3.93227395 +1 -1.2908431 +1 3.2583669 +1
O -4.47994813 +1 -1.7484900 +1 4.2473286 +1
O -3.01716897 +1 -1.8634903 +1 2.6683823 +1
C -3.65900455 +1 0.5257644 +1 1.6442928 +1
H -3.54241450 +1 2.1418783 +1 0.2785006 +1
H -6.67201047 +1 2.4287446 +1 3.0762563 +1
H -2.75360156 +1 0.0157625 +1 1.2102301 +1
N 1.49884210 +1 -1.5063949 +1 -8.7855723 +1
C 2.62600489 +1 -0.7593660 +1 -9.2932936 +1
O 2.95775876 +1 0.2912916 +1 -8.7592981 +1
N 3.25924865 +1 -1.2855254 +1 -10.4120302 +1
C 2.92649418 +1 -2.5466961 +1 -11.0231583 +1
O 3.62105636 +1 -2.8608436 +1 -11.9671670 +1
C 1.79914123 +1 -3.2392974 +1 -10.4091107 +1
N 1.35498489 +1 -4.4974357 +1 -10.9610322 +1
O 1.90923013 +1 -4.9586090 +1 -11.9443025 +1
O 0.42060945 +1 -5.0582633 +1 -10.3893456 +1
C 1.09685462 +1 -2.6856528 +1 -9.3395298 +1
H 0.97877649 +1 -1.0700186 +1 -7.9735198 +1
H 4.10833536 +1 -0.7784752 +1 -10.7695237 +1
H 0.19003162 +1 -3.1919123 +1 -8.9054921 +1
N -4.29556835 +1 -1.7156160 +1 -1.0931257 +1
C -3.17356584 +1 -2.4725056 +1 -1.6056617 +1
O -2.86162762 +1 -3.5312082 +1 -1.0808332 +1
N -2.53939882 +1 -1.9390089 +1 -2.7221944 +1
C -2.89213592 +1 -0.6947788 +1 -3.3527198 +1
O -2.23330168 +1 -0.3992448 +1 -4.3287006 +1
C -4.00615388 +1 0.0081110 +1 -2.7297583 +1
N -4.43274816 +1 1.2750153 +1 -3.2716315 +1
O -3.87507674 +1 1.7343725 +1 -4.2539089 +1
O -5.34999151 +1 1.8523361 +1 -2.6881562 +1
C -4.69676311 +1 -0.5380359 +1 -1.6494971 +1
H -4.81804049 +1 -2.1517862 +1 -0.2875316 +1
H -1.67947884 +1 -2.4323063 +1 -3.0756028 +1
H -5.60081864 +1 -0.0220939 +1 -1.2098497 +1
N 1.72686710 +1 -4.9422685 +1 -6.6101671 +1
C 0.59176972 +1 -5.6999207 +1 -6.1148210 +1
O 0.26964681 +1 -6.7346178 +1 -6.6713945 +1
N -0.04468527 +1 -5.1727325 +1 -4.9902599 +1
C 0.30616404 +1 -3.9278560 +1 -4.3557340 +1
O -0.36217071 +1 -3.6283401 +1 -3.3867834 +1
C 1.42008715 +1 -3.2171035 +1 -4.9746038 +1
N 1.85215727 +1 -1.9567052 +1 -4.4241036 +1
O 1.30357683 +1 -1.4960865 +1 -3.4366343 +1
O 2.77526310 +1 -1.3814937 +1 -5.0036811 +1
C 2.12291079 +1 -3.7640771 +1 -6.0503773 +1
H 2.23886700 +1 -5.3710523 +1 -7.4201285 +1
H -0.88691005 +1 -5.6852922 +1 -4.6319476 +1
H 3.02557304 +1 -3.2451431 +1 -6.4785292 +1
O 1.33255766 +1 0.3677723 +1 0.2930852 +1
C 0.42477066 +1 1.3191795 +1 -0.3265962 +1
C 0.62203379 +1 -0.5684014 +1 1.1482021 +1
H 1.10338507 +1 1.9271457 +1 -0.9672163 +1
H -0.05113881 +1 1.9145036 +1 0.4851244 +1
H 1.43077975 +1 -1.2468569 +1 1.5043980 +1
H 0.14559784 +1 0.0152620 +1 1.9697587 +1
O -1.33085568 +1 -0.3709241 +1 -0.2927061 +1
C -0.42426247 +1 -1.3233359 +1 0.3255013 +1
C -0.62115365 +1 0.5638511 +1 -1.1493170 +1
H -1.10252599 +1 -1.9318696 +1 0.9663178 +1
H 0.05189473 +1 -1.9205303 +1 -0.4845294 +1
H -1.43200815 +1 1.2408338 +1 -1.5077099 +1
H -0.14578225 +1 -0.0183818 +1 -1.9720465 +1
O -3.89632517 +1 -2.8373568 +1 -7.9978734 +1
C -2.99041286 +1 -1.8913946 +1 -7.3642614 +1
C -3.18880905 +1 -3.7847070 +1 -8.8415500 +1
H -3.67381911 +1 -1.2876698 +1 -6.7222158 +1
H -2.51288910 +1 -1.2932758 +1 -8.1720913 +1
H -4.00114354 +1 -4.4571182 +1 -9.1996958 +1
H -2.70907254 +1 -3.2049918 +1 -9.6644194 +1
O -1.24016494 +1 -3.5853633 +1 -7.3945966 +1
C -2.14576803 +1 -4.5377287 +1 -8.0120721 +1
C -1.94940916 +1 -2.6495563 +1 -6.5391035 +1
H -1.46390439 +1 -5.1455158 +1 -8.6497465 +1
H -2.62115113 +1 -5.1339955 +1 -7.2003838 +1
H -1.13734266 +1 -1.9738299 +1 -6.1791462 +1
H -2.42552908 +1 -3.2300146 +1 -5.7164018 +1
N 4.28697512 +1 1.7087605 +1 1.0982790 +1
C 3.15865424 +1 2.4546863 +1 1.6084919 +1
O 2.82827210 +1 3.5053445 +1 1.0748293 +1
N 2.52802769 +1 1.9284179 +1 2.7293518 +1
C 2.86442792 +1 0.6704741 +1 3.3425186 +1
O 2.18371416 +1 0.3524690 +1 4.2957770 +1
C 3.98329196 +1 -0.0252189 +1 2.7184868 +1
N 4.41827593 +1 -1.2883903 +1 3.2599264 +1
O 3.87603866 +1 -1.7485679 +1 4.2504490 +1
O 5.33411848 +1 -1.8579207 +1 2.6670962 +1
C 4.68766838 +1 0.5289044 +1 1.6491259 +1
H 4.80566851 +1 2.1455706 +1 0.2851244 +1
H 1.67886872 +1 2.4354163 +1 3.0882092 +1
H 5.59466469 +1 0.0207735 +1 1.2157435 +1
N 9.84450908 +1 -1.5085013 +1 -8.7818278 +1
C 10.97170469 +1 -0.7597257 +1 -9.2872752 +1
O 11.29970418 +1 0.2912833 +1 -8.7538033 +1
N 11.60557701 +1 -1.2875864 +1 -10.4048257 +1
C 11.26053195 +1 -2.5370422 +1 -11.0277250 +1
O 11.94057804 +1 -2.8335202 +1 -11.9890441 +1
C 10.14568704 +1 -3.2398920 +1 -10.4070133 +1
N 9.70659584 +1 -4.4990857 +1 -10.9597077 +1
O 10.26664358 +1 -4.9580107 +1 -11.9412388 +1
O 8.77308351 +1 -5.0631597 +1 -10.3908994 +1
C 9.44446701 +1 -2.6879843 +1 -9.3348696 +1
H 9.32678440 +1 -1.0728516 +1 -7.9672876 +1
H 12.45662252 +1 -0.7838229 +1 -10.7613506 +1
H 8.53921499 +1 -3.1962724 +1 -8.9003492 +1
N 4.05398341 +1 -1.7153458 +1 -1.0883692 +1
C 5.17749808 +1 -2.4724019 +1 -1.6003781 +1
O 5.48561387 +1 -3.5332862 +1 -1.0782140 +1
N 5.81606469 +1 -1.9374907 +1 -2.7134279 +1
C 5.46853629 +1 -0.6896358 +1 -3.3382653 +1
O 6.13218638 +1 -0.3907130 +1 -4.3095639 +1
C 4.35172054 +1 0.0123498 +1 -2.7176530 +1
N 3.92233646 +1 1.2747085 +1 -3.2660140 +1
O 4.47446697 +1 1.7303686 +1 -4.2532551 +1
O 3.00287352 +1 1.8508864 +1 -2.6842077 +1
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C -2.84925650 +1 5.7737735 +1 -3.3415815 +1
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N 4.06450473 +1 4.7211771 +1 -1.1026841 +1
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C 5.50135442 +1 5.7733814 +1 -3.3390063 +1
O 6.20623660 +1 6.1192249 +1 -4.2630337 +1
C 4.36572799 +1 6.4540659 +1 -2.7235506 +1
N 3.93104947 +1 7.7158524 +1 -3.2613997 +1
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C 3.66126893 +1 5.8981374 +1 -1.6548643 +1
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N 10.07110125 +1 1.5050362 +1 -6.5865427 +1
C 8.94222419 +1 0.7592753 +1 -6.0799786 +1
O 8.60711725 +1 -0.2888762 +1 -6.6157617 +1
N 8.31249355 +1 1.2881955 +1 -4.9605045 +1
C 8.66993803 +1 2.5297466 +1 -4.3282868 +1
O 8.00844660 +1 2.8252090 +1 -3.3541511 +1
C 9.78402235 +1 3.2307828 +1 -4.9524595 +1
N 10.21719714 +1 4.4953422 +1 -4.4096666 +1
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O 11.14295678 +1 5.0638643 +1 -4.9871186 +1
C 10.47543172 +1 2.6809671 +1 -6.0304300 +1
H 10.58811012 +1 1.0698371 +1 -7.4003897 +1
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C 8.77174520 +1 7.7560182 +1 -0.3229792 +1
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