527 Oxytocin 1XY10001
(Previous) tetrakis(Piroxicam) fumaric acid clathrate (DIKDIL)
(Back) Elements:
O 37
C 86
H 156
S 4
N 22
(Z = 2)
(Periodic Table)
(Next) Vanthoffite (MgNa6 (SO4)4)
Notes: Oxytocin is a nonapeptide. This structure is the largest
simple organic optimized during the tests. The RMS error is
about 0.6 Angstrom
Unit Cell Parameters: a b c alpha beta gamma Volume Density Heat of Formation (Kcal/mol)
X-ray: 23.04 9.04 27.27 90.00 102.24 90.00 5550.66 1.327 -1846.8 calc'd using PM7
PM7: 22.96 9.15 27.12 90.33 102.08 89.49 5570.06 1.323 -2426.7 calc'd using PM7
PM6: 22.06 8.89 26.73 90.55 99.12 88.36 5171.69 1.425 -2110.4 calc'd using PM6
X-Ray PM7 PM6
X-Ray data set:
OPT-H MERS=(1,1,1)
Oxytocin 1XY10001
O 0.00000000 +0 0.00000000 +0 0.00000000 +0
C -13.58900100 +0 -2.30300000 +0 -2.43700000 +0
O -14.23200000 +0 -3.20300000 +0 -1.96400000 +0
C -11.19000100 +0 -2.57300000 +0 -1.85500000 +0
H 0.22553508 +1 0.82945187 +1 0.41487425 +1
S -10.43100000 +0 -3.27000000 +0 -3.28000000 +0
N -13.99300000 +0 -1.59900000 +0 -3.57700000 +0
C -15.26499900 +0 -1.82500000 +0 -4.24300000 +0
C -14.95100000 +0 -1.94400000 +0 -5.72700000 +0
O -13.88299900 +0 -1.67100000 +0 -6.23400000 +0
C -16.22400100 +0 -0.64200000 +0 -4.04900000 +0
C -16.38699900 +0 -0.18600000 +0 -2.62200000 +0
C -15.53100000 +0 0.74100000 +0 -2.04300000 +0
C -17.41200100 +0 -0.69100000 +0 -1.83300000 +0
C -15.69899900 +0 1.18500000 +0 -0.73900000 +0
C -17.61300100 +0 -0.21600000 +0 -0.54600000 +0
C -16.76899900 +0 0.73100000 +0 0.03500000 +0
O -17.01100000 +0 1.15700000 +0 1.27400000 +0
H -13.38433502 +1 -0.87904851 +1 -4.00308289 +1
H -15.74252736 +1 -2.76857592 +1 -3.84765225 +1
H -15.88549259 +1 0.23419464 +1 -4.65017199 +1
H -17.22030947 +1 -0.92390772 +1 -4.45622857 +1
H -14.68824716 +1 1.13138839 +1 -2.62663885 +1
H -18.07853156 +1 -1.45874288 +1 -2.22678351 +1
H -14.99450912 +1 1.91426613 +1 -0.32903118 +1
H -18.44801639 +1 -0.59486057 +1 0.04551127 +1
N -16.02800000 +0 -2.44800000 +0 -6.47300000 +0
C -15.93300000 +0 -2.53900000 +0 -7.92100000 +0
C -15.55800100 +0 -1.19000000 +0 -8.50600000 +0
O -16.31300000 +0 -0.21900000 +0 -8.43000000 +0
C -17.26400000 +0 -3.07900000 +0 -8.48300000 +0
C -17.47499800 +0 -4.51800000 +0 -8.09200000 +0
C -17.37299900 +0 -2.84300000 +0 -10.02500000 +0
C -16.67700000 +0 -5.44900000 +0 -8.97000000 +0
H -16.96626033 +1 -2.53765057 +1 -6.05781200 +1
H -15.12356577 +1 -3.29292062 +1 -8.17029304 +1
H -18.09222835 +1 -2.46719816 +1 -8.02748029 +1
H -17.21567389 +1 -4.67784973 +1 -7.02267626 +1
H -18.55459677 +1 -4.76924788 +1 -8.16476582 +1
H -17.43892069 +1 -1.77438756 +1 -10.24853391 +1
H -16.50080865 +1 -3.25402002 +1 -10.54779218 +1
H -18.26975100 +1 -3.33591202 +1 -10.41428187 +1
H -15.61474659 +1 -5.17147786 +1 -9.00649029 +1
H -16.71750558 +1 -6.48652233 +1 -8.60507827 +1
H -17.05087930 +1 -5.45547633 +1 -10.00243070 +1
N -14.37299900 +0 -1.18800000 +0 -9.22500000 +0
C -13.85599900 +0 0.04300000 +0 -9.90000000 +0
C -13.63299900 +0 1.22600000 +0 -8.98200000 +0
O -13.53900000 +0 2.38600000 +0 -9.33000000 +0
C -14.69100000 +0 0.41400000 +0 -11.11600000 +0
C -14.60000000 +0 -0.61300000 +0 -12.22000000 +0
C -13.21500000 +0 -0.92400000 +0 -12.65800000 +0
O -12.38299900 +0 0.05800000 +0 -12.91600000 +0
N -12.77400000 +0 -2.16800000 +0 -12.67200000 +0
H -13.72615589 +1 -2.00617697 +1 -9.22224541 +1
H -12.80499198 +1 -0.23214892 +1 -10.26428847 +1
H -15.75351841 +1 0.54909486 +1 -10.81325836 +1
H -14.34896711 +1 1.40648604 +1 -11.49832754 +1
H -15.14341596 +1 -1.53791802 +1 -11.91267240 +1
H -15.15027194 +1 -0.23945612 +1 -13.12635136 +1
H -13.40015572 +1 -2.97895482 +1 -12.56835793 +1
H -11.81240144 +1 -2.39167027 +1 -12.99712384 +1
N -13.42300000 +0 0.88900000 +0 -7.63200000 +0
C -12.99400000 +0 1.87600000 +0 -6.66000000 +0
C -12.18499900 +0 1.21099900 +0 -5.58400000 +0
O -12.60300100 +0 0.86500000 +0 -4.50100000 +0
C -14.21600000 +0 2.54700000 +0 -6.07300000 +0
C -13.95100000 +0 3.42000000 +0 -4.83900000 +0
O -12.75700000 +0 3.93200000 +0 -4.70200000 +0
N -14.87800000 +0 3.63600000 +0 -3.91200000 +0
H -13.56674433 +1 -0.07964526 +1 -7.28873685 +1
H -12.36860947 +1 2.69180197 +1 -7.15779210 +1
H -14.70286676 +1 3.18733896 +1 -6.84733974 +1
H -14.98870002 +1 1.78164744 +1 -5.81014782 +1
H -14.64844210 +1 4.22161694 +1 -3.08675332 +1
H -15.79262656 +1 3.15824835 +1 -3.91242351 +1
N -10.93700000 +0 0.89200000 +0 -6.05000000 +0
C -10.02100000 +0 0.17700000 +0 -5.17600000 +0
C -8.65900000 +0 0.72700000 +0 -5.52500000 +0
O -7.93899900 +0 0.32600000 +0 -6.39400000 +0
C -10.04999900 +0 -1.31200000 +0 -5.47900000 +0
S -8.94100000 +0 -2.24500000 +0 -4.34200000 +0
H -10.67216727 +1 0.97019095 +1 -7.04748857 +1
H -10.30529465 +1 0.34505828 +1 -4.09748063 +1
H -11.07676646 +1 -1.73834675 +1 -5.43017425 +1
H -9.67545622 +1 -1.53637015 +1 -6.49950110 +1
N -8.18300100 +0 1.73500000 +0 -4.65200000 +0
C -6.89500000 +0 2.38700000 +0 -4.97200000 +0
C -5.71400100 +0 1.52800000 +0 -4.59800000 +0
O -4.58000000 +0 1.83000000 +0 -4.90800000 +0
C -6.93400000 +0 3.66100000 +0 -4.17800000 +0
C -7.90000000 +0 3.33000000 +0 -3.09500000 +0
C -8.98700000 +0 2.43800000 +0 -3.62600000 +0
H -6.83248683 +1 2.57449113 +1 -6.08612067 +1
H -5.94705224 +1 3.98862783 +1 -3.79998875 +1
H -7.30864504 +1 4.50070723 +1 -4.81546462 +1
H -7.37540693 +1 2.83078552 +1 -2.24728943 +1
H -8.33495236 +1 4.25189936 +1 -2.64551652 +1
H -9.40272810 +1 1.73660983 +1 -2.87909072 +1
H -9.82613641 +1 3.00653820 +1 -4.09896459 +1
N -5.96100000 +0 0.35100000 +0 -3.87100000 +0
C -4.88800100 +0 -0.51900000 +0 -3.49800000 +0
C -4.30999900 +0 -1.29800000 +0 -4.64100000 +0
O -3.12500000 +0 -1.59200000 +0 -4.72100000 +0
C -5.34300000 +0 -1.46000000 +0 -2.41400100 +0
C -5.83200100 +0 -0.77200000 +0 -1.13800000 +0
C -6.40600000 +0 -1.81200000 +0 -0.18700000 +0
C -4.72200000 +0 0.01200000 +0 -0.47300100 +0
H -6.91450833 +1 0.07546958 +1 -3.63664505 +1
H -4.02767888 +1 0.11933076 +1 -3.08897286 +1
H -6.13907669 +1 -2.13780607 +1 -2.79235488 +1
H -4.49735749 +1 -2.14353341 +1 -2.14399491 +1
H -6.65190022 +1 -0.05772150 +1 -1.40521284 +1
H -5.63446986 +1 -2.54243340 +1 0.10787905 +1
H -6.77085602 +1 -1.34537638 +1 0.73572563 +1
H -7.22853906 +1 -2.37382535 +1 -0.64257120 +1
H -4.35561450 +1 0.82686265 +1 -1.11003074 +1
H -5.05214607 +1 0.45093846 +1 0.47681234 +1
H -3.85850484 +1 -0.63292602 +1 -0.24294067 +1
N -5.21600000 +0 -1.80500000 +0 -5.56600000 +0
C -4.69500000 +0 -2.63400000 +0 -6.63200000 +0
C -5.92600100 +0 -3.20600000 +0 -7.28700000 +0
O -7.10400000 +0 -3.03400000 +0 -6.99900000 +0
H -6.17653235 +1 -1.45116754 +1 -5.65669869 +1
H -4.07388324 +1 -2.05245079 +1 -7.36373751 +1
H -4.02551679 +1 -3.44028618 +1 -6.22830165 +1
C -12.32800000 +0 -1.68000000 +0 -1.87700100 +0
C -1.45400000 +0 2.84000000 +0 2.34600000 +0
C -0.19300000 +0 2.21700000 +0 2.90600000 +0
O 0.45000000 +0 1.31700000 +0 2.43300000 +0
C -2.59200000 +0 1.94700000 +0 2.32399900 +0
H 0.07392318 +1 0.10682240 +1 -0.95655871 +1
S -3.35100000 +0 1.25000000 +0 3.74900000 +0
N 0.21000000 +0 2.92100000 +0 4.04600000 +0
C 1.48200000 +0 2.69500000 +0 4.71200000 +0
C 1.16800000 +0 2.57600000 +0 6.19599900 +0
O 0.10000000 +0 2.84900000 +0 6.70299900 +0
C 2.44100000 +0 3.87800000 +0 4.51800000 +0
C 2.60500000 +0 4.33400000 +0 3.09100000 +0
C 1.74900000 +0 5.26100000 +0 2.51200000 +0
C 3.63000100 +0 3.82900000 +0 2.30200000 +0
C 1.91700000 +0 5.70500000 +0 1.20700000 +0
C 3.83100000 +0 4.30400000 +0 1.01400000 +0
C 2.98600000 +0 5.25100000 +0 0.43300000 +0
O 3.22800000 +0 5.67700000 +0 -0.80600000 +0
H -0.38854320 +1 3.66516806 +1 4.45504626 +1
H 1.96127343 +1 1.75188597 +1 4.31847171 +1
H 2.10418334 +1 4.75517581 +1 5.12164565 +1
H 3.43821816 +1 3.59715869 +1 4.92867609 +1
H 0.90096087 +1 5.64979677 +1 3.09405888 +1
H 4.29976893 +1 3.06339173 +1 2.70020092 +1
H 1.21319443 +1 6.43775893 +1 0.79569071 +1
H 4.67696722 +1 3.91314056 +1 0.44542144 +1
N 2.24500000 +0 2.07200000 +0 6.94100000 +0
C 2.15000000 +0 1.98100000 +0 8.38900000 +0
C 1.77600000 +0 3.33000000 +0 8.97399900 +0
O 2.53100000 +0 4.30100000 +0 8.89800100 +0
C 3.48200000 +0 1.44100000 +0 8.95100000 +0
C 3.69200000 +0 0.00200000 +0 8.55999900 +0
C 3.59100000 +0 1.67700000 +0 10.49300000 +0
C 2.89500000 +0 -0.92900000 +0 9.43800000 +0
H 3.18508245 +1 1.97928891 +1 6.52591407 +1
H 1.33736296 +1 1.22567343 +1 8.64212244 +1
H 4.31027153 +1 2.05336764 +1 8.49485481 +1
H 3.43161313 +1 -0.15807762 +1 7.49101256 +1
H 4.77177898 +1 -0.25015605 +1 8.62960776 +1
H 3.66293785 +1 2.74614945 +1 10.71270744 +1
H 2.71261567 +1 1.27383927 +1 11.00986713 +1
H 4.48262011 +1 1.17721645 +1 10.88239996 +1
H 1.82838269 +1 -0.65743962 +1 9.46457012 +1
H 2.94057107 +1 -1.96771951 +1 9.07621659 +1
H 3.26047295 +1 -0.93240776 +1 10.47183639 +1
N 0.59100000 +0 3.33200000 +0 9.69299900 +0
C 0.07400000 +0 4.56300000 +0 10.36800000 +0
C -0.14900000 +0 5.74600000 +0 9.45000100 +0
O -0.24300000 +0 6.90600000 +0 9.79800000 +0
C 0.90800000 +0 4.93400000 +0 11.58400000 +0
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O -1.40000000 +0 4.57800000 +0 13.38400100 +0
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C 3.63096835 +1 3.81452282 +1 2.36261563 +1
C 1.88860231 +1 5.70178896 +1 1.23419050 +1
C 3.85080959 +1 4.24914924 +1 1.05533561 +1
C 2.97207199 +1 5.18652575 +1 0.51879177 +1
O 3.10108956 +1 5.65032784 +1 -0.75927177 +1
H -0.47737999 +1 3.76521179 +1 4.55901060 +1
H 1.82432713 +1 1.81287121 +1 4.29925991 +1
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C 17.97457393 +1 -2.81073541 +1 8.85984611 +1
C 16.97752159 +1 -5.33117522 +1 10.49457073 +1
H 16.62747529 +1 -2.31368523 +1 6.53495502 +1
H 14.50285415 +1 -3.08365138 +1 8.32873558 +1
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H 15.12602977 +1 -4.24088313 +1 10.23540476 +1
H 18.27374531 +1 -2.39844085 +1 7.88857993 +1
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N 14.15813394 +1 -1.21827243 +1 9.92275543 +1
C 13.72465248 +1 -0.05473776 +1 10.69398567 +1
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C 14.61227761 +1 0.21607490 +1 11.91803897 +1
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O 12.18241161 +1 -0.41486193 +1 13.43595889 +1
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N 13.31107567 +1 1.01455916 +1 8.51420924 +1
C 12.82916493 +1 2.07318498 +1 7.62458281 +1
C 12.07068057 +1 1.36803187 +1 6.47541104 +1
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C 13.98931173 +1 2.90202239 +1 7.05925628 +1
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O 12.56310015 +1 4.79771933 +1 6.65599289 +1
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H -7.80693116 +1 4.78537130 +1 -3.09369670 +1
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N -5.77604647 +1 -4.02482250 +1 -8.86335870 +1
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C 11.63820425 +1 -1.96671260 +1 2.37062070 +1
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S 9.22511721 +1 -2.02432820 +1 3.58265080 +1
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