Time stamp: Thu Mar 11 08:55:57 2021
3-Carboxyphenylammonium hydrogen 2,3-pyrazinedicarboxylate dihydrate (ZIKREQ)
299 3-Carboxyphenylammonium hydrogen 2,3-pyrazinedicarboxylate dihydrate (ZIKREQ)
(Previous) Bis(Pyridinium) oxalate oxalic acid (DEFCUM)
(Back) Elements:
N 3
C 13
O 8
H 15
(Z = 2)
(Periodic Table)
(Next) bis(4-(Dimethylamino)pyridinium) fumarate fumaric acid (GUKWIT)
The unsymmetrical hydrogen bond in the pyrazine carboxylate carboxylic acid
is reproduced.
Unit Cell Parameters: a b c alpha beta gamma Volume Density Heat of Formation (Kcal/mol)
X-ray: 10.12 9.49 7.89 100.38 88.63 88.17 744.41 1.523 -306.9 calc'd using PM7
PM7: 9.92 9.50 7.48 98.31 88.25 85.69 695.58 1.629 -413.8 calc'd using PM7 (ref: 0.0)
PM6_D3H4: 10.12 9.12 7.66 96.21 88.81 88.81 701.62 1.615 -404.0 calc'd using PM6_D3H4
X-Ray PM7 PM6_D3H4
|
Calc'd on: Feb 25 2021 @ 12:01:34 |
Feb 23 2021 @ 00:52:00
ARC file |
Feb 23 2021 @ 19:27:01 |
For X-Ray structure, contact the CCDC: http://www.ccdc.cam.ac.uk/
Optimized PM7 data set:
MERS=(1,1,1) CHARGE=0 OUTPUT THREADS=1 PM7 GRADIENTS NOTXT EF
m-Amino benzoic acid (ZIKREQ)
N -0.03719142 +1 0.0552438 +1 0.1506230 +1
C -4.06840111 +1 -0.7054686 +1 -1.7567254 +1
C -4.43752933 +1 0.6461937 +1 -1.8791305 +1
N -4.31845163 +1 1.4737314 +1 -0.8139597 +1
C -3.91168152 +1 0.9881384 +1 0.3615479 +1
C -3.58225308 +1 -0.3816834 +1 0.4920107 +1
C -4.04336942 +1 -1.7875148 +1 -2.8078663 +1
O -4.15701246 +1 -1.4692997 +1 -4.0597212 +1
O -3.90955919 +1 -2.9640686 +1 -2.4907032 +1
C -4.99552832 +1 1.3840810 +1 -3.0890442 +1
O -5.60991295 +1 2.4319314 +1 -2.9134602 +1
O -4.81098222 +1 0.8900369 +1 -4.2526208 +1
H -3.84332577 +1 1.7012283 +1 1.2032428 +1
H -3.26470253 +1 -0.8329953 +1 1.4451472 +1
H -4.42153006 +1 -0.3524182 +1 -4.2521286 +1
N -3.64599711 +1 -1.1920601 +1 -0.5655064 +1
N -0.71102952 +1 2.7225418 +1 -0.0525220 +1
C -0.30132471 +1 2.2140971 +1 1.1344604 +1
C 0.06873615 +1 0.8609087 +1 1.2341247 +1
C -0.42780182 +1 0.5633142 +1 -1.0203866 +1
C -0.75989091 +1 1.9346790 +1 -1.1270845 +1
C -0.34476113 +1 3.2823931 +1 2.1998763 +1
O -0.17314291 +1 2.9665616 +1 3.4440945 +1
O -0.57820949 +1 4.4489048 +1 1.9025256 +1
C 0.60761220 +1 0.0956248 +1 2.4360687 +1
O 1.13574405 +1 -0.9982758 +1 2.2612263 +1
O 0.49597315 +1 0.6112108 +1 3.5988173 +1
H -0.48112628 +1 -0.1335987 +1 -1.8761356 +1
H -1.07016059 +1 2.4057144 +1 -2.0728857 +1
H 0.12442634 +1 1.8520985 +1 3.6212070 +1
C -8.24916224 +1 -2.5877271 +1 -4.7018360 +1
C -7.32025685 +1 -3.6148071 +1 -4.5197353 +1
C -7.31288258 +1 -4.6709228 +1 -5.4278022 +1
N -6.23456443 +1 -5.6694888 +1 -5.3397159 +1
C -8.24938839 +1 -4.7565068 +1 -6.4609506 +1
C -9.18477312 +1 -3.7363127 +1 -6.6121773 +1
C -9.16383586 +1 -2.6349259 +1 -5.7569581 +1
O -8.87062740 +1 -0.3902714 +1 -3.9561451 +1
O -7.43806707 +1 -1.5893021 +1 -2.7500572 +1
C -8.24738096 +1 -1.4299957 +1 -3.7953150 +1
H -6.60850304 +1 -3.5840949 +1 -3.6809738 +1
H -6.54377909 +1 -6.6152197 +1 -5.6460020 +1
H -5.83468322 +1 -5.7331201 +1 -4.3698049 +1
H -5.44251263 +1 -5.3575921 +1 -5.9793461 +1
H -8.24637296 +1 -5.6052342 +1 -7.1580353 +1
H -9.93312327 +1 -3.7980441 +1 -7.4102973 +1
H -9.85584765 +1 -1.8021505 +1 -5.9170574 +1
H -7.39115006 +1 -0.7941539 +1 -2.1028875 +1
C -7.96920861 +1 2.6234786 +1 -0.2520961 +1
C -8.93949671 +1 3.6186007 +1 -0.3829017 +1
C -8.97279386 +1 4.6417367 +1 0.5621062 +1
N -10.08156729 +1 5.6087790 +1 0.5168227 +1
C -8.02403712 +1 4.7254899 +1 1.5839350 +1
C -7.04750557 +1 3.7378685 +1 1.6839724 +1
C -7.03865668 +1 2.6691238 +1 0.7891577 +1
O -7.31238894 +1 0.4550748 +1 -1.0344031 +1
O -8.74686545 +1 1.6559803 +1 -2.2384925 +1
C -7.94627480 +1 1.4894495 +1 -1.1876355 +1
H -9.66209498 +1 3.5867142 +1 -1.2121220 +1
H -9.78093377 +1 6.5681896 +1 0.7870582 +1
H -10.53452237 +1 5.6353160 +1 -0.4327368 +1
H -10.82789954 +1 5.3039197 +1 1.2094609 +1
H -8.04469128 +1 5.5480915 +1 2.3111264 +1
H -6.28877592 +1 3.8003674 +1 2.4722536 +1
H -6.31288088 +1 1.8587675 +1 0.9075826 +1
H -8.78451450 +1 0.8670866 +1 -2.8920484 +1
O -1.55367847 +1 -3.6810000 +1 2.5272126 +1
H -1.53021663 +1 -2.9178708 +1 3.1342173 +1
H -0.99105828 +1 -4.3487208 +1 2.9562161 +1
O -2.42689417 +1 -3.9629626 +1 -0.4698721 +1
H -2.41432129 +1 -4.7336627 +1 -1.0640968 +1
H -2.98123854 +1 -3.3122692 +1 -0.9327532 +1
O -5.71326034 +1 -5.4513960 +1 -2.5845197 +1
H -5.55362315 +1 -6.0376227 +1 -1.8207483 +1
H -4.94099035 +1 -4.8802978 +1 -2.6097428 +1
O -0.61466443 +1 -3.2896086 +1 -2.4683119 +1
H -0.77034311 +1 -2.7103951 +1 -3.2343002 +1
H -1.34879625 +1 -3.9079492 +1 -2.4741608 +1
Tv 9.49688158 +1 0.5158752 +1 -2.8319470 +1
Tv -0.53257802 +1 9.1144654 +1 -2.6277467 +1
Tv 2.28435262 +1 1.0391016 +1 7.0504524 +1
Optimized PM6_D3H4 data set:
MERS=(1,1,1) CHARGE=0 EF OUTPUT THREADS=1 PM6-D3H4 GRADIENTS
3-Carboxyphenylammonium hydrogen 2,3-pyrazinedicarboxylate dihydrate (ZIKREQ) (PM6-D3H4)
N -0.01855913 +1 -0.0795588 +1 -0.0163464 +1
C -3.93924919 +1 -0.8662947 +1 -1.6281949 +1
C -4.40319830 +1 0.4610327 +1 -1.6782725 +1
N -4.33960384 +1 1.2672838 +1 -0.5695469 +1
C -3.83595185 +1 0.7666634 +1 0.5677519 +1
C -3.31252281 +1 -0.5555000 +1 0.6100727 +1
C -3.95520345 +1 -1.9491998 +1 -2.7117550 +1
O -4.25562220 +1 -1.6516566 +1 -3.9067758 +1
O -3.63030235 +1 -3.1138275 +1 -2.4033801 +1
C -5.02196914 +1 1.2557199 +1 -2.8028553 +1
O -5.29281906 +1 2.4425551 +1 -2.7078011 +1
O -5.34346678 +1 0.6578830 +1 -3.9499515 +1
H -3.86026336 +1 1.4330741 +1 1.4423030 +1
H -2.84803416 +1 -0.9691990 +1 1.5281158 +1
H -4.92578926 +1 -0.3390699 +1 -4.0638973 +1
N -3.36406678 +1 -1.3427212 +1 -0.4778800 +1
N -0.95548056 +1 2.5439530 +1 -0.1336372 +1
C -0.38122298 +1 2.0723895 +1 1.0187239 +1
C 0.06884721 +1 0.7410259 +1 1.0796219 +1
C -0.53432007 +1 0.4117342 +1 -1.1516502 +1
C -1.03026088 +1 1.7436702 +1 -1.2093948 +1
C -0.35304934 +1 3.1672219 +1 2.0896134 +1
O -0.06981557 +1 2.8771887 +1 3.2917328 +1
O -0.64829738 +1 4.3329185 +1 1.7580156 +1
C 0.70137368 +1 -0.0394651 +1 2.2031261 +1
O 0.94638320 +1 -1.2338198 +1 2.1310628 +1
O 1.07850994 +1 0.5871240 +1 3.3187503 +1
H -0.54308410 +1 -0.2747810 +1 -2.0100363 +1
H -1.49109430 +1 2.1568269 +1 -2.1294828 +1
H 0.67724912 +1 1.5913611 +1 3.4229247 +1
C -8.27740360 +1 -2.6307345 +1 -4.7063801 +1
C -7.36912365 +1 -3.6723684 +1 -4.4557840 +1
C -7.31062728 +1 -4.7329561 +1 -5.3625982 +1
N -6.21373370 +1 -5.7256579 +1 -5.2593457 +1
C -8.19605389 +1 -4.8195461 +1 -6.4519435 +1
C -9.12554234 +1 -3.8002962 +1 -6.6540930 +1
C -9.15095808 +1 -2.6882661 +1 -5.8051195 +1
O -8.79705388 +1 -0.3466872 +1 -4.1016236 +1
O -7.63989110 +1 -1.5953730 +1 -2.6677461 +1
C -8.29094532 +1 -1.4393302 +1 -3.8382253 +1
H -6.71709116 +1 -3.6370497 +1 -3.5664306 +1
H -6.58395124 +1 -6.7073414 +1 -5.4262302 +1
H -5.69685909 +1 -5.6444395 +1 -4.3094502 +1
H -5.52201432 +1 -5.4553533 +1 -6.0627103 +1
H -8.15270609 +1 -5.6724856 +1 -7.1466179 +1
H -9.82632686 +1 -3.8682608 +1 -7.4915104 +1
H -9.83834100 +1 -1.8565664 +1 -6.0058209 +1
H -7.66087249 +1 -0.7328583 +1 -2.0770849 +1
C -8.08207377 +1 2.8536237 +1 -0.3908178 +1
C -8.98175538 +1 3.9020564 +1 -0.6413794 +1
C -9.02702620 +1 4.9661689 +1 0.2621532 +1
N -10.11272670 +1 5.9694420 +1 0.1495535 +1
C -8.14108988 +1 5.0488390 +1 1.3506369 +1
C -7.22258471 +1 4.0200964 +1 1.5546969 +1
C -7.20676896 +1 2.9072598 +1 0.7068192 +1
O -7.56453215 +1 0.5719841 +1 -1.0032214 +1
O -8.74259269 +1 1.8196895 +1 -2.4229609 +1
C -8.07584462 +1 1.6634399 +1 -1.2596900 +1
H -9.63507041 +1 3.8695936 +1 -1.5309182 +1
H -9.74754556 +1 6.9456849 +1 0.3563128 +1
H -10.58440608 +1 5.9156394 +1 -0.8243388 +1
H -10.82660182 +1 5.6927408 +1 0.9225630 +1
H -8.17636480 +1 5.9035899 +1 2.0420290 +1
H -6.52061358 +1 4.0827305 +1 2.3920713 +1
H -6.52523200 +1 2.0702662 +1 0.9067546 +1
H -8.72458479 +1 0.9605968 +1 -3.0165061 +1
O -1.68899244 +1 -3.2457785 +1 2.6676461 +1
H -1.42335154 +1 -2.3951054 +1 3.1203502 +1
H -1.24784230 +1 -4.0299027 +1 3.1477225 +1
O -2.52120036 +1 -4.1779440 +1 -0.3796136 +1
H -2.76599329 +1 -5.0320621 +1 -0.8434539 +1
H -2.95711400 +1 -3.3962720 +1 -0.8744954 +1
O -5.71774940 +1 -5.2328087 +1 -2.4901935 +1
H -5.84007287 +1 -5.9225449 +1 -1.7998906 +1
H -4.80923978 +1 -4.8438687 +1 -2.3874540 +1
O -0.71927490 +1 -3.7735922 +1 -2.4430700 +1
H -0.56921845 +1 -3.0926956 +1 -3.1390982 +1
H -1.63841307 +1 -4.1315393 +1 -2.5480335 +1
Tv 9.71659925 +1 -0.6285701 +1 -2.7491019 +1
Tv -0.08060190 +1 8.6231332 +1 -2.9557898 +1
Tv 2.28541095 +1 1.5909170 +1 7.1312701 +1