SUMMARY OF PM6 CALCULATION, Site No: 6578 MOPAC2012 (Version: 12.112M) Mon Apr 23 02:22:49 2012 No. of days left = 364 Empirical Formula: C684 H1263 N179 O309 S13 = 2448 atoms CUTOFF=6 PM6 geo_ref="pheromone_binding_protein_(1DQE).mop"3 PM6 OPT PDBOUT XYZ SETUP LBFGS GNORM=5 PL MOZYME pheromone_binding_protein_(1DQE)(Ref) HERBERTS TEST WAS SATISFIED IN BFGS SCF FIELD WAS ACHIEVED FINAL H.O.F PLUS STRESS = -16246.85984 KCAL/MOL = -67976.86156 KJ/MOL FINAL STRESS = 127.35984 KCAL/MOL = 532.87356 KJ/MOL HEAT OF FORMATION = -16374.21968 KCAL/MOL = -68509.73512 KJ/MOL TOTAL DISTORTION = 269.93233 Angstroms AVERAGE DISTORTION = 0.11027 Angstroms per atom (all atoms) RMS DISTORTION = 0.13169 Angstroms per atom (all atoms) TOTAL ENERGY = -225616.43106 EV ELECTRONIC ENERGY = -22244353.93277 EV CORE-CORE REPULSION = 22018737.50171 EV GRADIENT NORM = 9.38215 DIPOLE = 38.68688 DEBYE NO. OF FILLED LEVELS = 3413 MOLECULAR WEIGHT = 17356.296 MOLECULAR DIMENSIONS (Angstroms) Atom Atom Distance H 2309 H 2354 43.79783 H 2182 H 1979 42.84024 H 2128 H 1327 32.59810 SCF CALCULATIONS = 28 COMPUTATION TIME = 42 MINUTES AND 38.339 SECONDS FINAL GEOMETRY OBTAINED CHARGE *HEADER TRANSPORT PROTEIN 04-JAN-00 1DQE *TITLE BOMBYX MORI PHEROMONE BINDING PROTEIN *COMPND MOL_ID: 1; *COMPND 2 MOLECULE: PHEROMONE-BINDING PROTEIN; *COMPND 3 CHAIN: A, B; *COMPND 4 SYNONYM: PBP; *COMPND 5 ENGINEERED: YES *SOURCE MOL_ID: 1; *SOURCE 2 ORGANISM_SCIENTIFIC: BOMBYX MORI; *SOURCE 3 ORGANISM_COMMON: DOMESTIC SILKWORM; *SOURCE 4 ORGANISM_TAXID: 7091; *SOURCE 5 EXPRESSION_SYSTEM: ESCHERICHIA COLI; *SOURCE 6 EXPRESSION_SYSTEM_TAXID: 562 *KEYWDS HELICAL BUNDLE, TRANSPORT PROTEIN *EXPDTA X-RAY DIFFRACTION *AUTHOR B.H.SANDLER,L.NIKONOVA,W.S.LEAL,J.CLARDY *REVDAT 3 24-FEB-09 1DQE 1 VERSN *REVDAT 2 01-APR-03 1DQE 1 JRNL *REVDAT 1 10-JAN-01 1DQE 0 *JRNL AUTH B.H.SANDLER,L.NIKONOVA,W.S.LEAL,J.CLARDY *JRNL TITL SEXUAL ATTRACTION IN THE SILKWORM MOTH: STRUCTURE *JRNL TITL 2 OF THE PHEROMONE-BINDING-PROTEIN-BOMBYKOL COMPLEX. *JRNL REF CHEM.BIOL. V. 7 143 2000 *JRNL REFN ISSN 1074-5521 *JRNL PMID 10662696 *JRNL DOI 10.1016/S1074-5521(00)00078-8 *REMARK 1 *REMARK 2 *REMARK 2 RESOLUTION. 1.80 ANGSTROMS. *REMARK 3 *REMARK 3 REFINEMENT. *REMARK 3 PROGRAM : REFMAC *REMARK 3 AUTHORS : MURSHUDOV,VAGIN,DODSON *REMARK 3 *REMARK 3 DATA USED IN REFINEMENT. *REMARK 3 RESOLUTION RANGE HIGH (ANGSTROMS) : 1.80 *REMARK 3 RESOLUTION RANGE LOW (ANGSTROMS) : 30.00 *REMARK 3 DATA CUTOFF (SIGMA(F)) : 0.000 *REMARK 3 COMPLETENESS FOR RANGE (%) : 99.6 *REMARK 3 NUMBER OF REFLECTIONS : 26466 *REMARK 3 *REMARK 3 FIT TO DATA USED IN REFINEMENT. *REMARK 3 CROSS-VALIDATION METHOD : THROUGHOUT *REMARK 3 FREE R VALUE TEST SET SELECTION : RANDOM *REMARK 3 R VALUE (WORKING + TEST SET) : NULL *REMARK 3 R VALUE (WORKING SET) : 0.210 *REMARK 3 FREE R VALUE : 0.273 *REMARK 3 FREE R VALUE TEST SET SIZE (%) : 5.000 *REMARK 3 FREE R VALUE TEST SET COUNT : 1330 *REMARK 3 *REMARK 3 NUMBER OF NON-HYDROGEN ATOMS USED IN REFINEMENT. *REMARK 3 PROTEIN ATOMS : 2140 *REMARK 3 NUCLEIC ACID ATOMS : 0 *REMARK 3 HETEROGEN ATOMS : 34 *REMARK 3 SOLVENT ATOMS : 203 *REMARK 3 *REMARK 3 B VALUES. *REMARK 3 FROM WILSON PLOT (A**2) : 19.74 *REMARK 3 MEAN B VALUE (OVERALL, A**2) : NULL *REMARK 3 OVERALL ANISOTROPIC B VALUE. *REMARK 3 B11 (A**2) : NULL *REMARK 3 B22 (A**2) : NULL *REMARK 3 B33 (A**2) : NULL *REMARK 3 B12 (A**2) : NULL *REMARK 3 B13 (A**2) : NULL *REMARK 3 B23 (A**2) : NULL *REMARK 3 *REMARK 3 ESTIMATED OVERALL COORDINATE ERROR. *REMARK 3 ESU BASED ON R VALUE (A): NULL *REMARK 3 ESU BASED ON FREE R VALUE (A): NULL *REMARK 3 ESU BASED ON MAXIMUM LIKELIHOOD (A): NULL *REMARK 3 ESU FOR B VALUES BASED ON MAXIMUM LIKELIHOOD (A**2): NULL *REMARK 3 *REMARK 3 RMS DEVIATIONS FROM IDEAL VALUES. *REMARK 3 DISTANCE RESTRAINTS. RMS SIGMA *REMARK 3 BOND LENGTH (A) : 2.400 ; NULL *REMARK 3 ANGLE DISTANCE (A) : 0.012 ; NULL *REMARK 3 INTRAPLANAR 1-4 DISTANCE (A) : NULL ; NULL *REMARK 3 H-BOND OR METAL COORDINATION (A) : NULL ; NULL *REMARK 3 *REMARK 3 PLANE RESTRAINT (A) : NULL ; NULL *REMARK 3 CHIRAL-CENTER RESTRAINT (A**3) : NULL ; NULL *REMARK 3 *REMARK 3 NON-BONDED CONTACT RESTRAINTS. *REMARK 3 SINGLE TORSION (A) : NULL ; NULL *REMARK 3 MULTIPLE TORSION (A) : NULL ; NULL *REMARK 3 H-BOND (X...Y) (A) : NULL ; NULL *REMARK 3 H-BOND (X-H...Y) (A) : NULL ; NULL *REMARK 3 *REMARK 3 CONFORMATIONAL TORSION ANGLE RESTRAINTS. *REMARK 3 SPECIFIED (DEGREES) : NULL ; NULL *REMARK 3 PLANAR (DEGREES) : NULL ; NULL *REMARK 3 STAGGERED (DEGREES) : NULL ; NULL *REMARK 3 TRANSVERSE (DEGREES) : NULL ; NULL *REMARK 3 *REMARK 3 ISOTROPIC THERMAL FACTOR RESTRAINTS. RMS SIGMA *REMARK 3 MAIN-CHAIN BOND (A**2) : NULL ; NULL *REMARK 3 MAIN-CHAIN ANGLE (A**2) : NULL ; NULL *REMARK 3 SIDE-CHAIN BOND (A**2) : NULL ; NULL *REMARK 3 SIDE-CHAIN ANGLE (A**2) : NULL ; NULL *REMARK 3 *REMARK 3 OTHER REFINEMENT REMARKS: NULL *REMARK 4 *REMARK 4 1DQE COMPLIES WITH FORMAT V. 3.15, 01-DEC-08 *REMARK 100 *REMARK 100 THIS ENTRY HAS BEEN PROCESSED BY RCSB ON 14-JAN-00. *REMARK 100 THE RCSB ID CODE IS RCSB010291. *REMARK 200 *REMARK 200 EXPERIMENTAL DETAILS *REMARK 200 EXPERIMENT TYPE : X-RAY DIFFRACTION *REMARK 200 DATE OF DATA COLLECTION : 06-MAY-99 *REMARK 200 TEMPERATURE (KELVIN) : 100 *REMARK 200 PH : 8.2 *REMARK 200 NUMBER OF CRYSTALS USED : 1 *REMARK 200 *REMARK 200 SYNCHROTRON (Y/N) : Y *REMARK 200 RADIATION SOURCE : CHESS *REMARK 200 BEAMLINE : A1 *REMARK 200 X-RAY GENERATOR MODEL : NULL *REMARK 200 MONOCHROMATIC OR LAUE (M/L) : M *REMARK 200 WAVELENGTH OR RANGE (A) : 0.9134 *REMARK 200 MONOCHROMATOR : NULL *REMARK 200 OPTICS : NULL *REMARK 200 *REMARK 200 DETECTOR TYPE : CCD *REMARK 200 DETECTOR MANUFACTURER : ADSC QUANTUM 4 *REMARK 200 INTENSITY-INTEGRATION SOFTWARE : MOSFLM *REMARK 200 DATA SCALING SOFTWARE : CCP4 (SCALA) *REMARK 200 *REMARK 200 NUMBER OF UNIQUE REFLECTIONS : 26466 *REMARK 200 RESOLUTION RANGE HIGH (A) : 1.800 *REMARK 200 RESOLUTION RANGE LOW (A) : 32.400 *REMARK 200 REJECTION CRITERIA (SIGMA(I)) : 0.000 *REMARK 200 *REMARK 200 OVERALL. *REMARK 200 COMPLETENESS FOR RANGE (%) : 99.6 *REMARK 200 DATA REDUNDANCY : 5.100 *REMARK 200 R MERGE (I) : 0.06100 *REMARK 200 R SYM (I) : NULL *REMARK 200 FOR THE DATA SET : 9.2000 *REMARK 200 *REMARK 200 IN THE HIGHEST RESOLUTION SHELL. *REMARK 200 HIGHEST RESOLUTION SHELL, RANGE HIGH (A) : 1.80 *REMARK 200 HIGHEST RESOLUTION SHELL, RANGE LOW (A) : 1.90 *REMARK 200 COMPLETENESS FOR SHELL (%) : 99.9 *REMARK 200 DATA REDUNDANCY IN SHELL : 3.50 *REMARK 200 R MERGE FOR SHELL (I) : 0.26400 *REMARK 200 R SYM FOR SHELL (I) : NULL *REMARK 200 FOR SHELL : NULL *REMARK 200 *REMARK 200 DIFFRACTION PROTOCOL: SINGLE WAVELENGTH *REMARK 200 METHOD USED TO DETERMINE THE STRUCTURE: NULL *REMARK 200 SOFTWARE USED: SHARP *REMARK 200 STARTING MODEL: NULL *REMARK 200 *REMARK 200 REMARK: NULL *REMARK 280 *REMARK 280 CRYSTAL *REMARK 280 SOLVENT CONTENT, VS (%): 44.12 *REMARK 280 MATTHEWS COEFFICIENT, VM (ANGSTROMS**3/DA): 2.20 *REMARK 280 *REMARK 280 CRYSTALLIZATION CONDITIONS: PEG20000, TRIS, PH 8.2, VAPOR *REMARK 280 DIFFUSION, HANGING DROP, TEMPERATURE 298K *REMARK 290 *REMARK 290 CRYSTALLOGRAPHIC SYMMETRY *REMARK 290 SYMMETRY OPERATORS FOR SPACE GROUP: P 41 21 2 *REMARK 290 *REMARK 290 SYMOP SYMMETRY *REMARK 290 NNNMMM OPERATOR *REMARK 290 1555 X,Y,Z *REMARK 290 2555 -X,-Y,Z+1/2 *REMARK 290 3555 -Y+1/2,X+1/2,Z+1/4 *REMARK 290 4555 Y+1/2,-X+1/2,Z+3/4 *REMARK 290 5555 -X+1/2,Y+1/2,-Z+1/4 *REMARK 290 6555 X+1/2,-Y+1/2,-Z+3/4 *REMARK 290 7555 Y,X,-Z *REMARK 290 8555 -Y,-X,-Z+1/2 *REMARK 290 *REMARK 290 WHERE NNN -> OPERATOR NUMBER *REMARK 290 MMM -> TRANSLATION VECTOR *REMARK 290 *REMARK 290 CRYSTALLOGRAPHIC SYMMETRY TRANSFORMATIONS *REMARK 290 THE FOLLOWING TRANSFORMATIONS OPERATE ON THE ATOM/HETATM *REMARK 290 RECORDS IN THIS ENTRY TO PRODUCE CRYSTALLOGRAPHICALLY *REMARK 290 RELATED MOLECULES. *REMARK 290 SMTRY1 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.00000 *REMARK 290 SMTRY2 1 0.000000 1.000000 0.000000 0.00000 *REMARK 290 SMTRY3 1 0.000000 0.000000 1.000000 0.00000 *REMARK 290 SMTRY1 2 -1.000000 0.000000 0.000000 0.00000 *REMARK 290 SMTRY2 2 0.000000 -1.000000 0.000000 0.00000 *REMARK 290 SMTRY3 2 0.000000 0.000000 1.000000 95.77000 *REMARK 290 SMTRY1 3 0.000000 -1.000000 0.000000 26.59000 *REMARK 290 SMTRY2 3 1.000000 0.000000 0.000000 26.59000 *REMARK 290 SMTRY3 3 0.000000 0.000000 1.000000 47.88500 *REMARK 290 SMTRY1 4 0.000000 1.000000 0.000000 26.59000 *REMARK 290 SMTRY2 4 -1.000000 0.000000 0.000000 26.59000 *REMARK 290 SMTRY3 4 0.000000 0.000000 1.000000 143.65500 *REMARK 290 SMTRY1 5 -1.000000 0.000000 0.000000 26.59000 *REMARK 290 SMTRY2 5 0.000000 1.000000 0.000000 26.59000 *REMARK 290 SMTRY3 5 0.000000 0.000000 -1.000000 47.88500 *REMARK 290 SMTRY1 6 1.000000 0.000000 0.000000 26.59000 *REMARK 290 SMTRY2 6 0.000000 -1.000000 0.000000 26.59000 *REMARK 290 SMTRY3 6 0.000000 0.000000 -1.000000 143.65500 *REMARK 290 SMTRY1 7 0.000000 1.000000 0.000000 0.00000 *REMARK 290 SMTRY2 7 1.000000 0.000000 0.000000 0.00000 *REMARK 290 SMTRY3 7 0.000000 0.000000 -1.000000 0.00000 *REMARK 290 SMTRY1 8 0.000000 -1.000000 0.000000 0.00000 *REMARK 290 SMTRY2 8 -1.000000 0.000000 0.000000 0.00000 *REMARK 290 SMTRY3 8 0.000000 0.000000 -1.000000 95.77000 *REMARK 290 *REMARK 290 REMARK: NULL *REMARK 300 *REMARK 300 BIOMOLECULE: 1 *REMARK 300 SEE REMARK 350 FOR THE AUTHOR PROVIDED AND/OR PROGRAM *REMARK 300 GENERATED ASSEMBLY INFORMATION FOR THE STRUCTURE IN *REMARK 300 THIS ENTRY. THE REMARK MAY ALSO PROVIDE INFORMATION ON *REMARK 300 BURIED SURFACE AREA. *REMARK 350 *REMARK 350 COORDINATES FOR A COMPLETE MULTIMER REPRESENTING THE KNOWN *REMARK 350 BIOLOGICALLY SIGNIFICANT OLIGOMERIZATION STATE OF THE *REMARK 350 MOLECULE CAN BE GENERATED BY APPLYING BIOMT TRANSFORMATIONS *REMARK 350 GIVEN BELOW. BOTH NON-CRYSTALLOGRAPHIC AND *REMARK 350 CRYSTALLOGRAPHIC OPERATIONS ARE GIVEN. *REMARK 350 *REMARK 350 BIOMOLECULE: 1 *REMARK 350 AUTHOR DETERMINED BIOLOGICAL UNIT: DIMERIC *REMARK 350 APPLY THE FOLLOWING TO CHAINS: A, B *REMARK 350 BIOMT1 1 1.000000 0.000000 0.000000 0.00000 *REMARK 350 BIOMT2 1 0.000000 1.000000 0.000000 0.00000 *REMARK 350 BIOMT3 1 0.000000 0.000000 1.000000 0.00000 *REMARK 500 *REMARK 500 GEOMETRY AND STEREOCHEMISTRY *REMARK 500 SUBTOPIC: COVALENT BOND ANGLES *REMARK 500 *REMARK 500 THE STEREOCHEMICAL PARAMETERS OF THE FOLLOWING RESIDUES *REMARK 500 HAVE VALUES WHICH DEVIATE FROM EXPECTED VALUES BY MORE *REMARK 500 THAN 6*RMSD (M=MODEL NUMBER; RES=RESIDUE NAME; C=CHAIN *REMARK 500 IDENTIFIER; SSEQ=SEQUENCE NUMBER; I=INSERTION CODE). *REMARK 500 *REMARK 500 STANDARD TABLE: *REMARK 500 FORMAT: (10X,I3,1X,A3,1X,A1,I4,A1,3(1X,A4,2X),12X,F5.1) *REMARK 500 *REMARK 500 EXPECTED VALUES PROTEIN: ENGH AND HUBER, 1999 *REMARK 500 EXPECTED VALUES NUCLEIC ACID: CLOWNEY ET AL 1996 *REMARK 500 *REMARK 500 M RES CSSEQI ATM1 ATM2 ATM3 *REMARK 500 PHE A 12 CB - CG - CD1 ANGL. DEV. = -5.2 DEGREES *REMARK 500 ASP A 83 CB - CG - OD1 ANGL. DEV. = 6.3 DEGREES *REMARK 500 ALA A 82 O - C - N ANGL. DEV. = 9.9 DEGREES *REMARK 500 LEU B 16 O - C - N ANGL. DEV. = 10.2 DEGREES *REMARK 500 THR B 24 N - CA - CB ANGL. DEV. = -12.9 DEGREES *REMARK 500 THR B 24 C - N - CA ANGL. DEV. = 43.2 DEGREES *REMARK 500 LEU B 25 O - C - N ANGL. DEV. = 10.4 DEGREES *REMARK 500 ASP B 27 CB - CG - OD1 ANGL. DEV. = 6.8 DEGREES *REMARK 500 ASP B 32 CB - CG - OD1 ANGL. DEV. = 9.4 DEGREES *REMARK 500 PHE B 33 CB - CG - CD2 ANGL. DEV. = -6.4 DEGREES *REMARK 500 PHE B 33 CB - CG - CD1 ANGL. DEV. = 5.3 DEGREES *REMARK 500 ARG B 46 NE - CZ - NH1 ANGL. DEV. = 3.1 DEGREES *REMARK 500 ARG B 46 NE - CZ - NH2 ANGL. DEV. = -3.1 DEGREES *REMARK 500 ALA B 51 O - C - N ANGL. DEV. = 15.8 DEGREES *REMARK 500 LEU B 55 O - C - N ANGL. DEV. = 15.9 DEGREES *REMARK 500 PHE B 76 CB - CG - CD2 ANGL. DEV. = -5.5 DEGREES *REMARK 500 ASP B 105 CB - CG - OD1 ANGL. DEV. = 5.6 DEGREES *REMARK 500 GLU B 137 CB - CA - C ANGL. DEV. = -14.5 DEGREES *REMARK 500 *REMARK 500 REMARK: NULL *REMARK 500 *REMARK 500 GEOMETRY AND STEREOCHEMISTRY *REMARK 500 SUBTOPIC: TORSION ANGLES *REMARK 500 *REMARK 500 TORSION ANGLES OUTSIDE THE EXPECTED RAMACHANDRAN REGIONS: *REMARK 500 (M=MODEL NUMBER; RES=RESIDUE NAME; C=CHAIN IDENTIFIER; *REMARK 500 SSEQ=SEQUENCE NUMBER; I=INSERTION CODE). *REMARK 500 *REMARK 500 STANDARD TABLE: *REMARK 500 FORMAT:(10X,I3,1X,A3,1X,A1,I4,A1,4X,F7.2,3X,F7.2) *REMARK 500 *REMARK 500 EXPECTED VALUES: GJ KLEYWEGT AND TA JONES (1996). PHI/PSI- *REMARK 500 CHOLOGY: RAMACHANDRAN REVISITED. STRUCTURE 4, 1395 - 1400 *REMARK 500 *REMARK 500 M RES CSSEQI PSI PHI *REMARK 500 MET B 23 -155.47 -93.50 *REMARK 500 LYS B 44 -18.54 -143.19 *REMARK 500 ASN B 60 35.79 76.70 *REMARK 500 *REMARK 500 REMARK: NULL *REMARK 500 *REMARK 500 GEOMETRY AND STEREOCHEMISTRY *REMARK 500 SUBTOPIC: NON-CIS, NON-TRANS *REMARK 500 *REMARK 500 THE FOLLOWING PEPTIDE BONDS DEVIATE SIGNIFICANTLY FROM BOTH *REMARK 500 CIS AND TRANS CONFORMATION. CIS BONDS, IF ANY, ARE LISTED *REMARK 500 ON CISPEP RECORDS. TRANS IS DEFINED AS 180 +/- 30 AND *REMARK 500 CIS IS DEFINED AS 0 +/- 30 DEGREES. *REMARK 500 MODEL OMEGA *REMARK 500 THR B 24 LEU B 25 -141.54 *REMARK 500 *REMARK 500 REMARK: NULL *REMARK 525 *REMARK 525 SOLVENT *REMARK 525 *REMARK 525 THE SOLVENT MOLECULES HAVE CHAIN IDENTIFIERS THAT *REMARK 525 INDICATE THE POLYMER CHAIN WITH WHICH THEY ARE MOST *REMARK 525 CLOSELY ASSOCIATED. THE REMARK LISTS ALL THE SOLVENT *REMARK 525 MOLECULES WHICH ARE MORE THAN 5A AWAY FROM THE *REMARK 525 NEAREST POLYMER CHAIN (M = MODEL NUMBER; *REMARK 525 RES=RESIDUE NAME; C=CHAIN IDENTIFIER; SSEQ=SEQUENCE *REMARK 525 NUMBER; I=INSERTION CODE): *REMARK 525 *REMARK 525 M RES CSSEQI *REMARK 525 HOH A 391 DISTANCE = 6.84 ANGSTROMS *REMARK 800 *REMARK 800 SITE *REMARK 800 SITE_IDENTIFIER: AC1 *REMARK 800 EVIDENCE_CODE: SOFTWARE *REMARK 800 SITE_DESCRIPTION: BINDING SITE FOR RESIDUE BOM A 300 *REMARK 800 SITE_IDENTIFIER: AC2 *REMARK 800 EVIDENCE_CODE: SOFTWARE *REMARK 800 SITE_DESCRIPTION: BINDING SITE FOR RESIDUE BOM B 400 *DBREF 1DQE A 1 137 UNP P34174 PBP_BOMMO 23 159 *DBREF 1DQE B 1 137 UNP P34174 PBP_BOMMO 23 159 *SEQRES 1 A 137 SER GLN GLU VAL MET LYS ASN LEU SER LEU ASN PHE GLY *SEQRES 2 A 137 LYS ALA LEU ASP GLU CYS LYS LYS GLU MET THR LEU THR *SEQRES 3 A 137 ASP ALA ILE ASN GLU ASP PHE TYR ASN PHE TRP LYS GLU *SEQRES 4 A 137 GLY TYR GLU ILE LYS ASN ARG GLU THR GLY CYS ALA ILE *SEQRES 5 A 137 MET CYS LEU SER THR LYS LEU ASN MET LEU ASP PRO GLU *SEQRES 6 A 137 GLY ASN LEU HIS HIS GLY ASN ALA MET GLU PHE ALA LYS *SEQRES 7 A 137 LYS HIS GLY ALA ASP GLU THR MET ALA GLN GLN LEU ILE *SEQRES 8 A 137 ASP ILE VAL HIS GLY CYS GLU LYS SER THR PRO ALA ASN *SEQRES 9 A 137 ASP ASP LYS CYS ILE TRP THR LEU GLY VAL ALA THR CYS *SEQRES 10 A 137 PHE LYS ALA GLU ILE HIS LYS LEU ASN TRP ALA PRO SER *SEQRES 11 A 137 MET ASP VAL ALA VAL GLY GLU *SEQRES 1 B 137 SER GLN GLU VAL MET LYS ASN LEU SER LEU ASN PHE GLY *SEQRES 2 B 137 LYS ALA LEU ASP GLU CYS LYS LYS GLU MET THR LEU THR *SEQRES 3 B 137 ASP ALA ILE ASN GLU ASP PHE TYR ASN PHE TRP LYS GLU *SEQRES 4 B 137 GLY TYR GLU ILE LYS ASN ARG GLU THR GLY CYS ALA ILE *SEQRES 5 B 137 MET CYS LEU SER THR LYS LEU ASN MET LEU ASP PRO GLU *SEQRES 6 B 137 GLY ASN LEU HIS HIS GLY ASN ALA MET GLU PHE ALA LYS *SEQRES 7 B 137 LYS HIS GLY ALA ASP GLU THR MET ALA GLN GLN LEU ILE *SEQRES 8 B 137 ASP ILE VAL HIS GLY CYS GLU LYS SER THR PRO ALA ASN *SEQRES 9 B 137 ASP ASP LYS CYS ILE TRP THR LEU GLY VAL ALA THR CYS *SEQRES 10 B 137 PHE LYS ALA GLU ILE HIS LYS LEU ASN TRP ALA PRO SER *SEQRES 11 B 137 MET ASP VAL ALA VAL GLY GLU *HET BOM A 300 17 *HET BOM B 400 17 *HETNAM BOM HEXADECA-10,12-DIEN-1-OL *HETSYN BOM BOMBYKOL *FORMUL 3 BOM 2(C16 H30 O) *FORMUL 5 HOH *203(H2 O) *HELIX 1 1 SER A 1 LYS A 14 1 14 *HELIX 2 2 ALA A 15 MET A 23 1 9 *HELIX 3 3 ALA A 28 ASN A 35 1 8 *HELIX 4 4 ASN A 45 LEU A 59 1 15 *HELIX 5 5 HIS A 69 HIS A 80 1 12 *HELIX 6 6 ASP A 83 THR A 101 1 19 *HELIX 7 7 ASP A 106 LEU A 125 1 20 *HELIX 8 8 SER B 1 GLY B 13 1 13 *HELIX 9 9 ALA B 15 MET B 23 1 9 *HELIX 10 10 THR B 26 ALA B 28 5 3 *HELIX 11 11 ILE B 29 ASN B 35 1 7 *HELIX 12 12 ASN B 45 LEU B 59 1 15 *HELIX 13 13 HIS B 69 HIS B 80 1 12 *HELIX 14 14 ASP B 83 THR B 101 1 19 *HELIX 15 15 ASP B 106 LEU B 125 1 20 *SSBOND 1 CYS A 19 CYS A 54 1555 1555 2.12 *SSBOND 2 CYS A 50 CYS A 108 1555 1555 2.11 *SSBOND 3 CYS A 97 CYS A 117 1555 1555 2.13 *SSBOND 4 CYS B 19 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ASP* 32) -5.45379520 +1 1.89534598 +1 -9.59342964 +1 0.0014 C( 244 ASP* 32) -5.60107499 +1 0.78528603 +1 -8.53027597 +1 0.5179 O( 245 ASP* 32) -4.67874131 +1 0.01290277 +1 -8.30111447 +1 -0.5575 C( 246 ASP 32) -4.99446354 +1 3.15196517 +1 -8.84172083 +1 -0.4461 C( 247 ASP 32) -4.38087046 +1 4.14441277 +1 -9.77316435 +1 0.6789 O( 248 ASP 32) -3.76274905 +1 3.96175960 +1 -10.79449558 +1 -0.4933 O( 249 ASP 32) -4.50450356 +1 5.46739526 +1 -9.39329307 +1 -0.6308 N( 250 PHE* 33) -6.77846253 +1 0.75855867 +1 -7.81215913 +1 -0.4888 C( 251 PHE* 33) -6.97514138 +1 -0.24760955 +1 -6.74298062 +1 0.0023 C( 252 PHE* 33) -7.23491857 +1 -1.64003997 +1 -7.35841953 +1 0.5549 O( 253 PHE* 33) -6.58880169 +1 -2.62147956 +1 -6.98557337 +1 -0.6375 C( 254 PHE 33) -8.09843135 +1 0.21280511 +1 -5.80884711 +1 -0.4022 C( 255 PHE 33) -7.54646290 +1 1.24204301 +1 -4.86161533 +1 0.1181 C( 256 PHE 33) -7.45551066 +1 2.59906512 +1 -5.20783219 +1 -0.1850 C( 257 PHE 33) -7.02716189 +1 0.80092003 +1 -3.63393485 +1 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360 LYS* 44) -2.03516761 +1 9.32672090 +1 -11.62392815 +1 -0.5571 C( 361 LYS 44) -1.67393552 +1 6.73499958 +1 -13.23598287 +1 -0.2885 C( 362 LYS 44) -2.97226239 +1 5.96053632 +1 -13.47446223 +1 -0.3028 C( 363 LYS 44) -3.24540952 +1 5.71124529 +1 -14.96276142 +1 -0.2553 C( 364 LYS 44) -2.25388473 +1 4.72801140 +1 -15.60798628 +1 -0.1277 N( 365 LYS 44) -2.40796099 +1 3.37192063 +1 -15.00484340 +1 -0.5884 N( 366 ASN* 45) -3.31410798 +1 7.89224406 +1 -10.41503560 +1 -0.5263 C( 367 ASN* 45) -4.25657288 +1 8.96114317 +1 -10.08116659 +1 0.0216 C( 368 ASN* 45) -3.86813702 +1 9.58447566 +1 -8.71909060 +1 0.5403 O( 369 ASN* 45) -3.61511300 +1 8.93610668 +1 -7.70594167 +1 -0.6193 C( 370 ASN 45) -5.69184997 +1 8.43416424 +1 -9.94709383 +1 -0.4796 C( 371 ASN 45) -6.23752503 +1 7.88403950 +1 -11.26278405 +1 0.6566 O( 372 ASN 45) -7.09542935 +1 8.48484069 +1 -11.89548505 +1 -0.5846 N( 373 ASN 45) -5.77015975 +1 6.65239565 +1 -11.66016240 +1 -0.5706 N( 374 ARG* 46) -3.88148969 +1 10.97264982 +1 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CYS*117) 8.86325026 +1 0.52211478 +1 -4.35484154 +1 -0.5879 C( 911 CYS 117) 9.03414344 +1 3.90012314 +1 -3.85952039 +1 -0.3532 S( 912 CYS 117) 10.52871092 +1 3.22299380 +1 -3.11799743 +1 -0.0119 N( 913 PHE*118) 7.16154506 +1 1.45481363 +1 -3.15937784 +1 -0.5305 C( 914 PHE*118) 6.85019113 +1 0.21427256 +1 -2.41328003 +1 0.0145 C( 915 PHE*118) 6.48087291 +1 -0.91697404 +1 -3.40363678 +1 0.5829 O( 916 PHE*118) 7.02255627 +1 -2.01627494 +1 -3.34265281 +1 -0.6224 C( 917 PHE 118) 5.67879156 +1 0.48769331 +1 -1.45173733 +1 -0.3672 C( 918 PHE 118) 5.25337260 +1 -0.74976379 +1 -0.71396557 +1 0.0766 C( 919 PHE 118) 5.98261764 +1 -1.19290819 +1 0.39647142 +1 -0.2134 C( 920 PHE 118) 4.12471848 +1 -1.47211259 +1 -1.13755084 +1 -0.1631 C( 921 PHE 118) 5.57284611 +1 -2.33311936 +1 1.09438003 +1 -0.1106 C( 922 PHE 118) 3.70924758 +1 -2.59879860 +1 -0.42530887 +1 -0.1535 C( 923 PHE 118) 4.43211952 +1 -3.03304112 +1 0.69132284 +1 -0.1611 N( 924 LYS*119) 5.53168717 +1 -0.59697233 +1 -4.35295809 +1 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+1 -11.43606145 +1 -6.61391621 +1 0.0170 C( 984 ASN*126) 7.43749315 +1 -11.71026130 +1 -5.48399566 +1 0.5693 O( 985 ASN*126) 6.93199063 +1 -12.82211259 +1 -5.28008719 +1 -0.6744 C( 986 ASN 126) 9.05536219 +1 -12.75623096 +1 -7.11798210 +1 -0.4154 C( 987 ASN 126) 8.04273451 +1 -13.61211293 +1 -7.85093785 +1 0.6326 O( 988 ASN 126) 7.93751285 +1 -14.82450292 +1 -7.69146817 +1 -0.6077 N( 989 ASN 126) 7.19414934 +1 -12.95500676 +1 -8.72664910 +1 -0.5911 N( 990 TRP*127) 7.04330371 +1 -10.63115489 +1 -4.73128630 +1 -0.4628 C( 991 TRP*127) 6.00127236 +1 -10.77656802 +1 -3.69738218 +1 0.0301 C( 992 TRP*127) 4.65305599 +1 -10.18470733 +1 -4.17504300 +1 0.5224 O( 993 TRP*127) 3.69931406 +1 -10.13462263 +1 -3.39815845 +1 -0.6197 C( 994 TRP 127) 6.43585285 +1 -10.07143505 +1 -2.40388694 +1 -0.3178 C( 995 TRP 127) 7.52910163 +1 -10.75835266 +1 -1.67119261 +1 -0.0547 C( 996 TRP 127) 8.21832924 +1 -11.91546496 +1 -2.00595185 +1 -0.1055 C( 997 TRP 127) 8.03879375 +1 -10.30859519 +1 -0.39557929 +1 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55) -6.02214386 +1 2.00353181 +1 3.76944713 +1 0.1958 H( 1612 LEU 55) -7.65363913 +1 4.01167694 +1 2.05635491 +1 0.1353 H( 1613 LEU 55) -6.03817411 +1 2.83022546 +1 0.60006118 +1 0.1383 H( 1614 LEU 55) -6.46399606 +1 1.26099008 +1 1.29937287 +1 0.1523 H( 1615 LEU 55) -7.64875874 +1 2.15660059 +1 0.33260111 +1 0.1492 H( 1616 LEU 55) -8.31209137 +1 1.23328203 +1 3.27596390 +1 0.1882 H( 1617 LEU 55) -9.37424647 +1 2.13399758 +1 2.16896660 +1 0.1466 H( 1618 LEU 55) -8.99962848 +1 2.78352821 +1 3.76155275 +1 0.1546 H( 1619 SER* 56) -4.18027400 +1 4.91711556 +1 4.63815380 +1 0.3070 H( 1620 SER* 56) -3.07045373 +1 3.12266895 +1 6.62707605 +1 0.1904 H( 1621 SER 56) -1.14211019 +1 4.77024532 +1 6.65249655 +1 0.1595 H( 1622 SER 56) -2.12369928 +1 5.96992679 +1 5.70182147 +1 0.1533 H( 1623 SER 56) -2.13229571 +1 4.29310246 +1 4.01582494 +1 0.3364 H( 1624 THR* 57) -4.46748395 +1 6.51696779 +1 6.77300853 +1 0.3148 H( 1625 THR* 57) -3.69691110 +1 7.07733359 +1 9.54635759 +1 0.2101 H( 1626 THR 57) 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179) 16.35261390 +1 -3.42546200 +1 9.33776138 +1 0.3244 H( 2337 HOH 180) 9.48331617 +1 -2.15781914 +1 -10.53828018 +1 0.3494 H( 2338 HOH 180) 8.83878957 +1 -2.25673718 +1 -11.93784751 +1 0.3224 H( 2339 HOH 181) -8.42086440 +1 6.12139829 +1 -12.98665771 +1 0.3455 H( 2340 HOH 181) -8.10323540 +1 5.16017516 +1 -14.17277246 +1 0.3382 H( 2341 HOH 182) 11.47834271 +1 -11.12224598 +1 -10.07926003 +1 0.3124 H( 2342 HOH 182) 10.18370247 +1 -11.42753541 +1 -10.85337787 +1 0.3277 H( 2343 HOH 183) 14.45108643 +1 0.36330519 +1 3.87873371 +1 0.3318 H( 2344 HOH 183) 15.17394976 +1 1.12951899 +1 4.99373026 +1 0.3166 H( 2345 HOH 184) -9.64641475 +1 -2.52463329 +1 7.89598000 +1 0.3623 H( 2346 HOH 184) -11.08256694 +1 -2.02232271 +1 7.57041087 +1 0.3204 H( 2347 HOH 185) -1.11684942 +1 -14.40582674 +1 -4.06820692 +1 0.3187 H( 2348 HOH 185) -2.28216605 +1 -15.36362801 +1 -3.83064267 +1 0.3389 H( 2349 HOH 186) -8.11912079 +1 -8.51702010 +1 -9.30978398 +1 0.3564 H( 2350 HOH 186) -7.79715344 +1 -10.04230988 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