133 alpha Glycine
(Previous) Cholesteryl acetate (CHOLAD04)
(Back) Elements:
N 1
C 2
O 2
H 5
(Z = 16)
(Periodic Table)
(Next) beta Glycine
Unit Cell Parameters: a b c alpha beta gamma Volume Density Heat of Formation (Kcal/mol)
X-ray: 5.10 5.46 11.97 90.00 90.00 68.30 309.77 1.610 -97.9 calc'd using PM7
PM7: 4.98 5.34 11.61 89.28 89.57 66.00 281.69 1.770 -133.6 calc'd using PM7 (ref: -126.3)
PM6: 5.09 5.50 10.77 90.10 90.06 69.58 282.55 1.765 -122.9 calc'd using PM6
X-Ray PM7 PM6
X-Ray data set:
MERS=(2,2,1) 1SCF
alpha_glycLR_p1_8
h=-126.3 hr=crc
N 0.00000000 +1 0.00000000 +1 0.00000000 +1
C -1.12000000 +1 0.45000000 +1 2.21100000 +1
C -1.07800000 +1 0.72400000 +1 0.70900000 +1
O -0.11000000 +1 0.20600000 +1 2.75200000 +1
O -2.17700000 +1 0.52100000 +1 2.72900000 +1
H -0.08400000 +1 0.12100000 +1 -1.06200000 +1
H 0.96800000 +1 0.30800000 +1 0.29300000 +1
H -0.07500000 +1 -1.01500000 +1 0.21000000 +1
H -0.94100000 +1 1.79700000 +1 0.54900000 +1
H -2.03000000 +1 0.44400000 +1 0.25800000 +1
C 0.70800000 +1 -5.53600000 +1 -1.95000000 +1
C 0.66600000 +1 -5.26200000 +1 -0.44800000 +1
N -0.41200000 +1 -5.98600000 +1 0.26100000 +1
O -0.30200000 +1 -5.78000000 +1 -2.49100000 +1
O 1.76600000 +1 -5.46400000 +1 -2.46800000 +1
H -0.32800000 +1 -5.86400000 +1 1.32300000 +1
H -1.38000000 +1 -5.67800000 +1 -0.03200000 +1
H -0.33600000 +1 -7.00100000 +1 0.05100000 +1
H 0.52900000 +1 -4.18800000 +1 -0.28800000 +1
H 1.61800000 +1 -5.54200000 +1 0.00300000 +1
C -1.66300000 +1 -2.50400000 +1 1.72300000 +1
C -1.70500000 +1 -2.77800000 +1 3.22500000 +1
N -2.78300000 +1 -2.05400000 +1 3.93400000 +1
O -2.67300000 +1 -2.26000000 +1 1.18200000 +1
O -0.60500000 +1 -2.57500000 +1 1.20500000 +1
H -2.69800000 +1 -2.17500000 +1 4.99600000 +1
H -3.75100000 +1 -2.36200000 +1 3.64100000 +1
H -2.70700000 +1 -1.03900000 +1 3.72400000 +1
H -1.84200000 +1 -3.85200000 +1 3.38500000 +1
H -0.75300000 +1 -2.49800000 +1 3.67600000 +1
C 1.25100000 +1 3.48200000 +1 -1.46100000 +1
C 1.29200000 +1 3.20700000 +1 -2.96300000 +1
N 2.37100000 +1 3.93200000 +1 -3.67200000 +1
O 2.26000000 +1 3.72500000 +1 -0.92000000 +1
O 0.19300000 +1 3.41000000 +1 -0.94300000 +1
H 2.28600000 +1 3.81000000 +1 -4.73400000 +1
H 3.33800000 +1 3.62300000 +1 -3.37900000 +1
H 2.29500000 +1 4.94700000 +1 -3.46200000 +1
H 1.42900000 +1 2.13400000 +1 -3.12300000 +1
H 0.34000000 +1 3.48800000 +1 -3.41400000 +1
N -4.74100000 +1 0.00000000 +1 1.88700000 +1
C -5.86100000 +1 0.45000000 +1 4.09800000 +1
C -5.81900000 +1 0.72400000 +1 2.59600000 +1
O -4.85100000 +1 0.20600000 +1 4.63900000 +1
O -6.91800000 +1 0.52100000 +1 4.61600000 +1
H -4.82500000 +1 0.12100000 +1 0.82500000 +1
H -3.77300000 +1 0.30800000 +1 2.18000000 +1
H -4.81600000 +1 -1.01500000 +1 2.09700000 +1
H -5.68200000 +1 1.79700000 +1 2.43600000 +1
H -6.77100000 +1 0.44400000 +1 2.14500000 +1
C -4.03300000 +1 -5.53600000 +1 -0.06300000 +1
C -4.07500000 +1 -5.26200000 +1 1.43900000 +1
N -5.15300000 +1 -5.98600000 +1 2.14800000 +1
O -5.04300000 +1 -5.78000000 +1 -0.60400000 +1
O -2.97500000 +1 -5.46400000 +1 -0.58100000 +1
H -5.06900000 +1 -5.86400000 +1 3.21000000 +1
H -6.12100000 +1 -5.67800000 +1 1.85500000 +1
H -5.07700000 +1 -7.00100000 +1 1.93800000 +1
H -4.21200000 +1 -4.18800000 +1 1.59900000 +1
H -3.12300000 +1 -5.54200000 +1 1.89000000 +1
C -6.40400000 +1 -2.50400000 +1 3.61000000 +1
C -6.44600000 +1 -2.77800000 +1 5.11200000 +1
N -7.52400000 +1 -2.05400000 +1 5.82100000 +1
O -7.41400000 +1 -2.26000000 +1 3.06900000 +1
O -5.34600000 +1 -2.57500000 +1 3.09200000 +1
H -7.43900000 +1 -2.17500000 +1 6.88300000 +1
H -8.49200000 +1 -2.36200000 +1 5.52800000 +1
H -7.44800000 +1 -1.03900000 +1 5.61100000 +1
H -6.58300000 +1 -3.85200000 +1 5.27200000 +1
H -5.49400000 +1 -2.49800000 +1 5.56300000 +1
C -3.49000000 +1 3.48200000 +1 0.42600000 +1
C -3.44900000 +1 3.20700000 +1 -1.07600000 +1
N -2.37000000 +1 3.93200000 +1 -1.78500000 +1
O -2.48100000 +1 3.72500000 +1 0.96700000 +1
O -4.54800000 +1 3.41000000 +1 0.94400000 +1
H -2.45500000 +1 3.81000000 +1 -2.84700000 +1
H -1.40300000 +1 3.62300000 +1 -1.49200000 +1
H -2.44600000 +1 4.94700000 +1 -1.57500000 +1
H -3.31200000 +1 2.13400000 +1 -1.23600000 +1
H -4.40100000 +1 3.48800000 +1 -1.52700000 +1
N 0.00000000 +1 0.00000000 +1 5.45800000 +1
C -1.12000000 +1 0.45000000 +1 7.66900000 +1
C -1.07800000 +1 0.72400000 +1 6.16700000 +1
O -0.11000000 +1 0.20600000 +1 8.21000000 +1
O -2.17700000 +1 0.52100000 +1 8.18700000 +1
H -0.08400000 +1 0.12100000 +1 4.39600000 +1
H 0.96800000 +1 0.30800000 +1 5.75100000 +1
H -0.07500000 +1 -1.01500000 +1 5.66800000 +1
H -0.94100000 +1 1.79700000 +1 6.00700000 +1
H -2.03000000 +1 0.44400000 +1 5.71600000 +1
C 0.70800000 +1 -5.53600000 +1 3.50800000 +1
C 0.66600000 +1 -5.26200000 +1 5.01000000 +1
N -0.41200000 +1 -5.98600000 +1 5.71900000 +1
O -0.30200000 +1 -5.78000000 +1 2.96700000 +1
O 1.76600000 +1 -5.46400000 +1 2.99000000 +1
H -0.32800000 +1 -5.86400000 +1 6.78100000 +1
H -1.38000000 +1 -5.67800000 +1 5.42600000 +1
H -0.33600000 +1 -7.00100000 +1 5.50900000 +1
H 0.52900000 +1 -4.18800000 +1 5.17000000 +1
H 1.61800000 +1 -5.54200000 +1 5.46100000 +1
C -1.66300000 +1 -2.50400000 +1 7.18100000 +1
C -1.70500000 +1 -2.77800000 +1 8.68300000 +1
N -2.78300000 +1 -2.05400000 +1 9.39200000 +1
O -2.67300000 +1 -2.26000000 +1 6.64000000 +1
O -0.60500000 +1 -2.57500000 +1 6.66300000 +1
H -2.69800000 +1 -2.17500000 +1 10.45400000 +1
H -3.75100000 +1 -2.36200000 +1 9.09900000 +1
H -2.70700000 +1 -1.03900000 +1 9.18200000 +1
H -1.84200000 +1 -3.85200000 +1 8.84300000 +1
H -0.75300000 +1 -2.49800000 +1 9.13400000 +1
C 1.25100000 +1 3.48200000 +1 3.99700000 +1
C 1.29200000 +1 3.20700000 +1 2.49500000 +1
N 2.37100000 +1 3.93200000 +1 1.78600000 +1
O 2.26000000 +1 3.72500000 +1 4.53800000 +1
O 0.19300000 +1 3.41000000 +1 4.51500000 +1
H 2.28600000 +1 3.81000000 +1 0.72400000 +1
H 3.33800000 +1 3.62300000 +1 2.07900000 +1
H 2.29500000 +1 4.94700000 +1 1.99600000 +1
H 1.42900000 +1 2.13400000 +1 2.33500000 +1
H 0.34000000 +1 3.48800000 +1 2.04400000 +1
N -4.74100000 +1 0.00000000 +1 7.34500000 +1
C -5.86100000 +1 0.45000000 +1 9.55600000 +1
C -5.81900000 +1 0.72400000 +1 8.05400000 +1
O -4.85100000 +1 0.20600000 +1 10.09700000 +1
O -6.91800000 +1 0.52100000 +1 10.07400000 +1
H -4.82500000 +1 0.12100000 +1 6.28300000 +1
H -3.77300000 +1 0.30800000 +1 7.63800000 +1
H -4.81600000 +1 -1.01500000 +1 7.55500000 +1
H -5.68200000 +1 1.79700000 +1 7.89400000 +1
H -6.77100000 +1 0.44400000 +1 7.60300000 +1
C -4.03300000 +1 -5.53600000 +1 5.39500000 +1
C -4.07500000 +1 -5.26200000 +1 6.89700000 +1
N -5.15300000 +1 -5.98600000 +1 7.60600000 +1
O -5.04300000 +1 -5.78000000 +1 4.85400000 +1
O -2.97500000 +1 -5.46400000 +1 4.87700000 +1
H -5.06900000 +1 -5.86400000 +1 8.66800000 +1
H -6.12100000 +1 -5.67800000 +1 7.31300000 +1
H -5.07700000 +1 -7.00100000 +1 7.39600000 +1
H -4.21200000 +1 -4.18800000 +1 7.05700000 +1
H -3.12300000 +1 -5.54200000 +1 7.34800000 +1
C -6.40400000 +1 -2.50400000 +1 9.06800000 +1
C -6.44600000 +1 -2.77800000 +1 10.57000000 +1
N -7.52400000 +1 -2.05400000 +1 11.27900000 +1
O -7.41400000 +1 -2.26000000 +1 8.52700000 +1
O -5.34600000 +1 -2.57500000 +1 8.55000000 +1
H -7.43900000 +1 -2.17500000 +1 12.34100000 +1
H -8.49200000 +1 -2.36200000 +1 10.98600000 +1
H -7.44800000 +1 -1.03900000 +1 11.06900000 +1
H -6.58300000 +1 -3.85200000 +1 10.73000000 +1
H -5.49400000 +1 -2.49800000 +1 11.02100000 +1
C -3.49000000 +1 3.48200000 +1 5.88400000 +1
C -3.44900000 +1 3.20700000 +1 4.38200000 +1
N -2.37000000 +1 3.93200000 +1 3.67300000 +1
O -2.48100000 +1 3.72500000 +1 6.42500000 +1
O -4.54800000 +1 3.41000000 +1 6.40200000 +1
H -2.45500000 +1 3.81000000 +1 2.61100000 +1
H -1.40300000 +1 3.62300000 +1 3.96600000 +1
H -2.44600000 +1 4.94700000 +1 3.88300000 +1
H -3.31200000 +1 2.13400000 +1 4.22200000 +1
H -4.40100000 +1 3.48800000 +1 3.93100000 +1
Tv -9.48200000 +1 0.00000000 +1 3.77400000 +1
Tv 0.00000000 +1 0.00000000 +1 10.91600000 +1
Tv 0.00000000 +1 11.97100000 +1 0.00000000 +1
Optimized PM7 data set:
MERS=(2,2,1) GNORM=4
alpha_glycLR_p1_8
h=-126.3 hr=crc
N -0.00248391 +1 0.02211764 +1 0.02767926 +1
C -1.07856092 +1 0.45867643 +1 2.19050563 +1
C -1.11965775 +1 0.76411467 +1 0.69353144 +1
O 0.01925999 +1 0.09488816 +1 2.66292819 +1
O -2.11668509 +1 0.57422793 +1 2.86480504 +1
H -0.00581387 +1 0.15459326 +1 -1.02659193 +1
H 0.92460613 +1 0.35964284 +1 0.38431314 +1
H -0.06647852 +1 -0.99319163 +1 0.22989612 +1
H -1.00475365 +1 1.86837882 +1 0.52452197 +1
H -2.09966906 +1 0.49215235 +1 0.23944596 +1
C 0.67551216 +1 -5.36092512 +1 -1.85564735 +1
C 0.71788643 +1 -5.10993265 +1 -0.35056568 +1
N -0.38978327 +1 -5.87219961 +1 0.30987986 +1
O -0.42227689 +1 -5.70753106 +1 -2.34427076 +1
O 1.70883592 +1 -5.21190826 +1 -2.52993468 +1
H -0.37124906 +1 -5.76087996 +1 1.35125831 +1
H -1.32595657 +1 -5.55801993 +1 -0.04709077 +1
H -0.31348539 +1 -6.88713685 +1 0.07506854 +1
H 0.60470455 +1 -4.01075383 +1 -0.14798621 +1
H 1.70142066 +1 -5.40407448 +1 0.08000360 +1
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