498 Berberine sulfate (CISREB)
(Previous) Beryllium sulfate tetrahydrate (BeSO4 4(H2O)) (ICSD 23218)
(Back) Elements:
S 1
C 20
N 1
O 8
H 19
(Z = 8)
(Periodic Table)
(Next) 18-Crown-6 aminosulfuric acid clathrate (SOVJOC)
In the X-ray structure, one methoxy group has the methyl twisted out-of-plane by 51 degrees.
The current methods predict it to be nearer to in-plane. This is a fault.
Unit Cell Parameters: a b c alpha beta gamma Volume Density Heat of Formation (Kcal/mol)
X-ray: 20.37 7.44 27.43 97.70 116.22 85.45 3691.97 1.560 -180.8 calc'd using PM7
PM7: 20.27 7.45 27.78 98.63 115.78 87.38 3731.53 1.543 -297.5 calc'd using PM7
PM6: 19.91 7.43 27.51 97.62 117.33 90.69 3570.27 1.613 -266.8 calc'd using PM6
X-Ray PM7 PM6
For X-Ray structure, contact the CCDC: http://www.ccdc.cam.ac.uk/
Optimized PM7 data set:
MERS=(1,1,1) GNORM=4
Berberine_sulfate_(CISREB)
S -0.15495337 +1 -0.05079093 +1 -0.10024298 +1
C 3.41048021 +1 1.35564720 +1 7.24473850 +1
C 4.69628988 +1 1.46905832 +1 6.65969391 +1
C 2.26939810 +1 1.68417888 +1 6.55746327 +1
C 2.44263897 +1 2.11240643 +1 5.22627341 +1
C 4.87573381 +1 1.84989694 +1 5.35666578 +1
C 3.70833488 +1 2.18078659 +1 4.62831584 +1
C 3.84449544 +1 2.61318476 +1 3.23359510 +1
C 1.40269499 +1 2.15062255 +1 2.97062342 +1
C 1.24172089 +1 2.51238128 +1 4.44164498 +1
C 2.73448630 +1 3.09672448 +1 1.17180517 +1
C 3.96482647 +1 3.47991289 +1 0.57178223 +1
C 5.05008510 +1 2.98360475 +1 2.68456280 +1
C 5.15368606 +1 3.41649019 +1 1.33553422 +1
C 6.38090501 +1 3.77990929 +1 0.74083393 +1
C 6.43350827 +1 4.15356345 +1 -0.58419451 +1
C 5.25945066 +1 4.19927196 +1 -1.36261957 +1
C 4.02583444 +1 3.89377815 +1 -0.78145058 +1
C 6.44352611 +1 4.69035165 +1 -3.36165550 +1
C 2.58827184 +1 4.93550818 +1 -2.33066320 +1
N 2.69109934 +1 2.65680224 +1 2.43175293 +1
O 5.66043395 +1 1.13196525 +1 7.57810049 +1
O 3.51776519 +1 0.88520238 +1 8.52383805 +1
O 2.83264652 +1 3.86049030 +1 -1.42316310 +1
O 5.20381361 +1 4.53208119 +1 -2.67417323 +1
H 5.06393308 +1 -0.47921999 +1 8.72157951 +1
H 5.26382753 +1 1.15686795 +1 9.61114697 +1
H 1.27763600 +1 1.61743949 +1 7.00318977 +1
H 5.87985192 +1 1.87553988 +1 4.90640772 +1
H 1.37793734 +1 1.03812009 +1 2.82237298 +1
H 0.55067317 +1 2.56976107 +1 2.37582235 +1
H 1.05664453 +1 3.61382309 +1 4.55463314 +1
H 0.30898737 +1 2.02357976 +1 4.82100075 +1
H 1.79228578 +1 3.14501217 +1 0.57902538 +1
H 5.98375267 +1 2.93177351 +1 3.28030880 +1
H 7.29865683 +1 3.76004543 +1 1.34645637 +1
H 7.39996495 +1 4.41119362 +1 -1.04044501 +1
H 6.11983864 +1 4.68260213 +1 -4.41961922 +1
H 7.12912032 +1 3.85421002 +1 -3.18234376 +1
H 6.90921147 +1 5.64166434 +1 -3.08542475 +1
H 1.48691229 +1 4.98938448 +1 -2.32397691 +1
H 2.97749671 +1 4.66288550 +1 -3.31805209 +1
H 3.01960456 +1 5.87807256 +1 -1.98660201 +1
C 4.93364249 +1 0.61399878 +1 8.71252895 +1
C 10.63283960 +1 -1.75342856 +1 -3.49031107 +1
C 9.14873496 +1 -0.96159535 +1 -4.96774320 +1
C 10.43970710 +1 -0.89188880 +1 -5.55361319 +1
C 8.01645660 +1 -0.61844216 +1 -5.66044785 +1
C 8.19926176 +1 -0.20955366 +1 -6.99509997 +1
C 10.62760553 +1 -0.50906924 +1 -6.85532482 +1
C 9.46675818 +1 -0.15882217 +1 -7.58886933 +1
C 9.60488620 +1 0.26040958 +1 -8.98675666 +1
C 7.16381980 +1 -0.21001803 +1 -9.24505018 +1
C 6.99746050 +1 0.17414839 +1 -7.78206408 +1
C 8.50378543 +1 0.68293796 +1 -11.06812709 +1
C 9.72816986 +1 1.09777493 +1 -11.66116865 +1
C 10.80956234 +1 0.63130068 +1 -9.53796593 +1
C 10.91308398 +1 1.05356451 +1 -10.89031696 +1
C 12.14187383 +1 1.42361003 +1 -11.48023497 +1
C 12.19769018 +1 1.80123221 +1 -12.80325796 +1
C 11.02328804 +1 1.85020644 +1 -13.58163046 +1
C 9.79098524 +1 1.52856029 +1 -13.01008979 +1
C 12.20783161 +1 2.38755557 +1 -15.56738514 +1
C 8.35663703 +1 2.62827474 +1 -14.51316343 +1
N 8.45452040 +1 0.28174939 +1 -9.79477015 +1
O 11.38375230 +1 -1.27508566 +1 -4.63635294 +1
O 9.23049206 +1 -1.41612770 +1 -3.68856163 +1
O 8.60116509 +1 1.50540667 +1 -13.66522957 +1
O 10.96727008 +1 2.20342957 +1 -14.89223749 +1
H 10.70951543 +1 -2.85213519 +1 -3.45547802 +1
H 10.97966066 +1 -1.21040259 +1 -2.60262278 +1
H 7.02262155 +1 -0.67235613 +1 -5.22278478 +1
H 11.62922989 +1 -0.49574513 +1 -7.30645331 +1
H 7.13872131 +1 -1.32726358 +1 -9.35791565 +1
H 6.31148872 +1 0.18876681 +1 -9.84856076 +1
H 6.79069254 +1 1.26720787 +1 -7.65925035 +1
H 6.06937967 +1 -0.33543218 +1 -7.40621884 +1
H 7.57468285 +1 0.66487510 +1 -11.67925868 +1
H 11.73995382 +1 0.59048264 +1 -8.93969571 +1
H 13.05902556 +1 1.40218701 +1 -10.87501230 +1
H 13.16755293 +1 2.05941937 +1 -13.24931852 +1
H 11.88382123 +1 2.45440295 +1 -16.62021852 +1
H 12.87688779 +1 1.53054355 +1 -15.43154439 +1
H 12.68584087 +1 3.31769978 +1 -15.24208288 +1
H 7.25737014 +1 2.66352492 +1 -14.53996154 +1
H 8.77941296 +1 2.42915270 +1 -15.50375062 +1
H 8.76143932 +1 3.55647168 +1 -14.09395131 +1
C 0.73478597 +1 1.96081625 +1 -3.47858124 +1
C -0.73870600 +1 2.74403498 +1 -4.97056305 +1
C 0.55383593 +1 2.79716440 +1 -5.55484758 +1
C -1.86614842 +1 3.09222280 +1 -5.67011510 +1
C -1.67484770 +1 3.49652710 +1 -7.00449929 +1
C 0.74931493 +1 3.17543884 +1 -6.85721104 +1
C -0.40544837 +1 3.53670489 +1 -7.59445679 +1
C -0.26008563 +1 3.96590927 +1 -8.98938439 +1
C -2.69921760 +1 3.50198859 +1 -9.25864392 +1
C -2.87066342 +1 3.89521445 +1 -7.79741723 +1
C -1.36544933 +1 4.43136545 +1 -11.06188533 +1
C -0.13554116 +1 4.82288899 +1 -11.65630414 +1
C 0.94497984 +1 4.34086747 +1 -9.53627320 +1
C 1.05018285 +1 4.76919309 +1 -10.88697378 +1
C 2.27767112 +1 5.13860002 +1 -11.47945532 +1
C 2.33133681 +1 5.50824522 +1 -12.80571032 +1
C 1.15843664 +1 5.54997634 +1 -13.58534216 +1
C -0.07365147 +1 5.23719626 +1 -13.00894820 +1
C 2.32678904 +1 6.07044943 +1 -15.58491983 +1
C -1.51949013 +1 6.33156793 +1 -14.50141595 +1
N -1.41066932 +1 4.00378752 +1 -9.79743826 +1
O 1.49141725 +1 2.41034629 +1 -4.63330517 +1
O -0.66403869 +1 2.30620840 +1 -3.68549290 +1
O -1.25868718 +1 5.19863939 +1 -13.67031456 +1
O 1.09314200 +1 5.88582166 +1 -14.89935733 +1
H 0.79947851 +1 0.86268712 +1 -3.42374841 +1
H 1.09100803 +1 2.51759912 +1 -2.60208129 +1
H -2.86113681 +1 3.04626888 +1 -5.23374280 +1
H 1.75458753 +1 3.18220883 +1 -7.30443403 +1
H -2.71054739 +1 2.38651426 +1 -9.37607897 +1
H -3.55042241 +1 3.89620358 +1 -9.86956324 +1
H -3.04426502 +1 4.99930492 +1 -7.70188165 +1
H -3.80634180 +1 3.41962479 +1 -7.41051398 +1
H -2.30200500 +1 4.46209408 +1 -11.66237973 +1
H 1.87700840 +1 4.30050535 +1 -8.93478534 +1
H 3.19821770 +1 5.13692270 +1 -10.87328263 +1
H 3.30186854 +1 5.77123056 +1 -13.24659000 +1
H 1.99415352 +1 6.12506119 +1 -16.63678208 +1
H 2.99892878 +1 5.21724114 +1 -15.44704114 +1
H 2.80056077 +1 7.00743528 +1 -15.27387000 +1
H -2.61848165 +1 6.36587350 +1 -14.50164892 +1
H -1.11295556 +1 6.13839545 +1 -15.49983241 +1
H -1.11208672 +1 7.25854366 +1 -14.08155407 +1
C -5.54867285 +1 -3.08085061 +1 8.73861312 +1
C -7.06352471 +1 -2.34521673 +1 7.26066886 +1
C -5.77681133 +1 -2.24421096 +1 6.67653647 +1
C -8.20099857 +1 -2.01737717 +1 6.56848352 +1
C -8.02019881 +1 -1.59381154 +1 5.23704489 +1
C -5.58984996 +1 -1.85833262 +1 5.37531750 +1
C -6.75278443 +1 -1.52645708 +1 4.64151398 +1
C -6.61299868 +1 -1.09237112 +1 3.24654221 +1
C -9.05288243 +1 -1.55392962 +1 2.98320564 +1
C -9.21831906 +1 -1.19073662 +1 4.45210261 +1
C -7.72949349 +1 -0.57952304 +1 1.19414803 +1
C -6.49764854 +1 -0.20534579 +1 0.59036561 +1
C -5.40701921 +1 -0.72885591 +1 2.69463398 +1
C -5.30537140 +1 -0.28997650 +1 1.34614550 +1
C -4.07808581 +1 0.06128061 +1 0.74520922 +1
C -4.03005250 +1 0.44645749 +1 -0.57743712 +1
C -5.20873925 +1 0.51887983 +1 -1.34583550 +1
C -6.44163431 +1 0.21896446 +1 -0.75979690 +1
C -4.03663090 +1 1.02225220 +1 -3.34836874 +1
C -7.87924624 +1 1.24997111 +1 -2.32477905 +1
N -7.76894542 +1 -1.03553441 +1 2.44776450 +1
O -4.81668312 +1 -2.59323394 +1 7.59508693 +1
O -6.96116514 +1 -2.80069787 +1 8.54788455 +1
O -7.64005099 +1 0.19898381 +1 -1.38847148 +1
O -5.27152955 +1 0.87495422 +1 -2.65159798 +1
H -5.43335038 +1 -4.17572300 +1 8.77205812 +1
H -5.21125704 +1 -2.51833488 +1 9.62118178 +1
H -9.19584285 +1 -2.08319054 +1 7.00879424 +1
H -4.58250052 +1 -1.82307766 +1 4.93285034 +1
H -9.06143824 +1 -2.66737056 +1 2.83877289 +1
H -9.90855682 +1 -1.15210019 +1 2.38317348 +1
H -9.38878884 +1 -0.08658497 +1 4.56500247 +1
H -10.15408382 +1 -1.67134120 +1 4.83284152 +1
H -8.67466694 +1 -0.50590367 +1 0.61018539 +1
H -4.47175152 +1 -0.78438561 +1 3.28792519 +1
H -3.15734688 +1 0.02468317 +1 1.34476724 +1
H -3.06320558 +1 0.69489304 +1 -1.03766692 +1
H -4.37368099 +1 1.05828271 +1 -4.40378844 +1
H -3.37657510 +1 0.16012242 +1 -3.20376305 +1
H -3.54118961 +1 1.95093128 +1 -3.04975530 +1
H -8.98016607 +1 1.30758107 +1 -2.32264731 +1
H -7.49422925 +1 0.94817294 +1 -3.30609863 +1
H -7.44491568 +1 2.19811877 +1 -2.00219617 +1
C 4.51216983 +1 1.88414797 +1 -4.78373997 +1
C 5.99807598 +1 1.10077624 +1 -3.29708178 +1
C 4.70631552 +1 1.06981506 +1 -2.69846165 +1
C 7.12438373 +1 0.75034562 +1 -2.59676986 +1
C 6.94028745 +1 0.35528093 +1 -1.25656081 +1
C 4.52227308 +1 0.70949802 +1 -1.39164893 +1
C 5.67516882 +1 0.32183841 +1 -0.66045315 +1
C 5.53606844 +1 -0.11638048 +1 0.73096861 +1
C 7.96209643 +1 0.38906400 +1 1.00131491 +1
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