568 Methylene blue (MAPAZT10)
(Previous) XVIII (1-((4-Chlorophenyl)sulfonyl)-2-oxopropylidene)diazenium
(Back) Elements:
Cl 1
C 16
H 28
N 3
S 1
O 5
(Z = 8)
(Periodic Table)
(Next) Chlorine (Cl2) (ICSD 24653)
Unit Cell Parameters: a b c alpha beta gamma Volume Density Heat of Formation (Kcal/mol)
X-ray: 31.11 6.99 9.65 83.31 90.00 90.00 2083.84 1.307 40.2 calc'd using PM7
PM7: 30.94 6.77 9.31 82.14 89.85 91.25 1932.11 1.409 -352.2 calc'd using PM7
PM6: 30.84 6.77 8.99 85.69 90.04 90.37 1872.27 1.454 -284.8 calc'd using PM6
X-Ray PM7 PM6
For X-Ray structure, contact the CCDC: http://www.ccdc.cam.ac.uk/
Optimized PM7 data set:
MERS=(1,2,1) GNORM=4
Methylene_blue_(MAPAZT10)
Cl 0.01469313 +1 0.09377094 +1 -0.07748433 +1
Cl -4.15140224 +1 -15.30403898 +1 0.08699845 +1
Cl -3.55371890 +1 0.82557879 +1 -3.28624622 +1
Cl 0.14946160 +1 -14.71646904 +1 -3.45189659 +1
C 1.46330636 +1 -8.65239129 +1 -0.40912851 +1
C 2.36546504 +1 -7.52357763 +1 -0.27960027 +1
C 2.87243355 +1 -12.61872260 +1 -0.23999927 +1
C 5.17292807 +1 -11.77604638 +1 0.19509072 +1
C 5.91300304 +1 -1.35730088 +1 0.36698303 +1
C 3.79401655 +1 -0.17685121 +1 -0.05965989 +1
C 1.91335721 +1 -9.92591423 +1 -0.34544233 +1
C 3.32147451 +1 -10.21783163 +1 -0.14079587 +1
C 4.22272943 +1 -9.10596195 +1 -0.01539162 +1
C 3.76142518 +1 -7.82357111 +1 -0.07804868 +1
C 3.94718898 +1 -5.07633286 +1 -0.04856274 +1
C 4.58921335 +1 -3.86867668 +1 0.06387976 +1
C 3.86302008 +1 -2.64207542 +1 -0.05975520 +1
C 2.44203354 +1 -2.72991424 +1 -0.31889858 +1
C 1.81212763 +1 -3.93179947 +1 -0.40419745 +1
C 2.54048567 +1 -5.16525287 +1 -0.27117683 +1
H 0.39619357 +1 -8.43324174 +1 -0.56176327 +1
H 5.34631363 +1 -12.87004064 +1 0.25247957 +1
H 5.83114740 +1 -11.37642413 +1 -0.60446480 +1
H 5.50356356 +1 -11.34438973 +1 1.16056426 +1
H 6.09781711 +1 -1.54970095 +1 1.44390273 +1
H 6.52117344 +1 -2.05754514 +1 -0.23408323 +1
H 6.29090269 +1 -0.33937599 +1 0.14873308 +1
H 3.95825940 +1 0.24920812 +1 -1.06922627 +1
H 2.70509817 +1 -0.25718075 +1 0.12397298 +1
H 4.18375096 +1 0.54261213 +1 0.69279359 +1
H 1.21054042 +1 -10.76211989 +1 -0.45013723 +1
H 5.29804785 +1 -9.30984980 +1 0.11105915 +1
H 5.66711719 +1 -3.83492463 +1 0.26729720 +1
H 1.86014717 +1 -1.80788087 +1 -0.42918407 +1
H 0.73030649 +1 -3.99218721 +1 -0.57779641 +1
H 2.12973869 +1 -12.67398746 +1 0.58013481 +1
H 3.43763813 +1 -13.57278221 +1 -0.25779207 +1
H 2.31327601 +1 -12.55256831 +1 -1.19826799 +1
N 1.84068317 +1 -6.31033880 +1 -0.36752242 +1
N 3.76544530 +1 -11.47411410 +1 -0.06598179 +1
N 4.48384048 +1 -1.46012763 +1 0.06056409 +1
S 4.90086574 +1 -6.52417686 +1 0.09106453 +1
C 3.88200575 +1 6.87962452 +1 0.29809287 +1
C 2.99002526 +1 8.01262172 +1 0.14638052 +1
C 2.45437057 +1 2.91970764 +1 0.14547275 +1
C 0.14737601 +1 3.77119525 +1 -0.23298913 +1
C -0.54872746 +1 14.20679017 +1 -0.31309545 +1
C 1.58770748 +1 15.37017640 +1 0.06377987 +1
C 3.42416849 +1 5.60734776 +1 0.24937532 +1
C 2.01607854 +1 5.32351095 +1 0.03600214 +1
C 1.12416324 +1 6.43987814 +1 -0.11324926 +1
C 1.59479014 +1 7.72073924 +1 -0.06292340 +1
C 1.42643450 +1 10.47132385 +1 -0.10189874 +1
C 0.79129964 +1 11.68334011 +1 -0.19584728 +1
C 1.51800545 +1 12.90596233 +1 -0.03739230 +1
C 2.94572084 +1 12.80853384 +1 0.18185218 +1
C 3.57043237 +1 11.60320708 +1 0.24794166 +1
C 2.83395908 +1 10.37270554 +1 0.12192621 +1
H 4.94927746 +1 7.09184385 +1 0.45919650 +1
H -0.03755714 +1 2.67795977 +1 -0.25947713 +1
H -0.48034118 +1 4.19172037 +1 0.58170502 +1
H -0.20887041 +1 4.18544737 +1 -1.19588581 +1
H -0.79073789 +1 14.07607293 +1 -1.38738882 +1
H -1.12776562 +1 13.47244347 +1 0.27732437 +1
H -0.91473260 +1 15.20697886 +1 -0.01022570 +1
H 1.42264298 +1 15.77542297 +1 1.08379717 +1
H 2.67578468 +1 15.29206972 +1 -0.11610153 +1
H 1.19946293 +1 16.10525298 +1 -0.67294205 +1
H 4.11889167 +1 4.76839384 +1 0.38196067 +1
H 0.04984877 +1 6.24375754 +1 -0.25438243 +1
H -0.28492697 +1 11.72851955 +1 -0.40900508 +1
H 3.53334332 +1 13.72745833 +1 0.28374090 +1
H 4.65489345 +1 11.53577647 +1 0.40168103 +1
H 3.22194762 +1 2.88869504 +1 -0.65269739 +1
H 1.89040187 +1 1.96580504 +1 0.12009395 +1
H 2.98599095 +1 2.96036430 +1 1.12160527 +1
N 3.52465028 +1 9.22458244 +1 0.22307180 +1
N 1.56483116 +1 4.06798333 +1 -0.02237180 +1
N 0.89413008 +1 14.09080618 +1 -0.08379830 +1
S 0.46816398 +1 9.02818781 +1 -0.25822561 +1
C 4.29290564 +1 9.46518778 +1 -3.09202224 +1
C 3.39185862 +1 8.33725248 +1 -3.23010069 +1
C 2.88707164 +1 13.43067412 +1 -3.20425622 +1
C 0.57111337 +1 12.59536400 +1 -3.58332920 +1
C -0.18204660 +1 2.16220041 +1 -3.75461300 +1
C 1.94450437 +1 0.98596189 +1 -3.38855004 +1
C 3.84002755 +1 10.73885544 +1 -3.13684564 +1
C 2.43115731 +1 11.03178543 +1 -3.33150191 +1
C 1.53262116 +1 9.92107675 +1 -3.47946233 +1
C 1.99628492 +1 8.63749446 +1 -3.43329183 +1
C 1.80896234 +1 5.88963358 +1 -3.46720544 +1
C 1.16567450 +1 4.68152245 +1 -3.56889441 +1
C 1.88536509 +1 3.45496679 +1 -3.41998452 +1
C 3.30865367 +1 3.54267009 +1 -3.17459849 +1
C 3.94035338 +1 4.74420273 +1 -3.09735514 +1
C 3.21491878 +1 5.97867607 +1 -3.23820752 +1
H 5.36083456 +1 9.24506298 +1 -2.94633044 +1
H 0.38702734 +1 13.68911073 +1 -3.57516647 +1
H -0.06189070 +1 12.14928375 +1 -2.78724183 +1
H 0.22045342 +1 12.21388312 +1 -4.56202698 +1
H -0.39869914 +1 2.27010005 +1 -4.83713477 +1
H -0.76817734 +1 2.91628204 +1 -3.19756339 +1
H -0.56221662 +1 1.17154149 +1 -3.43847288 +1
H 1.74850699 +1 0.53283665 +1 -2.39601696 +1
H 3.03918151 +1 1.06988505 +1 -3.53153420 +1
H 1.57999218 +1 0.28980627 +1 -4.17461695 +1
H 4.54151487 +1 11.57412731 +1 -3.01575640 +1
H 0.45872361 +1 10.12340920 +1 -3.61525538 +1
H 0.08959033 +1 4.64643887 +1 -3.78507883 +1
H 3.88922639 +1 2.62032155 +1 -3.06141769 +1
H 5.02202820 +1 4.80289321 +1 -2.92183205 +1
H 3.63640204 +1 13.47077513 +1 -4.01849040 +1
H 2.32799864 +1 14.38939800 +1 -3.20500687 +1
H 3.43450445 +1 13.37197796 +1 -2.23817452 +1
N 3.91660221 +1 7.12278347 +1 -3.14493449 +1
N 1.98695663 +1 12.29050457 +1 -3.37473250 +1
N 1.25664664 +1 2.27223424 +1 -3.49567005 +1
S 0.86099497 +1 7.33794616 +1 -3.62675296 +1
C 1.87120992 +1 -6.07061589 +1 -3.78795511 +1
C 2.76479023 +1 -7.20380250 +1 -3.64338539 +1
C 3.29898700 +1 -2.10870712 +1 -3.62878859 +1
C 5.59821716 +1 -2.96205138 +1 -3.21418384 +1
C 6.28314705 +1 -13.38717742 +1 -3.01728224 +1
C 4.16695313 +1 -14.56023049 +1 -3.47819109 +1
C 2.32884069 +1 -4.79896583 +1 -3.73554996 +1
C 3.73770334 +1 -4.51407432 +1 -3.52838797 +1
C 4.63253587 +1 -5.63054326 +1 -3.39313038 +1
C 4.16210379 +1 -6.91127770 +1 -3.44186447 +1
C 4.32622770 +1 -9.65970550 +1 -3.38492883 +1
C 4.95941816 +1 -10.87127424 +1 -3.26889433 +1
C 4.23050116 +1 -12.09319951 +1 -3.40741077 +1
C 2.80764204 +1 -11.99904943 +1 -3.65010409 +1
C 2.18352154 +1 -10.79371820 +1 -3.73123462 +1
C 2.92007692 +1 -9.56351192 +1 -3.61040357 +1
H 0.80301596 +1 -6.28453285 +1 -3.94184644 +1
H 5.77935650 +1 -1.86795881 +1 -3.17210432 +1
H 6.24667384 +1 -3.37266363 +1 -4.01514057 +1
H 5.93343677 +1 -3.38146890 +1 -2.24566067 +1
H 6.47082705 +1 -13.22482539 +1 -1.93610917 +1
H 6.89032545 +1 -12.66399255 +1 -3.59413830 +1
H 6.66418630 +1 -14.39528251 +1 -3.26889156 +1
H 4.35337562 +1 -14.96509253 +1 -4.49321716 +1
H 3.07511830 +1 -14.48408071 +1 -3.31737650 +1
H 4.54391313 +1 -15.29376418 +1 -2.73278926 +1
H 1.63146352 +1 -3.95975344 +1 -3.85266842 +1
H 5.70796561 +1 -5.43463672 +1 -3.26429531 +1
H 6.03654000 +1 -10.91414074 +1 -3.05771206 +1
H 2.21962751 +1 -12.91776369 +1 -3.75127549 +1
H 1.09977176 +1 -10.72855327 +1 -3.89199189 +1
H 2.56610185 +1 -2.04738726 +1 -2.79999306 +1
H 3.87186996 +1 -1.15955394 +1 -3.65494313 +1
H 2.73043338 +1 -2.17279281 +1 -4.58195901 +1
N 2.22974162 +1 -8.41446103 +1 -3.71823593 +1
N 4.18684108 +1 -3.25877024 +1 -3.46008293 +1
N 4.85320703 +1 -13.27833027 +1 -3.31923354 +1
S 5.29015715 +1 -8.21915326 +1 -3.25343981 +1
H -1.23574666 +1 -13.63882893 +1 1.34772967 +1
H -2.30221249 +1 -14.06494627 +1 0.31741949 +1
O -1.67206792 +1 -13.35326978 +1 0.52741810 +1
H -2.94133755 +1 1.80510512 +1 -1.32153313 +1
H -1.80466949 +1 1.36335719 +1 -0.37171602 +1
O -2.51903143 +1 2.01166037 +1 -0.47201987 +1
H -3.20214071 +1 14.38844202 +1 2.08277450 +1
H -2.06179747 +1 14.75707454 +1 3.05434884 +1
O -2.79766578 +1 14.13616267 +1 2.92624862 +1
H -0.68646432 +1 -0.96733784 +1 -1.97139660 +1
H -1.74704196 +1 -0.49532065 +1 -2.99102398 +1
O -1.14590937 +1 -1.22966690 +1 -2.78717218 +1
H -1.72124374 +1 -8.78302280 +1 1.09372077 +1
H -1.62256930 +1 -7.77628002 +1 -0.08219367 +1
O -1.86000319 +1 -8.68964643 +1 0.14192408 +1
H -2.24776881 +1 6.80858770 +1 -1.09183394 +1
H -2.33899014 +1 7.76521386 +1 0.11599403 +1
O -2.12434563 +1 6.85399018 +1 -0.13609299 +1
H -2.59297891 +1 9.43706144 +1 2.30071428 +1
H -2.67590587 +1 8.42977776 +1 3.47394689 +1
O -2.43789470 +1 9.34292141 +1 3.24767090 +1
H -1.29489945 +1 -5.99284889 +1 -2.25157597 +1
H -1.20051589 +1 -6.95317567 +1 -3.45875925 +1
O -1.40764961 +1 -6.03868375 +1 -3.21047416 +1
H -0.56660244 +1 -12.76070143 +1 -0.62749077 +1
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O 0.04151535 +1 -12.37774974 +1 -1.28543817 +1
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S 5.70367470 +1 -6.51775204 +1 -6.62508965 +1
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N 2.36798995 +1 4.07496685 +1 -6.78164498 +1
N 1.71096173 +1 14.09615824 +1 -6.93679445 +1
S 1.27303730 +1 9.03656654 +1 -6.99641695 +1
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S 1.65754800 +1 7.34707471 +1 -10.34394280 +1
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C 3.72387134 +1 -9.54872117 +1 -10.36716025 +1
H 1.60900413 +1 -6.26790109 +1 -10.71924552 +1
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N 3.03270221 +1 -8.40097004 +1 -10.47525562 +1
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O -1.66997165 +1 2.07813609 +1 -7.21152664 +1
H -2.43055550 +1 14.58225214 +1 -4.63869506 +1
H -1.31081738 +1 15.00229895 +1 -3.66235434 +1
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O -0.60134551 +1 -10.14993030 +1 -8.75365199 +1
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Tv 1.55828608 +1 0.30198544 +1 -13.45124940 +1
Tv 9.30607712 +1 -0.15473575 +1 -0.20712846 +1
Optimized PM6 data set:
MOZYME MERS=(1,2,1) GNORM=4 PM6
Methylene_blue_(MAPAZT10)
h= hr=NIST
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Cl( ) -4.02662665 +1 -15.34993411 +1 -0.13232234 +1
Cl( ) -3.22907304 +1 0.99190868 +1 -3.48452880 +1
Cl( ) -0.01390974 +1 -14.49253220 +1 -3.55429356 +1
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N(+) 1.12248448 +1 14.09403905 +1 -0.13276673 +1
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S( ) 0.78053842 +1 7.31974993 +1 -3.32490067 +1
C( ) 1.95334344 +1 -5.95152495 +1 -3.79312488 +1
C( ) 2.79895852 +1 -7.14824113 +1 -3.70905775 +1
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C( ) 5.87580739 +1 -3.01694685 +1 -3.29552144 +1
C( ) 6.08319610 +1 -13.55996706 +1 -3.09468085 +1
C( ) 3.84329893 +1 -14.58557304 +1 -3.32677693 +1
C( ) 2.48014057 +1 -4.70890171 +1 -3.75488887 +1
C( ) 3.91896961 +1 -4.49161029 +1 -3.59526991 +1
C( ) 4.77388337 +1 -5.66683696 +1 -3.54031158 +1
C( ) 4.23275116 +1 -6.90940192 +1 -3.59024343 +1
C( ) 4.27747183 +1 -9.68644319 +1 -3.53675317 +1
C( ) 4.88004884 +1 -10.91374380 +1 -3.41152046 +1
C( ) 4.08006288 +1 -12.10530341 +1 -3.44311100 +1
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H( ) 4.17629391 +1 -1.17946229 +1 -3.93200032 +1
H( ) 2.71292648 +1 -2.17173265 +1 -4.24141819 +1
N( ) 2.20405735 +1 -8.32819701 +1 -3.75851719 +1
N( ) 4.43005042 +1 -3.25693298 +1 -3.49117145 +1
N(+) 4.63056944 +1 -13.33343226 +1 -3.26421926 +1
S( ) 5.31506201 +1 -8.27943305 +1 -3.51278583 +1
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Cl( ) -3.28162614 +1 -15.32343766 +1 -6.83783042 +1
Cl( ) -2.44749637 +1 1.02418175 +1 -10.21137680 +1
Cl( ) 0.79279047 +1 -14.47961362 +1 -10.29890984 +1
C( ) 2.32258601 +1 -8.66544907 +1 -7.16283265 +1
C( ) 3.22364865 +1 -7.51134501 +1 -7.06339088 +1
C( ) 3.77033554 +1 -12.64688842 +1 -6.96462835 +1
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C( ) 4.60782222 +1 -0.12844355 +1 -6.65624151 +1
C( ) 2.79089041 +1 -9.93139704 +1 -7.14167580 +1
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C( ) 5.12769236 +1 -9.08449060 +1 -6.92081112 +1
C( ) 4.64527007 +1 -7.81732041 +1 -6.95325124 +1
C( ) 4.81606974 +1 -5.04437300 +1 -6.86860497 +1
C( ) 5.47357127 +1 -3.84586190 +1 -6.74199695 +1
C( ) 4.72820545 +1 -2.61854504 +1 -6.76322175 +1
C( ) 3.29326970 +1 -2.70553274 +1 -6.93237719 +1
C( ) 2.66016521 +1 -3.90891957 +1 -7.03999303 +1
C( ) 3.40081648 +1 -5.14328132 +1 -7.00597490 +1
H( ) 1.24259818 +1 -8.45888046 +1 -7.25101859 +1
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H( ) 7.34334378 +1 -2.22117853 +1 -6.44540703 +1
H( ) 7.20513122 +1 -0.64718456 +1 -7.29428838 +1
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H( ) 3.50730483 +1 -0.26191275 +1 -6.68232616 +1
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H( ) 2.70775575 +1 -1.77761138 +1 -6.94872978 +1
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H( ) 2.85259476 +1 -12.44625846 +1 -7.56992690 +1
N( ) 2.68198665 +1 -6.30528862 +1 -7.09208966 +1
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N(+) 5.33798534 +1 -1.41575047 +1 -6.60762860 +1
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C( ) 0.64807643 +1 3.78959312 +1 -6.92512806 +1
C( ) 0.45430428 +1 14.32849810 +1 -7.17199745 +1
C( ) 2.65495947 +1 15.36445441 +1 -6.72158056 +1
C( ) 4.02041924 +1 5.48289872 +1 -6.32944006 +1
C( ) 2.58934940 +1 5.26507547 +1 -6.54244237 +1
C( ) 1.73565643 +1 6.43832771 +1 -6.63257035 +1
C( ) 2.27376993 +1 7.68208337 +1 -6.56117210 +1
C( ) 2.22975856 +1 10.45980801 +1 -6.61015195 +1
C( ) 1.63456254 +1 11.68707401 +1 -6.75979988 +1
C( ) 2.42999694 +1 12.87986045 +1 -6.67948253 +1
C( ) 3.84569894 +1 12.72791363 +1 -6.41588969 +1
C( ) 4.41952478 +1 11.49683954 +1 -6.29532924 +1
C( ) 3.63068930 +1 10.29568865 +1 -6.39974353 +1
H( ) 5.62798002 +1 6.88318826 +1 -6.14272189 +1
H( ) 0.41341664 +1 2.70080433 +1 -6.98240369 +1
H( ) 0.00821868 +1 4.20838857 +1 -6.11995873 +1
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H( ) 0.34409224 +1 14.82151445 +1 -8.16081819 +1
H( ) -0.13208694 +1 13.38810489 +1 -7.20068120 +1
H( ) -0.00079333 +1 14.98728395 +1 -6.39934195 +1
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H( ) 0.55595079 +1 11.77627350 +1 -6.96584666 +1
H( ) 4.46572781 +1 13.63001470 +1 -6.34456880 +1
H( ) 5.49564677 +1 11.39447383 +1 -6.11910303 +1
H( ) 3.30656105 +1 2.52691424 +1 -7.55628312 +1
H( ) 2.33118641 +1 1.96249629 +1 -6.16940534 +1
H( ) 3.79641233 +1 2.95567668 +1 -5.87903211 +1
N( ) 4.29227646 +1 9.10254510 +1 -6.30708877 +1
N( ) 2.08317913 +1 4.02868546 +1 -6.65931841 +1
N(+) 1.88493733 +1 14.10862706 +1 -6.86535255 +1
S( ) 1.19556412 +1 9.05233592 +1 -6.67909123 +1
C( ) 5.03040603 +1 9.49940656 +1 -9.60473044 +1
C( ) 4.13571690 +1 8.34554171 +1 -9.74153806 +1
C( ) 3.57754768 +1 13.48395199 +1 -9.84823666 +1
C( ) 1.26688755 +1 12.60725757 +1 -10.22513926 +1
C( ) 0.56127407 +1 2.11914646 +1 -10.53433071 +1
C( ) 2.71207572 +1 0.96385565 +1 -10.12156999 +1
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C( ) 3.14388976 +1 11.05112830 +1 -9.85298440 +1
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C( ) 2.72104214 +1 8.65221635 +1 -9.90951835 +1
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C( ) 4.04990904 +1 3.53729558 +1 -9.85711881 +1
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