476 VI (UJIRIO01)
(Previous) Methionine (LMETON02)
(Back) Elements:
N 3
H 11
C 11
S 1
O 2
(Z = 4)
(Periodic Table)
(Next) ROY (QAXMEH)
This is one of the solids used in the blind tests of crystal structure prediction.
See: "Significant progress in predicting the crystal structures of small organic molecules – a report on the fourth blind test", Acta Crys. B 865, 107-125 (2009), and
"Towards crystal structure prediction of complex organic compounds - a report on the fifth blind test", Bardwell, et. al Acta Cryst. (2011). B67, 535-551
The complete set consists of 22 solids.
Unit Cell Parameters: a b c alpha beta gamma Volume Density Heat of Formation (Kcal/mol)
X-ray: 8.54 15.15 9.06 90.00 90.00 91.49 1173.09 1.411 77.7 calc'd using PM7
PM7: 8.53 15.42 9.23 89.30 89.96 90.63 1213.30 1.365 -66.8 calc'd using PM7
PM6: 8.58 15.18 9.07 90.01 90.26 91.41 1181.51 1.401 -40.1 calc'd using PM6
X-Ray PM7 PM6
For X-Ray structure, contact the CCDC: http://www.ccdc.cam.ac.uk/
Optimized PM7 data set:
MERS=(1,1,1) GNORM=4
VI (UJIRIO01)
N 0.00277886 +1 -0.04382319 +1 0.00988383 +1
H -0.14812547 +1 2.61838081 +1 4.87742652 +1
C 1.22358997 +1 1.53838279 +1 3.69042488 +1
C 2.06128088 +1 1.60841949 +1 2.54295109 +1
H 2.60768123 +1 0.72708860 +1 2.22834857 +1
C 2.14611226 +1 2.77780328 +1 1.80819374 +1
H 2.78313282 +1 2.82141838 +1 0.91623969 +1
C 1.43774113 +1 3.90770631 +1 2.19553236 +1
H 1.48700917 +1 4.82666369 +1 1.61952176 +1
C 0.61675651 +1 3.86051331 +1 3.34196315 +1
N -0.10888900 +1 4.92042665 +1 3.78164106 +1
H -0.55769435 +1 4.91990795 +1 4.68841325 +1
H -0.01117743 +1 5.81558484 +1 3.30751698 +1
N 1.01810631 +1 0.53039545 +1 4.53380385 +1
S 1.53923544 +1 -1.05087101 +1 4.29784947 +1
O 1.12002657 +1 -1.57404543 +1 3.00547676 +1
O 1.06469746 +1 -1.82449620 +1 5.45365964 +1
C 3.28612109 +1 -1.02110691 +1 4.33264506 +1
C 3.99044123 +1 -0.06615046 +1 5.06375853 +1
H 3.47908958 +1 0.73280746 +1 5.61039651 +1
C 5.38150300 +1 -0.11890622 +1 5.10361539 +1
H 5.94935609 +1 0.62795577 +1 5.66438295 +1
C 6.05129876 +1 -1.13104758 +1 4.41792089 +1
H 7.13752444 +1 -1.18803132 +1 4.46853280 +1
C 5.34800929 +1 -2.06878437 +1 3.66513023 +1
H 5.88622443 +1 -2.84292708 +1 3.11028977 +1
C 3.95933297 +1 -2.00733326 +1 3.61589002 +1
H 3.40709090 +1 -2.73724966 +1 3.01139650 +1
N 0.51828799 +1 2.68788373 +1 4.07347214 +1
N 0.71676232 +1 -2.36153166 +1 -3.50035686 +1
H 0.04683164 +1 -2.29231429 +1 -2.69495088 +1
C 1.42157787 +1 -1.21434732 +1 -3.88642765 +1
C 2.25914153 +1 -1.28238915 +1 -5.03439131 +1
H 2.80556523 +1 -0.40069349 +1 -5.34883090 +1
C 2.34405040 +1 -2.45264518 +1 -5.76698922 +1
H 2.98291360 +1 -2.49726990 +1 -6.65733407 +1
C 1.63401625 +1 -3.58153333 +1 -5.37992792 +1
H 1.68506451 +1 -4.50024104 +1 -5.95498831 +1
C 0.81424467 +1 -3.53481002 +1 -4.23145179 +1
N 0.09091843 +1 -4.59536508 +1 -3.78795020 +1
H -0.36235082 +1 -4.58624339 +1 -2.88167192 +1
H 0.18476390 +1 -5.49034259 +1 -4.26475593 +1
N 1.22049966 +1 -0.19743021 +1 -3.05201316 +1
S 1.75047487 +1 1.37904974 +1 -3.30161093 +1
O 1.31943135 +1 1.89564697 +1 -4.59288858 +1
O 1.29181865 +1 2.15979313 +1 -2.14607976 +1
C 3.48863800 +1 1.35379091 +1 -3.25173688 +1
C 4.18771109 +1 0.39748867 +1 -2.51242111 +1
H 3.67099121 +1 -0.39928065 +1 -1.96549281 +1
C 5.57831890 +1 0.44967449 +1 -2.47242792 +1
H 6.14364286 +1 -0.29838277 +1 -1.90935297 +1
C 6.24794823 +1 1.46151946 +1 -3.16157901 +1
H 7.33405288 +1 1.51474075 +1 -3.11211863 +1
C 5.54784664 +1 2.40151370 +1 -3.91372739 +1
H 6.08655924 +1 3.17238893 +1 -4.47039287 +1
C 4.15944417 +1 2.34431123 +1 -3.96177672 +1
H 3.60965124 +1 3.07250341 +1 -4.56913765 +1
N -0.66615311 +1 2.17364765 +1 -0.29682595 +1
H 0.01496858 +1 2.25127592 +1 -1.09553204 +1
C -1.36623727 +1 3.32211083 +1 0.08985266 +1
C -2.20068320 +1 3.25124808 +1 1.23983174 +1
H -2.74770715 +1 4.13145373 +1 1.55543512 +1
C -2.28373998 +1 2.07869246 +1 1.96959429 +1
H -2.92181660 +1 2.03204022 +1 2.85978762 +1
C -1.57319312 +1 0.95029865 +1 1.58193907 +1
H -1.62036035 +1 0.03049800 +1 2.15615425 +1
C -0.74857408 +1 1.00456593 +1 0.43921130 +1
H 0.44358082 +1 -0.04041064 +1 -0.90258247 +1
H -0.09647129 +1 -0.94044296 +1 0.47943199 +1
N -1.16466059 +1 4.33466705 +1 -0.74953601 +1
S -1.68265785 +1 5.91242649 +1 -0.50866607 +1
O -1.26522696 +1 6.43717403 +1 0.78299162 +1
O -1.21189122 +1 6.68948216 +1 -1.66538709 +1
C -3.42518920 +1 5.88110144 +1 -0.55404437 +1
C -4.12643855 +1 4.92650245 +1 -1.28769077 +1
H -3.61465917 +1 4.12727199 +1 -1.83492637 +1
C -5.51735855 +1 4.97943535 +1 -1.32746857 +1
H -6.08698186 +1 4.23202304 +1 -1.88668283 +1
C -6.18787051 +1 5.98986946 +1 -0.64207016 +1
H -7.27410797 +1 6.04238727 +1 -0.68763030 +1
C -5.48612416 +1 6.92974902 +1 0.11145261 +1
H -6.02409077 +1 7.70321476 +1 0.66712077 +1
C -4.09803104 +1 6.86886458 +1 0.16083947 +1
H -3.54492170 +1 7.59866649 +1 0.76494473 +1
N -0.45443663 +1 -1.84588491 +1 -7.87450978 +1
H 0.20993600 +1 -1.91824055 +1 -8.68280344 +1
C -1.16252246 +1 -2.99374445 +1 -7.48790234 +1
C -1.99976240 +1 -2.92085312 +1 -6.33737403 +1
H -2.54638437 +1 -3.80362416 +1 -6.02458007 +1
C -2.08282538 +1 -1.75118615 +1 -5.60615373 +1
H -2.72201949 +1 -1.70417270 +1 -4.71517693 +1
C -1.36849352 +1 -0.62312462 +1 -5.99532974 +1
H -1.41982708 +1 0.29505629 +1 -5.41930143 +1
C -0.54462379 +1 -0.67480655 +1 -7.13858741 +1
N 0.20340708 +1 0.37532559 +1 -7.57485408 +1
H 0.63958514 +1 0.36471220 +1 -8.48964458 +1
H 0.10143775 +1 1.27535464 +1 -7.10773218 +1
N -0.96340242 +1 -4.00780793 +1 -8.32106094 +1
S -1.48439675 +1 -5.58997043 +1 -8.08780726 +1
O -1.05844848 +1 -6.10508506 +1 -6.79247288 +1
O -1.00559185 +1 -6.36124245 +1 -9.24059748 +1
C -3.22670481 +1 -5.56184134 +1 -8.13019336 +1
C -3.92852815 +1 -4.60324083 +1 -8.85914241 +1
H -3.41329122 +1 -3.80484609 +1 -9.40490504 +1
C -5.31976222 +1 -4.65420939 +1 -8.89776550 +1
H -5.88680685 +1 -3.90609485 +1 -9.46185237 +1
C -5.98979029 +1 -5.66566633 +1 -8.21112227 +1
H -7.07596285 +1 -5.71946420 +1 -8.26217080 +1
C -5.28871143 +1 -6.60496041 +1 -7.45715322 +1
H -5.82726710 +1 -7.37608160 +1 -6.90073128 +1
C -3.90014803 +1 -6.54796415 +1 -7.41110664 +1
H -3.35141140 +1 -7.27527608 +1 -6.80188558 +1
Tv -8.52640966 +1 0.00383458 +1 -0.14769712 +1
Tv 0.43734483 +1 -0.05380393 +1 -15.41003089 +1
Tv -0.00029713 +1 9.22914305 +1 -0.14554254 +1
Optimized PM6 data set:
MERS=(1,1,1) GNORM=2 PM6
VI (UJIRIO01)
N -0.02071385 +1 -0.09816791 +1 0.05359776 +1
H -0.24017711 +1 2.60791203 +1 4.85813096 +1
C 1.18199598 +1 1.53050363 +1 3.68256263 +1
C 1.99401751 +1 1.60856778 +1 2.51892747 +1
H 2.50993059 +1 0.72000430 +1 2.17125740 +1
C 2.10458449 +1 2.79691397 +1 1.80958860 +1
H 2.73842407 +1 2.84093758 +1 0.91752962 +1
C 1.42543409 +1 3.94088125 +1 2.21806135 +1
H 1.52813512 +1 4.88246904 +1 1.68082227 +1
C 0.56474784 +1 3.88702863 +1 3.33603150 +1
N -0.19531125 +1 4.95890470 +1 3.72532872 +1
H -0.68471204 +1 4.98110673 +1 4.62053784 +1
H -0.04298800 +1 5.86658209 +1 3.25592143 +1
N 1.03589997 +1 0.50350215 +1 4.53535687 +1
S 1.61267089 +1 -1.03700512 +1 4.35421191 +1
O 1.18865840 +1 -1.64622877 +1 3.08531282 +1
O 1.11357485 +1 -1.78826167 +1 5.52896683 +1
C 3.33273048 +1 -1.02001063 +1 4.40020171 +1
C 4.03853029 +1 -0.05606211 +1 5.12776382 +1
H 3.50903993 +1 0.72909256 +1 5.67847683 +1
C 5.43637061 +1 -0.08246594 +1 5.15079355 +1
H 5.99722004 +1 0.69189410 +1 5.68971028 +1
C 6.12318462 +1 -1.08336894 +1 4.45772599 +1
H 7.21595051 +1 -1.10666575 +1 4.47792724 +1
C 5.42009146 +1 -2.04519218 +1 3.72072797 +1
H 5.97000457 +1 -2.79475102 +1 3.14083904 +1
C 4.02584525 +1 -2.01455961 +1 3.69721917 +1
H 3.47500251 +1 -2.76370676 +1 3.11643576 +1
N 0.45636500 +1 2.69107527 +1 4.06588080 +1
N 0.71458793 +1 -2.36969950 +1 -3.52113858 +1
H 0.04200768 +1 -2.26867688 +1 -2.71091188 +1
C 1.44038506 +1 -1.22176149 +1 -3.94155141 +1
C 2.22006875 +1 -1.32637383 +1 -5.12558141 +1
H 2.73903272 +1 -0.44850991 +1 -5.49861112 +1
C 2.29023863 +1 -2.52107626 +1 -5.82760465 +1
H 2.89766783 +1 -2.58455599 +1 -6.73774363 +1
C 1.59708797 +1 -3.64758918 +1 -5.39097853 +1
H 1.66051347 +1 -4.59309364 +1 -5.92892782 +1
C 0.76972573 +1 -3.56799438 +1 -4.25204372 +1
N -0.02309394 +1 -4.61658148 +1 -3.85016309 +1
H -0.42235150 +1 -4.65726314 +1 -2.91118678 +1
H 0.10662876 +1 -5.52370478 +1 -4.32053867 +1
N 1.32836474 +1 -0.17524296 +1 -3.10621482 +1
S 1.91054948 +1 1.35471487 +1 -3.36421302 +1
O 1.54161832 +1 1.88072099 +1 -4.68558627 +1
O 1.36596418 +1 2.18716360 +1 -2.26671423 +1
C 3.63023228 +1 1.33930909 +1 -3.25750682 +1
C 4.31685465 +1 0.37892762 +1 -2.50911746 +1
H 3.77316519 +1 -0.40093801 +1 -1.96628051 +1
C 5.71394293 +1 0.40038131 +1 -2.45398467 +1
H 6.25889734 +1 -0.37267772 +1 -1.90005153 +1
C 6.42013200 +1 1.39577755 +1 -3.13589933 +1
H 7.51210685 +1 1.41978103 +1 -3.08484689 +1
C 5.73671624 +1 2.35358918 +1 -3.89525304 +1
H 6.30126571 +1 3.09814074 +1 -4.46604507 +1
C 4.34294266 +1 2.32722472 +1 -3.95154544 +1
H 3.80897529 +1 3.07422813 +1 -4.55220976 +1
N -0.68114480 +1 2.17302310 +1 -0.27208672 +1
H -0.01113071 +1 2.25367066 +1 -1.08582250 +1
C -1.38284655 +1 3.33888906 +1 0.13989252 +1
C -2.16500486 +1 3.25914934 +1 1.32428034 +1
H -2.66143782 +1 4.15114456 +1 1.69327295 +1
C -2.26956531 +1 2.06788852 +1 2.02850074 +1
H -2.87915982 +1 2.02322338 +1 2.93820386 +1
C -1.61175990 +1 0.91972502 +1 1.59259872 +1
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C -0.77925373 +1 0.97591252 +1 0.45652692 +1
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