156 Cytosine (CYTOSM03)
(Previous) Hydroquinone bis(aniline) (HIBFUT)
(Back) Elements:
O 2
C 4
N 3
H 7
(Z = 4)
(Periodic Table)
(Next) XV 2-amino-4-methylpyrimidine and 2-methylbenzoic acid
Unit Cell Parameters: a b c alpha beta gamma Volume Density Heat of Formation (Kcal/mol)
X-ray: 9.82 7.52 7.73 79.50 90.00 90.00 560.95 1.529 -91.1 calc'd using PM7
PM7: 9.83 7.39 7.64 80.34 90.92 89.97 546.75 1.569 -132.5 calc'd using PM7
PM6: 10.21 7.09 7.79 87.21 90.36 88.41 562.61 1.524 -103.2 calc'd using PM6
X-Ray PM7 PM6
For X-Ray structure, contact the CCDC: http://www.ccdc.cam.ac.uk/
Optimized PM7 data set:
MERS=(1,1,1) GNORM=4
Cytosine (CYTOSM03)
O -0.00940485 +1 -0.03294460 +1 -0.03456053 +1
C 0.51296242 +1 -2.46672364 +1 3.33945575 +1
O -0.69683604 +1 -2.51297737 +1 3.60685556 +1
N 1.18252576 +1 -1.29771189 +1 3.11599804 +1
C 2.50137337 +1 -1.32489420 +1 2.75361646 +1
N 3.13829567 +1 -0.14541420 +1 2.57939753 +1
C 3.18631089 +1 -2.57489788 +1 2.56904801 +1
C 2.50443724 +1 -3.73401214 +1 2.82178004 +1
H 0.67362918 +1 -4.58263711 +1 3.43806743 +1
H 4.10276973 +1 -0.14211032 +1 2.26447920 +1
H 2.66752800 +1 0.73981676 +1 2.71830834 +1
H 4.22121495 +1 -2.57586926 +1 2.23055800 +1
H 2.96804338 +1 -4.73495348 +1 2.71754715 +1
N 1.19135092 +1 -3.70179038 +1 3.22001121 +1
N 1.17944468 +1 1.20999547 +1 -3.70775872 +1
C 1.86324954 +1 2.44175436 +1 -3.82607509 +1
O 3.07460698 +1 2.38699655 +1 -4.08951693 +1
N 1.20308937 +1 3.61413058 +1 -3.60060300 +1
C -0.11663125 +1 3.59100061 +1 -3.24378096 +1
N -0.74446757 +1 4.77439130 +1 -3.07810935 +1
C -0.80886128 +1 2.34524748 +1 -3.05570560 +1
C -0.13162812 +1 1.18288773 +1 -3.29952628 +1
H 1.68082946 +1 0.32592728 +1 -3.93347467 +1
H -1.71357777 +1 4.78398406 +1 -2.76577671 +1
H -0.25563568 +1 5.65457610 +1 -3.16939991 +1
H -1.84549457 +1 2.34922976 +1 -2.72223978 +1
H -0.59751490 +1 0.18360588 +1 -3.19916733 +1
N 0.51007947 +1 6.07865279 +1 -0.04419655 +1
C 1.18734123 +1 4.84161829 +1 -0.16650876 +1
O 2.39191838 +1 4.89733151 +1 -0.45470182 +1
N 0.52515447 +1 3.67249546 +1 0.07253754 +1
C -0.78977206 +1 3.69642008 +1 0.44922493 +1
N -1.42536820 +1 2.51826039 +1 0.62424224 +1
C -1.46781408 +1 4.94799224 +1 0.65256075 +1
C -0.79267874 +1 6.10802669 +1 0.38847621 +1
H 1.01917259 +1 6.95303287 +1 -0.28771567 +1
H -2.40887806 +1 2.52396480 +1 0.89592021 +1
H -0.96727582 +1 1.63060659 +1 0.47361077 +1
H -2.49745273 +1 4.95104500 +1 1.01060016 +1
H -1.25517769 +1 7.10772582 +1 0.50365829 +1
N 1.86784266 +1 1.15773806 +1 -0.46171206 +1
C 1.19642054 +1 -0.07843771 +1 -0.31909134 +1
N 1.85110009 +1 -1.25110768 +1 -0.55395574 +1
C 3.16897451 +1 -1.22197335 +1 -0.91537767 +1
N 3.80499390 +1 -2.40560096 +1 -1.04727978 +1
C 3.85403777 +1 0.02571026 +1 -1.12268096 +1
C 3.17790530 +1 1.18762344 +1 -0.87042063 +1
H 1.35649457 +1 2.04277126 +1 -0.24251377 +1
H 4.76748288 +1 -2.41560743 +1 -1.38397736 +1
H 3.30985300 +1 -3.28438831 +1 -0.96321352 +1
H 4.88540477 +1 0.02205839 +1 -1.47296563 +1
H 3.64108184 +1 2.18706138 +1 -0.97767531 +1
O -1.79281133 +1 -0.84585149 +1 1.80626195 +1
H -1.07419974 +1 -0.58669442 +1 1.23258794 +1
H -1.43368021 +1 -1.40278700 +1 2.49710488 +1
O 4.17229683 +1 4.06373247 +1 -2.29382415 +1
H 3.44286252 +1 4.32253160 +1 -1.72324082 +1
H 3.82414839 +1 3.49523203 +1 -2.98659547 +1
O 3.54222538 +1 3.26168562 +1 1.35035575 +1
H 2.82636733 +1 2.98894615 +1 1.92650045 +1
H 3.17496851 +1 3.81498734 +1 0.65089862 +1
O -1.14985287 +1 -1.67506960 +1 -1.83175224 +1
H -0.44017965 +1 -1.95667525 +1 -2.40079117 +1
H -0.77527128 +1 -1.12884344 +1 -1.13632589 +1
Tv -0.20778457 +1 -9.82462561 +1 -0.00040127 +1
Tv 1.31636958 +1 -0.03113172 +1 -7.27153517 +1
Tv 7.63793087 +1 -0.03923546 +1 0.08017189 +1
Optimized PM6 data set:
MERS=(1,1,1) GNORM=4 PM6
Cytosine (CYTOSM03)
O -0.01468877 +1 0.27729530 +1 -0.15167980 +1
C 0.58328867 +1 -2.79092350 +1 3.18513750 +1
O -0.64587032 +1 -2.86520560 +1 3.37586520 +1
N 1.25363264 +1 -1.59538400 +1 3.07741320 +1
C 2.61482541 +1 -1.60471090 +1 2.82982900 +1
N 3.25108264 +1 -0.40784670 +1 2.74397690 +1
C 3.32990769 +1 -2.85041350 +1 2.66595790 +1
C 2.65101197 +1 -4.03216940 +1 2.76855560 +1
H 0.75554917 +1 -4.93025860 +1 3.11919040 +1
H 4.25894265 +1 -0.37129240 +1 2.54627490 +1
H 2.75612328 +1 0.48024980 +1 2.89059320 +1
H 4.40052991 +1 -2.82343920 +1 2.45207560 +1
H 3.13843763 +1 -5.02117510 +1 2.63771350 +1
N 1.28896841 +1 -4.03210410 +1 3.04014660 +1
N 0.94348166 +1 0.98563070 +1 -3.63152650 +1
C 1.72372688 +1 2.18825650 +1 -3.69205110 +1
O 2.95299115 +1 2.05203560 +1 -3.84627300 +1
N 1.11940176 +1 3.41545300 +1 -3.55061540 +1
C -0.24702826 +1 3.47504860 +1 -3.33910490 +1
N -0.81901148 +1 4.69927770 +1 -3.20264930 +1
C -1.03848959 +1 2.26728230 +1 -3.26935850 +1
C -0.42597611 +1 1.05383390 +1 -3.41098760 +1
H 1.42745721 +1 0.06125420 +1 -3.72021800 +1
H -1.82663509 +1 4.78281480 +1 -3.01922610 +1
H -0.27147505 +1 5.56443170 +1 -3.27756370 +1
H -2.11303224 +1 2.34445950 +1 -3.09462560 +1
H -0.97382165 +1 0.09023530 +1 -3.35066970 +1
N 0.53109321 +1 6.46915100 +1 0.01569980 +1
C 1.23838997 +1 5.22923220 +1 -0.13890390 +1
O 2.46578532 +1 5.30564790 +1 -0.33939400 +1
N 0.57028372 +1 4.03233970 +1 -0.03372870 +1
C -0.78828119 +1 4.03859480 +1 0.22823220 +1
N -1.42085873 +1 2.84007710 +1 0.31646010 +1
C -1.50372369 +1 5.28218380 +1 0.40614210 +1
C -0.82988241 +1 6.46566090 +1 0.29358670 +1
H 1.05823092 +1 7.36860270 +1 -0.06977330 +1
H -2.42958808 +1 2.80049930 +1 0.51002000 +1
H -0.92357081 +1 1.95536710 +1 0.15662520 +1
H -2.57159350 +1 5.25328680 +1 0.63368570 +1
H -1.32117486 +1 7.45332340 +1 0.41917380 +1
N 1.99972217 +1 1.33291610 +1 -0.39091240 +1
C 1.21138462 +1 0.13503980 +1 -0.31946180 +1
N 1.80477050 +1 -1.09766520 +1 -0.46044240 +1
C 3.16648360 +1 -1.16733430 +1 -0.69331610 +1
N 3.72579514 +1 -2.39737010 +1 -0.83260660 +1
C 3.96493189 +1 0.03450630 +1 -0.78250340 +1
C 3.36616497 +1 1.25287800 +1 -0.62609230 +1
H 1.52449121 +1 2.26022890 +1 -0.29066280 +1
H 4.73402966 +1 -2.49029920 +1 -1.00619660 +1
H 3.17029962 +1 -3.25590680 +1 -0.73948560 +1
H 5.03560095 +1 -0.05089990 +1 -0.97761010 +1
H 3.92581253 +1 2.20994010 +1 -0.68441580 +1
O -1.78657595 +1 -1.07177200 +1 1.52362160 +1
H -1.01817832 +1 -0.61255180 +1 1.12795400 +1
H -1.44548601 +1 -1.54690220 +1 2.31034460 +1
O 4.15969649 +1 3.83114490 +1 -1.99124800 +1
H 3.41735434 +1 4.35253840 +1 -1.62229460 +1
H 3.79381903 +1 3.34404190 +1 -2.75911440 +1
O 3.62595526 +1 3.51799120 +1 1.49567450 +1
H 2.85079281 +1 3.05382260 +1 1.87152640 +1
H 3.29839384 +1 4.00006500 +1 0.70832110 +1
O -1.23702996 +1 -1.51887330 +1 -1.99416270 +1
H -0.48893227 +1 -2.04258130 +1 -2.34989050 +1
H -0.87871609 +1 -1.02115540 +1 -1.23064690 +1
Tv -0.28915892 +1 -10.20219180 +1 -0.14728890 +1
Tv 1.08349626 +1 -0.12618450 +1 -7.00216750 +1
Tv 7.74510777 +1 -0.18189140 +1 0.81774690 +1